The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KYLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7Y, K60Y
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
12
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ABQ A; 4OMM A; 3M0P A; 1QLY A; 1WA7 A; 2RQU A; 1YWO A; 2KT8 A; 2OAW A; 1M27 C; 3TVT A; 3UA6 A; 2C0I A; 2DA9 A; 3NMZ C; 1U3O A; 4OML A; 1ZUU A; 1K9A A; 1J3T A; 1BU1 A; 2F2V A; 1ZUK A; 1GBR A; 4LE9 A; 1T3L A; 2F2W A; 1TUD A; 1BBZ A; 4HVW A; 1GBQ A; 3VS6 A; 4J9F A; 2VVK A; 4J9D A; 2RMO A; 2C0O A; 3M0R A; 2JMA A; 2GQI A; 2O31 A; 4JJD A; 2VKN A; 2RF0 A; 3UA7 A; 3SEM A; 4IIO A; 1I0C A; 2RN8 A; 4HVV A; 2JTE A; 4AFS C; 3PVQ A; 3H41 A; 1X2K A; 1PWT A; 3VS7 A; 4R0K A; 1AWW A; 4Z88 A; 4M4Z A; 1AOJ A; 4GLM A; 4JJB A; 1YP5 A; 1YNZ A; 2D8H A; 4ZNX A; 1CSK A; 2LZ6 B; 2DL4 A; 1OEB A; 2AZV A; 2DE0 X; 5IXF A; 1LCK A; 2KGT A; 2ENM A; 2MCN A; 1AD5 A; 1TG0 A; 1BK2 A; 2EW3 A; 2FRY A; 1UDL A; 3VS4 A; 2ROT A; 1YCS B; 1SRM A; 2DNU A; 5I22 A; 4F16 A; 2GTJ A; 5FWB A; 2J05 A; 5I11 A; 4HCK A; 3U23 A; 1Y57 A; 2ED1 A; 1ZUY A; 1K0X A; 2L2P A; 3REB B; 1MV3 A; 2FG0 A; 3NHN A; 2JS2 A; 4HXJ A; 1VYU A; 5L23 A; 1OPL A; 2K7A A; 2P4R A; 1NM7 A; 3O5Z A; 1AWX A; 1B3Q A; 2L3S A; 2AZS A; 3EG0 A; 4RTZ A; 4CC7 A; 2PTK A; 2J6O A; 2CT4 A; 2DYB A; 3VS1 A; 2LP5 A; 1AWJ A; 1UJ0 A; 1Z9Z A; 2KXD A; 2V1R A; 2JM8 A; 2O9V A; 4OMO A; 2ESW A; 1UJY A; 2KT1 A; 1Y0M A; 3EGU A; 2ECZ A; 2O88 A; 1GCQ A; 1A0N B; 1QKW A; 2VWF A; 2KRM A; 2MOX A; 4JZ3 A; 2DM1 A; 1HSQ A; 2EQI A; 2YUN A; 4IIM A; 4JPB W; 1GFD A; 2HDA A; 1GL5 A; 1X43 A; 1G83 A; 2BZX A; 4ESR A; 1FYN A; 2F2X A; 3NPF A; 4AG2 C; 2O2O A; 1M3A A; 1SRL A; 2ED0 A; 1AWO A; 2X3X D; 3UAT A; 2J7I A; 2DLP A; 3TSW A; 4J9I A; 2CUD A; 4CC3 A; 1QWF A; 1GFC A; 2KRN A; 2KYM A; 3THK A; 1E7O A; 1OPK A; 1GCP A; 1UG1 A; 4RUG A; 3VS3 A; 1Z9Q A; 1U5S A; 2AKL A; 1X6B A; 5FW9 A; 3IQL A; 1ZX6 A; 2LCS A; 1W70 A; 1UHC A; 2RQV A; 2D8J A; 1WXB A; 4AFZ C; 2LX7 A; 4D8D A; 2LJ0 A; 2YUO A; 3C0C A; 4J9B A; 2EYZ A; 2DRK A; 4Z89 A; 1G2B A; 1V1C A; 1GCQ C; 4Z8A A; 1K0S A; 2H8H A; 1UEC A; 1QWE A; 1U06 A; 1WYX A; 2KEA A; 1S1N A; 2JM9 A; 1EFN A; 1NEG A; 4LUE A; 4E6R A; 1JO8 A; 1SSH A; 5GJW B; 5IH2 A; 1I07 A; 2CUB A; 2FEI A; 2KE9 A; 2JXB A; 3QWX X; 1ARK A; 2J6K A; 2KBT A; 1RLQ C; 2DVJ A; 2M51 A; 3I5S A; 1SPK A; 4AFQ C; 4OMP A; 2EGC A; 2K2M A; 4ORZ A; 2K3B A; 2HEQ A; 2EBP A; 3RBB B; 1H3H A; 4QT7 A; 1AVZ C; 1M30 A; 1QCF A; 2CH4 W; 1NYF A; 2I0N A; 4CC4 B; 2QDL A; 2DL7 A; 2L3P A; 4J9G A; 3H0H A; 2RNA A; 2FO0 A; 1AEY A; 1K76 A; 1NG2 A; 2HSP A; 2MIO A; 3M0S A; 2LNH B; 1AZG B; 1NLP C; 2E5K A; 2W10 A; 2DL5 A; 2HBW A; 3VS2 A; 2A36 A; 2G6F X; 3RNJ A; 1JEG A; 2LJ1 A; 2JT4 A; 3EG3 A; 2J6F A; 4J9C A; 2GGR A; 1OV3 A; 1WIE A; 1WLP B; 1UFF A; 2SEM A; 3EHQ A; 1MUZ A; 2FPF A; 3NGP A; 2DMO A; 2O9S A; 1HJD A; 1ZSG A; 2EYX A; 2JS0 A; 2PNI A; 1T0H A; 1ZLM A; 4DEY A; 2A08 A; 1RLP C; 4AFU C; 1E6G A; 3H0F A; 1N5Z A; 2YSQ A; 1UE9 A; 2PZ1 A; 1IO6 A; 1M3B A; 3I5R A; 4LNP A; 4RTX A; 3TSZ A; 1SHG A; 2IIM A; 2DJQ A; 3M0Q A; 3JV3 A; 2L0A A; 2OI3 A; 2NWM A; 3I9Q A; 5HCK A; 2K6D A; 1PHT A; 3VRZ A; 1WFW A; 3H0I A; 1UHF A; 2FRW A; 2M0Y A; 1NLO C; 1RUW A; 4JJC A; 1VYT A; 2A28 A; 1KFZ A; 1KIK A; 2KR3 A; 1PRM C; 2NUZ A; 3EG1 A; 2K9G A; 3ZL7 C; 2CRE A; 2DL3 A; 1XOV A; 2DBM A; 2C0T A; 2EGE A; 2HCK A; 3I35 A; 2EPD A; 2DIL A; 2W0Z A; 2XMF A; 2EKH A; 1KSW A; 2DF6 A; 2AKK A; 3SHW A; 2AK5 A; 5FWC A; 2J06 A; 1NYG A; 2LQN A; 2RQR A; 1JU5 C; 1CKB A; 4OMQ A; 1ZBJ A; 1QKX A; 1GRI A; 4LUD A; 1YWP A; 5GJV B; 1M3C A; 2DRM A; 2KXC A; 2YUQ A; 3CQT A; 2OJ2 A; 2RQW A; 2V1Q A; 1HD3 A; 2BTT A; 3R6N A; 1E6H A; 2L3Q A; 4J9H A; 4RTY A; 1FMK A; 1YN8 A; 4HVU A; 1H92 A; 1X2Q A; 1VA7 A; 2X3W D; 2EYY A; 2LQW A; 1VYV A; 2JW4 A; 4LN2 A; 4F14 A; 2SRC A; 1B07 A; 3QWY A; 1ABO A; 3GBQ A; 1WX6 A; 1X69 A; 3FJ5 A; 4Y92 A; 2JMC A; 1UGV A; 2BZY A; 2DL8 A; 1NEB A; 2DX1 A; 2KRS A; 3VS5 A; 2B86 A; 3ULR B; 5ECA A; 2GNC A; 1K1Z A; 1W1F A; 1W6X A; 3M0U A; 4FSS A; 2DBK A; 4X1V A; 4DEX A; 2YDL A; 3VS0 A; 2CSI A; 3PE0 A; 1TUC A; 2YUP A; 1T0J A; 2FPE A; 2KNB B; 5IHK A; 1WXU A; 2ROL A; 5IHN A; 2GTO A; 4AG1 C; 4D8K A; 3VRY A; 2FPD A; 4RTV A; 2KRO A; 5IHI A; 2GBQ A; 2CSQ A; 1PNJ A; 3A98 A; 2CT3 A; 4KRT A; 1PKS A; 1M8M A; 1WI7 A; 1OOT A; 4WCI A; 1SEM A; 2ABL A; 1I1J A; 2K79 A; 1JQQ A; 1K4U S; 4EIK A; 2LJ3 A; 4JZ4 A; 1WXT A; 1AZE A; 2EGA A; 2D0N A; 2BZ8 A; 4A63 B; 1MV0 B; 4K11 A; 1BB9 A; 5EC7 A; 1T3S A; 1PKT A; 1X27 A; 1UTI A; 2EYW A; 1H8K A; 1KJW A; 1WDX A; 3LH5 A; 2RPN A; 1X6G A; 4CC2 A; 4J9E A; 4GBQ A; 4OMN A; 1PRL C; 4F17 A; 3EHR A; 1RI9 A; 2LMJ A; 4RTT A; 3M0T A; 2EVR A; 3PVL A; 2KYB A; 3EG2 A; 5IXB A; 1CKA A; 2RQT A; 2CH4 A; 2D1X A; 1JXM A; 2YT6 A; 3REA B; 2CDT A; 4RTU A; 4RTW A; 1JXO A; 2A37 A; 3UF4 A; 1SHF A; 1UUE A; 3KFV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAO l; 3M0P A; 2RQU A; 1YWO A; 1QP3 A; 2P0P A; 5CR2 A; 2DA9 A; 3NMZ C; 3I56 Q; 4ATO A; 1LOJ A; 1VQ9 A; 1YJN T; 4FU6 A; 1BCO A; 3GF5 A; 1WHL A; 1ZUK A; 3QO3 A; 4E2F B; 1TUD A; 4R55 A; 1KQS S; 4XU0 A; 3OY9 A; 4KH1 B; 2D0Q B; 3TRE A; 2VVK A; 2FYK A; 3ZFJ A; 3M0R A; 4D6W A; 2JMA A; 2GQI A; 3E9F A; 1WQW A; 2RHU A; 4JJD A; 2LRQ A; 2VKN A; 2YRV A; 2CZ6 B; 2ZPI B; 3GNG A; 4HVV A; 2FZG B; 4OF1 A; 1RAG B; 5I21 A; 2OTJ A; 2QDY B; 1X2K A; 2QA4 A; 1AWW A; 2LCC A; 4E7S A; 4QQ6 A; 1H64 1; 4KUL A; 4M4Z A; 4E47 A; 1B7T A; 1WHK A; 3S3N A; 2DTH A; 2QEX T; 3CME A; 1AOJ A; 2CP0 A; 3OS0 A; 3HL8 A; 4FCY A; 1VQN T; 3M53 A; 1OEB A; 5IXF A; 5HK3 A; 2IG0 A; 4AMC A; 1IHV A; 1F1B B; 1TG0 A; 3X28 B; 2AIR B; 1RAC B; 2EWN A; 4M7D A; 1UDL A; 1PC0 A; 4M7D G; 4XAX B; 3PNW C; 2H3J A; 1N9S A; 1K0X A; 4C8Q C; 3S6W A; 1BIA A; 2JS2 A; 4HXJ A; 3OW2 P; 1VQ8 Q; 4ME7 A; 4E7Z A; 2DXT A; 3QDR B; 4A53 A; 4A4E A; 4OGC A; 2RJD A; 2DIG A; 2HQH A; 2HAX A; 1SKU B; 1UJ0 A; 1X6O A; 2EQK A; 5DM7 R; 2V1R A; 1QVG P; 1VQM T; 2JM8 A; 2ESW A; 3CCL T; 1UJY A; 1Y0M A; 2O88 A; 1QKW A; 2VWF A; 3QHS A; 5LJ3 h; 3R6O A; 4IIM A; 2HDA A; 4C5H A; 4HA8 A; 1MND A; 4ZN3 A; 3LW5 E; 5GAN 4; 4QQD A; 4NS5 A; 5D6Y A; 3V7C A; 5GMK m; 2F2X A; 3NPF A; 4M7A B; 3I56 A; 1M3A A; 2X3X D; 2HZY A; 2EKO A; 2P0Q A; 5LJ3 e; 4EMK C; 1Q95 G; 1JJ2 S; 1E7O A; 2KY9 A; 3P8H A; 3CC4 Q; 3CPW A; 1Q7Y C; 1U5S A; 1IRX A; 3EGX A; 4C92 D; 4RCC A; 3CC2 T; 4AFZ C; 4Z02 A; 5FRO A; 4M75 B; 2LX9 A; 2X4J A; 4D8D A; 1TWB A; 2YUO A; 2EYZ A; 1V1C A; 3CCE Q; 4XTV A; 1QWE A; 1U06 A; 1VQ4 T; 4OVA A; 4DOV A; 2YXY A; 2CS7 A; 1EFN A; 5LJ5 j; 5GJW B; 3KUF A; 4F7U E; 1VQK T; 4FYW B; 3M4Y A; 3LGF A; 4C92 E; 2JXB A; 3KBG A; 2KBT A; 1RLQ C; 3JCM V; 2DVJ A; 3CCQ T; 3JCM h; 2OTL Q; 3I5S A; 4PKC C; 2WSC E; 3JB9 H; 4AFQ C; 2DFU A; 4OMP A; 1G5V A; 4XQ3 A; 5CQY A; 2E6N A; 3CCS T; 1H3H A; 2QAZ A; 4L6V 5; 3M55 A; 2QGF B; 2XD0 A; 2I0N A; 3M58 A; 1VQO Q; 4A4H A; 3JB9 I; 1M1G A; 4PK4 A; 2L3P A; 3V7S A; 2FO0 A; 3QYG B; 1AEY A; 3RMQ A; 2M1H A; 1U1S A; 5GAN 6; 1VUB A; 2HSP A; 3JCM e; 1YIT A; 3A8G B; 1LVK A; 2E5K A; 3HRT A; 4J8O A; 3QZ9 B; 2DL5 A; 1M5Q 1; 3CD6 T; 4F7U F; 1JEG A; 4PJO A; 4JUV A; 2A7Y A; 2J6F A; 4J9C A; 4C92 F; 4O5V A; 3FRN A; 1VQ8 A; 1WIE A; 3EHQ A; 2DMO A; 1HJD A; 3KXT A; 1YCY A; 1ZSG A; 3CBO A; 2EYX A; 2PNI A; 4M78 C; 4E7J A; 2RJF A; 1YJ9 T; 1M1K U; 2EFI A; 2F69 A; 3CCV T; 1IO6 A; 3BY7 A; 1PD0 A; 3CMA Q; 3CCM A; 3M0Q A; 2NWM A; 3CXC P; 2F5K A; 3VRZ A; 4J6X A; 1Q81 R; 3H0I A; 1M2V A; 1YFN A; 4JJC A; 3QUI A; 4ZN1 A; 2A28 A; 1KFZ A; 2KR3 A; 2K9G A; 2P0K A; 1K9M U; 2CRE A; 1XOV A; 1YJW Q; 2DBM A; 2HCK A; 1RL2 A; 7AT1 B; 2F1L A; 4E7L A; 4QKU A; 2HD0 A; 1W4S A; 2AK5 A; 5IAY A; 2J06 A; 2RQR A; 1YI2 Q; 3OB9 A; 4B9W A; 2DZ9 A; 1MMG A; 3VV0 A; 2LVM A; 4LDV A; 4PNO A; 4OMQ A; 5KYU A; 1Y7X A; 1BIB A; 5CKF A; 3CC4 A; 3MJX A; 5CCA A; 1VQ7 T; 3HRU A; 2DPP B; 1GXI E; 3CXC S; 2LNV A; 4BE1 A; 1ZBX A; 5CKB A; 1PSF A; 2DRM A; 4L59 A; 2OJ2 A; 1ZA1 B; 1E6H A; 2L3Q A; 4DOW A; 4GLK A; 1FMK A; 1YN8 A; 5GAM g; 1H92 A; 1VA7 A; 3JCM P; 3H8Z A; 2QXF A; 3CCE A; 4BI3 A; 3EGD B; 3AT1 B; 3FIF A; 4E7K A; 3FJ5 A; 1BI2 A; 1JRI A; 3EAE A; 2JMC A; 2BZY A; 2XKO C; 1MHN A; 1C1A A; 1NEB A; 4E7H A; 1OU9 A; 2ZAE A; 3ULR B; 1H3Z A; 3M0U A; 3L2R A; 2OTL A; 2DBK A; 4IUR A; 3VS0 A; 2CSI A; 4OP0 A; 3M56 A; 3A8M B; 2FPE A; 2KNB B; 3JCM c; 1WXU A; 1TH7 A; 1VQO A; 4D8K A; 2FPD A; 4RTV A; 2XHC A; 5IHI A; 4C92 G; 2CT3 A; 4C8Q B; 3RER A; 3D7S B; 1PKS A; 2DKG A; 1YHQ T; 1WI7 A; 4WCI A; 4HCB A; 1JQQ A; 2K2V A; 1Q82 R; 2COW A; 1AZE A; 1XTD A; 2BZ8 A; 1K8A C; 4HT8 A; 4K11 A; 1BB9 A; 5EC7 A; 1JB0 E; 5IT9 E; 1PKT A; 1X27 A; 1UTI A; 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4IUU A; 1AD5 A; 3PGG A; 1D1A A; 4IUT A; 4X9C A; 1NZ9 A; 1DJ7 B; 2DTI A; 2FRY A; 2GFA A; 1YCS B; 3OYY A; 4O6J A; 1TOV A; 2DNU A; 4HCC A; 3J80 E; 1MGQ A; 4BE0 A; 1Y57 A; 3CBP A; 1Q7Y U; 3FLG A; 4M78 B; 3REB B; 1MV3 A; 4DA4 A; 3HP9 A; 1VYU A; 8AT1 B; 5L23 A; 2K7A A; 1OX8 A; 2BE7 D; 2EQM A; 2L3S A; 1D0Z A; 3EG0 A; 2QQ9 A; 1OYX A; 4Y28 E; 4CC7 A; 3VS1 A; 2DYB A; 3EFS A; 2LP5 A; 2KXD A; 4NL2 A; 4LDX A; 1EX4 A; 3A8L B; 3I55 T; 2JZ2 A; 5HY6 A; 3EGU A; 1Q82 U; 1GCQ A; 2Y4X A; 2KRM A; 3GIB A; 2YUN A; 4RCB A; 4ELZ C; 5CKD A; 4J6W A; 4JPB W; 3TU4 K; 1X43 A; 2BZX A; 3NFC A; 3C4S A; 4M7D C; 1R0B G; 1FYN A; 4A4F A; 3G7Z A; 1U8R A; 4C8Q D; 2ED0 A; 2FL7 A; 5GAM j; 1AWO A; 1WJQ A; 2RHI A; 3RUX A; 1WJS A; 2QK0 A; 3FEO A; 3QBY A; 6AT1 B; 2KRN A; 1OX9 A; 3THK A; 1OPK A; 1GCP A; 4JDS A; 1G8X A; 2AKL A; 3GLX A; 3M57 A; 5FW9 A; 4C8Q E; 4PJN A; 3JB9 F; 1UHC A; 4FW1 A; 4JLI A; 3GP8 A; 3MP8 A; 4CI0 C; 1HYO A; 3QKJ A; 4PLI A; 3JCM b; 2KVQ G; 2M16 A; 3C0C A; 3N5B B; 3CPW S; 1G2B A; 1K0S A; 4OB3 B; 1VIF A; 2XDP A; 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