1JBPE

Crystal structure of the catalytic subunit of camp-dependent protein kinase complexed with a substrate peptide, adp and detergent
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
342
structure length
339
Chain Sequence
GEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADEPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title cAMP-dependent protein kinase: crystallographic insights into substrate recognition and phosphotransfer.
pubmed rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, ALPHA-CATALYTIC SUBUNIT
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 113
structure length 339
sequence length 342
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2001-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jbpE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jbpE02
4WG4A 5HLNA 4C4JA 5E8ZA 1KE6A 4CFWA 1KV2A 4H1MA 3SG8A 4TKSA 2QKWB 2OWBA 5A4LA 3K5VA 2R3HA 4OBOA 4DA5A 3ALOA 4HGTA 2ZV2A 3F9NA 4E5AX 4UZHA 3VUMA 5AR8A 2ZM4A 3KKVA 4ZEGA 4V0GB 4IWQA 5H8GA 1SVHA 4W8EA 4FZ6A 2QG7A 3SXSA 2A0CX 4JR7A 4QTEA 4IAIA 1GNGA 4FSYA 3O7LB 2WMBA 4ITIA 4OBPA 1P4FA 4FKOA 1OKYA 3WE4A 3O17A 3NAYA 4LYNA 3DLSA 1KUTA 4TRLA 3VBVA 5C4LA 3TZ9A 4C61A 5BUIA 5DGZA 1DI9A 1ZY5A 4KD1A 3CBLA 4O0TA 3D15A 4WBOA 5B7VA 2RFNA 2EUFB 3VUHA 4YJRA 2BFYA 2RFDA 2CCHA 2VTRA 2WTWA 4K2RA 4NCTA 2Z7RA 3TKHA 3BHHA 4O7YA 3C4XA 2GTNA 2W99B 3L8VA 4C2VA 1NW1A 2A27A 3FXWA 4AZTA 2OF4A 4F0IA 2HY0A 3ZRMA 3IOPA 3VRYA 2F7ZE 1ATPE 2HWPA 3IW5A 4QMLA 4EWHA 1AQ1A 4QPSA 5JRQA 3UG1A 1GY3A 5H8EA 4R7IA 2Y8OA 3PZEA 4FSNA 4RWIA 5LARA 3RBWA 3SV0A 5BMMA 4O7ZA 5J9ZA 3C1XA 4OTDA 3RHKA 3FHIA 5C03A 3GI3A 2ONLA 3HDMA 3PJCA 4F7SA 4AT3A 4AACA 5HG7A 2EWAA 2QG5A 2WIPA 3F5XA 3FSFA 5CEIA 4D28A 4UEUA 2ZB1A 2GDOA 1MRYA 1JNKA 2OJGA 2XM9A 3DJ5A 1PF8A 3H4JA 4GG5A 4CV8A 2QD9A 5DNRA 4YGAA 3GU7A 5IU2A 3LFNA 2QR7A 2W4KA 2XEZA 5E8YA 3G5DA 1R78A 3TT0A 4R77A 4F64A 1KE8A 3PPKA 4TYIA 4EH6A 4W9XA 5CF5A 4A07A 2OU7A 3DZOA 3N4TA 2PE0A 3IW8A 2LAVA 3EN6A 1Q24A 4L9IA 5AAFA 2RIOA 1B38A 3LFCA 2VRXA 3L8XA 3GGFA 1UVRA 4UMRA 3OCGA 2V7AA 4DCAA 4QP7A 2ITWA 3ZLYA 4JDIA 5DT3A 3UPZA 5KBRA 4KINA 1OIRA 3ZDIA 2YM5A 4XG9A 3K3JA 4ZP5A 5I5ZA 5I9VA 1YXUA 4FX3A 3WYYA 3F7ZA 4DTAA 4RSSA 4YR8A 3OY1A 2JDTA 4GT5A 3TV7A 3TTIA 4YJTA 2RSVA 2XK4A 4RJ6A 4QMMA 3QTWA 3AMYA 3Q32A 3CD3A 2BAQA 2ITOA 3RAIA 4BDGA 5HGIA 2XRWA 4XH6A 1OIUA 1U5QA 2C47A 4JG7A 2SRCA 4AW5A 4TWPA 4YLKA 5EKOA 5EYCA 2R3MA 4II5A 3VS2A 2R3OA 3B2TA 1OI9A 4O7VA 2YN8A 3VF9A 2PE1A 3SW4A 3ZO2A 1JAMA 1ZYSA 5JH6A 4HYIA 2X7OA 4H3BA 4EBWA 1Q5KA 1OL7A 4G3FA 1LEZA 3TDVA 3MI9A 4HCVA 4C4HA 4FSMA 4NJDA 4OT5A 3D5VA 4QMXA 2V62A 5K0KA 4ZTMA 5EHYA 3FPQA 4CKRA 3C9WA 4DFBA 4FTQA 3DZQA 4HNFA 4FZDB 3NEWA 5E1SA 4CFFA 3TG1A 3ZDUA 2UZWE 2A2AA 4XRJA 5CVHA 4MKCA 3WZDA 2B52A 4BZOA 3EMGA 4KS7A 5IZFA 4BRXA 5CT7A 3IDCA 1YXTA 3PE1A 4WRGA 5FEEA 5BMSA 2XIYA 4G6OA 2REIA 2J4ZA 3V6SA 4XOYA 2W1GA 1Q62A 4FSQA 2XCKA 4F63A 5LVOA 3KU2A 4F1MA 3UIMA 3QRTA 4FUXA 4UYNA 2YLFA 4BDEA 5J7BA 5E8XA 5D12A 2ZAZA 4RIOA 5L2IA 3NUYA 4U3ZA 3EQCA 5JKGA 3UZTA 3RHXA 5IQFA 3FUPA 4EOJA 3E92A 4AOIA 3MN3A 4U80A 4OW8A 4HNIA 5AWMA 2ZMCA 4D2SA 3PY3A 3VULA 2GTMA 5I4NA 4FIHA 4IZYA 4ACMA 4C62A 3GCVA 4N0SA 3DXQA 2DUVA 4H1JA 3QTXA 1GIJA 2Z2WA 3O51A 3VIDA 4EUTA 5AUUA 5FGKA 4RLLA 3ZYAA 4XP2A 4HVDA 3ZFMA 4H3PA 2BUJA 2C0OA 3ZFXA 2FSOX 3SQQA 3R83A 4AZWA 3ALNA 3FLYA 5EYMA 1KSWA 2VWVA 1U54B 2J0LA 3D14A 5JFWA 2CGUA 1OVEA 3RJCA 5A9UA 3FYJX 3D4QA 4IAAA 4QQCA 4Q9SA 4IC8A 1IRKA 5AX9A 3D2IA 4YZDA 3EN4A 2VWUA 5CXHA 3HMNA 5H8BA 5HX6A 3QF9A 4FTJA 3ETAA 1UWHA 3U9NA 4EH3A 2OXXA 3HRFA 4U79A 3HRCA 3UC4A 2C6EA 3TN8A 1OL1A 4BCOA 3O71A 4IAZA 2R7BA 1G5SA 3VAPA 4QO9A 1UWJA 2OJIA 3WZJA 3U6IA 4X2KA 3UIUA 5EQPA 3FL5A 1BX6A 3MJ2A 3G90X 4ZSJA 4PDSA 2JAVA 3TM0A 2EB2A 3LW0A 2EVAA 1CTPE 3LCDA 5BVOA 3ACJA 4TNDA 2P4IA 2WOTA 3KULA 4F70A 5BX0A 2VWWA 3FZTA 5LMKA 1Q8WA 3P7AA 2CJMA 4QTDA 5CSWA 4CT2A 4OTRA 3FQEA 3G6HA 3CPBA 3HP5A 2ZV9A 5BVFA 2C3KA 2C4GA 4C38A 5LVMA 3ZM4A 4CT1A 3L8PA 4A9YA 4BWXA 3NNXA 3OF0A 4MNFA 4L8MA 2HK5A 5LJJA 4Y83A 2IWIA 4NSTA 2IZTA 5BUJA 2C6KA 1Q4LA 4IZAA 2C0TA 1CMKE 4TYGA 4EC9A 5KZIA 4BFMA 3KXMA 4WD5A 5BVWA 3ZUUA 1UA2A 4D5HA 2XVDA 3LM5A 1E1VA 4FEUA 4TN6A 5FEQA 2WGJA 3COKA 2PUNA 4ZY4A 4YSJA 4EK3A 4CEGA 4AN3A 4DINA 4CFVA 2I40A 4LRJA 5CAUA 2BZHB 2ITPA 2GQRA 3QUDA 5JZNA 3L1SA 4LI5A 2WIHA 5EDPA 4EI4A 3U51A 5I3RA 1O6KA 5JMSA 2YJSA 4BN1A 3OWLA 4LV8A 2QOBA 4RT7A 2QNJA 4KKGA 4S32A 3RNIA 5TT7A 3H0YA 3W2CA 2XEYA 3MVMA 3AXWA 3UQCA 3CQEA 5CU2A 4EH8A 4TXCA 4YHJA 2ZDTA 4DFLA 1XWSA 5FDXA 4O7TA 4KIKA 1QPDA 4IIRA 2J50A 2YFXA 3IECA 4FNYA 4WSYA 3M11A 3R7GA 4USFA 5HVKA 3P5KA 3MBLA 2XJ0A 4CGAA 2VNYA 2BKZA 3HL7A 2XNOA 3C4EA 3FQSA 1UU3A 2PWLA 4UY9A 2PL0A 2PZRA 4L3PA 1PKGA 4J53A 2J5FA 4E4XA 2XK8A 1WVXA 5L2TA 1JKTA 3A7HA 5HICA 5AA8A 1NY3A 1YHWA 2XBJA 4D2VA 1ZMUA 2PVJA 3A7JA 4KSQA 4IDTA 3UVPA 3QBNA 5M4IA 3BE2A 3LZBA 5E7RA 1F0QA 2WMSA 3GU4A 5FQDC 2VWIA 4C35A 3DNDA 3FI2A 4BIDA 2HIWA 1OPKA 4ZY6A 5IQCA 4QP1A 2V5QA 3KGAA 5DA3A 3RPVA 4FL2A 2QCSA 3W2SA 3KMUA 5BYLA 5KO1A 2EU9A 3BU3A 2Z8CA 4EL9A 4MVFA 4XX9A 3ET7A 3C5IA 3CP9A 4FOCA 4FKPA 4O0YA 2CNVA 1S9IA 5KHXA 4PMPA 3DQXA 5CANA 3DS6A 3VS6A 2JAMA 3ZRLA 4U0IA 5ETAA 3AC4A 3CR0A 4JIAA 3BYUA 5M56A 3SDJA 3SC1A 4KUJA 4BDIA 3MJ1A 4WG5A 3R7VA 4NM5A 1KV1A 5L2WA 4RX9A 4Y5QA 3AG9A 3HMPA 1ZMWA 4FZ7A 1T45A 2VWXA 5CVFA 3W8QA 4D9TA 5ANDA 1Y57A 3R7OA 2UVYA 3LXPA 3O8TA 3R7EA 4BICA 3A7GA 4E73A 3FEGA 4DN5A 2C6LA 3GBZA 1AGWA 3R9OA 3UO5A 4FEXA 5EOLA 4DEIA 4FGRA 3KRWA 2VX3A 5C26A 4QMOA 5J8IA 5DYJA 3ZXZA 3OVVA 2QLQA 3BBTB 4CFXA 2R0IA 4OAVB 1IAJA 1R1WA 3BHTA 4I4EA 3MH1A 1ZYJA 2VO7A 5JGAA 2P2IA 3BYVA 3MESA 4HYHA 4NCTC 2X7GA 4F6UA 2P2HA 3Q4ZA 1PMNA 4YNOA 4BDKA 2XCHA 4R6VA 3VUKA 5HO8A 4D2RA 2WU6A 4NKAA 4C4EA 4ZMFA 3GT8A 3NW5A 2C3LA 5A14A 3RWPA 1ZZLA 2FVDA 4A06A 4QD6A 5CSPA 4FTRA 4FI1A 5JRSA 5A4CA 5IA1A 4FV4A 4ZTHA 5CF4A 3FMMA 4M0YA 2WD1A 4J52A 4AZVA 3PWDA 1Q61A 2OXDA 3RI1A 4XOZA 5F94A 2VTNA 5CQWA 5D11A 3QTSA 3G15A 3PLSA 2XIKA 3UBDA 1PHKA 1Y91A 5DEYA 4YU2A 3NYOA 4BIBA 2XS0A 2GS7A 5CQUA 3BIZA 3FLNC 2QU6A 4P7EA 4V05A 4N4SA 3R9DA 3GCPA 4OTQA 3OMVA 5IDNA 5FDPA 4F1TA 2XNGA 1W83A 1HOWA 3JVRA 2PMIA 3GOPA 2WMUA 5M4CA 5AUZA 2VO6A 4FT0A 5DFPA 3SLSA 3N9XA 3Q9WA 5M09A 4R3PA 3MY0A 4KB8A 4O7SA 4IJ9A 3V3VA 3BEAA 4FV0A 5IISA 2PYWA 4FV6A 4QPAA 3BRBA 3EFKA 4NIFB 4RC2A 1X8BA 4GT3A 2J6MA 4RFMA 2GFSA 2OK1A 4U43A 5TF9A 4BWKA 4MBJA 4R3CA 3OUKA 3GCUA 3S2PA 3GNIB 4ANOA 4DGNA 4FZAB 3ZXTA 2VTOA 5AM6A 3HA8A 4EYJA 2YEXA 5AP1A 2C6DA 5A6OA 3PIYA 2I6LA 2FO0A 3A4OX 3GC7A 4FK6A 5L8LA 5EK7A 3CQUA 5JSMA 3QQKA 4D1ZA 3O8UA 3ZS5A 2C6IA 5AFVA 4FYOA 1FVRA 4DEDA 1O6YA 4AS0A 3TNQB 2X0GA 3QUPA 4M84A 4YHFA 4F0GA 3PXYA 5C8KA 5DMZA 5L8KA 3DXPA 2AYPA 1UU9A 4L3JA 2X4FA 4JAJA 3MB7A 4C0TA 3A61A 1XH5A 2C1AA 4CVAA 2UZTA 2PZIA 4NM7A 2KULA 2X39A 3ORTA 4YLJA 3DK7A 3KL8A 4F9YA 3SW7A 3LFQA 5F95A 3Q6WA 3S95A 4DYMA 4EWQA 4B8LA 3MY1A 2CDZA 5IUIA 3VUTA 3PSBA 4IVCA 4RG0A 4P5ZA 2OLCA 2JIIA 1WBSA 3CGFA 4XG3A 1VZOA 3OG7A 4H58A 3V8TA 4EK4A 4X6RA 2YIRA 4FNWA 4MNEA 4KAOA 3PPJA 4APPA 1GJOA 3RPSA 3PDTA 2PVKA 4AT4A 4E7WA 5A4EA 1KE5A 4GRBA 5IQIA 3CEKA 4NL0A 1JKKA 4ACHA 4C4GA 3TIYA 5KX8A 5IDPA 4BGGA 2CNUA 4L67A 5AP5A 5CSXA 4ANSA 4ID7A 4R5YA 2GHLA 4FNZA 5CALA 4AUAA 4O7NA 4O86A 3K3IA 4E8AA 1Y6AA 4GK3A 5HNIX 4QTCA 2Q83A 1YI6A 4FTTA 2PVYA 2PK9A 3AC2A 3IDPA 3KCKA 4TYEA 4I92A 4KRDA 5E8SA 5DHJA 3VS5A 4NJ3A 3FQHA 3TXOA 3ZO1A 4IW0A 1YRPA 4X2FA 3RK5A 3DKOA 4BTFA 1UNHA 3HEGA 2ZJWA 4PDPA 3WIGA 2QU5A 5J7HA 4ORKA 1YKRA 4DG2E 4PPCA 3QLFA 4YTHA 4BDAA 4EBVA 4FSTA 3QC9A 4O6EA 4EOOA 3PIZA 3O23A 4GH2A 4XEYA 3ITZA 4PDOA 1YWRA 4F09A 4HGLA 2Y4PA 2BHEA 4F9BA 1YOJA 3GCQA 2VO0A 3FXXA 5CU0A 4MBIA 4ZK5A 2G2FA 3MTLA 3HGKA 3QTUA 4XNEA 4G5JA 3LQ5A 4C58A 3TIZA 3D5XA 5FRIA 3UVQA 4D2WA 3R30A 2OJ9A 2UW4A 4H05A 4JX7A 4OLIA 4PRJA 4Y8DA 1YXSA 4C3PA 2R3KA 4D4SA 3OBGA 3LFFA 4DBNA 4OAUC 2PMLX 2I0YA 2FSMX 2Y7JA 3DDPA 3HUCA 4GVJA 4AT5A 1G8AA 5TOZA 1WBPA 3MVLA 4FEVA 2C6TA 3CC6A 3KEXA 3DBEA 3H30A 2PHKA 4M8TA 2OH0E 3PG1A 4KIPA 3TUCA 2X2KA 3DKGA 1BMKA 4HPTE 3DQWA 5EQYA 3KXXA 2PUUA 2ZV7A 4YBJA 1H4LA 5FBOA 4N6ZA 2VGPA 4E3CA 1S9JA 4KWPA 3F69A 3IOKA 5LQFA 4FIJA 3DB6A 5B2KA 4CQGA 5LOHA 1R3CA 2HELA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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