The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
|
| publication title |
Binding Mechanism of the N-Terminal SH3 Domain of CrkII and Proline-Rich Motifs in cAbl.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
10
|
| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O9V A; 2F2V A; 4J9H A; 1T3L A; 2ECZ A; 2DRK A; 2YUN A; 1Z9Q A; 2V1Q A; 2W0Z A; 2F2W A; 2QDL A; 1K4U S; 3VS3 A; 3NMZ C; 4J9D A; 5ECA A; 3UA7 A; 4GLM A; 1GFD A; 3REB B; 3TSZ A; 3NPF A; 2RF0 A; 2W10 A; 3I5S A; 2F2X A; 1PKS A; 2PTK A; 1FMK A; 2JT4 A; 2JMA A; 2A37 A; 2L3Q A; 1KJW A; 2RQU A; 1W70 A; 1X6G A; 1I0C A; 2GGR A; 1GBR A; 1RLP C; 2D1X A; 3EHQ A; 2LQW A; 1I07 A; 2RQW A; 3M0S A; 1AZG B; 2H8H A; 1K1Z A; 1WX6 A; 2FPD A; 4FSS A; 2MIO A; 4DEY A; 1GBQ A; 1MV0 B; 1SEM A; 2KEA A; 2VWF A; 2DL5 A; 1SRL A; 1I1J A; 3I9Q A; 1J3T A; 3EGU A; 1WXT A; 1OPL A; 2C0I A; 2DL7 A; 2JTE A; 1K9A A; 4Z88 A; 1SSH A; 1BBZ A; 2KBT A; 4LE9 A; 1Y0M A; 1U3O A; 2NWM A; 4RTZ A; 2B86 A; 2JM8 A; 3RNJ A; 1QCF A; 2I0N A; 4D8D A; 2JM9 A; 1YCS B; 4IIO A; 1YWP A; 2ESW A; 1PWT A; 2K6D A; 3UA6 A; 4JJC A; 2YT6 A; 2KT8 A; 2AKL A; 2EGC A; 1SPK A; 3EG1 A; 2KRM A; 3QWY A; 2BTT A; 2GTJ A; 1UJ0 A; 2G6F X; 2HCK A; 1SHG A; 4J9G A; 1ARK A; 1AVZ C; 1MUZ A; 1HD3 A; 1X2K A; 1M3A A; 4D8K A; 1ZBJ A; 2EGE A; 1IO6 A; 1HSQ A; 1T3S A; 1BU1 A; 2C0T A; 2EYX A; 3I5R A; 4AFZ C; 1K0S A; 1AEY A; 2KXD A; 2BZX A; 5FWB A; 4LNP A; 5IXF A; 4JJB A; 2DIL A; 1U06 A; 1X27 A; 2KRO A; 2LMJ A; 1YNZ A; 2RQT A; 1TUC A; 3PVL A; 1UHF A; 4LUD A; 1T0J A; 2J6K A; 1JXM A; 2L3P A; 1NLO C; 4J9C A; 4RTT A; 3NHN A; 2A36 A; 1WFW A; 2ED1 A; 3H0H A; 1JO8 A; 4K11 A; 3VRY A; 2DBM A; 2YSQ A; 1UFF A; 1AD5 A; 4R0K A; 3VRZ A; 1HJD A; 2KXC A; 2RMO A; 1E6G A; 3SHW A; 2LJ3 A; 1OV3 A; 4OMO A; 2E5K A; 2JMC A; 2DLP A; 3H0F A; 2LP5 A; 2YUP A; 1PNJ A; 2JS2 A; 1W6X A; 2CRE A; 1QKX A; 1ZUK A; 1X2Q A; 3VS2 A; 1H3H A; 2O9S A; 4GBQ A; 2L0A A; 2M51 A; 2EYY A; 2K3B A; 2D8J A; 3VS6 A; 1VYU A; 4HVW A; 2AZV A; 4ZNX A; 3NGP A; 1CKA A; 3EG3 A; 1OEB A; 1S1N A; 2LJ0 A; 2JS0 A; 1AWW A; 2J7I A; 2DA9 A; 2CUB A; 2YUQ A; 1WYX A; 1PRM C; 2MCN A; 1GL5 A; 1GFC A; 2KGT A; 4JJD A; 4RTY A; 1VA7 A; 4QT7 A; 4OMN A; 1YWO A; 1M30 A; 1TUD A; 2GNC A; 2JXB A; 2YDL A; 1M27 C; 4A63 B; 1ZX6 A; 1UJY A; 2M0Y A; 5I22 A; 1AWO A; 1V1C A; 2FEI A; 5FW9 A; 1WXB A; 1VYT A; 4HCK A; 2OAW A; 3UF4 A; 3ULR B; 1AWX A; 3EHR A; 1BB9 A; 1QWE A; 1NLP C; 2FPF A; 2GTO A; 2FRW A; 2FPE A; 4HVV A; 2ABL A; 2VVK A; 2EYW A; 2DL4 A; 1QLY A; 1A0N B; 1E7O A; 2CH4 A; 1PKT A; 3RBB B; 2O2O A; 4RTU A; 5FWC A; 2O31 A; 1YN8 A; 5I11 A; 3TVT A; 3I35 A; 3TSW A; 1W1F A; 2PNI A; 3PVQ A; 4JZ4 A; 2D0N A; 2CH4 W; 1UEC A; 1G83 A; 4Y92 A; 5IHN A; 5HCK A; 2SRC A; 4F17 A; 1UUE A; 1CSK A; 2EBP A; 4AFQ C; 3VS0 A; 4JPB W; 1NEB A; 4AFS C; 1NEG A; 3EG0 A; 2DNU A; 5IXB A; 2LQN A; 2AK5 A; 4CC7 A; 1WIE A; 1K76 A; 5GJV B; 1G2B A; 1RLQ C; 1GRI A; 1M3B A; 2OJ2 A; 4F16 A; 3FJ5 A; 2HDA A; 3U23 A; 2EYZ A; 1UTI A; 2K7A A; 1N5Z A; 2HBW A; 1XOV A; 4ORZ A; 4J9I A; 1CKB A; 3LH5 A; 2EVR A; 1MV3 A; 1BK2 A; 1X43 A; 2DE0 X; 4Z89 A; 2DF6 A; 4JZ3 A; 2AZS A; 1KFZ A; 4LN2 A; 4J9F A; 2KE9 A; 1X69 A; 1H8K A; 5GJW B; 1E6H A; 1UE9 A; 4F14 A; 2KR3 A; 2KT1 A; 1WDX A; 1GCQ A; 2EGA A; 2LCS A; 1PHT A; 2K79 A; 2HEQ A; 2EW3 A; 4HXJ A; 1UG1 A; 1GCQ C; 3SEM A; 3CQT A; 2YUO A; 2EQI A; 3REA B; 1LCK A; 2KRS A; 4CC4 B; 1QKW A; 1ABO A; 1KSW A; 5L23 A; 2GQI A; 2DMO A; 2P4R A; 2EKH A; 2NUZ A; 4WCI A; 3H41 A; 2K2M A; 3M0T A; 1TG0 A; 3VS4 A; 2RNA A; 1VYV A; 1KIK A; 2VKN A; 2ENM A; 3R6N A; 2FRY A; 1NG2 A; 3A98 A; 2RQV A; 1WLP B; 1K0X A; 3H0I A; 4CC2 A; 2KYM A; 2DBK A; 1FYN A; 5IH2 A; 1AZE A; 2DX1 A; 1ZLM A; 2CT3 A; 2CSI A; 1M3C A; 3ZL7 C; 1NYG A; 3VS7 A; 3M0P A; 2KYB A; 2A08 A; 1GCP A; 2FO0 A; 4OML A; 2FG0 A; 2DYB A; 3UAT A; 2EPD A; 1WA7 A; 1OPK A; 4RTV A; 1SHF A; 2AKK A; 1UGV A; 2XMF A; 1YP5 A; 2HSP A; 2J6O A; 2CT4 A; 2V1R A; 4X1V A; 4M4Z A; 2K9G A; 1NM7 A; 1JXO A; 1SRM A; 2JW4 A; 3KFV A; 3PE0 A; 1JEG A; 2O88 A; 4AG1 C; 2L2P A; 1Y57 A; 2CDT A; 4J9B A; 1B3Q A; 3THK A; 1Z9Z A; 3O5Z A; 2ED0 A; 2J06 A; 1RI9 A; 2C0O A; 3M0R A; 2BZ8 A; 1UDL A; 4HVU A; 1ZUU A; 3VS1 A; 4AFU C; 1B07 A; 1NYF A; 2DL8 A; 2BZY A; 2MOX A; 4KRT A; 4RUG A; 1WI7 A; 4EIK A; 4RTX A; 2ROL A; 4OMP A; 2DL3 A; 2J6F A; 3IQL A; 2L3S A; 1PRL C; 3EG2 A; 1ZSG A; 1UHC A; 2GBQ A; 2J05 A; 1ABQ A; 2SEM A; 1AOJ A; 2ROT A; 1EFN A; 4IIM A; 4E6R A; 3GBQ A; 2DVJ A; 3JV3 A; 2RN8 A; 2DJQ A; 4J9E A; 3M0Q A; 2X3W D; 5IHI A; 1WXU A; 3C0C A; 4RTW A; 1QWF A; 2CUD A; 5EC7 A; 2DM1 A; 3VS5 A; 2LNH B; 2OI3 A; 2LJ1 A; 2KNB B; 1M8M A; 5IHK A; 1ZUY A; 2RPN A; 2IIM A; 1H92 A; 2DRM A; 4CC3 A; 2KRN A; 4OMM A; 4OMQ A; 1RUW A; 1T0H A; 1X6B A; 3QWX X; 2RQR A; 2LZ6 B; 2A28 A; 4AG2 C; 4DEX A; 4ESR A; 2CSQ A; 1AWJ A; 2LX7 A; 4Z8A A; 2PZ1 A; 2X3X D; 1U5S A; 2D8H A; 1OOT A; 1JU5 C; 1JQQ A; 3M0U A; 4LUE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EGX B; 1VIF A; 3KUF A; 2O9V A; 2JZ2 A; 2ECZ A; 1QVF S; 2DRK A; 1Z9Q A; 2E64 A; 4PFP A; 3MJX A; 4JRQ A; 2QDL A; 1K4U S; 3UT1 A; 3VS3 A; 3NMZ C; 4GLM A; 1GFD A; 3TSZ A; 5D6X A; 4L6V 5; 2F2X A; 4J7I A; 3CCR A; 2ZCF B; 1FMK A; 2JMA A; 2PVO B; 3FLG A; 3H8Z A; 5CK9 A; 1YJ9 Q; 4M7D E; 4C92 C; 4LD6 A; 2LT1 A; 3QDF A; 4OB1 B; 1N8R R; 1YI2 T; 1AZG B; 1VQN Q; 2QI2 A; 1BIA A; 4FSS A; 5FU7 C; 1JJ2 S; 4HCZ A; 1SEM A; 2KEA A; 4BE1 A; 1VQ4 A; 2DJZ A; 1WPY A; 1BBZ A; 4M7D B; 1VQO Q; 1FMW A; 3OBW A; 3QYG B; 1QCF A; 4ANJ A; 2LX9 A; 4BI8 B; 4IIO A; 3UA6 A; 3S3N A; 4ZTF A; 1QW1 A; 2EGC A; 3CCQ A; 3EG1 A; 1R77 A; 3TQ7 P; 2GTJ A; 3CCS A; 1HYO A; 3SB2 A; 4OB2 B; 2HCK A; 1SHG A; 5GAN j; 5KYN A; 1YIJ Q; 1ZA1 B; 4AT1 B; 4EMK C; 5GAN 4; 4D8K A; 4AFZ C; 1T3S A; 3INZ A; 2VV5 A; 2BZX A; 4LNP A; 1WJS A; 2P0K A; 4BI3 A; 4D6W A; 1X27 A; 4Z02 A; 1I5L A; 2EQJ A; 5I21 A; 1W2B A; 3M59 A; 1UHF A; 1VQ9 Q; 4M77 F; 1JXM A; 4JUV A; 4A4E A; 2LT4 A; 3X20 B; 3OS2 A; 4M7D D; 5GAO q; 3NHN A; 4HKE A; 4OGE A; 3LX7 A; 1EX4 A; 1WFW A; 1TOV A; 3H0H A; 1JO8 A; 3V8K A; 2QEX A; 2YSQ A; 1AD5 A; 3C94 A; 3MEA A; 3CXC A; 5GAM g; 3TU4 K; 2JMC A; 3GP8 A; 3H0F A; 1Q7Y U; 2X4X A; 1PNJ A; 1W6X A; 1LOJ A; 4C5H A; 4FW1 A; 2FHD A; 2FL7 A; 5LJ3 j; 2KY9 A; 2RK1 A; 2LNV A; 5GAO m; 3QZ9 B; 1F1B B; 4OB0 B; 5IT9 E; 2DXC A; 3C95 A; 4HVW A; 3OB9 A; 1RAB B; 3JB9 J; 4M75 F; 3NGP A; 4HCB A; 4MZT A; 3CCJ A; 1ZHI A; 4OVA A; 4J5Y A; 2GQV A; 2CUB A; 2YUQ A; 1WYX A; 3DB4 A; 2MCN A; 2DET A; 1GFC A; 2KGT A; 1VA7 A; 2HD0 A; 4OMN A; 1BIB A; 1M30 A; 2DXU A; 2EKO A; 2DYI A; 4M7A G; 2E4H A; 3MHX A; 1M27 C; 4RKU E; 3C12 A; 1S72 T; 1M90 C; 1OZ3 A; 1AWO A; 5FW9 A; 5LL6 S; 5LJ5 g; 3PGG A; 3JCM c; 4ZN3 A; 1W2B P; 2V8J A; 3GNG A; 1AWX A; 2E3H A; 3A8O B; 2BKD N; 1NLP C; 1LPL A; 4HVV A; 2FPF A; 2FRW A; 2VVK A; 3VV0 A; 2RJC A; 1AT1 B; 4FU6 A; 3CCE Q; 2O2O A; 1WHK A; 3S6W A; 1R8O B; 5CKD A; 3CXC P; 4FYW B; 3TVT A; 1ZSZ A; 1KD1 C; 3JCM X; 3TSW A; 1W1F A; 5GAO p; 5HK0 A; 2D0N A; 4C0D B; 3TCJ A; 3PIP A; 2FB7 A; 4KGX B; 2SRC A; 4C8Q E; 1UUE A; 3DLL A; 4QQ6 A; 3I55 T; 2EBP A; 2DZC A; 4JRP A; 3EG0 A; 1MNE A; 1YCY A; 1WQ7 A; 2AK5 A; 1WIE A; 1NE8 A; 4XTY A; 1U8R A; 1K76 A; 5AT1 B; 2MF2 A; 5KYW B; 2RJD A; 4L59 A; 2VGM A; 1D0Y A; 1GRI A; 8AT1 B; 2OJ2 A; 2RHI A; 1LNX A; 2QQA A; 1H64 1; 1VQ6 Q; 3U23 A; 2EYZ A; 2KQW A; 3BDU A; 4C8Q B; 2E5Q A; 1M1F A; 5GAM f; 3EG9 A; 1N5Z A; 1XOV A; 4J9I A; 2CP6 A; 2EVR A; 5GAN 6; 1N9S A; 4Z89 A; 3JCM b; 3S3M A; 2JTF A; 1PM3 A; 4IUT A; 5GJW B; 1Q95 G; 1IRX A; 1PHT A; 1K9M C; 3WXM B; 2K79 A; 3CCV A; 2YRC A; 2EW3 A; 4BE0 A; 3PFS A; 3CQT A; 3JAM E; 2QAZ A; 3REA B; 1K73 C; 3MEV A; 1TU0 B; 3OYF A; 3I56 Q; 3SWN C; 4KH0 B; 2EKH A; 4WCI A; 2K2M A; 1KC8 U; 1OQK A; 3WVE B; 2XDB A; 3CCM T; 2EWN A; 2RNA A; 4HT8 A; 4LDU A; 3JB9 G; 3R6N A; 1M2V A; 4QQG A; 5LJ5 f; 3MPU B; 3A98 A; 3BY7 A; 2RQV A; 3URG A; 3H0I A; 4CC2 A; 1AZE A; 1M3C A; 3ZL7 C; 3EFR A; 4C8Q D; 3A8M B; 4J7F A; 4BD3 A; 2NUT B; 5CKE A; 3CMA T; 1UGP B; 1YIT Q; 5C0M A; 2M02 A; 2FG0 A; 2DYB A; 3UAT A; 5KH6 A; 3G71 T; 3RER A; 4ZGE B; 2DZ9 A; 2EPD A; 2DD4 A; 3CCL A; 3L2U A; 2K4Y A; 3X26 B; 3OYG A; 3JCM Q; 3JCM W; 2QTV A; 2CT4 A; 4NS5 A; 1VUB A; 4X1V A; 3OYN A; 1VQ8 T; 1JXO A; 3PE0 A; 4DOV A; 4M7D C; 1VQK Q; 1VQ7 A; 3CCR T; 2MYS A; 4J9B A; 1KC8 R; 1Z9Z A; 2CP7 A; 1O75 A; 2J06 A; 3O5Z A; 3OYH A; 3OYA A; 4M75 B; 5EG2 A; 3BE3 A; 2KI7 A; 3M0R A; 3CD6 A; 3QUI A; 2NYS A; 4HVU A; 4JRK A; 2QA4 Q; 3GNF B; 1C0M A; 2MOX A; 2BZY A; 1PC0 A; 1K8A C; 2XDD A; 4PKC C; 1B34 B; 4BAC A; 2DL3 A; 2J6F A; 2RM4 A; 2H3J A; 3NTI A; 2LCC A; 1D1A A; 4PFZ A; 3ASK A; 4RCC A; 4PJO E; 4KUD K; 2BUD A; 5KYY A; 3L2V A; 2RN8 A; 1BYM A; 5GAM e; 2PVG B; 1I81 A; 3M4Y A; 2X3W D; 2I2L A; 1NPP A; 5FU6 C; 3L2Z A; 4QVC A; 2EQK A; 5IN1 A; 2EQM A; 2O01 E; 3CBM A; 2OI3 A; 2KNB B; 4PJO B; 3L42 A; 3PMT A; 3E1S A; 4F7U F; 3I56 A; 4OMM A; 1UGR B; 3CCS T; 1T0H A; 4FYY B; 3C4S A; 1BCO A; 2VXF A; 1WHG A; 2A28 A; 4AG2 C; 3CC4 Q; 2LQK A; 2M9U A; 2CSQ A; 3FDR A; 3LGL A; 5GAN h; 5DLQ E; 2KVQ G; 4QVZ A; 2R58 A; 3M0U A; 4LUE A; 4J9H A; 4ATO A; 2X35 A; 2M1H A; 3BDL A; 2YUN A; 3CME T; 3MKD A; 3G71 Q; 2F2W A; 1M4Z A; 4XU2 A; 3JCM g; 5LJ5 e; 4J9D A; 2K3X A; 5A0L A; 3LLR A; 3MEW A; 3I5S A; 4KGZ B; 5KCH A; 3RMS A; 4C92 A; 2JT4 A; 3GF5 A; 4PJL A; 3OYL A; 2RQU A; 3RKX A; 1W70 A; 1D09 B; 2GGR A; 4OP0 A; 1MMG A; 3G6E A; 1RLP C; 2D1X A; 3P8B B; 3CCR Q; 1ZA2 B; 2PUK B; 5FRO A; 2GFU A; 3M54 A; 2H8H A; 3RR6 A; 2FPD A; 2MIO A; 4DEY A; 1G3T A; 1MV0 B; 4IUQ A; 4PJO D; 3HPW A; 2DL5 A; 2YWW A; 5GAM j; 1SRL A; 3CC2 A; 3AHU A; 4JS4 A; 1WXT A; 1M1K C; 4XAX B; 2RJF A; 2DL7 A; 1YJ9 T; 4KUI A; 5LJ3 h; 2NWM A; 4JLI A; 4XTV A; 5LJ3 d; 4RTZ A; 1VQ4 Q; 1QVP A; 2NUP A; 3QYH B; 1VQN T; 2EJF A; 2I0N A; 3OS5 A; 4MZP A; 3FC3 A; 4JJC A; 2YT6 A; 2MWO A; 2JUF A; 2DER A; 1PCX A; 1U1S A; 2OTJ A; 4XU3 A; 3WVD B; 2BIV A; 1UJ0 A; 4A4G A; 4EMK A; 2G6F X; 4J9G A; 1ARK A; 3CCQ Q; 1MUZ A; 3M58 A; 2O4X A; 1WJR A; 1IRE B; 2EYQ A; 3I5R A; 5LJ5 j; 2C0T A; 3CBP A; 1WHH A; 1YJW A; 1TSF A; 1NBE B; 1YHQ A; 2KXD A; 1Q86 C; 2X4J A; 3TEE A; 5D6W A; 3JCM V; 2Y4X A; 4QVD A; 2RI2 A; 3OYC A; 3M4G A; 2LMJ A; 1YIJ T; 1M90 U; 3M56 A; 2EJ9 A; 5HK3 A; 4LUD A; 2B8A A; 1ACM B; 1BKB A; 1NLO C; 2DO3 A; 2XI9 A; 1TXQ A; 2V8K A; 2A36 A; 2RO0 A; 2JOY A; 1Q82 R; 3JCM f; 1KQ1 A; 1UB4 A; 1UFF A; 3OYM A; 4O6J A; 2KXC A; 3VYH B; 3SHW A; 2LJ3 A; 1OV3 A; 3CPW A; 2QEX Q; 1SG5 A; 5GAN 5; 1XQH A; 1VQ9 T; 3R6O A; 2E5K A; 2DLP A; 3DKM A; 2WSE E; 1KD1 U; 5GAN 2; 4FIB A; 4M7A C; 2CRE A; 2A0F B; 2JTM A; 4PJJ A; 4P5N A; 3M57 A; 4Y28 E; 3E9G A; 1LVK A; 1Y71 A; 3D7S B; 3OYY A; 2L0A A; 2M51 A; 3OW2 A; 1RAE B; 2P0Q A; 2OX7 A; 5I2S A; 2AZV A; 4ZNX A; 4X9C A; 4N4I A; 3GIB A; 1OEB A; 3E2U A; 1PD0 A; 2EIF A; 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