The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVADRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47A
rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
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| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M3B A; 1SPK A; 1M8M A; 5IHN A; 2C0I A; 1WXU A; 3REA B; 2RPN A; 1UJY A; 3VRZ A; 1WXB A; 2OAW A; 1FYN A; 1NG2 A; 2J06 A; 4LNP A; 1RLQ C; 4Y92 A; 2D1X A; 1Z9Z A; 1OPK A; 2A28 A; 2D8J A; 2RN8 A; 1M30 A; 1AWW A; 2LMJ A; 4A63 B; 2DA9 A; 1WI7 A; 1YWO A; 2KE9 A; 2FPE A; 5EC7 A; 5FWB A; 2W10 A; 2F2V A; 2LQN A; 3VS1 A; 1FMK A; 2MOX A; 2EGE A; 2ROL A; 4JJC A; 4LUD A; 2YT6 A; 3EHR A; 4J9I A; 4OMQ A; 2FRY A; 2LNH B; 2K79 A; 4CC4 B; 1AWX A; 3VS5 A; 2O9S A; 1WLP B; 1UTI A; 1GRI A; 2LQW A; 1CSK A; 2SRC A; 2A37 A; 1JU5 C; 2EGC A; 2CRE A; 2YSQ A; 1HD3 A; 4OMO A; 4FSS A; 1WYX A; 1OOT A; 1BK2 A; 2MIO A; 1X43 A; 1Z9Q A; 1NYF A; 1KFZ A; 4OMP A; 1JEG A; 1TUC A; 1E6G A; 2KRO A; 2J05 A; 1T3L A; 1NLP C; 3IQL A; 2HCK A; 2DE0 X; 1YCS B; 1JXO A; 1U5S A; 1JO8 A; 1AWO A; 2L3S A; 1HSQ A; 2DJQ A; 2EYW A; 2AKK A; 1WXT A; 2KXC A; 1UUE A; 3ULR B; 1UE9 A; 4RTU A; 1GBR A; 1GL5 A; 2KGT A; 1X27 A; 4HXJ A; 4D8K A; 4HVV A; 2DIL A; 2MCN A; 2CT4 A; 2RQV A; 2AKL A; 2ED0 A; 2RMO A; 2L0A A; 1WIE A; 1RI9 A; 4JJB A; 1WX6 A; 1WA7 A; 1ZUU A; 1GFC A; 2CT3 A; 1EFN A; 2DMO A; 1AZG B; 2BZX A; 2F2X A; 1UG1 A; 1A0N B; 1K4U S; 2YUO A; 2KT8 A; 4AFZ C; 2CSQ A; 1K76 A; 4QT7 A; 2K6D A; 2AZS A; 1X69 A; 2CH4 A; 2J6F A; 1E7O A; 1M3C A; 1I1J A; 2EW3 A; 4X1V A; 1OPL A; 1NEG A; 1PRL C; 2DX1 A; 2GTO A; 4RTW A; 1H8K A; 2RQU A; 4R0K A; 1JXM A; 1SSH A; 2CDT A; 2O2O A; 2O9V A; 2EVR A; 3RNJ A; 4E6R A; 3VS4 A; 2J6K A; 4F16 A; 2ROT A; 4ESR A; 1TUD A; 2NUZ A; 1GBQ A; 1QCF A; 1ZX6 A; 3O5Z A; 2C0T A; 1HJD A; 4RTY A; 1M27 C; 2BTT A; 1BU1 A; 4AFS C; 2EYZ A; 2PTK A; 1ZUY A; 2DL4 A; 1K0X A; 1TG0 A; 2A36 A; 4Z88 A; 2YUQ A; 2C0O A; 2HSP A; 2L3P A; 3M0S A; 3RBB B; 2LX7 A; 3UA6 A; 2DF6 A; 1K1Z A; 1K0S A; 2JS2 A; 2CUB A; 2BZY A; 5GJW B; 4Z8A A; 4IIM A; 1U06 A; 1G83 A; 1OV3 A; 4RTV A; 1Y57 A; 2EGA A; 2YUP A; 1MV3 A; 3TSZ A; 1E6H A; 2JMC A; 4LE9 A; 2DL7 A; 2ED1 A; 2DBK A; 3I35 A; 1CKB A; 2KXD A; 2DL3 A; 1GCQ C; 1VYT A; 3UAT A; 5IHI A; 1ABQ A; 1ABO A; 2FO0 A; 4GLM A; 1NLO C; 3VS2 A; 3H0H A; 2HBW A; 3SEM A; 2JS0 A; 4J9G A; 2H8H A; 2JTE A; 1LCK A; 3REB B; 1GFD A; 1PHT A; 2BZ8 A; 2JM9 A; 1W1F A; 2JMA A; 1AWJ A; 1I07 A; 1UEC A; 1ZSG A; 2GQI A; 2EKH A; 2LJ1 A; 2KR3 A; 2ESW A; 2LP5 A; 3VS7 A; 4AFU C; 4J9C A; 3H0I A; 1J3T A; 4J9D A; 2HEQ A; 1H92 A; 4HCK A; 3EHQ A; 2KNB B; 4ZNX A; 2DYB A; 3UA7 A; 2EYX A; 2EQI A; 5I11 A; 2XMF A; 3M0Q A; 1PRM C; 1AD5 A; 2V1R A; 2CH4 W; 5FWC A; 2FRW A; 4HVW A; 5IXF A; 1GCP A; 2O88 A; 4AG2 C; 2EBP A; 2VWF A; 4DEX A; 4CC7 A; 1S1N A; 1PNJ A; 2DNU A; 4AFQ C; 2KRM A; 2RNA A; 4OMN A; 2RF0 A; 2I0N A; 2LJ0 A; 2QDL A; 2ABL A; 2JM8 A; 4LUE A; 3QWY A; 2JT4 A; 1BB9 A; 3EGU A; 4WCI A; 5GJV B; 1PWT A; 3VRY A; 2W0Z A; 2O31 A; 5IH2 A; 1W6X A; 4EIK A; 2JXB A; 1I0C A; 2B86 A; 2F2W A; 1QKW A; 2ECZ A; 2FPF A; 2AZV A; 1PKT A; 4RTX A; 1UJ0 A; 4K11 A; 2AK5 A; 2RQW A; 2VKN A; 4IIO A; 4DEY A; 4RUG A; 3M0U A; 2GGR A; 3C0C A; 2KBT A; 2DRK A; 1UFF A; 2PZ1 A; 2DBM A; 2M0Y A; 3M0T A; 4OML A; 2RQR A; 4LN2 A; 3VS3 A; 2X3X D; 5HCK A; 2PNI A; 2V1Q A; 3JV3 A; 3M0R A; 5ECA A; 1GCQ A; 1WDX A; 2CSI A; 4JZ3 A; 4CC3 A; 1N5Z A; 1H3H A; 3UF4 A; 4D8D A; 4J9E A; 2E5K A; 2J6O A; 4KRT A; 1Y0M A; 3R6N A; 1ZUK A; 2KRN A; 5IHK A; 1M3A A; 4Z89 A; 3A98 A; 2D0N A; 3NHN A; 1NM7 A; 1IO6 A; 2K7A A; 4F14 A; 1CKA A; 2KYB A; 2K2M A; 2LZ6 B; 2KT1 A; 3PVL A; 4JZ4 A; 4ORZ A; 1VYU A; 4RTT A; 1X2K A; 4HVU A; 3GBQ A; 1KIK A; 2JW4 A; 1PKS A; 5FW9 A; 2DVJ A; 3H0F A; 3I9Q A; 2A08 A; 4AG1 C; 2DLP A; 3SHW A; 1SEM A; 1KJW A; 1ARK A; 3EG0 A; 3U23 A; 3NPF A; 2GTJ A; 2P4R A; 2EYY A; 3CQT A; 1AZE A; 2L3Q A; 2FG0 A; 3THK A; 1RUW A; 2OJ2 A; 1MUZ A; 4CC2 A; 4JJD A; 2NWM A; 2EPD A; 2FEI A; 1QWF A; 1G2B A; 1YN8 A; 1X2Q A; 1RLP C; 4M4Z A; 2YUN A; 3NMZ C; 2DRM A; 2RQT A; 1QWE A; 1YP5 A; 1AEY A; 2LJ3 A; 1SHF A; 2SEM A; 1T0J A; 4J9B A; 1AOJ A; 1T3S A; 2KEA A; 4GBQ A; 4J9F A; 4RTZ A; 1MV0 B; 2X3W D; 1UHF A; 3I5S A; 2KYM A; 1AVZ C; 2FPD A; 1UGV A; 3VS0 A; 1NYG A; 2CUD A; 3M0P A; 1K9A A; 3PVQ A; 1YWP A; 2K9G A; 1UDL A; 2K3B A; 1V1C A; 2DM1 A; 2GBQ A; 4JPB W; 3KFV A; 1VYV A; 3EG2 A; 3NGP A; 2DL8 A; 4OMM A; 1JQQ A; 1SHG A; 1X6G A; 2IIM A; 3EG1 A; 2KRS A; 2HDA A; 3I5R A; 1B07 A; 1BBZ A; 1QLY A; 1OEB A; 1XOV A; 3ZL7 C; 3H41 A; 3FJ5 A; 5L23 A; 2ENM A; 3TSW A; 2OI3 A; 1B3Q A; 1UHC A; 3QWX X; 1SRM A; 1VA7 A; 1W70 A; 1ZLM A; 3PE0 A; 2M51 A; 2L2P A; 2LCS A; 3LH5 A; 1WFW A; 1YNZ A; 1NEB A; 4J9H A; 2DL5 A; 2G6F X; 1KSW A; 5IXB A; 3EG3 A; 5I22 A; 1X6B A; 1T0H A; 2VVK A; 2D8H A; 4F17 A; 2J7I A; 1ZBJ A; 1QKX A; 1SRL A; 1U3O A; 2GNC A; 3VS6 A; 3TVT A; 2YDL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BDY A; 5LJ5 h; 3REA B; 2RPN A; 5FU6 C; 4UC4 A; 3RKY A; 4IUU A; 1VQ4 T; 3V7C A; 2J06 A; 3M53 A; 1NJI R; 4PJL A; 5GAN 5; 4C92 G; 2RN8 A; 1PSE A; 1VQ4 Q; 2E5Q A; 4PFO A; 4VUB A; 1H3Z A; 1N6A A; 3AHU A; 1IXD A; 1XNI A; 3UPU A; 2M9U A; 4M7A C; 4A63 B; 4NL2 A; 3J81 E; 2A3L A; 2W10 A; 2F2V A; 3QSU A; 1GXI E; 5J39 A; 3ZEH A; 2EGE A; 2ROL A; 5GAM e; 1QVG A; 4OMQ A; 2NUP B; 2DIG A; 1K8A C; 1RAE B; 3A8L B; 4CC4 B; 1VIE A; 3CCQ A; 1VQ8 T; 3SDZ A; 3RIR A; 3GF5 A; 4E47 A; 1CSK A; 4D6W A; 3HFO A; 4RG8 A; 1YCY A; 2K5F A; 4OMO A; 1HD3 A; 4FSS A; 3HSB A; 2DXC A; 2ZPE B; 1ZQ1 A; 5DLQ E; 1Q81 C; 3I56 T; 3L42 A; 2QEX T; 1TUC A; 2EKO A; 3I56 Q; 1QCN A; 2ZCF B; 3OYN A; 4PJO B; 2QEX Q; 1ZA1 B; 5KYY A; 3C12 A; 2HCK A; 1IGU A; 2DE0 X; 5LJ5 g; 1TTH B; 1JXO A; 1U5S A; 2L3S A; 3MEA A; 1BYM A; 1UUE A; 3ULR B; 1UE9 A; 1W4S A; 4RTU A; 1GL5 A; 5GMK m; 1Q82 U; 2QQS A; 1VQL Q; 3PMT A; 3CCQ T; 5GAO m; 3G4S T; 1RI9 A; 2ATC B; 4JJB A; 3MET A; 3ZBD A; 1MMN A; 4C0D C; 1Y71 A; 3CBM A; 3G4S Q; 2COY A; 2OX7 A; 1MMA A; 4PJO D; 2VYT A; 3EAE A; 1EFN A; 2NYS A; 4EMH A; 1IHV A; 4E7K A; 3JB9 D; 1UG1 A; 4O6J A; 4M7A A; 1A0N B; 2KT8 A; 2E1H A; 2FZK B; 2RO0 A; 2P4T A; 2J6F A; 2RJE A; 1WQW A; 1OUL A; 1NEG A; 1PRL C; 2RQU A; 1OX9 A; 2PVG B; 2HQX A; 1M8V A; 1LVK A; 4C5G A; 4A53 A; 4JRK A; 4BY6 C; 4RG2 A; 2FL7 A; 3LGL A; 4ESR A; 4O5V A; 1QCF A; 1VQ7 A; 3QDR B; 1ZX6 A; 4N0A C; 1JJ2 S; 1YFN A; 2LQK A; 4RTY A; 5KH6 A; 1BU1 A; 4AFS C; 1H64 1; 3P8D A; 1IZ6 A; 2ZPH B; 1K0X A; 5KYY B; 1FX7 A; 3CC2 A; 5GAN 6; 1MMD A; 2CKK A; 2MYS A; 1YI2 A; 3JCM W; 2MMP A; 2JS2 A; 2CUB A; 2LCL A; 3EFO A; 3P8B B; 1C1A A; 1Y57 A; 1IRX A; 2HQH A; 2YUP A; 3QPH A; 3QZ5 B; 3V7S A; 1G5V A; 1PC0 A; 1M1G A; 4XK8 E; 4LE9 A; 4C8Q E; 2ED1 A; 5FU6 B; 4F7U G; 4A4E A; 1QVG S; 2KXD A; 4P5N A; 2L8D A; 1G8X A; 2DL3 A; 1GCQ C; 4PLI A; 2MWP A; 2YRV A; 3MEU A; 1ABQ A; 1NLO C; 4M7A B; 1VQ7 T; 2HBW A; 4CRI A; 2JS0 A; 2JTE A; 3REB B; 2Y90 A; 3BE3 A; 1PHT A; 1R0C B; 2EJF A; 2JM9 A; 1W1F A; 4DBR A; 3LWH A; 4IKF A; 1UEC A; 3MP8 A; 3CBO A; 3E9G A; 3VS7 A; 3CC2 T; 4J9C A; 2XIC A; 3FEO A; 4YTL A; 2HEQ A; 1H92 A; 1YI2 T; 3CC2 Q; 3JRZ A; 3JCM d; 3L2Q A; 3UA7 A; 4XTX A; 5KYU A; 2XMF A; 3CMA A; 1PRM C; 2M1H A; 1YI2 Q; 4HVW A; 2Y4X A; 1GCP A; 3VUB A; 2GQV A; 4J8O A; 4HKE A; 1N8R U; 4M7A D; 1EZZ B; 4DEX A; 4CC7 A; 1S1N A; 4DOV A; 1B7T A; 5GMK h; 4N0A A; 4PKC C; 3CPW S; 5CIU A; 3HRU A; 2QDL A; 6AT1 B; 4FU6 A; 5GAM d; 2JT4 A; 4OMF B; 3RMQ A; 1BIA A; 2RHX A; 4M77 D; 4WCI A; 3FB9 A; 4FT2 A; 1I0C A; 2JTM A; 1QKW A; 2FPF A; 3PIP A; 2AZV A; 5C6S A; 4PJO G; 2LC4 A; 3CC7 A; 2RQW A; 2G3R A; 4E7S A; 3JB9 G; 5EG2 A; 1WHG A; 1UFF A; 4PLL A; 3OW2 A; 2C06 A; 1FWZ A; 2RQR A; 3TCJ A; 2D6F A; 3VS3 A; 1OZ3 A; 2PNI A; 3CMA T; 5ECA A; 1GCQ A; 4C0D B; 3PT9 A; 1WDX A; 1N5Z A; 1VQ5 T; 3OMC A; 1NE8 A; 2LRQ A; 1SG5 A; 4XTY A; 2OTJ Q; 1VQ5 Q; 3WXM B; 1Y0M A; 2QGG A; 1ZUK A; 3ME9 A; 3EH1 A; 3NHN A; 3CXC A; 2K2M A; 3QII A; 5GAN 3; 3PVL A; 5KYU B; 3X28 B; 4RTT A; 2KI7 A; 1M90 U; 4E7J A; 1B34 A; 3JCM J; 2DVJ A; 3H6Z A; 4BY6 B; 3CC7 T; 1QP2 A; 1PM3 A; 4MDX A; 4AG1 C; 2DLP A; 3X26 B; 4M7D C; 1NZ9 A; 2RI3 A; 5I21 A; 3U23 A; 4J6X A; 3NPF A; 5GAM f; 2GTJ A; 2YXY A; 2DO3 A; 2EYY A; 3CQT A; 2MAM A; 2L3Q A; 1YIT T; 5GAN e; 3HFN A; 3M9Q A; 2IG0 A; 2V8K A; 4C0G A; 1YIT Q; 3CCU A; 4M4Z A; 3VJP A; 1AEY A; 5CQY A; 5D6W A; 5GAN j; 3GNG A; 5LJ3 d; 1VOM A; 1T0J A; 2RHZ A; 3VU3 C; 5LL6 S; 1AOJ A; 1WHL A; 5FRO A; 4GBQ A; 5IAY A; 3I55 Q; 1FMW A; 1MV0 B; 3I5S A; 1NJI U; 1UGV A; 4QW2 A; 1AHJ B; 2CYZ B; 1YWP A; 3OYH A; 1UDL A; 1SF9 A; 2NLU A; 4M7A G; 2DM1 A; 4PJO E; 1VYV A; 3EFS A; 2H3J A; 2CP5 A; 2DL8 A; 1K73 R; 1SHG A; 2IIM A; 1SKU B; 2KRS A; 1TU0 B; 1XOV A; 2HL5 C; 2EJG A; 2PVD B; 3G6E A; 2HAX A; 1Q7Y C; 3NFC A; 3RES A; 5DM7 R; 4BB7 A; 1ZLM A; 2CZ1 B; 5L8R E; 2DL5 A; 4M7D A; 3D7S B; 4Y91 A; 3TQ7 P; 1VQP A; 1KQS P; 3OW2 S; 4KGZ B; 3JCM P; 2VVK A; 1JRI A; 4II1 A; 1NBE B; 3L2R A; 2YWW A; 1BI1 A; 2DTH A; 2DZ9 A; 4FW1 A; 3TVT A; 5HKC A; 3GNF B; 3LX7 A; 3E9F A; 3JCM h; 1W2B S; 1MNE A; 1FYN A; 2OAU A; 4LNP A; 2D1X A; 3CXC S; 3L2Z A; 5HK3 A; 2RHU A; 2A28 A; 3OYB A; 2D8J A; 2FVU A; 4N4G A; 5CKE A; 3PIO A; 3G6E T; 2QQA A; 2LMJ A; 5GAM h; 3G6E Q; 1FXX A; 1BKB A; 2KE9 A; 2FPE A; 2QQR A; 2A7Y A; 2RD1 A; 5FWB A; 2LQN A; 3VS1 A; 1U1S A; 4JLG A; 3A1P A; 4PFP A; 1VQP T; 2HL3 A; 2K79 A; 1IGQ A; 3FJP A; 4X9C A; 1VQP Q; 1AT1 B; 2LQW A; 4HCZ A; 1Q86 R; 4BDZ A; 3GOX A; 4FT4 A; 3UDC A; 1PCX A; 1JBM A; 2F5K A; 4B6M A; 2CRE A; 3NTK A; 3OS5 A; 1KQ1 A; 1WYX A; 3INZ A; 4M7D B; 1X43 A; 3UT1 A; 1KFZ A; 4OMP A; 2KRO A; 1QW1 A; 4LDV A; 5KE2 A; 3TU4 K; 4LDU A; 1LJO A; 4WF2 A; 2RJF A; 2ZZD A; 1RL2 A; 1JO8 A; 3E19 A; 4M77 E; 4DA4 A; 4FYX B; 2KXC A; 4JJN K; 1WPY A; 2EYQ A; 2DIL A; 2CT4 A; 2RQV A; 4QQG A; 3A5Z B; 3SWN A; 2RMO A; 1WIE A; 1I8F A; 1KC8 R; 3LWI A; 1V76 A; 1WX6 A; 5GAM g; 2CT3 A; 2JZ2 A; 2HD0 A; 5GAN d; 4B9W A; 4FW2 A; 3PNW C; 2BZX A; 4XU2 A; 1M1K C; 2L5Q A; 2K6D A; 2PUK B; 2CH4 A; 1M3C A; 1I1J A; 3MO8 A; 3JB9 H; 1RI0 A; 2DX1 A; 2GTO A; 5CR2 A; 2YHT A; 4LDX A; 1H8K A; 3OYC A; 4KUL A; 1QVP A; 2CDT A; 4DBF A; 2MPX C; 1KD1 R; 3RNJ A; 4EPC A; 2J6K A; 4NS5 A; 4F16 A; 2EQM A; 2DVE A; 3M5A A; 5AT1 B; 1TUD A; 2NUZ A; 4GLK A; 4Z02 A; 3FLG A; 1M27 C; 3L2V A; 4XTV A; 2EYZ A; 3JCM e; 2WSE E; 3OYL A; 2DL4 A; 2A36 A; 4R56 A; 2AHJ B; 2GFU A; 2L3P A; 1NJI C; 4ZTF A; 1LOJ A; 2BZY A; 1KQ2 A; 1VQK A; 5J26 A; 4Z8A A; 2COW A; 4IIM A; 1TUG B; 3VYH B; 1BI0 A; 1U06 A; 3Q1J A; 3BDU A; 2P84 A; 2HMA A; 3TSZ A; 2JMC A; 3KUF A; 4KH0 B; 2DL7 A; 3SWN B; 2R58 A; 1PD1 A; 1VQM A; 2DBK A; 3I35 A; 3MHX A; 1VYT A; 5FU7 C; 2ZAE A; 1K8A R; 3TEE A; 5GAM j; 1VQ8 Q; 4N4I A; 1UGR B; 2E41 A; 2BUD A; 2M02 A; 3QBY A; 1WHH A; 1ABO A; 1ZSZ C; 5IN1 A; 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