The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVADRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47A
rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
12
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MV0 B; 4RTX A; 1AD5 A; 2A08 A; 2JMC A; 3EG3 A; 2CRE A; 2GNC A; 3KFV A; 1AOJ A; 1M3C A; 2D8H A; 2HEQ A; 3H0I A; 5ECA A; 3JV3 A; 2A37 A; 3UAT A; 1ARK A; 3O5Z A; 2FRY A; 2J6K A; 1WXB A; 4D8K A; 1M8M A; 1JO8 A; 2KT1 A; 2BTT A; 2AKL A; 1K9A A; 1Y57 A; 2W0Z A; 4LUE A; 4K11 A; 2NWM A; 2L2P A; 1M3B A; 1TG0 A; 5IH2 A; 2QDL A; 2D8J A; 4AG1 C; 1UJY A; 1OPL A; 1K4U S; 1GBQ A; 4F16 A; 1UUE A; 3EGU A; 4AFQ C; 1IO6 A; 1ZBJ A; 2AKK A; 2KE9 A; 2KT8 A; 4Y92 A; 3VS0 A; 2SRC A; 4IIM A; 2RN8 A; 2NUZ A; 2KRS A; 4J9H A; 1K0S A; 1WDX A; 2LZ6 B; 2RMO A; 1GBR A; 1OV3 A; 2I0N A; 4J9D A; 3TSW A; 2JW4 A; 1TUD A; 2EVR A; 2J6O A; 2FPD A; 3I9Q A; 2D1X A; 2K9G A; 4ORZ A; 1E6G A; 1QKW A; 2CH4 W; 1YN8 A; 1NM7 A; 2M51 A; 1AEY A; 2MIO A; 2F2W A; 1UTI A; 2DMO A; 3R6N A; 2KRO A; 2YUO A; 5IHI A; 4HCK A; 2HBW A; 2EGE A; 1GCP A; 4CC3 A; 3VS2 A; 2A28 A; 1SRL A; 2GTO A; 1GCQ C; 3VS3 A; 3RNJ A; 1NYF A; 1QLY A; 2BZY A; 2H8H A; 2F2V A; 3CQT A; 1WX6 A; 1Z9Q A; 4J9B A; 1AVZ C; 2DNU A; 4Z88 A; 1M27 C; 1B07 A; 1X69 A; 2PNI A; 1HSQ A; 1RUW A; 3H41 A; 3NHN A; 4Z89 A; 4JZ3 A; 2KRN A; 2AK5 A; 1UJ0 A; 4LUD A; 2KGT A; 2D0N A; 2AZV A; 3VRY A; 5FWB A; 5I22 A; 1FYN A; 1UDL A; 2KXD A; 4OMP A; 5GJV B; 5IXF A; 1WFW A; 2P4R A; 3ULR B; 2B86 A; 1NEG A; 2JTE A; 1SHF A; 2HDA A; 1AZE A; 2JS0 A; 3VS5 A; 2J7I A; 1ZUK A; 4DEY A; 2EW3 A; 1UG1 A; 1GCQ A; 1UEC A; 1G2B A; 1WIE A; 2YUN A; 3M0R A; 2KBT A; 2EYZ A; 3M0U A; 1YCS B; 3FJ5 A; 1QWF A; 1SHG A; 2CUB A; 2OJ2 A; 1ZUU A; 2FEI A; 2DL5 A; 1QWE A; 4LN2 A; 2VKN A; 2O9V A; 1ABO A; 5HCK A; 4JJD A; 2MOX A; 3ZL7 C; 2RQT A; 1H3H A; 2JXB A; 3THK A; 3VS7 A; 2K6D A; 5IHN A; 1GFD A; 2DYB A; 2XMF A; 1PNJ A; 2LCS A; 2DE0 X; 1UHF A; 1BK2 A; 4GBQ A; 1MUZ A; 2V1Q A; 4E6R A; 2RNA A; 1RLQ C; 4FSS A; 4AFZ C; 1JEG A; 1BU1 A; 1NLO C; 3PVL A; 2DLP A; 2DF6 A; 2BZ8 A; 2YT6 A; 1KIK A; 1ABQ A; 5FWC A; 2L0A A; 2LP5 A; 2ED0 A; 4Z8A A; 1YP5 A; 1ZSG A; 4J9F A; 4RTW A; 1U06 A; 4CC7 A; 1J3T A; 4ZNX A; 1M30 A; 2LQN A; 1VYV A; 3EHR A; 1VA7 A; 5EC7 A; 2LJ3 A; 1XOV A; 1K0X A; 2DL7 A; 2OAW A; 1VYU A; 3EG0 A; 1AWO A; 2K7A A; 1Y0M A; 2JS2 A; 2ED1 A; 3REB B; 3TVT A; 2KNB B; 3NGP A; 2JT4 A; 4RTT A; 2SEM A; 4AFU C; 1SPK A; 2RF0 A; 4X1V A; 3SEM A; 2EYW A; 2LJ0 A; 1PKS A; 2K2M A; 4EIK A; 4HXJ A; 2KYM A; 4JZ4 A; 3LH5 A; 4LE9 A; 2G6F X; 2OI3 A; 1I07 A; 3TSZ A; 1LCK A; 1OOT A; 2HSP A; 1WYX A; 1UHC A; 2FPF A; 1NG2 A; 2GGR A; 4OMN A; 2DRM A; 2KXC A; 2DVJ A; 1NYG A; 1M3A A; 1PRL C; 2KEA A; 4RTZ A; 1AWW A; 2O31 A; 5FW9 A; 2YUQ A; 3EG1 A; 2DL4 A; 2FO0 A; 2FG0 A; 1VYT A; 2JM8 A; 2DIL A; 1H92 A; 3I5R A; 1QCF A; 2ROL A; 2F2X A; 1YWP A; 2DL3 A; 3IQL A; 2RPN A; 3PE0 A; 1Z9Z A; 1X43 A; 1GRI A; 4GLM A; 2KR3 A; 4RTU A; 1SSH A; 3M0T A; 1JU5 C; 2C0O A; 2DL8 A; 1U3O A; 1WA7 A; 2DJQ A; 4OML A; 2DBK A; 1K1Z A; 1X6B A; 3M0S A; 4CC2 A; 4WCI A; 1I0C A; 2EPD A; 2EYY A; 1SEM A; 3SHW A; 2PTK A; 1ZUY A; 1PRM C; 3M0P A; 1WLP B; 1X2Q A; 3NMZ C; 2CSQ A; 1B3Q A; 1W6X A; 2PZ1 A; 1PWT A; 1E7O A; 3U23 A; 5IXB A; 4CC4 B; 1UE9 A; 4OMO A; 1YNZ A; 2CUD A; 2YSQ A; 1AZG B; 4KRT A; 1JXM A; 1KSW A; 3EG2 A; 2O2O A; 1UFF A; 1CSK A; 2BZX A; 2EKH A; 1G83 A; 2DBM A; 1T0H A; 2FRW A; 1OPK A; 3VS4 A; 4F14 A; 3VS6 A; 2CT4 A; 2LQW A; 4JPB W; 4RUG A; 2JMA A; 1T0J A; 2FPE A; 2RQV A; 3UA7 A; 3NPF A; 2JM9 A; 4F17 A; 2M0Y A; 3I5S A; 1KFZ A; 2CSI A; 2ESW A; 1N5Z A; 2LX7 A; 2EQI A; 2RQR A; 1JQQ A; 2DM1 A; 4J9G A; 5L23 A; 4IIO A; 4HVW A; 2K79 A; 4R0K A; 2C0I A; 3M0Q A; 1ZLM A; 1HD3 A; 1X2K A; 2DX1 A; 1X6G A; 2O9S A; 3PVQ A; 4JJB A; 3VRZ A; 2E5K A; 2GQI A; 1QKX A; 2L3S A; 1CKA A; 1X27 A; 2A36 A; 2CT3 A; 4J9C A; 2J6F A; 4ESR A; 4AFS C; 1CKB A; 4HVV A; 3A98 A; 1GFC A; 3REA B; 1PHT A; 1TUC A; 3I35 A; 4OMM A; 1E6H A; 1V1C A; 2KYB A; 2VWF A; 1T3S A; 1H8K A; 2O88 A; 1NLP C; 4HVU A; 2RQW A; 2C0T A; 1UGV A; 2HCK A; 2L3P A; 1GL5 A; 5GJW B; 4OMQ A; 3VS1 A; 3GBQ A; 2RQU A; 5I11 A; 3UF4 A; 2AZS A; 2ROT A; 1U5S A; 1KJW A; 1MV3 A; 1AWJ A; 1JXO A; 1A0N B; 1T3L A; 4QT7 A; 2J05 A; 2W10 A; 2CDT A; 1S1N A; 2IIM A; 2KRM A; 4J9E A; 1BBZ A; 1ZX6 A; 1AWX A; 2X3W D; 2GBQ A; 2EYX A; 2ENM A; 2ECZ A; 2LJ1 A; 5IHK A; 2DA9 A; 4A63 B; 1K76 A; 2X3X D; 3RBB B; 3C0C A; 1WXU A; 2ABL A; 2V1R A; 2EGC A; 1WXT A; 1HJD A; 1SRM A; 2LMJ A; 3QWX X; 3EHQ A; 4M4Z A; 2YUP A; 2EGA A; 1RLP C; 2YDL A; 1NEB A; 3QWY A; 3UA6 A; 4AG2 C; 1I1J A; 4DEX A; 2EBP A; 2K3B A; 1OEB A; 2DRK A; 1PKT A; 1RI9 A; 4JJC A; 4RTV A; 2J06 A; 2VVK A; 2L3Q A; 3H0F A; 2LNH B; 2GTJ A; 1W1F A; 2MCN A; 4D8D A; 1EFN A; 1YWO A; 4RTY A; 2CH4 A; 1FMK A; 1W70 A; 4J9I A; 3H0H A; 4LNP A; 1BB9 A; 1WI7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EG9 B; 1MV0 B; 1RL2 A; 4KUL A; 1S72 A; 4Z02 A; 3GPL A; 3EG3 A; 2CZ6 B; 1HYO A; 1VQM T; 3RKW A; 3FRN A; 4FW2 A; 4RG8 A; 3GNF B; 4PJJ A; 3VU3 C; 2FL7 A; 2D8H A; 2HEQ A; 5GAN j; 3JV3 A; 2E1H A; 5D6X A; 1RAE B; 2A37 A; 4C0G A; 1VQL Q; 4MZM A; 2XKO C; 4PNO A; 2J6K A; 3TCJ A; 3JCM W; 4D8K A; 1M8M A; 3CD6 T; 3EFO B; 1K9A A; 4C8Q D; 3MEV A; 3OQ5 A; 3CC4 Q; 4J6W A; 1X6O A; 2X51 A; 4MDW A; 1TG0 A; 5IH2 A; 1WJQ A; 4M78 E; 3UPU A; 2PVO B; 2QXF A; 1UJY A; 1JRI A; 1OPL A; 1BI2 A; 1LPL A; 1VQP Q; 2QAZ A; 1ZSZ C; 3HFN A; 4Y92 A; 2HKQ B; 4IIM A; 4N4G A; 2P4T A; 3LGL A; 4E7H A; 4IUP A; 2KRS A; 4E7L A; 2IG0 A; 1NPP A; 1M2O A; 1OV3 A; 2JN0 A; 3A8G B; 4ANJ A; 1TUD A; 3QDF A; 3CCQ T; 2XID A; 4IUQ A; 2KK4 A; 4OF1 A; 2D1X A; 2ZPE B; 2RHZ A; 2HQH A; 2C06 A; 3X25 B; 2F5T X; 2CH4 W; 3CCE A; 3H8Z A; 1YN8 A; 1QVP A; 1M1K R; 5D6Y A; 1AEY A; 3SD4 A; 2HNI A; 1YIT A; 2RK2 A; 1HK9 A; 2KRO A; 4HCK A; 3A8O B; 2AT1 B; 2HBW A; 4II1 A; 3CCU A; 2EGE A; 2I2L A; 1K73 U; 1Q82 R; 1GCP A; 5KYU A; 4HCC A; 3QSU A; 2B8A A; 1PG5 B; 1XNI A; 1Q81 C; 2YRC A; 5IN1 A; 5I2M A; 5GMK m; 2RHU A; 4JRI A; 2BZY A; 4J9B A; 3OYK A; 3EH2 A; 3PNW C; 4RKU E; 2QAS A; 1AVZ C; 1ZSZ A; 3KUF A; 4F7U G; 3V8L A; 3CCM Q; 1M27 C; 3AT1 B; 2PNI A; 2H3J A; 3HHT B; 5CQX A; 3OW2 A; 1YJ9 A; 2FB7 A; 1OU9 A; 3H41 A; 1N8R C; 4Z89 A; 2KI7 A; 2AK5 A; 1UJ0 A; 4LUD A; 5FLX E; 1TXQ A; 3VYH B; 2CP6 A; 2AZV A; 1Q95 G; 4OMP A; 4C92 B; 1KD1 U; 1WFW A; 3DLM A; 2BKD N; 4KUD K; 1Q7Y C; 4MDX A; 3CXC P; 1TS9 A; 8ATC B; 1G2B A; 4Q5W A; 4J6Y A; 2X4Y A; 1SKU B; 2EQM A; 2EYZ A; 1NZ9 A; 2GF7 A; 4LD6 A; 4M77 B; 2DL5 A; 2R58 A; 5HK0 A; 4HKE A; 5GAM g; 2DER A; 4NS5 A; 3L1A A; 1WZO A; 3I56 T; 2MOX A; 2YXY A; 1I5L A; 2VGN A; 4N4H A; 3VUZ A; 2GFU A; 2K6D A; 2F1L A; 2DYB A; 2L89 A; 2DE0 X; 4GBQ A; 9ATC B; 5M9O A; 1VQK Q; 4FSS A; 3V7S A; 5LJ5 h; 2DLP A; 2BZ8 A; 1ABQ A; 4V2S A; 1WHK A; 2DAQ A; 3I55 Q; 4XTX A; 4J9F A; 4CC7 A; 2M0O A; 4KGX B; 1BYM A; 1ZBX A; 1M30 A; 1MMD A; 5CVI A; 5EC7 A; 2LJ3 A; 1NBE B; 1K0X A; 2LCC A; 2DL7 A; 1YHQ A; 3JRZ A; 3N5B B; 3D7S B; 3V8J A; 3VKI A; 1Q7Y U; 4ZGD B; 5CKF A; 3SDZ A; 2ED1 A; 4JJN K; 4E2F B; 2KNB B; 3G6E Q; 2EQU A; 1KC8 U; 4B9W A; 4DQ2 A; 4RCB A; 4AFU C; 3M4G A; 1BIB A; 3M57 A; 2K2M A; 1V29 B; 4EIK A; 2KYM A; 4JZ4 A; 3CPW S; 2G6F X; 1VQ7 T; 2OI3 A; 1YJW T; 2QTX A; 3QXE B; 2QQR A; 3LYI A; 1UHC A; 2FPF A; 3S6W A; 3V7R A; 3MO8 A; 2AHJ B; 5KE3 A; 2KXC A; 4C8Q B; 3JCM Q; 3GF5 A; 5LJ5 e; 1NYG A; 3V8K A; 3QII A; 3A5Z B; 4RTZ A; 1AWW A; 5FW9 A; 4BAC A; 3PT9 A; 2FZG B; 2HBP A; 2FO0 A; 5KCO A; 3A8H B; 1H92 A; 2ROL A; 1VQ9 Q; 2OTL A; 2D0Q B; 1R77 A; 4M7D G; 3DKM A; 3EGD B; 2DIG A; 3OSS C; 1X43 A; 1SSH A; 1RAI B; 4FT4 A; 3E9F A; 1WHL A; 1K1Z A; 1X6B A; 1D1A A; 2K4Y A; 1FX7 A; 3MKD A; 3ZBD A; 2EQJ A; 5J3B A; 3SHW A; 4PJO G; 2E6N A; 1VQM Q; 4M7A F; 1QMC A; 3HP9 A; 3MEA A; 4M7A C; 3NMZ C; 1IGU A; 1RAA B; 3HKS A; 3CCS A; 3HRT A; 1E7O A; 5KYX B; 1QP2 A; 2XDP A; 2RM4 A; 4MMK A; 1AZG B; 1JXM A; 5GAN d; 3EG2 A; 3TU4 K; 3JB9 J; 2HQX A; 2EKH A; 5LJ3 j; 1G83 A; 2CGH A; 2HKN A; 1W4S A; 5GAN e; 5KYN A; 1W2B P; 1IGQ A; 3J80 E; 4M75 F; 2DEU A; 2MWO A; 4KGV B; 4M75 C; 4JPB W; 4RUG A; 4BE2 A; 4FYV B; 3SWN B; 1S72 T; 2FPE A; 4P5N A; 2RQV A; 5FU7 C; 2BIV A; 3NPF A; 3QKJ A; 2LC4 A; 4F17 A; 4KGZ B; 4C0D B; 1N5Z A; 2EQI A; 1G3T A; 3OS5 A; 3JCM d; 3M0Q A; 3X26 B; 4M7A A; 3VJP A; 1OQK A; 2O9S A; 4JJB A; 3CCQ Q; 4JRK A; 3X28 B; 1JJ2 P; 2CP7 A; 4QQD A; 3JCM e; 1X27 A; 2VUB A; 1W2B S; 1GFC A; 1OX8 A; 2DXB A; 3REA B; 1G8X A; 1IRE B; 3I35 A; 3RES A; 5CAI A; 1H8K A; 4HVU A; 1NLP C; 2FYK A; 2P0Q A; 2DJZ A; 4M75 A; 2DEQ A; 4OMQ A; 3RR6 A; 2NUP A; 1PSE A; 2HD0 A; 3QO3 A; 2MF2 A; 2ROT A; 2LVM A; 1AWJ A; 1JXO A; 3CCR T; 3FJP A; 2CDT A; 2VYT A; 1JJ2 S; 1S1N A; 2HAX A; 2ZCF B; 3QJ6 A; 4ZGJ B; 3CCE T; 4CRI A; 2FHD A; 4M7A E; 4BB7 A; 2EYX A; 3TEE A; 1YIT T; 3CC2 Q; 2ECZ A; 2LJ1 A; 4L59 A; 2QA4 T; 5EG2 A; 4J6X A; 3RBB B; 3CCU T; 3Q1J A; 2EFI A; 3E19 A; 4LXC A; 3M53 A; 4IKF A; 5C0M A; 1VQO A; 1HJD A; 2LMJ A; 3M56 A; 1Y7X A; 1K9M R; 1NEB A; 5I2S A; 1G3S A; 3UA6 A; 2RJC A; 2DRK A; 1RI9 A; 1OYX A; 4RTV A; 5FRO A; 2J06 A; 5I21 A; 4M75 E; 4A53 A; 2LNH B; 2MCN A; 2QI2 A; 1YWO A; 1YJ9 T; 5LJ5 f; 4LNP A; 1KHC A; 1D1C A; 2LT1 A; 2D6F A; 4RTX A; 4FT2 A; 1AD5 A; 2JMC A; 2QEX T; 3ZEH A; 2CP5 A; 2RHX A; 3G4S Q; 2ZPI B; 1PM3 A; 2X9H A; 3L2R A; 1DJ7 B; 1NE8 A; 3UAT A; 4DOW A; 2L5Q A; 1ARK A; 1M90 U; 1Q86 R; 5A0D A; 2XHC A; 2AKL A; 3FEO A; 4OP0 A; 1Y71 A; 1Y57 A; 3KBG A; 2RH2 A; 2BE9 B; 1YIJ A; 2DTI A; 4C5I A; 2QG9 B; 2A0F B; 3NTH A; 3WVD B; 5CKB A; 2CZ1 B; 4E7K A; 3TRE A; 2MI6 A; 1LJO A; 3CME Q; 2YWW A; 2M1H A; 3ZFJ A; 4BDY A; 4F16 A; 2AKK A; 4EMH A; 1BI0 A; 4KT0 E; 1RAG B; 4M77 G; 2NUZ A; 1RAF B; 4OMF B; 1QVF P; 1K0S A; 1WDX A; 2LZ6 B; 2HL3 A; 4F7U F; 5GAN f; 2I0N A; 3L42 A; 2FPD A; 3OYB A; 2K9G A; 4ORZ A; 2P0K A; 3JCM g; 1YI2 A; 3RKY A; 3CMA A; 3CPW A; 4FL6 A; 1IB8 A; 2MIO A; 4M7A D; 3G71 A; 1KK7 A; 1YBY A; 5LJ5 j; 2DD4 A; 4HA8 A; 4CC3 A; 2LTO A; 1YHQ T; 1M1G A; 2GTO A; 3HPW A; 2DPP B; 1RI0 A; 1WJS A; 5KYY A; 3JCM f; 1SSF A; 2H8H A; 2JTF A; 1QVF S; 1QVG S; 3OSV A; 1PD1 A; 1I5O B; 2K5L A; 2DNU A; 5CKD A; 2V8I A; 2Z0W A; 5KE2 A; 1QCN A; 5CR2 A; 2V8K A; 2CKK A; 3G7Z A; 4JZ3 A; 2KDS A; 3GOX A; 4F7U A; 2PVD B; 1B7T A; 4FU6 A; 2KGT A; 3G1J A; 3RUX A; 3MET A; 1F1B B; 5FWB A; 1M5Q 1; 5I22 A; 4DA4 A; 1FYN A; 2EWN A; 1FXX A; 3OYF A; 2XD0 A; 2KXD A; 5GJV B; 3HRS A; 5IXF A; 3QDR B; 3HRU A; 2B86 A; 2JTE A; 4FSX A; 4CI0 C; 3M55 A; 4A54 A; 3OYG A; 4J83 A; 4EMK C; 4DEY A; 2OTL T; 1WIE A; 3CBP A; 1PCX A; 3R6O A; 1N9R A; 2KBT A; 2RI3 A; 5GAN 2; 1SHG A; 2CUB A; 2OTJ A; 2MMP A; 3RDV A; 2FEI A; 1VQL A; 2DXU A; 3A8L B; 4RCC A; 3CC7 T; 5LJ3 d; 2VKN A; 3RMS A; 2JOY A; 1UB4 A; 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