1Q97A

The structure of the saccharomyces cerevisiae sr protein kinase, sky1p, with bound atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
362
structure length
351
Chain Sequence
YHPAFKGEPYKDARYILVRKLGWGHFSTVWLAKDMVNNTHVAMKIVRGDKVYTEAAEDEIKLLQRVNDADNTKEDSMGANHILKLLDHFNHKGPNGVHVVMVFEVLGENLLALIKKYEHRGIPLIYVKQISKQLLLGLDYMHRRCGIIHTDIKPENVLMEIVDSPENLIQIKIADLGNACWYDEHYTNSIQTREYRSPEVLLGAPWGCGADIWSTACLIFELITGDFLFKDDDHIAQIIELLGELPSYLLRNGKYTRTFFNSLLRNISKLKFWPLEDVLTEKYKFSKDEAKEISDFLSPMLQLDPRKRADAGGLVNHPWLKDTLGMEEIRVPDRELYGSGSDIPGWFEEVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleotide-Induced Conformational Changes in the Saccharomyces cerevisiae SR Protein Kinase, Sky1p, Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords SR protein kinase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 112
structure length 351
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-08-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1q97A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1q97A01
3I7CA 3ALNA 2ITPA 2ITZA 2W0JA 3BE2A 4RLLA 3QZIA 3TJCA 4XG2A 2XNGA 1H01A 3II5A 4FKSA 5M57A 5AUVA 2CLQA 2BUJA 5J79A 2O8YA 3NLBA 4Y73A 4FTOA 3NIEA 3DBEA 4ZS0A 3RHKA 1PMUA 3RPRA 4CTCA 4FEVA 3AC4A 4I4FA 1CKIA 3Q5ZA 3LMGA 4FV1A 3COIA 5EOBA 5B2KA 3CE3A 4XG3A 4RIWB 5JMSA 5EOLA 4OT5A 4M66A 4RMZA 2X2MA 5CSHA 3LIJA 3VRYA 1PW2A 3F5XA 2XJ2A 5DI1A 2UZDA 3MA6A 3LLTA 5FRIA 3IGOA 4BKJA 2JIVA 3MFTA 3OBGA 3MGYA 2OXYA 4W4XA 2LAVA 1OIRA 4D2RA 4G3DA 4FSMA 1STCE 4QMZA 4U3YA 2VU3A 4DGOA 3LHJA 3QFVA 4H36A 4R5YA 2UW0A 4YTHA 5TO8A 2QKRA 3UIBA 2Z7LA 5BMSA 3BHTA 2EWAA 3KVXA 1QPJA 2WQOA 3L8VA 4NH1A 2R4BA 3UBDA 5A3XA 1R39A 5LVLA 2CKQA 3HAVA 4EYMA 4FTQA 4RJ6A 2GFCA 4JDIA 2PVHA 5HG5A 1OECA 3NW7A 2IZSA 2WMRA 3TIZA 4BDCA 2IZUA 3AC1A 2UZVA 1Y91A 2YCSA 3DZQA 4ACHA 5L8KA 3LQ3A 3LZBA 3OHTA 3G6GA 5KMMA 4AQCA 5KMJA 4G3GA 5ICPA 1NY3A 3P79A 3R01A 3VS4A 4YZMA 5KMKA 1LEWA 1MRYA 2HK5A 5J9LA 1LUFA 2ZB1A 5JQ8A 4J71A 5K4JA 3QHWA 1ZOEA 4IAZA 4MNEB 5DT4A 3KMUA 1H1SA 5HD4A 3QUDA 2CGVA 2WTKC 3JY9A 2OJ9A 3C7QA 5I9UA 4RFYA 4M14A 4E6AA 3OW3A 4FSWA 2GDOA 4G31A 3IOPA 5ETFA 3VIDA 3L9LA 2W7XA 4FV6A 4WG4A 4ASEA 4IX5A 4F6SA 2ETRA 5FEDA 5D9HA 3W10A 4EOKA 2W5BA 3FJQE 1QPEA 3L8PA 3PG3A 4IFCA 2FSMX 4C3PA 5BUIA 2XK7A 1UU7A 3HLLA 2OH0E 1TKIA 2BFYA 3P7AA 2P2HA 5IZFA 3EOCA 5EHOA 2WO6A 3VC4A 3IPHA 2QU6A 1KWPA 1GY3A 3CQEA 3CKWA 3R8LA 4CEGA 4MH7A 3UGCA 3GC0A 3KRXA 3EN4A 3AD6A 4RWJA 3SXFA 3WARA 2JKOA 3C13A 4CQEA 1ZRZA 2VWUA 4G3FA 4K6ZA 4EH3A 4DGNA 3FV8A 4II5A 3ZU7A 3QKKA 3A7JA 4RFMA 3UNKA 4JAJA 3ULZA 3UQGA 4E4NA 4RZWA 3LJ1A 3FC1X 3R7VA 3W8QA 3EZVA 4DGGA 4I5PA 5GJDA 2NRUA 3DOGA 3FXZA 4FEXA 4LUEA 4FUYA 3O8PA 4M67A 3DQXA 2QC6A 3UO4A 4DA5A 1RW8A 4NKSA 2I0EA 3QRKA 1KE5A 5M09A 3DK7A 2R3HA 2CMWA 3DFCB 1P4FA 4KNBA 3KRRA 5AIRA 3SW4A 2BZKB 2FYSA 3JVSA 5HIEA 1ZLTA 1OPKA 3GC7A 4OBOA 1J91A 3UMWA 4AOJA 4R3PA 3PPKA 4FEQA 4S33A 3HYHA 4L7SA 1PXLA 3BU6A 3EN7A 4WBBB 3ZO4A 3ZTXA 5GZ8A 2PPQA 4FICA 5IISA 3DV3A 4RLKA 1ZXEA 5A4CA 4TYGA 4JXFA 3BU5A 4FV3A 2O64A 4WNMA 4Y5HA 4ZJJA 2VTLA 4FODA 5TR6A 3ZFYA 4D5KA 4NZWB 4ZLOA 1ZAOA 1R0PA 4BTMA 2QURA 4DINA 4X3FA 1YI3A 3M42A 3FHRA 2J50A 1Q62A 4XRLA 4IX4A 1LP4A 1OL5A 3MIYA 4PQNA 3R8ZA 5J5SA 3HDMA 2HIWA 2W1IA 2VO0A 4BKZA 3OUNB 5E1SA 5KMNA 5I4NA 4QYEA 4IB3A 3VS3A 3LKMA 3DQWA 5JSMA 2G15A 1UWJA 4FOCA 2ITOA 3IECA 3LE6A 5JGAA 2I0HA 2WQMA 2BAQA 3D83A 3KK8A 4FE2A 4IX3A 4R5SA 3WZKA 4EKLA 1NT2A 4BZDA 5ETAA 3DFAA 3DKGA 1MRUA 2UVZA 4IW0A 2PUUA 4FIJA 2BDWA 3G9LX 4DLIA 3PIXA 4ENYA 5LMKC 4ORKA 3CLYA 4IXPA 3KULB 4TNDA 5DWRA 3TTJA 2FGIA 3QGWA 1H26A 4O0SA 4F7JA 5ETCA 2QLQA 1BLXA 1Q8TA 2BZIB 4V04A 2QONA 2Y4IB 5JGBA 1M14A 5HTIA 4FTIA 3O17A 4HJOA 2F4JA 4ZTQA 3VBXA 4WRSA 2ITYA 3E7OA 1KUTA 4MWHA 4ID7A 3KXZA 2E9VA 2HY81 3QZHA 2QODA 4IEBA 3DJ5A 3IDBA 4IDTA 3ZUTA 1CSNA 4Z3VA 4BI2A 3PY3A 1S9JA 1YHWA 2HCKA 3R8UA 4FTKA 1OL1A 3R7OA 3EQDA 1AD5A 2XK6A 2GS6A 2YDIA 5A4LA 5D1JA 2YM6A 4XOYA 3BQRA 4KKGA 4FV0A 4JG8A 5IDNA 4EYJA 4K8AA 4HZRA 5HU3A 3FZSA 2R3NA 3QA0A 4YO6A 5H8EA 3S00A 2Z8CA 4C58A 5AP2A 1P14A 3DBCA 5DBXA 4BI0A 4UMPA 2I7QA 2Y4PA 2OLCA 4QTDA 1YXUA 3PJCA 3CIKA 4JX7A 4B99A 4YNEA 3H9FA 4ZTLA 5A6NA 4ENXA 4PTEA 2OK1A 3LXNA 4AOTA 5KMIA 4BZNA 1OKYA 4RIWA 3RK7A 2BZHB 2IVSA 4RWLA 3TZ9A 3CS9A 4RVLA 2VNYA 3VO3A 4DITA 5DYJA 3AC8A 3REPA 3I6UA 1YW2A 3LJ0A 3G0EA 2B0QA 4XV1A 3ZZWA 3R1NA 4D4YA 5B2MA 3BZ3A 4BYIA 3P78A 1H1WA 4JX3A 4Y8DA 5AUTA 4QTEA 1NW1A 3HGKA 2OZOA 3D5WA 3Q4CA 2CCIA 3TKIA 2UZOA 3FL4A 2R3KA 3BYSA 4HPUE 1E1XA 4PDOA 5HLNA 3LCTA 3UZRA 4JOAA 3UQFA 5EQYA 3GU8A 3DJ6A 2W4KA 4AGCA 3DBDA 1KE7A 3QD4A 4FUXA 4J97A 4KKHA 4YTFA 3QCSA 2OXXA 2VV9A 4ANBA 4I0SA 2XNMA 4C4GA 3ZRMA 1K9AA 2V7OA 4USDA 3R04A 4CSVA 4EZ3A 3ZH8A 2R3LA 5JH6A 4EOMA 2BAJA 4XH6A 2XYUA 3I5NA 2G2HA 2HZNA 3F82A 3HX4A 3FQHA 4DBNA 5BUJA 4QRCA 4MNEA 5BYZA 2GS7A 3OP5A 3LXKA 5BVOA 2A19B 3DB6A 4NCTA 2X4ZA 3W8LA 2ZV9A 5HTCA 4GJ2A 5EI6A 3D14A 2VGPA 1Y8GA 5B7VA 5IUHA 3E62A 4YC8A 2XBAA 5AUYA 2GU8A 5EYKA 3E88A 3O96A 4C35A 4IH8A 3O8TA 4YLJA 4UWCA 2R3JA 2W4JA 3DLSA 3FZRA 4FGBA 5L3AA 2JKMA 4O2PA 4XG6A 4BWXA 4CQGA 3FYJX 3U6HA 1J7IA 1KV2A 2UW5A 3U55A 4AXAA 3BGPA 2IO6A 2WU7A 2X7OA 5L6WL 3S3IA 5HE1A 2IJMA 4ZSLA 4CLIA 3D7TB 4DHFA 2HXQA 4FTNA 2PTKA 3FMDA 2WTKB 3PFQA 3W1FA 5M07A 4L67A 3EL8A 4I93A 4IWQA 4QYFA 4UYNA 5AX9A 1J7UA 4C2VA 2WTDA 3WF5A 2C68A 4GVJA 2BR1A 3G6HA 3NIZA 4FG9A 4JNWA 4BRXA 3R9HA 4U81A 2QHNA 3D5XA 4FT9A 5IF1A 3MVLA 2BILB 4BBEA 2CSNA 3A61A 3DKFA 3KRWA 3PA4A 3SDJA 4BBFA 4EH5A 2QG5A 4FNYA 2IVTA 1CM8A 1W7HA 2PE2A 4BCNA 1PXMA 3RPVA 5DMZA 4EC9A 4LOPA 4FL1A 3TT0A 3GCSA 4AAAA 2Z7QA 1GZKA 4QP6A 1JOWB 4EOSA 2BVAA 2WQBA 5K9IA 4NM0A 4MQ2A 3PSBA 2Y6OA 3ZRKA 4IWDA 4AT3A 4YJVA 3PDTA 3BYVA 2YAKA 4E8AA 3F69A 5LCKA 2IZTA 4D5HA 3BRBA 3MI9A 1NVRA 2RFSA 4KUJA 2R3FA 4K33A 3THBA 4C4JA 4NK9A 3KF4A 4Z7HA 5FG8A 3EQPA 3NYXA 4QD6A 2YM3A 3IDPA 4GKIA 3MTLA 1OIQA 3GNIB 3SHEA 2J0LA 4I6HA 4F70A 4USEA 3FY0A 1YOLA 2Q0NA 5CI6A 2YHVA 4HVHA 4O0UA 3UODA 4A4OA 1A06A 1SNUA 5HBHA 3H0ZA 5K5NA 4JQEA 4CT2A 4F1TA 3QQGA 4QP4A 2OZAB 4I23A 2FSTX 3O0GA 2GCDA 2HXLA 4G9CA 5F9EA 3KREA 5LMAA 3R9OA 3UC4A 3QRTA 3KULA 4U97A 4APCA 5HGIA 4KINA 4F9WA 3CY3A 4IVBA 3IKAA 5J87A 4YJPA 5AV4A 2QO2A 3WF7A 4W9XA 4OBPA 1JKTA 3ODZX 1UWHA 4X2FA 3RM7A 3TV6A 2H9VA 4FSNA 3EJ1A 4GT4A 3VF8A 4ERKA 2IG7A 2ZM4A 4NFMA 2WIHA 4F9YA 1VR2A 3QTIA 1WBVA 2UUEA 3RBWA 3C5IA 5FUTA 4LL5A 3MV5A 4GG7A 4RC3A 3TTIA 1OITA 5IH6A 4R77A 2YN8A 5FDPA 4IC7A 4IB5A 4YLLA 3F5PA 4EBVA 2WMQA 2ITUA 2YCQA 3O71A 1JPAA 4FKOA 4QP1A 4YBJA 4YMJA 3LXPA 4EOJA 5C1QB 4MD8E 4DFZE 1H24A 3A60A 1OBGA 3OROA 3KVWA 4O83A 1H28A 1WBTA 5I9XA 1XJDA 3N51A 1YQJA 3QTXA 2BHHA 2PMNX 2WMUA 4UMRA 1U54A 3NAYA 4OTIA 4EKKA 3LFAA 2W05A 1UKIA 1W83A 4F7NA 3UOKA 4YLKA 2YZAA 3PUPA 3VW6A 3F2RA 4ZTMA 4XRJA 5HX8A 4YC3A 4D55A 4ZY4A 4FKVA 1HOWA 4K1BA 2J90A 3R8PA 3TUCA 4LYNA 4IAAA 3HAMA 3R9RA 2DQ7X 4BC6A 3H9RA 4O2ZA 5LCJA 2V7AA 2VX1A 4RT7A 5F95A 1H1RA 3RHXA 4FKTA 1AGWA 4RIXB 4BDBA 4UEUA 5GZ9A 2IVUA 3CP9A 3D2IA 5ANDA 1HCLA 5AP6A 4ZK5A 2C5NA 5AUUA 3ZBFA 3NX8A 4A06A 4O7NA 3R02A 2R0IA 1FPUA 2O5KA 5IMEA 2X8IA 3QC4A 4E7WA 5L2SA 2QOLA 3C4FA 3ZBXA 3OY3A 1NA7A 1ZYJA 1YXSA 4CFXA 4KIQA 4CKRA 4UALA 2HWPA 2OFVA 2P33A 3CTQA 4PF4A 5CQWA 4IM3A 3OT3A 3L9MA 1X8BA 2J51A 4O7VA 2E9NA 4KD1A 4J98A 4W8EA 4WD5A 5J8IA 4I94A 3RMFA 5IMXA 4X2JA 3E8CA 1GZNA 3PE2A 3OF0A 3MDYA 5BMMA 3BIZA 3LFQA 5J9YA 3EIDA 4AG8A 2JIIA 3SOCA 3Q53A 4GYIA 1XO2B 3R7IA 3NNVA 2EUFB 2XNOA 4XX9A 1WVWA 3CD3A 1A48A 4BDAA 5IQAA 1YXTA 1RJBA 5DT0A 4NWMA 2WD1A 1LR4A 5AAEA 2X6EA 4WSQA 2XNEA 3FXWA 3L9NA 2AUHA 4PL5A 3HV7A 4Y46A 2UZWE 4EOPA 3QQUA 5I3RA 3EZRA 4MBJA 1NVQA 3DXNA 4QTAA 1EH4A 5IH5A 4ALVA 3JR1A 2W99B 2X7FA 3M11A 3PXYA 3V04A 4BN1A 3KK9A 2X8EA 3ET7A 3C4EA 5KX8A 4LV5A 2NNWB 1VEBA 3ZRLA 4XCUA 3SOAA 3MA3A 3HP2A 3N9XA 5HVJA 2YM5A 4O1OA 2XM8A 2E9PA 4QYYA 2IW9A 3E92A 4BL1A 3WE8A 5BVWA 3LFNA 4GT5A 4FMQA 4AU8A 4CV8A 2C6OA 4BCQA 2YJRA 3FUPA 4PMPA 3IW6A 4YTIA 3WF9A 5CASA 4M8TA 4BCMA 2Y7JA 5EKOA 4BWPA 4GG5A 4P5QA 5EYMA 2BROA 3GC9A 2WXVA 5IA5A 4AS0A 3TV4A 4IWOA 4L53A 4MXXA 1BMKA 2OI4X 4YPSA 5HNBA 2ACXA 2CLXA 2R7IA 5KBQA 1E1VA 1UU9A 4KSPA 2J0JA 3RAHA 3ZMMA 4TZRA 3D0EA 3GVUA 5M56A 5CAVA 5EK7A 3R63A 5DVRA 5E90A 2BKZA 4IIRA 3UTOA 4CMUA 3KCKA 1L3RE 4NL0A 2YJSA 5AV0A 3ZS5A 3GU6A 3HV5A 3JYAA 4RWKA 2JFMA 3K5VA 2AYPA 3D4QA 5CF4A 2Z7SA 1FOTA 1YI4A 2ERKA 2HY0A 1KOAA 4RC2A 4WKQA 5FXQA 4D4SA 5HNGA 5FM3A 1B39A 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