The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the complex between the N-terminal SH3 domain of CrkII and a proline-rich ligand
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
|
| total genus |
10
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-07-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTZ A; 3VS5 A; 1GFD A; 4GBQ A; 3EG3 A; 2A36 A; 3C0C A; 1AWO A; 1RLP C; 2KT1 A; 1MUZ A; 2O9S A; 4HVU A; 3CQT A; 4DEX A; 2ED1 A; 1TUD A; 2SRC A; 4IIO A; 1UGV A; 4CC4 B; 3PVQ A; 2F2W A; 2EKH A; 2KEA A; 3EHR A; 1OV3 A; 2MIO A; 1I07 A; 1QKW A; 4K11 A; 2X3X D; 1AOJ A; 1ABQ A; 1E6H A; 2CT3 A; 1SRM A; 1I0C A; 3I35 A; 1X2K A; 1JO8 A; 4HXJ A; 1X43 A; 2PNI A; 4CC7 A; 3M0U A; 4RTW A; 2BZY A; 2NUZ A; 4DEY A; 2EVR A; 1Y57 A; 5IH2 A; 1B3Q A; 4ESR A; 4OMN A; 2A28 A; 4RTU A; 2J6K A; 3VS7 A; 5HCK A; 1MV0 B; 1QKX A; 1K0X A; 2CSI A; 4E6R A; 2V1R A; 2ESW A; 2LMJ A; 1A0N B; 1TUC A; 5IHK A; 1M3A A; 3REA B; 1X2Q A; 1QLY A; 1JEG A; 1RI9 A; 1H92 A; 1BU1 A; 1OPK A; 1VYV A; 2J6F A; 3KFV A; 2RQT A; 4AFS C; 1X6B A; 1SHF A; 2DF6 A; 1JXM A; 2SEM A; 4J9B A; 2L0A A; 1PHT A; 5L23 A; 4F16 A; 2AK5 A; 5IXB A; 2C0I A; 1WXB A; 2C0T A; 4RUG A; 2KYB A; 2RQU A; 5GJW B; 2V1Q A; 2HSP A; 2A37 A; 1X69 A; 5EC7 A; 2K3B A; 4F14 A; 2DLP A; 2K9G A; 1ABO A; 2FPE A; 2RNA A; 2JS2 A; 5I22 A; 1JU5 C; 2PTK A; 3EGU A; 1ZBJ A; 1SEM A; 2PZ1 A; 1NEG A; 2O31 A; 4LE9 A; 4OML A; 4JJB A; 1KJW A; 1KSW A; 1YNZ A; 2K2M A; 4Z89 A; 1WXU A; 3O5Z A; 2GGR A; 2ROL A; 1PWT A; 2LJ3 A; 4J9I A; 4CC2 A; 2KE9 A; 2GTO A; 4QT7 A; 2F2V A; 4J9H A; 1WI7 A; 1W6X A; 2BZX A; 2DRM A; 3I5R A; 1UJY A; 2LP5 A; 2O9V A; 4JZ3 A; 1K0S A; 1VYU A; 1GCQ A; 2RPN A; 2LJ0 A; 4LUD A; 3RBB B; 3H0F A; 1BBZ A; 2DNU A; 2RF0 A; 2X3W D; 2FRY A; 3M0P A; 4IIM A; 1K9A A; 2KRS A; 2MCN A; 4OMM A; 2JTE A; 4HVW A; 2EPD A; 1W1F A; 1WX6 A; 1XOV A; 1AWJ A; 4EIK A; 1AZE A; 2YUO A; 2F2X A; 1J3T A; 1QWE A; 2VWF A; 2DL5 A; 2KNB B; 4AG2 C; 1PKT A; 2K6D A; 1SHG A; 1GBR A; 3EG2 A; 4OMP A; 4AFQ C; 2DJQ A; 4A63 B; 2CUD A; 2HCK A; 3UA7 A; 3VS3 A; 2E5K A; 4J9G A; 3TSW A; 4AFZ C; 2O88 A; 2DE0 X; 4J9D A; 3UAT A; 4RTT A; 5FWC A; 1U06 A; 1T0H A; 1WYX A; 1CKB A; 2K7A A; 2EW3 A; 3VS6 A; 4JPB W; 4LUE A; 1BB9 A; 2ROT A; 4ORZ A; 2CUB A; 1X27 A; 4FSS A; 1WXT A; 2EGE A; 2JXB A; 2EQI A; 4J9F A; 4LNP A; 2YUQ A; 3GBQ A; 1V1C A; 1GCQ C; 1LCK A; 1ZX6 A; 2YT6 A; 1E7O A; 1OPL A; 1OEB A; 3I9Q A; 2ECZ A; 2LQN A; 2ABL A; 2D8H A; 1PKS A; 4OMO A; 1HD3 A; 2RQV A; 3NPF A; 2BZ8 A; 1UHC A; 2MOX A; 1UUE A; 1X6G A; 2JW4 A; 4CC3 A; 1GL5 A; 3SHW A; 2L3S A; 1QCF A; 2LX7 A; 1B07 A; 1Z9Z A; 2GNC A; 1M3C A; 5I11 A; 1NLO C; 1T0J A; 3R6N A; 2DIL A; 2DYB A; 2O2O A; 3EHQ A; 1G2B A; 2P4R A; 1H8K A; 2M51 A; 2RMO A; 1YN8 A; 2B86 A; 1YP5 A; 2OAW A; 3JV3 A; 5IHI A; 1K4U S; 2EYX A; 1W70 A; 2A08 A; 2RN8 A; 2LCS A; 2VKN A; 1ZUY A; 1MV3 A; 2D8J A; 2OJ2 A; 1WFW A; 2KRM A; 4RTX A; 2EYY A; 5FW9 A; 2DVJ A; 2YSQ A; 1RUW A; 2YDL A; 1K1Z A; 4LN2 A; 1PRM C; 2KYM A; 1UJ0 A; 2EYW A; 2FRW A; 1M3B A; 2BTT A; 4R0K A; 2DL3 A; 3RNJ A; 1ZLM A; 5FWB A; 1JXO A; 1WLP B; 2LQW A; 1QWF A; 1OOT A; 2CSQ A; 2JMC A; 2J6O A; 2KR3 A; 1GBQ A; 1ZUK A; 5IHN A; 4J9E A; 1IO6 A; 4D8D A; 2ENM A; 1S1N A; 2DMO A; 2I0N A; 2GQI A; 3NMZ C; 1UFF A; 4D8K A; 1Z9Q A; 1BK2 A; 2W0Z A; 1YWP A; 2M0Y A; 1UG1 A; 1U3O A; 2GBQ A; 2IIM A; 1CKA A; 2DBK A; 1H3H A; 1NG2 A; 2DRK A; 2CT4 A; 2DA9 A; 2FEI A; 2AZV A; 3THK A; 1I1J A; 2YUN A; 2EBP A; 1M27 C; 1NYF A; 3LH5 A; 1YWO A; 1M8M A; 2CDT A; 2EYZ A; 4M4Z A; 1SRL A; 1FMK A; 1M30 A; 4X1V A; 2DX1 A; 2D1X A; 2FG0 A; 3EG1 A; 3VS1 A; 1T3S A; 2XMF A; 3SEM A; 2LNH B; 2J7I A; 1E6G A; 3VS4 A; 1HJD A; 3UF4 A; 1VYT A; 1ZSG A; 4F17 A; 4HCK A; 3QWY A; 3VRZ A; 1KFZ A; 2L3Q A; 3TSZ A; 2DL4 A; 2FO0 A; 1TG0 A; 2HEQ A; 4JZ4 A; 2LJ1 A; 1UDL A; 4JJD A; 3M0T A; 3A98 A; 2C0O A; 2KT8 A; 3UA6 A; 1N5Z A; 2LZ6 B; 1GFC A; 1YCS B; 1EFN A; 2K79 A; 4RTV A; 3TVT A; 2DM1 A; 2JM8 A; 3VS2 A; 1NLP C; 3ZL7 C; 2G6F X; 1U5S A; 1SPK A; 5GJV B; 2KGT A; 2AKK A; 2W10 A; 1G83 A; 5ECA A; 2CH4 A; 1GCP A; 2KXD A; 4KRT A; 1AWW A; 1ARK A; 2YUP A; 2J06 A; 4GLM A; 1VA7 A; 2EGA A; 3H0H A; 1UEC A; 2JS0 A; 1T3L A; 2DBM A; 3H41 A; 2L3P A; 1K76 A; 2GTJ A; 2L2P A; 2NWM A; 2VVK A; 3VRY A; 1AVZ C; 1AD5 A; 2CH4 W; 2JM9 A; 2D0N A; 3REB B; 3U23 A; 1KIK A; 1WIE A; 4JJC A; 4Z88 A; 1WDX A; 4WCI A; 2CRE A; 1ZUU A; 1GRI A; 2KXC A; 4Z8A A; 4RTY A; 2KRN A; 3M0Q A; 2AKL A; 3IQL A; 1UHF A; 3H0I A; 1AWX A; 1PNJ A; 1CSK A; 2FPF A; 3PVL A; 3NGP A; 1JQQ A; 4OMQ A; 1HSQ A; 1SSH A; 3FJ5 A; 4ZNX A; 3M0S A; 1AEY A; 2H8H A; 2JMA A; 4AG1 C; 1UTI A; 1NYG A; 2RQR A; 2KBT A; 1FYN A; 2RQW A; 1UE9 A; 2JT4 A; 3M0R A; 3VS0 A; 2DL7 A; 2QDL A; 2EGC A; 1RLQ C; 3QWX X; 2J05 A; 2ED0 A; 5IXF A; 2OI3 A; 3NHN A; 3ULR B; 1WA7 A; 1PRL C; 2DL8 A; 2AZS A; 2FPD A; 3EG0 A; 1NM7 A; 4HVV A; 2KRO A; 2HDA A; 4Y92 A; 4AFU C; 3PE0 A; 2HBW A; 1Y0M A; 1NEB A; 3I5S A; 1AZG B; 4J9C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RTZ A; 2MWO A; 4A4F A; 1NE8 A; 4PFP A; 3EG3 A; 4EPC A; 1B34 A; 2DPP B; 2A36 A; 4A53 A; 1AWO A; 4HT8 A; 2ED1 A; 3OYG A; 1VQO Q; 4DOV A; 1TUD A; 4XTW A; 3QBY A; 2VGM A; 3VUB A; 3BFM A; 4DBF A; 3X26 B; 2EKH A; 3SWN C; 2JVV A; 3H9N A; 4J7F A; 1E6H A; 1SRM A; 2KAF A; 1I0C A; 2EKO A; 5GAN 3; 2CP3 A; 4HXJ A; 4NL3 A; 5GAM g; 3EG9 B; 2DIG A; 1P92 A; 2E65 A; 3V8L A; 4CC7 A; 2YRV A; 4M77 D; 1Q82 U; 2PUK B; 1M1G A; 4DEY A; 2EVR A; 1KD1 C; 4KUD K; 4OMN A; 3OS1 A; 2ZZD A; 3QDR B; 3HFN A; 2Y4X A; 5HCK A; 2CSI A; 3MP1 A; 4HCB A; 2D9T A; 1XTD A; 1A0N B; 1TUC A; 5IHK A; 1HXD A; 3REA B; 2PVG B; 4KGZ B; 1JEG A; 1MND A; 1YCY A; 3JCM d; 3CC7 T; 1G3S A; 1BU1 A; 4M78 B; 1VYV A; 5FLX E; 2RQT A; 3L2Z A; 2QA4 T; 4JLG A; 3NTI A; 1TOV A; 1Y07 A; 4FL6 A; 2A0F B; 2DF6 A; 2LNV A; 4M75 F; 1G5V A; 1AT1 B; 5IXB A; 3O8V A; 5GAN 4; 4NL2 A; 2C0T A; 3BY7 A; 1D1B A; 2A37 A; 3FDR A; 1Q7Y C; 3CCV A; 3OS2 A; 1ABO A; 2FZK B; 4BUG A; 1FWZ A; 2LQ8 A; 3CC7 A; 1IRX A; 3EGU A; 1ZBJ A; 2RHU A; 3CD6 A; 2QA4 A; 2PVO B; 2YRD A; 4C8Q D; 3OB9 A; 1KK7 A; 4PJJ A; 1WXU A; 2D6F A; 1XJW B; 1PWT A; 2DD4 A; 2EQK A; 1QVF P; 2V8J A; 1EIF A; 4OB3 B; 2BZX A; 1XNI A; 4E2F B; 1UJY A; 2LP5 A; 4PJM A; 3CC2 T; 4ZTJ A; 5A0L A; 2RPN A; 1M90 C; 5CKD A; 3L2Q A; 3H0F A; 2O01 E; 4M75 B; 5GAN 6; 5KYW B; 4IIM A; 4RCB A; 3GF5 A; 2MCN A; 1IHW A; 4D6W A; 3CCL T; 3N5B B; 5D6Y A; 5GAN 8; 3CCE Q; 4C0Z A; 2YUO A; 3X25 B; 2F2X A; 1SKU B; 1TU0 B; 2KNB B; 3OBY A; 3JCM h; 2E6N A; 4AG2 C; 2K6D A; 3CC2 A; 1VQ6 T; 2GCX A; 3A8G B; 1GBR A; 2EWN A; 3V7S A; 1N6A A; 2DJQ A; 2KVQ G; 3UA7 A; 4MZM A; 4J9G A; 4AFZ C; 4RTT A; 1CKB A; 3EFO B; 2K7A A; 3V8K A; 4M78 G; 5CO7 A; 2KSS A; 5EG2 A; 2CUB A; 4FSS A; 2EGE A; 2JXB A; 1WNL A; 2X35 A; 2EQI A; 1C6V X; 1FMV A; 1WZO A; 5GAO p; 2MI6 A; 1JBM A; 2YT6 A; 1RAF B; 4M7D A; 1F1B B; 3INZ A; 3OW2 A; 3EH1 A; 3ZBD A; 2H3E B; 3NPF A; 4E7J A; 3S6W A; 1UHC A; 3C12 A; 4BY6 C; 2HZY A; 3TRE A; 4M7A D; 1UUE A; 2JW4 A; 2P84 A; 4IUU A; 1K9M U; 1YHQ T; 3QKJ A; 2ZCF B; 4R55 A; 1D3B B; 2PVD B; 2YRC A; 1VQO T; 2O2O A; 3LLR A; 1G2B A; 2P4R A; 1RAG B; 1KHI A; 1IRE B; 2RMO A; 4N0A C; 2YWW A; 1RAI B; 1LOJ A; 2K3X A; 4B9W A; 3BDL A; 3G71 A; 2CS7 A; 1W2B P; 3QDF A; 4M77 C; 2KRM A; 5LJ3 f; 2DVJ A; 2NUP A; 1VQO A; 2FRW A; 3GIB A; 2QQ9 A; 5FU7 C; 2COY A; 3RNJ A; 3CCM T; 4C92 A; 1WLP B; 5KYX B; 3OYE A; 1VQP Q; 2J6O A; 1W4S A; 3QO3 A; 3JCM f; 2XHC A; 1IO6 A; 1M1K C; 2I0N A; 5CKH A; 1TWB A; 1WJR A; 4F7U E; 3SB2 A; 1YI2 A; 2DET A; 3CC4 T; 1MMN A; 1UFF A; 4BE2 A; 2GBQ A; 1X75 C; 3E1S A; 1VQ9 T; 1U8R A; 1NG2 A; 1N8R C; 2DYI A; 4X9D A; 5LJ5 d; 2EYQ A; 2NUT B; 1M27 C; 1OX8 A; 2DFU A; 1KHC A; 1K8A U; 4LD9 K; 1M8M A; 2CDT A; 3SWN B; 4X1V A; 4JRI A; 1OI1 A; 5GAN h; 2JN0 A; 4C8Q C; 3QXE B; 1HJD A; 4HKE A; 5C6S A; 2HL5 C; 4F17 A; 3P8B B; 3TSZ A; 4JZ4 A; 2X9H A; 1QMC A; 2QGF B; 4OP0 A; 2C06 A; 2QQR A; 2HD0 A; 5I21 A; 2LZ6 B; 2E3I A; 1YJN Q; 2K79 A; 1QVF A; 5CVI A; 2K4Y A; 1UGP B; 2K5I A; 2MK5 A; 1YJW Q; 4AMC A; 2IPO B; 1NZ9 A; 3RMS A; 2G6F X; 2KGT A; 5GAN 5; 2KXD A; 5HKC A; 5GMK j; 1R77 A; 4A4K A; 2RHZ A; 2LTO A; 4ATO A; 5GAO l; 1BIB A; 1K76 A; 2GTJ A; 2L2P A; 2NWM A; 2ZPF B; 3VRY A; 1AVZ C; 3PIO A; 3JCM V; 5CQX A; 4J6Y A; 1Y7X A; 1I81 A; 1W2B S; 1B7T A; 9ATC B; 1WIE A; 1VQ4 T; 2P0K A; 1VQK Q; 3ASK A; 3CXC S; 4RMO A; 1I4K 1; 1GRI A; 2RI5 A; 4FM4 B; 3AHU A; 5CIU A; 4WTO B; 2OTL A; 2RHI A; 2KRN A; 3CCE A; 3V7C A; 1UHF A; 1AWX A; 1PNJ A; 5CK9 A; 3I56 T; 1WHJ A; 2CZ7 B; 3TCJ A; 4OMQ A; 3JB9 D; 4L6V 5; 4ZNX A; 3CCQ Q; 1AEY A; 2XKO C; 4AG1 C; 4XAX B; 2JT4 A; 3EGX A; 1NJI C; 1VQ8 T; 1Q81 C; 4PJO E; 2M0O A; 3VS0 A; 2EGC A; 4MZT A; 2ED0 A; 3NHN A; 3ULR B; 2F1L A; 1PRL C; 2DL8 A; 2COW A; 4DBH A; 4EMK C; 4QVC A; 5J39 A; 3BE3 A; 4M7A C; 4HVV A; 7AT1 B; 2RI3 A; 2KRO A; 1H3Z A; 2E5Q A; 3T9N A; 5KH6 A; 1NEB A; 1BKB A; 4OGC A; 5LJ3 j; 3VS5 A; 3OYY A; 5GAN f; 4C0F A; 5KYU A; 1OQK A; 2KT1 A; 5GMK i; 2V8K A; 2A3L A; 4DEX A; 5CR2 A; 5KYY A; 2L5Q A; 2SRC A; 1UGV A; 4M78 A; 2QEX T; 4J6W A; 2E3H A; 1OV3 A; 3G1J A; 3G4S Q; 1QKW A; 4K11 A; 1PG5 B; 1LVK A; 3LYI A; 1AOJ A; 1BCO A; 2CT3 A; 2MWP A; 4IUR A; 3CEY A; 1R0B G; 1X2K A; 1X43 A; 3OA6 A; 2PNI A; 3QG1 A; 3M0U A; 2M02 A; 3RKY A; 4KH1 B; 3CCU Q; 4M7D D; 4JS4 A; 4M77 F; 1MV0 B; 2CYZ B; 3CCS Q; 2DK3 A; 5DLQ E; 3FLG A; 1YIJ Q; 4FW2 A; 2RD1 A; 1QLY A; 4BY6 B; 2DER A; 1RI9 A; 2R5A A; 3SFM A; 2OTJ Q; 2J6F A; 4AFS C; 4PJO B; 1D0Z A; 1U1T A; 5GAM d; 2SEM A; 2H3J A; 5L23 A; 4F16 A; 2KK4 A; 3WVE B; 3HRU A; 3G6E T; 2RQU A; 2QG9 B; 2YHT A; 5LJ3 e; 1VQP A; 2K3B A; 1UB4 A; 1KD1 U; 2DLP A; 4ANJ A; 2RNA A; 2RK2 A; 1Y96 A; 2JS2 A; 3JB9 J; 1LNX A; 2PTK A; 3H6Z A; 4BI3 A; 3CMA Q; 2PZ1 A; 1NEG A; 2O31 A; 4M77 B; 2KY9 A; 4LE9 A; 4OML A; 3OBW A; 1OYX A; 1YNZ A; 2K2M A; 3MEA A; 4Z89 A; 4C8Q F; 3ER0 A; 3OW2 P; 4J9I A; 4Q5W A; 3EFO A; 4J9H A; 2E4H A; 4A4H A; 5KCO A; 3OYA A; 1IZ6 A; 2CP0 A; 1UEB A; 3MKD A; 1W6X A; 4KT0 E; 4C92 D; 3HRS A; 3I5R A; 1K0S A; 4JZ3 A; 1YJN T; 4C0D C; 3JCM c; 1MMA A; 1VYU A; 2BE9 B; 1G3T A; 3CME Q; 4LUD A; 2M9U A; 1BBZ A; 3MP8 A; 4FYY B; 3CCJ Q; 4PNO A; 1QP3 A; 1K9A A; 2KRS A; 4BAC A; 4E7H A; 2JTE A; 1VQ5 Q; 4HVW A; 4A54 A; 2EPD A; 1YBY A; 2E10 A; 1LJO A; 1XOV A; 1AWJ A; 3OYC A; 1J3T A; 2RH2 A; 1PKT A; 1YJN A; 4Y91 A; 4AFQ C; 4A63 B; 3FJP A; 2HCK A; 3R6O A; 3VS3 A; 2E5K A; 1YJW A; 2ZPI B; 2O88 A; 2DE0 X; 5GAM h; 3A8H B; 2CKK A; 5FWC A; 2OX7 A; 5DLO A; 1T0H A; 1WYX A; 4C8Q B; 2EW3 A; 2HMA A; 4JRQ A; 1AHJ B; 1YI2 Q; 1M90 U; 1S72 Q; 2O4X A; 4PJO G; 4JPB W; 2V26 A; 4LUE A; 3OS5 A; 4M75 E; 4ORZ A; 1X27 A; 4BDZ A; 1KQS A; 2F5K A; 4F04 B; 4J9F A; 4M7A E; 4JJN K; 4LNP A; 1UGQ B; 3RER A; 1V1C A; 5GAN j; 1E7O A; 1VQK A; 1IGU A; 3GNG A; 4E7Z A; 5GMK l; 2ECZ A; 3CCV T; 3HRT A; 1NJI R; 1PKS A; 1Q81 R; 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