The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the complex between the N-terminal SH3 domain of CrkII and a proline-rich ligand
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
|
| total genus |
10
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-07-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GBQ A; 4OMM A; 2JT4 A; 2DJQ A; 1EFN A; 4RTU A; 1AZG B; 1KSW A; 1GBQ A; 1B07 A; 2CDT A; 2K2M A; 4EIK A; 1WXB A; 2DBM A; 4Z89 A; 2CSI A; 4OMP A; 1SRL A; 2K7A A; 3SEM A; 2NWM A; 1OEB A; 2O88 A; 2RMO A; 1K1Z A; 3H0H A; 4WCI A; 2BZX A; 2J6O A; 3EHR A; 4LE9 A; 2AKL A; 3FJ5 A; 2YUN A; 2J7I A; 1GCQ C; 1M8M A; 1ZUK A; 1LCK A; 3VS7 A; 1AWO A; 1WA7 A; 2ED0 A; 1JXO A; 2EYX A; 1YNZ A; 2EVR A; 3IQL A; 1UEC A; 2A37 A; 3R6N A; 2W10 A; 1H92 A; 3TSZ A; 4ORZ A; 2F2W A; 2K6D A; 1YP5 A; 1H8K A; 2QDL A; 1RI9 A; 3RNJ A; 4F17 A; 2J6F A; 1UHC A; 1GFC A; 2DBK A; 1WIE A; 1NYF A; 2LQN A; 1N5Z A; 1OPL A; 2V1Q A; 4RTZ A; 2YT6 A; 3UA7 A; 1NYG A; 1CKA A; 4F14 A; 1GL5 A; 1AOJ A; 3C0C A; 2RN8 A; 1PKT A; 2KT1 A; 4HVV A; 2JMA A; 4FSS A; 2A08 A; 1SRM A; 5L23 A; 4E6R A; 4HVW A; 4J9H A; 2FPE A; 3SHW A; 2HBW A; 2J06 A; 2KRM A; 1I1J A; 2LJ0 A; 5IHI A; 2ENM A; 3THK A; 3VS5 A; 1U5S A; 4CC3 A; 1AWX A; 1NM7 A; 2I0N A; 1Y0M A; 3I9Q A; 4AG1 C; 1V1C A; 3JV3 A; 3EG3 A; 1NLO C; 1NG2 A; 2DVJ A; 5FWC A; 4JJB A; 2X3W D; 1ARK A; 1UGV A; 4JPB W; 2BTT A; 4AG2 C; 1UUE A; 1GBR A; 3VS3 A; 2CSQ A; 1BK2 A; 2DNU A; 1QKW A; 2JW4 A; 2HEQ A; 2GQI A; 2DMO A; 1W6X A; 4HVU A; 1G2B A; 2KRS A; 3I5R A; 2GBQ A; 2DM1 A; 2F2X A; 1ZUU A; 4X1V A; 2B86 A; 1UDL A; 2OJ2 A; 2ESW A; 1AD5 A; 2KBT A; 1I0C A; 4CC2 A; 1WFW A; 1GCP A; 2SEM A; 2OAW A; 1VYV A; 2EKH A; 3I35 A; 4K11 A; 2JTE A; 3ZL7 C; 2W0Z A; 2EGA A; 1UTI A; 2AK5 A; 3ULR B; 1M3C A; 2YDL A; 2FG0 A; 2M0Y A; 1K76 A; 2LZ6 B; 3M0P A; 1K0X A; 1PHT A; 4CC7 A; 3KFV A; 1M27 C; 1AEY A; 2AKK A; 1PWT A; 3O5Z A; 2KYB A; 2JS0 A; 1QWE A; 5ECA A; 2DRM A; 1K9A A; 2BZY A; 4GBQ A; 3UA6 A; 2KEA A; 5FWB A; 3VS6 A; 1PNJ A; 2K3B A; 1MV3 A; 4AFZ C; 2L2P A; 3QWX X; 1UE9 A; 1ZBJ A; 4OMN A; 3PVL A; 1BBZ A; 1X2K A; 1YN8 A; 1QWF A; 3REB B; 1M3B A; 1VYT A; 1QCF A; 1W70 A; 2CUD A; 2KRO A; 3EG0 A; 1Z9Q A; 1M3A A; 2J05 A; 1TUD A; 2A28 A; 4AFS C; 1NLP C; 1RUW A; 2M51 A; 1K4U S; 2FPD A; 1RLQ C; 3H41 A; 1E6G A; 2VKN A; 1J3T A; 1GCQ A; 4LN2 A; 2RPN A; 3UF4 A; 2YSQ A; 1H3H A; 4R0K A; 3EHQ A; 4M4Z A; 2JM8 A; 1GRI A; 1S1N A; 2RQW A; 1T3L A; 1WXU A; 1E7O A; 2DL4 A; 2VVK A; 2YUO A; 1JQQ A; 4LUE A; 4CC4 B; 1W1F A; 1HD3 A; 1SPK A; 3EG2 A; 2ECZ A; 1YWP A; 1MV0 B; 1JEG A; 3CQT A; 3RBB B; 2EYZ A; 2KT8 A; 1VYU A; 3VRY A; 4AFQ C; 2LNH B; 2SRC A; 1AZE A; 1A0N B; 2FO0 A; 2DRK A; 2XMF A; 4RTX A; 3VS0 A; 2EW3 A; 1BU1 A; 1CKB A; 2YUQ A; 2LQW A; 3NMZ C; 4JJD A; 2RNA A; 2HCK A; 2ROT A; 4JJC A; 1FMK A; 1X6G A; 4J9D A; 3QWY A; 1HJD A; 2C0T A; 2EGE A; 4F16 A; 3U23 A; 4ZNX A; 3VS2 A; 2EYW A; 2ED1 A; 1JO8 A; 3NHN A; 1M30 A; 1G83 A; 2O9V A; 2LCS A; 5GJW B; 1OV3 A; 4IIO A; 1WXT A; 2DLP A; 1BB9 A; 2DYB A; 4OML A; 1RLP C; 2DL8 A; 4DEX A; 5IXB A; 3UAT A; 2X3X D; 4GLM A; 1ZX6 A; 3VRZ A; 2DL7 A; 2RQU A; 2D0N A; 2RQV A; 2CT4 A; 2LJ1 A; 1OPK A; 2DX1 A; 2GGR A; 1X6B A; 2L3S A; 5IXF A; 1KFZ A; 1UHF A; 1KJW A; 1T0J A; 4JZ3 A; 1FYN A; 3H0F A; 1SSH A; 2KE9 A; 4J9E A; 2H8H A; 2V1R A; 1E6H A; 3M0Q A; 4RTW A; 2O2O A; 2RQT A; 2KNB B; 2O9S A; 1PRL C; 2GNC A; 1AWJ A; 2O31 A; 1X27 A; 1WX6 A; 2FPF A; 2KXD A; 2G6F X; 4QT7 A; 1WDX A; 2MCN A; 2PNI A; 2KYM A; 5I11 A; 2A36 A; 2EYY A; 2CT3 A; 1U3O A; 1YWO A; 1PRM C; 5EC7 A; 2L0A A; 4J9F A; 2KXC A; 2YUP A; 1YCS B; 2AZS A; 1ABO A; 2D8J A; 4HXJ A; 4Z88 A; 1NEB A; 2RF0 A; 1SHG A; 5HCK A; 2C0I A; 2L3P A; 3I5S A; 5IHN A; 2EBP A; 4J9G A; 1K0S A; 1TG0 A; 1XOV A; 1Z9Z A; 4OMQ A; 2IIM A; 2JMC A; 2DF6 A; 1NEG A; 1Y57 A; 4KRT A; 4JZ4 A; 1X2Q A; 2CUB A; 2EQI A; 1IO6 A; 2K9G A; 1X69 A; 3M0S A; 4J9C A; 2LJ3 A; 2JM9 A; 1TUC A; 4DEY A; 3M0T A; 1ZLM A; 1PKS A; 1AWW A; 1U06 A; 2GTO A; 2C0O A; 1QKX A; 1ZUY A; 2CH4 W; 3A98 A; 1UFF A; 1UJY A; 2VWF A; 3LH5 A; 1GFD A; 3EGU A; 1VA7 A; 2FRW A; 2BZ8 A; 2D1X A; 3TVT A; 4IIM A; 2MOX A; 3EG1 A; 2EPD A; 2HSP A; 5GJV B; 3NPF A; 2DA9 A; 4Z8A A; 2FEI A; 4RUG A; 3M0U A; 2LX7 A; 3VS1 A; 1ZSG A; 1UG1 A; 1JU5 C; 1UJ0 A; 2DL5 A; 1I07 A; 2CH4 A; 1CSK A; 1QLY A; 2L3Q A; 2P4R A; 4J9I A; 1B3Q A; 4J9B A; 1KIK A; 2OI3 A; 3NGP A; 3REA B; 2E5K A; 2KR3 A; 4HCK A; 1WI7 A; 5FW9 A; 1MUZ A; 1SEM A; 2NUZ A; 2EGC A; 2LMJ A; 4OMO A; 2DL3 A; 1AVZ C; 2DE0 X; 5I22 A; 1ABQ A; 5IH2 A; 1JXM A; 1OOT A; 4D8D A; 2GTJ A; 1HSQ A; 2CRE A; 2K79 A; 4Y92 A; 4A63 B; 4LUD A; 2J6K A; 2KGT A; 1SHF A; 4RTV A; 4ESR A; 5IHK A; 2ABL A; 1T3S A; 3PVQ A; 3H0I A; 2JS2 A; 1X43 A; 3VS4 A; 2D8H A; 2PZ1 A; 4LNP A; 4D8K A; 2F2V A; 2HDA A; 3PE0 A; 2PTK A; 1WYX A; 3TSW A; 2RQR A; 2FRY A; 1T0H A; 2JXB A; 4RTT A; 2AZV A; 1WLP B; 3M0R A; 2DIL A; 2LP5 A; 4RTY A; 2MIO A; 2ROL A; 2KRN A; 4AFU C; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CQY A; 4TVR A; 2DJQ A; 3CCV A; 1KSW A; 1WHM A; 1YHQ A; 2RM4 A; 2MYS A; 1MND A; 3CC2 T; 2EQJ A; 4EIK A; 1R77 A; 4OMP A; 3SFM A; 1SRL A; 3UDC A; 3T9N A; 2YHT A; 2RK2 A; 2LRQ A; 3VU3 C; 3FEO A; 4J5Y A; 3C95 A; 4OMF B; 1VQK A; 1K9M C; 2J7I A; 2KK4 A; 3M5A A; 1AWO A; 2X4Y A; 1WA7 A; 2ED0 A; 2EVR A; 2IG0 A; 3IQL A; 3R6N A; 2V8J A; 1M2O A; 1BIB A; 1LNX A; 4F17 A; 3M55 A; 3CPW P; 2CS7 A; 3ASK A; 3L42 A; 1GFC A; 1WHH A; 1WIE A; 1OPL A; 3LWI A; 4Q5W A; 2L3R A; 3A8L B; 4F14 A; 3C0C A; 4PJO F; 3JCM f; 3AHU A; 4BUG A; 4J9H A; 2FPE A; 3OYG A; 1VQ4 T; 2G3R A; 2Y90 A; 4C8Q D; 2HBW A; 1I1J A; 1BI3 A; 2QXF A; 1Y0M A; 4BAC A; 4F7U B; 3KXT A; 3JV3 A; 3EG3 A; 2XI9 A; 3BE3 A; 1OQK A; 1YIT Q; 1EX4 A; 4M75 C; 1JBM A; 2X4J A; 3HP9 A; 2X3W D; 9ATC B; 5GMK m; 2MWP A; 3JB9 F; 3CCR A; 1ZQ1 A; 4JPB W; 3LH0 A; 5A0G A; 4M78 D; 2HQX A; 3CCL T; 2CSQ A; 3M9Q A; 3MEW A; 3CCQ Q; 3DLL A; 4RG2 A; 3EG9 B; 4M78 B; 1ZSZ A; 4M7A C; 3EH2 A; 3H6Z A; 3CXC A; 3CD6 Q; 4N0A C; 2RH2 A; 1G2B A; 1KD1 U; 1IHW A; 2DM1 A; 4X9D A; 2RA2 A; 3EGX B; 3CXC S; 2F2X A; 2X9H A; 2VAS A; 4ZGJ B; 4LXC A; 1TOV A; 2B86 A; 3P8D A; 4C5G A; 1BCO A; 2CYZ B; 2OJ2 A; 1AD5 A; 5CQX A; 2KBT A; 4R55 A; 3INZ A; 4DBQ A; 4E7L A; 1GXI E; 4K11 A; 2EKH A; 1IRX A; 3V8L A; 3ULR B; 1M3C A; 2YDL A; 2LZ6 B; 5D6Y A; 1VQ5 Q; 2VGM A; 2FZK B; 3UA6 A; 3OYK A; 2DRM A; 2E1H A; 2KVQ G; 2KEA A; 3NTK A; 5FWB A; 3J80 E; 1MV3 A; 5GAN 8; 4OMN A; 1BBZ A; 1X2K A; 3MEU A; 2XKO C; 4KT0 E; 5GAO m; 1QWF A; 5GAM g; 3CEY A; 1M3B A; 1VYT A; 1Q81 U; 3HRS A; 1W70 A; 2EJF A; 1UEB A; 2YRD A; 2J05 A; 5HY6 A; 1TUD A; 2A28 A; 1RUW A; 1VQL A; 4DQ2 A; 1Q86 R; 3HRU A; 2VC8 A; 1J3T A; 2RPN A; 4M75 F; 2D6F A; 2NUP A; 1PCX A; 5LJ5 e; 1YI2 Q; 5KYU A; 2M02 A; 1WXU A; 1E7O A; 2GFA A; 2DL4 A; 2VVK A; 3CCV T; 1YHQ T; 1KQS P; 4M7D B; 4M7A F; 4PJN A; 3EGD B; 1Q82 U; 2QQR A; 2EYZ A; 4E7I A; 1TWB A; 4ZN1 A; 1VQ6 Q; 4FYW B; 1AZE A; 3L1A A; 1UGQ B; 1LPL A; 2DFU A; 2DRK A; 3PIO A; 3EFO A; 3QBY A; 2QQS A; 2HKQ B; 1BIA A; 4M77 A; 1SKU B; 2ROT A; 1RAC B; 4PL6 A; 3CC4 A; 4J9D A; 1HJD A; 2C0T A; 4F16 A; 3VUZ A; 4C92 D; 3GLX A; 3FLG A; 4ZNX A; 2GCX A; 1OI1 A; 5DY9 A; 4A53 A; 1KHI A; 1FMW A; 2P4T A; 1N8R R; 4ELY C; 3SD4 A; 1YI2 T; 4C92 B; 1QVP A; 3V7C A; 2DLP A; 1BB9 A; 2DYB A; 4JRI A; 1M2V B; 5AYF A; 3FB9 A; 2DZC A; 3QO3 A; 2COW A; 2I2L A; 4XU0 A; 3TCJ A; 4OB3 B; 2RHZ A; 3I56 Q; 1OU8 A; 3OYA A; 1IXD A; 4JLI A; 4CRI A; 2R5M A; 4A4G A; 2D0N A; 2RQV A; 1B34 A; 5GAN f; 4QQ6 A; 1X6B A; 1KFZ A; 1BYM A; 2HMA A; 1ZHI A; 3CCM Q; 1KJW A; 1VOM A; 3M57 A; 4B9X A; 3CME A; 1IHV A; 2ZCF B; 1M90 U; 2DEQ A; 2H8H A; 2V1R A; 1E6H A; 3M0Q A; 3GNF B; 4PFP A; 2KNB B; 4MDW A; 3ZEH A; 1PRL C; 1AWJ A; 2O31 A; 2ZZD A; 1PD1 A; 2G6F X; 3H9N A; 3S3N A; 3HRT A; 3RR6 A; 1U1S A; 3G4S Q; 1WDX A; 4C8Q C; 3FIF A; 3DB3 A; 3G7Z A; 5J26 A; 2BE9 B; 2KXC A; 1MHN A; 2LTO A; 2CP0 A; 4HXJ A; 2EWN A; 1SHG A; 1K9M U; 2MMP A; 3QDR B; 3I56 T; 2C0I A; 3OS2 A; 4L59 A; 3MCA B; 4OMQ A; 1I4K 1; 1FMV A; 4F7U G; 4P5N A; 2JMC A; 2DF6 A; 1NEG A; 3CCM T; 2CUB A; 1ZBX A; 1IO6 A; 4PJO B; 3M0S A; 4RG8 A; 3OS0 A; 2LJ3 A; 1Y96 B; 3X24 B; 3CPW A; 2RI2 A; 5KYN A; 1U06 A; 4QVD A; 3CPW S; 3FRN A; 5GAM f; 5FU6 C; 2DTI A; 1JJ2 A; 5LJ3 d; 5CIU A; 1YJ9 A; 1UFF A; 4LDU A; 1JJ2 S; 4IIM A; 1LOJ A; 4N4I A; 1RAF B; 2EPD A; 1D09 B; 4Z8A A; 4RUG A; 3M0U A; 2YRC A; 2A3L A; 3GOX A; 1IGQ A; 1UG1 A; 1VQL T; 2EAY A; 2D9T A; 2EQU A; 1B3Q A; 4J9B A; 1YIJ Q; 3AT1 B; 1FX7 A; 2E5K A; 2K5F A; 3BFM A; 4BI8 B; 1M9S A; 5FW9 A; 1SEM A; 4C8Q F; 3OS5 A; 2D0Q B; 1ZSZ C; 5I22 A; 4C0F A; 4D8D A; 1WJR A; 2KGT A; 2XDP A; 1WHL A; 1G5V A; 1YFN A; 2D8H A; 4E47 A; 1RL2 A; 2PZ1 A; 4LNP A; 5GMK l; 2K4Y A; 4M78 F; 3QSU A; 4QQD A; 1Q7Y C; 1TTH B; 5LJ3 h; 3JB9 I; 4DA4 A; 3QYG B; 3GPL A; 1QP3 A; 4PFZ A; 2FRY A; 2LX9 A; 5FLX E; 1TU0 B; 4RTY A; 3G71 Q; 2KRN A; 4AFU C; 3CC4 T; 3GBQ A; 4J83 A; 2JT4 A; 1SSF A; 1EFN A; 2MPX C; 3MKD A; 2DKG A; 4M7D G; 2HNI A; 1B07 A; 1QVG A; 3JCM V; 2K2M A; 1QVG S; 3JCM Q; 2K7A A; 4M75 D; 2NWM A; 5CK9 A; 2O88 A; 3C4S A; 2NLU A; 2QGF B; 4FW2 A; 2CP5 A; 2BZX A; 2DXC A; 1M1K C; 3EHR A; 5CKD A; 4M75 B; 2AKL A; 2F69 A; 3FJ5 A; 1NPP A; 3A8M B; 2WSC E; 5GAN 5; 3VUB A; 1M8M A; 3HTR A; 3LX7 A; 1WHK A; 2MWO A; 5LJ5 j; 4JRQ A; 3C12 A; 2A37 A; 4Z02 A; 5GAO l; 3CME T; 1OZ3 A; 3V8K A; 4M7A B; 2O4X A; 3VV0 A; 1YP5 A; 1H8K A; 2QDL A; 1RI9 A; 2AHJ B; 2Z0W A; 1UHC A; 4IUV A; 3F70 A; 3G71 T; 1D1B A; 2LQN A; 2KDS A; 4RTZ A; 2YT6 A; 3UA7 A; 2KAF A; 2RN8 A; 5GAN 6; 3QYH B; 1Q7Y R; 4HVV A; 2JMA A; 4FSS A; 2A08 A; 4L6V 5; 3LGF A; 4X34 A; 5L23 A; 4E6R A; 2Y4Y A; 3OS1 A; 4A4K A; 4E2F B; 4FW1 A; 2JNG A; 3JCM b; 3V8J A; 1O9S A; 3X25 B; 4M77 C; 4LDY A; 2ZAE A; 1KG1 A; 1AWX A; 1NM7 A; 4II1 A; 1HK9 A; 3S3M A; 3I9Q A; 4PJL A; 4KH1 B; 1YIT A; 3EFS A; 3G1J A; 4JJB A; 1HXD A; 4EMK B; 1YBY A; 4A4H A; 5KCO A; 1GBR A; 3CCQ A; 3OMC A; 1QKW A; 2DNU A; 5M9O A; 2DXU A; 2JW4 A; 2OTJ Q; 3CD6 A; 4C92 F; 3PT9 A; 3I55 Q; 4LDW A; 3A1P A; 1YJ9 T; 2JVV A; 4DBF A; 4XTV A; 1OU9 A; 1UDL A; 2FZC B; 4MZP A; 4CC2 A; 3OMG A; 4FYX B; 2SEM A; 2OAW A; 1VYV A; 3I35 A; 5GMK e; 3JCM d; 2JTE A; 3CCU Q; 3OA6 A; 2AK5 A; 3GIB A; 1QCN A; 1K76 A; 1K0X A; 1VQ5 A; 1VQN Q; 2AKK A; 2PQW A; 5ECA A; 2JS0 A; 1QWE A; 2BZY A; 3M54 A; 3VS6 A; 3CC7 Q; 2JTF A; 4OF1 A; 4XAX B; 2DYI A; 4C0Z A; 4FT4 A; 4NL3 A; 2DER A; 1ZBJ A; 2PUO B; 2K5L A; 3QDF A; 2AIR B; 2OTJ T; 3E19 A; 2YRV A; 2CUD A; 1WQ7 A; 3EG0 A; 1OZ2 A; 1M3A A; 1P92 A; 2WSF E; 2E5Q A; 1NLP C; 4F7U A; 2M51 A; 5LJ5 d; 3OBY A; 3PTA A; 1KQ1 A; 1K8A R; 1EIF A; 1E6G A; 2QEX Q; 3NTH A; 2VKN A; 4YTL A; 4LN2 A; 1OX9 A; 1YI2 A; 3UF4 A; 2YSQ A; 2LQK A; 1KC8 U; 1H3H A; 4R0K A; 3EHQ A; 4M4Z A; 2RQW A; 3HKS A; 1T3L A; 3CCU T; 3EG9 A; 1JJ2 P; 4C5I A; 4CC4 B; 5I2M A; 2MF2 A; 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