1H25A

Cdk2/cyclin a in complex with an 11-residue recruitment peptide from retinoblastoma-associated protein
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
294
structure length
293
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Specificity Determinants of Recruitment Peptides Bound to Phospho-Cdk2/Cyclin A
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 293
sequence length 294
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h25A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h25A01
4O96A 2BRHA 3F3VA 2WMRA 3NAYA 3Q9XA 1MRYA 3ORKA 3LJ2A 3MPTA 4X2GA 1OPJA 2A4LA 4EK6A 2EWAA 1OIRA 5HO8A 1IG1A 4MHAA 3DZQA 1PMVA 2W9FB 3BHYA 3HV3A 5CXHA 5GZ9A 1REJA 4AW0A 4IZ5A 5A4TA 1YI4A 3TKUA 4L8MA 4ENYA 1YRPA 4CXAA 4NUSA 5HNBA 1U54A 2QOLA 3QQHA 5T6KA 5FUTA 4DLIA 4O83A 3LFQA 3VBXA 1NVSA 3MW1A 2UVYA 4ID7A 4CQEA 5I9WA 2C5YA 3KGAA 1JWHA 2BHEA 4D4RA 3V01A 5EK7A 5IEYA 3ZM4A 4UYNA 2QOKA 3V6SA 3EYHA 4BZOA 1PRYA 4Y95A 5M07A 2BDFA 1ZOHA 3KK9A 4U80A 5HTBA 3TV7A 2BVAA 5EW8A 4MXYA 3MTLA 2RFEA 3WZUA 5M56A 5FXSA 4FKJA 3OBGA 5G1XA 3WI6A 3E88A 3GFWA 2DUVA 3CEKA 5FBOA 5TE0A 5K5XA 1CMKE 1YW2A 2ITVA 4C3RA 2XNGA 2EXMA 3F2NA 3BV2A 2YLFA 4RMZA 3VF9A 4YGAA 4S33A 3UP7A 4RIOA 4S32A 4EH5A 3R8UA 3OOGA 4C02A 1OMWA 4EH4A 2PE1A 2R3JA 2RF9A 2EB2A 3ODYX 2BPMA 2GNLA 5EM6A 4F7NA 4P2KA 1OKZA 4IW0A 4NM0A 1HCLA 2WPAA 2ONLA 4GT5A 5HG8A 3UC3A 5ANIA 4U3YA 1PHKA 1WVWA 3QQGA 4QQ5A 4DTKA 4PTGA 3TNHA 3DAKA 2VO6A 3Q96A 2G01A 2XK3A 3P9JA 4UB7A 3QTRA 3R8VA 3EKNA 4BWPA 5E8TA 5LJJA 1W84A 4FG9A 4AN3A 3GC9A 4QQCA 4PP7A 2VTIA 2X9FA 4IFCA 4FV3A 4LGGA 3W16A 3R7UA 5A4LA 3IECA 5EM5A 2QCSA 3MY0A 2XK6A 3QAME 3F3UA 4MNFA 4RLLA 1SMHA 1YVJA 1UNLA 4MH7A 3SXRA 2C4GA 3HUCA 1GIJA 3HV7A 4YLKA 3EB0A 2IVTA 3DQXA 1KE5A 1XQZA 2HZ0A 4U43A 1URWA 2ETKA 4JXFA 4FTAA 2ERKA 4L7FA 5J95A 3V5QA 4RVTA 4RJ8A 4I5CA 4JDJA 4PTCA 4C4HA 1YDRE 2E9UA 2P0CA 4FTTA 3G6GA 5HE3A 1BMKA 3BYMA 2R0UA 3VS0A 4TL0A 5KKRC 4APPA 1GZKA 1YHVA 2XMYA 4MAOA 4IAYA 3QKLA 3QRKA 4O21A 3L1SA 2WQEA 2BHHA 4BDEA 2VX1A 4GEOA 4E4LA 4CZUA 3QL8A 5EOLA 4DGMA 3TEIA 3LQ3A 4FKIA 4BCQA 4G6OA 5T68A 2OF4A 4KSQA 3C9WA 3R7GA 5E92A 5K9IA 4FIFA 4F63A 3OW4A 4EOIA 5CEMA 3RPVA 2J0IA 2W1IA 2WMSA 4XP2A 3PA5A 5C8NA 4F1MA 5DLSA 2RFNA 2AC5A 2QO7A 4J7BA 2HW6A 3UG1A 5JSMA 3E8DA 4FZAB 3CR0A 1REKA 3CKXA 1VEBA 4FNXA 5EYMA 3RK5A 1PXJA 2W05A 3OCSA 4DTBA 2YZLA 5AR4A 4W8DA 3A2CA 3OROA 4K8AA 1YI6A 3BBTB 3TV6A 4O0RA 4C4IA 5IU2A 5AP1A 4A07A 1LR4A 4H39A 4RZVA 4TWNA 3QRUA 5AP2A 4AA5A 4RFYA 3RAWA 4AFJA 2XKEA 4ZSAA 2UZBA 4GS6A 5HNIX 5EQPA 4KA3A 3LAUA 4ASEA 3II5A 5HG5A 4KIQA 1U4DA 3IKAA 3OWKA 4O27B 1ZYSA 3COIA 4OT6A 2XK4A 4YJUA 4ANBA 3O2MA 1H24A 3GC0A 4JX3A 1YKRA 1OL7A 3MH0A 2E2BA 3R9OA 2R7BA 4NM7A 4K0YA 1SVGA 2QO9A 2FGIA 3MI9A 4CTBA 5DR6A 5JMSA 4MTAA 3NYNA 3P08A 4ZY5A 4EK4A 5KUPA 3V5JA 5J7BA 4AUAA 4E93A 2WU6A 4E5AX 4MK0A 4EH6A 1LUFA 3S4QA 1KWPA 2ZDUA 4FOCA 4FV6A 4J8MA 4YHFA 5AMNA 2EU9A 4G1WA 5EQEA 4U6RA 4TY1A 4YSMA 2VWWA 2ZMDA 4IX4A 5L8JA 1SZMA 3TNQB 4IB0A 2P3GX 2W96B 3ZDUA 4M13A 5FXQA 2JFLA 2X0GA 3VBQA 4IVDA 3RMFA 5AP3A 3QZFA 4DBXA 3DJ5A 4CKJA 3RI1A 3PXZA 2OXXA 1BL6A 2GS7A 3LJ1A 4QO9A 4FNWA 2VGPA 2WB8A 3C4CA 4FT7A 4L45A 3ZLSA 3L9LA 4FSYA 5IQGA 3Q5IA 4EEVA 3ALNA 4I5HA 4FKWA 2ITUA 3AT3A 4XUFA 3ZS5A 1IEPA 4RJ5A 4XEYA 4TYIA 4YJSA 3VHEA 4YU2A 4B8MA 3UODA 4FSUA 5HESA 3KXMA 4BDIA 5AM6A 4TYHA 1KV2A 2ACXA 5TT7A 4FIHA 5LMBA 3FQHA 3QUDA 2W4OA 2ZM1A 3CGOA 4IFGA 3O8UA 3CP9A 3RPYA 3DOGA 4GFOA 2QVSE 3G33A 5F9EA 2GQGA 3NAXA 4FTJA 3TNWA 4M97A 3NX8A 4CCUA 2J0JA 5H8EA 4M69B 2C3JA 3OEZA 2HWOA 5B2LA 2AUHA 3F3TA 4TNDA 4O7RA 2QKWB 3P1AA 4UXQA 4I5PA 4RA5A 3Q2MA 2W1GA 3PY1A 4U41A 1OITA 2IO6A 3D2KA 4PMSA 2R3IA 2C6OA 3IDCA 3GENA 1A06A 2Q0BA 3GU5A 4RIYB 1X8BA 1QPDA 4BCHA 2Y8OA 5L6WL 2FSOX 3DCVA 5HD7A 4C4FA 5IZFA 1Q62A 3OEFX 1XH5A 5M06A 3HMMA 2PVNA 4YTIA 4OBQA 1OIQA 4TYEA 3T8OA 5ANEA 4DEAA 3R8ZA 5AUXA 3DKGA 4UMPA 2XKFA 4YZDA 5JFWA 4HVIA 3CY3A 2WIPA 5KMIA 3ZZEA 3UDBA 4D58A 4PDOA 4FC0A 1PMUA 4FG8A 5LMAA 3S0OA 3OC1A 3Q9YA 4L3LA 2BMCA 4R77A 4XG2A 2OZAB 3Q53A 4BR3A 3DNEA 4ANQA 3R30A 3OUKA 4J97A 3MIAA 3KFAA 2QU5A 4PF4A 3MIYA 4KBAA 3LM0A 3D5UA 3AC2A 3O96A 3PG3A 4ZZOA 5GIOE 3DT1A 3D2IA 4FZFB 3RNIA 4APCA 5M53A 3KXNA 5HCYA 4WRSA 3LFFA 1SVHA 3OS3A 4IX6A 2QR8A 3D7TA 5BMMA 4C38A 2X81A 3BU6A 4PPBA 3RM6A 2ESMA 5TOZA 3E93A 4JQEA 1OUKA 2Y6OA 4L53A 3GCQA 4OTFA 1H1PA 4BCIA 3QTIA 3IDPA 2CGVA 3PRIA 3PVBA 3F61A 1NT2A 5AP5A 3UP2A 3UOLA 3P79A 4CV9A 1YWRA 5BVEA 3EHAA 4E4MA 1OECA 3PRFA 4Z7GA 2VTAA 4F64A 4S30A 4W4XA 4PL5A 4IE9A 4F0FA 4YSJA 3HGKA 2ETMA 3IDBA 4IX3A 3NUUA 3B2WA 1YHSA 2YWPA 2XVDA 3NYVA 3QWKA 4UV0A 3CD3A 4XOZA 4OBOA 4I0RA 1F3MC 4PMPA 4BCOA 5IA1A 4D55A 3DK3A 5H3QA 3C1XA 4LI5A 2Y4PA 5JFXA 3KEXA 4H3BA 1LP4A 5KZ0A 4MNEB 1PF8A 2VWZA 4X3FB 4GYIA 3E5AA 5LCKA 3OF0A 3EJ1A 2VWIA 4AXAA 1YOMA 3H10A 3PP0A 3T3VA 3GC7A 3MH1A 5J5SA 2IVSA 4FKTA 4WNMA 5F95A 4LMNA 3V8TA 4LRMA 2XH5A 4UYAA 2EXCX 2IW9A 3T3UA 4AG8A 2QC6A 3L8VA 4EOOA 4KABA 3TUCA 3OTVA 4BB4A 1SNXA 3H9OA 3KRLA 3QCQA 2C1BA 2F2UA 4EHVA 5CF8A 2X7OA 4D1XA 3DBFA 2XYNA 2UZNA 3ZONA 2QI8A 3JY0A 4IDVA 5HIDA 4TNBA 4IVAA 4M0ZA 3HA8A 2B7AA 3KF4A 4LGHA 4I6QA 3NW7A 4DLJA 1G8SA 3GC8A 4EOLA 4QP9A 4FVQA 4EWQA 5BMSA 3ZO1A 4ZJVA 4NKAA 5ICPA 5AUWA 5CSPA 1Q8WA 3OP5A 5L2SA 3FLZA 4FSZA 4D9TA 3HMPA 2XK7A 4J8NA 2OICA 1RW8A 4M12A 4YTHA 3OZ6A 1OL2A 4J95A 5AAEA 4R3RA 5IH6A 1XO2B 1YHWA 3K3IA 4IZAA 1ZOEA 1GZNA 3LFBA 3ZO2A 2CKOA 3FSFA 2QQ7A 1WFCA 1WZYA 2GCDA 3OCTA 4MF0A 4ZTNA 2UZLA 3QD3A 3U87A 5CANA 3HRCA 4FBXA 3UYTA 1OVEA 4FEWA 3UVRA 4FV8A 3QRIA 4F0GA 3VJNA 4XBUA 3FXXA 4BGGA 5LVMA 4RJ7A 1BI7A 1R0EA 3SC1A 3GU6A 3GQIA 4MYGA 5IA2A 4HCVA 3NR9A 3UBDA 4KUJA 1J91A 3ELJA 4C61A 3PIYA 3H0YA 2C6EA 2HY81 3QU0A 4I22A 3PJ2A 4NT4A 4RX7A 4DFXE 3BWJA 2H9VA 2R3GA 1OL1A 4DH5A 2C47A 3QTXA 4IB3A 2QD9A 2GQRA 3GVUA 2XEYA 4O2ZA 4CYJA 3DJ6A 1B39A 4YR8A 2PZRA 2V5QA 3KULA 3FYJX 3RAHA 3RJCA 4YLLA 2UZOA 2WMQA 4AT3A 2QODA 3LCDA 4L7SA 5E8VA 2BZJA 3MFUA 5CQUA 3BZ3A 3HA6A 4NWMA 3W2RA 5CEPA 5JGAA 3VW8A 4BF2A 5HTCA 4UWYA 4FKUA 4WUAA 5FEEA 3VS4A 1FVTA 2GHMA 3KRJA 4YHJA 3QFVA 4YZMA 4RJ6A 3ROYA 3T9IA 2ZV9A 4RSSA 4XMOA 4X2KA 3UO5A 4M69A 5L6OA 5IA5A 1YXXA 2YFXA 3FLSA 3I0QA 4FYNA 3ERKA 3PJCA 3PY0A 2CNVA 2R64A 3BX5A 3HL7A 4LV8A 3UIUA 4FT5A 3ZRMA 2PVRA 3U55A 2YISA 2C5NA 1ZZ2A 2VAGA 3LW0A 4AZFA 1G3NA 4DH1A 4QMVA 4RIYA 1O6KA 3M1SA 5D11A 5M55A 3UE4A 2WNTA 2YAKA 2Y6MA 4YURA 3F7WA 3ZHPC 2CJMA 2ITYA 5I9YA 4DE4A 4HGEA 4JRVA 1Z9XA 2UZWE 5IMEA 4ZAUA 5JGBA 3BLHA 2NO3A 5C1QB 4I3ZA 3ALOA 4YP8A 3ZLXA 4M3QA 5L2WA 4UWCA 4L00A 3A7GA 1U54B 4DGOA 3UOJA 4DF3A 5HX6A 4RBLA 4AZWA 2OZAA 1NVQA 2V7AA 4IC7A 2WIHA 4HYIA 1E1VA 2UW3A 4F1TA 5CASA 3I0OA 3QCXA 2VD5A 4U45A 4R7HA 1OUYA 1AD5A 3PA3A 4EONA 1XBCA 3S2PA 2R2PA 1Y6BA 4QMNA 4EQMA 4JBQA 1GIIA 4IZYA 2R3NA 2Z2WA 4DH7A 3DU8A 3PE2A 4M15A 4EH8A 1A9UA 2C6MA 2UW7A 3K3JA 2C3IB 2J0LA 4PP9A 1SM2A 4FIGA 3W2CA 3ORLA 1GIHA 3ACKA 1PW2A 4O0YA 3ZXZA 3LLAA 4C2WA 4QQTA 2UZTA 1XH6A 4H58A 3LJ0A 1S9IA 3A4OX 3D9VA 5DE2A 2BFYA 4FIJA 5DBXA 2H8HA 4E6QA 2JIIA 3W2QA 4OTHA 4D28A 2XM8A 1WAKA 2YDKA 3PXFA 4C4JA 1IA9A 3DTCA 3FLQA 3DJ7A 3PP1A 3VN9A 5J9ZA 4DEBA 4R78A 2XEZA 3Q60A 5KMKA 4O7ZA 3N4UA 3MWUA 4G5PA 3V3VA 4S34A 3UPZA 5E8XA 4W9WA 4ZMEA 2ZVAA 1VYWA 4F9CA 3R9HA 3KF7A 3I7BA 3OCGA 3KN6A 4QPMA 3GEQA 2GHLA 3NIEA 4FMQA 3PA4A 2ITWA 2XNPA 2YM7A 3QBNA 4MNEA 3VC4A 3DBQA 5L6PA 3FLWA 4OUCA 5HOAA 3QZIA 2XNMA 3PPKA 3SW4A 1URCA 3C5IA 4ASXA 3THBA 3KRWA 3H0ZA 2JD5A 2PZYA 2QONA 3GBZA 3LCOA 4C8BA 2I6LA 4DCEA 3QC9A 3QLFA 3SD0A 3PSDA 4EH7A 3WIGA 1ZRZA 4XH6A 3UQCA 2X2KA 4G5JA 5IQFA 3KXGA 5DWRA 4YJNA 3DA6A 4XG3A 4E6DA 3N51A 3EOCA 5HQ0A 4D1ZA 5ETCA 3WE4A 3OXIA 3VQUA 5IQCA 1JVPP 1UNGA 5CU2A 1OPKA 4XRJA 4F0IA 5EKOA 3V5TA 2G1TA 5DRBA 4KBCA 2VWUA 3AC3A 3JYAA 4PWNA 2OIBA 3QTQA 1ZAOA 3O7LB 1GZ8A 4BGQA 4D4VA 5AIKA 2C68A 2GFSA 4E6CA 3GU7A 4O22A 3RPSA 3Q4ZA 4DINA 2OXYA 2Y9QA 4C59A 4V0GA 1H26A 1IASA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5FGK A;  1JOW B;  2AC3 A;  3F5G A;  3Q5Z A;  4EOJ A;  3R2Y A;  4I4E A;  2WEL A;  4GRB A;  3TZ9 A;  4QOX A;  5AFV A;  2O2U A;  3NVM B;  5IUI A;  5L3A A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4O96 A;  2BRH A;  3F3V A;  2WMR A;  3NAY A;  3Q9X A;  1MRY A;  3ORK A;  3LJ2 A;  3MPT A;  4X2G A;  1OPJ A;  2A4L A;  4EK6 A;  2EWA A;  1OIR A;  5HO8 A;  1IG1 A;  4MHA A;  3DZQ A;  1PMV A;  2W9F B;  3BHY A;  3HV3 A;  5CXH A;  5GZ9 A;  1REJ A;  4AW0 A;  4IZ5 A;  5A4T A;  1YI4 A;  3TKU A;  4L8M A;  4ENY A;  1YRP A;  4CXA A;  4NUS A;  5HNB A;  1U54 A;  2QOL A;  3QQH A;  5T6K A;  5FUT A;  4DLI A;  4O83 A;  3LFQ A;  3VBX A;  1NVS A;  3MW1 A;  2UVY A;  4ID7 A;  4CQE A;  5I9W A;  2C5Y A;  3KGA A;  1JWH A;  2BHE A;  4D4R A;  3V01 A;  5EK7 A;  5IEY A;  3ZM4 A;  4UYN A;  2QOK A;  3V6S A;  3EYH A;  4BZO A;  1PRY A;  4Y95 A;  5M07 A;  2BDF A;  1ZOH A;  3KK9 A;  4U80 A;  5HTB A;  3TV7 A;  2BVA A;  5EW8 A;  4MXY A;  3MTL A;  2RFE A;  3WZU A;  5M56 A;  5FXS A;  4FKJ A;  3OBG A;  5G1X A;  3WI6 A;  3E88 A;  3GFW A;  2DUV A;  3CEK A;  5FBO A;  5TE0 A;  5K5X A;  1CMK E;  1YW2 A;  2ITV A;  4C3R A;  2XNG A;  2EXM A;  3F2N A;  3BV2 A;  2YLF A;  4RMZ A;  3VF9 A;  4YGA A;  4S33 A;  3UP7 A;  4RIO A;  4S32 A;  4EH5 A; 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