The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
DETGKFLVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
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| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7F, K60F
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
13
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4Z88 A; 1X69 A; 5ECA A; 2DL4 A; 2AZS A; 2KYM A; 3EG3 A; 2JTE A; 4KRT A; 2FPD A; 4HCK A; 2GBQ A; 2VKN A; 1I1J A; 1ARK A; 4CC3 A; 2J6F A; 3M0P A; 4LUD A; 2LX7 A; 2JT4 A; 1SHG A; 3A98 A; 1VYT A; 4AFZ C; 3VS3 A; 1B07 A; 1KJW A; 1E7O A; 1TUD A; 1YN8 A; 2L3P A; 3EG2 A; 5HCK A; 4ZNX A; 5EC7 A; 1UHC A; 2V1Q A; 2KRN A; 2JM9 A; 4D8D A; 1NLO C; 1BB9 A; 1UG1 A; 2LJ0 A; 1FMK A; 1KSW A; 4E6R A; 1K76 A; 4WCI A; 2W10 A; 1NLP C; 2E5K A; 2F2X A; 2F2W A; 4JZ3 A; 4OML A; 3TSW A; 2YUP A; 3M0T A; 2RN8 A; 3TSZ A; 2J7I A; 3C0C A; 2ABL A; 5IHN A; 1ZUU A; 5IHI A; 1QKX A; 2KYB A; 1KIK A; 1U3O A; 1ZX6 A; 1OEB A; 2LNH B; 3PE0 A; 1GCQ A; 2FPE A; 3EHR A; 1K4U S; 4J9B A; 1NEG A; 2JM8 A; 4FSS A; 3VS4 A; 1M3A A; 1UTI A; 2D8J A; 2V1R A; 2J6K A; 3M0S A; 1UDL A; 2P4R A; 2K3B A; 1ABQ A; 2IIM A; 2DL7 A; 3SEM A; 2MIO A; 2RPN A; 1I0C A; 3NMZ C; 1GCQ C; 2RQU A; 2VVK A; 1W70 A; 1HSQ A; 1AD5 A; 2OJ2 A; 1JO8 A; 4RTT A; 3I35 A; 2ROT A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 4LN2 A; 2ED1 A; 2C0O A; 1JEG A; 1OPL A; 2X3W D; 1AEY A; 2L3Q A; 1GFC A; 4HXJ A; 1UEC A; 3M0Q A; 2J6O A; 2O9V A; 2HDA A; 1S1N A; 1WX6 A; 1U06 A; 1JXO A; 1AZE A; 2LQN A; 2DBM A; 3ZL7 C; 5L23 A; 1SRL A; 3TVT A; 2EPD A; 2KRM A; 4LNP A; 1AOJ A; 1T0H A; 1UJ0 A; 2KT1 A; 3EGU A; 1WXU A; 1B3Q A; 2LZ6 B; 1Z9Q A; 1NEB A; 4HVV A; 2KRO A; 1H8K A; 1T3L A; 2EGC A; 4J9D A; 1NG2 A; 2GTJ A; 1JQQ A; 1PKS A; 2SEM A; 2YUO A; 1WI7 A; 1ZLM A; 1TUC A; 2BZX A; 2AK5 A; 1G2B A; 1PRL C; 2J06 A; 1E6G A; 2YUN A; 4ESR A; 3KFV A; 3GBQ A; 1WLP B; 2C0T A; 2KXC A; 1YP5 A; 1T3S A; 5IH2 A; 2CH4 A; 1SRM A; 1AWW A; 2RQV A; 2CSI A; 3VRY A; 1SSH A; 2JS2 A; 4RTY A; 4CC2 A; 1LCK A; 3M0R A; 3I5R A; 1I07 A; 2J05 A; 1J3T A; 2GGR A; 2CUB A; 1AWJ A; 2KT8 A; 2NWM A; 4J9F A; 1TG0 A; 2FRW A; 2DM1 A; 1N5Z A; 4Z8A A; 3REB B; 3VS5 A; 2EYW A; 2DF6 A; 4AFS C; 2BTT A; 2EYY A; 2O88 A; 3QWX X; 4RTZ A; 1WXB A; 1PKT A; 2ROL A; 5GJV B; 2RQT A; 1ZUY A; 2EGE A; 3H41 A; 1G83 A; 5GJW B; 1RLQ C; 1X2Q A; 2G6F X; 2BZY A; 2HEQ A; 1QWE A; 4R0K A; 1K9A A; 1SHF A; 2YT6 A; 3IQL A; 1QLY A; 2DX1 A; 4CC7 A; 2DE0 X; 2HSP A; 1CSK A; 2W0Z A; 4Z89 A; 2HBW A; 2EW3 A; 1PHT A; 1YWO A; 3PVL A; 4ORZ A; 4DEX A; 1SPK A; 1GCP A; 1ABO A; 4OMM A; 2YDL A; 3PVQ A; 2VWF A; 2AZV A; 2L3S A; 4GBQ A; 4LUE A; 3VS1 A; 4F14 A; 1CKB A; 1GFD A; 1UJY A; 1GBR A; 1GL5 A; 1PRM C; 3CQT A; 3FJ5 A; 4K11 A; 1WYX A; 2K7A A; 2FEI A; 2MCN A; 4F16 A; 1PWT A; 1UE9 A; 2KRS A; 3QWY A; 2MOX A; 1YCS B; 2DRK A; 2JS0 A; 2K9G A; 1RLP C; 4J9E A; 1EFN A; 1UGV A; 1W6X A; 2KE9 A; 4J9H A; 4JJD A; 1QWF A; 2ESW A; 3THK A; 3I5S A; 2EBP A; 2LJ3 A; 2AKK A; 2RQR A; 4RTV A; 2PTK A; 2DLP A; 2GNC A; 1M27 C; 4X1V A; 2EYX A; 1PNJ A; 2CT4 A; 3UAT A; 4J9C A; 2EQI A; 1AWO A; 3U23 A; 5I22 A; 3LH5 A; 4JJB A; 1HD3 A; 2A36 A; 1WIE A; 1UHF A; 4QT7 A; 2SRC A; 4F17 A; 1VYV A; 3H0H A; 5FW9 A; 1XOV A; 1JXM A; 2XMF A; 2O31 A; 1MV0 B; 2JMC A; 2CUD A; 4D8K A; 1AVZ C; 2DMO A; 2JW4 A; 2BZ8 A; 1W1F A; 4DEY A; 2D0N A; 3UA7 A; 3JV3 A; 4OMQ A; 5FWB A; 2KEA A; 1K1Z A; 1UUE A; 1Y0M A; 4RTU A; 4OMN A; 1NM7 A; 2O2O A; 4JPB W; 3ULR B; 2CDT A; 4CC4 B; 4OMP A; 1M3B A; 2AKL A; 2DA9 A; 2D1X A; 2KR3 A; 2H8H A; 1MV3 A; 5IXB A; 2CT3 A; 4EIK A; 2M51 A; 1K0X A; 1YNZ A; 1GBQ A; 1Z9Z A; 1K0S A; 2GTO A; 2DYB A; 2LQW A; 1BK2 A; 4RUG A; 3VS2 A; 4JJC A; 2DL3 A; 2FPF A; 2LCS A; 2FG0 A; 5IHK A; 2PNI A; 4AFU C; 2YUQ A; 2QDL A; 2RMO A; 1GRI A; 2L0A A; 4IIO A; 3H0I A; 1BBZ A; 5FWC A; 3RBB B; 4RTW A; 1Y57 A; 3REA B; 1WDX A; 1WFW A; 2KNB B; 1X2K A; 1YWP A; 1KFZ A; 4IIM A; 4M4Z A; 2ECZ A; 2OI3 A; 4OMO A; 1AWX A; 1JU5 C; 3I9Q A; 3R6N A; 2DL8 A; 1H92 A; 3UA6 A; 2LMJ A; 2PZ1 A; 2F2V A; 1AZG B; 1OV3 A; 2RF0 A; 4HVU A; 3UF4 A; 2DJQ A; 1QKW A; 2B86 A; 3EG1 A; 2HCK A; 4A63 B; 2DRM A; 2LJ1 A; 1WXT A; 2ENM A; 3RNJ A; 3VS6 A; 3O5Z A; 3NPF A; 1A0N B; 1QCF A; 1SEM A; 2GQI A; 2M0Y A; 1T0J A; 2DVJ A; 1OOT A; 3SHW A; 4RTX A; 1WA7 A; 2DL5 A; 2CSQ A; 1X27 A; 2L2P A; 4AFQ C; 1VA7 A; 2K79 A; 1RI9 A; 5I11 A; 1FYN A; 2EGA A; 3VS7 A; 2RQW A; 1MUZ A; 1E6H A; 1X6B A; 2K2M A; 1UFF A; 2A08 A; 2EVR A; 2JXB A; 2FO0 A; 1M8M A; 4HVW A; 2OAW A; 2RNA A; 1BU1 A; 2FRY A; 2DNU A; 5IXF A; 1U5S A; 2D8H A; 2DIL A; 2C0I A; 1IO6 A; 1ZBJ A; 1M3C A; 1OPK A; 2CRE A; 3NGP A; 1CKA A; 2I0N A; 3H0F A; 2A37 A; 3M0U A; 3EG0 A; 2LP5 A; 4AG1 C; 2KXD A; 3EHQ A; 1H3H A; 2EYZ A; 2EKH A; 2O9S A; 2DBK A; 2YSQ A; 4Y92 A; 2A28 A; 2X3X D; 2CH4 W; 1VYU A; 4J9G A; 2ED0 A; 2NUZ A; 4J9I A; 1X43 A; 1ZSG A; 1HJD A; 2JMA A; 2KGT A; 3NHN A; 4AG2 C; 1ZUK A; 4GLM A; 3VRZ A; 1RUW A; 2KBT A; 1X6G A; 1V1C A; 3VS0 A; 2K6D A; 1M30 A; 1NYG A; 1NYF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4Z88 A; 1YJW A; 2DL4 A; 2AZS A; 3R6O A; 2KYM A; 3EG3 A; 4IUU A; 1SG5 A; 8AT1 B; 1R8O B; 2HQE A; 1Q7Y U; 1JJ2 A; 2RB6 A; 3V7C A; 2FPD A; 5KH6 A; 1I1J A; 2NYS A; 4QQG A; 4C5E A; 1I81 A; 3JCM P; 2LX7 A; 1VQM A; 4A53 A; 1RAI B; 3VS3 A; 1WHM A; 1VQ8 Q; 2L3P A; 5CKD A; 1IGU A; 5DLQ E; 1IHW A; 3MP6 A; 3VJP A; 2YRV A; 4D6W A; 1N8R C; 1U8R A; 2QAZ A; 5CQX A; 3HTR A; 2KDS A; 3CC2 A; 2DTH A; 2JM9 A; 4D8D A; 1BB9 A; 4A54 A; 2K2V A; 1JBM A; 1LJO A; 2FZK B; 2OTL Q; 1MNE A; 5CKF A; 1K76 A; 4MML A; 1VQ4 Q; 3X28 B; 4JZ3 A; 3TSW A; 2ZPI B; 2YUP A; 2HL3 A; 4XU3 A; 4IUP A; 2HSE B; 2J7I A; 2V8I A; 3SWN A; 2XHC A; 1VQ5 T; 4FT2 A; 1RAF B; 5KYY B; 2KYB A; 2QQR A; 3VUB A; 5KE2 A; 1OEB A; 4R55 A; 3EHR A; 4M7A G; 3PIO A; 4FSS A; 3VS4 A; 2HNI A; 1VQ9 T; 1M3A A; 2F5K A; 3RDV A; 5KE3 A; 4XTY A; 2QQB A; 3GLX A; 2ZPH B; 2J6K A; 3CCU A; 4MZP A; 4M77 B; 4O6J A; 5KCH A; 2MI6 A; 1BI0 A; 1G8X A; 1GCQ C; 4AT1 B; 2RQU A; 1W70 A; 1HSQ A; 1AD5 A; 4PJO G; 3I35 A; 4V2S A; 4LN2 A; 1NJI U; 1OPL A; 1XQH A; 1PM3 A; 1AEY A; 2RHZ A; 4J5Y A; 4M75 C; 1OUL A; 3MEW A; 4BAC A; 1UEC A; 2J6O A; 3X25 B; 4RG2 A; 2P4T A; 5HK3 A; 2CP5 A; 2X35 A; 5AT1 B; 3V8L A; 2DEU A; 1SRL A; 2GCX A; 2HZY A; 2HKN A; 2LNV A; 2LCC A; 2EPD A; 1PD1 A; 1AOJ A; 5LJ5 e; 2WSE E; 1M90 C; 2KT1 A; 3EGU A; 1WXU A; 2LZ6 B; 3S6W A; 1M1G A; 1ZHI A; 4ELZ C; 3ME9 A; 2QQA A; 3JCM X; 3I55 Q; 1ZLM A; 1M1K R; 2AK5 A; 4PNO A; 4M7A F; 3DB4 A; 2J06 A; 3JCM W; 3GBQ A; 2KXC A; 4M7D A; 3G6E Q; 5CKH A; 1T3S A; 2OX7 A; 5D6Y A; 2JTM A; 4VUB A; 3OYD A; 1I4K 1; 4O5V A; 1SSH A; 2JS2 A; 4RTY A; 1I5L A; 1I07 A; 3EH1 A; 1SSF A; 4PJM A; 2QEX T; 4J9F A; 2XDP A; 2QDY B; 1N5Z A; 3OYE A; 1W2B P; 2EYW A; 3CPW A; 3JB9 F; 1K8A C; 4J6X A; 2DKG A; 2DVE A; 4PJO F; 1WXB A; 1VQL A; 5GJV B; 3JRZ A; 4EDU A; 3ZFJ A; 1WQ7 A; 2X4X A; 2LT1 A; 1JJ2 S; 2NLU A; 2L5Q A; 1RLQ C; 2JVV A; 4BD3 A; 2HEQ A; 5HKC A; 3CCR Q; 3BDU A; 3OA6 A; 1VQP A; 3LLR A; 4R56 A; 3MEU A; 1D1C A; 2KY9 A; 1VQ7 A; 2RJF A; 2MWO A; 3GNF B; 2DX1 A; 1BI1 A; 1CSK A; 3OMC A; 1N8R R; 4F7U G; 5GMK e; 4ORZ A; 2DXC A; 4M75 E; 4C8Q G; 2MF2 A; 3MPU B; 4RKU E; 2AZV A; 1VQL T; 3TEE A; 4GBQ A; 4UC4 A; 1OU8 A; 3VS1 A; 2WSF E; 4ZTJ A; 3OW2 P; 3M56 A; 1GFD A; 1UJY A; 3KXT A; 2XIC A; 2K5I A; 4RCB A; 3JB9 H; 3HL8 A; 3UT1 A; 3NFC A; 4XTV A; 4PFZ A; 3VYG A; 3A8G B; 3QG1 A; 5GAN 7; 3LX7 A; 3G4S Q; 4B6M A; 4KUL A; 2MOX A; 2DIG A; 2K9G A; 1KHC A; 3CCV Q; 1TWB A; 1LNX A; 4JJD A; 4PLL A; 1VQ8 T; 4II1 A; 5HK0 A; 3QSU A; 2EBP A; 1OZ2 A; 4C92 G; 1IHV A; 4C0D C; 4XTW A; 3O8V A; 3CCJ Q; 3OYC A; 4IUR A; 1G3Y A; 5C0M A; 1C6V X; 1PNJ A; 5A0L A; 1VQ6 A; 3CME Q; 2OTL T; 2O4X B; 1VQ4 T; 1Q86 U; 1BCO A; 4BI4 A; 5GAO q; 2RK1 A; 1AWO A; 1XJW B; 5FU6 B; 2R5A A; 1U1S A; 1WIE A; 2K3Y A; 1K9M U; 2SRC A; 1M2O A; 4Z02 A; 4M78 F; 5GMK i; 4F7U F; 5FW9 A; 1XOV A; 2QYZ A; 4C8Q F; 1KC8 C; 2XK0 A; 3JCM h; 1AVZ C; 2BZ8 A; 4JS5 A; 3OYB A; 2E3I A; 4PJJ A; 4DEY A; 3UA7 A; 3CCS A; 4XTU A; 3OBW A; 4OMQ A; 5FWB A; 4M7A A; 4HCZ A; 5D6X A; 1M90 R; 4JPB W; 3ULR B; 2CDT A; 5GAN j; 1M3B A; 1QVP A; 2KR3 A; 3CMA Q; 3M58 A; 2GTO A; 2IVW A; 2LX9 A; 2LQW A; 2YLC A; 3VS2 A; 1G5V A; 5C6S A; 4PK4 A; 2LCS A; 4PJO B; 2PNI A; 5KYW B; 2P0Q A; 2COY A; 4IIO A; 2DD4 A; 4C92 F; 1V29 B; 1Y57 A; 5DM7 R; 2QQS A; 2QXF A; 1MMD A; 1YWP A; 1KFZ A; 4IIM A; 3PTA A; 2OI3 A; 1S72 Q; 1JU5 C; 3R6N A; 2VB6 A; 2DZ9 A; 3UA6 A; 1D3B B; 3UF4 A; 2DJQ A; 1K8A R; 3EG1 A; 4N4I A; 1YI2 A; 2LJ1 A; 1X01 A; 3O5Z A; 1B34 A; 1QCF A; 2ATC B; 3I55 T; 2X4W A; 3EG9 A; 1WA7 A; 2DL5 A; 2CSQ A; 1Y96 B; 2L2P A; 1M2V B; 3PMI A; 3RER A; 3QBY A; 4AFQ C; 3G6E T; 1YJW Q; 2X4J A; 1WQW A; 3WVE B; 2DIQ A; 1FYN A; 2EGA A; 3OYH A; 1D1B A; 1E6H A; 4X34 A; 2K2M A; 2E41 A; 2EVR A; 3MO8 A; 2X4Y A; 3OYM A; 1U5S A; 1D0Z A; 3M53 A; 3QKJ A; 3GOX A; 2CGH A; 1VQM Q; 1KQ2 A; 1IO6 A; 1ACM B; 3M54 A; 1ZBJ A; 3NGP A; 2I0N A; 4JUV A; 3SDZ A; 1H3H A; 5FRN A; 4M77 D; 4FYV B; 2DBK A; 2A28 A; 3CC2 Q; 2CH4 W; 4N0A C; 3EGD B; 4QW2 A; 3HFN A; 1HJD A; 3GIB A; 3SB2 A; 3X24 B; 3URG A; 4YTL A; 2LTO A; 1R77 A; 4A4F A; 2K6D A; 4JDS A; 1NYG A; 1NYF A; 3CCR T; 2EWN A; 2E4H A; 3OYK A; 1SKU B; 1UGP B; 2JTE A; 4BDZ A; 1Y71 A; 3FEO A; 2GBQ A; 1ARK A; 3H8Z A; 3INZ A; 2J6F A; 4CC3 A; 2BE9 B; 3M0P A; 3CCM T; 5KYX B; 2JT4 A; 4M78 B; 1VYT A; 2DTO A; 4AFZ C; 1Q82 C; 4C8Q B; 5DY9 A; 3PT9 A; 3EG2 A; 5GMK m; 3EFR A; 5HCK A; 2E10 A; 4F7U A; 4BE0 A; 2JUF A; 5EC7 A; 4C5I A; 3V7S A; 4FYW B; 1BYM A; 3L2W A; 2KRN A; 1N9S A; 1BI2 A; 1NLO C; 3LYI A; 2PQW A; 2CP7 A; 3PMT A; 1UG1 A; 5GAM e; 2BE7 D; 4E6R A; 2F2W A; 4DBQ A; 3L2Q A; 5LJ3 e; 2QA4 A; 1KC8 R; 3OYL A; 2RN8 A; 3OYI A; 2RM4 A; 3CCV T; 4E2F B; 4E7J A; 4RG8 A; 4ZGE B; 3LGF A; 4KGZ B; 1LOJ A; 2CP2 A; 1GCQ A; 1PSF A; 2COW A; 2E5Q A; 4KH0 B; 4C92 B; 4E7H A; 4EMG A; 3JB9 J; 3CCJ T; 2DER A; 1MMN A; 2AIR B; 2FZC B; 3CD6 T; 4LD9 K; 1UTI A; 2MYS A; 4A4G A; 3P8B B; 3QXE B; 3L2R A; 2JOY A; 4J8O A; 3CME T; 4M75 A; 2P4R A; 4QVZ A; 3CBM A; 2EJF A; 1YFN A; 2MIO A; 4KGV B; 2RPN A; 1I0C A; 3NMZ C; 5I2S A; 4HCC A; 3CCE A; 3OW2 A; 2M0O A; 2ROT A; 2DFU A; 4DA4 A; 1QVG P; 1YJN A; 3WVD B; 2H3J A; 2X9H A; 3BFM A; 3X26 B; 5GAN d; 2YRC A; 1JXO A; 1AZE A; 2LQN A; 3ZL7 C; 3EFO A; 2KRM A; 4LNP A; 1K73 C; 3CMA T; 1VQL Q; 1B3Q A; 1Z9Q A; 1H8K A; 1T3L A; 2JN0 A; 2CP3 A; 4PJL A; 4J9D A; 4X9D A; 3CXC A; 3RKY A; 4OB2 B; 1NZ9 A; 1G2B A; 2COZ A; 4CRI A; 1VQP Q; 2IPO B; 5IH2 A; 2CH4 A; 1KQS S; 1AWW A; 2RQV A; 4RMO A; 4EMK A; 4JJN K; 2CSI A; 2C06 A; 1QVF A; 1VQ7 Q; 3VRY A; 3GP8 A; 1S72 T; 2DXU A; 4CC2 A; 2QTV A; 5FRM A; 1AWJ A; 3QZ9 B; 2FRW A; 3E19 A; 2M1H A; 2DXB A; 2RA2 A; 3QYG B; 1YJ9 A; 1RAH B; 1M1F A; 3REB B; 4LDU A; 1EX4 A; 1OX9 A; 3MCA B; 2O88 A; 4RTZ A; 1PKT A; 1GXI E; 5FRO A; 1N6A A; 2OTJ A; 1MMG A; 2JZ2 A; 2RQT A; 3PNW C; 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