1FMOE

Crystal structure of a polyhistidine-tagged recombinant catalytic subunit of camp-dependent protein kinase complexed with the peptide inhibitor pki(5-24) and adenosine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
338
structure length
336
Chain Sequence
ESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a polyhistidine-tagged recombinant catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase complexed with the peptide inhibitor PKI(5-24) and adenosine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE
molecule tags Complex (phosphotransferase/inhibitor)
source organism Mus musculus
total genus 108
structure length 336
sequence length 338
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 1997-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1fmoE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1fmoE02
4EC9A 3K5UA 3TDVA 2BRHA 2C69A 4QNAA 4EH6A 2VTNA 2HENA 2WQNA 3OWKA 1YWRA 4UXLA 4MYGA 3QZHA 2R3MA 4PL4A 4ZSGA 3WYYA 4F09A 3CTHA 4V0GA 2WAJA 5AV0A 3RPSA 4F6WA 2XK3A 3O17A 2J4ZA 3DLZA 4UALA 3HYHA 5T3QA 2B52A 3LXKA 2FVDA 4I94A 4PV0A 2GMXA 3LXNA 3TIYA 3VBQA 4BICA 2V22A 3LMHA 2IVSA 2XIZA 4R7HA 2XCHA 4FG7A 4XG4A 5A3XA 1OIQA 4NW6A 1K9AA 3SA0A 4NEUA 3ORIA 4KIOA 4EBVA 5IDPA 3DNEA 3PP0A 5E1EA 3VS3A 4AN3A 2XJ2A 2Z2WA 1M17A 3MH0A 3UNJA 3KXMA 3VJOA 2X7OA 1QPDA 4GFMA 3E8EA 3ZCLA 3LFEA 1V0OA 4W9WA 2RFNA 2F7ZE 2WQOA 3HMNA 4EKKA 4ZMEA 4RLLA 4O7RA 2YLFA 3JR1A 4ANOA 4FZAB 4AFEA 3QYWA 3R01A 4TN6A 5AIRA 4K0YA 4BIDA 3RM7A 2QHNA 3BPRA 4KRCA 2YDJA 3AD4A 1XQZA 3UIUA 4ASEA 3QRJA 5TKDA 4H3BA 4FT7A 4QPMA 5DH3A 3SKCA 2OJGA 5E4HA 3AOXA 1ZXEA 5M4CA 4IXPA 3E63A 4DFUA 4YSMA 4TYIA 2OZAB 4IWOA 3ZO3A 4AT5A 4ZIMA 5DWRA 2WTWA 1YXXA 4FG9A 2W0JA 2B4SB 3KA0A 5HU3A 4RMZA 5DI1A 3IDBA 3UP2A 4ACHA 3ZOSA 4IADA 4PUZA 3AC3A 3F3WA 1F3MC 2R3LA 4GT3A 2EB3A 3A4PA 4K11A 5ETIA 4ZTQA 2WEIA 2CNQA 1UWHA 2YCQA 2XKDA 4XNEA 1BKXA 3D5XA 3HUBA 5T6KA 5AUZA 2CKEA 1YHWA 3UE4A 2WXVA 5AR7A 4CT1A 5LMBA 5LWMA 3DBQA 1KSWA 3P78A 4WNKA 5T68A 3PXRA 1MRUA 1OKYA 1ZOGA 4NJDA 2JAVA 3TZ8A 1DAYA 2YM4A 3D7TB 3FKNA 5BMSA 5J1WA 3GB2A 4DEGA 3UC4A 2BDWA 4ZTMA 3DAEA 4CYIA 2BHHA 3GXLA 1OECA 4L3JA 2ETKA 3MVMA 1ZOHA 4EK5A 5F20A 5LVOA 3OROA 4FA2A 5C27A 3DY7A 2ONLC 2PWLA 2VTRA 3D83A 4M0ZA 4C4HA 4PDPA 5ANDA 3DDQA 4L9IA 3QHWA 2C3JA 4DITA 2C6EA 3Q53A 4O0SA 2R3PA 3DTWA 2AUHA 3LFCA 4WO5A 3C5UA 2B9FA 5GZAA 4MKCA 3BYMA 4OTFA 2W9ZB 1NY3A 4BI2A 3PVGA 4PRJA 3FY2A 3U4UA 2JFMA 4A06A 4C35A 5CF6A 4X2FA 4H05A 3VBWA 5HD7A 2VTJA 3VUDA 4WKQA 2R3NA 4F9WA 4GJ3A 4YLJA 3DZOA 2FO0A 3QXPA 4NJ3A 3VS7A 3OY1A 4Y73A 2YIWA 4JBQA 4JDKA 3I60A 3NNVA 4EOQA 2PYWA 3ODYX 4TWNA 3FZPA 1PY5A 4DCEA 4HYUA 5HVJA 4D5HA 4FICA 5KKRC 2VUWA 5CX9A 4BZNA 1ZYDA 4K2RA 4PPAA 3TIZA 5GJGA 4KIQA 5FBOA 3G6GA 2I1MA 4PTCA 4NM7A 4FIGA 4F63A 3FMJA 4I3ZA 3G0FA 4O86A 4R3CA 3MV5A 1WFCA 2KTYA 3CY3A 1M2QA 3LMGA 4RQVA 2W1HA 5CY3A 3TTJA 4F6SA 3FYKX 1APME 1E1XA 4JVGA 4FSMA 3NYXA 5JKGA 3I79A 4ZLYA 2V7OA 3FKLA 4QP1A 4RIYA 2E9PA 5B2LA 2VTPA 1XBAA 3Q6WA 4YSJA 1YI4A 1LEWA 3UP7A 3LM5A 4I6BA 5CT0A 4D58A 3SGCA 2YFXA 4BIEA 4QRCA 2GNLA 2HOGA 3QX2A 3EOCA 2VNWA 4WHZA 5H9BA 2I0YA 4LUEA 2WKMA 3ENHA 2OXYA 1FGKA 5I4NA 5DRBA 5GIPE 3BGPA 4YPDA 3ZLXA 4MEDA 2C1AA 5HCYA 1Q4LA 3FZSA 2WMAA 4W8EA 2G15A 3FMHA 3KREA 2RG6A 3FZRA 4L44A 2C47A 3DT1A 1LR4A 2CPKE 3QTRA 4QMSA 4A9RA 3C7QA 3UYTA 3JUHA 5HBEA 4FODA 5BVDA 4OBOA 3VBTA 1WBVA 4KA3A 5AP4A 1M52A 3O50A 2Z7QA 2CKOA 2B53A 3NNXA 1EH4A 2C5YA 5A6NA 4A9YA 3AC8A 4KS7A 2XKEA 4FTOA 2BPMA 4MBJA 2BILB 3R9NA 2WQMA 4YZ9A 3KL8A 2QOIA 4QPAA 3UNKA 1YXSA 2CMWA 2Y4PA 5AR5A 3W8QA 3CQWA 1L3RE 3VO3A 4O0WA 4M15A 5BPYA 3TJDA 4FI1A 4J7BA 2YIXA 4GG5A 1MP8A 1WBTA 1H26A 1UWJA 4OR5A 4UY9A 3E64A 4LRMA 4WUNA 5DEYA 3TEIA 3VF9A 2GTMA 2QG5A 4BDJA 1SMHA 4F4PA 5CAVA 4X21A 3OY3A 2HY0A 3FMMA 2JD5A 3RAIA 4C34A 4LG4A 3ORLA 2XM9A 2JDOA 3CQUA 4U43A 1V0BA 4IVBA 5K0KA 1J1CA 4EZ3A 4Q9ZA 3C1XA 1UA2A 4GFOA 5JRQA 1QL6A 4FSWA 4QQCA 3T8OA 4PP9A 4FSYA 4JDHA 4DC2A 4EUTA 4C36A 4F7NA 2H34A 3TKIA 1Q3WA 3BHUA 3DKFA 4IACA 4NIFB 2XUUA 4IB0A 4UMTA 4ANBA 2QR7A 3FHRA 2W5HA 4QD6A 2GNIA 4Y5HA 3JY9A 4IVAA 3I81A 4YC8A 3BU6A 5IQBA 3V6RA 3C4XA 2UW6A 5KZIA 3MTLA 4EL9A 3FMDA 3Q4CA 4I5CA 5B2MA 3FQHA 1STCE 3PA4A 2PVHA 1CKPA 1Y8GA 4GYIA 4WRSA 3SAYA 4O2ZA 3BHTA 1XH7A 3LCKA 1KOBA 4IJPA 4PL3A 5AMNA 2DWBA 3UMXA 1J7UA 4XEYA 2HWPA 3BI6A 4EWQA 4F6UA 3IKAA 1JSUA 1R0PA 2QKWB 2BR1A 1YDTE 3MY5A 5HO7A 3V04A 4QP2A 1YRPA 4D9TA 4G5JA 2G2FA 1VR2A 3BWFA 4DEHA 4JX7A 4BI1A 1BI7A 1FVVA 1Q8WA 1UU7A 2QURA 4G5PA 4YHTA 4NIFA 4BDKA 3HMMA 4UN0C 2GQSA 5F4NA 3R22A 3S0OA 2DQ7X 2HK5A 3W2PA 4CEGA 3ZH8A 2ITVA 2GPHA 4K77A 3NEWA 1QCFA 1ERKA 4M13A 3OT8A 3RZBA 4O7VA 4UMPA 4DFZE 2FSLX 3QBNA 4KB8A 4CKJA 3BBTB 3MB7A 5FEQA 2VO0A 5DA3A 5CENA 2QI8A 2BZJA 4MK0A 3C5IA 3PY0A 3QRIA 4G6LA 4G34A 4P90A 3IW4A 4QMVA 2XM8A 4HCVA 5JFVA 1I09A 3KRXA 3PG1A 4PP7A 4ENYA 3GT8A 3C4ZA 3QKMA 4GV1A 4MF1A 5AFVA 1YOMA 1ZMVA 3GC9A 4BBFA 5M55A 5AAEA 5K4JA 3R21A 3KN6A 4BIBA 4PTEA 2QLUA 5ETCA 4Z16A 1YKRA 2XRWA 1G3NA 2VTOA 2C6OA 3IW5A 3K54A 2ZDTA 4C61A 5FDPA 1M2PA 3HP2A 4IZ7A 2BFXA 4BDDA 4M3QA 1Q41A 4DG3E 3AT4A 3QD2B 4FL3A 3V3VA 5EYKA 4D2WA 3UVPA 5LMKC 3D4QA 4EH7A 1U4DA 2WB8A 4AU8A 4UYAA 3PWYA 4GL9A 2BRMA 1MQ4A 4N57A 4OTQA 2W4KA 2JITA 4G3DA 4YJPA 4IX4A 2Z7RA 2PSQA 3RAKA 1FVRA 3BRBA 2WIPA 4GT4A 4HGTA 3TUCA 1YWVA 5EQPA 2ZV8A 1LUFA 1YQJA 3E8NA 3H10A 4LUDA 4G16A 1FPUA 3NSZA 3FJQE 3GOPA 4I93A 3DJ7A 4O0XA 3V6SA 3G9NA 4NZWB 3LFNA 3SOAA 1NVRA 2XNOA 3G51A 3D15A 4B8LA 3O51A 3LJ0A 4RZWA 3UVQA 4AT3A 3E5AA 5JGAA 5AR2A 4FUYA 5EI6A 4LGDA 1JPAA 3QRUA 1XH4A 4FGBA 1JKKA 3QALE 4UZDA 4BVUA 4QMPA 3HMOA 2IO6A 4FTQA 4I0TA 2AC5A 3ZUVA 3ZFXA 3KGAA 2ZDUA 3D5WA 4JQ7A 2E9UA 5LQFA 4APPA 4D2PA 3IW8A 4TWOA 2VO6A 4U80A 5FLFA 5AWMA 1IEPA 3ENMA 3JYAA 4RA5A 5AP2A 4WT6A 4CV8A 4PX6A 2X0GA 4MVFA 2FUMA 4EYMA 4HVGA 4BZDA 3SG8A 4I0RA 3I4BA 4W4XA 1BYGA 3H30A 2HXQA 4LYNA 3R7YA 3ZU7A 3V51A 3PXQA 2YIRA 3OBGA 3LW0A 3OT3A 1KOAA 2QONA 1JKSA 3QWJA 2ERKA 3NMUF 2GQGA 2R3GA 4XOZA 3LAUA 1ZLTA 2C0OA 2VTQA 4ITHA 4QP4A 3U54A 3CTJA 3MVJA 3NS9A 3KF4A 4PF4A 4NL0A 2VX3A 4JIKA 3NIZA 5E8TA 4HGSA 3TL8A 5KKRB 2WHBA 4JL9A 3TZ9A 3RPVA 4E6AA 3OCTA 5D7VA 5BVKA 3PG3A 4D1SA 3QUPA 2ONLA 4ZJJA 2C1BA 4BDFA 2VTLA 2XIRA 3Q2MA 4HZSA 3A7GA 5EM7A 3S2PA 3MWUA 4FTKA 3QQUA 3TTIA 2QO2A 3EQCA 1WVYA 3EMGA 3JY0A 1W8CA 4IE9A 3I5NA 2YAKA 4L43A 4TWPA 3WZDA 2XCKA 2WU6A 4M66A 3OOMA 4EEVA 4DFYA 3DBCA 3PXKA 5IA4A 3C50A 3F61A 3R2YA 4YO6A 4GKHA 3VS4A 3RP9A 4KBKA 4IANA 3DGKA 2GHGA 4J98A 4QP7A 4GVJA 4JR3A 4LGGA 2JDRA 4MXYA 4DTKA 3L9NA 2XNEA 3PJ3A 5KHWA 5CSWA 5LCKA 2Y8OA 3RINA 3QD3A 3DQWA 5HIBA 3SDJA 3EHAA 3IOPA 5AP3A 5M4FA 3CTQA 3FUPA 3BLQA 4FV6A 3OXZA 2J0LA 2B55A 4OTPA 4FVQA 3HAVA 3VS5A 1WCCA 4A9SA 4KD1A 4UEUA 3R7GA 5K3YA 4TZRA 2JEDA 4AOJA 4L7FA 4O1OA 3OCSA 2BRGA 4H3PA 1YDRE 2H8HA 1P4OA 3QGYA 2PVLA 3SV0A 4BCMA 3SG9A 2XK9A 4HNIA 4PTGA 5CVGA 2UW4A 3BEAA 3EQBA 3KXXA 4IB1A 1PXNA 5KX8A 3MI9A 2R3JA 1ZAOA 3ZC5A 3EL7A 3KEXA 4KWPA 3HRFA 4MX9A 3C13A 2G9XA 4JAIA 5JFXA 1OPKA 3HUCA 3WF7A 4Y72A 2OK1A 2YN8A 3AD6A 1W84A 5AM6A 5GJDA 2OI4X 4BGHA 3AC1A 4EQMA 4FV0A 3G5DA 4J52A 2ITPA 2XMYA 3E62A 3MGYA 2WU7A 5DPVA 3ZUUA 4ACMA 4YURA 3TUDA 4TWCA 4XLVA 4XMOA 4CLIA 2Y7JA 2Z60A 2JDTA 5EM5A 3RKBA 2Q83A 4FKPA 3OWPA 2BDJA 1XKKA 3UIMA 4FTAA 4PMPA 4FV5A 3DBEA 5BUIA 3PY3A 1OBDA 1XH5A 5IEVA 4O6EA 2BAJA 4JNWA 4RJ4A 4KIPA 3CPCA 4I4FA 3WZEA 2XKFA 3TNWA 2XK4A 5FTGA 2WELA 3U55A 5HQ0A 4OGRA 3QZGA 1CM8A 3DOGA 2P0CA 4V04A 3WF6A 4EH3A 4FKGA 2OSCA 1PXKA 1GZNA 4RIWB 2F7XE 4HYIA 1W0XC 4C0TA 5C03A 3R7UA 5IUGA 3OW4A 4LV8A 3RM6A 1FGIA 1OKZA 2BMCA 2YDIA 3ZS5A 4IFCA 1PRYA 3NUAA 5JH6A 3AGMA 2PZIA 4LL5A 2VO3A 4OTIA 4AX8A 1XBCA 3QQKA 3DPKA 4LOPA 5CXZA 4YJNA 1ZZLA 3Q9WA 3ZXTA 5DOSA 4IC8A 5CU4A 4S2ZA 5EOLA 4IQ6A 4AFJA 3R8VA 4RJ5A 2R3HA 3R83A 4DH1A 3CSVA 1Q8YA 2ZOQA 1XH6A 3DB6A 3LFFA 3NNWA 4V05A 4X3FC 5EW9A 5IUIA 3ZM9A 3BE9A 3QFVA 4I1ZA 4L01A 1IAJA 5IQIA 2FA2A 1AQ1A 2GNFA 2W17A 4O0YA 1J7IA 2C6DA 4N6ZA 3OMVA 5K9IA 4RIWA 3AC2A 3DAJA 5AUTA 3QD4A 1SYKA 4IB5A 4NUSA 5D9HA 2XNBA 2I0HA 4F0IA 2YITA 4AOTA 3BHYA 4IB3A 2R9SA 4WUAA 1K3AA 2WMWA 5IQFA 5H3QA 4FT0A 5E8ZA 1PXIA 5FWKK 4L3PA 2CSNA 5DEWA 2R64A 4UMUA 3QUDA 1RDQE 2YM8A 3ZLYA 4AA4A 3JS2A 4CFFA 4X2KA 4Q5EA 5I9UA 5AUUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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