The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KYLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7Y, K60Y
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| total genus |
12
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS2 A; 3VS1 A; 2GGR A; 2LJ3 A; 4J9H A; 4RTV A; 1RUW A; 3IQL A; 3TVT A; 2DF6 A; 2EYX A; 1GCQ A; 5FWC A; 3VS6 A; 1AWW A; 1YCS B; 2FO0 A; 4CC2 A; 2JMC A; 2SEM A; 1ZUY A; 1XOV A; 4J9C A; 1M30 A; 1GCQ C; 2HBW A; 3EHQ A; 1WXU A; 2KXD A; 4X1V A; 2CT4 A; 4LNP A; 1TUC A; 1WI7 A; 1UJ0 A; 2W10 A; 2K79 A; 2KNB B; 4F17 A; 2VWF A; 3O5Z A; 2FRW A; 4R0K A; 1M3B A; 1BK2 A; 4RTU A; 1UTI A; 3PVQ A; 4M4Z A; 2RMO A; 2L0A A; 2QDL A; 1GFD A; 2KRS A; 2JW4 A; 2BTT A; 4LE9 A; 5I11 A; 3EHR A; 2EBP A; 1UFF A; 1UHF A; 3REB B; 1KSW A; 1VYU A; 2M0Y A; 2LJ1 A; 4J9G A; 1U3O A; 2C0O A; 2LQW A; 3VS0 A; 2K6D A; 2A28 A; 2KYM A; 2LX7 A; 1JXM A; 1Y0M A; 1ZUU A; 3SEM A; 3EG0 A; 2DLP A; 1YP5 A; 1GL5 A; 1T0H A; 1I0C A; 2V1Q A; 3UA7 A; 2JM9 A; 2FPD A; 4LUD A; 1OPK A; 2FEI A; 2KRN A; 1WYX A; 2H8H A; 1AOJ A; 1AZE A; 1QKW A; 2EYW A; 2RQW A; 5EC7 A; 1AWJ A; 2YUN A; 1SHG A; 1T0J A; 2DM1 A; 1QWE A; 1QCF A; 2L2P A; 2D0N A; 2NWM A; 2EGC A; 4KRT A; 1BBZ A; 4D8D A; 1SRL A; 3H0H A; 1WLP B; 1GBR A; 2LP5 A; 1U5S A; 1U06 A; 1JQQ A; 1W1F A; 1TUD A; 3NGP A; 3JV3 A; 1SPK A; 1Z9Q A; 2YUP A; 3U23 A; 2AKK A; 4F16 A; 2CSQ A; 2AZV A; 3QWY A; 2K9G A; 3I9Q A; 2GTJ A; 1YWO A; 1K1Z A; 4J9E A; 2O31 A; 3ZL7 C; 2KXC A; 1PHT A; 4WCI A; 1B07 A; 2ESW A; 1X2Q A; 1OPL A; 1ZX6 A; 2VVK A; 1H92 A; 1VYT A; 2DRM A; 2CUD A; 2EQI A; 3I5R A; 1WXT A; 2EGE A; 3QWX X; 1N5Z A; 3UF4 A; 2CH4 W; 1AD5 A; 1AWX A; 1M3A A; 1AEY A; 3H41 A; 4RTX A; 1AWO A; 2O9V A; 1VYV A; 4IIM A; 1PKT A; 1QWF A; 2VKN A; 2MIO A; 1PNJ A; 3VRY A; 2J6F A; 2DBM A; 1V1C A; 2D8H A; 2FPE A; 2DA9 A; 1X6B A; 2DNU A; 2A36 A; 4AFQ C; 3M0U A; 1PKS A; 1JO8 A; 2G6F X; 4K11 A; 1K4U S; 4F14 A; 4GBQ A; 1FYN A; 3M0Q A; 2X3W D; 2DBK A; 2C0I A; 2AK5 A; 2SRC A; 3NHN A; 1T3S A; 4HCK A; 4J9B A; 1UJY A; 2IIM A; 2RQR A; 2KRM A; 5FW9 A; 1X27 A; 2LZ6 B; 2AZS A; 2K7A A; 1K76 A; 4JZ4 A; 1WFW A; 2L3P A; 4JZ3 A; 2O9S A; 1H8K A; 2LNH B; 2OAW A; 1CKB A; 1JU5 C; 4Z88 A; 2F2V A; 1A0N B; 4CC7 A; 3SHW A; 2J06 A; 1ZLM A; 2DJQ A; 2JM8 A; 2JXB A; 3EG2 A; 3H0I A; 2EYY A; 1OOT A; 4RTY A; 2KYB A; 2YDL A; 1WIE A; 1QKX A; 1KIK A; 2JTE A; 2ROT A; 4J9I A; 3TSW A; 2GTO A; 2CSI A; 4AFU C; 4ZNX A; 2RF0 A; 1UGV A; 1H3H A; 1OV3 A; 2A37 A; 1UUE A; 2O88 A; 2C0T A; 3GBQ A; 2MCN A; 2KT8 A; 2KT1 A; 4JJD A; 1SHF A; 1SEM A; 2ED1 A; 5GJV B; 3UA6 A; 4RUG A; 2B86 A; 1FMK A; 2EKH A; 1G83 A; 2ROL A; 4IIO A; 1PWT A; 2D8J A; 4DEY A; 3ULR B; 2MOX A; 1PRM C; 2DL8 A; 4J9D A; 1YWP A; 1KFZ A; 2RNA A; 1YN8 A; 3EG3 A; 2EYZ A; 2DIL A; 2DL7 A; 1G2B A; 5GJW B; 2NUZ A; 2KRO A; 3M0R A; 3A98 A; 3VS4 A; 5I22 A; 2HDA A; 4HVW A; 2DL4 A; 2CH4 A; 4ORZ A; 1LCK A; 1E6H A; 4AFS C; 3CQT A; 4A63 B; 1WXB A; 3VS7 A; 1M3C A; 2F2W A; 5HCK A; 4AG2 C; 2I0N A; 2DMO A; 2EGA A; 4AFZ C; 5IHN A; 5IXB A; 4OMO A; 2HCK A; 2FRY A; 2GBQ A; 2CT3 A; 1K0S A; 3H0F A; 1UE9 A; 3M0S A; 1WA7 A; 2X3X D; 1X69 A; 2KBT A; 2PTK A; 4J9F A; 1HD3 A; 1NYG A; 5L23 A; 1M8M A; 1ABO A; 1UDL A; 1JXO A; 4JJB A; 4Z89 A; 3NPF A; 2BZX A; 1NLP C; 2DL5 A; 3C0C A; 1I1J A; 4Y92 A; 2BZY A; 2ECZ A; 2RQU A; 4LN2 A; 4DEX A; 2FG0 A; 2CRE A; 2L3S A; 2K3B A; 1RLP C; 3KFV A; 5FWB A; 3REA B; 1S1N A; 2O2O A; 2EW3 A; 2DRK A; 2GQI A; 2KGT A; 2YUO A; 1Z9Z A; 1Y57 A; 1X2K A; 2XMF A; 1NEG A; 1QLY A; 2YUQ A; 2W0Z A; 3EG1 A; 1GCP A; 1YNZ A; 4OMP A; 1UEC A; 2EPD A; 4ESR A; 3RNJ A; 4E6R A; 1OEB A; 4FSS A; 2J6O A; 4HVV A; 1MV3 A; 2YSQ A; 4OML A; 1WDX A; 4OMQ A; 4QT7 A; 2OI3 A; 1HSQ A; 3FJ5 A; 2A08 A; 2OJ2 A; 4CC3 A; 2ENM A; 2BZ8 A; 3VRZ A; 1BU1 A; 1GRI A; 1NLO C; 2EVR A; 1PRL C; 2V1R A; 2PNI A; 3I35 A; 3TSZ A; 2HEQ A; 2RQT A; 1ZSG A; 1X43 A; 2DX1 A; 1WX6 A; 2J05 A; 4RTT A; 5IHI A; 1I07 A; 5ECA A; 1W6X A; 4CC4 B; 2DYB A; 1ABQ A; 4JPB W; 5IH2 A; 1GFC A; 1ZBJ A; 2GNC A; 1CSK A; 3R6N A; 4OMM A; 1NM7 A; 1EFN A; 1B3Q A; 2ABL A; 2YT6 A; 2RPN A; 3NMZ C; 1UG1 A; 1SSH A; 3EGU A; 1T3L A; 1E7O A; 2FPF A; 2HSP A; 2E5K A; 1NG2 A; 4HXJ A; 3LH5 A; 4D8K A; 1UHC A; 1W70 A; 4GLM A; 2LJ0 A; 2RQV A; 4EIK A; 1TG0 A; 2PZ1 A; 1SRM A; 2AKL A; 4HVU A; 2J7I A; 3VS5 A; 2P4R A; 2DL3 A; 1RI9 A; 2ED0 A; 1E6G A; 2JT4 A; 2LMJ A; 1JEG A; 1NEB A; 1K0X A; 3PVL A; 1M27 C; 1ZUK A; 1KJW A; 4RTZ A; 5IHK A; 2D1X A; 1MV0 B; 2L3Q A; 2DVJ A; 4JJC A; 1VA7 A; 2JMA A; 3M0T A; 2M51 A; 1AVZ C; 4RTW A; 2LQN A; 1BB9 A; 3THK A; 2KEA A; 1J3T A; 2JS2 A; 2DE0 X; 1HJD A; 2K2M A; 1NYF A; 1X6G A; 2LCS A; 3RBB B; 1MUZ A; 4LUE A; 2J6K A; 5IXF A; 3M0P A; 1IO6 A; 1K9A A; 2CDT A; 1AZG B; 2JS0 A; 2KE9 A; 4OMN A; 1RLQ C; 2CUB A; 2RN8 A; 4AG1 C; 1ARK A; 3PE0 A; 2F2X A; 1CKA A; 1GBQ A; 2KR3 A; 3VS3 A; 3I5S A; 3UAT A; 4Z8A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VS2 A; 3VS1 A; 2LJ3 A; 4J9H A; 1RUW A; 1IHV A; 2LNV A; 1AWW A; 5FRM A; 3F70 A; 2FO0 A; 1YJN A; 4CC2 A; 2KI7 A; 1M30 A; 3LWH A; 3EHQ A; 3L2V A; 3GP8 A; 1WXU A; 1VIE A; 1SSF A; 4M78 A; 1C6V X; 5LJ3 e; 1VQL Q; 4J6Y A; 5GAO q; 4ZGJ B; 1WI7 A; 3S6W A; 1UJ0 A; 2HBP A; 1YBY A; 4PJO F; 2CYZ B; 4PLL A; 2QEX Q; 3OSV A; 2PVG B; 4KH1 B; 1ZA1 B; 3UDC A; 3FDR A; 1UTI A; 1GFD A; 2KRS A; 3OW2 P; 4BDY A; 2M02 A; 2E41 A; 3QZ9 B; 2EBP A; 1UFF A; 3REB B; 4C8Q B; 1D3B B; 4WF2 A; 1KSW A; 3URG A; 1MMD A; 1QCN A; 1UB4 A; 1U3O A; 2RA2 A; 3SB2 A; 3WVD B; 1H3Z A; 2K6D A; 1BI0 A; 4C5E A; 3EG0 A; 5FU7 C; 1YP5 A; 1W4S A; 2CS7 A; 3T9N A; 3OQ5 A; 2MK5 A; 3UA7 A; 3CXC P; 4C8Q F; 3GNG A; 3CCR Q; 1AOJ A; 1VQ9 T; 1QVF P; 1AZE A; 2BUD A; 1BIB A; 4Z02 A; 2CZ7 B; 4KUL A; 3V8J A; 3E19 A; 3OS0 A; 4D6W A; 3A8G B; 5KYX A; 2MPX C; 1FX7 A; 3RUX A; 2NWM A; 4KRT A; 3H0H A; 2L8D A; 4FIB A; 1K8A R; 3OYI A; 1WHK A; 1W1F A; 1W2B A; 3NGP A; 2D0Q B; 2DEQ A; 1D1B A; 2K3X A; 5KCH A; 3CCU T; 5GAN d; 2DXU A; 5CQY A; 5CKB A; 3QII A; 2AZV A; 2RO0 A; 2GTJ A; 4J9E A; 1VQK A; 3ZL7 C; 1PHT A; 4F04 B; 1OPL A; 1ZX6 A; 4NL2 A; 2EQI A; 4QKU A; 2CH4 W; 1FWZ A; 3SWN C; 1RAH B; 1QCO A; 2BKD N; 1M3A A; 2KK4 A; 2O9V A; 4IIM A; 3VU3 C; 2CZ1 B; 3QYG B; 4M7A D; 3RMS A; 2J6F A; 4B9X A; 3CCQ T; 1YI2 T; 2YRC A; 2E6Z A; 1OQK A; 1WHG A; 1KD1 U; 3OSS C; 3H6Z A; 2D6F A; 1M1K U; 2G6F X; 1C0M A; 5GAO p; 4GBQ A; 4M75 D; 2VGM A; 1FYN A; 3M0Q A; 3OS5 A; 3HP9 A; 2AK5 A; 1VQ9 Q; 4E7H A; 1VQP T; 5LJ5 j; 1WNL A; 1NPR A; 1Q81 U; 2DEU A; 3CCL T; 2P0K A; 4JZ4 A; 2L3P A; 5A0G A; 2F1L A; 2XDB A; 3LWI A; 2ZZD A; 2EJG A; 4OB1 B; 2RK1 A; 2JXB A; 3QDR B; 3OBW A; 3QSU A; 3CCU Q; 3JAM E; 3H0I A; 4RKU E; 3CMA A; 1WIE A; 4BDZ A; 1QKX A; 2X4W A; 1TU0 B; 2ROT A; 4PJJ A; 4J9I A; 3EG9 A; 2CSI A; 4PJN A; 2RF0 A; 1YCY A; 1G5V A; 3M4G A; 1H3H A; 2B8A A; 2O88 A; 3TQ7 P; 1I5O B; 4MZM A; 2MCN A; 1D0Y A; 2RJE A; 2ZGW A; 2VUB A; 1SHF A; 3L42 A; 4JRK A; 5GJV B; 1N27 A; 1W2B P; 2RHU A; 2EKH A; 1VQ7 Q; 1VIF A; 2D8J A; 4DEY A; 4HCC A; 3JB9 G; 2CGH A; 1YN8 A; 2QGG A; 4EPC A; 2DIL A; 3J7A F; 2OTJ A; 3A98 A; 4FL6 A; 3VS4 A; 3JCM Q; 2DL4 A; 2CH4 A; 4ORZ A; 2I2L A; 1RAA B; 1G3W A; 4C92 B; 1E6H A; 4AFS C; 1WJQ A; 4L5G A; 1WXB A; 3RIR A; 3I56 A; 1UGQ B; 2F2W A; 1R0B G; 1D0Z A; 2I0N A; 4LXC A; 2YHT A; 5IHN A; 3A8H B; 4LDU A; 3OBY A; 5I2S A; 2KQW A; 2VXF A; 3H0F A; 2O01 E; 1KQ1 A; 3CCL Q; 1WA7 A; 3ME9 A; 4J9F A; 4F7U A; 5L23 A; 1M8M A; 2LQ8 A; 2ZAE A; 3HRT A; 3LX7 A; 2BZX A; 2XHC A; 2YRD A; 2BZY A; 2ECZ A; 2DTI A; 2HL5 C; 4WTO B; 1X6O A; 3CD6 Q; 3LGL A; 2CRE A; 3REA B; 1RLP C; 3AHU A; 3C95 A; 2E6N A; 4TVR A; 2DRK A; 2GQI A; 3QUI A; 5GMK j; 1M90 U; 2XIC A; 2YUQ A; 3VJP A; 1WQ7 A; 4F7U G; 1UEC A; 1Q7Y C; 2DIG A; 4E6R A; 3HFN A; 1KD1 C; 1OU9 A; 1RAF B; 4OML A; 1WDX A; 3HSB A; 1M1K C; 5CKD A; 3CCV T; 4B9W A; 1VQ6 A; 4CC3 A; 2FYK A; 2EQM A; 2BZ8 A; 3OYM A; 3VRZ A; 4NS5 A; 3V7C A; 3G6E A; 2OTL A; 3TSZ A; 2KDS A; 3S3O A; 1OI1 A; 1BKB A; 1Q81 C; 1M2V A; 4V2S A; 1WX6 A; 3QJY A; 1S72 T; 1W6X A; 5LJ5 e; 3HL8 A; 3S3M A; 2K5I A; 9ATC B; 1ABQ A; 2XG8 D; 4BY6 C; 4C92 A; 3HRU A; 2VV5 A; 5KYU A; 1YHQ T; 1ZSZ C; 1ZBJ A; 1YFN A; 1K73 R; 5GAO m; 1Q82 C; 4RG8 A; 1CSK A; 4PNO A; 2LCL A; 4ELZ C; 2LQK A; 3G7Z A; 4HXJ A; 3NTH A; 4XTZ A; 4D8K A; 2DIQ A; 5CAI A; 4JS4 A; 2IPO B; 4AMC A; 4HVU A; 2J7I A; 2E64 A; 4QVZ A; 1RI9 A; 1E6G A; 2JT4 A; 2LMJ A; 4JRQ A; 2NUP A; 3H9N A; 2PVO B; 2RHX A; 3HFO A; 1KJW A; 4RTZ A; 1GXI E; 2E12 A; 2QQA A; 1IRX A; 3G1J A; 2NLU A; 2F5K A; 3M0T A; 1VQ8 Q; 2M51 A; 2XD0 A; 1AVZ C; 4DA4 A; 4PJO C; 1KHI A; 5HKC A; 2H3E B; 5GAN h; 4M7D B; 4M77 D; 3CC4 T; 4IUQ A; 1BB9 A; 1WGS A; 3THK A; 2JS2 A; 1VQL A; 4PJL A; 1JJ2 A; 5DY9 A; 4M7A B; 2DE0 X; 5FU6 B; 2K2M A; 1X6G A; 1N8R U; 1OX9 A; 4LUE A; 2QEX A; 3JCM e; 4XTU A; 2CKK A; 3VYG A; 5CKF A; 3CCM Q; 4NL3 A; 1KC8 C; 1K9A A; 4OMN A; 1SF9 A; 2KE9 A; 1RLQ C; 2CUB A; 4AG1 C; 3JCM b; 4M7D F; 1UGP B; 3QKJ A; 2F2X A; 4M7A F; 1S72 Q; 4M75 B; 2K2V A; 2GGR A; 3X20 B; 3IQL A; 5FWC A; 3EGX B; 1GCQ A; 3I55 Q; 1VQ5 T; 2DET A; 3MHX A; 4ME7 A; 4N0A C; 1ZUY A; 1MMG A; 3M54 A; 2LTO A; 1YIT A; 1M90 R; 1LJO A; 4X1V A; 3GNF B; 4KUD K; 4LNP A; 4PFO A; 1SG5 A; 5A2Q E; 3CCS T; 2L5Q A; 4JLI A; 4M75 F; 4RCB A; 2E5Q A; 2L3R A; 5GAN 8; 2KNB B; 3QYH B; 4R0K A; 2EJF A; 1M3B A; 3CPW A; 1PCX A; 3L2R A; 2L0A A; 5GMK e; 4EMH A; 2JW4 A; 4LE9 A; 3E9F A; 3WVE B; 1BYM A; 1YJW T; 4XU3 A; 5D6Y A; 1UHF A; 4BE1 A; 2YLB A; 3UAT A; 3QPH A; 2LJ1 A; 1D1A A; 1MND A; 4J83 A; 2JJ9 A; 3OYH A; 1BI2 A; 3OYY A; 3A1P A; 1IZ6 A; 2A28 A; 4EMK C; 1BCO A; 2KYM A; 1ZUU A; 4GLK A; 1GL5 A; 1T0H A; 2V1Q A; 4DBQ A; 4M7A A; 2MWO A; 5GAN f; 4OVA A; 2JM9 A; 2PQW A; 1NE8 A; 2KRN A; 2X4X A; 3JCM W; 4O5V A; 4BD3 A; 3L2W A; 4KUI A; 1AWJ A; 3M53 A; 4HKE A; 1SHG A; 1T0J A; 4XTY A; 2DM1 A; 1FXX A; 1QCF A; 2OAU A; 2L2P A; 1KHC A; 2LDM A; 2EQU A; 2EGC A; 1N6A A; 1BBZ A; 1SRL A; 2RM4 A; 2DTH A; 3MP6 A; 1U06 A; 4BUG A; 1JQQ A; 1N9R A; 3EGX A; 3J80 E; 1SKU B; 2YUP A; 1V29 B; 2AKK A; 1JJ2 P; 2CSQ A; 2RI5 A; 2K9G A; 4FYX B; 2O31 A; 1Y07 A; 1B07 A; 1X2Q A; 3M9Q A; 3VUB A; 4J8O A; 3CCS Q; 3L2U A; 4E7Z A; 2VYT A; 1MGQ A; 2EGE A; 1N8R R; 2QAS A; 1LVK A; 2RJC A; 4ZGD B; 1AD5 A; 3P8D A; 5KE2 A; 1AEY A; 2ZPE B; 4RTX A; 4X9C A; 1VOM A; 1RI0 A; 1VQN Q; 1PKT A; 2VKN A; 2MIO A; 4FYW B; 1IB8 A; 2DBM A; 1V1C A; 2FPE A; 3TEE A; 3MPU B; 3O8V A; 2DNU A; 2A36 A; 4KBM B; 4DBF A; 1TTH B; 2M0O A; 2P0P A; 3CCU A; 1OZ2 A; 3QDF A; 1ZA2 B; 2M9U A; 1PKS A; 1XNI A; 2QYZ A; 4XU0 A; 2EQJ A; 3MKD A; 3CPW P; 3A8L B; 4OB2 B; 2SRC A; 3NHN A; 1UJY A; 5M9O A; 3OYF A; 2HSE B; 1Q86 C; 2K7A A; 1K76 A; 1WFW A; 1VQ7 A; 1UEB A; 2J06 A; 1RAC B; 2EFI A; 4XQ3 A; 2DO3 A; 2X9H A; 3CME T; 3EG2 A; 5GMK i; 1WHM A; 2KYB A; 2WAC A; 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