The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
61
|
structure length |
61
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Chain Sequence |
SEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the human Hck SH3 domain and identification of its ligand binding site.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMATOPOIETIC CELL KINASE
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1998-03-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0T A; 2DM1 A; 1K4U S; 3TSZ A; 4HXJ A; 5I11 A; 1GRI A; 1RLP C; 3REA B; 2BZY A; 3TSW A; 2HBW A; 2K3B A; 2FPD A; 4ZNX A; 3SHW A; 1ZUU A; 1OEB A; 1AWJ A; 3RBB B; 1I07 A; 4E6R A; 2LJ1 A; 2O31 A; 5IHN A; 2LZ6 B; 1W1F A; 4RTW A; 1Y57 A; 3I35 A; 1ZBJ A; 4RTU A; 3VS5 A; 2KRO A; 4F16 A; 2DL4 A; 1ZUY A; 2J6K A; 1N5Z A; 5I22 A; 1CKA A; 4IIO A; 1WI7 A; 3JV3 A; 4LN2 A; 5IH2 A; 1AWX A; 2O9S A; 2LCS A; 2I0N A; 1JU5 C; 3NGP A; 2YUO A; 3EGU A; 3UA7 A; 1WIE A; 1AWO A; 2EVR A; 2A37 A; 2CH4 A; 2LJ0 A; 2AZV A; 4M4Z A; 2DBM A; 3UA6 A; 1OOT A; 1JQQ A; 4CC3 A; 3EG2 A; 1UFF A; 3QWY A; 1GFD A; 1TG0 A; 1NYG A; 2J6O A; 5GJW B; 2DL5 A; 2L2P A; 1ZUK A; 2SEM A; 1WYX A; 2FG0 A; 2X3X D; 1OPK A; 3H41 A; 2KNB B; 3EG1 A; 1M8M A; 3H0I A; 2D1X A; 3H0F A; 2LX7 A; 4J9F A; 1K1Z A; 1VYV A; 4ORZ A; 1NLO C; 1QKX A; 2PNI A; 2FRY A; 1E6G A; 2DL7 A; 2KRS A; 4RUG A; 1U3O A; 1WFW A; 3THK A; 4OML A; 1H3H A; 1LCK A; 1FMK A; 4Z8A A; 2ED1 A; 2RN8 A; 2C0T A; 1XOV A; 2JM8 A; 2KE9 A; 4Z89 A; 3VS7 A; 2CSI A; 2KYB A; 1CKB A; 5IXF A; 4J9E A; 2EKH A; 1BK2 A; 1Y0M A; 1NEB A; 1FYN A; 1VYU A; 3PE0 A; 2ESW A; 2FRW A; 2K9G A; 3VS1 A; 2DRK A; 2VKN A; 4D8D A; 2AKK A; 4AG2 C; 4OMM A; 2J05 A; 3R6N A; 1HJD A; 1X2K A; 1UGV A; 4JJB A; 3M0Q A; 3KFV A; 2CRE A; 2ROL A; 1HSQ A; 2ENM A; 2L3S A; 2M51 A; 5L23 A; 2L0A A; 1JXM A; 1PKS A; 4J9G A; 1AEY A; 1SPK A; 2CSQ A; 1KJW A; 1U5S A; 2DRM A; 2PTK A; 2YSQ A; 4K11 A; 4IIM A; 3RNJ A; 2EYZ A; 2ECZ A; 2JTE A; 2O2O A; 2CUD A; 2PZ1 A; 3VRZ A; 4J9B A; 1YNZ A; 4AFZ C; 1M3A A; 2C0O A; 4F17 A; 2J7I A; 1OV3 A; 2JT4 A; 3U23 A; 1UJ0 A; 4J9C A; 2MCN A; 2KGT A; 4JJD A; 2RNA A; 2ED0 A; 1JO8 A; 3CQT A; 2EYY A; 2GTO A; 3UAT A; 1TUC A; 1RLQ C; 2O88 A; 1T0H A; 1UUE A; 2AK5 A; 2V1Q A; 2VWF A; 2JS0 A; 3LH5 A; 1X27 A; 3UF4 A; 4FSS A; 4Z88 A; 2DL3 A; 1GCQ A; 1E7O A; 2EGA A; 2K7A A; 1BU1 A; 2K2M A; 2D0N A; 4DEY A; 5FWB A; 3C0C A; 1T0J A; 3M0S A; 2GQI A; 1H8K A; 3EG0 A; 1EFN A; 1AD5 A; 2JMA A; 1M27 C; 2BTT A; 3ZL7 C; 4WCI A; 2CUB A; 2RF0 A; 2JMC A; 2K79 A; 2HCK A; 4OMO A; 2BZX A; 2DBK A; 4RTV A; 4D8K A; 1TUD A; 4JZ4 A; 2DA9 A; 2F2W A; 4LE9 A; 4AG1 C; 3VS0 A; 2P4R A; 3ULR B; 2ROT A; 1UJY A; 3M0P A; 1QKW A; 2GBQ A; 1WXT A; 4HVV A; 3VS3 A; 2DLP A; 1MV0 B; 1RI9 A; 2K6D A; 2A36 A; 1UEC A; 4JPB W; 2EYX A; 2SRC A; 2EPD A; 1K0S A; 3SEM A; 4JZ3 A; 4R0K A; 1UHC A; 4A63 B; 1KFZ A; 3I5S A; 2CT4 A; 2FPE A; 4OMQ A; 3GBQ A; 5IHI A; 1WXU A; 4AFU C; 1K76 A; 2NWM A; 3PVL A; 1G2B A; 2KYM A; 2QDL A; 2EGE A; 2F2V A; 2D8H A; 1YCS B; 4AFQ C; 2GNC A; 3H0H A; 1IO6 A; 2GGR A; 1GFC A; 1AZG B; 1M3C A; 1OPL A; 4RTY A; 2LQN A; 1NEG A; 2DMO A; 1MV3 A; 2KRN A; 2LNH B; 2RQW A; 5GJV B; 1ABQ A; 4OMN A; 3NHN A; 1T3L A; 1S1N A; 1YP5 A; 1X6B A; 2LP5 A; 2O9V A; 1RUW A; 3M0R A; 2DYB A; 1UE9 A; 1YN8 A; 1I0C A; 1A0N B; 5ECA A; 3QWX X; 1ZLM A; 2GTJ A; 5FW9 A; 1GBQ A; 1AWW A; 2MIO A; 2D8J A; 4HVW A; 1U06 A; 1W6X A; 2E5K A; 2C0I A; 2EBP A; 1UHF A; 4J9D A; 1E6H A; 2J06 A; 1VYT A; 4KRT A; 1UDL A; 1SRM A; 2YDL A; 1ZSG A; 3A98 A; 3NMZ C; 2KT1 A; 2RQU A; 1VA7 A; 1SHG A; 1K0X A; 3PVQ A; 1B3Q A; 3VRY A; 3IQL A; 1SRL A; 5HCK A; 1WXB A; 2EGC A; 1SSH A; 4QT7 A; 1KIK A; 2AKL A; 4GLM A; 1X69 A; 2BZ8 A; 2OJ2 A; 5FWC A; 2KT8 A; 2L3P A; 4RTZ A; 2IIM A; 2KEA A; 2HEQ A; 4EIK A; 4HCK A; 4AFS C; 1CSK A; 4JJC A; 2YT6 A; 1G83 A; 1UG1 A; 1WX6 A; 4RTX A; 4CC7 A; 1BB9 A; 2LJ3 A; 1QWF A; 2HSP A; 3M0U A; 2OI3 A; 4J9I A; 1JXO A; 2RQV A; 2JS2 A; 4RTT A; 1ABO A; 1PKT A; 2FPF A; 4DEX A; 1AZE A; 1YWP A; 2DX1 A; 3I5R A; 1NYF A; 3VS2 A; 4F14 A; 1T3S A; 2DIL A; 2LQW A; 1AVZ C; 1WDX A; 4CC4 B; 2EW3 A; 1MUZ A; 2DNU A; 2W0Z A; 1M30 A; 4LUE A; 2KXD A; 1NM7 A; 1X6G A; 1UTI A; 2KBT A; 1GCQ C; 1SHF A; 1ARK A; 1W70 A; 2DF6 A; 1Z9Q A; 2H8H A; 2JM9 A; 2YUQ A; 2DL8 A; 1WLP B; 2CDT A; 1HD3 A; 1BBZ A; 3NPF A; 1QCF A; 1I1J A; 1NLP C; 1X43 A; 1SEM A; 2G6F X; 2FO0 A; 2W10 A; 3EHR A; 2OAW A; 2YUP A; 4LUD A; 2RPN A; 5IXB A; 4J9H A; 2A08 A; 1M3B A; 1ZX6 A; 2HDA A; 2RQR A; 2M0Y A; 1GL5 A; 3EG3 A; 2DJQ A; 1GBR A; 1QWE A; 1PRM C; 2EQI A; 2A28 A; 2DE0 X; 1H92 A; 1PHT A; 1WA7 A; 1V1C A; 1PRL C; 1B07 A; 2RMO A; 4CC2 A; 2B86 A; 1AOJ A; 2JW4 A; 2EYW A; 2RQT A; 2V1R A; 1KSW A; 4X1V A; 2YUN A; 2KXC A; 2KRM A; 2AZS A; 2KR3 A; 3O5Z A; 2XMF A; 2FEI A; 5EC7 A; 1X2Q A; 1GCP A; 2NUZ A; 2F2X A; 1PNJ A; 2MOX A; 5IHK A; 1PWT A; 3I9Q A; 1YWO A; 2CT3 A; 4HVU A; 4LNP A; 4Y92 A; 1Z9Z A; 2LMJ A; 4GBQ A; 3TVT A; 2DVJ A; 4OMP A; 2CH4 W; 2J6F A; 2ABL A; 1QLY A; 3REB B; 1JEG A; 2JXB A; 1K9A A; 3VS4 A; 2X3W D; 1J3T A; 1NG2 A; 3FJ5 A; 2VVK A; 4ESR A; 3EHQ A; 3VS6 A; 2L3Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CME Q; 1G8X A; 3M0T A; 1JRI A; 1R0C B; 2DM1 A; 4FYW B; 3TSZ A; 4M7D E; 4HXJ A; 1GRI A; 2VB6 A; 2BZY A; 2JOY A; 3TSW A; 4J6X A; 1Q82 U; 1UGR B; 3PFS A; 1ZUU A; 3DLM A; 3JCM P; 4QQD A; 2O31 A; 4CRI A; 1NE8 A; 3LYI A; 1KG1 A; 1BKB A; 1D0Z A; 4M75 D; 1ZUY A; 2J6K A; 2ZPG B; 5GAM e; 5I2S A; 3RER A; 2OTJ A; 2QTV A; 1WI7 A; 4LN2 A; 2EJG A; 3WXM B; 4OP0 A; 2LCS A; 2I0N A; 1JU5 C; 1QQJ A; 1WJS A; 4KUI A; 1WIE A; 1YIT A; 1Y07 A; 2EVR A; 1PSF A; 6AT1 B; 2PUK B; 4X9D A; 2LJ0 A; 1SSF A; 4M4Z A; 1P92 A; 3MEA A; 3CD6 A; 3RKX A; 3QKJ A; 1D0X A; 4LDV A; 4JRQ A; 3QDF A; 3QWY A; 1GFD A; 3UT1 A; 1VQ9 A; 3V7R A; 2YHT A; 1AT1 B; 3HRT A; 2DL5 A; 2GFU A; 1M8V A; 1WYX A; 2CS7 A; 5GAN j; 4MZM A; 1M1G A; 2HD0 A; 2KNB B; 3H9N A; 3EG1 A; 4DA4 A; 2D1X A; 3CXC P; 1YIT T; 3QJY A; 1NLO C; 1QKX A; 2DIG A; 1U3O A; 2XK0 A; 3G71 A; 3CD6 T; 2E64 A; 2L8D A; 4Z8A A; 5D6X A; 1MND A; 2MWP A; 4XQ3 A; 2C0T A; 4DOW A; 1N27 A; 1XOV A; 3OYJ A; 2E10 A; 2CSI A; 2KYB A; 1VQ9 T; 1RAD B; 2EKH A; 2HQE A; 2K5I A; 2EQU A; 4BAC A; 1RAB B; 4DQ2 A; 2ESW A; 4J7F A; 5GAO l; 1PC0 A; 4P5N A; 2AKK A; 3L2W A; 4AG2 C; 1JJ2 S; 1QVG A; 4F7U G; 1ZHI A; 4C8Q E; 2RHZ A; 1D0Y A; 3M4Y A; 1VQO A; 2RHI A; 2CRE A; 3FLG A; 3QG1 A; 2ROL A; 3G71 T; 4XTU A; 4M78 A; 4JS5 A; 2L0A A; 1PKS A; 2CSQ A; 5DY9 A; 1KJW A; 2CYZ B; 2DRM A; 2YSQ A; 4YTL A; 4IIM A; 3RNJ A; 2P0P A; 4PFO A; 3URG A; 3OYE A; 5LJ3 f; 2FVU A; 3OYI A; 3NTI A; 3HL8 A; 4AFZ C; 2C0O A; 2QEX Q; 4RG8 A; 1VQO T; 1QVF S; 2VC8 A; 5CO7 A; 1YIJ Q; 2VXE A; 1UJ0 A; 3CCV Q; 1EX4 A; 1KD1 C; 3CQT A; 3E9G A; 1V29 B; 4GY5 A; 1BIB A; 1R8O B; 1T0H A; 5GAN 4; 4NS5 A; 3O8V A; 1UUE A; 3LH5 A; 2JJ9 A; 4HA8 A; 2HSE B; 3OW2 P; 2QQB A; 3CCJ Q; 5GAN d; 3S6W A; 4ZN3 A; 2XID A; 4FT4 A; 1VOM A; 2EJ9 A; 4IUP A; 2R5M A; 5FRN A; 4MZP A; 1T0J A; 3LWH A; 4BDZ A; 2JMA A; 5GAO q; 3ZL7 C; 1YJN Q; 2Y4Y A; 1UGQ B; 2JMC A; 2K79 A; 1O9S A; 4DBQ A; 2BZX A; 4D8K A; 1FXX A; 1VQ7 A; 1K8A C; 3VS0 A; 2CZ0 B; 1JBM A; 1HXD A; 2NUP B; 1UJY A; 5GMK m; 3I56 Q; 4JDS A; 4MDW A; 3ZEH A; 1SKU B; 3A1P A; 2ZPE B; 2QA4 Q; 2P4T A; 1OQK A; 1MHN A; 2F1L A; 3SEM A; 3QYH B; 3E9F A; 3EAE A; 1UHC A; 2DK3 A; 4C5G A; 1OI1 A; 2FPE A; 1VQ7 T; 4M7A B; 1K76 A; 1G2B A; 4BB7 A; 3OYY A; 2EFI A; 4Q5W A; 3RDV A; 2EGE A; 2JUF A; 3CXC S; 1WNL A; 2GNC A; 3OYG A; 4Z02 A; 2JVV A; 4C0F A; 5CK9 A; 3X20 B; 1GFC A; 2MI6 A; 3VJP A; 5GAN 6; 1M3C A; 3CCR A; 4RTY A; 2NUT A; 1YHQ A; 3OS5 A; 1MV3 A; 3V8L A; 2KRN A; 2X35 A; 2VXF A; 4PL6 A; 1IHV A; 1WHM A; 3NHN A; 1WHH A; 4NL3 A; 1S1N A; 4M7A A; 2DTI A; 2LQK A; 1C6V X; 3M0R A; 2DYB A; 5GMK j; 3A8L B; 2CP7 A; 2E3I A; 3GPL A; 1U1T A; 2IG0 A; 3QWX X; 3OQ5 A; 5CQY A; 1GBQ A; 4XU2 A; 3QUI A; 1EZZ B; 4CI0 C; 2E5K A; 3A5Z B; 3CCR T; 2EBP A; 1YHQ T; 3JB9 J; 3JCM V; 4FL6 A; 3JCM W; 4C0G A; 3QZ9 B; 2RHX A; 3OYD A; 3CC7 Q; 1VA7 A; 2QAZ A; 3PVQ A; 3VRY A; 1ZSZ B; 1SRL A; 3IQL A; 1WXB A; 3HFO A; 4QT7 A; 1KIK A; 2E41 A; 1H3Z A; 1X69 A; 5GMK i; 3BDL A; 2BZ8 A; 2L3P A; 2M9U A; 3C4S A; 4AFS C; 1MMD A; 2E1H A; 4JJC A; 2YT6 A; 1UG1 A; 2QQA A; 3QII A; 2QI2 A; 2EJF A; 2LJ3 A; 3M0U A; 4HCZ A; 4EMK A; 1PD0 A; 1U8R A; 3AT1 B; 1D3B B; 1PKT A; 2A3L A; 3ASK A; 4MMK A; 3OW2 S; 3J80 E; 4ZGE B; 4FIB A; 5GAM j; 1UGP B; 2DIL A; 4J7I A; 2DXU A; 1W2B A; 2EW3 A; 4EMH A; 2HQX A; 1MUZ A; 3G6E A; 3CCE A; 1X6G A; 3OSS C; 4C92 A; 3PMI A; 1VQK A; 1Z9Q A; 1UEB A; 2JM9 A; 3CC2 A; 1M2V B; 2CKK A; 1PSE A; 1WLP B; 3NPF A; 1ZA1 B; 3V8K A; 1NJI R; 1NLP C; 1X43 A; 4M7D C; 2FO0 A; 3CBO A; 2OAW A; 3HRS A; 2YUP A; 4LUD A; 1LPL A; 3G6E T; 3CCE T; 4C0D B; 1YIT Q; 1ZBX A; 4ZN1 A; 1K73 C; 3QZ5 B; 2VUB A; 4XTX A; 1M3B A; 1ZX6 A; 3CD6 Q; 1VQK T; 4KGV B; 4AT1 B; 3CC2 T; 3ZFJ A; 2HQH A; 2DJQ A; 8ATC B; 1YIJ A; 3EFR A; 3V7C A; 4DBR A; 1VQ9 Q; 1KC8 U; 3LGL A; 2E12 A; 4DBF A; 1H64 1; 1KSW A; 3QXE B; 2AZS A; 1M1K C; 5EC7 A; 2OTL T; 1X2Q A; 1GCP A; 3QO3 A; 2MOX A; 2QTX A; 1MMA A; 3DLL A; 1IXD A; 3G71 Q; 3GNG A; 4F7U B; 4GBQ A; 4EDU A; 2FYK A; 2E3H A; 4L59 A; 5GMK l; 2ABL A; 2F5K A; 3M5A A; 1RAF B; 1TOV A; 5GAM d; 1J3T A; 1NG2 A; 3OB9 A; 5CVI A; 4KGZ B; 2HL5 C; 4E7L A; 1Q81 C; 5FU6 C; 1X01 A; 2L3Q A; 3RUX A; 1NJI C; 1K4U S; 1VQO Q; 1RLP C; 2CP6 A; 2DAQ A; 3N5B B; 4M7D G; 2HBW A; 3JCM f; 2DYI A; 1AWJ A; 4QW2 A; 3RBB B; 1I07 A; 4E6R A; 2EKO A; 1QP3 A; 2HZY A; 3LX7 A; 1W1F A; 5GAN 5; 4OF1 A; 1Y57 A; 1Y96 B; 2OAU A; 4RTU A; 4F16 A; 3BDU A; 1SG5 A; 3GLX A; 5CKD A; 4X34 A; 3MKD A; 4C8Q C; 1CKA A; 3JCM g; 1BI3 A; 1AWX A; 3SWN C; 3MO8 A; 2YUO A; 4E7H A; 5A0L A; 4WTO B; 1AWO A; 2A37 A; 2B8A A; 2CH4 A; 2MK5 A; 5FU7 B; 1OOT A; 5LJ3 h; 3JB9 I; 1JQQ A; 2FHD A; 4CC3 A; 4EMK C; 4M77 A; 4BUG A; 5A0G A; 2SEM A; 1YBY A; 3TQ7 P; 2KDS A; 4M78 E; 3WVD B; 2P0Q A; 1RAI B; 2DL7 A; 3SB2 A; 2KRS A; 4RUG A; 1WFW A; 4QQG A; 3THK A; 1LCK A; 1MGQ A; 2ED1 A; 2QG9 B; 3M53 A; 2EAY A; 2JM8 A; 1PG5 B; 1VQ7 Q; 4N0A C; 4J9E A; 1NEB A; 1ZA2 B; 3EGD A; 1KHC A; 4D8D A; 1N9R A; 5HKC A; 2RJC A; 1XQH A; 2RM4 A; 4EMG A; 3JAM E; 1UGV A; 1OZ2 A; 4FU6 A; 1VQ6 A; 1Q95 G; 1HSQ A; 4C8Q G; 3V8J A; 1NZ9 A; 4DBH A; 4J9G A; 1SPK A; 1U5S A; 3VKI A; 4M75 B; 4K11 A; 1I5O B; 3JCM c; 1KD1 U; 5GAN f; 1I5L A; 4R55 A; 4XU0 A; 2DXT A; 1N6A A; 2KSS A; 2DEU A; 3VRZ A; 2GFA A; 3EFO B; 2J7I A; 1VQ6 T; 3CCR Q; 4KUL A; 1YHQ Q; 1OUL A; 4A54 A; 1KHI A; 2QQ9 A; 2MCN A; 3FRN A; 3S3M A; 2COY A; 2ED0 A; 2EYY A; 2XIC A; 5I2M A; 1VIF A; 3UAT A; 1TUC A; 2O88 A; 2AK5 A; 1W4S A; 2HKN A; 2JS0 A; 1X27 A; 4KH0 B; 3UF4 A; 4ELZ C; 2CP2 A; 1N8R U; 4LXC A; 1E7O A; 2ZPH B; 1X75 C; 2LDM A; 3EFS A; 3JB9 H; 1UGS B; 1BU1 A; 4J8O A; 4B9X A; 1K8A U; 3LLR A; 3Q1J A; 2LCL A; 5CKF A; 2E70 A; 1R0B G; 1OZ3 A; 3RMQ A; 3M0S A; 2GQI A; 1H8K A; 2ATC B; 3LH0 A; 3CCL A; 4WCI A; 3MHX A; 2CUB A; 4RTV A; 1Q7Y R; 2DBK A; 2KVQ G; 1R77 A; 5HY6 A; 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