1H1SA

Structure of human thr160-phospho cdk2/cyclin a complexed with the inhibitor nu6102
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
297
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Based Design of a Potent Purine-Based Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 296
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h1sA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h1sA01
4I3ZA 1J1BA 3MVMA 4AX8A 4GH2A 4CMTA 4E4LA 2H8HA 3TCPA 4QMUA 4XRLA 2R3PA 3OT3A 4U0IA 5CVFA 2I0VA 4BVUA 4BCKA 4BY9E 3E8NA 4I5HA 4WBBB 2NRYA 4J97A 4OT5A 4QQTA 2J2IB 3SKCA 2Z60A 1XH6A 4WNPA 5IQIA 5HE3A 4D5KA 3VUTA 3P79A 3QTUA 5C4LA 2OSCA 3W1FA 5HX8A 3WYYA 3DDPA 3PPKA 4BCMA 4CSVA 4DLJA 3FUPA 3HECA 3NGAA 4IZAA 3TIYA 2I1MA 1RQQA 1AQ1A 1O6YA 3F3VA 1DI9A 3DCVA 4YPDA 3UG1A 1GY3A 4RVLA 3KL8A 5IA4A 1VZOA 2WEIA 5TOZA 5K4JA 4QNYA 1PXOA 3VS6A 4I93A 2AC3A 4DYMA 3EN4A 5BYLA 2WMXA 4A9TA 3LMGA 3UE4A 2VTOA 5AA9A 3H4JA 2J5EA 2R3LA 4B0GA 2X8DA 5EOLA 2UVYA 4NK9A 2CCIA 5CVGA 2ZV2A 4AQCA 5FXQA 4ZTRA 5J7BA 3NMUF 4E5WA 4AE6A 5D10A 4CFWA 3G9LX 4ANNA 4D2RA 2R3NA 2V22A 4ACHA 3OOMA 5H8GA 4UMRA 3GBZA 5ANKA 3UO4A 4DGLC 2W1ZA 4BTKA 3I6UA 1KE9A 5ICPA 3FLSA 3IDBA 4V0GA 3UMWA 3UOJA 2XNMA 1KE6A 1M2RA 2CN8A 5AX3A 3FMLA 5AP5A 3C5IA 4IJPA 5GNKA 1W7HA 3CD8A 2B7AA 4O0VA 5GINE 4K9YA 4BHNA 3E3BX 4HGLA 3NYVA 5A6NA 1ZLTA 1I09A 4M14A 3FC2A 1W82A 4NJ3A 2VWYA 2E9NA 4FKSA 5CSPA 4IAZA 4R5YA 3TWJA 2GHLA 4LRMA 4XG6A 3KA0A 2JAVA 1F5QA 1FOTA 2GFCA 4FSRA 3CPBA 4IZ7A 4S30A 3WILA 3VF9A 4DTBA 5LCKA 1ZWSA 3F88A 3QQFA 4OAUC 2X7GA 2V7AA 2YA9A 3JVSA 4NIFB 3WZEA 3PA4A 3QQKA 1ZAOA 4XLVA 3E93A 4MVFA 3KXHA 2H9VA 2FSLX 3BLQA 3QAME 4HPTE 4UZDA 4FT3A 2IN6A 4X3FA 3TKIA 2BKKA 4JR7A 2XKEA 5HCXA 3BHHA 5AIRA 2VU3A 4KKHA 4QYYA 3QA0A 4BC6A 5JFSA 2B54A 3B2WA 4L3PA 2X8EA 3R71A 3PIYA 4FZFB 4HNIA 2BMCA 2VTJA 3C4WA 4LOQA 2GNIA 3SW4A 5KUPA 3R8VA 1ZARA 4LUEA 2YN8A 3DK7A 2VO3A 3EL8A 4YBKA 4OUCA 3V04A 4CT1A 3LFBA 4HYSA 1K9AA 3OCSA 3EYGA 2BZHB 5GHVA 1GZOA 4IX5A 1CKIA 2XRUA 5I3OA 1H07A 3VW8A 5KKRB 4YUQA 2WZJA 2ZAZA 3R04A 2ZMCA 3LHJA 2A1AB 3RAWA 1JBPE 4AW2A 4JAIA 4HNFA 4PTEA 5CEPA 4DT9A 3FC1X 4CXAA 4GG5A 4EWHA 1BKXA 3CPCA 3D7TA 2NP8A 4L6QA 3RAKA 5E9EA 4FK6A 2CKQA 3Q9XA 4RIOA 5LJJA 4JIAA 5J5SA 3WYXA 4O7ZA 4QP4A 4LL0A 4G6OA 1H1QA 5HICA 4FGRA 2GS2A 4LM5A 5FEEA 5EM5A 3Q32A 2VTRA 3A2CA 3V5QA 2VX1A 1KOAA 3PVGA 2HZ0A 3V8TA 4KIOA 5AAFA 2RL5A 2YIRA 5HTBA 1BLXA 4BZOA 2PUPA 1JAMA 5HOAA 4PRJA 5HD4A 3DPKA 5C8MA 2P55A 2PZPA 3ULIA 1KE7A 2GNFA 5FBNC 3ZEWA 4CG8A 3MV5A 4E6CA 4F1TA 1PKGA 4MF0A 4QYHA 5IZFA 3GB2A 2C6EA 3JPVA 1Q8TA 4G34A 1Q4LA 1Q97A 2HY81 2C0TA 2W1GA 5C01A 5J95A 3QQHA 5JQ8A 2JDRA 3L8XA 4I4EA 4QTEA 2HXQA 3EN9A 3L9PA 5JN2A 4Y83A 5JEBA 4O6LA 5KX8A 5M08A 1NA7A 2OZOA 4XMOA 3SHEA 1UU7A 4O0WA 4IM0A 1L3RE 4AN3A 2P3GX 1IRKA 3Q4CA 4C4JA 3OZ6A 4YHFA 1YQJA 1JSTA 4BDGA 3G2FA 3O8TA 3BV2A 4F65A 3HUCA 4ZEGA 2HCKA 2WTCA 1UA2A 4DEAA 3KU2A 1ZYJA 1PXKA 4EKLA 5KZIA 1R1WA 3F61A 3BU6A 1Y8YA 2AUHA 4FT7A 3RWQA 4E4XA 4KIKB 3KB7A 2CHLA 2QU6A 4HVHA 2XK7A 2FVDA 2Y8OA 4QMLA 5I5ZA 2GHMA 2W9ZB 2XH5A 2R7BA 3NX8A 3D0EA 4Y5HA 1PW2A 3BWFA 4Y8DA 4JIKA 2X81A 4YJTA 3I7CA 1ZYSA 1APME 2PTKA 2JGZA 4G16A 4AAAA 3QX4A 4FEXA 2YDKA 3KVXA 4L45A 2UW6A 4H39A 2ZM4A 4M0ZA 2G2IA 2PMIA 3K5UA 4QQJA 1R3CA 4I0TA 4NIFA 2C5YA 3MH0A 3C5UA 4MXXA 4PPCA 3UOLA 3ZYAA 4CYIA 2W1HA 4BRXA 1IASA 2J6MA 4IB1A 4C37A 4DN5A 4F0FA 3C1XA 3CKXA 3C4CA 4XRJA 4YTFA 3FLQA 3CY2A 4FKPA 3PZHA 2QCSA 4I4FA 4FX3A 1CSNA 1MRVA 4O7YA 2OJ9A 1O9UA 1CKPA 5C1QB 2W06A 2HZIA 2RGPA 4PPBA 4RSSA 2QOQA 4TYEA 4GT3A 4YZMA 3PRFA 4PMMA 3TEIA 3BU3A 2W1IA 5I9VA 4F63A 2P4IA 2XVDA 1TQPA 2A19B 2GQRA 4F7JA 1H1WA 1ZYLA 4PPAA 5HCZA 4WNOA 4CZUA 5I9XA 5ITAA 2OF2A 4XLIA 4CG9A 2C3KA 2WTKB 3DTCA 3GU5A 4WSYA 5KHWA 4E6QA 3BEGA 4ITJA 4L8MA 4WO5A 1YXUA 3R63A 4RGJA 1XH4A 3BQRA 3PY3A 2PZRA 4UYAA 5HBHA 5IA2A 3UYSA 2X6DA 3NUXA 5I9ZA 4RMZA 4AN9A 4ENYA 5JKGA 3RNYA 1Z5MA 5BVKA 3ODYX 4D4VA 4L7SA 2GTNA 3BQCA 4G3EA 4RX8A 5E8UA 4D55A 3HDNA 4G3GA 4IVCA 2B52A 5HI2A 5K5XA 2IVSA 2ITYA 3G33A 3G51A 4U8ZA 3FEGA 4JX7A 4FKQA 5ANGA 5HE2A 1NW1A 5FQDC 1OZ1A 4ASDA 3K5VA 3SXRA 2W5AA 3ZOSA 4QP2A 3QC4A 3QKLA 1WBNA 1HCLA 4BR3A 4O0TA 2J0KA 1YKRA 2XA4A 3ET7A 3IW4A 4NCTA 4ZTNA 4ZS4A 5EI8A 4D2PA 4DFLA 4F1OA 4ARKA 5DG5A 3QLFA 2YLFA 4NW6A 1OI9A 4XV3A 3HNGA 3F7WA 5DYJA 4IIRA 4RJ4A 5FUTA 2XJ1A 1IR3A 4P5QA 3TJCA 4G3DA 4IAFA 4EYJA 5KO1A 4KA3A 4YJNA 3B2TA 4PMTA 5FBOA 5L6WL 1SMHA 4EK8A 4F6WA 4NTTA 2VTNA 3HRFA 4FKLA 4EQUA 2JDTA 4C35A 3R8UA 3MFSA 5E92A 4USEA 2UW4A 2FSMX 1FGKA 3EKKA 3ZZEA 3F9NA 4FKTA 4GEOA 4ZTSA 4BZDA 4GRBA 2BDFA 4TW9A 5AJQA 5T68A 4A06A 3BYSA 4Z9LA 5DWRA 4AACA 5F9EA 4G5PA 3LMHA 4ANQA 5CT7A 4FTKA 3EIDA 3F3WA 2PVHA 3D5UA 3EFKA 4RA5A 1NY3A 5F4NA 1H26A 4DEBA 4EK3A 3VHEA 4FSMA 4X6QC 5AIKA 2I0HA 4RWKA 4KRDA 3NCZA 5E7RA 3VVHA 4H36A 4QMYA 4C4FA 4D2TA 1FINA 3KEXA 5G6VA 2C3LA 1OITA 3TN8A 4KIKA 3SVVA 4DFUA 2R3JA 2WIPA 3GVUA 3OW4A 3R9NA 3LFFA 4BDAA 4EHZA 4BCFA 5DMZA 3LM0A 3FBVA 4WHZA 4AOJA 3PLAE 5CF6A 4FBXA 4ZP5A 5HO8A 4AN2A 4JJRA 3SGCA 1LUFA 4J1RA 5CY3A 1YXSA 1H1SA 4O83A 2QQ7A 3MYGA 3ORZA 3DK6A 4G5JA 5ETFA 2B9IA 5LCJA 3CQEA 4AU8A 4C34A 4O38A 4C38A 3ATTA 3EN6A 3GC0A 1BL7A 4BCHA 4BCOA 3RAHA 2QR7A 1ZYCA 3LMIA 4YTCA 3MVJA 2Y4IC 2XIRA 2V5QA 2VRXA 3DK3A 4JDJA 5AR7A 4USDA 3UO6A 4GKHA 5AR8A 1PMVA 4F7NA 3Q96A 5E8YA 5I9UA 3ZLYA 5EG3A 3MN3A 4L52A 3E8CA 3IQ7A 4UWYA 2YISA 5JZJA 4R77A 3NNXA 1XH8A 2J5FA 2ERZE 2A2AA 3KXZA 3ZBXA 4EI4A 1PYXA 1WZYA 2UUEA 2F2UA 1UWJA 2ITVA 3G5DA 3KULB 4GT4A 4IXPA 4NM7A 4U43A 3W8LA 2OU7A 2OIQA 3FYKX 5FTGA 3ZSHA 5FP6A 2BAKA 4I6BA 1NT2A 2IZSA 2WPAA 5EHLA 3E7OA 2F9GA 4DGNA 5E8XA 5DE2A 3VHKA 2W7XA 1O6LA 4AW0A 3PP0A 4O91A 3PG3A 4BDKA 4MYGA 1OPLA 4QMNA 2QLQA 2G15A 3OUKA 4YLJA 5HNBA 5CAOA 3LFDA 1URWA 2QOKA 2BRMA 2G2HA 3QRKA 4YNEA 4AZWA 5KZ0A 4FV4A 3TKHA 5IQHA 4CFNA 2GMXA 3R1YA 4RBLA 4ASEA 4CMOA 5BVDA 3HA8A 2WKMA 5HIEA 3HMPA 5HTCA 2FSTX 3GFEA 3MW1A 1B39A 5CT0A 3VUHA 3R02A 2WAJA 4HCTA 5BX0A 4H1JA 3HV3A 4QYEA 3UG2A 2BRHA 3U6HA 4ZXTA 1QMZA 3DKOA 3EB0A 3IKAA 4L46A 4RRVA 3GFWA 4R8QA 2WMTA 1U46A 1X8BA 3DNEA 3T9TA 1P4OA 1Q8UA 2HOGA 2YEXA 4JG8A 3N4VA 1TKIA 4EZ3A 4EHGA 4OTGA 5AADA 2OGVA 3C50A 3KN6A 5F20A 4L67A 4NTSA 1Y91A 3U8WA 3A62A 2JLDA 3AC8A 3HV4A 4NFNA 3QCSA 4GUEA 4P7EA 4EHEA 4PY1A 1ZMWA 4X21A 3ZLXA 4FR4A 4FL1A 4O0YA 3OWJA 4FSTA 4EZ7A 3K54A 5CF5A 3R1QA 5L6OA 5IQFA 4PDPA 3GU6A 3O96A 4WBOA 5LWMA 2KTYA 1WAKA 3GCQA 4K0YA 1WCCA 4TRLA 3AGMA 2VO7A 2WMWA 5CI7A 2ITZA 2GQGA 4OR5A 4FZ6A 3QTSA 2X39A 1A06A 5HESA 3I6WA 4BDEA 5A6OA 5JMSA 5KBRA 3Q5ZA 2OJJA 4NJDA 3FI4A 4TT7A 5IUIA 3EQRA 4YZCA 5J9LA 3NW7A 1Q41A 3RCDA 3SV0A 3ZSIA 3TACA 1LR4A 3VS2A 4AA5A 1ERKA 2HY0A 2ZDUA 3OEZA 2YACA 3RKBA 3LQ5A 4YZDA 3BLRA 3PE2A 3R7EA 1SM2A 3NYXA 2W4OA 2XM9A 1RJBA 3NIZA 3MPTA 4UZHA 1YI4A 3W55A 4C59A 3MJ1A 2ZDTA 1PRYA 3QKMA 4F6SA 1XJDA 2YCRA 3E8DA 4CQGA 4FKJA 4PX6A 2WQBA 4FKVA 3MA6A 4GYIA 3TXOA 2YAKA 4OTWA 4FI1A 4O21A 5HBJA 2GS6A 5AV2A 3MESA 2C5XA 4JQ8A 2P2HA 2WMUA 3VIDA 2VTIA 4GVJA 2W0JA 4FVQA 4IX4A 5DPVA 3W32A 3N9XA 4RJ6A 5DR2A 2JKQA 4FV9A 4GIIA 4FEVA 3ANQA 3S2PA 2YWPA 2Z7QA 1J3HA 2J90A 3MSSA 2JC6A 3P1AA 3ZFMA 3KRXA 4OTPA 1FBNA 2QOLA 3IW7A 3PVBA 4YJVA 3LXLA 4DTKA 3O8PA 3FQHA 4U6RA 2OK1A 3LCOA 4I0RA 3IONA 4I6HA 3BHUA 4H1MA 4J52A 4MD9E 3EZRA 3KN5A 1XH7A 4ALWA 4GVAA 3CS9A 4EOSA 4MF1A 2W1DA 4I24A 3R7VA 3LJ2A 3MJ2A 3F5GA 3H9RA 5E8ZA 3ERKA 3L8SA 3TNWA 3MFRA 4TPTA 4NU1A 3IPHA 4DH3A 3D5XA 4FMQA 5EHOA 5JFXA 5KCVA 4M13A 3DJ5A 2YJRA 4R6VA 4OAVB 2HWOA 3LKMA 3DAKA 3WE8A 2GNGA 2VWBA 3O2MA 3KULA 4LV5A 5KMKA 2EVAA 2FO0A 1UVRA 3NNWA 3SG8A 3UNJA 5IQEA 5GIOE 2ITXA 2GQSA 3E88A 4JS8A 3AGLA 2BKZA 2PK9A 2X1NA 3G6HA 3QXOA 4KKGA 5GJGA 4CV9A 1H4LA 1CTPE 3PSDA 3VF8A 5M44A 2BAJA 3QRUA 2P2IA 2UW7A 2B4SB 2WMRA 5HG9A 5M4FA 4DT8A 4O1OA 2JDVA 4FIGA 3OT8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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