The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
DETGKFLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7F, K60F
rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| total genus |
13
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z9Q A; 1IO6 A; 1B3Q A; 1T3L A; 5IXB A; 3C0C A; 1BBZ A; 2F2V A; 2JM9 A; 1NEG A; 2J6O A; 2YUN A; 3H0H A; 2L3Q A; 3H41 A; 5ECA A; 1W1F A; 4D8K A; 2EYW A; 4J9F A; 4AG2 C; 1UE9 A; 1AWJ A; 3UA6 A; 2EYX A; 2DMO A; 5IHI A; 5L23 A; 2EKH A; 1SPK A; 1WXB A; 2DA9 A; 3REB B; 1WA7 A; 3ULR B; 1SSH A; 5IH2 A; 3EHQ A; 4KRT A; 1MUZ A; 2EYY A; 4Z89 A; 3I5R A; 2O2O A; 3H0I A; 1NEB A; 2DYB A; 1NYG A; 4HCK A; 1G2B A; 1YWO A; 2RQT A; 5IHN A; 1GCQ A; 1PRM C; 2KNB B; 1VYV A; 3VS3 A; 1YNZ A; 1TUD A; 2ECZ A; 2BZX A; 4OMN A; 3QWY A; 4Z8A A; 5IHK A; 1CKA A; 2EPD A; 2KRM A; 1ABO A; 2RQW A; 1QWF A; 1SRL A; 1PKT A; 4F14 A; 2K79 A; 2C0I A; 1PKS A; 2RMO A; 2CUD A; 4OMM A; 2QDL A; 2EW3 A; 3NMZ C; 1WI7 A; 4QT7 A; 2JW4 A; 4WCI A; 2A37 A; 3RBB B; 1B07 A; 4AFU C; 1OOT A; 1PWT A; 1YN8 A; 2OJ2 A; 1E6H A; 3JV3 A; 2FPD A; 1GBR A; 3VS0 A; 2KT1 A; 1FYN A; 2PTK A; 4E6R A; 2KYB A; 2LQN A; 2YDL A; 1FMK A; 1UTI A; 1JO8 A; 2DF6 A; 4OMO A; 4D8D A; 1WX6 A; 3EGU A; 4J9I A; 1G83 A; 1LCK A; 2JT4 A; 1WXU A; 4Y92 A; 2AKK A; 2EYZ A; 4J9G A; 1VA7 A; 2CH4 W; 4LNP A; 1QKX A; 2AK5 A; 2BZY A; 4RUG A; 3KFV A; 3PVL A; 2DLP A; 1TG0 A; 2FPF A; 4CC7 A; 1SHG A; 2HDA A; 4ORZ A; 2OI3 A; 1H3H A; 2NWM A; 2DRM A; 1GFC A; 2DNU A; 2RN8 A; 2LJ1 A; 1BB9 A; 2HCK A; 2EGE A; 2J6F A; 3LH5 A; 3PE0 A; 4X1V A; 4IIO A; 1M3A A; 2YUQ A; 1CKB A; 2DBM A; 5I22 A; 2BTT A; 2PZ1 A; 2A36 A; 2D8J A; 1I1J A; 2C0O A; 2JMA A; 5HCK A; 1U3O A; 2F2X A; 4HVW A; 3UF4 A; 1HD3 A; 1OPK A; 3M0Q A; 4JZ3 A; 1I0C A; 2JS0 A; 1K0X A; 2ABL A; 4RTZ A; 1GL5 A; 2L0A A; 4J9H A; 5I11 A; 1AOJ A; 2W10 A; 2LP5 A; 1I07 A; 2FEI A; 3FJ5 A; 1M3C A; 2A08 A; 1RI9 A; 3A98 A; 3M0T A; 1ZBJ A; 2D1X A; 3M0R A; 1UG1 A; 1UFF A; 2RF0 A; 1AZG B; 1ZLM A; 5EC7 A; 1NG2 A; 1ABQ A; 1X6G A; 4LE9 A; 1S1N A; 2C0T A; 2CRE A; 3I5S A; 1T0J A; 2AZS A; 4R0K A; 4AFQ C; 4GBQ A; 1M30 A; 1PRL C; 2J06 A; 2O88 A; 3PVQ A; 1AZE A; 1E7O A; 2D0N A; 1NLO C; 3EG0 A; 3TSW A; 3M0U A; 3VS2 A; 1UHC A; 4AFZ C; 3NGP A; 2CDT A; 3TSZ A; 2DRK A; 4DEX A; 1SHF A; 2DL4 A; 1UGV A; 1NYF A; 2CT4 A; 4JPB W; 1X2Q A; 2A28 A; 2GTO A; 4A63 B; 1W70 A; 4JJB A; 1QWE A; 2RNA A; 1GCP A; 3REA B; 1K1Z A; 1V1C A; 2DE0 X; 2KXD A; 4J9D A; 2X3W D; 1NM7 A; 4HXJ A; 2DM1 A; 3ZL7 C; 1Y0M A; 1KFZ A; 1X43 A; 1KSW A; 2YUO A; 2CSQ A; 1BK2 A; 1J3T A; 2K6D A; 4RTX A; 2CT3 A; 3M0P A; 3VS5 A; 1U5S A; 1X27 A; 5FWC A; 2RQR A; 2GBQ A; 1A0N B; 1K9A A; 1VYT A; 2E5K A; 2EVR A; 2VWF A; 4JJC A; 2LZ6 B; 1M8M A; 2LJ0 A; 2LNH B; 2XMF A; 4RTT A; 1UJ0 A; 2DIL A; 4ESR A; 4GLM A; 2LCS A; 3I9Q A; 2EGA A; 3UA7 A; 5IXF A; 2PNI A; 3GBQ A; 1HJD A; 2J7I A; 2W0Z A; 1XOV A; 2MIO A; 1SRM A; 2KYM A; 1X6B A; 1WFW A; 2AKL A; 1HSQ A; 3CQT A; 5FW9 A; 1UHF A; 2X3X D; 2MCN A; 3VS6 A; 4JZ4 A; 3IQL A; 1K76 A; 4RTY A; 1RLQ C; 2K2M A; 2GNC A; 2RPN A; 1JU5 C; 1QKW A; 4F16 A; 2DL7 A; 1SEM A; 3I35 A; 3SEM A; 3H0F A; 2KR3 A; 1H92 A; 2AZV A; 4F17 A; 1EFN A; 1T0H A; 1GFD A; 4DEY A; 1MV3 A; 2L3P A; 1M27 C; 1OEB A; 2FRW A; 2DBK A; 2DVJ A; 2JMC A; 2VKN A; 2O31 A; 5FWB A; 3SHW A; 1YWP A; 1ZUK A; 1NLP C; 1VYU A; 2CUB A; 2KEA A; 4FSS A; 2I0N A; 2P4R A; 4RTW A; 3R6N A; 2HSP A; 1UJY A; 1UDL A; 1JQQ A; 2B86 A; 2F2W A; 2JTE A; 2CSI A; 1OPL A; 1K0S A; 4CC4 B; 2HBW A; 4OML A; 3VS4 A; 1BU1 A; 4LN2 A; 1KIK A; 2J6K A; 3VS7 A; 3M0S A; 2FO0 A; 1AD5 A; 3EG1 A; 2JM8 A; 4JJD A; 2H8H A; 1WYX A; 2L3S A; 1X2K A; 1OV3 A; 2LQW A; 2ENM A; 2ROL A; 3EHR A; 1QCF A; 1QLY A; 2KGT A; 4AG1 C; 4RTV A; 2KBT A; 2OAW A; 3THK A; 1TUC A; 1PHT A; 2KRN A; 1E6G A; 2GTJ A; 3TVT A; 1X69 A; 2MOX A; 1M3B A; 1Z9Z A; 2J05 A; 4OMQ A; 2ED1 A; 2DJQ A; 4ZNX A; 1JEG A; 1Y57 A; 2YT6 A; 5GJV B; 1PNJ A; 4IIM A; 2D8H A; 3NHN A; 4CC2 A; 2K7A A; 1K4U S; 2DX1 A; 1ZSG A; 2G6F X; 4AFS C; 1YP5 A; 2BZ8 A; 2V1R A; 4J9E A; 4Z88 A; 3NPF A; 3EG2 A; 2FRY A; 4J9B A; 1JXO A; 2LX7 A; 2KE9 A; 1WXT A; 2ED0 A; 3U23 A; 3VRY A; 1GRI A; 3VRZ A; 1YCS B; 4HVV A; 2JXB A; 2NUZ A; 2KT8 A; 1GCQ C; 2LMJ A; 2SRC A; 4M4Z A; 2JS2 A; 1W6X A; 2RQU A; 1AWX A; 2O9V A; 1UEC A; 3UAT A; 2KXC A; 1JXM A; 4LUD A; 1T3S A; 2GGR A; 1WDX A; 1CSK A; 3VS1 A; 2EQI A; 4OMP A; 5GJW B; 2YSQ A; 4EIK A; 2ESW A; 3QWX X; 1GBQ A; 1H8K A; 2ROT A; 1WIE A; 4CC3 A; 2DL8 A; 2KRO A; 4K11 A; 1AVZ C; 1RUW A; 2V1Q A; 1AEY A; 1UUE A; 1U06 A; 2VVK A; 1AWO A; 1ZUY A; 2YUP A; 2M51 A; 2RQV A; 4J9C A; 2CH4 A; 1MV0 B; 1AWW A; 4LUE A; 2K3B A; 2K9G A; 2IIM A; 1N5Z A; 2EBP A; 2FPE A; 2GQI A; 3EG3 A; 4RTU A; 2L2P A; 2DL3 A; 1ZUU A; 2HEQ A; 3RNJ A; 1KJW A; 2DL5 A; 1RLP C; 1ARK A; 2EGC A; 2O9S A; 1ZX6 A; 4HVU A; 2LJ3 A; 2FG0 A; 2SEM A; 3O5Z A; 1WLP B; 2M0Y A; 2KRS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Z9Q A; 5LJ3 j; 1B3Q A; 1TTH B; 5IXB A; 2JVV A; 2MK5 A; 3FC3 A; 5DM7 R; 2JM9 A; 1NEG A; 2YUN A; 3H41 A; 4D8K A; 1VQK A; 4QVZ A; 1G3T A; 1AWJ A; 5GAN g; 5CKE A; 3URG A; 1RAG B; 3MKD A; 5CVI A; 3PIP A; 3CPW S; 4PJL A; 1G3Y A; 3CBP A; 1RAH B; 3OYY A; 5IH2 A; 4FW2 A; 2LCC A; 2RHU A; 3OMG A; 5KYY B; 1NPR A; 2OTL A; 4FT2 A; 2E3I A; 4NS5 A; 5KE3 A; 2ECZ A; 3QWY A; 2EPD A; 1ABO A; 3CME A; 4HT9 A; 4XU3 A; 1Y07 A; 4P5N A; 2RH2 A; 2QQ9 A; 2C0I A; 1OU9 A; 4M77 A; 2WSC E; 4LDV A; 3NMZ C; 2XU8 A; 5CIU A; 4QQD A; 4HKE A; 4C8Q D; 2X4X A; 4BY6 B; 5LL6 S; 4WCI A; 3CCS T; 1B07 A; 3RKW A; 3PIO A; 1PWT A; 1WHL A; 2FPD A; 2R57 A; 3VS0 A; 2KT1 A; 1FYN A; 2L8D A; 2ZPB B; 2KYB A; 3P8B B; 2HL3 A; 3DB4 A; 1WJQ A; 5LJ5 h; 1FMK A; 4OP0 A; 2JOY A; 4D8D A; 3EGU A; 4VUB A; 1VQM Q; 2RJE A; 4OB0 B; 3LWI A; 2JT4 A; 4M7A D; 5HKC A; 5GAN 7; 1O9S A; 4J9G A; 4LNP A; 1QKX A; 3EFR A; 3VUZ A; 4RUG A; 4X9D A; 2DLP A; 2E6Z A; 4CC7 A; 1SHG A; 1BI3 A; 3RES A; 2F69 A; 4RMO A; 4PJO E; 2OI3 A; 2DRM A; 1D09 B; 2DPP B; 2EGE A; 2J6F A; 1TU0 B; 3PE0 A; 4JRP A; 2CZ0 B; 4IIO A; 1M3A A; 2DVE A; 1CKB A; 2BTT A; 2V26 A; 3UF4 A; 1HD3 A; 4JZ3 A; 5GAO n; 3I56 Q; 1I0C A; 4QVD A; 2QQA A; 1K0X A; 2ABL A; 3HL8 A; 5I11 A; 2PUK B; 5HK3 A; 2CP5 A; 4DBH A; 1S72 Q; 5D6Y A; 1M3C A; 4EMK A; 3A98 A; 3CCS A; 1K9M C; 4FYY B; 2MAM A; 1XTD A; 1ZSZ C; 1ZLM A; 2E12 A; 1PG5 B; 5LJ5 f; 3OW2 P; 4ELY C; 3ASK A; 4LE9 A; 1Y71 A; 2CRE A; 3JCM c; 5GAN e; 3QDR B; 1T0J A; 4R0K A; 3E19 A; 3UWN A; 3V7C A; 1FX7 A; 5IN1 A; 1YIT T; 1KC8 C; 1PRL C; 2VUB A; 4FL6 A; 2K5L A; 1PSE A; 1NLO C; 3OYB A; 5KYU B; 2RHX A; 3PNW C; 3HRS A; 3M0U A; 1D1A A; 3NGP A; 2CDT A; 3FB9 A; 3TSZ A; 2DRK A; 4RCB A; 5GAO q; 2RHY A; 4C0D B; 3JCM d; 5KYN A; 1KQS A; 2CT4 A; 4JPB W; 1X2Q A; 2K4Y A; 3X20 B; 1TSF A; 2A28 A; 1W70 A; 2COY A; 4TVR A; 2EJ9 A; 1V1C A; 1WHK A; 2YHT A; 2KXD A; 4M7D B; 1H64 1; 4Q5W A; 3CCQ T; 5KYY A; 1VQP Q; 4XU1 A; 4BI4 A; 2DD5 A; 1BK2 A; 4RTX A; 4L59 A; 2XDB A; 3JCM W; 3LX7 A; 2M16 A; 3A8L B; 3JB9 D; 3PGG A; 1YHQ Q; 3QZ5 B; 1NJI R; 1A0N B; 1K9A A; 1VYT A; 2E5K A; 2VWF A; 4JJC A; 5CR2 A; 2LZ6 B; 2XMF A; 2LJ0 A; 5FLX E; 2LRQ A; 2QQS A; 2DIL A; 4GLM A; 1YIT A; 4M78 G; 1AT1 B; 1UGQ B; 3G7Z A; 3WVE B; 2EGA A; 5GAN f; 2PNI A; 3GBQ A; 1LOJ A; 4PJN A; 1OUL A; 3I55 Q; 3M4G A; 4XK8 E; 2LQ8 A; 1M4Z A; 1XOV A; 3M4Y A; 4M77 C; 1X6B A; 3A1P A; 1N8R C; 1C0M A; 3X25 B; 1HSQ A; 3LYI A; 1G3S A; 1KD1 R; 3EG9 B; 2YRV A; 4IUU A; 3E9F A; 1OZ2 A; 2MCN A; 2KDS A; 3CCQ A; 3FJP A; 4LDW A; 2RM4 A; 1RLQ C; 2A7Y A; 4DOW A; 3OW2 S; 2K2M A; 3SWN B; 1W2B P; 3CMA T; 4M75 D; 1SEM A; 3I35 A; 1VQ4 Q; 1JB0 E; 2VGM A; 1H92 A; 1BCM A; 1T0H A; 3CD6 Q; 1GFD A; 4DEY A; 4MZT A; 2HZY A; 2FRW A; 2JMC A; 1KQ2 A; 2D9T A; 1YWP A; 2E41 A; 1NLP C; 2QA4 Q; 5GAN 4; 2KEA A; 2I0N A; 2P4R A; 4RTW A; 2HSP A; 2G3R A; 2L89 A; 1EIF A; 2BE7 D; 2B86 A; 2F2W A; 3CCL T; 4M78 C; 2CSI A; 1M1K U; 2NUP B; 4OML A; 3VS4 A; 1BU1 A; 4C92 B; 3VS7 A; 4QQG A; 3M58 A; 5KYW B; 3M0S A; 1AD5 A; 8AT1 B; 1ZQ1 A; 5D7U A; 4ZN3 A; 2JM8 A; 2BKD N; 1X2K A; 4EMH A; 4ZN1 A; 5KYU A; 3ME9 A; 2ZPI B; 4J83 A; 1QCF A; 2KGT A; 2HBP A; 2LCL A; 4Z02 A; 2M1H A; 3A8M B; 3M57 A; 1TUC A; 2GTJ A; 3C12 A; 1Q7Y R; 3CMA A; 2K5F A; 1M3B A; 1WZO A; 2CP0 A; 5J3B A; 2X4Y A; 4E7Z A; 1Y57 A; 2YT6 A; 2D8H A; 3LGF A; 3JB9 J; 2EKO A; 2JN0 A; 4PFO A; 1ZSG A; 2G6F X; 5L8R E; 4AFS C; 1QCO A; 4M7D A; 1YP5 A; 2V1R A; 1VQ5 T; 2DK3 A; 3BE3 A; 3N5B B; 2JTF A; 4J6Y A; 4FU6 A; 2QAS A; 1JJ2 P; 2FRY A; 1RAE B; 3QG1 A; 3QDF A; 2LVM A; 2KE9 A; 1YI2 T; 1WXT A; 3L42 A; 3U23 A; 4OB1 B; 1I8F A; 3CCL A; 3CXC A; 2KT8 A; 3GNG A; 1GCQ C; 1OYX A; 2SRC A; 2RQU A; 1AWX A; 2O9V A; 1U1S A; 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4OMN A; 4PLI A; 2KRM A; 1VQP T; 1SRL A; 1D0X A; 4ATO A; 2RB6 A; 2XG8 D; 5KCO A; 3LGL A; 4DBQ A; 3PFS A; 3V8K A; 1WI7 A; 4O6J A; 5GAN 3; 2DXT A; 1XJW B; 3L2W A; 1YHQ T; 3V7S A; 2KVQ G; 2A37 A; 2DIQ A; 2OJ2 A; 2E4H A; 3MEU A; 1GBR A; 4M7D C; 2LQN A; 4HCC A; 2LT4 A; 2DF6 A; 1R0B G; 4OMO A; 3RDV A; 2DTH A; 4M77 E; 1LCK A; 1M2V B; 3RUX A; 3I55 T; 3CMA Q; 2EYZ A; 1VA7 A; 1R77 A; 3MP1 A; 2EQJ A; 3KFV A; 3GP8 A; 4C0F A; 3QO3 A; 5FU6 B; 2FL7 A; 1H3H A; 3SB2 A; 2NWM A; 1VQ8 T; 1GFC A; 1M5Q 1; 2DNU A; 3LH5 A; 3QII A; 3JCM h; 2VB6 A; 2DBM A; 3G71 T; 2D8J A; 1I1J A; 1VQP A; 2HMA A; 4HVW A; 1TH7 A; 2Y4X A; 4FT4 A; 3AHU A; 2KSS A; 2JS0 A; 1WHM A; 4RTZ A; 2F1L A; 4J9H A; 1VQ4 T; 1I07 A; 2FEI A; 3L2U A; 2YRC A; 3EGX A; 1YHQ A; 1Y96 A; 1NJI U; 1WPY A; 3CD6 T; 1WHH A; 4PJO F; 3EH1 A; 4J7F A; 4E7H A; 5EC7 A; 1D0Y A; 3V7R A; 2RJD A; 2QEX Q; 1S1N A; 1KK7 A; 3I5S A; 4M78 E; 3SWN C; 2QA4 T; 1VIF A; 3CCU Q; 3QSU A; 2O88 A; 3I55 A; 3EG0 A; 3J80 E; 4AFZ C; 4L5G A; 1VQ8 A; 3JCM f; 3MCA B; 1EX4 A; 4DBR A; 2XKO C; 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