1H28A

Cdk2/cyclina in complex with an 11-residue recruitment peptide from p107
Total Genus 72

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
297
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (4-9)TI1 (0-3)TI3 (23-26)EMPTYTIV1 (13-16)TI4 (24-27)S3 (29-36)AH1 (46-56)TI5 (60-63)AH3 (101-121)S9 (140-143)S4 (66-72)S5 (75-81)S6 (85-86)S8 (133-136)AH2 (87-93)3H6 (284-286)TI13 (286-289)S7 (123-124)TIV8 (153-156)S10 (150-151)TIV7 (125-128)TI8 (146-149)3H1 (130-132)TI7 (136-139)TVIII1 (177-180)O1 (161-163)AH4 (171-175)AH6 (208-217)TIV9 (201-204)TIV10 (217-220)TIV13 (268-271)TII1 (227-230)TIV11 (223-226)3H3 (230-232)TI9 (224-227)TI10 (233-236)TI11 (237-240)AH7 (248-251)TI12 (252-255)AH8 (257-266)TIV14 (276-279)3H5 (279-282)S2 (18-23)TIV2 (38-41)TIV3 (40-43)TIV5 (72-75)AH5 (182-198)3H2 (166-168)3H4 (271-273)TI6 (94-97)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Cell cycle/transferase substrate
source organism Homo sapiens
publication title Specificity Determinants of Recruitment Peptides Bound to Phospho-Cdk2/Cyclin A
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 72
structure length 296
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h28A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h28A01
2YDKA 4P7EA 1OKVA 2Y9QA 2NNWB 3OC1A 2QU5A 3QGYA 4BF2A 3WZUA 2I6LA 3B2TA 4C7TA 5E4HA 4I6HA 2JIVA 3KXXA 3QU0A 3QXPA 5LJJA 4HVHA 3VS7A 3EOCA 2VTMA 4N0SA 1AD5A 3UQGA 4RRVA 4FIGA 4Q9SA 5AA8A 3ITZA 4FBXA 5EM6A 1WAKA 3BU6A 5LQFA 2PTKA 3DDPA 3BGPA 5ANDA 4I23A 4YLJA 4PRJA 3TL8A 4C4JA 2IVVA 4W9WA 3UP7A 3RAHA 2GMXA 2PVFA 3TNPC 5BYLA 4DHFA 3C5IA 5ETFA 4ZZNA 2R3PA 2Z7SA 4NFMA 5GJGA 4USFA 3EL8A 5M56A 2NPQA 3I7BA 2P3GX 5ANOA 3VQUA 4FGBA 4TNBA 3R1SA 4WBBB 5HIDA 4CFWA 2BALA 4DH7A 3BU5A 4X3FC 2PYWA 3Q5ZA 2BAKA 3RBWA 2OZAB 3EQCA 3CEKA 3LW0A 3MY5A 5E92A 1GIIA 2B55A 2WEVA 5EG3A 3F61A 2UVXA 2C5XA 4L6QA 5A4QA 4IMYA 1Q24A 4FK3A 1J7LA 4V0GB 5DI1A 3QLGA 4FEVA 3U8WA 4I0SA 2E2BA 4EHZA 3LCDA 5KO1A 4HZSA 3V8TA 2BHEA 2XK7A 4ZS0A 5EK7A 3Q53A 3QKKA 5AR8A 5BMMA 3TIYA 3ZMMA 3V01A 3SRVA 3TNHA 4ACCA 2CLQA 2AC5A 4NSTA 4OBQA 1PW2A 5BYYA 5I4NA 5EHLA 4QPSA 4D4RA 5DR9A 4YJNA 3PA5A 2RFNA 4Z7HA 4EJ7A 1CKIA 4FZFB 4IB3A 4QQJA 1ZMUA 2O3PA 3FQEA 4K11A 2PVHA 2W1GA 2WTDA 4MD7E 3SXFA 3WI6A 3ZDUA 4AOTA 4YURA 3PPKA 1SVGA 3FQHA 5HO8A 1B39A 4DTBA 1KE6A 5DGZA 4QPMA 1Y6BA 4LV5A 2E9VA 1K3AA 5EI6A 3RZFA 3A7FA 4AGWA 4K6ZA 4XP2A 1RE8A 2BAJA 2JLDA 4KIKA 3DB8A 2JDSA 5AUXA 4FEQA 2VAGA 3KULB 4IDTA 4YSJA 5BUJA 5BUEA 4EKLA 2C0IA 3KRJA 3QTZA 4FTKA 4AOIA 4C4EA 3VO3A 1CSNA 4S31A 5CQWA 3FUPA 2YWVA 4ZY4A 3O51A 4NJDA 3EZVA 1UNGA 3OUKA 2UZNA 4ZP5A 3R71A 2WMXA 4MKCA 2O2UA 2VWUA 3ZH8A 4FKGA 2ITTA 3ZZEA 4ORKA 2NRUA 3O7LD 4YTFA 3K5UA 4BCJA 3TJDA 1JSTA 5DE2A 4F08A 2FUMA 4WNMA 4Z16A 3HVCA 4PNKA 3B2WA 4X2NA 2WTJA 2W1CA 4EKKA 3FZSA 2XM9A 3ORTA 1NVSA 2OGVA 4HVIA 4DTAA 1R0EA 5D11A 4AZEA 3BYVA 4PTEA 3SDJA 3VS2A 4UV0A 2ITUA 5L6OA 3K3JA 4F63A 2UW5A 3R30A 4I0TA 3ENHA 4XHKB 3PPJA 3LOKA 3BU3A 4Y8DA 3Q9ZA 3GBZA 3UYSA 4E4XA 1UU7A 4RJ7A 5KHWA 2CKEA 5JQ8A 3C4CA 2R7BA 1YXXA 3COKA 2E9OA 1XWSA 2VX1A 3BRBA 5C01A 3UVRA 4UWCA 1YDRE 3CR0A 1M14A 4NWMA 4DBNA 5EQYA 2Z8CA 2REIA 1OL1A 2J0MB 3VUMA 4DT9A 3AT3A 3FBVA 4QTCA 3BV3A 4YJRA 1PJKA 5AIRA 5F20A 4E3CA 2A4LA 2OJFE 5TT7A 3F88A 2G9XA 3CY2A 1Q8WA 2W1ZA 4QMYA 3PTGA 4FKVA 4PPBA 4ZK5A 3GCVA 1W8CA 4NKSA 5HEZA 4I5MA 4L52A 3OXIA 2W4KA 3QRIA 1VZOA 2X2MA 4XEYA 3ZEPA 3MFTA 3GT8A 4H1JA 3U4UA 5CWZA 4O7SA 5CXHA 4XG6A 4H58A 2VNYA 4F7SA 4I4EA 2QODA 2PY3A 2UZUE 5HQ0A 4TWPA 2VN9A 2JIIA 2ZMDA 3LFFA 3HX4A 4Q5HA 4RQVA 4I5PA 5EYCA 3ZS5A 5CU4A 2GQGA 3NWWA 1CKJA 3GEQA 3PXKA 3QCYA 4FTLA 5HI2A 4ZZMA 4RPVA 3TXOA 3ZCLA 3DGKA 5C03A 3SLSA 4O91A 3FL5A 3EKNA 2W5BA 1P4FA 3MVJA 4O6EA 4I0RA 4YZMA 2WTIA 4GRBA 1OBDA 2E9NA 4ID7A 4PDYA 4D2VA 1LEWA 5AR4A 4G17A 4KRCA 4QMWA 3TKIA 5IQIA 4MXXA 3ZSGA 2GNJA 3QRJA 4ZTHA 1F3MC 4FIIA 2DWBA 2GNIA 3D2KA 2VWYA 4LRJA 4TN6A 3FI8A 4PX6A 3V5QA 2XK3A 3MTFA 3AC3A 4MBJA 4BTMA 1PHKA 1O6YA 3EB0A 3WZDA 3FHRA 5E8UA 3WOWA 3CP9A 2XNBA 4DGOA 4FIEA 1OL7A 3BGZA 2YLFA 2G2HA 3HMNA 4HPUE 4IWOA 5IEXA 3UQFA 1Z5MA 4AA0A 2CGVA 4FR4A 3C0GA 2ETRA 4CXAA 5EM7A 2H96A 3HP5A 3NCZA 4YZNA 5CLPA 2LAVA 4Z3VA 3F6XA 3KL8A 2EVAA 2WD1A 3CTHA 3I60A 3DKGA 3VS1A 3RK9A 5JZJA 4BKZA 4AU8A 5D12A 2GU8A 1J1BA 3FQSA 4OTHA 3WE4A 4GCJA 3WIKA 5FTGA 3U54A 2VU3A 4FKJA 4MD9E 4FOBA 5A4LA 2G2IA 2GHLA 2FH9A 2QKRA 2B9JA 3LCSA 3PA3A 4QP3A 4YHTA 3RAKA 3SAYA 1TQIA 4QTAA 4A9UA 1J7IA 4OTRA 4QT1A 3LMIA 2WTKB 2ZM1A 3NYXA 3W2RA 3TTIA 5IISA 1DAYA 4F65A 1GY3A 3C0HA 3TIZA 5IQGA 5CS6A 5HHWA 4ANNA 1GZNA 5L2TA 1REKA 4L68A 4JBOA 3QUDA 2RFDA 4C3PA 5B7VA 1XHAA 3D5XA 3FL4A 3MSSA 2OJIA 3VUIA 2I0VA 2KTYA 3IW8A 5HD4A 5AAEA 2XEZA 3PJ1A 1JVPP 5DLSA 1Q8TA 5CI6A 3PP1A 4RBLA 5BUIA 3E88A 1YHSA 3G6HA 1E1VA 2UVYA 4Y5QA 4L01A 4FIHA 4K2RA 3VRYA 3O2MA 2J5EA 4IVDA 2O64A 4XMOA 3P7BA 4M7IA 1I09A 3KMUA 2W06A 3E62A 1OPJA 2JFLA 4L43A 2JDOA 4MVFA 5T6KA 3R02A 2BUJA 1H24A 3R9NA 4BKJA 3ZZWA 3PY3A 2A1AB 4DC2A 5CALA 4ENYA 3R1YA 2QD9A 4PDOA 3LXLA 2VTNA 1Y8YA 3NR9A 2WMWA 1TQMA 4FTMA 3LZBA 3ALOA 3MH3A 3KXHA 3RHXA 1LPUA 3ZXTA 4EOLA 1OBGA 3LHJA 3ZO3A 2Y0AA 5GJFA 4D2TA 3IO7A 2UW4A 3D7ZA 4HVGA 5LVOA 2BDWA 2JDTA 3L8XA 1YDSE 5E8XA 3VN9A 3RNIA 4CD0A 4QD6A 3FZ1A 3OOMA 5CEIA 2VX3A 1CTPE 4OGRA 1OITA 3EN6A 3W1FA 2OJ9A 2QO2A 3COHA 2NP8A 2GNGA 4NW6A 4FYNA 5FXRA 5HTIA 5JFSA 2PUIA 5EW9A 3UZTA 4RX7A 3O7LB 5AUTA 5JFVA 4BC6A 1ZY4A 2GFSA 4FVQA 4BICA 3BELA 3VULA 4M97A 2XEYA 4L3LA 4K33A 4FNWA 1OUYA 1J7UA 5IQEA 3TZ8A 4LG4A 3KCKA 4R5SA 4G9CA 4FT9A 2WQNA 4I41A 3UPXA 3AMAA 3FPQA 2C6MA 3PJ2A 5DH3A 3QTSA 4C0TA 1R39A 4QMNA 4M66A 4L9IA 3AC8A 4QOXA 2XBJA 3Q32A 4FKRA 3BYOA 4M14A 4MXAA 4X3FA 4D4YA 2OLCA 4FKPA 5D9HA 2C0TA 3FKNA 5J9LA 4Y5HA 4DYMA 4LUEA 5ANKA 3S1HA 2OO8X 3F2RA 2YCQA 2YITA 3PPZA 4W9XA 5HBHA 4AW0A 2BFXA 2XIKA 4BB4A 4YU2A 4Z7GA 4FEWA 4BIBA 1JPAA 3FKLA 2RFSA 4FIJA 2ERKA 2PZYA 4C2WA 2QO9A 2PULA 3WZJA 3SHEA 5CANA 2XKFA 2IW8A 3UIUA 4BWXA 4O81A 3ZUTA 5CSHA 1JBPE 3CS9A 4GH2A 4AACA 5L8JA 5A3XA 4HVDA 5B0XA 5IA0A 5E8SA 3QCQA 4RVKA 3LJ2A 3Q6WA 3VNTA 1V1KA 2CJMA 2Q0NA 3DDQA 2R4BA 5J1VA 2AUHA 3DNEA 3QUPA 3BHTA 3OVVA 3HLLA 4JDJA 2IG7A 4D4SA 4F7LA 5I9VA 4K18A 4HVSA 3REPA 3CQUA 5FBOA 5IEVA 3B8QA 2G1TA 2PZPA 2OG8A 1Y91A 3ROCA 3EJ1A 4F7JA 2B9HA 3OD6X 3BYUA 3JVRA 3FDNA 3QQGA 4G34A 4OTFA 5M06A 1FPUA 1SVEA 2BRMA 4D0WA 4FTAA 2XIXA 4P2KA 3FZTA 5J7HA 3DB6A 1F5QA 1H08A 4YHFA 5HNIX 5TOZA 3R9RA 2QHNA 3IDCA 4FYOA 2NO3A 3D83A 3R7YA 4FV1A 3EFLA 4HGSA 5JH6A 5T68A 3FLZA 5LCJA 5HG9A 4BBFA 2RKUA 2YIWA 4WNOA 1OECA 3E8EA 3DJ5A 3PZEA 4K8AA 4JQ7A 4Y46A 1BL6A 5HCXA 2OJGA 4PQNA 4S2ZA 3ANQA 3ZSIA 4FZ6A 3F3VA 3S4QA 4WUNA 4IM2A 2BIYA 4BRXA 4RIYA 3AC2A 4TY1A 3V5LA 3HAVA 3I0OA 5E1EA 3BPRA 1W84A 2EUFB 3EQIA 4DEGA 1M2RA 3OEFX 4IW0A 3Q2JA 3PG1A 4XYFA 1SNUA 3VS0A 3JS2A 2JAVA 3TEIA 4EEVA 2WB8A 4FE2A 1JSUA 1I44A 1MRVA 1KWPA 4A4LA 3OTVA 4GFOA 3ORXA 5FQDC 3ZC5A 3UBDA 2OSCA 3HA6A 1QPJA 2VWBA 2YHVA 2PE2A 3VF9A 2P55A 2XJ2A 4G1WA 3LFCA 4QMQA 2GS7A 3UNJA 5I9YA 3GU8A 3BEGA 5CT0A 1RJBA 2O8YA 4U40A 1H0VA 5CX9A 5EKNA 3OF0A 5CEOA 2YIQA 4RIXB 4FV5A 3I5NA 5HKMA 3K5VA 4KABA 3IW5A 4RX5A 4UBAA 2ITPA 3NSZA 4RJ6A 4YLKA 3N51A 4O82A 2R9SA 4XOZA 3PWYA 4D55A 3EQPA 2CN8A 3QCSA 3L8PA 4ZY5A 5KMNA 1W0XC 2HIWA 2PVNA 3E7OA 3QD3A 4O6LA 4DITA 5CU0A 3NAXA 4RC3A 5FLFA 4IDVA 4H1MA 1H1QA 4AP7A 4CTCA 3Q96A 3FY0A 4IE9A 4RFYA 2X6EA 2C5OA 3ID6C 3FSKA 1JAMA 1JQHA 2ITYA 4ITJA 3H10A 5KKRC 5M4FA 5HTBA 4OAUC 1W98A 1PRYA 2Y7JA 1ERKA 4ITHA 4YNOA 3RJCA 4A7CA 5IZFA 5J5TA 2X1NA 4GFMA 1R78A 4FVRA 3ATSA 4C8BA 3RPVA 2R3FA 3HMMA 3GXLA 5EOBA 2V62A 2HELA 3OW3A 2QCSA 3C4ZA 4LOOA 1URCA 5HE2A 2UZEA 1YHWA 3QD0A 5ITAA 4ANQA 4O0WA 4QQTA 2BTRA 4R8QA 1U5RA 3EN9A 2YIRA 3BE2A 4R3PA 4ZLOA 5HE0A 1PKDA 1PXOA 3UG1A 1J1CA 3G0FA 3TV7A 4R3CA 1JKTA 1VEBA 1HCLA 2WMBA 4EZ7A 3GQIA 3MWUA 4H39A 2OI4X 4MF0A 4GK3A 2VTRA 2Q0BA 3FI4A 3GI3A 4GU6A 4HGLA 5HE1A 2DYLA 5LMAA 3RCDA 4F0FA 1PYEA 3KRWA 4X2GA 4CSVA 4S34A 4E6QA 3PUPA 3R7GA 4X3JA 3RALA 4ZSJA 4BI1A 4JJRA 5BX0A 4F7NA 3Q4ZA 1Q8YA 5HVYA 3S3IA 4I6FA 3OBJA 4BCQA 2CDZA 4GVAA 2GHGA 3LCOA 3VJNA 4O2PA 4M0YA 4BWPA 3DFAA 3D2IA 4LI5A 3RWQA 2WMAA 3HMOA 1H8FA 4CQGA 5HVKA 2JDVA 2VZ6A 4FZAB 1DI8A 2OBJA 2C3LA 3TZ9A 5JQ5A 4HCTA 5CXZA 1GZOA 2W4OA 4WO5A 3KQ7A 5CY3A 3RVGA 4ZY6A 2X6DA 3FYKX 3ULIA 4DE4A 2BCJA 2V5QA 4PV0A 4GV1A 2WMQA 1K2PA 1ZOHA 2VTOA 3ORPA 2PU8A 1T46A 4CMTA 4UY9A 1KV2A 1OL5A 1V0BA 3C4EA 4ZTNA 3H3CA 2Z7QA 3UTOA 2R5TA 3FZPA 2OXDA 1PF8A 2WMSA 2YABA 5TE0A 5J9YA 1ZARA 5JFWA 4FSRA 4BYIA 4UYAA 3MPTA 4EHVA 3A7GA 4EK6A 5M4CA 2Z02A 2C5VA 2VRXA 2YM4A 3DBEA 3LAUA 4MWHA 4RFZA 4UWBA 5GNKA 2FVDA 3AD5A 4BTFA 3FMNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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