1OB3A

Structure of p. falciparum pfpk5
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
286
structure length
277
Chain Sequence
MEKYHGLEKIGEGTYGVVYKAQNNYGETFALKKIRLEKEDEGIPSTTIREISILKELKHSNIVKLYDVIHTKKRLVLVFEHLDQDLKKLLDVCEGGLESVTAKSFLLQLLNGIAYCHDRRVLHRDLKPQNLLINREGELKIADFGLARAFGIVTLWYRAPDVLMGSKKYSTTIDIWSVGCIFAEMVNGTPLFPGVSEADQLMRIFRILGTPNSKNWPNVTELPKYDPNFTVYEPLPWESFLKGLDESGIDLLSKMLKLDPNQRITAKQALEHAYFKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of P. Falciparum Pfpk5 Test the Cdk Regulation Paradigm and Suggest Mechanisms of Small Molecule Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 2 HOMOLOG
molecule tags Transferase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 77
structure length 277
sequence length 286
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1ob3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1ob3A01
2W99B 3ZXZA 5HE0A 1ZZ2A 5IA2A 4H1JA 4FKVA 3GCUA 2JIVA 4RA5A 5I9VA 4JAIA 3HUBA 3QYWA 4EOSA 2C68A 3GEQA 2X2MA 4YZCA 3SOAA 5EW8A 3ZO3A 4FSUA 1U46A 2I6LA 2OZAB 3BZ3A 2VTHA 2BAKA 1WAKA 4BKYA 4CZUA 1G8AA 3TJCA 4QP3A 4RJ4A 4X2JA 5AP0A 2C69A 3OTUA 3VUMA 4BCNA 5JRQA 4R7HA 2W5AA 4BDAA 1J7LA 4IMYA 3R01A 4PMTA 5IQIA 4C0TA 4DITA 3QA0A 3VBWA 3PY1A 4JX3A 5CLPA 3R8ZA 3MV5A 5FXSA 3RHXA 4AW5A 3UG2A 2HXQA 4MAOA 5HIBA 2JD5A 4NIFA 4I94A 3ULIA 4CCUA 4AOTA 2BTRA 4EK6A 3BHHA 3UQCA 4QMZA 2ZVAA 1OKYA 4FKWA 4HYIA 5J7HA 4X3FC 5EYMA 3ZC6A 3HZTA 3VUKA 4H1MA 5IA5A 2XNPA 5L6PA 1RW8A 2E9OA 3R83A 2O2UA 4DEDA 5IU2A 2QNJA 5CU0A 3VJNA 4V05A 4OT5A 3QTQA 5CEKA 2W1IA 1K9AA 4QQTA 3VJOA 4I22A 2R4BA 4MXOA 4BVUA 3QQUA 2CCHA 2ZM4A 4GMYA 2ZB0A 5HNBA 4RLLA 3KRWA 4AX8A 2BRGA 1ZYDA 3BQRA 2J0JA 3F82A 3AD6A 3IKAA 3MN3A 4RGJA 2IW8A 2W4OA 3BELA 2HWOA 3F7WA 4DLIA 5HI2A 3LXLA 4ORKA 4EL9A 5HHWA 4EK3A 3SKCA 5I5ZA 1CKIA 1VJYA 3D14A 2DQ7X 3CR0A 1M2PA 5KNJA 3CXWA 3Q32A 5GJGA 2YN8A 5EM6A 2IVTA 4HVIA 3HAVA 3A8XA 1JQHA 2WOTA 3ZM4A 3QQFA 4FKTA 3Q9WA 4NIFB 2WU6A 2YDKA 4OTGA 5CTPA 3TIYA 2YDJA 4GK4A 4YJQA 4QMOA 1DI9A 1FMOE 1Q5KA 4FKRA 4RWIA 5E8YA 4QT1A 3R6XA 4FZFB 3MH1A 2IO6A 3AC2A 3MH0A 3KRLA 3VQHA 1PHKA 3EWHA 3PVUA 3WE4A 4IWQA 4WOVA 3QKLA 5AUWA 1URCA 2HY81 5KHXA 2B0QA 2JKMA 4FTIA 1ZMVA 2B54A 4ASDA 3QTSA 3DK7A 3HYHA 2ZMDA 4JDIA 4DEHA 3NW6A 3QQKA 5HE3A 4F6WA 2CNVA 2BZIB 2HCKA 3QD2B 3KXNA 4IAAA 4O91A 4OUCA 2O63A 4RIYA 4Y85A 2QO7A 5D11A 3AOXA 2UZVA 4DEGA 3R73A 4AW2A 5K4JA 2VTIA 2QR7A 3UIBA 2PVYA 3TZ7A 4YHJA 3WF7A 1XBBA 3FMNA 3MJ1A 3TM0A 1OM1A 3W2CA 4DE4A 4FICA 3BIZA 3PIYA 4UWYA 4J52A 2Q0BA 3K5VA 4G9CA 3Q5ZA 3WZEA 3MPMA 4CTCA 1SVHA 5ANJA 1OB3A 4KIOA 1BL6A 3R7YA 2ITYA 3QFVA 2I0YA 1F0QA 3EQHA 3HA8A 5BQ0A 2CKQA 4EHZA 1FVVA 2H6DA 5E1EA 2WQEA 1PJKA 4G6LA 5JN2A 2PUPA 4OTFA 3R8MA 4TTHB 3Q4CA 4OTRA 4WUAA 3GBZA 5HIEA 5IQFA 4GCJA 5FXRA 5A9UA 3ORKA 4ERKA 5HU3A 2ZMCA 4JRVA 3HRFA 3OVVA 3PVBA 4ITHA 4JBOA 4BRXA 3TUDA 3EJ1A 5FWKK 2PU8A 4AFEA 3R0TA 4FYOA 5EM8A 4QMYA 4WRGA 1UV5A 1XKKA 2HWPA 4JR7A 4XG7A 3MFUA 4AA4A 3NAYA 4KKGA 3QC9A 4JXFA 1YI4A 3O51A 4XH6A 4FSZA 1JNKA 2PK9A 3UC3A 4EBVA 1JPAA 5J9ZA 1XH9A 2OICA 4L68A 5F9EA 3QA8A 4YLKA 5CZIA 3IW4A 4P5ZA 3W16A 3GNIB 4UY9A 4HOKA 2V55A 3C4FA 3JPVA 3MVJA 5AUYA 2QONA 1B39A 5AP7A 4IM2A 2IJMA 4FZ7A 4MH7A 3CP9A 3GENA 1JSTA 4M0ZA 3TG1A 4NUSA 4ZTRA 4NCTA 3ZEPA 5HTCA 4FTUA 4MNEA 3EYGA 3COIA 4QYYA 4PP9A 3PUPA 2JDVA 3H10A 4F1TA 4F7SA 2I40A 4ANSA 4EK5A 5GNKA 2V7AA 4FSNA 5M44A 2A2AA 3MWUA 3BV2A 4RWJA 4O84A 4EH9A 3NYXA 3SOCA 3II5A 2PSQA 3W32A 3L9NA 3BYUA 4S33A 5DNRA 4G9RA 1H1RA 2UVZA 5H2UA 3Q6UA 3ZS5A 4F63A 5T3QA 3EFKA 2PHKA 4HVSA 1REKA 2XK9A 2XNNA 4FSWA 4A4XA 3DNDA 4KBCA 3CQEA 5AX3A 1GIHA 2CMWA 1UNHA 3OUKA 2OJJA 3C5UA 3LOKA 3SRVA 2PMOX 2CHLA 3SX9A 3AMAA 4BTMA 5AUXA 3FLQA 2R3LA 1Q8WA 5AAFA 2UW6A 2C6EA 3Q4UA 4H3QA 3U4WA 4XRJA 3WZUA 4JNWA 4WKQA 1SNXA 3MIAA 2XEYA 3F3VA 3PZHA 5AP3A 2F7XE 2VO3A 4X3FA 2DUVA 1NY3A 2GCDA 2R64A 3HDNA 1CKJA 4ZTMA 5CI6A 5FQDC 3DGKA 3GVUA 4ACCA 1IRKA 4HGLA 3EQPA 4BGHA 4APCA 5IQAA 3W2PA 4XG4A 2BDFA 4IZAA 2FGIA 4Y5HA 3BPRA 3FQHA 3DT1A 4DH1A 4XG2A 5BVEA 3ZUUA 4MXAA 4OGRA 1H1PA 2JBPA 5AUVA 3F2RA 2A4LA 3LMGA 3QXOA 3UVPA 1MRYA 1JKLA 4XUFA 1STCE 4K11A 5LVMA 3FMKA 3FY0A 4FTNA 4CSVA 4I93A 2G9XA 4GU6A 4KIPA 3SRVB 4CYIA 3QWKA 1PXOA 2AC3A 1UNGA 4X2KA 1LUFA 3OCBA 4ZTHA 1V0BA 4PNIA 3FYJX 3NVMB 1OVEA 3CCNA 3D2IA 4QMSA 1JKSA 4G1WA 4D2VA 2UZNA 3ZZWA 3OWJA 4E8AA 2QODA 3NUXA 1M14A 3WE8A 4DGMA 1L8TA 5IQDA 2ZV7A 2VWUA 4FV5A 5CU4A 2E9NA 3COKA 4XS2A 4NM5A 2P55A 5EK7A 4X3FB 3R2YA 2W1FA 3ACJA 3WILA 5D41A 1CTPE 1Q8YA 2QLUA 2W0JA 5I9ZA 4OTWA 3SDJA 2ETRA 4XOYA 2UZEA 2BVAA 3BWFA 4E6CA 2XNEA 2NRUA 2PY3A 3ALNA 3DTCA 3O50A 3R8PA 2XCKA 4CMOA 1WBTA 2W1GA 2YIXA 1IASA 4QMLA 4U6RA 5J9LA 1A48A 5GIPE 4Y73A 5LARA 3VHKA 4FC0A 1H1WA 4MTAA 4K6ZA 2IVVA 4FV9A 4DEIA 4DTBA 1L3RE 4CYJA 1F3MC 2JDOA 2F49A 2VX3A 1H1QA 3FPMA 3FQSA 4WG4A 1YHWA 5HLPA 4ANQA 4C3FA 1OL1A 3G9NA 3DQXA 4ZZMA 5FEDA 4J53A 1OKZA 3K3IA 4X7QA 5KKRC 2PVNA 2QHNA 1B38A 3D9VA 4IX4A 3VUIA 3BKBA 3TV7A 1YDSE 3IO7A 3S95A 2PYWA 3DQWA 3DK3A 5HLWA 2CDZA 3FAAA 2PULA 2RFSA 2ITZA 3DOGA 2ERKA 5L2QA 1MUOA 4GT3A 4PPCA 2VTPA 3KQ7A 4XV9A 3DFAA 3FPQA 4FTLA 4FTOA 4X21A 4BR3A 1S9IA 2HELA 4OR5A 4P7EA 5M06A 2PE0A 1O9UA 4BF2A 4BY9E 5ITAA 1A9UA 4D9UA 2UZUE 3QXPA 5B0XA 3GU8A 4OBOA 2J0LA 4DGOA 1GZOA 3HV5A 4I6FA 2UZLA 5JSMA 4II5A 4XBUA 2O5KA 2XIZA 4MBJA 4XP3A 5CASA 4XX9A 2WMUA 3ITZA 4IQ6A 2XZSA 3FZPA 3MPTA 3F2AA 4RQVA 4XNEA 5J79A 5M56A 2CNUA 4F08A 5DVRA 2XH5A 5CT0A 4N57A 3TNPC 1IA9A 3NUAA 5HX8A 3TWJA 2UZDA 1FOTA 4L53A 4P2KA 4YJVA 3RCDA 2QOBA 2G01A 3OXZA 2CCIA 3WZDA 4G3EA 4RC2A 5IUHA 5JGBA 4QP2A 2AC5A 4TYEA 4QD6A 4EHVA 5BVDA 3C4CA 1JVPP 3RPYA 5IQHA 3VW6A 2R3OA 3R1SA 4M84A 4HVDA 5FP5A 3C4WA 3FHIA 2YIWA 5JK3A 4LGHA 1G3NA 1LP4A 2Z7RA 4NK9A 1JKKA 4BDIA 3P23A 4CG8A 1WBNA 2B9FA 4HGEA 4E5AX 3DKFA 3E63A 3QKMA 3TNHA 4NSTA 4FTRA 2YWPA 3W18A 4A07A 2VGPA 3E3PA 3GC9A 5TR6A 2GS7A 3NNUA 4HZSA 4PDPA 3NAXA 4DGLC 3EMGA 3DXNA 4IC8A 1UNLA 4XV3A 4XV1A 2VTJA 5M07A 4D4RA 3OF0A 4IHPA 4LV5A 3BGZA 5L2WA 4L42A 4EHEA 4EUUA 5L6OA 4U44A 4CKRA 2OZOA 2BZKB 2QKWB 4MQ2A 1J7UA 2G2IA 3A99A 3THBA 4FK3A 2X9FA 5HBJA 1PMNA 3E8EA 3DFCB 4BWPA 3HDMA 1GJOA 1ZAOA 3OHTA 4EONA 2OFVA 2C30A 3F3UA 2VZ6A 4IWDA 3BU5A 4FIFA 4ZP5A 3MESA 4TNBA 2OBJA 3BHYA 3GQIA 4FNYA 1TKIA 1OIUA 4YNEA 5CVGA 3DKOA 3SXRA 2CGWA 4B6LA 4NTSA 4D5HA 4DFUA 3HGKA 5BVNA 3Q4TA 1Y6AA 3UPZA 5CXHA 5K0KA 4LMUA 3UIMA 5LOHA 2EXEA 4RX5A 3PPKA 4RFMA 3DBFA 4W4WA 4WHZA 4EOPA 3IW5A 2UVYA 3LXKA 2ZV2A 3QX4A 4W9WA 1W82A 2XP2A 3A8WA 2E2BA 3VS0A 3ODZX 3MTLA 3F9NA 5C27A 3QL8A 4ZY4A 3L9PA 1PRYA 1PY5A 3EQDA 3V6RA 2ETMA 4QOXA 2OJFE 3F88A 3LFFA 4ANLA 3R30A 4FNWA 4FGBA 3FLYA 2YM5A 4DT9A 3LCKA 4USDA 4RVLA 4I24A 4EC8A 2HK5A 3PTGA 3HP5A 3W8LA 4DFZE 4IVDA 2X2KA 5BVFA 2BRBA 3FZRA 4BDJA 3BLQA 2XKDA 4JJRA 1OBDA 4BL1A 5AM6A 4CRLA 4TXCA 2XRUA 1I44A 1V1KA 4PMMA 4C3PA 5EFQA 1FVTA 3EQFA 2X1NA 2JAMA 3Q9XA 4QYHA 5I4NA 4BYIA 3L8SA 1P2AA 3QGWA 2PWLA 3ORPA 4GT5A 5AV0A 4A4OA 2WTDA 4M69A 2B52A 3KK9A 2JKQA 4X3JA 2YIRA 1Z5MA 4E4LA 3IS5A 4G5PA 3FQEA 4JBPA 5IUIA 4J98A 5M57A 2PZYA 4LM5A 4JLCA 4KINA 4DEBA 3ORZA 2G15A 3CBLA 5IA4A 1XR1A 1MRUA 3CKWA 3NIEA 4UMPA 3A60A 4XP2A 5E8SA 2VWYA 1UU3A 3T9TA 2WTIA 4USEA 1Q8ZA 1OL6A 1TQIA 4PQNA 3VBYA 1QMZA 3KXXA 2VWIA 2VTTA 2BDWA 2J0MB 4EOQA 3Q52A 3FLWA 3CTQA 3HP2A 4KRCA 3NVKI 3MFTA 4EUTA 4YBJA 2WAJA 1Q8UA 3EQBA 4FKOA 4PNKA 2R3PA 2H96A 4ASEA 3R7IA 3T3UA 5DR2A 4FEXA 4O2ZA 3IECA 4YU2A 4UX9A 4O81A 2GQGA 2QOOA 4I0SA 4MBIA 3OG7A 4PUZA 3T9IA 3PY0A 3O0GA 4DCEA 4WT6A 4GSBA 3ULZA 3RZFA 3R2BA 3SD0A 5ICPA 5CSPA 4LFIA 2EXCX 3G90X 1NA7A 5JFXA 4D0XA 2HY0A 5AUUA 1H8FA 5CF4A 3G5DA 2WMBA 3BI6A 2ZYBA 1ZLTA 2JITA 2XK8A 3GCVA 4J1RA 5DYJA 1FMKA 1M2QA 4J95A 4FODA 1W8CA 3BU3A 3REPA 2GPHA 4AG8A 4OAVB 4R77A 3SG9A 3OFMA 2XS0A 3NW5A 3QRIA 4FT7A 4ACGA 4O7VA 4BCKA 3LFQA 4FSMA 2IZRA 1OIRA 3PE1A 1YOMA 3QZFA 3DJ7A 2A0CX 1FGKA 2OK1A 3PSDA 2OF4A 2XNMA 5D9HA 4PTEA 3VS5A 5AP5A 5JGDA 5T68A 2W9ZB 3UQFA 3VRZA 4UMQA 2PMIA 4AGCA 5CXZA 2VGOA 4Z9LA 1ZZLA 4RT7A 5KKRB 4R78A 2QD9A 3QU0A 4R1VA 5FXQA 3DNEA 5D7AA 4Q5HA 2B1PA 1YXSA 3D5UA 1HOWA 2CGUA 4PY1A 2B7AA 3BX5A 3MSSA 5KHWA 2KULA 4LGDA 4ZJJA 4IAKA 2UW7A 3EN5A 4PF4A 3B2TA 3M42A 4JOAA 2EXMA 2JFLA 5L4QA 1LR4A 4IADA 4KSQA 4Q9ZA 1QL6A 4BIDA 1RJBA 3UZPA 2H9VA 4ENXA 5HZNA 4TWOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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