1M2QA

Crystal structure of 1,8-di-hydroxy-4-nitro-xanten-9-one/ck2 kinase complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Inhibition of protein kinase CK2 by anthraquinone-related compounds. A structural insight
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II, alpha chain
molecule tags Transferase
source organism Zea mays
total genus 107
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2002-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1m2qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1m2qA01
5E1EA 1ZYJA 3EQRA 3VAPA 2JLDA 3UG2A 1EH4A 5EM5A 2YIXA 4HNFA 4AT3A 4GK2A 5GJDA 4ANOA 4WD5A 2PZYA 3PSCA 3ZFMA 3ET7A 4UX9A 3JUHA 3FQHA 2YACA 3OG7A 3HA6A 2H6DA 2FYSA 4M8TA 3ERKA 3NNUA 2F9GA 5FGKA 3RPVA 4U5JA 4AFJA 5M06A 2OZAA 5AAEA 3RCDA 4UYAA 5B7VA 4DAWA 3CC6A 3LXNA 4FK3A 3OHTA 2JGZA 4CMUA 4DFZE 3VVHA 2XNMA 3DGKA 3NNXA 5JFVA 3MESA 4CFNA 3OTVA 3QC9A 5EHOA 3BX5A 3V04A 3V01A 3MFTA 4DFLA 4TNBA 2NNWB 2BRHA 3PRFA 3DPKA 4ERKA 3LXPA 2GPHA 3ZSIA 3UBDA 4ANNA 1CMKE 4G5PA 5JGBA 4EOLA 4TYGA 3IQ7A 4C2WA 2YLFA 3KMUA 5HD4A 4BICA 3I7BA 2FUMA 3ZLXA 3D5UA 4M68A 5HG7A 2JKQA 2VZ6A 4KRDA 4F63A 5BUEA 2UW3A 3ZOSA 4QMVA 5HLNA 4A07A 3Q52A 4P2KA 5DWRA 4E4XA 4H3QA 4RC4A 1PXKA 2PMLX 2UW6A 1F0QA 2WIHA 2QHMA 5CASA 2ZM4A 1YXVA 2UZOA 3EYGA 1XO2B 2QI8A 4FTLA 4GCJA 4RJ3A 2R3RA 3TXOA 4UWCA 1OPKA 1H25A 3LVPA 4D2TA 3KXNA 4JNWA 4K77A 4USDA 4PMMA 4D5KA 4EOIA 4BBFA 5IEVA 1OI9A 3HP5A 3TJCA 4F9YA 2VWZA 2WTDA 4UV0A 4OAUC 2WMXA 4QTDA 3OD6X 3AQVA 4IM2A 5AP1A 2ZM1A 4RIWB 4D9TA 3FV8A 4EHZA 3VS6A 5IQBA 4CMOA 4RJ4A 3Q6UA 4BCGA 2C5XA 5AJQA 4L6QA 3JPVA 3TTIA 4ZSJA 3WZDA 4BCPA 3W32A 4NIFA 2PUIA 3QQLA 3EFLA 4F9CA 4H3BA 4CKRA 1PKDA 3G0EA 5EKNA 1NA7A 5HZNA 4BDHA 4BDBA 5DT0A 1PXOA 4BCQA 3I79A 2IJMA 4MNEB 5DMZA 4EZ7A 2JDRA 3NCZA 4IAYA 1UU8A 4PX6A 4ZTHA 3PSDA 3BE2A 5EFQA 4EC8A 4F7LA 2O64A 4EH5A 3RP9A 2OIQA 3EKNA 3WYXA 2CPKE 4EHGA 2PYWA 3IW4A 5LARA 4MF0A 3G5DA 3ZTXA 2IZRA 4AZFA 1YOMA 3I1AA 5DN3A 3O8UA 4JOAA 3N4VA 4F7JA 4JDHA 2Q0BA 2W4KA 2YERA 4BDIA 3DBEA 3JYAA 3KULA 4P5QA 4CG8A 2HXQA 4O0UA 1ZZ2A 2JFMA 4GUEA 1YXSA 3KK8A 4L46A 5AR8A 3PXKA 4U0IA 4QYYA 4BL1A 3VWAA 3LJ0A 3R9HA 4E5WA 3MB6A 3F2AA 4G1WA 5CSVA 5LMAA 3PVUA 4FNZA 4IM3A 4BGGA 2UVXA 3P0MA 5IDNA 4D58A 4FSMA 4B4LA 2BFXA 3HDNA 1Q61A 1UKHA 4PV0A 3MI9A 3VS5A 4I21A 4KINA 3G0FA 1SMHA 4S34A 4FZ7A 4TYJA 3PXQA 3PXYA 2Z60A 1WBSA 2IPXA 3ITZA 5FQDC 4R78A 3NW7A 4BI0A 3ORMA 5HIDA 4FF8A 4JDJA 3KY2A 2B0QA 2I0HA 3VS3A 2C47A 3UPXA 5CENA 4ZY5A 4ZTQA 3KF4A 5LXMA 4EOJA 3HMOA 1YWNA 1NVQA 4XNEA 4QPMA 5DIAA 3R7OA 5CNOA 3BHYA 1SNUA 3HRCA 5L2SA 2RG6A 2B54A 1Q99A 2BROA 3F2NA 5IMXA 4KIQA 5ANEA 3E62A 3AGMA 4JXFA 3R30A 5ANJA 3QXOA 1GJOA 1UWHA 2PVYA 2XRUA 4I6HA 3M2WA 1YRPA 1WFCA 4QOXA 4LRMA 4HGTA 4I22A 3REPA 3G90X 5K3YA 1OL1A 2YHVA 3ZZWA 1LEZA 3Q5IA 2QVSE 1YHVA 3PIXA 5GZ9A 4C7TA 4CLIA 3ZFYA 4BGHA 3BPRA 4IZAA 4L3PA 5BVWA 3F82A 4FTTA 4IB1A 4QMLA 3DTWA 5GJFA 3ZM9A 1OIQA 3AGLA 2C3LA 4O0WA 4WUNA 1RW8A 4USFA 2R3KA 4JJRA 2JDOA 3UPZA 3COHA 3FMKA 4K11A 4X21A 3UVRA 4D1SA 3L9LA 1UU3A 2JIIA 4IFGA 4K6ZA 1KSWA 4OTQA 4KS7A 4UWBA 2BIKB 2GTMA 4RJ8A 3FZTA 4BTMA 3GXLA 1DI9A 2UW0A 3UOHA 1S9IA 3VW8A 3RVGA 4GT3A 3VF9A 2GHGA 5CTPA 3ODYX 4I5PA 5EW8A 2FVDA 4E4LA 3BBWA 3GEQA 1PXNA 2ZMCA 2BZIB 2GNJA 3ELJA 3RHKA 3FZPA 2PZPA 5EKOA 4W9XA 5IA4A 3TNHA 1Q4LA 4MK0A 3QTRA 4IBMA 4E6DA 4ANLA 3NVKI 4FZ6A 2R3IA 4FMQA 3H10A 3IW8A 4MX9A 4OW8A 4ZMEA 2ONLA 3F3WA 3F7WA 4IX3A 3OS3A 5JZJA 2GU8A 3ORXA 5C1QB 5L6WL 3VS4A 3L1SA 4C36A 4PF4A 5TOZA 2JC6A 3RGFA 4EQUA 3L8PA 4ITHA 4GYGA 1ATPE 2RL5A 2VO0A 3RPRA 3HAMA 5CQUA 5KKRC 2CN8A 2AUHA 5C4KA 5DNRA 5D41A 3O7LB 3UJGA 2VTNA 2G2FA 3LKMA 3R02A 1URCA 2WNTA 3BBTB 3DT1A 1QPCA 5AV2A 4FKWA 3W10A 3N9XA 4U41A 5E8VA 5TE0A 3ROYA 4ZJVA 4JL9A 4MQ1A 2OF2A 4TTHB 3R7YA 4MWHA 4F0IA 4PNIA 4BDFA 2VWUA 5M07A 3CGOA 2PMIA 3GT8A 3GP0A 3OXTA 2OIDA 5J9LA 2X0GA 3FLSA 4O27B 4XUFA 5IZFA 3MPAA 2QOOA 5ANIA 3VJNA 2Y0AA 4ASDA 3E63A 4GH2A 5JFXA 4FTIA 3ZCLA 3ANRA 2JEDA 4HCVA 4MBLA 2HYYA 5GZ8A 3UVPA 3ID6C 5CF4A 2PY3A 1MRUA 2WD1A 3QL8A 4FVRA 4JG8A 4XP0A 5G1XA 4ZSEA 4CVAA 3UQCA 1I09A 3MY5A 5CLPA 5ANGA 3OF0A 1PF8A 2O0UA 3PP0A 4KRCA 5DT3A 4ZY6A 3O8TA 1A48A 4PPCA 1HCKA 2WMRA 5E92A 2I6LA 4BYJA 1YOJA 3DZOA 3P7CA 3CR0A 4MYGA 4PL4A 2GNLA 4HW7A 5IF1A 4FSZA 4BDDA 2E2BA 3E87A 4S30A 4IZYA 5EYDA 1WVWA 2BDFA 3I6UA 5CU2A 5AAFA 3TNIA 4ACGA 2VV9A 5CEKA 4MBJA 4YJQA 4MH7A 4O7RA 1OUKA 3F61A 1XQZA 3EQBA 2W99B 3CY3A 4WA9A 4GKIA 3VBVA 3BQRA 4DEGA 5AV4A 4O22A 2PMNX 4K8AA 2JD5A 4C34A 2G15A 4C3FA 3GUBA 4BWXA 4JRVA 3H4JA 3I60A 4ID7A 2ZMDA 4AN3A 4CG9A 4FTKA 4WOVA 5GINE 5LVLA 5EDRA 1LUFA 4K18A 4TPTA 3K3JA 4IW0A 3BU5A 3NMUF 3BU3A 2O8YA 3HECA 4IC7A 3OFMA 4ARKA 2ZDTA 3ULZA 3MH3A 4I93A 5K0XA 5J5SA 4RA4A 2JBPA 2EUFB 5HESA 5KCVA 5C03A 4QRCA 5CEIA 3R0TA 3WF9A 4DEAA 4A9RA 3JY9A 3WE4A 3ALOA 4E93A 5JH6A 1QCFA 3HEGA 4HVGA 2AC3A 3RALA 4LOOA 5DVRA 4RA5A 5M4FA 2H9VA 4FOCA 3O8PA 1GZKA 3PWDA 4FIGA 3IGOA 4FV4A 5AR7A 1VEBA 4KS8A 4CQGA 4NZWB 4O81A 5H8EA 4ERWA 1W84A 4DEHA 1Q3WA 3R21A 4D0XA 4PNKA 3PY0A 5HTCA 2EXCX 4I41A 4CTBA 2PZRA 4E5BA 3FE3A 3OXZA 4NWMA 1S9JA 4C37A 4BIBA 3MDYA 3COKA 2C5VA 3QUDA 5CEOA 3R8LA 5E8YA 1G5SA 3POZA 4CT1A 4IADA 4XOZA 3QALE 2ITNA 3QRKA 5FEQA 3FL5A 4OLIA 3ZU7A 3BIZA 2OU7A 3ZUVA 4W4VA 4AW0A 3OCTA 5FBNC 2RKUA 2W5AA 3NUYA 5IA5A 5TR6A 2WTVA 4W4XA 5AUYA 3L8XA 1M17A 1ZOHA 4J8MA 4MXAA 3NPCA 3TUCA 4YGAA 3DTCA 5AUTA 5EYKA 4DG3E 3GC7A 4FVPA 4EL9A 2EXMA 2XP2A 5EW9A 1SM2A 4GEOA 4JBPA 4L7SA 4E6CA 3CD3A 4YJTA 3RZBA 4CKJA 5AUVA 4ZS0A 3BELA 3WF8A 1R78A 3TDWA 5IKWA 5C8MA 3EQDA 3UC3A 5LVNA 2C30A 4Y72A 5M4CA 2J4ZA 2W5BA 2X7OA 2YFXA 3DNEA 3Q96A 3OCSA 2C6LA 3Q9XA 4E3CA 1PYXA 4FTMA 4FV0A 3TG1A 1OGUA 3DKCA 2GDOA 1OL6A 3HRFA 3EWHA 1XH5A 4DYMA 2CKEA 3ZUTA 2V22A 3NYNA 2C3KA 5LVMA 4JBOA 4EWQA 3LZBA 3BWJA 5D1JA 4G3FA 3LFNA 3Q53A 3MIAA 5I5ZA 3CLYA 2NPQA 4G3EA 4CGAA 2PL0A 3CIKA 3Q4CA 5IEXA 2FSMX 5FTGA 2F7XE 2YLEA 4M12A 4CCUA 3KQ7A 3SX9A 5L6OA 3AT3A 4MXZA 2E9OA 2J5EA 2XBJA 5J79A 3TNPC 4QMQA 1ZOEA 1JKLA 1XJDA 4QMXA 2ETKA 1A06A 4C8BA 1YDSE 5BYZA 3H9RA 3UOJA 2BIYA 3FY2A 3LQ8A 5T68A 1PKGA 3ZO1A 3WYYA 2Z7SA 3F3VA 3FZRA 5JGDA 2R3OA 2BR1A 4RIWA 3ZS5A 1WZYA 1REJA 4CNHA 4F4PA 1YHSA 5CAPA 4QMZA 3OEFX 4ENXA 3D2KA 4C57A 3NEWA 2Y6MA 5CI6A 3GI3A 3ZM4A 4ZMFA 5LMKA 5HORA 1YWVA 2IW9A 3KKVA 2FSLX 4H1JA 1OVEA 4FUXA 3WZKA 5L2WA 3VRYA 2XF0A 4O96A 1PY5A 2QURA 4FTUA 4RIXA 5E1SA 2HWOA 4MNEA 4YTCA 3D94A 4QO9A 1WMKA 4X6RA 3LFFA 4MCVA 3TN8A 4AA4A 2PVMA 4AN9A 2HENA 5M55A 2OO8X 3D5VA 3LAUA 2YDIA 3QD0A 3IOPA 4CYIA 2IG7A 4I3ZA 3GU5A 3QRJA 1LR4A 1DM2A 2CSNA 1DS5A 5F4NA 4M13A 3IKAA 4DEDA 2KULA 4WNOA 4TWCA 3RK7A 5BNJA 1K9AA 2OH4A 1VYZA 4Q5EA 3C51A 1PW2A 5D7AA 1MQ4A 4IM0A 5FG8A 3E8DA 5KMIA 1X8BA 4HCTA 1GIHA 4IZ7A 4BDGA 4X2FA 4XG7A 4YUQA 4FV3A 3VIDA 2VRXA 4YZNA 1RQQA 5B2LA 2J5FA 3L8SA 2OSCA 3LFCA 3NYOA 5FDXA 2H96A 4WNMA 4BDCA 3U54A 2Q0NA 4FT7A 4E4NA 4RJ7A 5E90A 5FP6A 1BKXA 4NKSA 2PZ5A 4F0GA 1J7LA 2EXEA 2YIWA 1UU7A 3U6HA 2UV2A 3ORNA 4FKUA 4RWKA 3RNIA 3TUDA 3L9NA 2QOHA 5JGAA 5I9UA 5FP5A 5HIBA 1PYEA 3R8PA 4FT5A 4NCTC 1FBNA 4H1MA 3V6SA 2ITPA 4IVAA 3K5UA 2OFVA 3UODA 3VUDA 4I0RA 4QT1A 2E9VA 4L52A 4MF1A 4AQCA 2FA2A 3FSFA 5H3QA 4E8AA 3KXMA 3FLWA 5E8ZA 5KKRB 3W2OA 4QTEA 3FQSA 1Z5MA 2LAVA 1TQMA 2PVHA 2IZSA 3NVMB 3QAME 1JBPE 4JR3A 5AIKA 3FJQE 5CXZA 2PUNA 2YM3A 3M1SA 3VBTA 4QP2A 4B8LA 4DFBA 2BAJA 4L3JA 3PLAE 3W2SA 5BMSA 1GIJA 4TN6A 3C4XA 2ESMA 2GQSA 2OFUA 4FNWA 4FT9A 3E7OA 3FLZA 4G9RA 1GIIA 4LV5A 3NUXA 5F95A 5FM3A 4LL0A 5AP5A 2VX1A 3HL7A 3DCVA 2ZVAA 3VHKA 3G6HA 4YJVA 4OBQA 1KV2A 3FWQA 3K3IA 3DJ6A 2QG5A 5DHJA 2QOBA 4RJ5A 3LXKA 1ZYLA 3CKXA 4K0YA 5AR2A 1VZOA 4R5YA 1Q24A 3C0HA 1WBWA 4G31A 3D2IA 3JR1A 3UTOA 3LCSA 1CKPA 2GNFA 4ALVA 4HVHA 3NYVA 4J1RA 5KZ0A 5BVFA 4ZZOA 2B4SB 1M14A 1LP4A 5CF5A 1PXIA 2RFSA 2VWXA 4GSBA 4HOKA 1XH6A 3FZSA 2ZV9A 4RWJA 3PPKA 4A4XA 5CAUA 4JT3A 2RIOA 5AUZA 3ZDIA 3R63A 4BCOA 2BKKA 2P33A 5ITAA 1NY3A 4KIOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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