1BLXA

P19ink4d/cdk6 complex
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
GLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the complex of the cyclin D-dependent kinase Cdk6 bound to the cell-cycle inhibitor p19INK4d.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 6
molecule tags Complex (inhibitor protein/kinase)
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 305
sequence length 305
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 1998-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1blxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1blxA01
1IR3A 5ANIA 4Z3VA 4L45A 1MUOA 4J1RA 1WMKA 3S4QA 4C0TA 1R3CA 2ONLA 4C38A 5TOZA 1PYEA 4L52A 1A48A 4NSTA 4ZJJA 5LVLA 3DK3A 2Q83A 5HTCA 4YR8A 4WRGA 3QRUA 1G5SA 4TZRA 3R9HA 4WA9A 2OI4X 5J1VA 3QKLA 3DAJA 4DFBA 4D2RA 4ITIA 5CEPA 5JSMA 5E90A 3AD6A 1ZRZA 3CC6A 2XH5A 4YNOA 5FG8A 4F1TA 5IQBA 2FSMX 4XV9A 1XHAA 3DLSA 3D5VA 3VWAA 5AM6A 4W4XA 4QMNA 4KIOA 2CKEA 1XH9A 2B55A 3EFLA 4UZDA 3NUPA 3H4JA 1PXOA 3R1NA 5A4EA 3RKBA 4HYUA 4XS2A 2DYLA 4BCOA 2IN6A 5JGAA 4F6UA 3NR9A 4RZVA 2HZ4A 2WMAA 3QWJA 1MRYA 5BQ0A 4X0MA 2J0JA 3V8SA 4QT1A 5AR7A 4B8LA 4RX5A 2WXVA 3BYSA 2X2KA 5KMIA 3WF7A 1FVRA 2JIVA 3UPXA 3CKWA 4DG2E 4GG5A 2BCJA 3C4FA 3BCEA 4O82A 2XK3A 4XHKB 4YPSA 4O6EA 3TZ7A 3ZEWA 2E9OA 3Q6WA 3D5UA 4LV5A 3ZS5A 5M4CA 1VR2A 4ONAA 3O0GA 3BU6A 5JEBA 4F7NA 5AFVA 1Q8UA 3EL7A 3I7BA 1K3AA 4F7JA 3C5IA 1CDKA 2AUHA 4NTSA 2W1HA 3NSZA 4KAOA 3U9NA 4D1ZA 4G6LA 5DMZA 3ZSGA 4MXYA 3SW7A 3D15A 4EH6A 5BMMA 3TTIA 2F2CB 3HL7A 3Q4UA 5EG3A 3EYGA 4DAWA 2C0TA 2UUEA 2YCFA 3HMNA 4NFNA 3BYOA 3FAAA 2I1MA 5K4IA 4GVJA 3ALOA 5KKRB 5K0XA 3CBLA 4K18A 4HGSA 4EORA 3CP9A 2BHHA 2X6DA 1PMUA 3ODZX 4TWPA 4WNOA 4ID7A 2GS7A 2CGUA 2G2FA 3SLSA 4G2FA 4WG3A 3O50A 3T3UA 2VD5A 4U0IA 5HG5A 5FGKA 2HK5A 3LQ8A 3R28A 4IM0A 3CJFA 3LFDA 5HI2A 1YHWA 2IW8A 3FPQA 3UODA 4YNEA 1G8SA 1GAGA 5K5NA 2G01A 2HIWA 3RHKA 3KFAA 4O0WA 3PTGA 1QCFA 3VW8A 3KRJA 5JZNA 4I5CA 5J1WA 4DEDA 3VUTA 3O7LB 4HYIA 2B54A 3F6XA 3RAIA 5HZNA 3Q4ZA 2X7OA 4GS6A 5I0BA 5HHWA 3FMKA 3LAUA 2WMXA 2IPXA 2BRHA 2VO7A 2Y6OA 2CKOA 2OW3A 4GFMA 1PKGA 3RZBA 3IQ7A 1GY3A 4DLJA 3UQGA 4O7VA 2F49A 3GVUA 3D83A 3ULIA 1Q99A 4GKIA 4EOOA 4UB7A 2WELA 5JZJA 5AAEA 4QMZA 3HP5A 4O0RA 1OZ1A 2PY3A 3V5QA 3CPCA 5C01A 4E7WA 4LOOA 5IEVA 4EHZA 4DCEA 5IU2A 5L2QA 1UKHA 4DG0E 5BVFA 5LQFA 3V5TA 2WOUA 1H24A 5AJQA 1BUHA 3OBJA 4ITJA 4DFZE 4AS0A 4F9BA 3A4PA 1H08A 2XNNA 3ELJA 4C59A 4S34A 5IISA 5FDXA 5C27A 1PXLA 2IVSA 5FUTA 3KA0A 3UYTA 3F66A 1OL7A 4DGOA 4BVUA 2UW0A 4BFMA 5HLWA 4G3DA 5KBQA 2QQ7A 1XH8A 2XCKA 3BWJA 3P79A 1OKZA 2R3JA 3QC9A 5AX9A 3ZC6A 2W1EA 1PMVA 2VWWA 4C8BA 3IS5A 1OECA 3MB7A 3V5WA 4WRSA 2UW3A 4L7FA 4FYNA 4O7ZA 4O81A 3Q2MA 3K2LA 5EK7A 1DAWA 3PG3A 5E8WA 4N57A 1YI3A 4UYAA 4ASZA 1PMEA 2XIKA 2UZUE 4HNIA 4U79A 2P2HA 3QCSA 4D0WA 1PF8A 2XIRA 5AP4A 3QKKA 4BTKA 3SA0A 3EH9A 5FXSA 5M4IA 1R78A 5HVYA 2GMXA 3AT4A 3LJ1A 3I5NA 2XK4A 3LXNA 2Z60A 3ZU7A 5HU9A 4QMPA 5EOLA 1Q8TA 3LMGA 2FH9A 4AA4A 4I22A 5I9VA 1M7NA 2GFCA 3W10A 5HG7A 2PVYA 4YJOA 5J8IA 1L8TA 2JBOA 2C6IA 2EWAA 4DINA 5C4LA 3CGFA 4D2VA 3R8ZA 4AN2A 3OY1A 3R30A 4AA0A 4L53A 3PSDA 4GV1A 3LMHA 5HE3A 3QRJA 2YDKA 4KKEA 3SXSA 4FIHA 1GZOA 2P0CA 2E9UA 3IPHA 5CYIA 4BDAA 3DK7A 4P4CA 5EI8A 5FDPA 4IM2A 5TKDA 2CDZA 5KMMA 4UMPA 4I41A 1R0PA 3MH2A 5LVPA 4BI0A 5F4NA 2NRYA 3CY3A 2JC6A 1SVGA 2QLUA 1Z57A 2XKCA 2WMUA 3MA6A 3IOKA 4OGRA 4I4FA 4QTEA 4UWYA 4EHGA 3V8TA 4I5HA 5E8SA 4FL1A 4IFGA 4BCIA 3I79A 3R9DA 3TN8A 3MBLA 2C0OA 3LJ2A 4N6ZA 4S32A 3BQCA 5BUJA 5JH6A 1ATPE 2PTKA 3VS2A 4EH2A 4BIEA 3TT0A 4YTIA 5CSHA 1Q8WA 4IWQA 4FT0A 4AACA 2WIPA 5ANJA 2V7OA 5CXZA 4DE4A 4O38A 2Y7JA 4GYIA 4MH7A 3K5VA 4FTIA 3RBWA 4EI4A 3DKOA 1V1KA 2XNMA 2Y4PA 5DEYA 3DFAA 5FEDA 4CTBA 2CLXA 4NUSA 4EK4A 3HUCA 2HWOA 4PNIA 4ZK5A 1J1CA 4R3RA 4ARKA 3QD0A 4OR5A 4OW8A 1JWHA 4B9DA 4IAFA 4RX7A 1B39A 2O0UA 2VTMA 5DRDA 3ATSA 4P5QA 3FY0A 3EN4A 3E93A 3P86A 4JRVA 3GXLA 3O2MA 4PQNA 4CFXA 1JKTA 1U59A 3ORNA 1XH7A 3GB2A 3GOKA 4JBOA 2CNVA 3VQHA 2Z7LA 3F7WA 3HVCA 4OTIA 4OTPA 4ANOA 4C7TA 3AG9A 2W1CA 5G1XA 4LRJA 4X2GA 5H8EA 3TG1A 3F69A 3BLHA 2YWPA 2WMWA 3KRXA 3CLYA 4O91A 4TNDA 5EI2A 2BFYA 3V8WA 3DKCA 4AGWA 3P7AA 3VBYA 4O0UA 3CKXA 3G6HA 3OTUA 3QRTA 3DNEA 5F1ZA 2VTLA 1S9JA 5ETFA 3G15A 4I6QA 2W9ZB 4XP3A 4J97A 2W1IA 4R78A 4E4LA 3MI9A 4MD8E 3L8VA 4CYIA 4YC8A 3G5DA 5LOHA 2XP2A 4BYJA 3WI6A 1PXNA 4IX5A 4D0XA 4K77A 1YI4A 4I6BA 2G15A 4K33A 3TWJA 2BAJA 3U4WA 4ZS4A 5CU4A 2BRMA 5KMOA 4EQUA 4D2WA 3MPAA 4G3EA 5AV2A 2XKDA 3D9VA 3E3BX 4NEUA 4FGRA 2IZTA 2BDWA 4FV5A 2XNPA 3BI6A 3A7FA 1XJDA 4OTDA 4FOCA 4PPBA 3LOKA 2XVDA 2QC6A 4QYGA 3CJGA 5CXHA 3WZKA 4BBMA 4TNBA 4HGTA 3GENA 2OKRA 1H25A 1FQ1B 1U5QA 1YWNA 2HY0A 3DTWA 2HAKA 3FMMA 4EOLA 4MKCA 1BI8A 4EKKA 5C9CA 3ORMA 5AUWA 2C5YA 4AU8A 1TKIA 1Y6BA 2IJMA 4YJVA 2NPQA 4EWQA 4KBAA 4G6NA 2BKZA 1GZKA 5F20A 5IMXA 2Z7QA 4JS8A 4FZFB 4BB4A 2XBJA 1ZYJA 2F9GA 1XBAA 2Z02A 4E6CA 4ZSEA 5M09A 1YXTA 5BVKA 4ANMA 2B7AA 2CNUA 5K4JA 3P9JA 3MH1A 2WGJA 4F6SA 4RJ3A 3ZO3A 3E7OA 5LVOA 2VTNA 3RMFA 4O0YA 3FWQA 2W4OA 3ZXZA 3NCZA 2ITNA 3UG1A 5DPVA 3PWDA 3RCDA 1FVTA 4JX7A 3POOA 5M08A 3ITZA 4C2WA 3VF8A 3GC9A 3A62A 4E1ZA 3HAVA 2JFMA 3R9NA 3VS7A 3JVSA 3O17A 4MD7E 3H10A 4IIRA 3W2PA 4HPTE 1OUYA 3F2NA 3PXRA 3GU6A 3VHKA 1IAJA 5DVRA 2R0UA 4QMYA 1LEZA 3FI3A 3MSSA 3QUEA 1YXSA 3THBA 5DR2A 3BQRA 1JSVA 5ANDA 3FC1X 4D5HA 2P2IA 4M69A 1YRPA 2A2AA 3ENHA 4HYHA 2OU7A 2BDFA 3JY0A 4ENYA 4MK0A 3WF5A 4L8MA 5IZFA 5C8MA 2RSVA 1XBBA 3QGWA 4RFYA 3VULA 4YURA 3LQ3A 4Q5HA 5HCXA 3QTQA 4H3PA 4ZS0A 4NYEA 4QP9A 4XG8A 4P7EA 4AW2A 1F3MC 3HRBA 4GT3A 4IX6A 2W99B 4JRNA 4KKHA 2W1DA 3WOWA 2X9FA 3FDNA 5AA8A 1OKYA 1SNXA 5HKMA 4RVMA 2QVSE 4NTTA 4MWIA 2V7AA 3CTJA 3ZBXA 3F61A 4LOQA 2ZDUA 3C9WA 4Y85A 2WIHA 1I44A 4M69B 4W8DA 5KMJA 4U97A 3TNPC 3ALNA 3RALA 4H1MA 4BCMA 5B2MA 3UO4A 2QNJA 2PVFA 3LLTA 3LM5A 5L6WL 2YERA 5K9IA 3JPVA 5JGBA 5LCKA 4JQ8A 5HOAA 3M42A 4KRCA 4O0XA 4XOZA 3FZOA 2V5QA 2JDVA 4YBKA 4QTCA 4IE9A 5EYDA 4DEBA 3E92A 4JXFA 2WTKB 1Y8GA 3OVVA 4OTQA 4RFMA 4F70A 5I3RA 2WMQA 3F3ZA 2EUFB 4GU6A 3EQBA 1NVQA 3QZHA 3V5JA 5BVOA 3NNUA 2ZM3A 2ZM4A 2X39A 4K8AA 3HDNA 3ZM4A 3EIDA 3ET7A 1JSTA 3IONA 3Q3BA 4RIYA 5J9LA 4ZIMA 5I9YA 3PY0A 1XKKA 4FV1A 4JDIA 4F0IA 3IW8A 2UZNA 4N0SA 5HIEA 1UU9A 3CS9A 4I24A 1JVPP 1GZ8A 1U54A 2GTMA 2XEYA 2XJ1A 4MQ1A 1J7IA 4DCAA 3FZSA 3S3IA 4EJ7A 3UIXA 4JQ7A 4I23A 5EM8A 4E4MA 4ZMEA 1Q97A 5EM6A 4FF8A 2CMWA 3NAYA 5IPJA 4J8MA 3BX5A 4RIWA 3FXWA 4BF2A 4GL9A 2F57A 4LGHA 2PWLA 5KE0A 3G9LX 4I5PA 5EKNA 3UYSA 2VTOA 3DJ7A 2W7XA 4CMOA 3W2CA 2QO2A 3VVHA 2YIWA 2QU6A 4HPUE 4PUZA 4XG7A 3IW4A 4ORKA 2RGPA 4USDA 1IAHA 5EFQA 3A7JA 4RX9A 5L4QA 2HCKA 5EKOA 4YZCA 2YIXA 3DBCA 3NW5A 4FGBA 5AP3A 3P1AA 4RG0A 3F82A 3ZCLA 1YKRA 2FVDA 3ZUVA 2IZSA 2WEVA 4ALVA 3HGKA 3ZBFA 3R7UA 1R0EA 3KMUA 4QRCA 1WBTA 1J7UA 3DB8A 3DT1A 4C02A 2XIXA 2YDJA 4EONA 4F7LA 4IDVA 2P55A 4RIWB 3QTXA 5EOBA 2UZDA 3KQ7A 4PP9A 5HU3A 3PSBA 1PXIA 4JR7A 3LKMA 5FWKK 3VS5A 4CYJA 4DFYA 4EZ7A 4GUEA 4CV8A 4ZTMA 3QL8A 5AEPA 4UEUA 5A14A 2C4GA 4FKIA 1VYZA 5HG9A 5JFSA 3VUIA 2Z7RA 3ZONA 4AWIA 1M2RA 4FZDB 3Q96A 3TXOA 3BHVA 2OIQA 4FX3A 4GYGA 4TRLA 3BGZA 1OL6A 3GU5A 5FP6A 4J98A 1J3HA 2O65A 4FTNA 2XMYA 3HMPA 3HDMA 5C1QB 1Q3WA 1P2AA 4KWPA 4QMXA 4R8QA 4U42A 3SD0A 4EOIA 4G17A 4L7SA 3ZOSA 5HD4A 2C30A 4L3PA 4F0GA 3KXMA 3LIJA 3OF0A 1B6CB 1NXKA 3FEGA 2ITYA 4PY1A 3KKVA 3T8OA 1GIJA 4X6RA 3NPCA 4EKLA 5A54A 2VTAA 3C4ZA 5EYMA 4FV0A 4O84A 4CFUA 4FT9A 5DR9A 1JKSA 3E62A 2WPAA 4GT4A 3KGAA 2GTNA 3CTHA 4N6YA 4ZOGA 3VS4A 3RK5A 4PL3A 4JBPA 4XV1A 4BKJA 4EL9A 3IGGA 4JIAA 4YSJA 4RVKA 2WTVA 2ZB1A 2VX0A 3EOCA 5DFPA 2FSLX 4YPDA 5BVEA 4QO9A 4ZJIA 5G6VA 4S30A 3C4CA 4AW1A 1ZOEA 1UWJA 3NYVA 1W83A 3ODYX 3BV2A 3FKOA 1TVOA 3UTOA 4FSQA 2R5TA 3LCKA 3H0ZA 5KZ0A 4CVAA 3QX2A 3E88A 3FQSA 5FEQA 5FXQA 2WTJA 4CXAA 1WVXA 3MY5A 3RK7A 3CXWA 3RWQA 2F7XE 2I0EA 2Y8OA 3FSFA 4FKGA 1M2PA 5CAVA 1O9UA 4QMWA 5HE0A 4RGJA 2DUVA 4EHEA 5IH5A 4HVDA 1EH4A 4RJ7A 3V01A 1MQ4A 4HCVA 1KOAA 4MXCA 2OJIA 5GZ9A 4ACDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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