1JBPE

Crystal structure of the catalytic subunit of camp-dependent protein kinase complexed with a substrate peptide, adp and detergent
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
342
structure length
339
Chain Sequence
GEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADEPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title cAMP-dependent protein kinase: crystallographic insights into substrate recognition and phosphotransfer.
pubmed rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, ALPHA-CATALYTIC SUBUNIT
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 113
structure length 339
sequence length 342
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2001-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jbpE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jbpE02
3EN5A 1UU8A 3BLHA 5EI8A 5TR6A 1MRYA 1MQBA 5ANJA 2C3KA 1OECA 3LFDA 3BHTA 5LQFA 3WIGA 5IA4A 3LFBA 4C38A 1B39A 3OP5A 1I44A 4ZZNA 2O65A 3U4UA 5E90A 5H8BA 4FKVA 3OC1A 3ORMA 4UXLA 5I5ZA 5M06A 3PLAE 2J7TA 3BKBA 3AC2A 2V7AA 5K4IA 3ZO1A 4QRCA 3JS2A 3P4KA 5FQDC 2YM8A 1ZLTA 4C3RA 3DLZA 2J9MA 3AMBA 3UQGA 4DYMA 1W8CA 3QTIA 1OPKA 4FIFA 1PMNA 3HUBA 5CLPA 3LM0A 3MV5A 4ZTNA 4FG8A 1OKYA 3ENHA 5IQGA 5HTIA 3BGQA 3KMMA 5EFQA 4XLVA 2CLXA 3R6XA 4FTTA 5E8VA 5HBJA 4BIEA 5C8MA 1Y8YA 4FYOA 4DTBA 1XH4A 2EU9A 5AAFA 4BYJA 4NW6A 4USDA 5KMLA 3QD0A 4LOOA 1XO2B 4FV8A 1MRUA 1YXUA 2QO2A 2BRGA 3HX4A 3OROA 5L8JA 4AFJA 4TYJA 4U97A 3UVQA 3QUEA 5E8TA 5EM8A 2B55A 2VTNA 4DN5A 4J99A 2XYNA 3A4OX 3NWWA 5FG8A 5JT2A 1NVQA 5AA9A 3H30A 4YJVA 1IA8A 2W1IA 4RVLA 1FOTA 4M8TA 5CXHA 3G90X 3F3UA 3ZFYA 1SVEA 4DEIA 1YHWA 3MA3A 4XRJA 2XJ0A 5I3OA 2QOIA 1HOWA 4G3EA 4GVAA 3W8LA 5CEQA 3U6JA 3KK8A 3R1YA 3R8ZA 4IC8A 3OY3A 2JKMA 4AW5A 3E8DA 3EZRA 4QQJA 2GFSA 4B9DA 1JVPP 1WBOA 3QA0A 1BI7A 3FMKA 4EK8A 5IQCA 5CSVA 1XQZA 4O0XA 5DE2A 1OKWA 5LWNA 3R28A 4RWKA 5GJFA 5JZJA 3EQDA 2VWZA 4QMQA 1Y6AA 4AOTA 1E1VA 4A9UA 5M08A 3PSBA 5IA0A 1W7HA 2FSTX 4FBXA 4EH2A 4EYJA 1Q3DA 3OW3A 5IQHA 1UWJA 3HP2A 3L9NA 2YCSA 2I0VA 2FVDA 2PZYA 2GSFA 4F63A 4YU2A 2PMLX 4FUXA 3FUPA 4RQKA 3RM7A 3NYNA 1V1KA 4E6CA 1ZOHA 4BDFA 3QX2A 3MFUA 2B1PA 4UN0C 5A4LA 3BCEA 1NT2A 3TNQB 4LOQA 4P5QA 3TEIA 4V0GB 4BZOA 5AEPA 3BBWA 3D7TA 5IUHA 2ERKA 2UVZA 4L44A 4AW0A 5HG9A 3R9OA 1QPCA 1OL7A 4YLKA 4C2WA 4I93A 4CZTA 3C5UA 3T3UA 2YA9A 2HY0A 3C0IA 3Q4TA 5E7RA 5LCJA 3K5UA 4EOPA 3EWHA 3KXMA 3JYAA 4TT7A 4MK0A 5A14A 2IZUA 2WGJA 3HRBA 1ZXEA 1OVEA 2WAJA 3COMA 4OTRA 2PSQA 3UP2A 5DR9A 5FDPA 3W2SA 3F3VA 5JKGA 1J91A 3KXZA 4BTMA 5AP4A 2YAKA 3I6UA 5HIDA 2LAVA 4O27B 5A4CA 4JX3A 2PVLA 4AT5A 4Y46A 4TXCA 3LMIA 4YTCA 4CFWA 4FTOA 5CVFA 3KULA 3WZJA 3IS5A 4OAUC 2GS2A 3ODZX 3HDMA 5DT3A 5ETIA 4Z16A 2OXDA 4OR5A 2QG7A 3O17A 4L6QA 3CKWA 3U4WA 2CJMA 3CTJA 2PK9A 3DBEA 4UZDA 4QP7A 5FP5A 4HVDA 1U5QA 2BDJA 2OLCA 4DCAA 4GYIA 2BCJA 4S32A 4RWLA 4JDIA 2ZV8A 3RAHA 4RIXB 2C5VA 3KVXA 4F9WA 4EK3A 1XKKA 3PE1A 3GU4A 3MY1A 4FK6A 3FWQA 5C8KA 2C1BA 1PXNA 2UW5A 3OF0A 2WMRA 3O8PA 3SQQA 1FINA 4QMPA 3ORNA 3VUMA 4EHZA 3OWKA 3DFCB 2Z7RA 4H1JA 4QMTA 3VC4A 3PDTA 4FZAB 3TL8A 2PVMA 5E1SA 2OJGA 3B2WA 3AMAA 3HA6A 2X4ZA 4L3LA 3UIUA 5JGDA 2X7OA 4AA5A 2F7EE 2BVAA 4TN6A 3LMHA 4C4FA 5CAVA 3OCBA 4DFNA 1Y57A 2O64A 1O9UA 4D2WA 4FKGA 2VGOA 2A2AA 3R9RA 4WO5A 4JLCA 3TIZA 4H05A 3WF7A 1CMKE 3V51A 4XOZA 1DM2A 3VAPA 4AUAA 2XZSA 3FZTA 4IM2A 2JKQA 4LOPA 4XG7A 2PUIA 3UMWA 2A1AB 3TZ9A 1LEZA 5CSWA 3VUIA 2W4OA 3KMWA 4FZDB 1OIQA 4O0SA 3HRCA 4BDAA 2WZJA 4PDSA 4QMMA 4ZSLA 1JKSA 2XBJA 3CC6A 4X2GA 3LFSA 3MVJA 3TTIA 4YLLA 2V7OA 2Z7SA 5L2SA 2ZOQA 5T68A 5EYDA 4CNHA 4NM5A 4GCJA 3SHEA 4D0WA 3IDPA 5AV0A 2HZIA 3TV4A 3FKLA 4YZNA 4ZY5A 4ZY4A 4ZJIA 2JLDA 3T8OA 2PZPA 4J7BA 5AUWA 2HW7A 5ETFA 5HVYA 2WOTA 4M0YA 1YWRA 2IVTA 4UMTA 3OBGA 5C03A 5CNNA 4D4RA 5IA2A 4NIFA 2OWBA 3KKVA 3LZBA 1M2QA 2P3GX 3EQFA 5HLPA 2R3QA 4XV3A 5AV3A 3DXPA 2C5XA 2W1EA 4IADA 4BB4A 4FV5A 4FKLA 3UQFA 1Z5MA 1WVXA 1JOWB 4FV3A 3DK3A 3F66A 3PPKA 3PXQA 4NWMA 1M52A 5CZIA 4EQUA 3OOMA 1AD5A 5AMNA 5JGAA 3L8XA 3NNVA 3RMFA 3H10A 5KUPA 2UZOA 3AG9A 5JQ5A 3CQEA 4AGDA 4PMPA 2PL0A 4II5A 5DBXA 3QBNA 4GFMA 3UO5A 4E73A 5HX8A 5HKMA 4EH9A 4KIKA 4BDEA 3RHKA 4FSRA 2GDOA 4ONAA 4JNWA 4Z3VA 1FPUA 3AOXA 1M7NA 2UZDA 3OHTA 2W17A 1MP8A 3R7EA 2BZHB 5IPJA 2C5NA 3H3CA 3SC1A 3O50A 2J5FA 4PDOA 4YJNA 2FSMX 3E63A 4TYHA 1WBWA 3LFFA 3OT8A 4NM3A 5EH0A 5HBEA 4DG2E 3R8MA 2OO8X 3Q9ZA 5K5NA 1UU7A 5DRDA 3MVHA 3NUSA 3BI6A 2BHHA 4U40A 1I09A 5FP6A 2NRYA 3IGOA 3LOKA 4RJ5A 4NSTA 3W2QA 2X8EA 3DNDA 3N9XA 4FTIA 2JFMA 2C6IA 1YKRA 2ITYA 4KKGA 5B2LA 1DI9A 2YZLA 3QFVA 4UWBA 1P2AA 3F3TA 4Y83A 5EOBA 4IC7A 3LQ3A 4V01A 2UZNA 3I7BA 3UO6A 3CE3A 3LXKA 5ANOA 3VHEA 4ALWA 5IF1A 3BHVA 2HWOA 3T9IA 3B8QA 4LGGA 2BRBA 2VX3A 5IUIA 2R3MA 3LFEA 4FT5A 4L68A 3ZZEA 5J1VA 3O7LD 4FSZA 4FSNA 4QMVA 4U3YA 4BIBA 4FI1A 4PP9A 3NIEA 4U79A 2W4JA 3I5NA 4KS7A 2VTMA 3D0EA 5HORA 5GINE 3KN6A 5A4TA 4LM5A 4BI2A 3ZLWA 3COHA 1J1CA 3CKXA 2E9NA 3KRJA 2EXCX 1H07A 4EK6A 4CTCA 4FICA 2E9PA 5LMBA 3IGGA 4ZZOA 2JIUA 3W32A 2VWBA 4W9XA 4EK5A 1R0PA 3RAKA 4E4MA 2BRHA 4EKKA 4QMZA 1J7IA 2F7XE 2AC5A 4DF3A 3L8SA 4ZTMA 3ZXZA 4Y85A 4O7LA 5CU3A 3D94A 3VUGA 3FZRA 2YISA 3E8NA 4O0VA 1H27A 3TNIA 2WTWA 1UKIA 2YIRA 4L3JA 4ERKA 4EZ7A 5B2MA 2ITQA 2O2UA 1U5RA 3GVUA 5AUZA 4YTIA 5GZAA 4JRNA 3TM0A 1KSWA 5JFSA 4D2TA 3ORTA 4KINA 4O0UA 1WBTA 4CMTA 3QQHA 4BDCA 3EIDA 3SRVB 3QD4A 4DEEA 3QUDA 2PMIA 2Q83A 1JSTA 3KC3A 3R7VA 3ITZA 4ZMFA 1KV1A 3BQRA 3R0TA 3QQUA 4P4CA 4RZVA 5E91A 4ZLZA 3ZLYA 5I9XA 3P08A 4R6VA 2H6DA 3LJ2A 3NNUA 3CD8A 2X8DA 4A9RA 3PY0A 5ICPA 1YDRE 2HOGA 2OH4A 2V22A 2CGUA 4CEGA 2A27A 4GT4A 4NM7A 2PVRA 4FTLA 3HLLA 3I60A 3KL8A 4I4EA 4P2KA 4WNMA 5CF8A 4FSUA 2X81A 4W4WA 4O7VA 4UMPA 1SVGA 4FV6A 4I5MA 3A7FA 2HENA 4IAIA 1GY3A 4FTAA 4IW0A 3RZFA 4C7TA 3SA0A 5A6OA 4I20A 4ERWA 2W9FB 3BHUA 3C0HA 4D4YA 4BDGA 5AIKA 1XH8A 2PVYA 3C13A 4B7TA 3JXWA 2UZTA 4FKSA 1UNGA 1SZMA 3SD0A 3Q9YA 4D2RA 5BVEA 3NW7A 4E5WA 5F9EA 3V5LA 2W9ZB 2IW8A 3BYMA 3H9OA 3FY0A 1YDTE 3WE8A 4A4XA 3LCTA 3EN4A 1APME 2VO3A 2ZDTA 3GQIA 3II5A 4HYHA 4EEVA 4H36A 2XK9A 3ZC6A 4QMSA 4XRLA 4N6ZA 4C02A 5LMAA 2I0EA 3JY9A 3P7AA 4CQGA 2Q0NA 3F6XA 2ITWA 4GT3A 4CFNA 2IN6A 2XKFA 4HVGA 5IUGA 2EB3A 1AGWA 3G15A 4BKZA 1XBCA 2JDVA 4W4XA 3WF5A 2GHGA 1G3NA 3KU2A 1YVJA 4LGDA 4C8BA 4QQ5A 1W0XC 2R7IA 2FO0A 3BU6A 4D9UA 2WIPA 4O2ZA 5H9BA 1VR2A 2UW3A 3VULA 4CMOA 5GZ8A 3ZLSA 5JN2A 1V0OA 2VRXA 3K54A 4DT9A 2R0UA 4EBVA 3DLSA 2WMUA 4YP8A 1SM2A 1H1PA 5AP2A 5A6NA 5IDNA 3CD3A 3FZPA 2HELA 2ITPA 2ZB0A 1TQMA 3OEFX 3DDPA 4I92A 3KF7A 4XG4A 3PPZA 1PHKA 3BYOA 4IAKA 2JAVA 5CU6A 3NCZA 5I0BA 4QP4A 4F65A 4L46A 1SNXA 2GPHA 3MH3A 3PIXA 4PMSA 3QCYA 4R5YA 5AM7A 4H39A 2IG7A 4Q2AA 4NTTA 3B2TA 3BWFA 1BX6A 2WIHA 3RZBA 2WD1A 2UZUE 1KV2A 4QMYA 5J7HA 4F99A 4XV1A 3HDNA 3MWUA 3QZGA 4MBIA 3E93A 2J50A 3QLFA 3W2RA 2OIQA 2CCHA 3LQ5A 4AOIA 4EKLA 4PNIA 4CFXA 2O3PA 4C3FA 5EYCA 4NL0A 4QYFA 3MYGA 1YHSA 1JKKA 4PPBA 4K2RA 3TUBA 2GS6A 5LMKA 3ZEWA 4JAIA 3RJCA 2OF2A 1PKGA 3AT4A 4XV9A 3DA6A 4AT3A 5GIOE 3O7LB 4HCTA 1EH4A 2UVYA 2XEZA 3NYXA 3GFWA 5JRQA 4JDHA 3SVVA 5CALA 1HCKA 1YW2A 2ZMCA 4YJPA 2B9IA 4CCBA 2Y7JA 3MESA 2G2HA 4CRLA 4HNIA 1IAHA 5FXQA 5CVGA 4OTWA 2R3LA 4EOLA 4X3JA 4AWIA 4IDTA 5AR3A 1PXOA 4O1OA 1Q8TA 3FV8A 3TZ7A 5ANDA 4QYYA 2GMXA 1KUTA 5D11A 3GC9A 2VNYA 3AGMA 1CDKA 2WNTA 2W5AA 5DRBA 4AU8A 1PMEA 3GENA 4KBKA 5DEYA 3BE9A 5EHOA 4NEUA 3FLWA 3UPXA 5JEBA 3BU5A 4FTMA 5FGKA 2XK4A 3BQCA 5HD7A 4PNKA 3BRBA 3CTQA 1UU9A 4O0WA 4MBLA 5L6WL 1YWVA 4DA5A 3POZA 3LLTA 1RDQE 4NT4A 3R73A 3FZSA 5CEKA 3LJ1A 3Q4CA 3GU5A 2GQSA 3V5JA 2ZYBA 3C50A 3G0EA 5CAPA 5M4FA 1O6KA 4KS8A 1L3RE 4PL5A 1LUFA 3HMPA 3R7GA 3WF6A 5BNJA 4YHJA 1H08A 3Q96A 4XG3A 2FSOX 2GNJA 3O2MA 3E87A 4I5PA 4PPAA 2QONA 5DG5A 4C4IA 4DC2A 2NNWB 3U54A 1PXMA 5EKOA 2QR8A 3IG7A 4H3BA 4MEDA 3V04A 1P14A 4FVQA 4RIYB 3JUHA 3FLYA 1OL5A 3KULB 2ZM1A 3N51A 3QRJA 1MRVA 4IM3A 2J0MB 3UMXA 3DS6A 4FSQA 4JX7A 4FKWA 4EI4A 4JDKA 1H26A 3EFWA 3FI8A 2VTAA 1BL6A 5EG3A 1GZ8A 3TTJA 1FQ1B 3SGCA 4A7CA 3KRLA 5H8GA 5LVPA 5L8LA 4UMRA 5ETCA 2F49A 5CAOA 4DINA 4AP7A 4ZAUA 3PRIA 3JVRA 1SNUA 1W98A 2WMAA 4M66A 2OU7A 3GCVA 4Y95A 4APCA 3WF9A 4D2VA 3HKOA 5CX9A 5GZ9A 2WQBA 3H9RA 4BTFA 1F0QA 3AT2A 4FG9A 5D1JA 5AAEA 4DG3E 2OZOA 4FKQA 3PSDA 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