1JKTA

Tetragonal crystal form of a catalytic domain of death-associated protein kinase
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
276
structure length
276
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the catalytic domain of human protein kinase associated with apoptosis and tumor suppression.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DEATH-ASSOCIATED PROTEIN KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 276
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2001-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jktA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jktA01
3IGOA 4Y85A 1I44A 3PXYA 4OAVB 1KWPA 4N70A 3ZXZA 5LMBA 4AE6A 4G17A 1PXOA 4GT4A 2I0VA 2UW0A 3RCDA 1JVPP 5AR3A 5L4QA 3R8PA 5EW8A 3DXQA 4K33A 1IRKA 1CM8A 3HA6A 4M12A 4XP0A 1FVVA 3MFTA 2HZ4A 1H1PA 3DDQA 3ZM9A 1BI8A 2JEDA 4A07A 5HGIA 1SZMA 2YM3A 4HZRA 4M84A 3H0ZA 3I6UA 4L3PA 3KK9A 4BVUA 4FV9A 3VBQA 4CTCA 3RAKA 3A7FA 3ACKA 4D0XA 4C4FA 3ZSHA 5HLPA 4IM2A 2F2UA 3KXHA 2BIKB 5DHJA 4XG8A 4RC2A 4DEHA 4FI1A 4YZBA 4IWPA 4CMTA 3H0YA 2QO7A 1V0PA 3PP0A 3C9WA 4QPMA 4EK3A 4XG6A 3K5UA 3LMIA 4LGHA 2WFYA 4ZTLA 1PKDA 2P2IA 3BX5A 4HCVA 1PYXA 4QMLA 1RW8A 3AD4A 5TE0A 2Y7JA 3O71A 4FT9A 4IDTA 3V5PA 4EH7A 4PP7A 5A4CA 1YXXA 3L9LA 3MVHA 1IASA 4FVQA 1WBVA 4TY1A 1KE7A 4DEAA 3LQ8A 4TKSA 5M4UA 3F2NA 4DA5A 4FTKA 1ZOEA 4C35A 4DF3A 4RLKA 3PVUA 2HZIA 3NYVA 3PSCA 4RA5A 4BHZA 3PIZA 4Z16A 1PHKA 4FUXA 5CZIA 4E6QA 5LVOA 4RX9A 1OKZA 1OPJA 2BMCA 4O96A 5CEPA 3UPZA 2KTYA 3Q32A 3QZIA 2XNBA 1O6YA 3L8VA 4XX9A 3VJOA 3TNHA 1OECA 1R78A 3HV6A 4I6BA 3QALE 5F94A 3PG3A 4LYNA 2VTSA 4AFJA 4ZSLA 1LPUA 1IG1A 2IW6A 3LFAA 4BCHA 2OZAA 2OH0E 3KMUA 3HMMA 4EWQA 5BMMA 1BYGA 4QD6A 3LKMA 3QKLA 4IWOA 2XKDA 2ITZA 2WQMA 4G5JA 2EWAA 3HEGA 1OIYA 3TUBA 2QOLA 4X6RA 3C51A 4FKQA 4JR7A 4WNKA 2DS1A 5CSHA 4AX8A 4EZ7A 1IAJA 4DEDA 1UU8A 2WTVA 4E6DA 1HCLA 4D4VA 3VUTA 3GC8A 3K3JA 2C0TA 4AAAA 2XK7A 1PXLA 3QTIA 4BDHA 5IQHA 1E1VA 5G6VA 5C8MA 4ENYA 3MPAA 4IVDA 5ANEA 4ITJA 5HIDA 3W2PA 2ETRA 3FLNC 1UKHA 3EHAA 3OT8A 4D9UA 2BZKB 3ALNA 4U79A 4G5PA 3HUBA 4PF4A 5CVFA 2YZLA 4FSNA 1BX6A 5A6NA 3GU5A 4XG7A 3DXNA 3F3WA 3UIMA 4EOLA 1KOAA 3Q6WA 5EYKA 3CS9A 4OTFA 2OU7A 2PMNX 2Q0NA 1QCFA 3EN9A 4GT5A 4V0GA 4O7YA 3C4ZA 3IGGA 4BKZA 2QLUA 3IW6A 1CDKA 2F7EE 3JR1A 4P5QA 3QF9A 4EI4A 4I1ZA 4TZRA 4D4SA 5K0XA 5M07A 1M17A 1TKIA 2BFYA 3Q4UA 4WNPA 5BUEA 5IISA 3LOKA 4K0YA 1O9UA 1DI9A 4YTHA 4AF3A 4NM3A 3LFEA 4FV5A 5DEYA 2WHBA 3F5XA 4NSTA 1WBOA 4ITHA 4FIFA 4KSPA 4IC8A 4LOPA 4OTHA 3UBDA 1T45A 2OF4A 2VTNA 3FE3A 3UQGA 4D2VA 3G2FA 1YRPA 1A06A 4EH3A 4RIXB 3GT8A 1OPKA 2XCKA 2BILB 2E9OA 4GV1A 5FDXA 4BB4A 5HNIX 3DA6A 4JIAA 1Q99A 3ZOSA 3Q52A 3NWWA 2GPHA 4G9CA 3NVMB 3GQLA 5EI8A 3UNZA 4BY9E 4ERKA 1LP4A 5DNRA 3D14A 4A7CA 1J91A 4C2VA 2UVZA 4OTDA 5HD7A 1QPDA 2QOIA 3U51A 4AFEA 2O2UA 2JBOA 3R6XA 4RVKA 5DRDA 5A46A 3MA6A 5D7AA 3KRRA 1JKSA 3QA0A 4CKRA 5DT3A 4F9WA 4E5WA 4JX7A 1LUFA 5DWRA 4II5A 4RLLA 5KE0A 4FX3A 4FKPA 4GMYA 2BAJA 3FJQE 4FC0A 1K3AA 4J8NA 4EH6A 4XJ0A 5J5SA 4ZK5A 4AA5A 4CFWA 1R39A 1U4DA 2JIIA 4TYIA 5HLNA 4M69A 2C4GA 4W4XA 3BE9A 1RE8A 4CZYB 4U44A 3V5TA 3ORLA 3WF7A 3GU6A 3AT2A 5AR8A 3HUCA 3OCSA 4A4XA 2R7IA 3H30A 4RC4A 3VWAA 4HCTA 2R3RA 4O1OA 4YBJA 4F6WA 3QYZA 5D12A 5M55A 4L00A 5A4LA 4RVLA 4D58A 4GT3A 4L6QA 4BGGA 1GJOA 1JLUE 4PMMA 4O0YA 1YWNA 2W1CA 2WQOA 3OCTA 3R63A 5HKMA 3W18A 3SV0A 5E4HA 4C4IA 5AAGA 3OCGA 2RFSA 5AM6A 5DR6A 3SX9A 4RGJA 1JNKA 3HRCA 2WD1A 4ANOA 3KMWA 4QYEA 3MH1A 3QQKA 3SQQA 4AA4A 5J9ZA 4S30A 1GY3A 2HWPA 2RL5A 4YJUA 4LM5A 4I5HA 4YO6A 2VGOA 5TKDA 3KF7A 2C3KA 5TF9A 5LVNA 4KWPA 4DT9A 1SVHA 5KMIA 4D28A 3GCPA 4QNAA 1OM1A 2OZAB 4V05A 2LAVA 3TV6A 5JQ8A 2EXEA 4X2KA 4EQUA 3QLFA 1H28A 3IK3A 2IZRA 4U7ZA 5FTOA 5AA8A 3HL7A 4FGRA 5BX0A 4CT1A 3BYUA 3KRJA 1E1XA 1KOBA 4KRDA 5CYIA 4OBOA 3MFRA 1GZ8A 2IZTA 1WBSA 2UV2A 4BZDA 2IW9A 2YDIA 4UMQA 3KY2A 5BQ0A 1W7HA 3DLSA 1SNUA 3PP1A 4CQEA 2VWZA 4I23A 1REKA 2UZNA 4FBXA 3FEGA 5KX8A 3HYHA 2AC5A 5C27A 1XQZA 1VJYA 2YCFA 4GH2A 3UO5A 3D5UA 4QT1A 5M4CA 1G3NA 3V3VA 4F7SA 4RA4A 3QTUA 4FTNA 4O84A 4IX6A 1TQMA 3S3IA 1P2AA 3UC3A 4C4HA 3P79A 4P4CA 4RG0A 5BVOA 3A7GA 3DS6A 3VRYA 4CLJA 2J0LA 3F7WA 4F65A 4PMTA 4DC2A 5F9EA 4BCNA 5HCZA 2Y8OA 2EXCX 4AT5A 5DGZA 4KIPA 2QVSE 1U46A 3POZA 3ZEWA 4G6LA 3TIZA 3CJFA 3P78A 4IFGA 3EWHA 4JS8A 4WA9A 3ODYX 4GYGA 3FQSA 2VAGA 4D2PA 4OUCA 5GZ9A 3C4CA 3EYHA 3PVGA 3BCEA 5AA9A 1V0BA 5HEZA 2XM8A 1S9JA 2QO9A 3DNEA 1NXKA 2VWVA 3FXXA 3DV3A 5IA0A 4A06A 4FV3A 4ARKA 4FODA 3C4EA 3PE2A 5JH6A 4HCUA 4TPTA 2J0IA 2REIA 3G0FA 3WF5A 4B6LA 3L9NA 4BDDA 3FYKX 2UZWE 2HXQA 4MD7E 5CAPA 4L3LA 2XBAA 3OOMA 4NUSA 4P7EA 2BFXA 3NEWA 3QC9A 3GFWA 4RQKA 2JKMA 3D7TA 3SDJA 3RHXA 2VD5A 5FEQA 4EOPA 3KVWA 4ZY4A 3L8XA 2YDKA 3OWJA 2WIPA 3Q4CA 3ZS5A 3LJ2A 1K2PA 4FG9A 4NWMA 3FQEA 2HENA 3S95A 4N6ZA 2UZTA 3CEKA 4IAYA 3KULA 3QLGA 5BPYA 3V8WA 5CAVA 3DFAA 5L6WL 1OVEA 3ITZA 2HIWA 5E8WA 2KULA 1JSUA 5I9YA 3FHIA 2Z7QA 3KCFA 3FMNA 3LE6A 3LCSA 4H3QA 3P1AA 3RINA 2GHGA 5B2KA 3H4JA 2QONA 4IMYA 5LMAA 2GNHA 3BIZA 2JD5A 4DFNA 4YSJA 2B9HA 2GSFA 3CXWA 3UPXA 3LLTA 4KBCA 1KV2A 5E7RA 2CNVA 2W17A 3NZ0A 4KKEA 4V04A 4BYJA 4H36A 5KHWA 3C13A 4XV9A 3DKCA 3FLSA 4TN6A 4FKOA 3F5PA 4NM0A 5JGAA 2C6LA 4Y95A 5EYCA 3AGMA 4HVGA 1M2QA 4LRJA 5EKOA 1KE8A 2OLCA 4M0ZA 2WMTA 3W2OA 4E6AA 3WZEA 4MX9A 1WBPA 4GJ2A 5IEYA 3QTRA 4F0IA 3E8CA 3MWUA 2JKOA 2GHMA 3EQBA 4O7SA 5FEEA 4D4RA 4XCUA 3P7AA 3RK7A 3D7ZA 4XV2A 3OEFX 5LWMA 3WF9A 2W1HA 3GU4A 2ZV2A 3MPTA 2VTHA 3FMLA 2R4BA 4LV5A 4XV3A 4YMJA 4YC8A 4QTDA 2HZ0A 3MS9A 3QRKA 4Y5QA 5KNJA 4IJPA 5GHVA 1UU3A 3DZOA 3F5UA 5CASA 4MD9E 2VGPA 4BGHA 4YLKA 3L9PA 4C3PA 4MXYA 1F5QA 3KXGA 3R7VA 4DYMA 1OL1A 4DH1A 3ET7A 1J1CA 2YLFA 3VS0A 4BDBA 1ZXEA 3Q9YA 2H9VA 4G3FA 3OTVA 5J1VA 2WU6A 2ACXA 4Y5HA 4BWXA 2OZOA 3I1AA 2YLEA 3DTCA 3OY3A 2QOHA 4AOJA 2VWUA 1P14A 4NFMA 4B8LA 1OIQA 3ZFYA 4EH8A 4KINA 2PVRA 4ASZA 4RIYA 3E8EA 3VS7A 5HTCA 3SVVA 4AN2A 3R1NA 2A0CX 4PUZA 3CJGA 3A8WA 3E62A 3R30A 3UVRA 4DFXE 5L2SA 2GNGA 3OUKA 2Z02A 4AZTA 1JSTA 3OC1A 4UXLA 3R7YA 1OZ1A 4XV1A 3HV7A 4FTOA 5FXRA 5HX8A 2OXXA 5D41A 4EBWA 4I5PA 5CI7A 5CT0A 2EUFB 4YC3A 3DJ6A 3NVKI 2AUHA 1JKLA 3REPA 4ZSJA 5CU2A 4BBFA 3QFVA 3RAWA 4FTAA 3ZSIA 4BBMA 4EC8A 3MH2A 3F3ZA 4BC6A 3ATTA 3DGKA 2OICA 2W7XA 5HESA 3MESA 2JIUA 3O51A 5ANGA 1WFCA 2BALA 4O2PA 3R0TA 4MXOA 2NNWB 1YDRE 2Q83A 1QPJA 5TOZA 2NPQA 2YM7A 3R28A 2WTIA 4GEOA 2GTMA 5CI6A 3R9OA 5JFVA 3UOHA 4JAJA 2GNJA 3GC7A 4GVJA 4PWNA 4TRLA 3F2AA 3WBLA 3VS1A 2WMQA 4F08A 3QQUA 4L44A 3WIGA 2RFEA 4FV2A 3FZSA 4C37A 4YJRA 4O7NA 2ZM4A 2XM9A 2NRYA 4QP4A 2BDJA 4R1YA 2OJGA 2PE1A 4X2NA 5LVPA 3E87A 4C61A 2FVDA 3Q3BA 4S34A 4AG8A 1W82A 4DTBA 4F7NA 3W2SA 3O50A 4NTTA 4DE4A 3MPMA 1MP8A 3QC4A 3WIKA 4AWIA 3V5JA 3KMMA 1M52A 3LCTA 3NSZA 2UZEA 2C47A 3RZBA 3DLZA 3KVXA 3TV4A 3D5VA 4YZCA 4AZEA 3LXPA 3GU7A 1CTPE 3OXZA 4RX7A 4YHFA 4F9YA 1WZYA 4S2ZA 3LZBA 3R1YA 4BCOA 3OWLA 2FUMA 4PTCA 2UZBA 2QKRA 2X8DA 3COHA 3QGYA 3QRTA 5A14A 3CR0A 4BICA 2H8HA 2W06A 4ITIA 4U6RA 3L8PA 1GOLA 4LFIA 2X2KA 4R7HA 2UZOA 4WT6A 5ANKA 4DINA 5CQWA 3VJNA 3CY2A 1Y8GA 4JG6A 2GNFA 4YTCA 4Q2AA 5J9YA 3HKOA 2QHMA 5HG5A 1G5SA 1UVRA 3T9TA 4W9WA 4PTGA 3O0GA 2J6MA 4IAKA 3BGPA 4IH8A 3E8DA 3TWJA 3VAPA 2IVVA 3HP2A 4XMOA 3SXFA 4IEBA 1W98A 2WZJA 4L68A 2YM5A 4FK6A 4QMXA 4AZWA 2ONLA 5IH4A 4FV0A 4XP2A 3ORTA 4KIKB 5B2MA 3VNTA 4M8TA 1OPLA 4KS8A 4UWYA 4QTBA 5AV0A 2W5AA 5I3RA 1IA9A 3JS2A 3DKOA 4BDEA 4WHZA 3IS5A 3SOAA 1Q8UA 4LMUA 3BU6A 3W10A 3BLRA 3H3CA 3RBWA 3EQPA 5L8KA 4EL9A 4G6OA 4UZHA 1Q62A 5H8EA 3HAMA 5AEPA 4I5MA 2JBPA 4X3FC 2G2IA 1URWA 3UP2A 3HX4A 3LCKA 4YSMA 5LMKA 4I4EA 5IQFA 2W99B 4XS2A 5EH0A 5AP1A 5HNBA 3LLAA 3SHEA 5ETCA 3EKKA 3K5VA 2Y6MA 5K5NA 3E64A 3I60A 3R7IA 4U40A 2BAKA 5JK3A 5I9WA 3ZRMA 1R0PA 3RK9A 3KK8A 4HGEA 3SW7A 3UG1A 3QHRA 2V55A 3VUKA 3QQHA 5BUIA 2BRGA 4RSSA 3ANRA 4ENXA 4EQMA 3FKLA 5EDRA 5AADA 2HXLA 4ALVA 1R3CA 4YBKA 4YZ9A 2I7QA 1FPUA 3M11A 4L52A 2X6DA 4M68A 4EONA 4M3QA 3IDPA 2F49A 4FSRA 4RFYA 4U81A 5EOLA 5J9LA 2OJFE 4L7SA 1IA8A 3U9CA 4FKIA 2XNPA 3VHEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IGO A;  4Y85 A;  1I44 A;  3PXY A;  4OAV B;  1KWP A;  4N70 A;  3ZXZ A;  5LMB A;  4AE6 A;  4G17 A;  1PXO A;  4GT4 A;  2I0V A;  2UW0 A;  3RCD A;  1JVP P;  5AR3 A;  5L4Q A;  3R8P A;  5EW8 A;  3DXQ A;  4K33 A;  1IRK A;  1CM8 A;  3HA6 A;  4M12 A;  4XP0 A;  1FVV A;  3MFT A;  2HZ4 A;  1H1P A;  3DDQ A;  3ZM9 A;  1BI8 A;  2JED A;  4A07 A;  5HGI A;  1SZM A;  2YM3 A;  4HZR A;  4M84 A;  3H0Z A;  3I6U A;  4L3P A;  3KK9 A;  2XAN A;  4BVU A;  4FV9 A;  3VBQ A;  4CTC A;  3RAK A;  3A7F A;  3ACK A;  4D0X A;  4C4F A;  3ZSH A;  5HLP A;  4IM2 A;  2F2U A;  3KXH A;  2BIK B;  5DHJ A;  4XG8 A;  4RC2 A;  4DEH A;  4FI1 A;  4YZB A;  4IWP A;  4CMT A;  3H0Y A;  2QO7 A;  1V0P A;  3PP0 A;  3C9W A;  4QPM A;  4EK3 A;  4XG6 A;  3K5U A;  3LMI A;  4LGH A;  2WFY A;  4ZTL A;  1PKD A;  2P2I A;  3BX5 A;  4HCV A;  1PYX A;  4QML A;  1RW8 A;  3AD4 A;  5TE0 A;  2Y7J A;  3O71 A;  4FT9 A;  4IDT A;  3V5P A;  4EH7 A;  4PP7 A;  5A4C A;  1YXX A;  3L9L A;  3MVH A;  1IAS A;  4FVQ A;  3UDS A;  1WBV A;  4TY1 A;  1KE7 A;  4DEA A;  4O4F A;  3LQ8 A;  4TKS A;  5M4U A;  3F2N A;  4DA5 A;  4FTK A;  1ZOE A;  4C35 A;  4DF3 A;  4RLK A;  3PVU A;  2HZI A;  3NYV A;  3PSC A;  4RA5 A;  4BHZ A;  3PIZ A;  4Z16 A;  1PHK A;  4FUX A;  5CZI A;  4E6Q A;  5LVO A;  4RX9 A;  1OKZ A;  1OPJ A;  2BMC A;  4O96 A;  5CEP A;  3UPZ A;  2KTY A;  3Q32 A;  3QZI A;  2XNB A;  1O6Y A;  3L8V A;  4XX9 A;  3VJO A;  3TNH A;  1OEC A;  1R78 A;  3HV6 A;  4I6B A;  3QAL E;  5F94 A;  3PG3 A;  4LYN A;  2VTS A;  4AFJ A;  4ZSL A;  1LPU A;  1IG1 A;  2IW6 A;  3LFA A;  4BCH A;  2OZA A;  2OH0 E;  3KMU A;  3HMM A;  4EWQ A;  5BMM A;  1BYG A;  4QD6 A;  3LKM A;  3QKL A;  4IWO A;  2XKD A;  2ITZ A;  2WQM A;  4G5J A;  2EWA A;  3TYK A;  3HEG A;  1OIY A;  3TUB A;  2QOL A;  4X6R A;  3C51 A;  4FKQ A;  4JR7 A;  4WNK A;  2DS1 A;  5CSH A;  4AX8 A;  4EZ7 A;  1IAJ A;  4DED A;  1UU8 A;  2WTV A;  4E6D A;  1HCL A;  4D4V A;  3VUT A;  3GC8 A;  3K3J A;  2C0T A;  4AAA A;  2XK7 A;  1PXL A;  3QTI A;  4BDH A;  5IQH A;  1E1V A;  5G6V A;  5C8M A;  4ENY A;  3MPA A;  4IVD A;  5ANE A;  4ITJ A;  5HID A;  3W2P A;  2ETR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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