The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
55
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structure length |
55
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Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEGNGRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
|
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain double mutant V46G-D48G
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
55
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| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YWO A; 4F16 A; 2DE0 X; 2AKK A; 1YWP A; 2DL5 A; 4DEX A; 1JXO A; 4LNP A; 3C0C A; 2HCK A; 1BBZ A; 2KT1 A; 4JJD A; 1G2B A; 4JPB W; 3I5S A; 1KJW A; 4K11 A; 4AFZ C; 4ESR A; 4RTY A; 2JT4 A; 3H41 A; 1YP5 A; 2LMJ A; 1K9A A; 1WDX A; 4FSS A; 2J7I A; 1I1J A; 3PVL A; 3FJ5 A; 2FPF A; 2K79 A; 2KYM A; 4OMQ A; 2J6F A; 1WYX A; 4OMM A; 3EG2 A; 1JQQ A; 1GCP A; 2M51 A; 1QWE A; 2EBP A; 2W10 A; 1HSQ A; 2CSI A; 2LP5 A; 2L2P A; 1KIK A; 1YCS B; 5IHN A; 1W70 A; 1IO6 A; 2DJQ A; 1NYG A; 5FWC A; 2L0A A; 1NEG A; 1AWO A; 2CSQ A; 1OV3 A; 2KE9 A; 4RTZ A; 3EG1 A; 5GJW B; 2HBW A; 3GBQ A; 4AG2 C; 1BU1 A; 4J9F A; 1YN8 A; 2JM9 A; 1YNZ A; 3EG0 A; 3SHW A; 1OPK A; 1E6G A; 2YUO A; 3EGU A; 2O88 A; 3PVQ A; 4LUE A; 1RLP C; 2J06 A; 1CKA A; 3VS0 A; 1UHF A; 2L3S A; 1GCQ A; 1H3H A; 1UFF A; 3H0F A; 4LN2 A; 4DEY A; 2EGC A; 2YUQ A; 4A63 B; 1HD3 A; 1X6B A; 1WXT A; 1FMK A; 3TSZ A; 4GLM A; 4M4Z A; 2MIO A; 1Y0M A; 2FG0 A; 2ROT A; 2LNH B; 1GRI A; 4AFU C; 2BTT A; 4X1V A; 4D8K A; 3UA7 A; 1ABQ A; 2C0T A; 3RBB B; 1VYV A; 1WA7 A; 3A98 A; 2D1X A; 2C0O A; 4JZ4 A; 2MOX A; 2NWM A; 2KRM A; 4J9I A; 2F2W A; 2ED1 A; 1AWW A; 5HCK A; 4RUG A; 1GL5 A; 1JU5 C; 2KEA A; 4IIO A; 1Y57 A; 2JS0 A; 4F14 A; 5L23 A; 1NM7 A; 2PNI A; 2ECZ A; 2J6K A; 1NEB A; 3H0I A; 1RUW A; 2O2O A; 1AZG B; 1AWJ A; 4OML A; 2D8J A; 2K2M A; 1G83 A; 4J9E A; 5IHK A; 1K76 A; 1A0N B; 1K1Z A; 4LE9 A; 2LQW A; 3NGP A; 2GGR A; 3O5Z A; 1J3T A; 1FYN A; 1X6G A; 1M30 A; 2VWF A; 1T0J A; 2ED0 A; 1M8M A; 1NYF A; 2SRC A; 2J6O A; 1GFD A; 2CH4 A; 2W0Z A; 1WXB A; 1X27 A; 1OPL A; 1MUZ A; 3REB B; 4AG1 C; 2GTJ A; 2RQT A; 2E5K A; 2F2V A; 2YUN A; 5FW9 A; 2EYX A; 1T3S A; 1CSK A; 1MV0 B; 1E6H A; 3VS4 A; 2K9G A; 1K0X A; 2OJ2 A; 3IQL A; 4E6R A; 2DBM A; 2O31 A; 1M3B A; 1ARK A; 1WLP B; 2OI3 A; 2YSQ A; 2EYZ A; 3UAT A; 2LJ1 A; 2KXC A; 1S1N A; 2X3W D; 2VVK A; 4CC3 A; 2A37 A; 1JO8 A; 4ORZ A; 3UA6 A; 3TSW A; 2RN8 A; 4GBQ A; 3VS6 A; 1AOJ A; 1SRM A; 4HVU A; 2X3X D; 3RNJ A; 4CC7 A; 2NUZ A; 1AEY A; 1SSH A; 3M0R A; 4JZ3 A; 2G6F X; 1UGV A; 2JMA A; 4QT7 A; 2XMF A; 2ROL A; 2EPD A; 2GNC A; 3VS7 A; 1UG1 A; 2EYY A; 2LJ0 A; 1UUE A; 2FPD A; 2EGE A; 2EGA A; 1PWT A; 2GQI A; 3TVT A; 1LCK A; 2A28 A; 2AK5 A; 2A08 A; 2FRY A; 4KRT A; 2YT6 A; 4Z8A A; 4OMP A; 3ZL7 C; 5I11 A; 2HSP A; 1GFC A; 2DVJ A; 4RTX A; 4AFQ C; 2L3P A; 1MV3 A; 1TUC A; 3VS1 A; 2PZ1 A; 1NLO C; 2DL8 A; 3VRZ A; 2EYW A; 2KRS A; 3JV3 A; 5ECA A; 1QLY A; 4Z88 A; 4LUD A; 1GBR A; 3NMZ C; 3REA B; 3SEM A; 1VA7 A; 1ZBJ A; 2DL7 A; 2FEI A; 2RQV A; 2MCN A; 1XOV A; 1ZSG A; 2O9S A; 1M27 C; 1GBQ A; 3M0S A; 5EC7 A; 1NLP C; 3THK A; 2YUP A; 1AWX A; 1UTI A; 1ZUY A; 4IIM A; 2B86 A; 3M0T A; 1UEC A; 1PRM C; 1JEG A; 2BZ8 A; 5IXF A; 1ZUK A; 1ZX6 A; 1H92 A; 1M3A A; 2DYB A; 1KSW A; 2KBT A; 2KT8 A; 1HJD A; 2DBK A; 1SEM A; 1WXU A; 2DF6 A; 1AD5 A; 1AVZ C; 2BZX A; 2LJ3 A; 2M0Y A; 3LH5 A; 3U23 A; 1PNJ A; 4CC4 B; 3M0Q A; 2PTK A; 2DRK A; 2F2X A; 2HEQ A; 4Z89 A; 1SHG A; 2K6D A; 4J9H A; 1OEB A; 2RQU A; 1BK2 A; 5GJV B; 4EIK A; 3EG3 A; 1WFW A; 1OOT A; 2AZV A; 2BZY A; 2RQR A; 2K7A A; 2YDL A; 1SHF A; 1W1F A; 2SEM A; 2CDT A; 1AZE A; 2K3B A; 3I9Q A; 1N5Z A; 1X43 A; 4J9B A; 3ULR B; 2CRE A; 4HVV A; 1QKW A; 3I35 A; 3M0P A; 4RTW A; 1X2K A; 1ZLM A; 2JS2 A; 1U06 A; 1WIE A; 2EQI A; 2KNB B; 2LQN A; 4D8D A; 3EHQ A; 1BB9 A; 2A36 A; 2LX7 A; 4HCK A; 1V1C A; 2O9V A; 3I5R A; 4JJB A; 3QWY A; 2LCS A; 3PE0 A; 1B3Q A; 5IH2 A; 2RNA A; 3VS2 A; 1WI7 A; 1PRL C; 3R6N A; 2DIL A; 2CH4 W; 2KXD A; 2JTE A; 4CC2 A; 2KYB A; 3CQT A; 2DA9 A; 2KRO A; 3NPF A; 2KRN A; 4HVW A; 2QDL A; 1UJ0 A; 1I0C A; 2AZS A; 3NHN A; 4J9C A; 2JXB A; 1UDL A; 1SPK A; 2FPE A; 3VS3 A; 2OAW A; 2RPN A; 1UJY A; 2P4R A; 4JJC A; 4WCI A; 1T3L A; 5IHI A; 1UE9 A; 2DLP A; 1KFZ A; 1K4U S; 2D0N A; 1JXM A; 4F17 A; 1RI9 A; 2DL4 A; 2VKN A; 4AFS C; 4R0K A; 5FWB A; 2ENM A; 1CKB A; 1H8K A; 1VYT A; 3M0U A; 2ESW A; 1M3C A; 2CT3 A; 2D8H A; 2CUB A; 1T0H A; 2EKH A; 2J05 A; 4J9G A; 1Z9Z A; 1WX6 A; 2AKL A; 4RTU A; 1ABO A; 2EVR A; 1QWF A; 2HDA A; 2RMO A; 4OMO A; 1X2Q A; 2I0N A; 1EFN A; 1Z9Q A; 2DRM A; 2ABL A; 1TUD A; 4Y92 A; 2C0I A; 4J9D A; 1QCF A; 3UF4 A; 5I22 A; 1RLQ C; 5IXB A; 1GCQ C; 1W6X A; 4RTV A; 2EW3 A; 1ZUU A; 4OMN A; 4ZNX A; 2RQW A; 2FRW A; 1PHT A; 2CUD A; 3VS5 A; 1PKS A; 2DX1 A; 4HXJ A; 2DMO A; 1B07 A; 2GTO A; 1U5S A; 3EHR A; 1QKX A; 1PKT A; 2IIM A; 3VRY A; 1U3O A; 2GBQ A; 1E7O A; 2JMC A; 2LZ6 B; 2FO0 A; 2KR3 A; 2KGT A; 3QWX X; 2V1R A; 2JM8 A; 1I07 A; 1NG2 A; 2CT4 A; 1UHC A; 2RF0 A; 2JW4 A; 1VYU A; 2V1Q A; 2DNU A; 1SRL A; 1K0S A; 1X69 A; 3H0H A; 2L3Q A; 1TG0 A; 2DL3 A; 2H8H A; 3KFV A; 2DM1 A; 4RTT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HQX A; 5KYU A; 2DE0 X; 5CAI A; 1YWP A; 3FDR A; 3C0C A; 2HCK A; 1ZSZ A; 2K5L A; 4JRI A; 4C0D B; 1FMW A; 4FM4 B; 1KJW A; 4AFZ C; 5A0G A; 3JCM X; 2E1H A; 2XD0 A; 4ESR A; 2JT4 A; 3CCU Q; 2OX7 A; 1YP5 A; 1G3S A; 1YJ9 A; 3JCM f; 3QDF A; 3QZ9 B; 2RJC A; 3BW1 A; 3FJ5 A; 2JUF A; 3PMI A; 3TU4 K; 1M2V A; 3CC7 T; 3EGX B; 1NJI C; 2JN0 A; 1VQ9 Q; 1D3B B; 4PJO C; 1QWE A; 5C6S A; 1W70 A; 1IO6 A; 4C92 A; 2FYK A; 4C0D C; 1IB8 A; 2L0A A; 2EJG A; 1AWO A; 2XDP A; 2CSQ A; 2KE9 A; 2ZPI B; 1VQ7 Q; 4PFZ A; 3EG1 A; 4PLI A; 4JLI A; 3PT9 A; 5KYW B; 4AG2 C; 4DQ2 A; 2ZAE A; 4A54 A; 3RER A; 1YN8 A; 1QQJ A; 3EG0 A; 1YNZ A; 3SHW A; 1E6G A; 1UGQ B; 3PMT A; 3RMQ A; 3PVQ A; 2O88 A; 2KQW A; 2J06 A; 2V8J A; 1UHF A; 2L3S A; 1GCQ A; 1H3H A; 1K73 U; 4LN2 A; 4BDY A; 4DEY A; 1U8R A; 1HD3 A; 2D9T A; 1WXT A; 1FMK A; 1N6A A; 2YRD A; 1Y0M A; 2FG0 A; 1JJ2 P; 3LWH A; 1UEB A; 1ABQ A; 1IGU A; 4C8Q A; 3RDV A; 1VQ4 A; 1WA7 A; 4Y91 A; 2KRM A; 4N0A C; 5HCK A; 3CCR A; 3A8H B; 2EJ9 A; 3EG9 B; 1JU5 C; 5CQX A; 4IIO A; 4J6Y A; 3CCU T; 3CCV Q; 1QMC A; 2JS0 A; 1N9R A; 1Q81 C; 3G71 A; 1M90 C; 2PNI A; 4JUV A; 1HK9 A; 1WHL A; 3MHX A; 1TXQ A; 1Q81 U; 1AWJ A; 1M90 U; 3OBY A; 2K2M A; 4J9E A; 2DXT A; 1A0N B; 3JCM Q; 4LE9 A; 1PC0 A; 2MAM A; 5DM7 R; 2GGR A; 1J3T A; 3CC2 A; 3QYG B; 2VWF A; 2HMA A; 1D0X A; 1GFD A; 2LVM A; 1MNE A; 5KCO A; 3X26 B; 4XU0 A; 1WXB A; 3OMG A; 1PSE A; 1OPL A; 5KYU B; 3REB B; 4AG1 C; 2CP3 A; 4M78 A; 5FW9 A; 2EYX A; 1ZSZ B; 1T3S A; 2VXE A; 5CKH A; 2K57 A; 4M75 F; 4NL2 A; 2K9G A; 4ANJ A; 4CI0 C; 1B7T A; 2VYT A; 4F7U F; 3UAT A; 2LJ1 A; 3CCL Q; 1M2V B; 1S1N A; 2E6Z A; 4OMF B; 2MWO A; 3TSW A; 3VS6 A; 1AOJ A; 4EMK A; 1SRM A; 2X3X D; 1TH7 A; 2EYQ A; 3LYI A; 2DIQ A; 3RNJ A; 3X25 B; 1EIF A; 2IVW A; 1OUL A; 5HK3 A; 1AEY A; 1S72 A; 4PFO A; 4C92 B; 2HD0 A; 5LJ5 g; 2VUB A; 2HKQ B; 2WSE E; 3OB9 A; 2ROL A; 2VGN A; 1ZA1 B; 3EGD A; 2JZ2 A; 3CCV T; 4KBM B; 1UG1 A; 2EYY A; 3JCM d; 3P8D A; 2E41 A; 3I56 T; 2EAY A; 2RO0 A; 4JRQ A; 1KHI A; 2A28 A; 2AK5 A; 2A08 A; 2FRY A; 4OMP A; 4XTY A; 2R5A A; 3JAM E; 5HKC A; 1K73 R; 4FL6 A; 2DVJ A; 1KHC A; 3JB9 J; 4A4K A; 4QQD A; 1MV3 A; 2ZPB B; 3CCE A; 1KC8 R; 2LT4 A; 2OTL T; 3CCE T; 2L89 A; 4XU1 A; 1WQ7 A; 2HL3 A; 2QXF A; 4C8Q B; 4XTZ A; 3E19 A; 3MP6 A; 1UB4 A; 3NMZ C; 2D6F A; 1ZBJ A; 1RAE B; 3CME T; 1YHQ T; 1B34 A; 3G4S Q; 3G6E A; 3CCQ T; 1Y96 A; 2MCN A; 4BY6 C; 1M4Z A; 3G6E T; 2DEQ A; 1YIT T; 3CC4 A; 4M75 E; 3THK A; 1AWX A; 1UTI A; 3M0T A; 1Q81 R; 2BZ8 A; 2VC8 A; 4HCZ A; 1XQH A; 4M7D E; 4PJO F; 2E10 A; 2DEU A; 4XTV A; 3QZ5 B; 1SEM A; 2P0K A; 1WXU A; 4MDX A; 4C8Q C; 2PVD B; 3U23 A; 3A8L B; 5IAY A; 2DRK A; 2F2X A; 2A0F B; 2YWW A; 3GP8 A; 4WF2 A; 3PNW C; 1BK2 A; 4FYV B; 5GJV B; 5GAN h; 2RH2 A; 2AZV A; 4PFP A; 3OYH A; 3GF5 A; 2CGH A; 3HTR A; 4KUL A; 1SHF A; 1W1F A; 2CP5 A; 2K3Y A; 2CDT A; 3CXC A; 4M78 B; 5C0M A; 3P8B B; 3DKM A; 4BE2 A; 1N5Z A; 4AT1 B; 4HVV A; 3OS5 A; 2RHI A; 2GF7 A; 1MMG A; 4QVZ A; 1VQN T; 1WIE A; 4D8D A; 1KQ2 A; 2A36 A; 1D0Y A; 4ZTJ A; 2O9V A; 2LCS A; 4DOW A; 2H3J A; 1B3Q A; 4EMK B; 3RKY A; 3RIR A; 4M77 D; 3TQ7 P; 3R6N A; 3G7Z A; 1I8F A; 2KXD A; 4M78 C; 2KYB A; 1WHH A; 3EGD B; 4MZT A; 2DA9 A; 3T9N A; 2YRV A; 2KRN A; 4M7D A; 4O6J A; 1BIA A; 1H3Z A; 4Y28 E; 4J9C A; 4MZM A; 1O75 A; 1N8R C; 4QQG A; 2DLP A; 1MGQ A; 2E5Q A; 4PJO E; 2VKN A; 1MND A; 2ZPF B; 2FZK B; 1N8R U; 1CKB A; 1H8K A; 3M0U A; 2PU9 B; 1WJR A; 2CT3 A; 3HFO A; 2EQM A; 3WVE B; 1QCO A; 2KK4 A; 1VQM T; 2EVR A; 2RJD A; 1QWF A; 2HDA A; 1JB0 E; 1TTH B; 3V7R A; 2QDY B; 2DRM A; 3A5Z B; 1TUD A; 4Y92 A; 5D6X A; 4J9D A; 1NPP A; 5I22 A; 3CD6 A; 1RLQ C; 4J5Y A; 1YIJ T; 5IXB A; 5CR2 A; 1W6X A; 2VGM A; 1Y71 A; 4FYW B; 1B34 B; 3CCS A; 4OGE A; 2EW3 A; 2HAX A; 4DOV A; 1Y96 B; 3A8M B; 3CCS T; 1VQP A; 2RHZ A; 1LJO A; 5HY6 A; 3I55 A; 1EX4 A; 1XJW B; 1M1K C; 4LD9 K; 1PKS A; 4HXJ A; 1VQ6 T; 2DMO A; 4L59 A; 4JLG A; 5L8R E; 3EHR A; 1M1K U; 2JTM A; 2LZ6 B; 2LDM A; 2KR3 A; 2DXU A; 2LX9 A; 2RF0 A; 4JJN K; 2DNU A; 3PGG A; 3M59 A; 3H0H A; 2QK0 A; 4X34 A; 1BI3 A; 2DM1 A; 3LX7 A; 4RTT A; 4LDU A; 1ZBX A; 5D6W A; 5LL6 S; 5FRN A; 1G5V A; 1G3W A; 4LNP A; 4E7J A; 2QA4 T; 1BBZ A; 2KT1 A; 1G2B A; 3S3O A; 1LOJ A; 2LMJ A; 1QVF P; 3GIB A; 1WDX A; 3PVL A; 4R56 A; 1GXI E; 4DBQ A; 3F70 A; 4NOY A; 3OA6 A; 2FPF A; 2K79 A; 2KYM A; 4OMQ A; 1JQQ A; 3SB2 A; 2RI2 A; 2L5Q A; 1GCP A; 2MYS A; 4FIB A; 4A53 A; 1QVG P; 4A4H A; 2LP5 A; 2M16 A; 3EFR A; 5IHN A; 1JJ2 A; 4MMK A; 3CXC P; 5FWC A; 1VQK T; 1NEG A; 3EAE A; 3L2Q A; 1OV3 A; 3KBG A; 1KQS P; 1YBY A; 5GJW B; 3GPL A; 2HBW A; 3GBQ A; 2QI2 A; 3VV0 A; 2RK2 A; 3DLL A; 2V8I A; 4OB2 B; 2YUO A; 4M7D B; 1WHM A; 3EGU A; 1RAI B; 3CCJ Q; 1JJ2 S; 1XNI A; 3VS0 A; 1UFF A; 5GMK m; 4J6W A; 2RI3 A; 4LDX A; 3NTK A; 1YFN A; 1N8R R; 3TSZ A; 3FEO A; 4M4Z A; 3V8L A; 2ROT A; 2LNH B; 4M75 G; 2K5I A; 4AFU C; 3OYC A; 2X4J A; 2OTJ Q; 4X1V A; 3JSC A; 4LDY A; 1VQ8 T; 1I5O B; 3UA7 A; 2P84 A; 1VYV A; 2YHT A; 4M77 F; 3CMA A; 2GCX A; 4F7U G; 2D1X A; 3OYA A; 1LVK A; 3CMA T; 2F2W A; 3OYM A; 4NS5 A; 2VAS A; 1AWW A; 4A4F A; 1RAH B; 1OU9 A; 1N27 A; 2HQE A; 1Y57 A; 4M75 D; 2DZ9 A; 2MWP A; 2F69 A; 3X28 B; 4M7A C; 2MK5 A; 5L23 A; 1NM7 A; 2ECZ A; 5J26 A; 1IHV A; 2O2O A; 4MML A; 2D8J A; 5GAN 6; 4GY5 A; 4IUQ A; 2EIF A; 1HXD A; 1RI0 A; 2QEX T; 3SDZ A; 2DZC A; 4RCC A; 1X6G A; 2VB6 A; 2QQA A; 1YJN Q; 2FHD A; 4L5G A; 3JCM e; 2ED0 A; 1M8M A; 1NYF A; 1YJW Q; 5LJ3 g; 1WHJ A; 4MZP A; 2QTX A; 2E5K A; 1WHK A; 1VIF A; 2QQS A; 1UGS B; 4OB0 B; 1RAD B; 1VQL Q; 5GAN g; 3CBP A; 3CC7 A; 3C4S A; 2F5T X; 3LGL A; 1K0X A; 4HCC A; 1VQ4 Q; 2DK3 A; 4E6R A; 2DBM A; 2O31 A; 1M3B A; 3MEV A; 3CCR Q; 4CRI A; 2VVK A; 3S6W A; 2E3I A; 3RMS A; 2DD4 A; 3M53 A; 4ELY C; 4M77 E; 3OSS C; 3M0R A; 1UGV A; 2JMA A; 3OQ5 A; 4QT7 A; 4RG8 A; 4PJO G; 1WGS A; 2EPD A; 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