1OKVA

Cyclin a binding groove inhibitor h-arg-arg-leu-ile-phe-nh2
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights Into Cyclin Groove Recognition. Complex Crystal Structures and Inhibitor Design Through Ligand Exchange
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 295
sequence length 295
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1okvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1okvA01
3KXXA 3DTWA 3ZCLA 5KO1A 3DXQA 2ZAZA 4QP6A 2G1TA 1XHAA 2ZM3A 4U43A 3LQ3A 4ZS4A 2LGCA 2XJ2A 4YJSA 1JNKA 4X6RA 3CJGA 3QRIA 3UE4A 3PXYA 2A4LA 1F5QA 4GK2A 3V5TA 1V0BA 2JBPA 2VN9A 5AP2A 1IA8A 4AZTA 5FD2A 2XKEA 4Q2AA 3R9NA 2JBOA 5EDPA 3EQRA 4YJVA 4W9WA 5AR4A 3ZC6A 5AA8A 2QHMA 3WF8A 4ZK5A 4G17A 2B9JA 2WMWA 3U8WA 1ZYJA 3ROCA 3AMBA 3VW6A 5I9YA 3DK3A 3QWKA 2BAJA 2CDZA 4BKYA 2YLFA 3SGCA 4JBPA 3O7LB 4LGGA 4BI0A 2OH0E 4G9CA 3EKNA 5AP3A 4ZTNA 4ZSLA 3A62A 5H8EA 3BU3A 5HBJA 4YJTA 5AUZA 4FG7A 5EW9A 3R8MA 3E7VA 4O7RA 4I4EA 1SVGA 4JT3A 3RJCA 3TZMA 3SV0A 1GIHA 2XUUA 2QKRA 2RFNA 4MXCA 4NJ3A 4NW5A 5E1EA 3S95A 2Y4IB 3NUUA 4HGSA 4LUDA 2H8HA 4XNEA 5IUGA 2O2UA 2V62A 4NKSA 3VHKA 3C13A 3BYVA 2J0IA 3E64A 4OBQA 4C38A 4C3RA 4E7WA 4DGNA 4DH8A 4Q9SA 4BVUA 2QLUA 1LEWA 4BCMA 2XNNA 3IK3A 2JKKA 2VTRA 2G01A 2B52A 2XNMA 2AYPA 4UXLA 4X6QC 5CAQA 5F9EA 2WTIA 5T68A 4PX6A 3G6HA 4FKSA 4XG3A 2EXMA 4EZ3A 5M57A 4RA4A 3OBJA 4L9IA 4CT2A 4QP3A 3ORKA 2UW4A 2ZDTA 3BBTB 5CTPA 4E26A 2REIA 4AGUA 3DT1A 4A9SA 2X9FA 3FZ1A 3PVGA 4CZTA 1ZYSA 2YJRA 3ZUTA 5J7BA 2J4ZA 4FOCA 1H1QA 4DG3E 1ZY5A 3UZRA 1OI9A 3OC1A 3FYJX 3BIZA 3I7CA 3NWWA 3R83A 5LQFA 2WB8A 2FVDA 2GNHA 3QXOA 3S4QA 5ANEA 4OTRA 5D10A 4S31A 4HJOA 3R9DA 5M4CA 3BYMA 2P0CA 4L53A 1B38A 1UA2A 3LIJA 4Q5EA 5DA3A 2CGVA 3QKKA 4BHNA 4WSQA 2OBJA 3BBWA 4GVJA 4JIAA 3IW8A 3GCQA 3BQCA 4G34A 4NTTA 4BCIA 4PDYA 4RJ4A 4WG4A 3R1YA 4LI5A 5FDXA 3MH1A 4UMQA 2W5BA 4GUEA 4I0TA 4RJ7A 5EYDA 3SX9A 4AOTA 4F9AA 2UW7A 3VBYA 4M7IA 2GFCA 3D2IA 1ZMUA 1ZZ2A 4KABA 1P2AA 5IKWA 2R3GA 3KULA 4NZWB 3RGFA 4O7WA 2YFXA 2VTPA 1OECA 1HOWA 3COMA 2ZJWA 3BV2A 4U0IA 3VBQA 3BKBA 1GZKA 1KOAA 3TXOA 3D15A 4NKAA 1ZAOA 4BDKA 3VNTA 2QONA 4GG7A 3FKLA 3BWJA 1VR2A 1CKJA 1B6CB 3FI2A 1BLXA 3R6XA 4J7BA 4U7ZA 4F6SA 2OGVA 3CC6A 5IUIA 3EWHA 2XP2A 4WNKA 5EH0A 3Q4TA 2VWUA 4IW0A 4P2KA 5HU9A 2ZB0A 4BTJA 4UV0A 3QAME 2PMOX 1KE9A 3D5XA 3FJQE 4AE9A 1IASA 3IQ7A 4XLIA 3QHWA 2C5OA 1PXNA 4UWCA 5JKGA 2CSNA 3E88A 3LCSA 3B8QA 3MN3A 2PK9A 3DB6A 4FBXA 3SLSA 3KF4A 4UWBA 2ZMCA 2YIWA 4S32A 3K2LA 4K77A 3RPOA 3VS0A 4IVCA 3KY2A 5HOAA 3ZS5A 2CJMA 3W8LA 5DRDA 5LWMA 2Q83A 4O86A 3GQLA 4IMYA 1XH7A 1BI8A 2Y9QA 4PTGA 4RC3A 3D2KA 4TL0A 5H9BA 4KIKB 5KUPA 2WIPA 4GK4A 2XNGA 1OIQA 3R21A 5ICPA 3U54A 1A06A 4F7SA 5B2KA 2HXLA 3Q32A 3W18A 4DGLC 2GNJA 3WE8A 3QCSA 4KKHA 4IAIA 5KKRC 3DJ6A 2W05A 4K18A 2G15A 5E4HA 4TT7A 4W8DA 3R7GA 4Z16A 1OL7A 4OTFA 4EQCA 4YSJA 5D7AA 5M07A 3VF9A 1BX6A 3C4XA 4LGHA 4TYJA 5CNOA 3VW8A 4JNWA 3K5VA 5LVPA 2VRXA 5HZNA 2F7ZE 2JEDA 4YMJA 2J2IB 3PP0A 4PMSA 4JOAA 3SDJA 4YJOA 4UY9A 1H08A 3U51A 4ASZA 4NM3A 1UVRA 5C01A 2ITQA 4LMUA 4DFYA 4O2ZA 4YO6A 3KXMA 2J6MA 2EB2A 4HPUE 3BI6A 4IZYA 2W4JA 3RCDA 5HG8A 4MXZA 3M11A 2QOHA 3PWYA 4M67A 4DTKA 4UMUA 2WAJA 4BKZA 1YXVA 3TG1A 4F7JA 2W4OA 4JI9A 3V8SA 1H0VA 3CIKA 4EHVA 2V55A 2DQ7X 4KBAA 5BVNA 4QPSA 2VU3A 4D1SA 2BZJA 2WQEA 4WBOA 3VULA 2XVDA 4YNEA 4QTEA 5L8LA 2QODA 5KKRB 3FEGA 2W5AA 3DDQA 4XV9A 3KMWA 1NVSA 2R5TA 4BR3A 4FKQA 5JZNA 3DLSA 3G9NA 4UZHA 5HE0A 2XK8A 2YAAA 3FZOA 3UO6A 1OIYA 3AC2A 3C4CA 2OZAA 4C62A 4A9RA 3BGZA 1OL1A 3F5PA 2HXQA 2JLDA 4ZIMA 4KIQA 4GK3A 4KD1A 4QMXA 4MXYA 1DM2A 4I6BA 1JSUA 4MVFA 4PF4A 3LLTA 2PVJA 2CGXA 4CYIA 3PXRA 2W4KA 4O1PA 4CFXA 4JBVA 1Q3WA 2BALA 3OF0A 4FIGA 4YPSA 3IKAA 2ITPA 4F4PA 2GHLA 1P5EA 2P3GX 3GUBA 3HZTA 4AW0A 4E4MA 5HLNA 3R8ZA 5L2IA 3G9LX 2RL5A 5DT4A 5A4QA 4ZY4A 3ZRMA 1XBBA 5AAGA 1M2QA 4EZ7A 4QNAA 2BAQA 5ANOA 3KB7A 3OTUA 4EZ5A 3IONA 3UJGA 2B55A 4D9TA 3Q3BA 1J91A 1X8BA 2RFDA 2X8EA 4A4OA 4WT6A 3QGWA 3OG7A 4W4XA 4YTCA 4QTBA 4EI4A 5HE1A 3EQPA 3BLHA 3F82A 4HW7A 3UBDA 1ZLTA 4C3PA 1LPUA 3LXKA 4G3DA 5FQDC 3CP9A 5L6OA 3EQIA 3FY0A 3FWQA 3MYGA 4MEDA 5K0XA 5DG5A 4UWYA 4G3CA 4JQ7A 5CXZA 1HCKA 2Z7RA 3H10A 3MFUA 4OTHA 1ZARA 4KSQA 5FGKA 2YAKA 4LYNA 2CCIA 2JIUA 3AC5A 3E8NA 2X1NA 3PFQA 4XP0A 1PMUA 2X2LA 4RWJA 2QOLA 4BI1A 3C4EA 4L3LA 5BMMA 4OTGA 4BL1A 2J0MB 3A60A 4X3JA 5DE2A 2GNFA 4OTIA 2VTNA 5CQUA 5E8TA 4D4YA 5BX0A 4ONAA 5LMBA 3Q96A 2IPXA 3DBDA 4X2NA 5EDQA 5JT2A 1Q24A 4CFMA 5C26A 2R3PA 3NIZA 4I21A 3FLWA 1FPUA 1KE8A 3HV4A 3CY2A 3N51A 3GOKA 3Q52A 2X39A 3PDTA 3UG1A 1UKIA 3QTZA 4PRJA 4YURA 3PIXA 3SXSA 1XBCA 2HWOA 2VO0A 2VTIA 4IX4A 3UOHA 4FSYA 2OJGA 5HEZA 4J95A 3DAKA 3LFNA 5CANA 2XBJA 4BBMA 4PMMA 4O91A 4QO9A 3DFCB 3PY1A 4GMYA 1L3RE 4DG2E 2OI4X 3FSKA 3V6RA 4XEYA 4K9YA 4TXCA 1J7IA 4RWIA 1J1BA 4QMUA 4QYEA 2YITA 2OIQA 3A7FA 2XNPA 3H0YA 4IAYA 5BMSA 5FXSA 4R1VA 5CAVA 5IEVA 5D7VA 4EHZA 2I0VA 1U54A 3COIA 3RZBA 4K1BA 2OJIA 4NW6A 3L1SA 5I9VA 2PVLA 2RKUA 2UW3A 3JPVA 1H25A 2QNJA 3PRFA 2QVSE 4QPAA 3TWJA 3LCTA 5KMMA 4L7SA 2BCJA 4EC8A 4YLJA 4ZS0A 2QO2A 3GCVA 3CGOA 1YOMA 4RPVA 1VYWA 1YXTA 2GQGA 2VWIA 5KMOA 2BIKB 1ND4A 3CTJA 2G2HA 5DBXA 4RVKA 4FEUA 4I5PA 4ZMFA 2C6EA 4AE6A 4CVAA 3F5XA 3DK7A 2ZV2A 4IQ6A 4RIYA 2GFSA 2WQBA 2EUFB 2XK4A 3KEXA 4QYHA 4CRSA 2GPHA 5CF4A 3NAYA 2R3LA 4HYIA 4ANMA 2PE2A 3TKIA 4PTEA 3VUKA 2IVVA 4O84A 4JG7A 3RNIA 2UW0A 3ODZX 4IVAA 4UEUA 4EOMA 3ODYX 3RHKA 3Q04A 4IHPA 2IZSA 1H07A 2ZM4A 1SVEA 5ANGA 3ACJA 4M8TA 4IDVA 2YDKA 3C4ZA 4TY1A 3ZDUA 4ANNA 3DBCA 4GUBA 4D1XA 1BL6A 4I6HA 3LFQA 2DUVA 4KRDA 4APCA 5ANDA 2WXVA 4ANBA 5C4KA 3QBNA 3LCKA 3QQUA 3KXZA 3I5NA 5C9CA 4AN2A 3UPXA 3I4BA 4F1TA 4IAFA 1U4DA 1OB3A 2GNLA 3HRBA 2OF2A 4KKEA 4OTDA 4QP4A 3LJ0A 3N4VA 5EHYA 1OIRA 4PDSA 4DE4A 4FT9A 4HNFA 5D11A 1UKHA 4L00A 3QCYA 4O6EA 3ZM9A 4BTMA 3JVRA 3ANRA 4QQTA 3R71A 2CLXA 2W1IA 2OO8X 4PP7A 1OBDA 4FV9A 3K3IA 5EHLA 3FPMA 4EC9A 4DFBA 2BZKB 3G51A 2XNOA 2C5XA 3OWPA 3QZHA 3RVGA 1CMKE 4QP7A 3MS9A 3FKOA 3H4JA 4TNBA 3W10A 4H1MA 5EW3A 2PY3A 3TDVA 2W5HA 3GBZA 3PJ3A 1KE7A 3PVBA 4PQNA 3HP2A 4C4FA 3UMXA 5M08A 5CSXA 3ZUUA 1Z5MA 5JN2A 4IX3A 3HA8A 4Y83A 5EI2A 3A61A 2OW3A 3DB8A 4AN9A 5L6PA 4ASXA 2JD5A 4NU1A 2VWVA 5EM6A 4PDPA 5D1JA 3A7GA 2RSVA 4EEVA 2QG5A 1XJDA 4YJQA 2PHKA 1OL2A 1NY3A 2B7AA 2W17A 1VEBA 4YPDA 5AP4A 3ZU7A 5KMKA 3LM0A 4CD0A 4EBVA 2QOBA 4DINA 2JC6A 4O7VA 4O7NA 4GJ3A 2RIOA 5L2TA 2X8DA 4MXOA 4E6AA 2C0TA 2BILB 4Y95A 4BDIA 5FEEA 3IDCA 4YGAA 4GKIA 3ATTA 2Z2WA 2X2KA 3QRKA 3VS2A 4II5A 2IJMA 2XS0A 4PMPA 4EH6A 1RE8A 4HVGA 4QMTA 1TQMA 4O7LA 4NFNA 3ATSA 3OWJA 4IWDA 3D9VA 2VX0A 4FKJA 4AN3A 3CS9A 3EQGA 4G1WA 3U6JA 5BUIA 3DJ5A 5I9WA 1MRYA 4O22A 2YIRA 4D0WA 4EL9A 3FI8A 2VNYA 3G0FA 3MA6A 4QP8A 2PZYA 4R7HA 4ZTLA 3GC9A 4I20A 3TTJA 4JG8A 4FKLA 4JAJA 1WBTA 2C6TA 4F08A 2ZDUA 4R8QA 4CRLA 2IVUA 5G6VA 4MQ2A 1G8SA 3NUNA 4KIPA 4R7IA 1TVOA 5JFWA 4ZSGA 1NW1A 4QQJA 5HX8A 3ZXTA 3TI1A 4XG2A 3UZPA 4UN0C 2QO7A 3EH9A 2C3KA 1XH8A 5KZ0A 3R8UA 2WU7A 4AU8A 4I0RA 5JSMA 2R3IA 1E1VA 3KA0A 3CXWA 4FSWA 4B9DA 5CEPA 1LR4A 1W83A 3PXFA 2FSLX 1Q4LA 3SRVA 3I7BA 1O6LA 5HVKA 4E6CA 4QTAA 1VZOA 5E8SA 1JLUE 4FTUA 5L2WA 3DNEA 3B2TA 4I41A 5IQAA 4CNHA 3KXNA 3R9OA 4AZEA 5HD4A 4DTAA 3GCPA 1WMKA 5FM2A 4MBLA 5CF8A 3H0ZA 4NM7A 3DGKA 3LQ5A 2W1CA 2OLCA 1OKYA 5ETCA 3ZSHA 4ZSAA 5CEOA 3LPBA 4UMTA 4R77A 5HG5A 3BWFA 5IZFA 2PYWA 1M7QA 4CYJA 4IWQA 3U6IA 2ETMA 3D94A 3EN5A 4EQUA 4LUEA 3W2CA 4ERKA 1H00A 4M14A 4UMRA 3CTQA 3VF8A 3A4OX 4LRKA 3OHTA 4IANA 4XV2A 3W1FA 2BR1A 1ZYLA 5CZIA 3PZEA 3HDMA 5K4JA 4X2JA 1U59A 5EW8A 4A4XA 4HGTA 2YWPA 3DKOA 1GY3A 3N9XA 4ZOGA 4D4SA 4C4EA 5D12A 3RBWA 4O0YA 5K5XA 3KVXA 2WKMA 2ZMDA 4ACDA 5CEIA 2BFYA 2Z60A 4G6OA 1H1SA 4L45A 3RNYA 4FV1A 2X2MA 2J0JA 1K3AA 5IQHA 4TRLA 4FV0A 3LFBA 1WBNA 2VUWA 3O8UA 4ANLA 1F3MC 4FSUA 4O6LA 3ZOSA 4PNKA 2HY0A 4GFGA 2JFMA 3E62A 3GC0A 4EK8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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