1JSVA

The structure of cyclin-dependent kinase 2 (cdk2) in complex with 4-[(6-amino-4-pyrimidinyl)amino]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
298
structure length
287
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKITAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The cyclin-dependent kinases cdk2 and cdk5 act by a random, anticooperative kinetic mechanism
pubmed rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 287
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2001-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1jsvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1jsvA01
2WIHA 4II5A 3HV6A 2ITQA 4NW6A 5CSWA 3C4CA 1R39A 4FTKA 5IISA 4P90A 1YHWA 2VNYA 5FP6A 1MP8A 5H2UA 1TKIA 1U54A 1J3HA 3HRBA 1W0XC 3UG2A 2VD5A 4F0FA 1URCA 2C0OA 3BYOA 5AUYA 5CEPA 3ZDIA 2V55A 5CTPA 3LMIA 2OJJA 3COHA 4DGMA 2Q83A 2GNHA 3E5AA 2OJFE 1PMNA 4DT8A 1YI4A 1G8AA 3MH0A 1R0EA 3WZDA 5CF4A 4QO9A 2FSLX 4PX6A 3GU4A 3OT8A 3ZLWA 4E6DA 2ZM1A 3TUDA 3CR0A 4UWYA 3BV3A 2X0GA 4GYIA 2OGVA 5H9BA 2XK8A 4Q5EA 3RCJA 5LARA 1OBDA 3GNIB 2YZLA 2CSNA 4IFGA 3LXPA 1APME 1OIRA 3QRIA 5CEMA 4P2KA 5DI1A 3W2RA 2Y4IB 3VULA 4ACGA 5AP0A 4FSMA 5HU3A 4CG9A 1Q8TA 1O6KA 2JIVA 5FEQA 4ZY5A 1XBBA 1GZOA 2YN8A 4JG8A 4W4WA 1J7IA 4YURA 3MH2A 1GOLA 4BBFA 4GL9A 4YJUA 4QMNA 4YTHA 4PNKA 4MEDA 2JGZA 4ZY4A 5I9YA 3RWPA 4FKTA 1URWA 4BBEA 5HNGA 3PUPA 3QC4A 4ZMEA 1YXSA 3A8WA 4PL5A 3NIEA 4XV3A 5J87A 5CEQA 3V3VA 3WF7A 4CLJA 4DT9A 3CE3A 2P2HA 4QOXA 4TWNA 5EDRA 2GDOA 3AT4A 3F3VA 4X3FC 3UIMA 3ET7A 2WD1A 4MF0A 3DXQA 3G9NA 4DA5A 1JKLA 4EKLA 4JNWA 4NM0A 4U81A 4YP8A 4QMZA 4MXOA 5EM5A 3SKCA 4RSSA 4WOVA 5A4TA 4L52A 3FZTA 3JUHA 3LFEA 3NCZA 2YCQA 4ZSEA 5F95A 4QMUA 4F0GA 5IA4A 4I23A 1V0PA 2UW9A 3R9NA 3Q6WA 5CZIA 1SNXA 2B52A 1FPUA 1GIJA 3LJ0A 4OTGA 3LW0A 2YACA 3MS9A 4KWPA 5I9VA 5IPJA 5JZJA 1H01A 3C5UA 3OXIA 4GT5A 4RPVA 1FGIA 3C0HA 4FSQA 4TPTA 3KRWA 4FR4A 5L6WL 5CSXA 3NUYA 5HO8A 5BUIA 3Q4CA 2XIYA 2YIRA 3COIA 5E8TA 4B8LA 4O1PA 3OXTA 4XG4A 2C5XA 4Y5HA 4A4LA 4OUCA 5G6VA 1PRYA 2F4JA 3ZH8A 3MIAA 4U42A 3ZLXA 2F7ZE 4APPA 4F7NA 4LUEA 4QP7A 5EQYA 1RDQE 4ANLA 4UY9A 5CXHA 4R8QA 3P08A 5F4NA 2GQRA 2RL5A 3DZQA 5C4KA 4BCHA 1PXNA 2OXYA 4JDIA 3UQGA 3DK3A 2SRCA 2XRUA 2ZB0A 1RJBA 3PIXA 5DLSA 4PMTA 5IEXA 4P7EA 4ZJVA 3VBVA 2Z7SA 4PF4A 5AUZA 3LXLA 2OLCA 2UW8A 2X2LA 1OPJA 4FSWA 4JQ8A 4OLIA 4XYFA 2W1DA 4ZTLA 3RALA 5JQ5A 4MQ1A 3LFBA 2QO7A 1ATPE 1M14A 4JX7A 4GIHA 4AZSA 1GAGA 4DTBA 1Q3DA 4L6QA 3D2IA 1G5SA 3F3WA 3CGOA 4I6FA 4DEAA 5DYJA 3FXWA 3R7GA 4QQCA 4E20A 2OO8X 3KREA 2ZB1A 3LM0A 4OTRA 4QQTA 4IHPA 5TR6A 2XJ2A 3ALOA 2YDIA 3QQFA 5FD2A 1QPCA 1UWJA 3KFAA 5M4IA 2GNGA 3FLYA 3H4JA 3MVMA 3KRJA 3V8SA 4BL1A 3DXPA 3LE6A 4F6SA 3DJ6A 3LXNA 3TKHA 4EUUA 3VW8A 3RCDA 3JS2A 3C4XA 3VBTA 4CCUA 3RBWA 2XYUA 1PMUA 3PJ2A 3QZFA 4FI1A 2F49A 4BHZA 2ZMCA 4UX9A 3KN5A 3PSBA 4KIPA 4TT7A 1XJDA 2PE2A 3D5XA 4OBQA 4F9YA 3LCKA 3AXWA 2QHMA 2AUHA 5LMBA 1B39A 3E7OA 4PL3A 4G6NA 3HZTA 5TKDA 3OG7A 3FL5A 3ORKA 4UYAA 4LMUA 4WHZA 4GVJA 4X2JA 1NVQA 2P4IA 2PK9A 5HCZA 5HE3A 3TZ9A 5HO6A 4EH7A 4DBXA 4U0IA 1XO2B 1PY5A 3PP0A 5DFPA 1GIHA 4C35A 3QTWA 4JR7A 3VAPA 4RX7A 5FTQA 4G3EA 2I6LA 1REKA 2XK7A 5EHLA 4HZRA 1IR3A 2XK4A 4RLKA 5J79A 3MV5A 5J1VA 2UZNA 3OWPA 4D1SA 4GG7A 4YR8A 3NUNA 3DBFA 5A4CA 3CTHA 4TXCA 2C5VA 2EU9A 1AGWA 3F3ZA 2HW6A 1Q41A 4FV8A 4OBOA 4PTGA 3SXSA 2CGXA 2V0DA 2YLFA 2QU6A 2XA4A 3A4PA 3R1NA 3NUPA 2QOBA 3AC3A 2XNEA 5CZHA 5EHOA 5AV3A 4CZTA 2WPAA 4DAWA 1HCKA 4Z3VA 5KO1A 2DUVA 2O8YA 1ZOEA 2W5BA 3VJOA 3VIDA 2PUPA 4NSTA 1V0BA 3UMWA 3FZSA 3G90X 5E8ZA 2O63A 3TIYA 3Q2MA 1YOLA 5A4EA 1WCCA 4C0TA 1LEZA 4AA4A 3PJ1A 2RG6A 4HNIA 2BAKA 2VTAA 4BHNA 4PP7A 2QOIA 3RHXA 4DN5A 5FDXA 2ONLA 3DPKA 3LLAA 4FTUA 5A4QA 4RG0A 4KRCA 3U8WA 4QP9A 3ZYAA 3GENA 3MY5A 3QZHA 3QTSA 4XG7A 4A7CA 3CIKA 4EWHA 2OFVA 4AU8A 5E8YA 4ZJIA 4Q2AA 2J6MA 3DK6A 1O9UA 5AUTA 2BDJA 3SV0A 2F2CB 3C1XA 1FQ1B 3LFQA 4KSQA 4X2NA 2X6EA 5ETAA 1AD5A 3MBLA 4D55A 5IU2A 3W55A 1BKXA 5CAPA 3CD8A 3PPKA 4FMQA 1J7UA 4F0IA 5M51A 3ZRLA 3RKBA 1XBAA 4O7YA 5AR7A 4YGAA 4EK5A 4MVFA 4GIIA 4JT3A 3RP9A 2XKFA 2R3IA 3A4OX 4D2WA 3R01A 1PKGA 3POOA 3QQKA 1MUOA 2H96A 2OXXA 4MF1A 4E5AX 5FXRA 2A2AA 3WARA 2P33A 2I0YA 1NA7A 4QTEA 4OTWA 5KBRA 3EN4A 4RZVA 4F99A 4DH1A 4HVSA 4EOKA 4QTAA 4EQMA 2Z7LA 2XKCA 5ANGA 4A07A 3HDNA 4QMOA 4XJ0A 3F61A 2C6MA 4JDJA 4AT4A 3UP7A 1JOWB 4EBVA 2ZV8A 3I6WA 4LRMA 4ZZOA 1JKKA 5I4NA 3QD0A 3ERKA 4KAOA 4AQCA 3HAMA 1LPUA 1ZYJA 2VU3A 3NCGA 5IG1A 2OK1A 3QRTA 4HNFA 1LP4A 3O71A 5GJGA 3TNQB 4Z9LA 2QG5A 5FWKK 3SRVA 4CT1A 3QUPA 4ZK5A 1XH6A 1VZOA 1WVXA 2UW0A 4GK3A 4NTSA 3LMHA 5CEIA 4L3PA 4CTCA 4K18A 3KU2A 4E8AA 4U5JA 2YIQA 3O8PA 4XUFA 3DA6A 3QZIA 2C5NA 1PMEA 2YWPA 3LCOA 4FT3A 4N70A 4TYHA 4XV9A 2EVAA 4O2ZA 4BWPA 4IVAA 2Y4IC 4XG2A 2PVMA 3ORZA 1WVWA 4FV3A 4RA5A 4WNOA 1GNGA 3FLZA 2EXCX 3ZZWA 4CYIA 5L6OA 2Z7RA 4L3JA 5J7HA 3BZ3A 1UWHA 2C3LA 1IEPA 3GBZA 4L00A 2NRUA 3EQHA 4AOTA 3FI4A 4JS8A 4CZUA 2VO0A 3E87A 3CGFA 3PPJA 3P5KA 5B2KA 3E62A 3EQGA 3FSFA 4H3BA 4BCPA 2XK6A 4UMUA 3GB2A 4CNHA 5DVRA 4E4MA 3FC1X 4DFUA 2OIQA 3V5LA 4IWOA 2IW6A 2XS0A 2YHVA 4RJ8A 1OGUA 5FGKA 3MW1A 5FM3A 1JSUA 5CALA 4G3DA 4O91A 3FI8A 4I4EA 4QT1A 4S2ZA 3MIYA 2WNTA 3O2MA 4MXCA 3D7TA 5M55A 4FKJA 3F88A 3QTIA 3E8NA 4EOIA 4EUTA 3MPAA 4L67A 1GZKA 4O81A 4CV8A 3AOXA 5KMIA 1Z9XA 4WSYA 3SQQA 2VTLA 5AP2A 5LQFA 3QWKA 5E1SA 3E3PA 2R3RA 4BGGA 1LEWA 2R3NA 2W4OA 2IPXA 3AGLA 3HLLA 1BI8A 4NM5A 4XP0A 5C26A 3S00A 2YWVA 4AACA 4TW9A 1DI8A 5A6OA 3VNTA 4BDAA 4FT5A 4AZWA 2GCDA 4BWKA 4RC3A 2J4ZA 2YAAA 5BX0A 5AR4A 4LMNA 4QTBA 1I09A 4G1WA 1FVRA 3UNKA 5DBXA 3TNPC 5B2MA 4X6RA 4AFEA 4D2PA 2ITPA 2XH5A 4I0RA 5C1QB 4BDIA 3QL8A 2JDTA 2YERA 2CDZA 1VEBA 4WRGA 4C57A 4RIOA 2YZAA 3QQJA 2WTJA 3FYKX 1XR1A 3ZLSA 4AT3A 2OU7A 3OUNB 3E93A 4F4PA 5IKWA 4QQJA 3C9WA 4FTOA 3EQFA 2EXEA 4E6AA 5J5TA 3PXQA 4BWXA 4EH6A 4O86A 3DY7A 4D5KA 1PYEA 3GOKA 3CTQA 5AP6A 2WO6A 3W8LA 2X4ZA 3DCVA 3NGAA 1JAMA 3REPA 3CBLA 4GS6A 4MBJA 4KIKA 1WAKA 3DNEA 3OCBA 4V01A 1G3NA 2PUUA 4GFMA 4X0MA 5DE2A 5JFXA 1TQIA 5J1WA 4NH1A 4Q5HA 4Z55A 3CSVA 4EC9A 2UZTA 4QTCA 4RC4A 4RLLA 2VUWA 3IPHA 3IKAA 3RAIA 1RQQA 3IOKA 4MBIA 3EMGA 3U87A 2XMYA 4GKHA 3ZBXA 4O7RA 3S95A 2B9IA 4S32A 5I9XA 4I41A 3TV7A 5HG7A 4C61A 2C6IA 4YBKA 4YLLA 3VUTA 2ERKA 4Z7HA 1ZZ2A 3MFSA 4UBAA 5EI2A 3ZRKA 3TNWA 3IO7A 5IA3A 1R78A 3UIXA 4QP6A 4V0GB 1M2PA 3QQUA 4QMQA 4DFBA 4JX3A 4G16A 4BI2A 4QMSA 3V6RA 3UP2A 4FKSA 3V5PA 5FTOA 5FBNC 3UIUA 4BCIA 3LQ3A 2WMWA 2VTQA 2IVTA 4QMVA 3G2FA 5GZ8A 4FC0A 4DFZE 4YSJA 2QQ7A 3II5A 2YCSA 3NW6A 3HVCA 5FEDA 3WZUA 2WXVA 3KA0A 1HCLA 2OI4X 2PMLX 3QRUA 4M12A 4ALWA 5LCJA 1OUYA 3OROA 4O0RA 4F7LA 3CPCA 2H9VA 4YJQA 3R7OA 3D5VA 4F63A 3W18A 4PMPA 3HP5A 1GZNA 1ZY4A 2R9SA 3C4WA 3O7LD 4ENXA 3G15A 4FV9A 2XUUA 3U6HA 2PVHA 2BALA 3TKIA 4I94A 2CCHA 4M84A 1IA8A 2BKZA 4ANQA 3PLSA 4L68A 5BNJA 4KD1A 3L8PA 4PTEA 5C03A 4U7ZA 5AP7A 4JAJA 3FXZA 2XIXA 2W0JA 3RHKA 1W82A 2GU8A 1Y8YA 1Q61A 3LMGA 3S4QA 2UW6A 1SM2A 2WTKB 4J52A 3ZTXA 4QP3A 3DTCA 5GZ9A 5BVKA 4KS7A 1FOTA 5IUIA 4GJ3A 4EK6A 5EQEA 1M52A 3QYZA 4FYOA 4PP9A 4TRLA 2VGOA 3GGFA 4FE2A 5ACBC 3LJ2A 2YIYA 2B4SB 2GNLA 5AV1A 3H0YA 3BHUA 4IM0A 4X3FA 4CQGA 2Z02A 4EJ7A 1PHKA 4EK4A 4QP1A 2R4BA 4FKWA 1KE9A 2C30A 3ACJA 1Q5KA 5HICA 3QD3A 2ZOQA 2VAGA 2EUFB 3OZ6A 4FIJA 5A6NA 3SGCA 3I7BA 3KCFA 3C13A 1Q8YA 2FSMX 2ZAZA 3LLTA 3ZONA 4BBMA 4U3ZA 3TWJA 4O84A 1BL6A 1Z57A 4LFIA 1CMKE 4IH8A 4B8MA 4DFNA 4GU6A 4NKAA 4FKQA 4FEVA 4FNZA 3UNJA 1BUHA 1IAJA 3IGGA 4MNFA 4HCTA 2CGUA 4K33A 4GEOA 2VRXA 1J1BA 3DFAA 5HNIX 4RWKA 3NYOA 2C5OA 5IQAA 4DYMA 4XG9A 3NSZA 4EJNA 3UOHA 1CM8A 2JEDA 5CT7A 3SW7A 4D0WA 1Q8UA 1P2AA 3DT1A 4L3LA 2WMRA 4BYJA 4BZOA 3UODA 5H8EA 2RSVA 3ZFYA 1KWPA 4EOQA 3IECA 3ZO1A 1Q97A 5FQDC 3ORLA 2X1NA 3RWQA 4ZTRA 4EK8A 3ZFXA 3FZPA 3K3IA 5E90A 4IEBA 3ZHPC 3F6XA 2XK3A 5E8SA 3RK5A 5BQ0A 1M17A 2OSCA 2X9EA 4OTQA 3KRXA 4XOYA 5EW3A 3KN6A 4AZFA 3OXZA 4J71A 4CCBA 4GU9A 4K2RA 2XKDA 5DPVA 3A7HA 4BCJA 3IGOA 2JDRA 3MPMA 2HYYA 2JIIA 4XOZA 4JOAA 1H0WA 3A99A 5BYZA 1OUKA 5M57A 1R0PA 2XNNA 3MJ1A 3CJFA 3L1SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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