1DAYA

Crystal structure of a binary complex of protein kinase ck2 (alpha-subunit) and mg-gmppnp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title GTP plus water mimic ATP in the active site of protein kinase CK2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN KINASE CK2
molecule tags Transferase
source organism Zea mays
total genus 107
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 1999-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1dayA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1dayA01
2BRNA 4YJVA 3BHHA 2ITOA 3MS9A 4WD5A 4ZMEA 5HZNA 5KMLA 4RX9A 2ONLC 5F9EA 4FG7A 4YJOA 3BEGA 1GZ8A 2WTKC 3E8NA 2EXEA 1H0WA 3UTOA 2Y0AA 2WZJA 4FZFB 3ZXTA 3PXQA 3EMGA 4DH1A 3C4WA 4TYIA 2P55A 5FBNC 1XH6A 3FMLA 4HCUA 3ZONA 4Z9LA 3NLBA 3M2WA 3ZOSA 3OVVA 3W2CA 4YTFA 2J0KA 3O2MA 1TVOA 3QD0A 3WZDA 3W1FA 5KBQA 3FKNA 2W1GA 2UW0A 4FG9A 4DC2A 1IAHA 4IWDA 4BDJA 2B1PA 4DGNA 1OL1A 4IC8A 1A48A 4O22A 2QHNA 4F09A 4EYJA 3KVWA 3D94A 5AM7A 4ZOGA 2QOKA 4PMMA 1F0QA 4NFMA 1VEBA 4L44A 3FLQA 4R77A 5BUJA 3EZVA 3MDYA 5KMIA 3MH1A 3E92A 3V8SA 4F9WA 5CAQA 3GP0A 4O2PA 1OPKA 2R3JA 2YM4A 1VJYA 4GG5A 4O7WA 3BGQA 3LCTA 3JUHA 4NKAA 4C4HA 5GZ9A 3MH3A 5C27A 3WYXA 3OUNB 3KF7A 4NEUA 5H8GA 2NRUA 2ZYBA 1OITA 4IANA 2JDVA 2V5QA 3EQDA 4BCPA 1PXLA 4KUJA 2BALA 1U5RA 3DZOA 4XMOA 3GOPA 4CMUA 5DE2A 4XG3A 3TZ7A 4GK4A 2UW8A 2F2CB 4D28A 4FTMA 1PMUA 3BHYA 1WBNA 4FNYA 3ZC5A 5ITAA 3DXNA 4NM5A 4EBWA 3RZBA 2Z7SA 4JR7A 2Q0NA 4MQ1A 1OZ1A 3NYNA 1APME 3HNGA 3ORLA 4BHNA 2WKMA 3CGOA 5K9IA 5M4UA 5GHVA 3OT3A 1OKYA 2BTSA 2R3FA 4FKQA 3F82A 4HPTE 4Q5EA 3PXKA 4CQEA 5HCYA 3WILA 3PY0A 3BQRA 4PTGA 3VS3A 4FGRA 2W1DA 1ERKA 5IQGA 3UO5A 3ZXZA 5L2WA 4O7SA 4QYGA 1W0XC 3R83A 4D5KA 4CMTA 4HGSA 4APCA 4FX3A 4NTTA 4TNBA 5EOBA 1BI7A 1E9HA 4EL9A 1Z9XA 3N4UA 1FMKA 4RJ8A 3DBFA 3NAYA 2YABA 4TXCA 2W5HA 4ZIMA 4JBVA 4GJ3A 4FTLA 4RIWB 4I20A 4OTDA 5AUYA 1O6YA 4JT3A 2C6KA 4EHGA 3QHRA 4YZNA 2I6LA 2QHMA 2JGZA 2OFVA 3FMEA 3GOKA 4OLIA 3RGFA 4WUNA 3ZM4A 3MVHA 4TT7A 2AC3A 5CEQA 3F3VA 3HAMA 5LCKA 3KCKA 3NUSA 2VNYA 2OIBA 2WIPA 5EM5A 5AUZA 3E88A 3TNHA 3R9NA 3MVLA 4RT7A 5EI6A 4BIEA 4CLJA 4PP9A 5IA1A 3FSKA 2Y4PA 4K18A 2YM5A 3R21A 5CAVA 4L43A 5JQ5A 3IW7A 4DA5A 3BBTB 4MD7E 3EQFA 3LCDA 5HG9A 4AU8A 2WOTA 5EOLA 5LMAA 4EOJA 4XYFA 4N6ZA 3RK7A 5E8YA 2VWUA 1JPAA 4TWOA 3KCFA 3Q9YA 4BDHA 3TACA 3DKFA 5DRDA 4EZ7A 4LV5A 3UVPA 4BDAA 3PJ2A 3LOKA 3R7EA 4AZWA 4YNEA 4R1YA 1U54B 4FTNA 4JRVA 2RGPA 5G1XA 3V6RA 4DH5A 3ITZA 4RJ6A 3G2FA 4QMSA 1JKKA 3TN8A 3EL8A 2Z60A 4QNYA 2UW4A 1SYKA 3QAME 4LRJA 2CNQA 3Q4ZA 4EHZA 3DA6A 4YR8A 4M7IA 1ZXEA 1W83A 2RIOA 3IO7A 4FT9A 2OK1A 3WIKA 5CT0A 1WCCA 2UZOA 5JGAA 2V7OA 2BKKA 2XZSA 2GHLA 4U6RA 4ZK5A 2YFXA 3QCQA 5C03A 5EQEA 3DFCB 1SZMA 1W98A 2W17A 3C4FA 2QO7A 3MVJA 2PZRA 3TV6A 3PXRA 4CTCA 4BY9E 1TQPA 2X7FA 4MK0A 5J9ZA 4IACA 1YRPA 4M8TA 5T68A 3DBDA 3BLQA 2AUHA 5CAPA 1B39A 3IKAA 2GFSA 5EM8A 3UO4A 5HVKA 2YCRA 3DJ5A 1V0OA 4JX3A 3R8UA 3DK7A 3CS9A 4QTAA 5E90A 4O21A 4YNOA 4DG2E 2FSOX 3UDBA 4TTHB 3RM7A 5LMKA 1XH5A 5CTPA 2VTHA 4JVGA 2VWWA 3C4ZA 4YTIA 4FL2A 4DGGA 3LQ8A 1XBAA 4UMUA 5CQUA 3FWQA 4AF3A 4IZ5A 4J53A 3IK3A 3EN9A 5BUIA 1GZOA 3HMOA 2XIXA 3TUBA 2BCJA 3QUPA 3BYSA 4RX5A 1S9JA 3BI6A 5A4CA 3WF7A 4U80A 2I0VA 3ORZA 4GT4A 4X2GA 4YO6A 1ZY4A 3PJ1A 3DXPA 5KKRC 3S00A 4GT3A 3NMUF 3VO3A 3EQGA 1QL6A 4G6NA 4WHZA 3P78A 4XBUA 5AR2A 3GFEA 5HICA 4CZYB 4D55A 4KIPA 4X7QA 2ITYA 5DGZA 3C50A 4FF8A 3R01A 3OP5A 5T3QA 4AS0A 5FUTA 5AP2A 2R7IA 3F6XA 4LM5A 2IWIA 5HE0A 3JVSA 3MA3A 4JRNA 5HKMA 4OR5A 2YDKA 4DLIA 4CLIA 4PUZA 2W5BA 5HO7A 3AG9A 3R8MA 2WQNA 1UWHA 3PP0A 2WNTA 1YOJA 3ALNA 3M1SA 4F1MA 4F7NA 4L53A 2PL0A 3DBQA 5IZFA 5CANA 1Q8WA 4Y72A 3QF9A 3UMWA 4LQMA 5HTCA 5EDQA 4HVDA 2ITNA 3CR0A 5B2KA 2YCQA 5E1EA 3OW3A 3EH9A 4E93A 4C36A 3SGCA 3QA8A 3PPKA 4FTAA 4CEGA 5CEKA 3DAKA 4G1WA 4BB4A 1NXKA 3FMDA 3GEQA 3ORMA 3OY3A 5M56A 3NEWA 2XB7A 4LL5A 4TKSA 5IA3A 4BCHA 4D2PA 4C38A 1M7NA 1HCLA 4FTCA 4KBAA 4DEIA 5EYCA 2FUMA 4N0SA 2YIYA 3D5UA 3PXFA 4D2VA 4EHVA 2ITUA 2PSQA 3FL5A 1ZZLA 1OKZA 2OSCA 4NM0A 4DGMA 2XEZA 2PZIA 3M42A 4FV5A 4EK4A 4HW7A 5HTBA 5HU9A 3ZU7A 3ID6C 2W7XA 3ORKA 2VO7A 3OZ6A 4R7HA 5DHJA 5KUPA 3NUXA 3DDPA 1YOLA 5CVGA 3R8LA 5AR8A 3P4KA 4O0YA 3N4TA 3REPA 3O0GA 4DAWA 2R3MA 3PYYA 4B0GA 3BCEA 1JWHA 1PHKA 1F3MC 3UYTA 4GRBA 5IDPA 3FBVA 3TXOA 4IVBA 5DPVA 2XK4A 3VF8A 4CYIA 3TNQB 2PVNA 4F0IA 3QC4A 2G15A 2X7GA 3R1QA 4I6HA 4ZSJA 3H0YA 1KE8A 4BCMA 4ZMFA 5HLPA 2XYUA 4MXZA 3G0EA 2RF9A 4BVUA 4EJNA 4O7NA 2UW3A 4QP2A 3PPZA 3ZDUA 2XA4A 4ID7A 1JNKA 1FINA 4GKHA 3OY1A 3UVQA 2Z7QA 3C5UA 2ERZE 2PUUA 3BLRA 2VTMA 5IEXA 4UXLA 4X2KA 5IH5A 4MKCA 1YW2A 4FNXA 4K2RA 3R1SA 4FV7A 4CQGA 3N9XA 4I5MA 5HNIX 4FSMA 1GAGA 3K3JA 1YI6A 5TF9A 3GI3A 3V5JA 2O5KA 5DEWA 3QQUA 1KE9A 3OTUA 2QKRA 4RWLA 5ETIA 4EK3A 1O6LA 1WBTA 3MJ1A 3H30A 4U40A 1AQ1A 4A06A 4HZSA 2QOBA 4XG6A 1UKHA 2BZJA 4H58A 3TNPC 4YBJA 4DN5A 2YWVA 1YXUA 1GJOA 3AGMA 3FXXA 2R4BA 4FSQA 1IAJA 2CGUA 3MY1A 4BYJA 2BUJA 3AGLA 3CQWA 4U0IA 2CHLA 5EW8A 3NUAA 5BYYA 3LVPA 5C01A 1B6CB 3U54A 1ZYJA 3OG7A 5C4KA 1PY5A 4R5YA 3UIXA 4O84A 2C3IB 4KSPA 4L68A 3IONA 4HPUE 5M08A 2QOIA 2QOFA 4RBLA 4G3DA 4A9SA 5D9HA 4C8BA 4F9YA 3LMIA 4ANQA 5BVKA 3QL8A 2A19B 2XNNA 4ITJA 5IQAA 3HDMA 4HYHA 2DUVA 4YTHA 4AZFA 5FBOA 2CMWA 4IB0A 5J1VA 1ZYCA 3FI3A 2BFXA 3ACJA 3DQXA 4M84A 5ANOA 4MEDA 3LXNA 4M15A 5G6VA 3D7TB 2BAQA 3VQHA 4C59A 4FTKA 5CEPA 4OGRA 2YLFA 5TO8A 5JN2A 4W9XA 2P33A 3KY2A 2VWZA 2W4KA 3BE9A 3RP9A 3KFAA 4ZTLA 3PJCA 4C4IA 4D2RA 3ZBXA 5F20A 2PVFA 1BX6A 2UVZA 3HLLA 2FSMX 1YWRA 1QMZA 4S33A 3TG1A 4O7TA 5KNJA 3EOCA 2Y6MA 3UNZA 3WARA 4L7SA 4NUSA 2NO3A 4FSZA 5CI7A 1Q5KA 1YOMA 4RFZA 4NIFA 4IDVA 4HVSA 4JOAA 3O23A 1IA9A 1YXTA 5EQYA 3FYKX 4B99A 2R3PA 1MQ4A 1VYZA 3AC1A 3KRLA 4IIRA 3ZRMA 4ZLYA 2QLQA 4C61A 2JLDA 3ORPA 4U41A 5CSXA 4O0WA 4IB1A 4QQJA 5HE2A 3ORIA 4GYGA 2QOHA 4EOPA 2EXCX 4QYYA 4EH3A 4NKSA 4C4GA 4CFMA 1UU8A 3DCVA 2G1TA 3I7BA 2HY0A 1GNGA 4RIOA 3PE2A 3QQGA 5HEZA 5CWZA 5C8KA 1YWVA 4ZLZA 2ONLA 4RX8A 2XNEA 4AGCA 4AGUA 2WU7A 3TI1A 2F9GA 3O7LB 3QKMA 4A9RA 3MPTA 2C5XA 4LG4A 5I9YA 3QWJA 4I6FA 3KRWA 4LGHA 5J95A 4FZDB 1OKVA 4QO9A 2R3RA 3NYXA 4FC0A 2OW3A 5KZ0A 4HVIA 1YI3A 2XYNA 4O0VA 4IMYA 3R7OA 5I9ZA 1RDQE 4FT3A 4QMLA 1Q24A 4CYJA 3W8LA 5HQ0A 3PSDA 2OO8X 4MQ2A 5K5NA 1UV5A 1MRYA 3ERKA 5IDNA 2WIHA 1BLXA 4Y83A 4CV9A 4PL4A 3V3VA 4CV8A 1SVHA 4FSWA 1P4OA 4AA4A 4DBXA 1CM8A 3P5KA 4AG8A 2QVSE 3R8ZA 5B2LA 4FKIA 2UZNA 1KE6A 4L3PA 5GJGA 5HD7A 4QP4A 2HYYA 2WTWA 3P0MA 1H1SA 1PXPA 3G0FA 3BQCA 4FT0A 2OJFE 1H1RA 4W4XA 5CNNA 3UPZA 3UE4A 3VW8A 3R7VA 3TJDA 2B4SB 4PDOA 2QKWB 3O7LD 4YBKA 2XEYA 4F70A 2G01A 3DLSA 4QMNA 5HE3A 4ALWA 2OF2A 2QR8A 4F9BA 1U5QA 1AGWA 5CXZA 5CEIA 2OJ9A 3G6GA 1HOWA 5DBXA 5I9VA 3EQPA 4Y95A 1YXSA 4GU9A 4AAAA 4KIQA 2W4OA 4D4RA 3NNXA 4AZEA 3LCSA 2VO0A 4WG4A 5HLWA 4C34A 4F1TA 4DTKA 3CTQA 3TCPA 4PY1A 4UYNA 3ZYAA 4XRJA 4HZRA 3ZLSA 2UZWE 2XBAA 3MJ2A 3UOLA 3VHKA 3LKMA 1Q3DA 2VNWA 3PJ8A 5LCJA 4UALA 5M44A 3R30A 5FDPA 4ZJVA 5E8UA 4FKVA 4BDFA 2WTDA 2X2MA 2C5NA 1ZMUA 4IX3A 2W1ZA 4PPBA 4JQ7A 4UZDA 1Y8GA 3EWHA 1Q62A 3R9DA 3RCDA 3C9WA 4K0YA 4PNKA 1OBGA 3F2NA 5I9WA 3D7TA 2WD1A 1H27A 3MFSA 3R1NA 4D1XA 3KMUA 3OCTA 4FTOA 4OW8A 4DLJA 5BPYA 4XRLA 4HGTA 2B55A 3AT4A 4G34A 3PWYA 4UXQA 3WYYA 2O65A 1QPCA 4A9UA 1NT2A 1OL7A 3H0ZA 2NPQA 3H10A 4FSTA 1J1CA 5J87A 2QONA 3NRMA 1PXOA 3O8PA 5CU0A 5AFVA 1JKSA 3Q4TA 5JZJA 2OIDA 3KXXA 3IDPA 5L2IA 1ZYSA 3MW1A 2OICA 4EUUA 2Y7JA 1M17A 3COKA 4KB8A 4DTAA 1YXVA 1YHSA 3FLNC 2RG6A 4PTEA 3EJ1A 4O0TA 4TW9A 4ZTRA 4MWIA 5IQDA 4FA2A 3ALOA 2NNWB 3LAUA 3BWFA 3BGZA 4AUAA 4HVGA 1U46A 2CGXA 4BZDA 1W84A 4NCTC 5AA8A 2VTOA 1UNGA 2QQ7A 4I93A 3UG1A 4F0FA 5JFWA 4OTRA 2JFLA 4PTCA 1LEZA 3NUNA 4IWPA 3CJFA 5C4LA 4ZZOA 4QYEA 3IW4A 1YXXA 4WRSA 3Q9XA 4FKGA 3CCNA 4GS6A 3FZPA 4JNWA 3RAHA 4DITA 4F7SA 4NH1A 3MESA 3EN5A 4RJ5A 2JBOA 4IAYA 2LGCA 5AX3A 4BDIA 4DGOA 2SRCA 2JITA 4O0SA 4ZY6A 1A9UA 4EJ7A 3NUYA 3R28A 2F57A 3UC4A 4MX9A 2W05A 4BR3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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