1B6CB

Crystal structure of the cytoplasmic domain of the type i tgf-beta receptor in complex with fkbp12
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the cytoplasmic domain of the type I TGF beta receptor in complex with FKBP12.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FK506-BINDING PROTEIN
molecule tags Complex (isomerase/protein kinase)
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 1999-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
B PF08515 TGF_beta_GS Transforming growth factor beta type I GS-motif
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1b6cB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1b6cB01
2GPHA 2GQGA 4AFJA 4KRDA 3NIEA 3A7IA 5CI6A 1GZOA 2BKZA 3KF7A 2R3OA 3LFFA 2I40A 3SG9A 1IR3A 4K18A 4DC2A 5C8MA 4RIYB 1Q41A 3C0GA 4YTCA 2PVJA 1IA9A 2SRCA 4X3JA 3UOJA 4M68A 5JH6A 4PL4A 3TKHA 2RKUA 3ZC6A 2DS1A 3NYOA 2PMOX 3PRIA 3Q53A 4PP9A 3FLWA 4F1TA 3I4BA 4NWMA 5DWRA 5F9EA 4DG3E 4MBLA 1K2PA 3V3VA 2YDIA 2UZDA 2X8IA 5HX8A 5J9LA 3QD0A 2XKCA 1WBVA 3HV3A 5HBHA 2DWBA 3H30A 3DB8A 4GFGA 2I0YA 3PPKA 2ITNA 2PE2A 3ZOSA 4W4VA 3TDWA 3QQKA 4QD6A 4FL2A 3P1AA 2WPAA 2W1IA 5AP0A 4N70A 4F7LA 3VHKA 4YHFA 5C01A 3GCPA 4PPCA 3EL7A 4GYGA 4O0SA 4QOXA 3FYKX 2UZOA 1XO2B 3KRLA 3SLSA 1H08A 5CEOA 4EOJA 3DAJA 4FKQA 4PUZA 3OG7A 4TN6A 4EK6A 4I0SA 2CHLA 4QP8A 3FYJX 4XG3A 5LMKC 3BKBA 5LXMA 2R3QA 3L9LA 3DK7A 2QOOA 4O0TA 4R1YA 5BVDA 3MVLA 3R8VA 3U8WA 3DPKA 5AR3A 4J1RA 2CKQA 4APPA 3FI3A 4S31A 1ZOHA 2GS2A 3KK8A 5BVEA 2JFLA 3ODZX 1H4LA 1V1KA 3ZFYA 4ANLA 3RBWA 1YWRA 1YXSA 3QD4A 2NRUA 2BDJA 4RQVA 3W2CA 2BIYA 3ZEPA 3D83A 1SNUA 2XUUA 4F0GA 3NIZA 1XBBA 2R3NA 3H10A 4FTTA 4CFXA 5J7HA 1A48A 2HY0A 3OC1A 4OBPA 1STCE 4C4GA 3NCZA 3KY2A 3BPRA 4TWNA 5F94A 3R8MA 4BDIA 4BDCA 1PMEA 1ZARA 3QFVA 4LMNA 3A8XA 4YURA 4RIOA 3TDVA 2RFDA 1OKZA 4TRLA 1M2QA 4EK3A 2XNEA 4OTHA 3V5WA 3IO7A 4RRVA 4BI0A 3MY1A 5JQ8A 3U6IA 3HRCA 5HTBA 5IQDA 5AV4A 1YI6A 3DXQA 2W05A 4W8DA 3BGQA 5M08A 2VWXA 5GZ9A 4IXPA 3UPXA 3U4WA 2ITWA 3N9XA 1PKDA 2XRUA 3H0ZA 3C50A 3NX8A 4FKJA 3VO3A 1GY3A 3E7VA 3OBGA 4F7JA 4E3CA 3Q9YA 4FEVA 1OIQA 4IDTA 1ZZ2A 4BI2A 5L8LA 4ZXTA 1OL2A 3LFCA 2A0CX 2WMBA 1J91A 3OVVA 4CCUA 4D1ZA 4FIJA 4ERKA 3NNWA 2VWIA 4E20A 4E4NA 5HO7A 5IUGA 4JIAA 5EH0A 3PYYA 2GFSA 4LL0A 4E6AA 4KAOA 2VNWA 4O82A 3CS9A 2VRXA 4FT3A 4YU2A 5BVOA 4L6QA 1T45A 5FM3A 2CMWA 1MP8A 2A19B 3PXKA 3S3IA 3O0GA 2R3KA 2R9SA 3BYVA 4BDHA 3M2WA 5HO6A 3ALOA 3P0MA 3TUBA 4D28A 3CC6A 4R78A 4FV5A 4D9UA 3OUKA 5C9CA 4I92A 1H24A 2C6IA 3P5KA 4G3EA 3UNJA 4ACHA 5L6PA 1ZYJA 2C47A 3DFAA 3CQWA 4IDVA 4KIKB 5DN3A 1BYGA 4J7BA 4YJPA 4YC8A 5EDQA 5E8SA 5HNIX 4R77A 3UO5A 5M56A 1ATPE 2J0MB 2PSQA 2QLUA 1H0WA 4AT3A 2Z7SA 3AC3A 3HRFA 3ATTA 2WTWA 5KNJA 5E8XA 3MW1A 2C3LA 5JRSA 1W7HA 3R1NA 3ET7A 1H01A 3R2YA 3VQUA 4EOSA 5DT4A 5LMAA 4HYIA 3MIYA 5LMKA 1YXUA 2QI8A 4L53A 5LCKA 4FSQA 4OGRA 3UZRA 3K3JA 3QYZA 2X6EA 1CKIA 2FSOX 3D2IA 5IQHA 4XRLA 3UDBA 4DEEA 5IUIA 5EKNA 2JDOA 2H96A 4IBMA 4IHPA 4JS8A 4M97A 4B7TA 3DZOA 1KWPA 3ORPA 3F5UA 4ZTSA 1SVHA 3TCPA 2W5BA 3EN6A 3GCSA 3CSVA 3L8SA 2PVRA 3DQXA 5KX8A 3V51A 3GU7A 3RAKA 3IECA 4Q9SA 1VR2A 3KXZA 4RSSA 4QNAA 5EM6A 3FKLA 4DE4A 2ITOA 4QQTA 4ZZMA 3QRJA 3B8QA 3TZ8A 3COHA 4EL9A 3AG9A 3JPVA 4L46A 4ORKA 4IZYA 4C36A 4C8BA 4FKPA 4ZMFA 2BAQA 5AWMA 5M55A 5K5XA 4IWPA 2H8HA 4LV5A 2IZUA 5HCZA 1VJYA 2F2UA 3EN7A 4G5PA 3AGMA 3I1AA 3GB2A 4TNBA 4EH9A 5TF9A 2F7EE 3KMWA 2XK4A 2GHLA 3CY3A 3PSDA 5AR4A 4DH7A 2YAAA 4K0YA 2CN8A 5DHJA 5IA1A 4MNEA 4AQCA 4ZAUA 3EQCA 4BTFA 4DEHA 3HMMA 3IONA 1OPJA 2J4ZA 4Y8DA 4Y5QA 1WBWA 2R64A 3MH1A 3EMGA 3E8CA 3LVPA 4CV8A 5HVKA 3MFSA 4AF3A 5D7VA 4I5HA 4RVLA 3Q9WA 3OT3A 3KXMA 4G3DA 3PXFA 3ORIA 3FBVA 4ACCA 3UODA 4ZS4A 3LM5A 5A6OA 4BGGA 4IC8A 5L6WL 3OZ6A 3UQFA 2WXVA 4GV1A 4TT7A 3Q6WA 4EORA 3QCXA 3S00A 3NAXA 2PVHA 2VX0A 2QOFA 3HDNA 3IGOA 2VWVA 4ZP5A 4R8QA 4RVKA 4BDKA 3G90X 5KZIA 2C3IB 1XH9A 4I94A 4XBUA 4PMSA 3VRZA 4XS2A 4G6OA 4LRMA 5IF1A 3FI8A 3H9OA 3BHUA 4BWXA 3GCVA 3L9MA 3EN5A 3W16A 3E5AA 1RW8A 3C4FA 1OPLA 3NUYA 3V6RA 3NDMA 4CV9A 4FOBA 3ZRMA 1NA7A 1WVXA 3BU5A 3GC9A 5HEZA 3R8UA 4NW6A 4BTMA 3G6GA 4IM3A 1J1CA 4WBBB 3W2SA 2R3MA 5CT0A 2PYWA 2DYLA 3FY0A 3H9RA 5E91A 3DZQA 4LUEA 4OLIA 5IDNA 4WRSA 2XIZA 1Y8GA 3PIYA 5F95A 3F2NA 1JWHA 1ND4A 4L44A 4K33A 2YN8A 2QURA 4AUAA 4FNYA 2J7TA 2HZIA 2R0UA 3BRBA 1LPUA 5E8VA 3FMMA 3K5UA 1PYEA 2VUWA 3EKNA 1P2AA 3EQHA 3FMJA 3SC1A 4BCNA 2YHVA 3FV8A 4GK4A 4B9DA 4CG8A 3FXZA 4K11A 4O0YA 5CVHA 3OD6X 1PJKA 3QC4A 4FV4A 5IZFA 4YMJA 2JBOA 4C02A 3T8OA 5L2SA 3JXWA 3ZC5A 5IA3A 5K3YA 1Q4LA 2A4LA 2W1CA 4P7EA 4Y46A 1ZYDA 5CU4A 3UGCA 2JDTA 5CENA 4AN3A 3DBCA 4IZ7A 3Q5ZA 2PZYA 3PA4A 4NFMA 4PL3A 1FVVA 2WIHA 4FKSA 5HD7A 5FXRA 5ACBC 4NIFB 5AADA 2BTSA 3P86A 5FTGA 4HYSA 5CQUA 4PRJA 3OOGA 4WUNA 4JG8A 4MXXA 3NW7A 4CEGA 5HLPA 2BILB 4CTCA 3I6WA 4GCJA 4PTEA 5IQIA 4JX7A 3PXZA 4FKVA 2AC5A 2Q0NA 3F3WA 5AR8A 4AA5A 3PFQA 4ANNA 4MX9A 4X2GA 3LXPA 3UIXA 3FEGA 3FC2A 3KF4A 4R7HA 4MD9E 1JVPP 4FUYA 1OUKA 4I6HA 5D11A 2ZM3A 3QQHA 3ZSIA 5J1VA 4C3RA 4OAVB 3HRBA 3MFRA 4ZMEA 4X3FC 1PY5A 4GEOA 5I9WA 3R9OA 3ZBXA 2JKOA 4USEA 1Q3DA 1OPKA 2I0VA 5EHYA 5IEXA 4O96A 3MY5A 4O81A 4O7RA 3POOA 2BHHA 3ERKA 5ITAA 3AT2A 4DEAA 2XB7A 4QYEA 3QZHA 5K0KA 3DDPA 4R5YA 3FMKA 1XH4A 4GU9A 2UW8A 2C6EA 5G1XA 1Q99A 4O0RA 4RMZA 4MWIA 3A7HA 2VTSA 3WE4A 4WSYA 2PVLA 2YM8A 1UV5A 3SXFA 2C5VA 3KKVA 3KULB 4P5ZA 4LUDA 5G6VA 3R9HA 5EHOA 3Q96A 2E9NA 4WD5A 5IQEA 1DS5A 1NT2A 1JLUE 3L8VA 4IANA 4D4VA 2WTIA 5EOBA 2NPQA 4C3FA 3DLZA 1FGKA 2XIRA 3VW6A 5CI7A 3BLHA 4MKCA 3NNUA 1ZAOA 4FSTA 3EZVA 5I3OA 4EEVA 2UW5A 1W83A 3DJ6A 4KKEA 3HKOA 3OCGA 1MRUA 1Q8UA 2WIPA 3UZTA 4D9TA 2VTNA 2W1FA 5F1ZA 4ZZOA 3EQFA 4QP2A 3BELA 4L9IA 2QHNA 2VTRA 3KCKA 5I3RA 3HNGA 5L2IA 2JKKA 1REKA 4G34A 2REIA 3ZFXA 5HTCA 2PVYA 4GRBA 5HGIA 3UNKA 5B7VA 4ASEA 4EHEA 2PUPA 1BL7A 2BCJA 5DOSA 4YJRA 5CS6A 3HP5A 4R3RA 1ERKA 1U54A 2BZKB 2QU6A 3ORTA 2JGZA 2GS6A 4ALUA 4FSRA 3MH2A 2C1BA 3R7YA 3OCTA 3EFJA 3LFQA 2W96B 4D1XA 4I4FA 3R04A 4NM5A 4LI5A 4AW1A 4CQGA 2HY81 5BYYA 3QRUA 4BCQA 4NM7A 3VJOA 4HVSA 3AC4A 2ITUA 5L8JA 3TXOA 5KUPA 5KMKA 2LAVA 5FLFA 3HMIA 4XBRA 1H1PA 1Y91A 3PZHA 4HJOA 1URCA 2C1AA 4F0IA 1MRYA 4IFCA 4IFGA 4K1BA 3OTVA 2CNVA 2WQOA 3FSFA 2W1EA 4YZDA 2CKOA 2YJRA 1JQHA 1Q8ZA 2WOTA 4HNFA 3THBA 5KMOA 4U6RA 4XRJA 4W4WA 3EN4A 3MVMA 3MPMA 3OUNB 3WILA 4BBEA 2C0TA 4P5QA 4IAZA 4L67A 5JGBA 1WBOA 2YM7A 5BVNA 4AACA 4G9CA 2P0CA 3GP0A 3RTPA 2CGWA 3FQHA 4FV6A 1WBNA 2VZ6A 4HGSA 5T6KA 1JNKA 4ZTMA 3VN9A 5E8TA 2P2HA 4EK8A 5JN2A 2V22A 1UWHA 1YOMA 4Z16A 2UZEA 5J1WA 3ODYX 5E4HA 2B0QA 4DTAA 4KUJA 5FTQA 2J0IA 4X3FA 2XZSA 3F3UA 1XH5A 3FZPA 4MK0A 3VS5A 3ZLSA 4XX9A 5HU9A 1U4DA 3TV6A 4FOCA 3N4VA 5HI2A 1TVOA 5FM2A 5GIPE 4OR5A 2PK9A 4WIHA 4IVDA 3LFNA 3PY1A 2UV2A 3DK3A 3WF6A 2IW6A 4EH7A 5I9XA 3SVVA 4QP3A 3VNTA 1OL7A 2G2IA 3P23A 4QQ5A 3DBFA 3PJ1A 4JVGA 5E8WA 5HG7A 2Y9QA 3BV3A 2ERZE 3BLQA 3RPSA 2ZDTA 4X6QC 2Z60A 4TWCA 2R5TA 1GZNA 4H1JA 4V04A 5A46A 4MQ1A 4GT4A 2C5OA 4ZIMA 2Q0BA 4R5SA 3UMWA 2QKRA 3PPJA 4RFYA 4H58A 2UW3A 4XG2A 3BGZA 2X7OA 4FTLA 4GT5A 4AU8A 4AW5A 2CLXA 1OIUA 4ZTNA 2CDZA 3B8RA 4G17A 4Q5EA 4AXAA 2B7AA 4L42A 4WOVA 3AMAA 3WE8A 4TL0A 3TIYA 4J8MA 3W18A 3C0HA 3FAAA 3FLQA 5EQYA 3DA6A 3EQDA 4RX5A 3EL8A 3PP0A 3RK7A 3WOWA 2YAKA 4ENXA 3MH3A 4JAIA 5HESA 5AFVA 3DV3A 2Z7RA 4BCGA 2RL5A 4X2NA 4AS0A 2PE0A 2P2IA 2UW4A 3IDBA 1BMKA 2HAKA 4QYFA 1DAYA 3ZSGA 4F4PA 1P4FA 4YBJA 3SDJA 4PNIA 4DLJA 4ZY5A 3O17A 1YXVA 4DN5A 2UZUE 1OB3A 3PSBA 4C2WA 3O71A 4GFMA 2BRNA 3IDPA 5DT0A 3FPQA 3V8WA 3ZLWA 5BVWA 4C4IA 2IO6A 4EUTA 4FL1A 4LYNA 3UO4A 3HLLA 3C4ZA 2X2KA 4RC2A 4DEDA 2HCKA 3EHAA 2OH0E 2FUMA 4O22A 4UXLA 2OK1A 2QOQA 4IAIA 5CNOA 4YLKA 3U55A 2O5KA 3PE1A 2C6DA 2HENA 4H3QA 4YZNA 2CGVA 2XIKA 4MAOA 4AA0A 2C3KA 3A61A 2PUUA 2ZV8A 1PXLA 4EWHA 4FSUA 4K9YA 4S34A 4M3QA 3QD2B 4F6SA 3HAMA 2QOIA 2XIYA 1A06A 2E9UA 3ENMA 4EYJA 5L2TA 3UYSA 5IH4A 3Q4UA 3DLSA 3LCDA 1ZLTA 2PY3A 3LQ8A 3SV0A 3NMUF 3Q2MA 3QKKA 4F6UA 2WMAA 5A14A 4BIDA 1RE8A 1L3RE 3SQQA 2QODA 3H3CA 4M84A 1H28A 1R0PA 4PTCA 2F9GA 2X8EA 2XK3A 4GKIA 2WTDA 3KCFA 2WGJA 5EG3A 4ANBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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