The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Binding Mechanism of the N-Terminal SH3 Domain of CrkII and Proline-Rich Motifs in cAbl.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
10
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PTK A; 1HSQ A; 2LJ3 A; 2EPD A; 2RMO A; 4AG2 C; 1K4U S; 1HD3 A; 3EHR A; 1WX6 A; 2JM8 A; 1T0J A; 3EG1 A; 2DYB A; 1ABQ A; 1ZBJ A; 2O9V A; 1AWX A; 2L2P A; 3I5S A; 1MV3 A; 2VVK A; 3TSZ A; 2RQV A; 1ZX6 A; 4DEX A; 4LN2 A; 2RQU A; 2K3B A; 1H92 A; 3LH5 A; 3REA B; 2FEI A; 1T3S A; 4ORZ A; 4LUD A; 4HVU A; 4JJC A; 2W10 A; 3UF4 A; 4CC2 A; 2EKH A; 5GJW B; 1WA7 A; 3UA6 A; 2AZS A; 2EVR A; 2EGA A; 2A28 A; 1NYG A; 1M30 A; 3SEM A; 3THK A; 1W6X A; 2V1R A; 1WXU A; 2DL3 A; 1TUC A; 4F14 A; 2AK5 A; 4OMN A; 2JM9 A; 3C0C A; 5EC7 A; 1PHT A; 2MOX A; 3NGP A; 1GCQ C; 2DRK A; 2OAW A; 1AWJ A; 1UEC A; 2DL5 A; 2DMO A; 1X2Q A; 2ECZ A; 3M0T A; 1MV0 B; 1UTI A; 2DL8 A; 4J9E A; 4OMQ A; 3VS4 A; 1J3T A; 1AOJ A; 2JT4 A; 2CT4 A; 2RQT A; 3VS5 A; 3EHQ A; 3UA7 A; 4D8D A; 1Y57 A; 1GBQ A; 1PKT A; 2RF0 A; 3M0U A; 2H8H A; 2EGC A; 5FW9 A; 1WFW A; 1OEB A; 4K11 A; 1UG1 A; 2RNA A; 1IO6 A; 2LX7 A; 3PE0 A; 2RQW A; 2D1X A; 2F2X A; 2AKL A; 2GNC A; 2DBM A; 1ZLM A; 1GCP A; 4CC3 A; 3REB B; 2LP5 A; 5IHN A; 1VYV A; 1ZUU A; 2O88 A; 2YUP A; 1T3L A; 1GL5 A; 2EYW A; 3M0S A; 3NMZ C; 2LJ0 A; 1NM7 A; 2J6F A; 1KIK A; 1AEY A; 2PZ1 A; 4LNP A; 2D0N A; 2LQN A; 1WYX A; 1U06 A; 1N5Z A; 2CUB A; 2DA9 A; 3EG0 A; 2SRC A; 2LNH B; 3IQL A; 4GBQ A; 4OML A; 3I9Q A; 2E5K A; 1SHG A; 4RTZ A; 5I11 A; 4DEY A; 1M3B A; 1PRM C; 2K9G A; 1ZUK A; 2HDA A; 2A36 A; 2YUO A; 2HEQ A; 4LUE A; 2LMJ A; 3EGU A; 2G6F X; 1M8M A; 4R0K A; 1A0N B; 1B3Q A; 2ESW A; 2KRO A; 2JW4 A; 2J05 A; 1KFZ A; 4D8K A; 2CUD A; 4HXJ A; 4F17 A; 1QWF A; 4J9F A; 3VS7 A; 2DE0 X; 4CC7 A; 1I0C A; 2YSQ A; 2EW3 A; 3QWX X; 1WIE A; 4HCK A; 2VWF A; 1WXT A; 5HCK A; 1HJD A; 1WI7 A; 1AWO A; 3PVL A; 2AKK A; 1G2B A; 1K76 A; 3M0R A; 2O31 A; 2LCS A; 1X6G A; 2KR3 A; 4WCI A; 3GBQ A; 2KT8 A; 1NG2 A; 2DRM A; 2FG0 A; 2DNU A; 2J06 A; 1KJW A; 1OV3 A; 2NWM A; 2JMA A; 5IHI A; 1SRL A; 4J9B A; 4X1V A; 2EYX A; 3A98 A; 2NUZ A; 1GFC A; 4IIM A; 1ZUY A; 2DF6 A; 2DJQ A; 1YP5 A; 2RPN A; 1W70 A; 1X2K A; 1RLQ C; 2MCN A; 4J9I A; 3VS6 A; 2GTO A; 1YWP A; 2W0Z A; 4J9C A; 1CKA A; 4F16 A; 2KGT A; 2CSI A; 2KRM A; 3SHW A; 2O2O A; 1OPK A; 4JJB A; 3ZL7 C; 1OOT A; 4RTV A; 1H8K A; 3ULR B; 1AZE A; 5I22 A; 2DX1 A; 1GFD A; 1X69 A; 2FO0 A; 2KBT A; 1WXB A; 3I5R A; 2JMC A; 2DL4 A; 3CQT A; 3TVT A; 5L23 A; 2CH4 W; 5IH2 A; 1M27 C; 3QWY A; 4LE9 A; 2CH4 A; 4Z88 A; 1UJ0 A; 1GBR A; 5IXF A; 2KXC A; 1ARK A; 4M4Z A; 2P4R A; 2CRE A; 2JTE A; 4ZNX A; 1M3A A; 1JQQ A; 2ABL A; 2L3Q A; 2GTJ A; 1AWW A; 3VS2 A; 2K7A A; 1RLP C; 2K79 A; 2ED0 A; 2AZV A; 4HVW A; 1YCS B; 2KRN A; 2KYB A; 1SEM A; 3VS0 A; 3M0Q A; 1QLY A; 1BU1 A; 1PKS A; 2F2V A; 1NEG A; 1QKX A; 2ENM A; 4AFQ C; 2EYZ A; 1UUE A; 1NEB A; 4E6R A; 4AFZ C; 2B86 A; 1AD5 A; 2KE9 A; 2L0A A; 2L3P A; 2FPD A; 3UAT A; 1K1Z A; 1E6H A; 1GRI A; 2EGE A; 1JEG A; 2J7I A; 2HSP A; 3H0F A; 2EBP A; 2MIO A; 2ROT A; 1FMK A; 5IHK A; 2BZ8 A; 1TUD A; 4RTT A; 2DBK A; 2SEM A; 2YUQ A; 1B07 A; 1NLP C; 2OJ2 A; 1JXM A; 2J6K A; 3RNJ A; 2K2M A; 2OI3 A; 2GBQ A; 2FRW A; 1M3C A; 4HVV A; 2M51 A; 4RUG A; 2YUN A; 2KNB B; 1X43 A; 2JS2 A; 3KFV A; 1S1N A; 3O5Z A; 2F2W A; 1T0H A; 5GJV B; 3VS3 A; 1K0S A; 1V1C A; 4JZ4 A; 2L3S A; 2DL7 A; 4AFU C; 1BK2 A; 2DLP A; 2A37 A; 3H0I A; 2DVJ A; 4CC4 B; 2KT1 A; 4JPB W; 1H3H A; 1VYU A; 1JO8 A; 1AZG B; 4Z8A A; 4Y92 A; 1U3O A; 3I35 A; 2GGR A; 2BTT A; 2DM1 A; 1CSK A; 1TG0 A; 2KEA A; 1JXO A; 3NHN A; 1SPK A; 1YNZ A; 1RUW A; 1FYN A; 4Z89 A; 1Y0M A; 2FPE A; 4RTY A; 2FPF A; 2V1Q A; 1OPL A; 3VRY A; 1GCQ A; 4AFS C; 1QCF A; 4FSS A; 1RI9 A; 2HCK A; 4AG1 C; 2QDL A; 1PWT A; 2LZ6 B; 2CT3 A; 5FWC A; 2C0T A; 3H0H A; 1UHC A; 4A63 B; 3M0P A; 5FWB A; 2X3W D; 2EYY A; 2XMF A; 5IXB A; 1BBZ A; 1UDL A; 2IIM A; 1K0X A; 1UE9 A; 1X27 A; 2BZY A; 3FJ5 A; 4GLM A; 2CDT A; 2YDL A; 4RTX A; 2FRY A; 4QT7 A; 1NYF A; 3EG2 A; 3VRZ A; 1MUZ A; 1WLP B; 1BB9 A; 1QWE A; 2YT6 A; 1SHF A; 1YWO A; 1UHF A; 1QKW A; 1E7O A; 4OMO A; 4J9H A; 1SSH A; 1NLO C; 1SRM A; 3H41 A; 2RQR A; 2K6D A; 3TSW A; 3NPF A; 1W1F A; 2J6O A; 1EFN A; 1WDX A; 1ABO A; 3VS1 A; 1VA7 A; 3U23 A; 2ROL A; 1UGV A; 1JU5 C; 1Z9Q A; 2GQI A; 1LCK A; 2HBW A; 1E6G A; 1I1J A; 3JV3 A; 4J9G A; 4JJD A; 2I0N A; 1XOV A; 2KXD A; 3RBB B; 2KRS A; 4RTU A; 1CKB A; 2C0O A; 2X3X D; 1G83 A; 1UFF A; 1YN8 A; 2JXB A; 2LQW A; 3PVQ A; 2O9S A; 2LJ1 A; 2C0I A; 5ECA A; 1ZSG A; 2RN8 A; 1KSW A; 3R6N A; 1I07 A; 2A08 A; 2JS0 A; 4J9D A; 2D8H A; 2VKN A; 4OMM A; 2CSQ A; 1PRL C; 2DIL A; 2ED1 A; 4KRT A; 4IIO A; 1UJY A; 1Z9Z A; 2EQI A; 2KYM A; 3EG3 A; 4RTW A; 4OMP A; 1PNJ A; 4JZ3 A; 1VYT A; 1X6B A; 1AVZ C; 4ESR A; 2BZX A; 2D8J A; 4EIK A; 1U5S A; 2PNI A; 1K9A A; 2M0Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M55 A; 2PTK A; 4LXC A; 1HSQ A; 1K4U S; 3PGG A; 1WX6 A; 2JM8 A; 3PMI A; 4BDZ A; 2BUD A; 3JB9 I; 3BY7 A; 4IUR A; 2QGF B; 1M1K C; 3GNG A; 2K3B A; 2OTJ Q; 4ORZ A; 2W10 A; 5I2M A; 1YIJ A; 1KQS S; 2AZS A; 2QGG A; 2JTM A; 2DPP B; 3M59 A; 1VIF A; 3V7S A; 1G5V A; 4C92 E; 1RI0 A; 4F7U B; 4NOY A; 4OMN A; 3SB2 A; 5KH6 A; 3OYY A; 5EC7 A; 3RIR A; 2GCX A; 1AWJ A; 3EG9 B; 1X2Q A; 3M0T A; 4A54 A; 5LJ3 j; 2RM4 A; 2OTL A; 5KCH A; 1AOJ A; 2JT4 A; 4DBH A; 5KYY B; 4M7A C; 2F5K A; 3EHQ A; 4M78 E; 2KDS A; 3HFO A; 3RR6 A; 4FYY B; 1D0X A; 4PK4 A; 2DET A; 1WQ7 A; 1OEB A; 1UG1 A; 5LJ3 d; 1IO6 A; 5GAN j; 3PE0 A; 4M7A F; 1N27 A; 2PUO B; 5CK9 A; 3URG A; 2OTL Q; 3T9N A; 4M7D C; 4N0A A; 4VUB A; 2WSE E; 1GL5 A; 3HHT B; 1KHI A; 1RAD B; 2D0N A; 4M7D F; 5KYW B; 5GAN h; 2LQN A; 1WYX A; 1U06 A; 1N5Z A; 2VGM A; 1I4K 1; 1B34 B; 4GBQ A; 3CCU A; 1SHG A; 1YJ9 T; 2DZ9 A; 3P8H A; 3JCM Q; 1M3B A; 2DIQ A; 5DY9 A; 4PJL A; 2A36 A; 2YUO A; 2HEQ A; 4LUE A; 4IUT A; 4KGX B; 2ATC B; 2G6F X; 2R57 A; 1QVG P; 1A0N B; 2L5Q A; 2DEU A; 2KRO A; 2JW4 A; 4XU1 A; 1TSF A; 2Y4Y A; 4J9F A; 2DXB A; 3A8H B; 4JRI A; 1EX4 A; 2VYT A; 5C6S A; 1W2B P; 4OGC A; 4EDU A; 1YIJ T; 4DQ2 A; 3CXC S; 2EW3 A; 1WIE A; 3CCU Q; 5HCK A; 1AWO A; 4TVR A; 2AKK A; 1K76 A; 4QVC A; 2Y4X A; 5GMK m; 4DA4 A; 3X20 B; 4WCI A; 3GBQ A; 4FSX A; 2K57 A; 1NG2 A; 2LVM A; 5GMK e; 3QG1 A; 4JS4 A; 5GAN 2; 3JCM J; 1FWZ A; 2DXU A; 1GFC A; 4IIM A; 1BCO A; 5GAO n; 1YP5 A; 2OTL T; 4F04 B; 3OMC A; 3QJ6 A; 2MCN A; 3VS6 A; 2PU9 B; 3JCM X; 3OS1 A; 2KGT A; 2QXF A; 2IVW A; 2RJF A; 3SHW A; 2O2O A; 4E7I A; 1O75 A; 5I22 A; 1Q86 C; 3OW2 P; 3JB9 F; 2DL4 A; 2X4Y A; 3CQT A; 4E7S A; 4RCB A; 3LLR A; 5IH2 A; 5AT1 B; 4LE9 A; 3V7R A; 1KHC A; 2CH4 A; 4KGZ B; 4M77 F; 1NPR A; 4NL3 A; 4F7U A; 2NUP B; 3JCM V; 1ARK A; 1BIB A; 2EAY A; 2QI2 A; 1WQW A; 4XTV A; 3M4G A; 3S3O A; 4ZNX A; 1JQQ A; 3EG9 A; 1VQP T; 3E9F A; 1WJS A; 4QKU A; 2EWN A; 4EMH A; 5KYY A; 1QW1 A; 1PKS A; 4Q5W A; 2BIV A; 2XU8 A; 1QKX A; 3DB3 A; 1MMN A; 4E6R A; 2CKK A; 1M4Z A; 1ZHI A; 3ER0 A; 3HRT A; 1YIT Q; 3M4Y A; 1TS9 A; 2NUT B; 2L0A A; 1PC0 A; 2RHZ A; 5CVI A; 2EGE A; 2M0O A; 3S3M A; 5I2S A; 2J7I A; 2EBP A; 1G3S A; 2ROT A; 1FMK A; 2BZ8 A; 2P0P A; 4M77 D; 2RH2 A; 1BI1 A; 1UGS B; 2NYS A; 2E3H A; 2YUQ A; 4LDU A; 3GOX A; 2WSF E; 1K9M R; 3OYD A; 2AT1 B; 4OF1 A; 1EZZ B; 2OI3 A; 4KH1 B; 4PJN A; 1Q7Y C; 5LJ5 e; 1B34 A; 5GAO r; 4RUG A; 2KNB B; 2JS2 A; 3KFV A; 1S1N A; 1KD1 C; 4HCB A; 2F2W A; 1T0H A; 4MDW A; 4J83 A; 4JRK A; 1KQS A; 1V1C A; 4AFU C; 1BK2 A; 3CMA A; 4KT0 E; 3H0I A; 2DVJ A; 2K5I A; 4JDS A; 3JAM E; 3CD6 A; 3CBO A; 1M90 R; 1JO8 A; 1AZG B; 4PNO A; 4Z8A A; 3JCM b; 1NE8 A; 5FU7 C; 2DM1 A; 5HK0 A; 2KEA A; 1YNZ A; 2K3X A; 4C92 C; 4C0D C; 2LRQ A; 2V1Q A; 5KYX B; 2O01 E; 1QCF A; 4E7H A; 4FSS A; 3J80 E; 1RI9 A; 3CMA Q; 5AYF A; 3CCM A; 4KGV B; 4DOW A; 1MNE A; 2YXY A; 3BW1 A; 5FWC A; 2C0T A; 4C0G A; 3H0H A; 3QYG B; 4JS5 A; 3EFS A; 1K9M U; 4C92 F; 3RES A; 2QQS A; 2X3W D; 2ZPI B; 3OA6 A; 5CCA A; 4M78 C; 1X27 A; 1ZBX A; 2BZY A; 3FJ5 A; 2YDL A; 1NYF A; 3CCM Q; 2DTI A; 1PM3 A; 1QKW A; 1E7O A; 1Q81 R; 1RAI B; 2DXC A; 4M78 F; 2LDM A; 1O9S A; 4XQ3 A; 2E12 A; 3UWN A; 1M90 U; 2EJG A; 2D9T A; 2K6D A; 2EJ9 A; 2RK1 A; 4HCZ A; 3TSW A; 3NPF A; 3TQ7 P; 4B6M A; 1EFN A; 3OB9 A; 1BKB A; 2NUP A; 4A4F A; 5GAN f; 3N5B B; 1JU5 C; 3FC3 A; 1Z9Q A; 3JB9 G; 1YJN A; 4J9G A; 4HT8 A; 1XOV A; 4KUI A; 1KK7 A; 4M77 G; 1RAC B; 4OB1 B; 3PTA A; 3C95 A; 2C0O A; 3CC7 A; 2JXB A; 3PVQ A; 2H3J A; 1JJ2 A; 2C0I A; 1RL2 A; 5GMK j; 3E2U A; 1VQN A; 1IZ6 A; 3RDV A; 4C8Q D; 3HKS A; 1KSW A; 3R6N A; 4J9D A; 3OY9 A; 4QVD A; 2E10 A; 1P92 A; 3PNW C; 3CXC A; 2ED1 A; 1YJN Q; 3JCM f; 2I2L A; 4RTW A; 2NUT A; 3ASK A; 3CMA T; 1OX9 A; 3E1S A; 4C5H A; 1C0M A; 3LH0 A; 3CD6 T; 1UGR B; 2PNI A; 1D1B A; 3CC7 Q; 4ANJ A; 5GMK h; 2L89 A; 3LX7 A; 3NFC A; 1D0Y A; 1WPY A; 4KUL A; 5GAM g; 5CKE A; 1Q81 U; 3EG1 A; 4E7Z A; 2GF7 A; 2DYB A; 3JCM e; 1VQN Q; 1EIF A; 2RI3 A; 2DFU A; 2DTO A; 3I5S A; 4V2S A; 1RAH B; 1ZX6 A; 2RQU A; 1H92 A; 3LH5 A; 3REA B; 3OQ5 A; 2FEI A; 1UGQ B; 2QTV A; 3CCE A; 3CCM T; 3UA6 A; 2EVR A; 5GAM d; 2EGA A; 1GXI E; 4MZT A; 4J6X A; 5J26 A; 2KI7 A; 4OB0 B; 1KC8 U; 1W6X A; 3OS5 A; 1WXU A; 4M7A B; 4OMF B; 2YRD A; 4M77 E; 4J7F A; 5L8R E; 3JB9 H; 4HT9 A; 4CRI A; 2MOX A; 2ZCF B; 2HL3 A; 3NGP A; 3CCE Q; 1UEC A; 2DL5 A; 4J9E A; 1J3T A; 1C6V X; 2G3R A; 3C12 A; 4M7D B; 2CZ6 B; 4PJM A; 1RAG B; 2RQT A; 5CIU A; 4E47 A; 2DD5 A; 3FIF A; 1IGQ A; 3MEU A; 3VS5 A; 3RMS A; 3UA7 A; 3S6W A; 4PKC C; 2VGN A; 1GBQ A; 3EGX A; 4QVZ A; 5KYX A; 4WF2 A; 1Y7X A; 3E19 A; 2QTX A; 3CCL A; 3CC2 A; 2YHT A; 4A4G A; 1WFW A; 3SFM A; 1VQ7 A; 2JUF A; 4K11 A; 3CCR A; 2RNA A; 1YJN T; 1S72 A; 3G1J A; 2MYS A; 2EKO A; 2RQW A; 5I21 A; 4KBM B; 5FU6 C; 1IHV A; 2DBM A; 1ZLM A; 1GCP A; 2LQ8 A; 5KCO A; 3CC7 T; 4QQ6 A; 5IHN A; 1ZUU A; 2FZG B; 4NS5 A; 4C5G A; 3M0S A; 3I55 A; 1QVF P; 2LJ0 A; 1VQN T; 2V8K A; 3TEE A; 1Q82 R; 4ZN1 A; 1AEY A; 3CCL Q; 3CC2 Q; 4LNP A; 1VQ7 Q; 4C8Q G; 1HK9 A; 2K5L A; 3QHS A; 3CCR Q; 1VQM Q; 3EG0 A; 2SRC A; 2LNH B; 3IQL A; 3HRS A; 3G6E A; 1TTH B; 1ZSZ B; 5GMK i; 1HYO A; 2DVE A; 5I11 A; 5DLQ E; 5LJ5 h; 2OTJ A; 2FL7 A; 4ZGJ B; 4M78 G; 1QVG S; 2MPX C; 3QO3 A; 4R0K A; 5GAO l; 2VXF A; 4JJN K; 1B3Q A; 4FL6 A; 4JRQ A; 3CCE T; 1W2B S; 2DYI A; 1XTD A; 1I0C A; 2YSQ A; 2RHU A; 3G6E Q; 1M1K R; 3QWX X; 4ELY C; 5HK3 A; 4HCK A; 3P8B B; 1WXT A; 1MGQ A; 1XNI A; 3PVL A; 5GAN 6; 2O31 A; 2LCS A; 3OYA A; 2RJE A; 2DER A; 4BI3 A; 2XHC A; 2D6F A; 1D09 B; 3NTI A; 4FCY A; 5D6X A; 4Y28 E; 4GY5 A; 2NWM A; 1U8R A; 2JMA A; 1SRL A; 1NJI R; 1I5L A; 4J9B A; 1OYX A; 1VQ6 A; 1F1B B; 3A98 A; 2NUZ A; 1VQ8 A; 1PD1 A; 2DF6 A; 1W70 A; 1RLQ C; 2EQU A; 1ZQ1 A; 2W0Z A; 4C8Q E; 2DK3 A; 4KH0 B; 3INZ A; 2HNI A; 4F16 A; 2LNV A; 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