1JLUE

Crystal structure of the catalytic subunit of camp-dependent protein kinase complexed with a phosphorylated substrate peptide and detergent
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
339
structure length
337
Chain Sequence
QESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
publication title cAMP-dependent protein kinase: crystallographic insights into substrate recognition and phosphotransfer.
pubmed rcsb
molecule keywords AMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, ALPHA-CATALYTIC SUBUNIT
total genus 104
structure length 337
sequence length 339
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2001-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jluE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jluE02
2YAAA 5LXMA 3DV3A 3QZFA 3ROYA 4OLIA 1MQ4A 4C4FA 3LCOA 3LW0A 3VAPA 3NWWA 3Q32A 5C8MA 4I41A 5TE0A 3PSBA 5KKRB 3BEGA 1GZNA 1Y91A 3LFSA 4FI1A 4KRCA 1GZOA 5CF8A 3GCUA 5LMKC 2B7AA 2ITNA 4QTBA 4RMZA 4YGAA 3HRBA 3CY3A 4BGHA 1OECA 4QYFA 4RC4A 5J9LA 1J7IA 2OH4A 4GIHA 3UMXA 1NT2A 5D1JA 1AQ1A 3GC7A 4L3JA 3RHKA 4FZ7A 5JK3A 3SA0A 4PY1A 4RIYA 5E8SA 4EQCA 3KC3A 4RPVA 1JAMA 3NEWA 5DYJA 3RZFA 3DS6A 4GMYA 3ZBXA 4JR7A 5HICA 4EWQA 5CZHA 5FDPA 5IQAA 1EH4A 5GIPE 3QL8A 4F1MA 3NX8A 3BGZA 2BTSA 4FVRA 1O6LA 5AIRA 5HEZA 3VW6A 2FSLX 3TNIA 4ARKA 4UYNA 4BDBA 2XK7A 5DT0A 4JDKA 5A6OA 4AOTA 5F20A 4FTAA 4WNMA 4RJ6A 2XKEA 4BCGA 2YDIA 4HPUE 4M97A 1APME 3F2RA 5IQBA 4QQ5A 2UVZA 2R3JA 5HORA 2WEIA 1H0WA 3A4PA 4FTNA 1ZYDA 2O0UA 3R7VA 2OF2A 4O91A 3ZRKA 3MW1A 4APCA 4Z55A 4FT0A 4E8AA 5GZ9A 1LEZA 5J9ZA 4BDIA 3ZC5A 2R3RA 2RGPA 2OJGA 5EKNA 4F9AA 5IH5A 3A2CA 3A62A 4FOBA 4X3FA 4E5BA 4FKSA 4I0SA 4DGGA 2W96B 5FP6A 1YHSA 5J7BA 4FKPA 5IUHA 3UVRA 4EH3A 5AAGA 5AR8A 2WMXA 3VRYA 3BX5A 4C8BA 3QXOA 3QHWA 2YCQA 1WBNA 1E9HA 1OL5A 3NS9A 2OXYA 4BICA 4O0XA 1BL7A 3KCKA 2I0VA 3FWQA 1O6KA 3QX4A 3IW8A 4TNBA 1RW8A 3DTWA 4O84A 4S32A 3EQHA 4IZYA 4GJ2A 5HIBA 3FQSA 1L8TA 2V62A 3CJFA 3T9IA 4FG9A 4L8MA 2H34A 3ZXTA 2QR7A 3CE3A 3QQLA 1OIYA 4MWIA 5IQDA 3PXKA 4FZDB 1ZARA 4RIOA 3H0YA 1KV1A 3TL8A 4C61A 5I9XA 2QOCA 3KRRA 3ORNA 4UBAA 4C38A 4JAJA 4CMOA 2CGVA 4FIHA 3HGKA 3P23A 4ACDA 2GNFA 3QAME 4E5WA 4HGLA 2ZDUA 3KA0A 4KIPA 3TZ8A 4FA2A 2C1BA 3DBFA 4E93A 3VBYA 3ANRA 4EORA 2PL0A 3RAWA 4V05A 5IG1A 4EUUA 4YJSA 2VWXA 1IA8A 4M14A 2WMQA 3WBLA 2RSVA 4U6RA 3TIZA 5A46A 2X9EA 1WVXA 2JGZA 4FV3A 4NIFB 3IO7A 3C50A 3NW5A 4BKZA 5JZNA 4U0IA 3RPVA 4MF0A 3SRVA 4CMTA 1CKPA 2J6MA 4FZAB 2ITWA 4TY1A 2WMTA 4J52A 4ANOA 4JQ8A 5CF4A 2C5NA 1REJA 3C4WA 2UZTA 2G2HA 4M12A 3ZC6A 3I7BA 3G6GA 2GNHA 2JKQA 3DB8A 1MUOA 4XS2A 3HRFA 5CZIA 5HU3A 2DUVA 2GQRA 3ULZA 2XNNA 2RL5A 4KBCA 2BKKA 1U5RA 1LR4A 2Z7RA 3E64A 2XK6A 3FHRA 3H10A 3KXMA 4FKGA 3OROA 4MD9E 5AUYA 3NUSA 1PMNA 4MQ2A 5B2KA 3MTLA 3L8VA 4C57A 1JSTA 3DLSA 1KE5A 1YVJA 5T6KA 4LL0A 4DEBA 4CQGA 2WMRA 4HZRA 4WNOA 2VO0A 3F61A 2FH9A 4MD8E 2Z60A 3S95A 1T45A 3PXQA 3NNUA 5CAPA 5CEPA 3R01A 5M55A 3NVMB 1K3AA 1ZY4A 3MVHA 1V0BA 3QF9A 4I6QA 5DN3A 5HLNA 5AFVA 3RAKA 3IW5A 4C4HA 3GU6A 4W9WA 5ANJA 5K5NA 1M2QA 3PPZA 5HG8A 5DGZA 4O7TA 3FXWA 3OUKA 4R7IA 4AS0A 5EHOA 4YMJA 3TKUA 4O0WA 1M7QA 5L4QA 4NT4A 3KULA 4BCKA 4RT7A 5L8JA 4EH7A 2BPMA 2V22A 3RWQA 4XNEA 3E8NA 2VTJA 4ZLZA 2VTMA 3MB6A 4O7ZA 3MJ2A 5IQEA 3QWKA 3VHEA 2WMSA 4BRXA 4MTAA 5I0BA 2WMBA 3N4VA 1JKLA 4WO5A 3E62A 5HO8A 2E9PA 1M17A 2VNYA 3HKOA 4QO9A 5EQPA 2HENA 1PMVA 5IA0A 3HAVA 2J0LA 3DKCA 2HWPA 1H08A 4XOYA 1KE9A 3PA3A 4BHNA 4IFGA 3BHTA 2JITA 1I09A 4YJPA 5KX8A 3VBWA 3Q6UA 2ZOQA 5CSXA 5AR5A 4IANA 3QLFA 5JQ5A 2BRMA 2B4SB 3L8PA 4YSMA 3NIZA 1PJKA 4K1BA 5HZNA 3S00A 4G6NA 3UDBA 5J1WA 4ZS0A 4EC9A 4IVDA 4L44A 2C5YA 4V0GA 3EQFA 4U45A 5LVOA 3D5VA 3DPKA 3NZ0A 1BMKA 3OCSA 4HNFA 4IM2A 4UZHA 3NYVA 4N0SA 4JLCA 2WZJA 2VWIA 4EOMA 3UJGA 4HOKA 4B99A 2IVVA 3FLNC 4D4RA 2YM8A 3H0ZA 4D2TA 1GNGA 2XZSA 3BLQA 2C1AA 3DFAA 2GS6A 3PUPA 2WTCA 4B4LA 2BVAA 4F0FA 3W2QA 4NW6A 4CG9A 4U3ZA 4C3RA 3R8MA 1OKZA 3EHAA 4FR4A 3BI6A 3QQFA 4GU6A 5TKDA 3IGGA 1H1WA 4GRBA 2C6IA 2HY81 3BV3A 4DTKA 2QQ7A 5FXSA 2QKWB 4IB5A 4TWOA 3QZHA 3HYHA 4CV8A 4L7SA 3EL8A 3HUCA 5JGAA 3Q4ZA 3B2WA 3H9FA 4MXZA 3TTJA 3TDWA 4X2FA 3R7UA 3O23A 2YCRA 3OT8A 3GGFA 2O63A 4FKVA 4U5JA 4ZOGA 3V6RA 4H36A 1PMEA 4O6LA 4X3JA 4KNBA 3H4JA 4RQVA 2ACXA 1QPEA 3E7VA 1U5QA 3UVPA 4LRMA 1Q99A 5ACKA 2G1TA 3PVWA 5GINE 3IW4A 2EUFB 3OFMA 2F7EE 3W2RA 4Q2AA 5LVPA 1XH5A 3BPRA 1J1BA 2ITXA 3PPJA 2HK5A 2VTQA 2VO7A 3KB7A 1RJBA 3EZVA 2JC6A 5M53A 3DZOA 3JXWA 5AP5A 3SOAA 4L00A 3TJDA 1H1PA 1YDTE 4AGCA 1V0OA 2IVSA 5HBEA 5KO1A 5E9EA 2XJ0A 2ZM3A 3O96A 2GFSA 3LCTA 4O1PA 5EHYA 4EOLA 2CN8A 2WAJA 3E8DA 5CNNA 5CAVA 1Y57A 3QTSA 4CNHA 3EIDA 4IXPA 4XP2A 3ZSHA 3GU5A 5ITAA 2Y8OA 3FSFA 3G33A 3ERKA 3KRLA 1BYGA 4O2PA 3HMIA 5HCZA 4DYMA 4PNIA 3CTQA 4FT3A 5F1ZA 4CFVA 5FRIA 4J53A 4IWOA 4X6QC 3TUBA 3IS5A 4YC8A 2A0CX 2BILB 4LV8A 4X2GA 4C37A 4WOVA 5AEPA 2UW0A 4A9UA 3I79A 4JBQA 5LOHA 2XRUA 1XBCA 2X2LA 3HZTA 3C4FA 3GOPA 3PY3A 4FL2A 4LGGA 2XF0A 4AZWA 4F9YA 3ID6C 5BQ0A 1PKGA 3RPSA 1YHVA 4KD1A 4OT6A 5HG9A 1H26A 4U79A 1QPCA 3S2PA 2R5TA 2GQSA 4FNZA 1YWNA 4GK4A 2W9FB 4RX7A 4BZNA 4FE2A 3VRZA 4EOIA 3KVXA 3LFQA 5M09A 4H58A 4CCUA 3RI1A 1OITA 4PMTA 3P79A 1SVGA 3OF0A 4X2KA 4XCUA 4ZXTA 3TWJA 2J0MB 4Z16A 1G3NA 3IK3A 1BUHA 2R3NA 4BIBA 4E4NA 2RFDA 3TV4A 4C58A 4XG9A 2Z02A 3QQUA 3FI4A 2WO6A 2OBJA 3P86A 5BYZA 4CZYB 4MD7E 1UV5A 4R78A 2QNJA 2NRUA 2BRNA 3P9JA 4EWHA 2XNOA 3Q60A 4RFMA 5J79A 2ZV9A 1F3MC 3ZM9A 3RPYA 2I0HA 4YZMA 2HOGA 2X6DA 4ZY5A 2E9UA 3C4ZA 4IADA 2VO3A 4UMQA 2C68A 2PMLX 2HXQA 2YM7A 3QHRA 4C4GA 4D2WA 2R3HA 4EK4A 1XHAA 3LAUA 3PG1A 3RM7A 4YPDA 3BQRA 3MH1A 3KMWA 1YW2A 5AADA 4D2VA 4NIFA 2RFEA 1H1SA 2J0KA 4C62A 4XBRA 1NW1A 3KREA 1PMUA 5EYCA 4K6ZA 4O0RA 4G2FA 3OC1A 3SLSA 3TCPA 2XYNA 1CKIA 1M2RA 2P2HA 3UOHA 1CTPE 3OBJA 1VYZA 3AGLA 4MVFA 2A1AB 3V8WA 1H1RA 3LXLA 5HNIX 3CKXA 4G3DA 5AUXA 4ONAA 3QTUA 5CYIA 1E1XA 4FNXA 4YO6A 2BIKB 5LCJA 1GZKA 2ZMDA 4C4JA 2QVSE 2C5OA 4L3PA 5DRDA 3THBA 3QQHA 4BVUA 1PXPA 4EQMA 5EOBA 4JG8A 4OTGA 3E88A 4YZ9A 3OOGA 2C6MA 3DK7A 1MRUA 1YWRA 4OAUC 5ANEA 4DFBA 1MRYA 4EOPA 4AW5A 1U54B 5HX6A 2VU3A 3ZS5A 3C5IA 1UWJA 5KCVA 1XJDA 4JS8A 4RG0A 4GSBA 4ACGA 4C59A 3BBTB 4ERWA 4F1TA 2PE2A 3IGOA 3EMGA 4DFLA 3G5DA 5CF6A 4RFZA 4JJRA 3RAIA 4IAKA 5BVEA 1ZWSA 4I6FA 1KE7A 3AOXA 3ORZA 5AP7A 5TF9A 3QUPA 2WEVA 3T3UA 2PK9A 2OF4A 3EN5A 2R0UA 2CGUA 3L8SA 4AOJA 4UMUA 2CKOA 2I40A 3O51A 3VNTA 2GMXA 4O0VA 4BCHA 5A4LA 3LFCA 5D9HA 1PHKA 5E8ZA 3NNVA 2YIWA 1PY5A 4YJQA 2O64A 4G3EA 4LMUA 4XP3A 3ZO2A 2E9OA 3BYUA 5M4IA 5JFWA 4RJ5A 3P7BA 2OGVA 2P55A 1ZOEA 3O2MA 3PYYA 4IM0A 4RVTA 3R21A 3CCNA 4C4IA 2PVMA 2Z7SA 4KSPA 4PL3A 4PP7A 4FMQA 4FK6A 5CT7A 5HOAA 3ZOSA 3O7LB 2GTNA 1SM2A 3BHHA 3GQLA 2YIYA 4U81A 2VN9A 3F7ZA 5I9UA 3O8PA 2IW8A 2JFMA 4DH1A 4CFUA 5AP6A 4G16A 4G5JA 1Q8ZA 4CT2A 3F6XA 2H6DA 4BY9E 1IR3A 1Q3WA 2XBJA 4F99A 3I60A 1PXNA 4EZ3A 4CG8A 3LXNA 2KULA 3KU2A 2QOHA 2OKRA 3SHEA 4GK3A 4XHKB 3UIMA 4R3CA 3II5A 4GT5A 2X0GA 2YACA 4CVAA 4NCTC 1FQ1B 3OEZA 3ZONA 2XIZA 3DBDA 3RK7A 3EB0A 3QKMA 5KMNA 1P4OA 2J2IB 2A2AA 3R00A 3TNHA 5KUPA 3C5UA 4QOXA 1KE8A 3TG1A 3OMVA 5LMKA 2BAJA 2C0OA 4NWMA 3PA5A 4F09A 1M52A 3ZSIA 1X8BA 5DFPA 4FSUA 1WVWA 4IX3A 3ALNA 3BU3A 4MBLA 4RA4A 5EDRA 3ZTXA 2CDZA 3BYSA 3LCKA 5JN2A 2PU8A 2PUNA 1FPUA 3GUBA 3PFQA 4A9YA 2VNWA 2Z2WA 3LZBA 2YM6A 4QMSA 3CJGA 3ZLYA 3DJ7A 2C47A 3A61A 3LQ8A 5E8TA 3RPRA 1SZMA 3HMPA 3NAXA 4RWLA 3AT4A 4H1JA 4WHZA 4E73A 2UV2A 2XK4A 2XNEA 4HCVA 1YXSA 4QYGA 2XNGA 1YDRE 4BC6A 3RVGA 3EQRA 5BNJA 4IVCA 1M7NA 2I7QA 2EVAA 2WNTA 3DOGA 3OVVA 4ZTHA 3UMWA 2UW6A 3UZPA 3CSVA 2JKKA 5EM8A 2VZ6A 1GAGA 5BX0A 4IB3A 2W99B 3IDBA 1BI7A 1XWSA 5EI2A 4E3CA 1Y8GA 1OKVA 2OIBA 4ZMEA 4RFYA 2I1MA 4YJTA 5KE0A 5JT2A 4B8MA 1PYXA 3ETAA 4Q5HA 1FVTA 5D12A 4NM3A 5AAFA 4E6QA 4GVAA 5ANKA 2J51A 2W05A 3QGWA 2QONA 2J0JA 3P0MA 4PTCA 4YHJA 4QP3A 4YU2A 3KEXA 3PXRA 4YURA 1RQQA 1Q8WA 3P7CA 4DGLC 5AM6A 2OJ9A 2Z7QA 4ZZNA 5JKGA 2WMVA 4QNAA 2X81A 4QYYA 4DLIA 5TO8A 3AT2A 4LM5A 3NRMA 2JIVA 4UXLA 2EB3A 3V8TA 3PE1A 1H4LA 5EFQA 1I44A 3RMFA 1JLUE 4JBVA 5G6VA 4BR3A 1JOWB 1H8FA 3FMNA 3PIYA 5EI6A 3DK3A 2JBPA 2HCKA 3CQEA 4NTSA 4TYGA 5HBJA 5L6OA 3DXPA 3TNPC 1BI8A 2W1ZA 4G17A 2A27A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ZRL A;  4DIN A;  2JAM A;  2EXM A;  1NA7 A;  4TWC A;  4YHT A;  3FI3 A;  5E90 A;  2LAV A;  1W82 A;  4IEB A;  3PTG A;  3LFF A;  4HCU A;  4AA4 A;  3ODZ X;  1NVQ A;  2CGW A;  3F3V A;  3WI6 A;  2B9F A;  2B9H A;  4FTI A;  3CS9 A;  5JRQ A;  3JY9 A;  2X1N A;  3CQU A;  1ZY5 A;  3KUL B;  3K54 A;  4RLL A;  4CFM A;  3QU0 A;  4FTJ A;  2BRH A;  3VS6 A;  5CEM A;  3RAH A;  1U4D A;  2WTJ A;  4IFC A;  4C35 A;  4HGE A;  2CLQ A;  3Q4U A;  4YP8 A;  2PY3 A;  4DFX E;  4FOC A;  2R2P A;  4FL3 A;  3EH9 A;  3LFN A;  3ZUV A;  2YIS A;  4M3Q A;  2ITO A;  3V6S A;  4F65 A;  4D1S A;  4K8A A;  2XCK A;  4KS8 A;  2RFS A;  2PVJ A;  4FTQ A;  1Q3D A;  1XQZ A;  3HAM A;  2QO9 A;  4USD A;  2VWW A;  3C4C A;  1P2A A;  3Q53 A;  3ZSG A;  3DZQ A;  3VS3 A;  4V0G B;  2UVX A;  5IDN A;  4I5P A;  2OU7 A;  2YA9 A;  3LIJ A;  3M11 A;  2ZB1 A;  4WSQ A;  3ZUU A;  4IX4 A;  1Z9X A;  2GHM A;  3OEF X;  4NFM A;  4A4X A;  3QWJ A;  4AWI A;  4BI1 A;  5CU0 A;  3F9N A;  5A9U A;  5IIS A;  2EWA A;  2XRW A;  4ZEG A;  2BRB A;  4FSR A;  3F3Z A;  3NYX A;  5CAQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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