The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KALVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKALD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, NON-ERYTHROCYTIC 1
|
| publication title |
Human Spectrin SH3 Domain D48G, E7A, K60A
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4R0K A; 3M0R A; 4LN2 A; 1HSQ A; 2MIO A; 2O9V A; 3I35 A; 2OJ2 A; 1GBQ A; 2H8H A; 3M0U A; 2GTJ A; 2E5K A; 4RUG A; 1JQQ A; 2P4R A; 3VRY A; 2KYM A; 1BBZ A; 3NPF A; 2C0T A; 1TUD A; 2LMJ A; 1ZUU A; 1JO8 A; 3RNJ A; 5FW9 A; 2EYZ A; 4ZNX A; 2J7I A; 2KGT A; 2ESW A; 2DM1 A; 1WX6 A; 2DBK A; 2GQI A; 2F2V A; 1AZG B; 2CDT A; 3RBB B; 1ZLM A; 3ZL7 C; 1CKA A; 2DX1 A; 2D8H A; 2YUP A; 2RMO A; 4K11 A; 1ZUK A; 1Y57 A; 2FO0 A; 4HCK A; 4F17 A; 2EGA A; 2RF0 A; 1X43 A; 2J06 A; 3EGU A; 2EQI A; 2CRE A; 2RQU A; 2EYY A; 1M3A A; 2YUQ A; 1UGV A; 3REA B; 2YUO A; 1G83 A; 3QWX X; 4J9H A; 2DNU A; 4OMM A; 2EGE A; 1M3C A; 2CH4 A; 1W70 A; 2PNI A; 3VS2 A; 2CUB A; 2W10 A; 4JJB A; 1QLY A; 2X3X D; 2ROL A; 1M3B A; 3SEM A; 1PKS A; 3REB B; 2JS2 A; 2LP5 A; 2A28 A; 1S1N A; 1UJY A; 2BTT A; 2EGC A; 2L3Q A; 4LUD A; 1AVZ C; 2AZV A; 2J6K A; 4GBQ A; 4J9D A; 3O5Z A; 4JZ3 A; 1W6X A; 1PWT A; 3VS4 A; 2KT1 A; 3EG0 A; 2RPN A; 1NM7 A; 2AKK A; 2AKL A; 5FWC A; 1M27 C; 1T3S A; 2DLP A; 4RTZ A; 2KRM A; 4IIM A; 5IHK A; 1X6G A; 2ED1 A; 2SEM A; 1OPK A; 1BU1 A; 5IHN A; 4RTW A; 2DRM A; 4A63 B; 3VS5 A; 4GLM A; 4DEX A; 2O31 A; 3IQL A; 2CT3 A; 4ORZ A; 4WCI A; 1QKW A; 1UUE A; 2OI3 A; 2KT8 A; 3PE0 A; 1FMK A; 2NUZ A; 2JS0 A; 5HCK A; 2O88 A; 1X69 A; 4OMN A; 2FPF A; 3CQT A; 4Y92 A; 1NYG A; 1X27 A; 1OOT A; 1UDL A; 2ECZ A; 1RI9 A; 3QWY A; 2DIL A; 5GJV B; 4M4Z A; 1H92 A; 2DBM A; 1J3T A; 3H41 A; 1T3L A; 4D8D A; 2JMA A; 3PVL A; 2QDL A; 3EHQ A; 1UJ0 A; 2RNA A; 1T0J A; 1K4U S; 2X3W D; 1I1J A; 1VYU A; 3EHR A; 3TVT A; 2MCN A; 2F2X A; 2JTE A; 4LUE A; 2CSQ A; 1I07 A; 3PVQ A; 4JJD A; 2D8J A; 2M0Y A; 2HSP A; 5IH2 A; 4Z88 A; 4CC7 A; 2RQT A; 2CH4 W; 2EVR A; 1GBR A; 1NYF A; 1WYX A; 5IXB A; 3UA7 A; 2HDA A; 3M0Q A; 4CC3 A; 1UFF A; 3I9Q A; 1NLP C; 2GBQ A; 1M8M A; 4HVV A; 4JZ4 A; 3SHW A; 4HVU A; 3FJ5 A; 1KFZ A; 1SSH A; 1ZSG A; 4J9C A; 3NMZ C; 2SRC A; 4RTV A; 3VS0 A; 4HVW A; 1MV0 B; 2DVJ A; 2RQW A; 3TSW A; 4AG2 C; 1Z9Z A; 2B86 A; 2L0A A; 1CKB A; 4HXJ A; 1H3H A; 2LX7 A; 1GCQ C; 2KEA A; 2EBP A; 1GRI A; 1ABQ A; 2EYX A; 4EIK A; 1AWJ A; 3TSZ A; 4OMQ A; 5IXF A; 1AD5 A; 2KRO A; 2HCK A; 3EG3 A; 3M0S A; 2AZS A; 1ZUY A; 2GNC A; 1PKT A; 2ROT A; 2D0N A; 1JU5 C; 1OEB A; 2YSQ A; 1U06 A; 2FRW A; 1X2Q A; 2KBT A; 3U23 A; 4OML A; 1I0C A; 1ZBJ A; 1YWP A; 1VYT A; 1QWF A; 2IIM A; 4AG1 C; 3H0F A; 1SRL A; 1N5Z A; 5I22 A; 2RQR A; 4ESR A; 2DL5 A; 3VS7 A; 3THK A; 1HD3 A; 1FYN A; 2FEI A; 1YNZ A; 2ED0 A; 2KR3 A; 2LJ1 A; 4X1V A; 5EC7 A; 2LCS A; 2DL4 A; 2JM9 A; 2ENM A; 4RTT A; 2KRS A; 1RLP C; 1KIK A; 2EKH A; 1HJD A; 1GCQ A; 2HBW A; 2DRK A; 2ABL A; 1BK2 A; 1U3O A; 3UAT A; 2KYB A; 2JW4 A; 2VVK A; 4Z8A A; 1WXB A; 2PTK A; 3LH5 A; 3VS3 A; 2EW3 A; 2I0N A; 4J9I A; 2JXB A; 1YP5 A; 1WXT A; 2LQW A; 1A0N B; 2F2W A; 5FWB A; 2J6O A; 2BZX A; 1QWE A; 2YDL A; 5IHI A; 1GFC A; 2C0O A; 2BZ8 A; 1RLQ C; 1ABO A; 1JEG A; 1T0H A; 3A98 A; 2DMO A; 1GL5 A; 1LCK A; 2DF6 A; 1MUZ A; 1WDX A; 4RTU A; 2DJQ A; 4JJC A; 1UHC A; 1K0X A; 1V1C A; 3UA6 A; 1NLO C; 2DE0 X; 3M0T A; 2RN8 A; 1Z9Q A; 4Z89 A; 4AFQ C; 2KNB B; 2DL7 A; 2A37 A; 1MV3 A; 4DEY A; 1KSW A; 2JM8 A; 2PZ1 A; 2GGR A; 2LNH B; 2CT4 A; 1JXM A; 2C0I A; 4F16 A; 1OV3 A; 1X6B A; 2A08 A; 1K0S A; 2G6F X; 1OPL A; 1AEY A; 2FPD A; 2OAW A; 3I5R A; 2DA9 A; 1ZX6 A; 1K1Z A; 2CUD A; 4J9G A; 1SPK A; 2JT4 A; 3NGP A; 4J9E A; 1VA7 A; 1WI7 A; 1YWO A; 1AWX A; 1WLP B; 2EYW A; 4LNP A; 2J6F A; 3JV3 A; 2V1Q A; 1SHG A; 3KFV A; 1JXO A; 1IO6 A; 2K9G A; 3H0H A; 1RUW A; 2A36 A; 5GJW B; 1NG2 A; 4RTY A; 2MOX A; 1W1F A; 1UHF A; 2LZ6 B; 1AOJ A; 1CSK A; 3ULR B; 2XMF A; 4CC2 A; 1G2B A; 2K7A A; 2FRY A; 2FPE A; 1UE9 A; 1K76 A; 2LQN A; 2KRN A; 4OMO A; 1XOV A; 1E7O A; 1SEM A; 3H0I A; 1AZE A; 5I11 A; 2K79 A; 2W0Z A; 2JMC A; 4AFS C; 2K2M A; 4CC4 B; 1X2K A; 2O9S A; 4OMP A; 3GBQ A; 1TUC A; 3UF4 A; 2VKN A; 4FSS A; 2KXD A; 1NEG A; 2K6D A; 4AFZ C; 1SHF A; 4E6R A; 4RTX A; 2NWM A; 1VYV A; 1Y0M A; 2DL3 A; 4J9B A; 5ECA A; 1PNJ A; 1BB9 A; 2L2P A; 2GTO A; 4JPB W; 1GFD A; 2YUN A; 1H8K A; 2K3B A; 2YT6 A; 4IIO A; 2V1R A; 3VS6 A; 3VS1 A; 1WIE A; 3NHN A; 1SRM A; 2CSI A; 1E6G A; 1B07 A; 2D1X A; 3I5S A; 1KJW A; 1WFW A; 2L3S A; 1AWW A; 2LJ3 A; 3EG1 A; 1QKX A; 2O2O A; 1QCF A; 4AFU C; 3VRZ A; 4F14 A; 1GCP A; 3R6N A; 4KRT A; 1WA7 A; 2J05 A; 1AWO A; 1EFN A; 1YN8 A; 4LE9 A; 1U5S A; 1UTI A; 5L23 A; 1PHT A; 1NEB A; 2VWF A; 1PRM C; 3C0C A; 4J9F A; 2KE9 A; 1TG0 A; 2M51 A; 2FG0 A; 2KXC A; 2RQV A; 2DYB A; 1B3Q A; 3M0P A; 2HEQ A; 4D8K A; 2LJ0 A; 1YCS B; 2AK5 A; 1PRL C; 2BZY A; 1ARK A; 2L3P A; 1K9A A; 1UG1 A; 1M30 A; 1UEC A; 4QT7 A; 1WXU A; 2EPD A; 3EG2 A; 1E6H A; 2DL8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M0R A; 4LN2 A; 1Q82 C; 4XTY A; 2VGM A; 2R58 A; 2H8H A; 2COW A; 2E5K A; 2JZ2 A; 3HHT B; 4BB7 A; 5GAM j; 2KYM A; 4M7D F; 3NPF A; 5CKF A; 4ME7 A; 4QQ6 A; 2J7I A; 3A8H B; 1OU9 A; 1WX6 A; 1AZG B; 2KQW A; 3L42 A; 5A0G A; 2JN0 A; 3ZBD A; 2D8H A; 3OB9 A; 5HKC A; 2RMO A; 3VKI A; 1M9S A; 4HCK A; 5CAI A; 1VQ6 Q; 3EGU A; 2CRE A; 3JCM g; 4BI3 A; 1M3A A; 2YUQ A; 3REA B; 5CKH A; 5LJ5 h; 1G83 A; 2RD1 A; 2DNU A; 1M3C A; 2CH4 A; 4KUI A; 4A53 A; 1W70 A; 3VS2 A; 2HMA A; 1YHQ A; 4QQG A; 3REB B; 3CCL A; 1VQP A; 2A28 A; 4F7U F; 1MMG A; 1S1N A; 2Y90 A; 4LUD A; 3JB9 G; 1AVZ C; 4BDY A; 1QVF S; 1QW1 A; 3JCM V; 2J6K A; 4GBQ A; 1D09 B; 4FM4 B; 3H8Z A; 4J9D A; 2KI7 A; 2LVM A; 4PK4 A; 1W6X A; 2KT1 A; 3BDU A; 2X4J A; 2DJZ A; 4ATO A; 4AMC A; 1MMN A; 1NM7 A; 4EMG A; 4E7H A; 1S72 T; 1M27 C; 4JJN K; 2COZ A; 1WJR A; 4EPC A; 2DLP A; 2QTX A; 1K8A R; 4C8Q F; 1YIT Q; 1HYO A; 4IIM A; 4E2F B; 1X6G A; 4BD3 A; 5IHN A; 1V76 A; 4EMH A; 3V8K A; 4C8Q C; 2CT3 A; 4ORZ A; 2COY A; 3A5Z B; 2EQJ A; 2KT8 A; 3I56 Q; 3PE0 A; 3G6E T; 2JS0 A; 2ZAE A; 3CCR T; 4OMN A; 1N27 A; 3QKJ A; 1TTH B; 3CQT A; 2CGH A; 3CBO A; 3G4S Q; 3OYH A; 4HCC A; 1D0Y A; 3QYH B; 1X27 A; 1UDL A; 2MYS A; 5IN1 A; 2ECZ A; 4FT2 A; 4BY6 B; 3RMS A; 2DIL A; 2QGG A; 3CPW A; 5FU6 C; 4PJO G; 2JMA A; 3CBM A; 4KH1 B; 2A7Y A; 4QW2 A; 4JS4 A; 3CCQ A; 2RNA A; 1WJQ A; 2V8J A; 4IUT A; 1VYU A; 4N0A A; 5GMK i; 3UPU A; 2XDB A; 2MCN A; 2JTE A; 4LUE A; 1I07 A; 3PVQ A; 1VQK T; 2MF2 A; 2HSP A; 1W2B A; 2X9H A; 3H6Z A; 1C0M A; 1ACM B; 2CH4 W; 2QG9 B; 3UWN A; 1YIJ Q; 2EVR A; 1D3B A; 2Y4Y A; 5IXB A; 3UA7 A; 4CC3 A; 1UFF A; 2KDS A; 2QQ9 A; 3I9Q A; 1NLP C; 3MKD A; 2CP0 A; 4II1 A; 8AT1 B; 4PJN A; 5KYX B; 2E12 A; 1ZSG A; 2K5I A; 5GAN 7; 4HVW A; 3DB3 A; 4AG2 C; 3OQ5 A; 4RMO A; 3QO3 A; 3L2V A; 1CKB A; 4HT8 A; 4HXJ A; 3CD6 T; 3ASK A; 3EAE A; 2EBP A; 2AIR B; 3X25 B; 3JCM X; 5IXF A; 2KRO A; 2HCK A; 3EG3 A; 3CCV T; 1C1A A; 3QPH A; 2AZS A; 3CC2 A; 4E7I A; 4ZGD B; 1OEB A; 1B7T A; 2FRW A; 4BDZ A; 3V8L A; 3PTA A; 2QEX T; 2KBT A; 3MET A; 3HFN A; 2E65 A; 5GAM e; 1PM3 A; 4A4H A; 2EYQ A; 1WQW A; 2FZC B; 4J6W A; 3VJP A; 1K9M U; 2DEU A; 3VS7 A; 3THK A; 1HD3 A; 2KR3 A; 4X1V A; 5EC7 A; 1C6V X; 2DL4 A; 3JRZ A; 4KT0 E; 3KUF A; 1YJN Q; 1RLP C; 3CCU T; 2RI3 A; 1VUB A; 2X4W A; 1QVF A; 2V26 A; 3J80 E; 1U3O A; 1NPP A; 4FW2 A; 2JW4 A; 2PTK A; 3LH5 A; 3VS3 A; 2EQM A; 4M78 F; 2JXB A; 1A0N B; 2OX7 A; 2D9T A; 2F2W A; 4X9D A; 4X9C A; 4BUG A; 5FU7 C; 2VUB A; 3FB9 A; 3T9N A; 5GMK h; 1M90 U; 1X75 C; 1UGP B; 2CZ7 B; 4C8Q D; 4NOY A; 3CCL T; 3MPU B; 2R57 A; 5CQX A; 1UHC A; 1FX7 A; 1K0X A; 3E19 A; 3WXM B; 1V1C A; 1NLO C; 3L1A A; 4PJO E; 2DE0 X; 2L3R A; 2RHY A; 3HRU A; 4Z89 A; 2MWO A; 1I8F A; 2KNB B; 2A37 A; 4OB3 B; 1MV3 A; 1NBE B; 3OYM A; 2KK4 A; 1D0Z A; 2FVU A; 2PZ1 A; 2QXF A; 1OZ2 A; 1YJ9 A; 2CT4 A; 4JLI A; 2A0F B; 2RK1 A; 3QJ6 A; 4AT1 B; 2K2V A; 3S3O A; 4BI4 A; 3S3M A; 1VQ7 A; 1D0X A; 1ZX6 A; 1UEB A; 1K9M R; 4J9G A; 5I2S A; 1SPK A; 3C95 A; 5FRN A; 2QI2 A; 2LDM A; 1WLP B; 1X6O A; 1YFN A; 3JV3 A; 2V1Q A; 2P0K A; 3M58 A; 4DOV A; 3H0H A; 1NG2 A; 4RTY A; 2GQV A; 4ELY C; 2O01 E; 3V7R A; 1UHF A; 3M4Y A; 1O9S A; 2DIQ A; 4M7D G; 1YJW A; 1UE9 A; 5D6Y A; 3LLR A; 4BI8 B; 1XOV A; 4O6J A; 4MDW A; 1M90 R; 3CCQ T; 2QTV A; 3JCM b; 2EJF A; 4AFS C; 2K2M A; 2O9S A; 4OMP A; 3UF4 A; 2OTL A; 1VQN Q; 2KXD A; 2K6D A; 2DTO A; 3OYY A; 2FZG B; 3E1S A; 3M4G A; 1HXD A; 1SHF A; 1YI2 Q; 2JVV A; 2LT4 A; 2NYS A; 2VB6 A; 3RKX A; 2DL3 A; 2EIF A; 1BB9 A; 4JPB W; 1GFD A; 4M7A G; 1YCY A; 3CC4 A; 2QAS A; 1HK9 A; 1D1B A; 3BY7 A; 2JNG A; 1U1S A; 3I55 A; 1TU0 B; 1Q86 C; 4M75 G; 1VQL Q; 3OYK A; 4C92 G; 1M2V B; 3HFO A; 2O2O A; 3UT1 A; 1M1K U; 2ZCF B; 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3A8O B; 3O5Z A; 4JZ3 A; 5GAO p; 1PWT A; 2RPN A; 1WPY A; 3JB9 D; 3G6E Q; 2HZY A; 5CKE A; 5GAN 8; 5FWC A; 4YTL A; 3CCR Q; 1T3S A; 5GAN 2; 1ZQ1 A; 4J8O A; 4M7A E; 2KRM A; 2ED1 A; 2F5T X; 2SEM A; 1VQN T; 1BU1 A; 4N0A C; 5FLX E; 1Q7Y R; 7AT1 B; 4DOW A; 1QMC A; 4M75 E; 2O31 A; 2Y4X A; 5LJ3 d; 2OI3 A; 3CEY A; 5GAM h; 4C92 E; 1M5Q 1; 2NUZ A; 1MHN A; 2QYZ A; 1X69 A; 4N4G A; 2FPF A; 5FRM A; 4FL6 A; 1KG1 A; 1VQK Q; 3LW5 E; 3G71 T; 3VUB A; 4ZN1 A; 1RI9 A; 3SD4 A; 4R56 A; 2HNI A; 2V8K A; 5GMK l; 1OUL A; 1J3T A; 3H41 A; 1T3L A; 3PVL A; 3RUX A; 1VQ8 T; 1WJS A; 1K8A U; 4M77 E; 1SKU B; 4M78 G; 4JJD A; 4BE1 A; 5IH2 A; 2L8D A; 2XID A; 3QHS A; 3HKS A; 4X34 A; 1VQ6 A; 3F70 A; 3CD6 Q; 3VYH B; 4OB1 B; 3BFM A; 3CC4 T; 2JOY A; 4RG8 A; 3CCV Q; 3JCM c; 3JB9 J; 2L5Q A; 2HDA A; 1FMW A; 4DBF A; 1YBY A; 2GBQ A; 4PJO A; 2RJE A; 4HVV A; 2VXE A; 1D1C A; 3KBG A; 3CC7 A; 4JZ4 A; 2RJD A; 2QEX Q; 2SRC A; 2PVG B; 4RKU E; 1KC8 C; 2L0A A; 1N8R C; 3EGX B; 1PCX A; 5J3B A; 2LX7 A; 2KEA A; 1EX4 A; 1GRI A; 1ABQ A; 4EIK A; 3QYG B; 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