The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVGDRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
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| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47G
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFU C; 3C0C A; 4AFS C; 1NG2 A; 1ZLM A; 2J05 A; 1HJD A; 1QCF A; 1WXT A; 4D8K A; 1J3T A; 3UAT A; 1W70 A; 1TG0 A; 2KXD A; 3M0S A; 4AG1 C; 3PVL A; 3QWY A; 2O31 A; 1JEG A; 2HEQ A; 1PWT A; 5I22 A; 1H92 A; 2IIM A; 1CSK A; 1YWP A; 2FPE A; 4RTY A; 2FRY A; 1X43 A; 2JMC A; 1X27 A; 3TVT A; 1EFN A; 2LQW A; 2VVK A; 2KXC A; 1QKX A; 2DE0 X; 2K6D A; 2ENM A; 3M0T A; 3EHR A; 3M0R A; 1GFD A; 2DRM A; 2KYM A; 4J9G A; 1TUC A; 2V1R A; 3IQL A; 4K11 A; 1W6X A; 1SEM A; 1JU5 C; 4ORZ A; 1X2K A; 1JO8 A; 2M0Y A; 4HXJ A; 3JV3 A; 1SRL A; 1ABQ A; 2GNC A; 2KT1 A; 2I0N A; 2G6F X; 2BZX A; 1GCP A; 1I0C A; 2MIO A; 4LN2 A; 4RTZ A; 1NLO C; 1WYX A; 1H3H A; 4OMP A; 1M3B A; 3RBB B; 2EQI A; 2ROL A; 2SEM A; 1WLP B; 1GCQ C; 5GJW B; 2K3B A; 1B3Q A; 2J7I A; 1QLY A; 1UE9 A; 1HD3 A; 2DL7 A; 3EG3 A; 2JM8 A; 4J9H A; 1PKT A; 2FRW A; 1RI9 A; 2E5K A; 2HBW A; 3VS3 A; 1KFZ A; 4RTU A; 4J9D A; 1UUE A; 4HVW A; 2YUP A; 2AZV A; 5IXB A; 1WDX A; 3VS5 A; 3SEM A; 1E7O A; 2MOX A; 2JM9 A; 1CKB A; 1LCK A; 1ZBJ A; 2J6F A; 4JZ3 A; 4J9E A; 5ECA A; 2L0A A; 2ROT A; 2A37 A; 1YCS B; 2KBT A; 2KR3 A; 3SHW A; 3TSZ A; 4E6R A; 1V1C A; 2FPD A; 2DIL A; 2J6K A; 1AWW A; 1YWO A; 4FSS A; 1UTI A; 5IHK A; 1SPK A; 2DM1 A; 2RF0 A; 2ED0 A; 1JXM A; 2EPD A; 3REB B; 1X6B A; 4JJB A; 2CSI A; 2KRN A; 2YUQ A; 2EYW A; 1X69 A; 1K0S A; 4RTV A; 4JJD A; 2C0T A; 2DL3 A; 4J9C A; 1GL5 A; 2DNU A; 4HVV A; 3O5Z A; 1OV3 A; 1SHF A; 2X3W D; 2L3S A; 4QT7 A; 2L2P A; 4WCI A; 2GQI A; 2KE9 A; 1GBQ A; 1ZUK A; 4AFQ C; 3UA6 A; 2QDL A; 3M0Q A; 2SRC A; 2EYX A; 2F2W A; 1BK2 A; 5IHI A; 2AK5 A; 3I5S A; 1ABO A; 3EHQ A; 2LJ0 A; 1GBR A; 2JW4 A; 1UG1 A; 4JZ4 A; 3VS1 A; 3ZL7 C; 1GFC A; 3I5R A; 4Z8A A; 1VA7 A; 3I9Q A; 2ECZ A; 4J9F A; 2C0O A; 1Z9Q A; 1BBZ A; 4RTW A; 2A08 A; 2K79 A; 4RTX A; 3EG0 A; 3UA7 A; 1UJY A; 2A28 A; 3GBQ A; 1BU1 A; 4ESR A; 2VWF A; 3I35 A; 1OOT A; 5IXF A; 4GBQ A; 2ED1 A; 2OAW A; 2BZY A; 1YNZ A; 1VYT A; 2LJ3 A; 3THK A; 1UDL A; 4JPB W; 1UEC A; 1AZG B; 1Y57 A; 3TSW A; 1PRM C; 1PNJ A; 2YDL A; 1K1Z A; 1UHC A; 1I1J A; 3VRY A; 4OMO A; 2GGR A; 1KIK A; 3PE0 A; 4CC4 B; 2O9V A; 4JJC A; 1WI7 A; 2F2X A; 3NPF A; 4OMQ A; 2KYB A; 4M4Z A; 1YN8 A; 1M30 A; 1NEG A; 2PZ1 A; 2FEI A; 4AG2 C; 4LUD A; 3FJ5 A; 5I11 A; 5HCK A; 1K4U S; 1NYF A; 4F17 A; 1AZE A; 1PHT A; 1VYU A; 2D8J A; 1AWJ A; 1WIE A; 2CT3 A; 2X3X D; 1H8K A; 5IH2 A; 1T3S A; 2K7A A; 1KSW A; 2MCN A; 1K9A A; 1TUD A; 3ULR B; 3UF4 A; 2EGC A; 2GTJ A; 2NUZ A; 2AKL A; 2DYB A; 2DVJ A; 2JMA A; 1FYN A; 1NYG A; 1CKA A; 1T0J A; 2RQT A; 2DBK A; 2LQN A; 2HDA A; 2YUN A; 2CH4 A; 1U06 A; 1E6G A; 1K76 A; 3VS0 A; 2KRM A; 5L23 A; 1BB9 A; 4Y92 A; 3VS4 A; 2D8H A; 4F16 A; 2FO0 A; 2EVR A; 2AZS A; 2LNH B; 2OJ2 A; 1SHG A; 4ZNX A; 1GRI A; 4DEY A; 2LJ1 A; 2RMO A; 1ZUU A; 3PVQ A; 2L3P A; 3M0U A; 3U23 A; 4GLM A; 1SSH A; 2OI3 A; 2LMJ A; 1U3O A; 3NHN A; 1PRL C; 2A36 A; 1WXU A; 1T3L A; 1WA7 A; 2RQW A; 2RQV A; 4HCK A; 3NMZ C; 4J9I A; 2JS2 A; 1QWE A; 1W1F A; 2M51 A; 2ABL A; 2KGT A; 2DF6 A; 1OPL A; 3NGP A; 1FMK A; 2YSQ A; 4CC3 A; 3QWX X; 2O88 A; 1N5Z A; 4D8D A; 2J06 A; 1AWO A; 3LH5 A; 2CRE A; 1X2Q A; 1ZSG A; 2CSQ A; 2RQU A; 1AVZ C; 2DL5 A; 1G2B A; 2O2O A; 2EGE A; 1ZUY A; 4J9B A; 1RLP C; 3VS2 A; 1SRM A; 1G83 A; 5IHN A; 1WXB A; 2BTT A; 5EC7 A; 4OML A; 1AWX A; 2CUB A; 2D0N A; 1AD5 A; 2RN8 A; 1WX6 A; 2DL4 A; 1K0X A; 5FWC A; 1VYV A; 4LE9 A; 4OMM A; 5GJV B; 4IIO A; 2EKH A; 3KFV A; 4CC2 A; 4Z88 A; 1MUZ A; 5FW9 A; 4X1V A; 1MV0 B; 1T0H A; 3REA B; 1I07 A; 2EYZ A; 4F14 A; 1YP5 A; 2ESW A; 1XOV A; 3H0I A; 2BZ8 A; 2KT8 A; 2C0I A; 2W10 A; 3EGU A; 2LX7 A; 1M8M A; 1RLQ C; 2EYY A; 2RPN A; 4AFZ C; 2LZ6 B; 4RUG A; 2DL8 A; 2H8H A; 2XMF A; 2F2V A; 2RNA A; 4HVU A; 3VRZ A; 2FPF A; 2NWM A; 2JT4 A; 2LCS A; 2DBM A; 2EGA A; 4DEX A; 1ZX6 A; 2RQR A; 2V1Q A; 2DLP A; 3EG1 A; 1JQQ A; 2J6O A; 3M0P A; 3H41 A; 2KRO A; 1QWF A; 1AOJ A; 2YUO A; 1WFW A; 2VKN A; 3R6N A; 1UHF A; 4Z89 A; 2JS0 A; 2PNI A; 3EG2 A; 4IIM A; 1GCQ A; 1QKW A; 1Y0M A; 2CDT A; 2HCK A; 2KRS A; 1A0N B; 2D1X A; 2JTE A; 2LP5 A; 2KNB B; 1UGV A; 1PKS A; 2CUD A; 3A98 A; 1NEB A; 2PTK A; 2O9S A; 1M27 C; 4RTT A; 1ARK A; 2P4R A; 1M3C A; 2CH4 W; 1UFF A; 1Z9Z A; 2CT4 A; 1AEY A; 2W0Z A; 2L3Q A; 1HSQ A; 3VS6 A; 4KRT A; 1OEB A; 1MV3 A; 2DJQ A; 1X6G A; 2K2M A; 2FG0 A; 1KJW A; 5FWB A; 3H0H A; 2GBQ A; 2B86 A; 4EIK A; 1B07 A; 2DX1 A; 2HSP A; 2YT6 A; 2DRK A; 1RUW A; 1E6H A; 1NLP C; 4CC7 A; 2JXB A; 3CQT A; 3RNJ A; 2DMO A; 2EBP A; 1IO6 A; 2K9G A; 3H0F A; 4OMN A; 4LNP A; 1JXO A; 1S1N A; 1OPK A; 1UJ0 A; 1U5S A; 2DA9 A; 2GTO A; 1M3A A; 2KEA A; 4LUE A; 2AKK A; 4R0K A; 3VS7 A; 4A63 B; 2EW3 A; 1NM7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BCO A; 4AFU C; 3C0C A; 1ZLM A; 1HJD A; 1WXT A; 5LL6 S; 2M1H A; 3UAT A; 2OTJ Q; 1TG0 A; 5D6Y A; 3OYG A; 1U1T A; 4AG1 C; 1KC8 R; 1VIF A; 1JEG A; 5KYX B; 4PK4 A; 1H92 A; 2IIM A; 1CSK A; 1QVF A; 1VUB A; 2K3X A; 4RTY A; 4QKU A; 5KYY B; 2DPP B; 3TRE A; 1BI3 A; 2JMC A; 4M78 C; 2FB7 A; 2P0Q A; 2KXC A; 3BDL A; 1JJ2 A; 3CCU Q; 1ZQ1 A; 1PD1 A; 1VQ7 A; 2EKO A; 5GMK e; 2QQB A; 4MML A; 4GY5 A; 3LYI A; 1TUC A; 1KC8 U; 1QCN A; 2RB6 A; 4BD3 A; 1X2K A; 4M7D G; 1IGU A; 3NTH A; 4JRK A; 4FYY B; 5CKH A; 1IRX A; 4RMO A; 2BZX A; 1GCP A; 2EYQ A; 4M77 E; 4JUV A; 1OX9 A; 2RJC A; 2MIO A; 4LDY A; 2GQV A; 1Q95 G; 1Q86 C; 5GAN 6; 4M75 E; 4OMP A; 3RBB B; 1GXI E; 1HYO A; 1KQ2 A; 3JCM P; 1YIJ Q; 5GJW B; 1RAG B; 4VUB A; 5GAO l; 3TCJ A; 1YHQ A; 2ZPI B; 2DZ9 A; 5LJ3 j; 2J7I A; 1HD3 A; 1I5O B; 2VYT A; 2EQM A; 1KQ1 A; 1VQ8 Q; 3M56 A; 1VQP Q; 1K9M U; 1PKT A; 4EMH A; 3JCM h; 3S3N A; 2E5K A; 2NUT B; 1OQK A; 5L8R E; 1EZZ B; 2PVO B; 1SF9 A; 4HVW A; 2HMA A; 2E1H A; 3DB4 A; 2LQ8 A; 3VS5 A; 4LD9 K; 1CKB A; 2CP0 A; 2QEX T; 1V29 B; 1IXD A; 2YRV A; 4J5Y A; 4C8Q D; 5ECA A; 3EGD A; 2L0A A; 2ROT A; 5GAN 5; 1VQ9 T; 5KYU B; 4C92 E; 2KBT A; 1K8A C; 3PGG A; 3RR6 A; 5LJ5 d; 4ZGE B; 2J6K A; 4FSS A; 1WHM A; 5GAM d; 4PJO A; 1TXQ A; 2COY A; 4ANJ A; 1FX7 A; 1ZSZ A; 4PFP A; 2EYW A; 4RTV A; 4JJD A; 2EQJ A; 1IRE B; 2LVM A; 4J9C A; 3OQ5 A; 2DNU A; 4M77 G; 4HVV A; 4IUT A; 2X3W D; 2EJF A; 2L3S A; 4QT7 A; 4RG8 A; 1TWB A; 3DLL A; 2ZPF B; 3RKY A; 4M75 G; 1SKU B; 4AFQ C; 3UA6 A; 3CME A; 4A4E A; 2F2W A; 4FU6 A; 3ZFJ A; 3CD6 T; 2LCC A; 1ABO A; 3KBG A; 3CCR T; 4JZ4 A; 1VQ6 A; 4R55 A; 3VS1 A; 2VGN A; 1G8X A; 3QUI A; 4N4H A; 3UT1 A; 3I5R A; 5D6X A; 4KUI A; 2OTL T; 4XAX B; 4HCB A; 2ECZ A; 4J9F A; 5M9O A; 1C0M A; 1N8R R; 2DTI A; 3EG0 A; 2ZGW A; 4QQG A; 1S72 A; 2VWF A; 2ZCF B; 5FRN A; 2OAW A; 3ER0 A; 2BZY A; 3JB9 H; 3TQ7 P; 2EQK A; 5FRO A; 3J7A F; 4BY6 C; 3LH0 A; 3THK A; 4C92 G; 1M5Q 1; 1UEC A; 3A5Z B; 1PRM C; 4JRQ A; 3GIB A; 2DTH A; 2X35 A; 3GF5 A; 3VRY A; 1WHL A; 3MEW A; 2RD1 A; 3QXE B; 5AYF A; 2PQW A; 1VQN Q; 3CCQ Q; 1KIK A; 4KUD K; 4LDW A; 4CC4 B; 2O9V A; 1G3S A; 1QCO A; 5J3B A; 2F2X A; 5DLO A; 2ATC B; 4OMQ A; 2KYB A; 1BIB A; 1W4S A; 1M30 A; 3T9N A; 3JCM f; 3CXC S; 5HCK A; 4LD6 A; 1YCY A; 1AZE A; 1F1B B; 1PHT A; 3CCV T; 1TUG B; 3CC2 A; 4JS4 A; 3H6Z A; 3NFC A; 8AT1 B; 1H8K A; 1PC0 A; 2AT1 B; 2K7A A; 2MCN A; 3ZBD A; 4KUL A; 3M57 A; 3PIO A; 3MHX A; 3VYG A; 3UF4 A; 2EGC A; 2DYB A; 2EJ9 A; 3S6W A; 2Z0W A; 2R5A A; 4EPC A; 1CKA A; 4XTZ A; 1VQ5 Q; 3MCA B; 1WHH A; 1E6G A; 4MZT A; 5GMK i; 1C6V X; 4PFO A; 1D1C A; 5L23 A; 3FEO A; 3A8L B; 1WHK A; 3M9Q A; 2JUF A; 1YJW Q; 4C5H A; 4F7U A; 2LNH B; 4M7D D; 3PFS A; 1M90 R; 2DIG A; 2LJ1 A; 2RMO A; 1TOV A; 5KYX A; 5DM7 R; 3OYE A; 3ZEH A; 2Y90 A; 2A7Y A; 2RQW A; 2RQV A; 2RH2 A; 4HCK A; 5I2M A; 4FW1 A; 1W1F A; 3UDC A; 1BI2 A; 2HD0 A; 2VUB A; 1PM3 A; 2R5M A; 2DF6 A; 4GLK A; 1VQL A; 3NGP A; 3C12 A; 3G6E Q; 5C6S A; 4D8D A; 1AWO A; 2HBP A; 1ZSG A; 2PUK B; 1HK9 A; 2CSQ A; 2RQU A; 5HY6 A; 1AVZ C; 2DL5 A; 2O2O A; 2QG9 B; 2KDS A; 4A53 A; 5GAM f; 3C94 A; 2H3J A; 5IHN A; 1WXB A; 5EC7 A; 4L5G A; 2CUB A; 2D0N A; 5A0L A; 4E2F B; 3CMA A; 4M7A B; 2RN8 A; 3CC4 Q; 1K0X A; 2RK2 A; 2CZ7 B; 4OMM A; 4KGX B; 1QVG P; 5FW9 A; 4FM4 B; 1T0H A; 1YP5 A; 1YJN Q; 3VV0 A; 1KQS S; 3H0I A; 3PMT A; 3EFR A; 4M78 F; 1BI0 A; 1RLQ C; 2CP3 A; 1IB8 A; 1LJO A; 1VQO T; 3CXC P; 2LZ6 B; 4M77 D; 4KGV B; 3JRZ A; 3RUX A; 2YHT A; 2NYS A; 3VRZ A; 2FPF A; 2NWM A; 2JT4 A; 4M75 D; 2RQR A; 1I81 A; 4ZTJ A; 3EG1 A; 2J6O A; 1B34 B; 3GNF B; 3MJX A; 3TU4 K; 3G71 T; 3FIF A; 2D1X A; 1N9R A; 3JB9 I; 3Q1J A; 5GAN 7; 2QEX A; 1M2V B; 3C95 A; 4HT8 A; 4PJO C; 2KNB B; 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2QDY B; 3LX7 A; 2L3R A; 6AT1 B; 2SEM A; 2FZK B; 4J6W A; 2XID A; 4FYV B; 3VYH B; 4IUR A; 3CC2 T; 2M02 A; 3OYH A; 1B3Q A; 4N4I A; 2DIQ A; 2CZ1 B; 3WVD B; 4C5E A; 2JVV A; 2JZ2 A; 1XNI A; 4RTU A; 3I55 A; 2BKD N; 1KC8 C; 2YLC A; 4A4H A; 3CC7 Q; 3CCS A; 2VV5 A; 5GAN e; 1LCK A; 2J6F A; 2YLB A; 4D6W A; 4J9E A; 1QVF P; 1G3Y A; 4OB3 B; 2D6F A; 1VQM Q; 3JCM c; 1MMA A; 5KCH A; 2XD0 A; 2X4W A; 3SHW A; 4E6R A; 2MYS A; 3PTA A; 2MF2 A; 1RAB B; 2RJF A; 1AWW A; 4BDZ A; 5IHK A; 3OS0 A; 1KQS A; 2DM1 A; 2LNV A; 3M5A A; 1H64 1; 1QW1 A; 2JN0 A; 1YJ9 Q; 2G3R A; 1BCM A; 2YUQ A; 1K9M C; 2OX7 A; 1GL5 A; 3EG9 B; 2PVG B; 1QMC A; 1OV3 A; 1SHF A; 2RHY A; 4RCB A; 4RKU E; 4WCI A; 2GQI A; 1GBQ A; 1ZUK A; 3M0Q A; 2SRC A; 1VQL T; 2DAQ A; 4M7D A; 3P8D A; 2P84 A; 2LJ0 A; 2QQ9 A; 2IG0 A; 2XDB A; 3SFM A; 1UG1 A; 3JCM d; 4L6V 5; 1GFC A; 4QVZ A; 1VA7 A; 3I9Q A; 2OTJ T; 4DA4 A; 1WJQ A; 1B7T A; 1RAI B; 4HA8 A; 1NPR A; 3E2U A; 2FL7 A; 4BE0 A; 2K4Y A; 2DD4 A; 2A28 A; 1BU1 A; 3CMA T; 4GBQ A; 4V2S A; 2F69 A; 4J6X A; 1OX8 A; 2LJ3 A; 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