The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVGDRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47G
rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
|
| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XMF A; 2K7A A; 2QDL A; 2ROT A; 2CH4 A; 1MV3 A; 2FPF A; 3VRY A; 2K79 A; 1SSH A; 2BZY A; 3VS2 A; 1AZE A; 3H0F A; 3VS5 A; 2M0Y A; 2GBQ A; 2FEI A; 2BZX A; 1WIE A; 3EG3 A; 1RLP C; 3EGU A; 3UF4 A; 1UE9 A; 1XOV A; 1M27 C; 2MIO A; 1OOT A; 2CSQ A; 4Z88 A; 1AVZ C; 1GFC A; 1I1J A; 4Y92 A; 1ZX6 A; 3LH5 A; 1QKW A; 4M4Z A; 1NYG A; 2HCK A; 2DM1 A; 1AD5 A; 3EG0 A; 1YWO A; 3RNJ A; 2RMO A; 3KFV A; 2HBW A; 2JT4 A; 2KNB B; 2W0Z A; 1M3C A; 2B86 A; 2L3P A; 2EBP A; 2KYM A; 2KYB A; 4RTY A; 1AZG B; 3VS4 A; 4J9D A; 1WYX A; 1N5Z A; 2JMA A; 2J7I A; 2MCN A; 2EVR A; 2J6K A; 1G2B A; 1ZUY A; 3A98 A; 1H8K A; 1UHF A; 1YNZ A; 3ZL7 C; 2ECZ A; 2LJ3 A; 4JJB A; 4J9E A; 3QWY A; 1RI9 A; 2KXD A; 2GNC A; 2EGE A; 3NGP A; 2HSP A; 1T3S A; 1B07 A; 3CQT A; 2AK5 A; 1GRI A; 4GBQ A; 1PKS A; 1WFW A; 3VS3 A; 1TUD A; 1KJW A; 4OML A; 1WXU A; 1UG1 A; 2KGT A; 1K0X A; 1SHG A; 2CT4 A; 4J9C A; 1I07 A; 1Y57 A; 2YSQ A; 1MV0 B; 1SRM A; 4RTV A; 3REA B; 2VVK A; 1NLO C; 1U06 A; 1H3H A; 1ZUK A; 4HCK A; 2EKH A; 4HVU A; 2LQN A; 2O2O A; 1X27 A; 1JXM A; 2YUP A; 2YDL A; 4D8D A; 1JQQ A; 2JMC A; 4F16 A; 2ESW A; 4RTT A; 1OPK A; 4GLM A; 4J9G A; 2BTT A; 2O9S A; 4J9I A; 2LX7 A; 1GFD A; 2RQU A; 1VYU A; 2LCS A; 3TSW A; 1AOJ A; 2F2X A; 2DBM A; 2LQW A; 1NYF A; 1T3L A; 2L3S A; 3I35 A; 2ED0 A; 1WXT A; 3SHW A; 1A0N B; 2DNU A; 4AFZ C; 5IHK A; 1PRL C; 1OEB A; 1X2Q A; 1FYN A; 5EC7 A; 4CC7 A; 1SRL A; 1K9A A; 3UA7 A; 1SHF A; 2DX1 A; 1J3T A; 1JU5 C; 2DL5 A; 4OMN A; 2IIM A; 1UUE A; 2KRO A; 2A08 A; 4OMM A; 2J05 A; 2KXC A; 3VS6 A; 4CC3 A; 4JJD A; 3NMZ C; 2PNI A; 2RQR A; 2PTK A; 2YUQ A; 1YN8 A; 2D8H A; 3I5R A; 2E5K A; 1PWT A; 2DIL A; 1W1F A; 2I0N A; 1UFF A; 5IHI A; 3VRZ A; 3UAT A; 1TG0 A; 3M0P A; 3O5Z A; 3QWX X; 2KT8 A; 2AZS A; 4LN2 A; 2EQI A; 3TVT A; 1B3Q A; 1W70 A; 1CKA A; 3PVL A; 1U3O A; 1W6X A; 2J6O A; 3EHQ A; 4LUE A; 1LCK A; 1BU1 A; 5IHN A; 1JXO A; 2O9V A; 2M51 A; 2AZV A; 4FSS A; 4AFS C; 1PNJ A; 3IQL A; 1UGV A; 3I5S A; 2F2V A; 3PVQ A; 1K1Z A; 2KRS A; 2DMO A; 2D8J A; 5I11 A; 5FWB A; 1RUW A; 2K3B A; 4KRT A; 4EIK A; 4HVW A; 2LNH B; 1K4U S; 2W10 A; 1OPL A; 3SEM A; 2V1R A; 3JV3 A; 1UHC A; 1QKX A; 1AWX A; 4JPB W; 2J06 A; 1ARK A; 1HJD A; 3NPF A; 4Z89 A; 1OV3 A; 2CUD A; 2CUB A; 3R6N A; 1GCQ C; 1UJ0 A; 2GQI A; 1IO6 A; 3M0T A; 5ECA A; 1BK2 A; 5IH2 A; 1QWF A; 2JXB A; 2D0N A; 3UA6 A; 4A63 B; 4AG1 C; 3TSZ A; 2ABL A; 2L3Q A; 1WA7 A; 2HEQ A; 4R0K A; 2MOX A; 2KEA A; 1VYV A; 2NUZ A; 2X3X D; 1GL5 A; 2RN8 A; 2EGA A; 2JM8 A; 2C0I A; 1E7O A; 4K11 A; 1KIK A; 1NG2 A; 2DVJ A; 2DJQ A; 2DRM A; 1NEB A; 4OMQ A; 1AEY A; 1PKT A; 4JJC A; 1YP5 A; 2LP5 A; 2EYX A; 1M3A A; 4RTZ A; 2K9G A; 2OJ2 A; 1UJY A; 2KRM A; 1JEG A; 3M0Q A; 1VYT A; 2RQV A; 2RQW A; 1GBR A; 1Y0M A; 1HD3 A; 1T0H A; 2JS0 A; 2BZ8 A; 1WDX A; 4AG2 C; 5FWC A; 3GBQ A; 1AWJ A; 4WCI A; 1ZLM A; 3M0U A; 3EG1 A; 1PRM C; 1ZSG A; 1FMK A; 2DL7 A; 3VS1 A; 2DL8 A; 2JW4 A; 4HVV A; 2K6D A; 3I9Q A; 2DL4 A; 1MUZ A; 4ORZ A; 4RTW A; 4HXJ A; 4D8K A; 2FPD A; 4J9F A; 2EYZ A; 1ZUU A; 2FRW A; 4J9H A; 1NM7 A; 2LZ6 B; 1JO8 A; 1UDL A; 1WI7 A; 2F2W A; 2RQT A; 4OMO A; 1Z9Q A; 1SPK A; 4F17 A; 1TUC A; 1GCQ A; 1M3B A; 2JM9 A; 3H0I A; 4DEX A; 4F14 A; 5L23 A; 4CC4 B; 2GGR A; 1X6G A; 2KT1 A; 2EYY A; 4OMP A; 2J6F A; 2L2P A; 2FRY A; 3REB B; 3THK A; 4J9B A; 1QWE A; 2FG0 A; 2KRN A; 1YWP A; 4AFU C; 2EPD A; 2GTJ A; 2KE9 A; 2FO0 A; 1V1C A; 4JZ3 A; 4LE9 A; 4RTU A; 1H92 A; 1BB9 A; 1CSK A; 4ZNX A; 2PZ1 A; 4Z8A A; 2DE0 X; 3M0S A; 3H0H A; 2K2M A; 2A28 A; 2OI3 A; 2YT6 A; 5HCK A; 1UEC A; 3RBB B; 1UTI A; 2DYB A; 1X6B A; 1X2K A; 1AWW A; 2A36 A; 2YUN A; 3EHR A; 2HDA A; 1S1N A; 2ED1 A; 4X1V A; 2DLP A; 2EW3 A; 2CH4 W; 1ZBJ A; 3VS0 A; 2AKL A; 2L0A A; 2ROL A; 3C0C A; 3PE0 A; 2DBK A; 2EYW A; 2FPE A; 2O31 A; 1NLP C; 3ULR B; 1HSQ A; 2RNA A; 2CT3 A; 1I0C A; 5I22 A; 2DL3 A; 2D1X A; 2LJ0 A; 1U5S A; 1GBQ A; 4IIO A; 1EFN A; 1WLP B; 1M8M A; 2KR3 A; 1GCP A; 1NEG A; 2SEM A; 2JTE A; 2JS2 A; 5IXF A; 2EGC A; 1KSW A; 2KBT A; 4E6R A; 1K0S A; 1K76 A; 2RPN A; 1ABO A; 5FW9 A; 2GTO A; 2P4R A; 4IIM A; 5GJV B; 2DRK A; 3EG2 A; 1YCS B; 1E6H A; 2VKN A; 4LUD A; 4ESR A; 1PHT A; 1RLQ C; 4CC2 A; 1M30 A; 2DF6 A; 5GJW B; 2CRE A; 2C0O A; 1Z9Z A; 2LJ1 A; 3U23 A; 1E6G A; 3NHN A; 3FJ5 A; 2RF0 A; 3M0R A; 2AKK A; 2C0T A; 2YUO A; 4RTX A; 1G83 A; 2DA9 A; 1X43 A; 2LMJ A; 2O88 A; 4LNP A; 2SRC A; 2V1Q A; 2NWM A; 4DEY A; 1BBZ A; 2G6F X; 1QCF A; 4AFQ C; 5IXB A; 2CSI A; 3VS7 A; 3H41 A; 1SEM A; 1VA7 A; 2CDT A; 2OAW A; 4RUG A; 1T0J A; 2A37 A; 1WX6 A; 2H8H A; 4QT7 A; 2ENM A; 1WXB A; 1QLY A; 1X69 A; 2VWF A; 1ABQ A; 2X3W D; 4JZ4 A; 1AWO A; 1KFZ A; 1CKB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QDL A; 2D6F A; 1PSE A; 2QG9 B; 1VQ9 A; 3A8G B; 2COZ A; 3VRY A; 2M0Y A; 4M7A C; 4N0A C; 1WIE A; 3EGU A; 3UF4 A; 2VUB A; 1UE9 A; 3M55 A; 1XOV A; 4J7I A; 1QVF S; 1OOT A; 2Y4Y A; 1TS9 A; 3EFO B; 1C0M A; 4GY5 A; 3I56 A; 2QK0 A; 4M4Z A; 1NYG A; 2HCK A; 2RK1 A; 1AD5 A; 1N8R U; 3V7S A; 3HTR A; 1QVP A; 2LQK A; 2RMO A; 1JRI A; 3EGX A; 2HBW A; 8ATC B; 2E5Q A; 1FMV A; 2E3I A; 2W0Z A; 1M1K U; 1M3C A; 2X9H A; 3VYH B; 2EBP A; 4RTY A; 2PVO B; 2NYS A; 3JCM W; 1N5Z A; 3OYL A; 5FRN A; 1G2B A; 1V29 B; 3DB4 A; 4JS4 A; 1IXD A; 4M7A E; 1H8K A; 1UHF A; 3M9Q A; 1YIJ T; 4MDX A; 4F7U E; 2LJ3 A; 1ZSZ C; 1TOV A; 4PLL A; 4XTU A; 2FL7 A; 4J9E A; 1WHL A; 3FJP A; 4C0D B; 2KXD A; 2YRC A; 3DLM A; 3NGP A; 2HSP A; 4X34 A; 1PCX A; 2XDD A; 1WHK A; 4MDW A; 1PKS A; 2ZZD A; 1WFW A; 2FZC B; 3CPF A; 4PLI A; 5GMK h; 5GAM e; 4OML A; 1YI2 T; 1WXU A; 4A4G A; 3CCS T; 1K0X A; 1KHC A; 3CPW P; 4J9C A; 3V7R A; 1KQS P; 3MP8 A; 3LLR A; 5KYN A; 2YSQ A; 1YIJ A; 1SRM A; 3FEO A; 1WJR A; 3OYC A; 3REA B; 4KBM B; 4XAX B; 3KUF A; 1ZUK A; 1U1S A; 3FDR A; 4HVU A; 2OTL T; 4OMF B; 2DKG A; 2NUP B; 2H3J A; 4FW2 A; 2YDL A; 1JQQ A; 3GP8 A; 3SD4 A; 2HSE B; 3EG9 A; 3WVE B; 1NE8 A; 2LX7 A; 5FU7 B; 1YI2 A; 3TSW A; 1AOJ A; 1I5O B; 1YIT T; 1NYF A; 3E2U A; 2L3S A; 3BDU A; 1WXT A; 3QO3 A; 1U1T A; 4A4K A; 2DNU A; 4IUT A; 1PRL C; 3OY9 A; 4ZGE B; 2X4W A; 2OTL A; 3UA7 A; 1VQN A; 2DX1 A; 3FB9 A; 4DA4 A; 4M77 B; 3LGL A; 1YCY A; 3PGG A; 2LC4 A; 2DXC A; 3CMA Q; 3VS6 A; 4CC3 A; 1K9M U; 1MHN A; 3BDL A; 4C8Q F; 1YIT A; 2E5K A; 2ZPI B; 1W1F A; 4C8Q D; 2I0N A; 1QVG A; 1UFF A; 5GAN e; 1YHQ T; 4XK8 E; 3MKD A; 2EQI A; 2I2L A; 1YJ9 T; 1NZ9 A; 4LD9 K; 1W6X A; 1QMC A; 4HT9 A; 1QP2 A; 4QW2 A; 1M8V A; 3JCM c; 2EYQ A; 4LUE A; 3QZ9 B; 1JXO A; 4LDV A; 5CR2 A; 1FMW A; 3OSV A; 3IQL A; 4JDS A; 4JS5 A; 1K1Z A; 2DMO A; 1RUW A; 4PJO C; 4QQD A; 1VQL Q; 4EIK A; 1K4U S; 1X75 C; 2PU9 B; 2W10 A; 1VQP Q; 1OPL A; 1VOM A; 3CCL A; 4PFZ A; 2V1R A; 3JB9 J; 1M4Z A; 3ZBD A; 1QKX A; 3G71 Q; 4QKU A; 2J06 A; 3MEW A; 3CD6 Q; 1YJ9 A; 1OV3 A; 2CUB A; 1JJ2 P; 2RB6 A; 2DZC A; 4D6W A; 4PNO A; 3RUX A; 2L3Q A; 4XU1 A; 1OQK A; 4R0K A; 3QJY A; 3TCJ A; 1VQ5 T; 1FXX A; 2X3X D; 2RN8 A; 3M53 A; 1NG2 A; 2RHU A; 5GMK l; 3ZEH A; 4PJO E; 3FIF A; 3ER0 A; 1Y7X A; 4JJC A; 4PK4 A; 1PM3 A; 1SF9 A; 4C8Q A; 3I56 Q; 4JRP A; 2JZ2 A; 2EYX A; 1M3A A; 4RTZ A; 2K9G A; 1B34 B; 2VGN A; 3WVD B; 2LDM A; 4M75 G; 2KRM A; 4HKE A; 1JEG A; 1YJW T; 2RQV A; 4RCC A; 5GAN f; 4QVC A; 2JS0 A; 3VJP A; 1WHG A; 5GAM h; 4WCI A; 1ZLM A; 2O4X B; 1K73 R; 1VQM T; 1ZSG A; 3VS1 A; 2GCX A; 4N4H A; 1YBY A; 3PNW C; 3I9Q A; 2DL4 A; 3JCM V; 1MUZ A; 4HXJ A; 2QXF A; 4R56 A; 4J9H A; 5HY6 A; 3CCM T; 2LZ6 B; 2E65 A; 1WI7 A; 2HL3 A; 5KE3 A; 1TTH B; 2HKN A; 1TUC A; 1WGS A; 2JM9 A; 3H0I A; 4M78 F; 2PUK B; 4CC4 B; 1VQM A; 2DJZ A; 4J5Y A; 4M78 D; 4DBQ A; 1QP3 A; 4O5V A; 3BW1 A; 4BDZ A; 2J6F A; 2L2P A; 1Q81 U; 2PVG B; 3THK A; 4J9B A; 4C92 B; 2BE9 B; 1YIJ Q; 1WPY A; 2LQ8 A; 2KRN A; 1OU9 A; 3E1S A; 4AFU C; 2GTJ A; 5LJ5 h; 2FO0 A; 2EQK A; 3OYY A; 3CBO A; 3CCM A; 4RTU A; 1BB9 A; 3JCM g; 1CSK A; 2PZ1 A; 2RH2 A; 3H0H A; 2M02 A; 2K3X A; 1VQK T; 2EQJ A; 4ZGJ B; 2D0Q B; 1YI2 Q; 1X6B A; 1ZA1 B; 2RHX A; 3UWN A; 3RKW A; 2QA4 A; 4PJN A; 4E7J A; 2QQA A; 3EHR A; 5GAN h; 1VQ6 T; 1S1N A; 2XU8 A; 4X1V A; 3M56 A; 1W4S A; 2EQU A; 3OS5 A; 4XTV A; 2OTL Q; 1Q7Y C; 1VQN Q; 3QPH A; 1RL2 A; 2JTF A; 2L0A A; 2EYW A; 5GAO n; 1VQK A; 1OI1 A; 1NLP C; 3OYK A; 3ULR B; 2CT3 A; 3BFM A; 5I22 A; 5FRM A; 4BY6 C; 2DAQ A; 1YIT Q; 5LJ5 j; 4DBF A; 4IIO A; 1EFN A; 1M8M A; 2E10 A; 1VQ6 A; 5GMK m; 2SEM A; 1NJI U; 5D6Y A; 4NOY A; 4M78 A; 1N9R A; 2KBT A; 1K76 A; 1K73 U; 1F1B B; 3CC4 T; 3EGX B; 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2FB7 A; 1VQP T; 4N4G A; 2LTO A; 4RG2 A; 1KJW A; 1M90 R; 5CKB A; 3CCE A; 1UG1 A; 3P8D A; 3L42 A; 4L59 A; 2KGT A; 1BCM A; 1SHG A; 2CT4 A; 5FRO A; 2K5L A; 1VQM Q; 1K8A C; 4X9C A; 3G6E A; 1I07 A; 3L2W A; 2A3L A; 4QVZ A; 4E7K A; 1RAG B; 2LQN A; 1AT1 B; 4FT4 A; 4M7A A; 4N0A A; 2R58 A; 4F7U A; 1WQ7 A; 3C94 A; 2DFU A; 4KH1 B; 3CCM Q; 2JMC A; 2JJ9 A; 2QQ9 A; 1VQ9 T; 4M7D C; 2EJ9 A; 2RQU A; 3X25 B; 2LCS A; 1O9S A; 2YLC A; 2DBM A; 2LQW A; 1T3L A; 3I35 A; 2BUD A; 3TEE A; 2ED0 A; 2QA4 Q; 2YXY A; 3OS1 A; 1G8X A; 4AFZ C; 1KD1 U; 1OEB A; 1D09 B; 1X2Q A; 1FYN A; 1ZBX A; 5EC7 A; 3OYB A; 5GAO l; 3OYG A; 1SHF A; 2VV5 A; 5KCO A; 1JU5 C; 2DL5 A; 2IIM A; 2KRO A; 4OMM A; 2KXC A; 1MND A; 4JJD A; 4HA8 A; 1VQK Q; 5GAM g; 2HL5 C; 1ZSZ A; 2PNI A; 2PTK A; 1Q86 R; 3HFO A; 1OX8 A; 1PWT A; 4M7D E; 2DIL A; 1VIF A; 4C8Q B; 1TG0 A; 2DPP B; 1VQ6 Q; 1H3Z A; 3QWX X; 2LCC A; 2AZS A; 4LN2 A; 2LVM A; 2NUT A; 2MAM A; 2Y4X A; 3TVT A; 1CKA A; 1ACM B; 2DEU A; 1BU1 A; 1RAA B; 2LRQ A; 4JRI A; 3G4S A; 2XK0 A; 4AFS C; 1S72 A; 3I5S A; 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