The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KYLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7Y, K60Y
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| total genus |
12
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DM1 A; 2JS0 A; 4HCK A; 1UHF A; 2M0Y A; 2LP5 A; 1K9A A; 3M0Q A; 1Y0M A; 1SEM A; 2HCK A; 4HVV A; 1QKW A; 1SHG A; 1T3L A; 2MIO A; 2EPD A; 4IIM A; 1KFZ A; 4F16 A; 2L3S A; 2KR3 A; 2YUP A; 1M3A A; 4Z8A A; 1UDL A; 2KRM A; 2AZS A; 1NLO C; 2KYM A; 2YDL A; 3CQT A; 4RTV A; 3NMZ C; 2DL7 A; 1NM7 A; 1UEC A; 1NYF A; 4JPB W; 2ROT A; 1ZLM A; 2RQR A; 1ZUK A; 2GGR A; 1N5Z A; 1GFC A; 2JW4 A; 3UAT A; 1OV3 A; 2FEI A; 1UGV A; 2JM9 A; 2EW3 A; 1J3T A; 1WFW A; 1JO8 A; 1JU5 C; 1AEY A; 1X6B A; 1HJD A; 4ESR A; 1KJW A; 1WXB A; 2JXB A; 2RN8 A; 4J9G A; 2DLP A; 1YP5 A; 1XOV A; 4RTU A; 4J9I A; 2D8H A; 4CC7 A; 1ZX6 A; 2RQW A; 1OPK A; 4J9B A; 3VS7 A; 2K6D A; 2KGT A; 2CSQ A; 2KT8 A; 4GBQ A; 2CT4 A; 2KNB B; 2EKH A; 3REA B; 3THK A; 1CKB A; 1NEB A; 2KBT A; 1AWX A; 1T0J A; 2FPD A; 2ECZ A; 2L3Q A; 2VVK A; 2RQU A; 1G2B A; 2CH4 W; 4KRT A; 1AOJ A; 4EIK A; 2YT6 A; 2VWF A; 2H8H A; 3RNJ A; 4ZNX A; 1IO6 A; 2BTT A; 2JMA A; 2K2M A; 2JTE A; 2J6O A; 3R6N A; 1TUD A; 1U5S A; 2XMF A; 2CH4 A; 2ED1 A; 1AWJ A; 2J7I A; 3VRY A; 4JZ3 A; 4AFZ C; 2BZX A; 1SPK A; 1K4U S; 2GTO A; 2VKN A; 2O31 A; 5GJW B; 2EGA A; 2SRC A; 1QWE A; 1WXT A; 1PRL C; 1UE9 A; 1MV0 B; 1RI9 A; 2X3X D; 1BK2 A; 1WA7 A; 2LZ6 B; 4F17 A; 5I11 A; 1PHT A; 1UTI A; 2EYY A; 1CSK A; 1TG0 A; 2FRY A; 1UJY A; 4AG2 C; 5IHK A; 4RTW A; 2E5K A; 4J9H A; 1AZG B; 2GNC A; 1GBQ A; 3TSZ A; 3M0U A; 1X2K A; 2RMO A; 3M0T A; 1EFN A; 4OMP A; 1K0S A; 1M8M A; 3H0I A; 4GLM A; 1T3S A; 2K7A A; 1CKA A; 2K9G A; 3PVQ A; 2PTK A; 4HVW A; 3TVT A; 4J9C A; 2O88 A; 1RLQ C; 3H0H A; 1MV3 A; 2FPF A; 3GBQ A; 1NEG A; 1Y57 A; 1BBZ A; 1I07 A; 1QKX A; 5FWC A; 2L0A A; 1GCP A; 2KRO A; 2CDT A; 2EGE A; 3A98 A; 2HDA A; 1GL5 A; 4OMN A; 1BU1 A; 3NHN A; 1V1C A; 4FSS A; 2L3P A; 2RQT A; 4CC3 A; 1GRI A; 2V1R A; 2J6F A; 4F14 A; 1OEB A; 1ZUU A; 2KYB A; 3NGP A; 1WI7 A; 4JJC A; 3C0C A; 1GFD A; 1ABO A; 1HD3 A; 3QWX X; 2DVJ A; 3I35 A; 3EG1 A; 1KSW A; 5IXF A; 1X69 A; 1WX6 A; 1T0H A; 2K79 A; 2LJ1 A; 3VS3 A; 1M27 C; 2PNI A; 3LH5 A; 4JZ4 A; 2IIM A; 1E7O A; 4OMQ A; 4D8D A; 4X1V A; 3IQL A; 3PVL A; 1KIK A; 1I0C A; 1W1F A; 1M3B A; 2DBK A; 4R0K A; 1SSH A; 1U06 A; 1ZUY A; 2F2X A; 1AVZ C; 2F2V A; 2CUB A; 1JQQ A; 3EG2 A; 4J9F A; 1H92 A; 3VS0 A; 4J9D A; 4OMO A; 2DIL A; 4Y92 A; 2F2W A; 3SHW A; 1PWT A; 1G83 A; 3EG3 A; 2D8J A; 2J6K A; 5HCK A; 3UA7 A; 1JEG A; 2OAW A; 2O2O A; 2EQI A; 1QCF A; 2ED0 A; 2FO0 A; 2K3B A; 2LMJ A; 1HSQ A; 1JXM A; 1NLP C; 2D0N A; 1ABQ A; 2P4R A; 2ESW A; 1SRM A; 3PE0 A; 3I5R A; 2DYB A; 3EGU A; 4JJD A; 5IHN A; 1H8K A; 2JMC A; 1UFF A; 1WLP B; 2OJ2 A; 2LNH B; 1NG2 A; 2J05 A; 3H41 A; 1LCK A; 2RQV A; 2RPN A; 3H0F A; 2LQW A; 3RBB B; 2SEM A; 1GCQ C; 2LJ0 A; 3EG0 A; 2CRE A; 1GCQ A; 1VYV A; 2KEA A; 2M51 A; 4RTX A; 5EC7 A; 1UG1 A; 1VYU A; 2AZV A; 1FMK A; 1U3O A; 3NPF A; 2D1X A; 3M0R A; 2KXD A; 1JXO A; 2CSI A; 2I0N A; 2LQN A; 1SRL A; 3FJ5 A; 3ZL7 C; 1W6X A; 1ZBJ A; 4HXJ A; 3SEM A; 2KXC A; 4J9E A; 3KFV A; 1K1Z A; 4E6R A; 2G6F X; 2JM8 A; 1S1N A; 2NUZ A; 2OI3 A; 2FRW A; 4LN2 A; 3REB B; 4LE9 A; 1BB9 A; 4CC2 A; 2BZ8 A; 2C0T A; 4RTY A; 5GJV B; 1YWO A; 4OMM A; 1AWW A; 5IHI A; 2DNU A; 5FWB A; 2EYW A; 2NWM A; 1FYN A; 4HVU A; 2GQI A; 1QWF A; 2AKK A; 2JT4 A; 2EGC A; 1M30 A; 4JJB A; 2LX7 A; 2YUO A; 4RTT A; 2ABL A; 1PKS A; 2O9S A; 2QDL A; 2HBW A; 2C0I A; 5IXB A; 4RTZ A; 1M3C A; 1RUW A; 2CUD A; 2DE0 X; 3UF4 A; 2A36 A; 3VS2 A; 2PZ1 A; 4AFS C; 4WCI A; 2X3W D; 2HSP A; 2A08 A; 2DL5 A; 3EHR A; 3I5S A; 5I22 A; 2B86 A; 4Z89 A; 1ARK A; 4DEX A; 1YNZ A; 1PKT A; 3M0P A; 1GBR A; 2DX1 A; 2DRM A; 1VYT A; 2MOX A; 4D8K A; 2FPE A; 1E6H A; 3TSW A; 4M4Z A; 5FW9 A; 2EYZ A; 4LNP A; 2EBP A; 5L23 A; 3VRZ A; 1ZSG A; 3U23 A; 3EHQ A; 3VS5 A; 2RNA A; 4AG1 C; 2BZY A; 2MCN A; 2ENM A; 2J06 A; 1B3Q A; 2DBM A; 2L2P A; 2GBQ A; 2YUN A; 1AD5 A; 3M0S A; 2DL3 A; 2KRN A; 3VS6 A; 1UJ0 A; 1X43 A; 1YN8 A; 4ORZ A; 2W0Z A; 1TUC A; 1W70 A; 2A28 A; 1PNJ A; 3O5Z A; 1I1J A; 1E6G A; 1UUE A; 2DA9 A; 2ROL A; 2DJQ A; 2YUQ A; 1MUZ A; 1QLY A; 1RLP C; 1X2Q A; 1WYX A; 1AZE A; 1WIE A; 1VA7 A; 4A63 B; 1K0X A; 1SHF A; 2FG0 A; 1Z9Z A; 1NYG A; 2KRS A; 4Z88 A; 2LCS A; 2JS2 A; 3VS4 A; 1B07 A; 3QWY A; 2W10 A; 1OPL A; 2RF0 A; 2DL4 A; 1WXU A; 2AK5 A; 5IH2 A; 3I9Q A; 4LUE A; 3VS1 A; 1OOT A; 1PRM C; 1Z9Q A; 4K11 A; 5ECA A; 1H3H A; 2V1Q A; 2HEQ A; 4RUG A; 2C0O A; 2YSQ A; 2DRK A; 4OML A; 2DMO A; 4AFU C; 2EYX A; 4DEY A; 1X27 A; 2LJ3 A; 4AFQ C; 1X6G A; 2DL8 A; 2AKL A; 1YCS B; 2GTJ A; 3JV3 A; 4IIO A; 4QT7 A; 3UA6 A; 2O9V A; 2KE9 A; 2KT1 A; 4CC4 B; 1K76 A; 2CT3 A; 1A0N B; 4LUD A; 1AWO A; 1UHC A; 3ULR B; 2DF6 A; 2EVR A; 1WDX A; 1YWP A; 2A37 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DM1 A; 4HCK A; 5DY9 A; 1UHF A; 3UDC A; 4XU0 A; 2LP5 A; 1SEM A; 2HCK A; 4C92 D; 1QKW A; 1SHG A; 1T3L A; 1SG5 A; 4F7U F; 2YUP A; 1M3A A; 1UDL A; 3QYH B; 3JB9 F; 2WSF E; 4X9C A; 2YDL A; 3NMZ C; 3CCR A; 3NTI A; 3CEY A; 5GMK m; 2GQV A; 5LJ5 e; 1YIT A; 2HBP A; 1UEC A; 3MCA B; 4M77 F; 1GFC A; 1RAD B; 3UAT A; 2RHZ A; 3QUI A; 2DXC A; 2JM9 A; 5GAM j; 3M56 A; 1JO8 A; 2WAC A; 1RI0 A; 1M1G A; 5LJ5 d; 2KI7 A; 5GAO r; 1KJW A; 2MMP A; 3TRE A; 2DLP A; 1XOV A; 4RTU A; 4HCB A; 4R55 A; 2XHC A; 2RI2 A; 4CC7 A; 4J9B A; 1OPK A; 1VQK Q; 3EH2 A; 2KT8 A; 3PFS A; 4GBQ A; 1WNL A; 2NUP A; 5GAO q; 5AT1 B; 1JB0 E; 3CXC P; 3CPW S; 3PMT A; 1T0J A; 2FPD A; 4MZP A; 4M75 C; 3M5A A; 3HL8 A; 3MPU B; 4QVC A; 4M75 A; 2CH4 W; 4KRT A; 3URG A; 5GAO m; 1NJI C; 1AOJ A; 3CBP A; 3CCQ Q; 2YT6 A; 2VWF A; 2H8H A; 3MP1 A; 3RNJ A; 4M7A A; 5LJ5 f; 2BTT A; 4ZN3 A; 3S3N A; 2JMA A; 2K2M A; 1QVG S; 4NS5 A; 2HD0 A; 3MO8 A; 3OYJ A; 1U5S A; 1EX4 A; 1YHQ T; 3MJX A; 2CH4 A; 1QW1 A; 1AWJ A; 4AFZ C; 4E7K A; 1VQK A; 3HRS A; 2QK0 A; 4FW1 A; 1M9S A; 3JCM g; 5CKE A; 2AT1 B; 2E12 A; 1MV0 B; 4IUP A; 2DXB A; 1RI9 A; 2X3X D; 1TSF A; 3AT1 B; 4QQ6 A; 1CSK A; 2FRY A; 1WZO A; 2RB6 A; 1M90 R; 1NBE B; 5GMK j; 1JJ2 P; 2MWO A; 3CCQ A; 1AZG B; 3OYK A; 4E7Z A; 1M8M A; 5GAN e; 3HFN A; 1M2V B; 2EKO A; 2K9G A; 3A8O B; 4RG8 A; 3E1S A; 1VQ9 T; 1TWB A; 2PTK A; 3TVT A; 3DLM A; 4DBH A; 3CC7 T; 1RLQ C; 4MDX A; 4RG2 A; 1PSE A; 1RAA B; 2LT4 A; 3GBQ A; 1NEG A; 5GAN d; 3SWN C; 3PTA A; 2OTJ T; 3JB9 D; 2FHD A; 5A0D A; 2COW A; 2E41 A; 1K73 U; 1VQ9 Q; 2CDT A; 3PGG A; 3CC7 Q; 1D3B B; 4LDV A; 3A98 A; 2Z0W A; 1ZA1 B; 2HDA A; 4KH1 B; 3OW2 A; 1Y96 B; 2RQT A; 1GRI A; 2V1R A; 4M77 D; 5FU7 C; 3ASK A; 2OTJ Q; 4QKU A; 1YJW T; 4KBM B; 2L5Q A; 3EG1 A; 1KSW A; 1W2B P; 1WX6 A; 2K79 A; 5GAN f; 2PUK B; 3VS3 A; 3QJ6 A; 1Y07 A; 1E7O A; 4OMQ A; 2E3I A; 3PMI A; 2HKQ B; 3QG1 A; 4RKU E; 4X1V A; 3PVL A; 4J6W A; 1KIK A; 2BUD A; 1W1F A; 1M3B A; 2DBK A; 1K8A U; 4R0K A; 1SSH A; 1U06 A; 1ZUY A; 1AVZ C; 2DEQ A; 1PSF A; 1VQ9 A; 4PJM A; 1LPL A; 3QBY A; 4C92 B; 3CC7 A; 4DBR A; 2Y4Y A; 4OMO A; 2DIL A; 2F2W A; 3S6W A; 4JS5 A; 1BI2 A; 3EFO A; 3WVE B; 5GAM g; 1G83 A; 3UPU A; 2CZ6 B; 3HTR A; 3I56 T; 2OTJ A; 1JEG A; 5KYW A; 1QVG P; 2ED0 A; 3MP6 A; 3OYF A; 3OSS C; 1NJI R; 2LMJ A; 4VUB A; 1NLP C; 4A4H A; 3I56 Q; 2DYB A; 3JCM V; 1H8K A; 3QZ9 B; 1PCX A; 2LNH B; 4OB0 B; 3O8V A; 4E7S A; 1ZHI A; 2J05 A; 2K3Y A; 2LQW A; 3FC3 A; 1RAE B; 5KH6 A; 2LJ0 A; 2WSE E; 4RTX A; 1VYV A; 1VQO Q; 1QP2 A; 2CZ7 B; 5EC7 A; 1UG1 A; 2DZC A; 1Q82 R; 3OS0 A; 1FMK A; 1U3O A; 3NPF A; 1SF9 A; 2D1X A; 3M0R A; 2CSI A; 2KY9 A; 3L2Q A; 1KC8 C; 1XJW B; 3CCJ Q; 3H9N A; 1FX7 A; 3G71 T; 1RL2 A; 4MDW A; 3I56 A; 2WSC E; 2BE7 D; 4OMM A; 5IHI A; 2EYW A; 2JVV A; 1Q86 C; 2JUF A; 1K9M U; 4OVA A; 2QDL A; 1TUG B; 4FT2 A; 1G3Y A; 2VYT A; 3QDR B; 2CP6 A; 1M3C A; 2QYZ A; 5IAY A; 1UEB A; 1VQO A; 3UF4 A; 3H8Z A; 3PT9 A; 5IN1 A; 3X28 B; 3HFO A; 1AT1 B; 3P8H A; 2DL5 A; 4P5N A; 2QAZ A; 4F04 B; 1GBR A; 4DEX A; 1YNZ A; 3M0P A; 1RAC B; 3CCJ A; 1VYT A; 2XDP A; 5KYN A; 1Q7Y R; 3TSW A; 3HRU A; 1QCN A; 3G4S T; 3EHQ A; 3OB9 A; 2BZY A; 2RHY A; 4JRP A; 1QVF S; 4FL6 A; 4FM4 B; 1IGQ A; 2KRN A; 2M9U A; 4XTW A; 1TOV A; 5GAO n; 3V7C A; 4ATO A; 1UJ0 A; 3CCV Q; 4C92 G; 3G6E T; 3CCS T; 1W70 A; 2A28 A; 4ME7 A; 2XID A; 3WXM B; 4KGZ B; 2PVG B; 1UUE A; 2DA9 A; 2ROL A; 4JRK A; 4F7U B; 2X35 A; 3OYH A; 5KCO A; 4HT8 A; 4IUT A; 2RJC A; 3JB9 H; 3CME T; 2FG0 A; 3CCS Q; 3JCM W; 2JS2 A; 4O6J A; 3SB2 A; 3BDU A; 3MP8 A; 4M77 B; 4RCB A; 1WQ7 A; 2YLC A; 3I9Q A; 4LUE A; 1Z9Q A; 4ZN1 A; 3CCV A; 5KYX B; 3CME Q; 1LNX A; 2HEQ A; 4RUG A; 3JCM X; 4NL2 A; 4PJN A; 4XU1 A; 4PJO F; 5LJ3 d; 3KBG A; 1YI2 T; 4OML A; 4AFU C; 2CYZ B; 2EYX A; 2XDD A; 1VQ4 T; 2L3R A; 1YCS B; 2O01 E; 2LNV A; 4DBF A; 1WJR A; 2P0Q A; 2O9V A; 3P8B B; 3CCS A; 4NL3 A; 2FYK A; 1LVK A; 1NPR A; 4X9D A; 2KT1 A; 3TCJ A; 4CC4 B; 1RAB B; 2CT3 A; 2DEU A; 1MNE A; 4BUG A; 1VQ4 Q; 2F5T X; 1KC8 R; 2DIQ A; 5LJ3 f; 2DF6 A; 3CME A; 1WDX A; 1YWP A; 2D6F A; 5CKB A; 2E10 A; 2M0Y A; 2O4X B; 1K9A A; 3A8M B; 3HRT A; 2E70 A; 4HVV A; 4M78 G; 5EG2 A; 2HQE A; 2EPD A; 2KR3 A; 3RER A; 1KQ1 A; 2OAU A; 4L6V 5; 2AZS A; 4AMC A; 2KYM A; 4RTV A; 1BIB A; 4C92 E; 4XTV A; 4C0D C; 1IZ6 A; 1NM7 A; 4N4G A; 1KHI A; 3OYI A; 3C94 A; 4QQD A; 1I8F A; 1VQN T; 3RKW A; 2EW3 A; 1J3T A; 1WFW A; 4E2F B; 1AEY A; 4V2S A; 3TQ7 P; 4ESR A; 3JCM P; 1WXB A; 2BIV A; 2JXB A; 3JRZ A; 3CD6 T; 3M54 A; 1M2V A; 4J9I A; 5D6Y A; 1VQL Q; 2COY A; 3CCM T; 1UGR B; 4M7D B; 3CBO A; 2KGT A; 5GAN 5; 3VV0 A; 2KNB B; 2EKH A; 3REA B; 3CXC S; 1NEB A; 5LJ5 j; 2KBT A; 1AWX A; 3FLG A; 3LLR A; 1D1C A; 2CS7 A; 2ECZ A; 3HHT B; 4OGC A; 3CD6 Q; 1BCM A; 1G2B A; 3LWI A; 1VOM A; 2DJZ A; 3M9Q A; 4ZNX A; 4L5G A; 3LX7 A; 2JTE A; 4ZGD B; 1Y96 A; 1WQW A; 4PJO D; 4FYY B; 1TUD A; 2DTH A; 4PFO A; 1K8A R; 1MMD A; 2KMT A; 1VQL A; 2J7I A; 1OI1 A; 4JZ3 A; 4EDU A; 2VKN A; 3FEO A; 5GAO p; 3E19 A; 1WXT A; 3QXE B; 3CCU T; 2CP0 A; 4F17 A; 1PHT A; 4M78 F; 4FYW B; 4M7A E; 3CD6 A; 4ZTJ A; 2V8I A; 4KT0 E; 4C92 C; 1GBQ A; 3M0U A; 4C92 A; 3M0T A; 4LDY A; 3H0I A; 2VXF A; 1VIF A; 2PUO B; 2K7A A; 1D1B A; 4HVW A; 2LCC A; 2O88 A; 2EJ9 A; 2FPF A; 1RAG B; 4IKF A; 1VQ7 T; 2XG8 D; 3LYI A; 5FWC A; 1GCP A; 4J7F A; 5CO7 A; 3JCM h; 2EQU A; 3OYY A; 2DXU A; 3N5B B; 4ELY C; 4R56 A; 2EGE A; 4FYX B; 3G7Z A; 2JNG A; 4J8O A; 2KQW A; 2DD5 A; 1VQ6 T; 1GL5 A; 4F7U E; 5GAN j; 2L89 A; 1N8R U; 1KQS A; 1VQ7 Q; 2J6F A; 4BD3 A; 2IPO B; 1P92 A; 4JLG A; 1OEB A; 1EIF A; 2EIF A; 1WI7 A; 4JJC A; 4XTU A; 3RMQ A; 5I2S A; 3ZEH A; 3FJP A; 2DVJ A; 1W2B S; 1YBY A; 3NTH A; 1X69 A; 5C0M A; 2LJ1 A; 1M27 C; 8AT1 B; 4M77 E; 4JZ4 A; 2LT1 A; 1VQ5 T; 2KSS A; 4D8D A; 4M7D G; 3INZ A; 1NPP A; 1D1A A; 3JB9 J; 2FZC B; 1K9M R; 4XTY A; 4CI0 C; 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