1NVQA

The complex structure of checkpoint kinase chk1/ucn-01
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
271
structure length
264
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structural Basis for Chk1 Inhibition by UCN-01
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 80
structure length 264
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1nvqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1nvqA01
2X9FA 1YXUA 4ANSA 4BZOA 2WFYA 4C02A 4K6ZA 4M7IA 2UVZA 3E3BX 2E9VA 2OIBA 4L6QA 2VD5A 4GH2A 4OTHA 5FM2A 4NK9A 3VJNA 4RWIA 5EFQA 3GXLA 4XLVA 3EN9A 4BKJA 1OL7A 3MA6A 4O7SA 1IEPA 4RX8A 2V7AA 3LCSA 3R73A 1ZMVA 2Y0AA 3L9NA 1RE8A 4C4GA 3MH0A 4LRMA 3QQJA 4I6QA 4FK3A 3R02A 3LCTA 2ETMA 2VWIA 5KE0A 3R9NA 1ZOHA 4O7LA 3GCUA 4NTTA 3V01A 3HP2A 5KBRA 4MH7A 5KMOA 4YU2A 1TKIA 4JRNA 4RA5A 4IFGA 3UVPA 2Y6OA 4BTFA 2QKRA 2J51A 4NIFA 4IE9A 2VO3A 3C4XA 3E88A 2HZ0A 4OW8A 1OUKA 3O51A 5CVFA 3RVGA 4FV4A 4BCJA 3MYGA 4J8MA 3LFBA 3A7IA 4FSQA 4QMNA 3FI3A 4D4SA 4IM0A 1R39A 2H6DA 3BLQA 1JNKA 2ZM1A 3NCGA 4WRSA 3BU3A 5CU4A 3TCPA 1I09A 5C8MA 2PMIA 5IA4A 2IVVA 3AC3A 1VEBA 4EOPA 3U51A 3PG3A 3QX4A 4G5PA 3R6XA 3VS7A 1ZARA 4QPSA 5DR2A 3O7LD 3E87A 3F9NA 4L7SA 4LGHA 1QL6A 3LVPA 4XLIA 5TR6A 3ZO2A 5HLNA 3CJGA 5JEBA 2R3NA 2RIOA 2WMBA 3NUXA 4RC3A 2W5AA 1ERKA 2YM7A 1JKSA 4G16A 2OFVA 4TW9A 5DRBA 4BDCA 3QUEA 4MKCA 4CFMA 4DEBA 3VIDA 2FSMX 2J6MA 2QD9A 4H05A 4PQNA 2B53A 2C6TA 4PL5A 1YWRA 3KQ7A 5FG8A 3ZC6A 5CEMA 3N51A 4O7TA 2XKFA 3VVHA 5AUTA 4RSSA 4C4JA 3Q6WA 2VWYA 3TIZA 3D14A 3VAPA 4DLJA 4E5BA 1UA2A 3UPXA 2I7QA 4ZLYA 1T46A 2HW7A 4YTHA 2IZRA 4YC3A 5HU9A 4W9WA 5LWNA 5HO6A 4QTDA 4MXZA 4D2PA 1IA9A 4PL3A 2RKUA 1PRYA 4I5MA 4QMOA 5F95A 4CCBA 1HCLA 2QVSE 4FSUA 4CMOA 2OKRA 3G9LX 2QKWB 2A27A 2C5OA 1KE7A 4IBMA 3BWFA 2JBPA 4C2VA 4JBPA 3BHVA 4R1YA 1WZYA 5CT0A 4A9UA 2NO3A 2QNJA 2VTLA 4AGUA 1IR3A 4FF8A 4TN6A 4UYNA 4CFFA 5KMKA 2W99B 4Y72A 5CXZA 2CKOA 2BZIB 4C35A 1I44A 2QOBA 4XG8A 4D2SA 1NVSA 3ZLWA 4HVIA 1LR4A 3FEGA 3IONA 3QTSA 4BN1A 3KMUA 3KRJA 3GP0A 4LQMA 1VR2A 4PP9A 3IG7A 2PY3A 4PDSA 1EH4A 2WQMA 4K0YA 4V01A 3ID6C 4XP3A 2JDOA 5I9UA 2PUIA 4BTJA 4WUNA 4ASDA 5TT7A 4CRSA 4D1ZA 4QT1A 4KSPA 4O2PA 1YHVA 4EH6A 5JQ5A 1V0BA 1JOWB 4V05A 4YJPA 4YLJA 2XIKA 5JQ8A 4BCNA 3WZKA 4X21A 4DBXA 3MGYA 4K33A 5CU6A 1KOBA 4UEUA 1GOLA 3GC8A 4E7WA 2UVXA 4JI9A 4P90A 1H27A 2C6EA 3OWJA 5JT2A 2ZOQA 3ZSHA 5K4JA 2F2CB 1WVWA 4GUEA 5M4FA 4QTAA 3ZFMA 3FQEA 2UVYA 3LQ3A 2J4ZA 3QTQA 4B7TA 4EH3A 3PXQA 1ZRZA 2RG6A 3FZSA 4KAOA 4L53A 4F7LA 5C8KA 1OB3A 4ARKA 1J3HA 3CD3A 5EK7A 3WI6A 3OT3A 5DGZA 1KE5A 1V0PA 4I5CA 3PLAE 3ALOA 1G8SA 4G6OA 4UZDA 3FYKX 2XNOA 4BCKA 5K5XA 3EWHA 4JS8A 3VHKA 4HGEA 4DBNA 2CPKE 2CKQA 4EBWA 4CV9A 2BIYA 1W83A 3MVHA 3EB0A 4AW0A 4QQ5A 4EZ3A 3FSKA 1MQBA 3LCKA 4FUXA 3QCXA 4PX6A 4WA9A 3ITZA 3L8SA 5B0XA 1JSVA 5FBNC 4HVHA 3R8VA 4O21A 3LFSA 3LLAA 2YWPA 3HP5A 4A4OA 2W7XA 4RJ8A 2IPXA 4CFUA 5I9YA 2YZLA 2C0OA 3FLZA 4I4EA 1NVRA 4BZDA 4EEVA 5I4NA 4FZDB 3R1NA 4YP8A 1SVGA 3UMWA 3BU5A 2YN8A 3BGZA 3NYXA 3QAME 3R71A 5GZ9A 5CENA 4DEEA 3MJ1A 4ERWA 1H1QA 5DR9A 3RTPA 4I0SA 1Z57A 2ESMA 5A14A 4EOJA 1YDTE 2WMAA 4FKQA 4FTCA 4J97A 4F70A 3UGCA 4C62A 4IC8A 4V04A 5D12A 3EJ1A 5I9ZA 3PVBA 2QI8A 3KRRA 1MRVA 4QYYA 4TNDA 1XBAA 4N6YA 4PMSA 3KF7A 4BL1A 3FI8A 2HXLA 5L8LA 4YNOA 3UOHA 2HY0A 3F82A 4X3FC 2C68A 4D28A 4IIRA 2R64A 1NA7A 4JIKA 3NX8A 3HA6A 3NYVA 3JVSA 3H30A 4GFOA 5HORA 4Q9ZA 2O5KA 1JSTA 2VWUA 3HGKA 3ENMA 3E63A 3OBJA 4HOKA 4IVAA 4UBAA 4D9UA 4BHZA 4ZJJA 1R0EA 5EM6A 1FVRA 4B99A 2VO6A 5FXQA 3ZFYA 4D2TA 1ZAOA 3IPHA 4BDAA 2BUJA 4PY1A 5C1QB 2R2PA 1PXIA 3CTHA 2FSTX 3E3PA 1DAYA 3AMYA 1H28A 3KXGA 5FD2A 4JR7A 3W2SA 5DT3A 3RAWA 4O86A 3EZRA 4II5A 3QRTA 4UY9A 5IEVA 3UIXA 5ITAA 5J7BA 2QOOA 3D0EA 3GCSA 3NCZA 4Y83A 5AR8A 3UO4A 2XUUA 5HD7A 3RJCA 3QRKA 3UVQA 4F9WA 4HCUA 4K18A 3GQIA 5AR3A 2NP8A 4GVJA 3GNIB 3VUTA 2C6KA 3TTJA 4K1BA 4Z55A 2XCKA 3LFEA 1J7LA 3GU6A 1CMKE 3KXNA 5HO8A 4FT5A 3WF9A 4Z7GA 2VWXA 3ZCLA 2W1GA 3QD4A 3IQ7A 2AUHA 3MSSA 1H0VA 3LE6A 3ENHA 3SXSA 3OUNB 4HW7A 5B2KA 3AT3A 4CFVA 2YJSA 2GTMA 1BI7A 4C59A 3BHHA 4DN5A 4U3YA 2ZYBA 3IOPA 4BDEA 1OPJA 5FXRA 4XBRA 1Q8UA 2BTRA 2EB3A 5KZIA 2XK9A 3V8SA 4NFMA 3ORKA 4BIDA 1BMKA 4B8MA 3F66A 3PSBA 3WF6A 4FBXA 2O8YA 4G3GA 4JBVA 5ICPA 3C1XA 4S30A 5CEKA 1GIHA 3WZEA 3TT0A 3OWLA 2PVMA 4YZ9A 5EW9A 4CZUA 3E62A 3I5NA 3TIYA 3R01A 2OH4A 4PWNA 4BCPA 4FKLA 4PV0A 1OMWA 2R5TA 4FT7A 3UO6A 5FTGA 5HOAA 2JKOA 2QQ7A 4M66A 4M68A 4DEIA 2HENA 3NUNA 5HCYA 3R2BA 3BU6A 5HQ0A 5G1XA 4ASEA 3GU7A 2XP2A 4O7WA 5EOBA 4DFYA 3GC0A 3VUDA 4FKUA 2YERA 4NU1A 1OPKA 3QTZA 4F4PA 3HECA 2QODA 4YJSA 4BCOA 2XA4A 3OBGA 2YM5A 4BWXA 5CSWA 4O1PA 3TJCA 5KX8A 2X8IA 1YXXA 4HYUA 5AUXA 2BKKA 3Q9XA 5IQBA 2WU7A 2YIXA 3NS9A 4I6BA 2X7FA 4KBKA 4RT7A 3RPOA 2CSNA 1S9JA 2ITQA 3DK6A 5AR2A 5IDNA 3W32A 3VBXA 2QOHA 4FG7A 5IMXA 1J1CA 3NIZA 3CEKA 3DBDA 3FXWA 5CQWA 4NKSA 5IDPA 3DKGA 3NNWA 5HBJA 1ZMWA 1KE6A 5AX9A 1OGUA 2ITWA 3PJCA 4GEOA 4ID7A 3W2CA 4ZLOA 2W4KA 3C50A 3BEGA 3ZFXA 3GFEA 4IHPA 3ERKA 1L3RE 4JIAA 2WOTA 4TL0A 3FKLA 3G6HA 5M08A 3FMJA 5ANJA 3CSVA 3M11A 3P23A 4DG0E 5JN2A 3FMNA 3GCVA 1CM8A 3EFKA 3SQQA 4AUAA 1B39A 3FWQA 4C3RA 5DVRA 4NYEA 5HIEA 4O7RA 1OBGA 4CTBA 3QZFA 2X2LA 4IDVA 5AIRA 3BV2A 4EWHA 5CVGA 4JX3A 5DFPA 3SW4A 4QQTA 4FTIA 3PJ3A 3QBNA 4YJQA 5AUVA 2A4LA 4C3PA 2P4IA 3Q4TA 2BFXA 2ZJWA 5IEYA 4BGGA 3PY3A 3LM0A 4E6DA 3CBLA 3DAEA 3A2CA 4IDTA 5EKNA 2OU7A 3R7GA 3MA3A 2VGPA 2WMTA 2J0KA 1O6LA 2XNMA 4XOZA 3ZYAA 5J9LA 1H4LA 4KINA 5M53A 3TJDA 2R9SA 3GFWA 2EXCX 4D5HA 2XJ2A 2WTJA 4MHAA 4M3QA 4WIHA 1YI4A 3AC1A 1MRYA 3PZHA 1XH4A 4FEUA 1W8CA 5LMBA 1V0OA 3VO3A 2OF2A 4GSBA 3NYOA 1Q5KA 4FV5A 1YKRA 3D15A 5D11A 4ZZNA 1ZZ2A 2B0QA 1XH6A 4GRBA 4J1RA 3DU8A 3A62A 4IAIA 2IVSA 4ZOGA 1JLUE 3FPMA 3LXLA 3A7GA 3F3UA 4FIFA 3O8TA 5AP4A 4QYHA 5EOLA 4G6NA 3IGGA 4LM5A 1YOMA 4HNFA 1FOTA 2A1AB 2NRUA 2P0CA 4EOQA 3DQWA 4YC6A 2KULA 2FA2A 2GSFA 3MH2A 3TNIA 5HCXA 2G15A 4HCTA 3UP7A 3FMKA 3R21A 3DJ6A 4CLJA 4NFNA 4ZP5A 5CANA 3DA6A 4FTAA 4K11A 3A7HA 3GCQA 2QLUA 2WZJA 1UNHA 3SD0A 4JXFA 4U40A 1AD5A 4ACCA 4CMTA 1ZOGA 4FTNA 5KUPA 3S0OA 1X8BA 3OMVA 1PJKA 2QR7A 4E4NA 3Q6UA 5HE2A 1K3AA 4I93A 3ZRLA 3FHRA 3A4OX 5C03A 4I41A 1YOJA 3PXZA 2A2AA 3ZH8A 4PMMA 1WBNA 5BUEA 4YURA 3UPZA 4DHFA 4GFGA 5CNNA 4EK8A 4AE6A 2QHMA 3MW1A 5HVYA 2UW0A 4ANMA 4I6HA 1WBSA 5EYMA 3C51A 3R7IA 4AZTA 3SRVB 4WG5A 4AT3A 3RINA 3OXTA 4DH1A 1GY3A 1Y6BA 4FNXA 3KCFA 3LAUA 4XBUA 4DA5A 2WIPA 3BRBA 5J1WA 2ETRA 5E1EA 2A0CX 5AP2A 4L67A 1DS5A 2O0UA 5HO7A 5HX6A 1XHAA 3ZC5A 4YHJA 4NWMA 4TYHB 5FRIA 4C57A 5IZFA 3TUDA 4O0RA 1KUTA 3R8MA 2B1PA 4JT3A 4FVPA 3ZXTA 2PVLA 1JPAA 4WT6A 3FY0A 3VS0A 5CSXA 5BX0A 3OOGA 4AACA 2XBJA 1E9HA 2JKQA 2VGOA 1VJYA 3EQIA 4RC4A 3VRZA 4AG8A 3SGCA 2QU6A 4G1WA 5HNGA 3NAXA 3HRCA 1JKKA 3MN3A 4PTCA 4RJ3A 5D1JA 1MRUA 3PRFA 4FOCA 5DNRA 4FVRA 4JG8A 1W7HA 3L9PA 4MAOA 1OKWA 3D2IA 1CKPA 1MQ4A 4J98A 5IH6A 4Y5HA 2G2FA 3GCPA 3I7BA 4N70A 4R5SA 1YHWA 2IW8A 5HVKA 5EI6A 4GL9A 4F99A 4JRVA 4EK4A 2XIYA 4NEUA 1PY5A 3A8XA 1PYXA 4HZSA 4QD6A 1WBWA 2JLDA 2VX3A 2VWBA 4CTCA 3VS6A 3ORXA 4WG3A 1JVPP 2B4SB 4IZYA 4XG3A 3ZEPA 2XRUA 2PZ5A 4DEAA 2PMNX 2X81A 4DGMA 1LEWA 4QP3A 3RHXA 3TEIA 4TWNA 2W4OA 3OF0A 4GT3A 5HEZA 3WZUA 2R7BA 2OJGA 2OI4X 4BGQA 4QPAA 3T9TA 3SA0A 3QD0A 3CCNA 4RLLA 4BY9E 2WO6A 3QWKA 5IPJA 5LMAA 4DGLC 5LQFA 3AMBA 5HG9A 3S3IA 4UN0C 4J8NA 3RBWA 5AP1A 5FEEA 5AWMA 4ALUA 3TDVA 4QMZA 4F1OA 4ORKA 4HGLA 3F2RA 2VX1A 1M2PA 2WQOA 3SOCA 3SRVA 4C2WA 4D2RA 4G3DA 1CKJA 5E1SA 3TZMA 3Q4UA 2BAQA 3R9OA 1JSUA 1E1XA 3FXZA 4RQVA 4C4FA 1OKVA 3GEQA 2XS0A 4TYHA 3RP9A 1ZYLA 2CGUA 4G9RA 4EONA 3FLSA 4UALA 5LWMA 2GQRA 3O0GA 4BCFA 2Y4PA 5LARA 3BX5A 3FSFA 2PZIA 3KRLA 2PE2A 5TOZA 2BILB 5IA3A 1RJBA 4U43A 4AW2A 5IUHA 1H24A 5A54A 3D5UA 4OLIA 4O7ZA 4M97A 5JFVA 2FUMA 1ZYJA 2JIVA 4DH3A 3LQ8A 4GMYA 5M57A 5DBXA 3KKVA 3PA5A 5AV4A 1HOWA 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