The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KYLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7Y, K60Y
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
|
| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
12
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JS2 A; 1NG2 A; 4JZ3 A; 2VWF A; 1M3C A; 1B07 A; 2LMJ A; 1I0C A; 3NPF A; 1M3B A; 4Y92 A; 1AWX A; 1PRM C; 1PNJ A; 2EPD A; 2K2M A; 2CH4 A; 4J9B A; 2DLP A; 2X3W D; 1ZSG A; 1H92 A; 2RQW A; 2DBM A; 1NEB A; 3UA7 A; 2DRM A; 2MOX A; 3UAT A; 1Y0M A; 2ABL A; 1K4U S; 2EBP A; 2P4R A; 2J7I A; 5IXB A; 2LJ1 A; 4R0K A; 1LCK A; 1J3T A; 2KGT A; 2AZV A; 5GJW B; 2DF6 A; 2MCN A; 2I0N A; 2E5K A; 1OV3 A; 3M0S A; 2EYZ A; 2FPE A; 3M0P A; 1JU5 C; 2A08 A; 1K0X A; 2L0A A; 2D0N A; 1M27 C; 2CRE A; 3PVQ A; 2BZ8 A; 1K76 A; 3R6N A; 2FRW A; 2NUZ A; 3TVT A; 2LQW A; 2KNB B; 2J6F A; 2DL3 A; 4AG2 C; 2D8J A; 1CSK A; 1H3H A; 2JM9 A; 2W0Z A; 1UHC A; 1Z9Z A; 1PRL C; 2RPN A; 4KRT A; 1HJD A; 2KEA A; 2M51 A; 4ORZ A; 5GJV B; 1ZBJ A; 2DNU A; 2NWM A; 4JJB A; 2C0O A; 5IHI A; 1A0N B; 3M0R A; 2X3X D; 1K1Z A; 4J9G A; 1X69 A; 2DA9 A; 3CQT A; 3I5R A; 1TUD A; 1PKS A; 3EHQ A; 1AOJ A; 4A63 B; 1E6G A; 2JW4 A; 4ZNX A; 2D8H A; 2QDL A; 2KRN A; 5HCK A; 2ENM A; 1PKT A; 2H8H A; 2V1R A; 2K7A A; 1BBZ A; 1WA7 A; 1Y57 A; 2KRM A; 3KFV A; 1FYN A; 1YWO A; 1WX6 A; 2EKH A; 3I5S A; 3TSW A; 2GTJ A; 1GBQ A; 2F2V A; 4RTW A; 3RNJ A; 2EYY A; 2EGE A; 4IIO A; 1WFW A; 1SEM A; 1X27 A; 1AD5 A; 3VS5 A; 4OMP A; 3ULR B; 4FSS A; 1Z9Q A; 2VVK A; 1PWT A; 1GL5 A; 3H0I A; 1SHF A; 1ZX6 A; 3NHN A; 4LN2 A; 4LNP A; 2FPD A; 4X1V A; 1TUC A; 4LE9 A; 2L3S A; 2OAW A; 3H41 A; 2EW3 A; 2A37 A; 1ZLM A; 1KJW A; 1U06 A; 2YDL A; 3PE0 A; 3A98 A; 2KBT A; 4J9D A; 2KR3 A; 2LCS A; 2GQI A; 1QWF A; 4CC7 A; 1UFF A; 1X6G A; 4ESR A; 4OML A; 1ABO A; 2YSQ A; 2LZ6 B; 2YUO A; 1AEY A; 3REB B; 3GBQ A; 3QWY A; 1RLP C; 2YUQ A; 4QT7 A; 1EFN A; 4Z89 A; 2YT6 A; 5I22 A; 1T3S A; 2RF0 A; 4AFZ C; 1SPK A; 1UJY A; 2K9G A; 4CC2 A; 3JV3 A; 2HEQ A; 3VS7 A; 2J6K A; 4AFU C; 2L3Q A; 1E6H A; 3U23 A; 2EGA A; 2DL5 A; 2CT3 A; 2PNI A; 2EYX A; 4OMN A; 1OPL A; 3ZL7 C; 2GGR A; 1GBR A; 1UUE A; 4D8K A; 1VYV A; 5FWC A; 3THK A; 2EGC A; 1SSH A; 1MUZ A; 1YCS B; 1RUW A; 1H8K A; 1QKW A; 1MV3 A; 2AZS A; 1T0J A; 3O5Z A; 1BU1 A; 2L2P A; 4F17 A; 2ED1 A; 2GBQ A; 2SRC A; 2V1Q A; 1CKB A; 2F2W A; 4HVW A; 1UG1 A; 4GLM A; 1WLP B; 4HXJ A; 4JZ4 A; 3EG1 A; 1AWJ A; 1QLY A; 1UEC A; 2JXB A; 2KE9 A; 1WXB A; 4RTY A; 3IQL A; 1GFC A; 1QWE A; 4AFQ C; 2KT8 A; 4RTT A; 4RTZ A; 2KYB A; 4Z88 A; 3VS2 A; 2DYB A; 1GCQ A; 2MIO A; 1AWW A; 1CKA A; 1W1F A; 2JM8 A; 3VS4 A; 1VYU A; 3PVL A; 2EQI A; 4CC4 B; 4DEX A; 2ECZ A; 1SRL A; 1M3A A; 2DL4 A; 3M0Q A; 3RBB B; 2HSP A; 2RQR A; 1ZUK A; 2CH4 W; 2W10 A; 2A28 A; 1I1J A; 2KRO A; 2O9S A; 1WXT A; 2EVR A; 1WDX A; 2IIM A; 4M4Z A; 4J9H A; 1OOT A; 1X2Q A; 4HVV A; 1GCP A; 3NGP A; 1GRI A; 2G6F X; 1X43 A; 1W70 A; 2RQU A; 1NM7 A; 2LX7 A; 4RTU A; 1ARK A; 1UTI A; 4F14 A; 2ROL A; 1AWO A; 1BK2 A; 2AKL A; 2BZY A; 2KXD A; 3SEM A; 2PTK A; 3I9Q A; 3EGU A; 3FJ5 A; 4AFS C; 2RN8 A; 1UDL A; 1WIE A; 4WCI A; 1MV0 B; 2J06 A; 4J9I A; 2RQV A; 2FRY A; 5IHN A; 2DIL A; 1JEG A; 4RTV A; 1AZE A; 2LP5 A; 1UHF A; 1K0S A; 1PHT A; 2FEI A; 1OEB A; 4RTX A; 2LJ0 A; 2C0T A; 2F2X A; 2FO0 A; 4OMO A; 1WXU A; 3LH5 A; 2DMO A; 1SHG A; 2ESW A; 4LUD A; 1OPK A; 2KT1 A; 2D1X A; 1B3Q A; 1WI7 A; 2JTE A; 2K6D A; 2A36 A; 2K3B A; 1FMK A; 3VS0 A; 2CUB A; 4JPB W; 2DVJ A; 2O2O A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 1UGV A; 2JS0 A; 3I35 A; 2JT4 A; 2CDT A; 5IXF A; 2HBW A; 1YWP A; 4J9E A; 1SRM A; 3VS3 A; 1JQQ A; 1JXO A; 2L3P A; 3REA B; 1KIK A; 1TG0 A; 5EC7 A; 5FWB A; 2DX1 A; 2YUP A; 4OMM A; 3SHW A; 2VKN A; 4DEY A; 4IIM A; 2DL7 A; 4RUG A; 2OJ2 A; 3C0C A; 5IH2 A; 4AG1 C; 2KYM A; 1NLP C; 2RMO A; 3VS1 A; 2LNH B; 1N5Z A; 4HVU A; 2CSI A; 3UA6 A; 1UE9 A; 1T3L A; 2DM1 A; 1VYT A; 2EYW A; 2HCK A; 3VRY A; 2CT4 A; 1KSW A; 1G2B A; 4LUE A; 4J9F A; 4GBQ A; 1U3O A; 3TSZ A; 2AKK A; 2ED0 A; 2KRS A; 1NYF A; 4HCK A; 5L23 A; 3EHR A; 2AK5 A; 1VA7 A; 2ROT A; 2CSQ A; 1AZG B; 1M8M A; 3M0U A; 4F16 A; 1NEG A; 4EIK A; 3EG3 A; 1V1C A; 2DJQ A; 3VS6 A; 1E7O A; 2GNC A; 2JMC A; 3NMZ C; 2CUD A; 2LQN A; 2OI3 A; 1W6X A; 1WYX A; 1ZUU A; 1AVZ C; 3QWX X; 2O88 A; 4CC3 A; 1UJ0 A; 2YUN A; 1NLO C; 1X6B A; 1JO8 A; 1YP5 A; 2HDA A; 4OMQ A; 2O9V A; 3H0H A; 1GFD A; 1BB9 A; 2PZ1 A; 2GTO A; 4JJD A; 1M30 A; 2FPF A; 1K9A A; 4J9C A; 1X2K A; 1GCQ C; 1HSQ A; 1RI9 A; 2DE0 X; 2O31 A; 3M0T A; 3EG0 A; 1QCF A; 1NYG A; 1S1N A; 1I07 A; 2SEM A; 3UF4 A; 2DL8 A; 1ABQ A; 1G83 A; 4JJC A; 2B86 A; 3EG2 A; 2JMA A; 5FW9 A; 1U5S A; 2K79 A; 2BZX A; 2J6O A; 2BTT A; 2M0Y A; 2XMF A; 3H0F A; 1IO6 A; 4E6R A; 2DRK A; 1T0H A; 5IHK A; 2RNA A; 4D8D A; 1KFZ A; 1HD3 A; 4K11 A; 1QKX A; 1RLQ C; 1YNZ A; 2FG0 A; 2DBK A; 4Z8A A; 5I11 A; 5ECA A; 2J05 A; 3VRZ A; 1JXM A; 1XOV A; 2KXC A; 2RQT A; 1YN8 A; 2C0I A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NUP B; 1B07 A; 1NPR A; 3S6W A; 1PRM C; 4HKE A; 2GFA A; 4M77 D; 3M58 A; 2A3L A; 1DJ7 B; 5FLX E; 5GAN e; 1VQ8 Q; 2OTJ A; 3CXC S; 5GAN 8; 3OYJ A; 1NEB A; 2YRC A; 2HQH A; 2XHC A; 4ZGE B; 3LGL A; 3UAT A; 4JRI A; 1K4U S; 1XQH A; 1RAG B; 4KGZ B; 2PUO B; 4MDX A; 2Y4Y A; 1WJR A; 4RMO A; 2LCC A; 4C92 E; 4R0K A; 1LCK A; 4C8Q F; 3CCQ A; 3CCS T; 4PJO A; 4M7A C; 3S3M A; 5GAN f; 1XTD A; 1VIE A; 2LQ8 A; 3M0S A; 3TRE A; 1WZO A; 2A08 A; 4M78 E; 4Y28 E; 3FRN A; 2DTH A; 5GAN 6; 5FU7 C; 1N8R R; 3G4S A; 1NE8 A; 2D8J A; 3A5Z B; 1KHI A; 3HHT B; 1VQL A; 1K9M R; 2P0P A; 5D6Y A; 2VUB A; 2YWW A; 4KRT A; 4C8Q G; 1M2V A; 1G3T A; 4ORZ A; 1KD1 C; 2NWM A; 2C0O A; 4E7J A; 4DOV A; 1MMA A; 4IUR A; 1K1Z A; 3CQT A; 3GF5 A; 1IGQ A; 3OSS C; 1QCN A; 5CKE A; 3T9N A; 4M77 A; 3CCR Q; 3PGG A; 3OYE A; 3J80 E; 2QQB A; 2ENM A; 1PSF A; 1W2B P; 2LDM A; 2V8J A; 3OMG A; 2LT1 A; 2MWO A; 3HFN A; 1YWO A; 4XTW A; 3G71 T; 2CGH A; 2M16 A; 3CCJ A; 1BIA A; 4FU6 A; 4RTW A; 4IIO A; 1WFW A; 3M54 A; 1M90 R; 4BI8 B; 2ZGW A; 1QVF P; 3VUZ A; 3VJP A; 1PWT A; 2KQW A; 5DY9 A; 1ZX6 A; 3SWN B; 1IHV A; 3EGX B; 1Q86 R; 3JCM d; 3JB9 D; 3JRZ A; 4X1V A; 1TUC A; 2XK0 A; 2CP0 A; 1YHQ T; 4XTV A; 3P8D A; 1ZLM A; 3A98 A; 3CBP A; 5GAO r; 2KBT A; 4PKC C; 2KR3 A; 1FMW A; 3ZFJ A; 4LDV A; 4OML A; 3L2R A; 2KSS A; 2LZ6 B; 1AEY A; 2LRQ A; 4PJO B; 2YUQ A; 1EFN A; 4Z89 A; 2PU9 B; 2RHZ A; 3QYH B; 1YIT Q; 2ZZD A; 2PUK B; 3CC2 A; 2A7Y A; 3VU3 C; 2K9G A; 2CP6 A; 3OW2 A; 3JV3 A; 4AFU C; 2L3Q A; 3CD6 Q; 3CCL T; 4GY5 A; 4KUD K; 2LT4 A; 5KYY B; 3EH2 A; 1M2V B; 4KGV B; 1VYV A; 2QQS A; 5FWC A; 1I81 A; 1Q7Y C; 2EGC A; 1OZ2 A; 4M75 F; 1RAC B; 1SSH A; 1Y96 A; 5I21 A; 2D9T A; 1H8K A; 2AZS A; 3QUI A; 5GAM h; 2V1Q A; 1YIJ Q; 1CKB A; 3X26 B; 2F2W A; 4M77 B; 1WLP B; 2COZ A; 2EQJ A; 4V2S A; 4WF2 A; 3CXC P; 4HCC A; 3MO8 A; 3EG1 A; 3OBY A; 1K73 R; 2EJG A; 2KE9 A; 4PJO C; 2K2V A; 4Z88 A; 2X4W A; 1X6O A; 1YI2 Q; 2JM8 A; 4A4H A; 2EQI A; 4KT0 E; 4DEX A; 3CCV A; 1M3A A; 3L2U A; 2K57 A; 2HSP A; 3H9N A; 4BD3 A; 4F7U F; 2JNG A; 2X4J A; 2DPP B; 3CCM T; 1UGQ B; 2OTL Q; 4J9H A; 3ER0 A; 4HVV A; 1WPY A; 1GRI A; 3OQ5 A; 1W70 A; 2HQE A; 3CME A; 1P92 A; 5CIU A; 4BE2 A; 1VQM T; 3QYG B; 2ROL A; 1KC8 C; 1AWO A; 2RHX A; 3E2U A; 3SEM A; 3OYF A; 1Q95 G; 4M77 C; 5CQY A; 3PTA A; 3EGU A; 3M5A A; 2DYI A; 5A2Q E; 1RAA B; 2RK1 A; 3MPU B; 2BUD A; 1K0S A; 5LJ3 j; 3CBO A; 3M56 A; 2QDY B; 1ZQ1 A; 1VQ5 Q; 1NJI U; 1WXU A; 4C5H A; 4ZGJ B; 1N27 A; 4BDZ A; 4NOY A; 4ZTJ A; 1OPK A; 2D1X A; 1B3Q A; 3WXM B; 3SDZ A; 4FW1 A; 1FMK A; 3VS0 A; 1ZUY A; 1TH7 A; 1UGV A; 2JS0 A; 2CDT A; 5IXF A; 4PJJ A; 5GAN g; 3C4S A; 3QDR B; 3E19 A; 4C92 F; 2MWP A; 1ZA1 B; 1TG0 A; 3G6E T; 1Y07 A; 4GLK A; 2DX1 A; 2YUP A; 2DK3 A; 3EAE A; 4DEY A; 5FU6 C; 4LDX A; 4IIM A; 1YJ9 T; 3M53 A; 3CPF A; 1VQ6 T; 4M78 F; 4OVA A; 2MI6 A; 5I2S A; 2E4H A; 4EDU A; 2P84 A; 2DM1 A; 1VYT A; 1OUL A; 3ZEH A; 3JCM e; 2QAS A; 2CT4 A; 3M9Q A; 2AIR B; 1LVK A; 4LUE A; 4J9F A; 1IHW A; 4ZTF A; 2AHJ B; 3I56 A; 4J5Y A; 1D3B B; 1NYF A; 2HQX A; 5GAM f; 5L23 A; 4L6V 5; 3JCM f; 2WAC A; 2GNC A; 1S72 T; 1YHQ A; 4JUV A; 1W6X A; 4DBH A; 4X34 A; 1K8A U; 3HKS A; 2X35 A; 2K3X A; 2E70 A; 3BFM A; 2DXT A; 1NLO C; 1WQ7 A; 1JO8 A; 1YP5 A; 2HDA A; 4OMQ A; 2PVG B; 3OW2 P; 4EMK B; 2GTO A; 3OYB A; 4XTU A; 3J7A F; 4J9C A; 5CO7 A; 3LWH A; 2CZ0 B; 4Z02 A; 2XU8 A; 1NYG A; 4JRQ A; 1R8O B; 1S1N A; 1I07 A; 3UF4 A; 1G83 A; 2B86 A; 4JS4 A; 3JCM X; 2GFU A; 2DER A; 1QVG A; 2NUT A; 1IO6 A; 4E6R A; 1VQ8 T; 4BI4 A; 4M7A G; 1TWB A; 1KFZ A; 3GPL A; 1G3W A; 3OY9 A; 1BI2 A; 1RI0 A; 5GMK m; 5I11 A; 5ECA A; 3VRZ A; 2RQT A; 2KDS A; 3ME9 A; 2JUF A; 1ZHI A; 4JZ3 A; 2QA4 Q; 4ME7 A; 2LMJ A; 1QVG S; 4M7A A; 2DD5 A; 3NPF A; 4UC4 A; 1AWX A; 2AT1 B; 1I5L A; 2DLP A; 1ZSG A; 1B34 A; 1I8F A; 1PCX A; 2RQW A; 1KQS A; 2DXB A; 2KI7 A; 1N9S A; 2E12 A; 1VQN Q; 2MOX A; 4MZM A; 1Y0M A; 4XTY A; 2J7I A; 1K9M C; 4NL2 A; 5GAO p; 1X01 A; 5IXB A; 3L2Z A; 3CC7 A; 3DB3 A; 2E65 A; 1MNE A; 2FYK A; 2C06 A; 2MCN A; 2KMT A; 3L2V A; 2E5K A; 3QG1 A; 2EYZ A; 3CCM A; 4KUL A; 1Y7X A; 4E7K A; 2DAQ A; 2WSF E; 2ATC B; 1M27 C; 5GAN 3; 5GAN 5; 2CRE A; 4BAC A; 4IUQ A; 5GAM j; 2DKG A; 2FRW A; 2HMA A; 2NUZ A; 3N5B B; 3TVT A; 2DL3 A; 4AG2 C; 1M1K U; 1CSK A; 1H3H A; 3X20 B; 1Y71 A; 2PVD B; 2RI5 A; 4MML A; 3X25 B; 2EWN A; 2QQR A; 5I2M A; 1WNL A; 3OYI A; 1HJD A; 1KQ1 A; 2X4X A; 2KEA A; 4M7D D; 1VQ4 T; 1ZBJ A; 4JJB A; 2XIC A; 2DTI A; 2EIF A; 3X24 B; 3M0R A; 4LD9 K; 2X3X D; 4OGE A; 2DA9 A; 4AT1 B; 3I5R A; 4B9X A; 5M9O A; 2IPO B; 1KK7 A; 2FVU A; 4ZN3 A; 2QDL A; 2O4X B; 4NS5 A; 3LX7 A; 3CMA Q; 2V1R A; 4ZGD B; 2RM4 A; 2X4Y A; 1WA7 A; 3H6Z A; 1FYN A; 4A4E A; 1WX6 A; 3TSW A; 3OYH A; 1KD1 U; 1GBQ A; 1R0C B; 2QQ9 A; 1B7T A; 1C6V X; 1X27 A; 1RAF B; 3G6E A; 4FSS A; 1Z9Q A; 3H0I A; 1SHF A; 3DKM A; 3NHN A; 1MMD A; 3C12 A; 1YIT T; 3QXE B; 2E64 A; 4LNP A; 1V29 B; 1VQ6 A; 2EAY A; 4LE9 A; 3CD6 T; 2I2L A; 2FB7 A; 3CCQ Q; 3A8H B; 2A37 A; 3M4G A; 3GOX A; 1OYX A; 1KJW A; 2YDL A; 3RDV A; 4J9D A; 3SWN A; 3EGX A; 4M7D A; 1QWF A; 1UFF A; 2GCX A; 1NJI R; 5A0D A; 1UGS B; 2YUO A; 2RJC A; 4PJO G; 3REB B; 2EQK A; 5GMK i; 2OX7 A; 3G4S Q; 4A54 A; 3S3O A; 1VQP A; 3GBQ A; 3QWY A; 3DLL A; 4OF1 A; 5D7U A; 4OGC A; 2YT6 A; 1YIJ T; 5I22 A; 3GNF B; 4AFZ C; 1H3Z A; 2HL3 A; 5D6W A; 3V7S A; 2EKO A; 2J6K A; 5KYU A; 1E6H A; 1S72 A; 2COW A; 3U23 A; 3OYD A; 4OP0 A; 2DL5 A; 1VQK A; 2CT3 A; 3SFM A; 3R6O A; 2E3I A; 4C0D B; 1OPL A; 2Z0W A; 3ZL7 C; 5GAM g; 1VIF A; 1YI2 T; 1GBR A; 1UUE A; 3THK A; 1MMN A; 3CCU Q; 2RO0 A; 2YRD A; 1QVG P; 1MUZ A; 1MV3 A; 3JCM g; 1T0J A; 4N4G A; 1BU1 A; 2SRC A; 4M77 G; 4HVW A; 3L1A A; 5KYY A; 1PD0 A; 4GLM A; 2OTL T; 4HXJ A; 3HPW A; 6AT1 B; 1QLY A; 5A0L A; 1WXB A; 4RTY A; 1GFC A; 3EH1 A; 4AFQ C; 2KYB A; 5D6X A; 2LX9 A; 3VS2 A; 5CKF A; 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