1QMZA

Phosphorylated cdk2-cyclyin a-substrate peptide complex
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
297
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structural Basis for Specificity of Substrate and Recruitment Peptides for Cyclin-Dependent Kinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 296
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 1999-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1qmzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1qmzA01
3F88A 2GHLA 1SMHA 3F3WA 2GMXA 2OIQA 4R1VA 5IH6A 5DYJA 3GU5A 3HECA 3QBNA 4JQ8A 2P33A 1Q97A 5HVJA 2OXXA 3QRIA 4FT3A 5FQDC 3H0YA 3DA6A 4MK0A 3UIUA 3UP7A 3DBFA 3UPXA 3DU8A 4NL0A 3U4UA 4AN2A 2UW5A 4RA5A 2GQSA 5HIBA 3ZS5A 3QX4A 3LQ3A 5HO7A 4U41A 1IR3A 2O65A 3LMIA 1VEBA 1KUTA 2HZ4A 1A48A 4IWOA 2JIVA 2FSOX 4XP0A 4JXFA 4A9UA 5IA1A 3L8SA 2GDOA 4KIKB 3SAYA 5D7VA 5LMBA 4O86A 4CGAA 2R2PA 5A46A 2DS1A 2Z60A 4LMUA 1SNXA 4TWPA 3W32A 4O83A 4YZNA 3P7AA 1W8CA 4M84A 4PTGA 4X3FB 4BGHA 4EUUA 3HEGA 4F0IA 2PYWA 5H3QA 3P7CA 4HGLA 4YPSA 4L42A 4FVRA 2YIWA 4BI0A 3LPBA 5BUEA 5AX9A 5HBHA 2VWUA 3NLBA 4UMTA 4YNEA 4BCMA 4D5KA 3C5UA 4G17A 1Q3DA 4GT5A 4C4IA 1XH4A 3IDCA 4S31A 3HDMA 3MFSA 1ATPE 4WO5A 4DE4A 3F6XA 1W82A 3QUDA 2VTJA 3BELA 3DS6A 1W98A 3DZQA 3LVPA 2YLEA 4O6LA 4F1MA 4K6ZA 4Z16A 2ZV9A 5IKWA 3FYJX 1ZOGA 1BL6A 1AD5A 5HZNA 4K1BA 4XOYA 1XH5A 3EH9A 5KMKA 4RX5A 3U6JA 4AE9A 3CGFA 3QALE 4BRXA 5E1EA 4V04A 5DR6A 3UBDA 3QTZA 3FAAA 2OXYA 1M7QA 2YIQA 3QF9A 3FZSA 2WTDA 3U4WA 3AT4A 2REIA 4IB1A 2QHNA 5J7HA 4EOSA 2E9UA 5HVKA 2UZUE 2VN9A 4J71A 2HYYA 4EBWA 3JXWA 5EW8A 5F94A 3Q2MA 4ZXTA 3MPTA 3QZIA 4FTIA 3LXNA 4OTGA 4KAOA 5E1SA 4AGDA 2V7AA 5TT7A 4TYHA 3ROCA 3NW6A 4H3BA 2XK6A 2A1AB 1J3HA 4LFIA 3BE2A 1OL7A 4TKSA 2C3JA 3MVLA 1NXKA 4G16A 4PV0A 4XG6A 4AGWA 2VWIA 5IZFA 5L6PA 2OLCA 3UO6A 2OU7A 4M7IA 2W1DA 3CGOA 3W2RA 3KMUA 3QZGA 4PDSA 2CN8A 5IA3A 3NRMA 4BDGA 3LQ8A 4I6FA 2RG6A 4RJ3A 2A0CX 4XV9A 5FD2A 5H9BA 2WEIA 3H4JA 1H1RA 2PVJA 1FOTA 4OTRA 4QPSA 1ND4A 4JBPA 1H0VA 3VS2A 3MJ2A 2C5XA 3QRUA 4E4LA 3LLAA 4P5QA 2I40A 4D4SA 4BCOA 3L9PA 4C33A 3R28A 4ZIMA 4MBLA 4PP9A 3SOAA 2QOOA 4DEHA 2YIXA 1CKIA 2J6MA 5DR9A 2V55A 5CXZA 2PU8A 1OGUA 4NZWB 4QRCA 2XNBA 5B0XA 3UG1A 3KRRA 4DTAA 3A61A 4U44A 4BVUA 3OT8A 4FIGA 5JZNA 3DB8A 2F49A 2WB8A 3C7QA 4XX9A 4MF1A 4E6QA 3QTUA 3SXSA 4E1ZA 3F2AA 3PZHA 3EQPA 2EWAA 4FIIA 4K9YA 4CRLA 5IQIA 3GT8A 3EB0A 3AGMA 4BWPA 2ITUA 2BAQA 3LM0A 3WILA 5DHJA 4BYJA 3NPCA 4X2NA 3UOHA 3GFEA 1V0BA 5AP7A 5A6OA 1OL2A 2B0QA 4W9XA 5H8GA 1E1XA 4NM5A 2VTSA 4NTSA 4D0WA 5BUJA 3ZLWA 2WHBA 4D2VA 3M2WA 2EU9A 5AM7A 4G3GA 1NW1A 5EQPA 3ULIA 5FXQA 4XV1A 5C01A 1H1WA 1YHSA 3COHA 4R7HA 4KBAA 4E26A 2R3IA 3BE9A 4GG5A 3NCGA 3E92A 4X0MA 4RLLA 4BWXA 3HVCA 3PWYA 3NAYA 5DNRA 3TKHA 2FA2A 2DUVA 2IVTA 4C4JA 2WD1A 3E3PA 1WVXA 3K5UA 5AUWA 4BCHA 4PL3A 2XNMA 3TNHA 2YZLA 3EN9A 4EI4A 2BRGA 2X6DA 3SC1A 2XIXA 5EG3A 2LAVA 2F2UA 4OTIA 2YFXA 4C57A 1R39A 3FI8A 5DVRA 4YJQA 4GSBA 2YCRA 4CV8A 5BMMA 5GZ8A 2WOTA 4PX6A 3BCEA 3QLFA 2Z7SA 3FWQA 3FL5A 4ACCA 4PDYA 2X2KA 1UU3A 2J0JA 2XKDA 5KKRB 3QCQA 2CNVA 5FTGA 5E91A 5FTQA 4JL9A 3IKAA 4BDJA 4IQ6A 1G3NA 2WGJA 2OXDA 3PXFA 5GIPE 1SYKA 5JH6A 3UE4A 4NU1A 3COIA 5CAUA 3ZSIA 3N4VA 4FZ7A 4YJUA 4FYNA 4LUEA 4JIKA 1KE9A 4FZ6A 1WAKA 3BBTB 4BCFA 3MYGA 5CASA 3W18A 4G6OA 4DFUA 2PVKA 3UYSA 3AOXA 4FSNA 2OFVA 3ALNA 3DLZA 3JS2A 4XUFA 3PDTA 2C69A 3UZRA 2IVVA 5HOAA 3LFCA 4H36A 4ZK5A 4E6AA 3ZC5A 3TDWA 3MVHA 5C8NA 2UZNA 3AC5A 2J50A 4EQMA 3MW1A 5HE1A 3ZYAA 2C47A 3VNTA 3W1FA 1PY5A 3LHJA 5IQFA 1Q3WA 3OOMA 4J8NA 3EFKA 3PPZA 5J9ZA 4JDIA 1YOMA 3KFAA 3KCFA 4IM2A 4EZ5A 5M09A 2ZVAA 5CZIA 3QHRA 4IIRA 4WOVA 2XZSA 2YEXA 4IVCA 3ZO1A 4ZTHA 3ZRLA 3C1XA 3DAJA 2CNQA 3RK5A 1OL1A 3FQEA 3EHAA 3ZO4A 2R0IA 4O7TA 3Q4ZA 3NYVA 5JN2A 3ZUVA 3IW8A 4TYJA 3RPVA 4DFBA 3KF4A 3T9IA 3ZZWA 4HW7A 3DPKA 1WMKA 5EW9A 4HOKA 3ID6C 3ZCLA 4ZLYA 5EM8A 3P9JA 3F2NA 4IC8A 4APCA 4FIEA 3C13A 3AC1A 4IVBA 4HCTA 3OUNB 4I6BA 4EK8A 4O96A 4BTJA 4NH1A 3F66A 4L68A 2EXCX 4FNZA 3V8WA 3CPCA 4FKJA 5B2LA 4PMMA 4FG8A 1QMZA 2W9ZB 5AUVA 2BDWA 4FF8A 3V5PA 3ORZA 3JR1A 2W1EA 3L9NA 1V0OA 3OS3A 5IEYA 2IN6A 3QYWA 4XG4A 1S9JA 3UVPA 3E8EA 3R30A 2ITQA 3FMEA 3LXKA 5AX3A 4DGGA 4BWKA 5EI2A 3HMNA 2ITNA 4ZTNA 2XIRA 3TDVA 3GCUA 2I0EA 3FZOA 3K3JA 3ORTA 3ORXA 4N6ZA 3MY1A 2YACA 4IH8A 4R7IA 3S3IA 4MH7A 3VS1A 1YVJA 4A7CA 4FA2A 4S33A 2UW3A 3DFCB 3VO3A 2PE0A 4L46A 4FSQA 3RWQA 3SXFA 4L3JA 4BDFA 4XP2A 4BCGA 4HNFA 1OB3A 2YWVA 3G2FA 4M69B 2QKRA 3WARA 1JBPE 3EZRA 1W0XC 2HWPA 4FSMA 2Y0AA 4KIPA 3VQUA 5KO1A 4WSQA 1YXTA 1E9HA 3GP0A 3GEQA 4YTHA 2RFDA 2X9FA 3E7OA 3TN8A 1OPJA 5HU3A 2J2IB 3W2OA 4DFNA 2W4KA 5KHWA 1YI6A 3V5JA 1UNGA 3FHIA 4IXPA 3R01A 2XK8A 5DWRA 3OG7A 2CGUA 3PVUA 4YZCA 5HESA 4U6RA 1IASA 1P5EA 3CJFA 3BHUA 2WMTA 3C4CA 2ZMCA 2RGPA 3AG9A 5T3QA 4M8TA 3CJGA 3MIAA 2Y4IB 2WEVA 4QO9A 3LFBA 4MQ1A 4QTDA 4KBCA 3D0EA 4IVDA 4FEWA 3EN4A 3KRWA 3LMHA 3R8MA 3VJNA 2ONLA 3Q52A 4GU9A 4JQEA 3ZM9A 4YZBA 4EBVA 4XV3A 5FP5A 4BL1A 4WUAA 5DT0A 3GFWA 3VUTA 2PULA 3TZ8A 4XH6A 4E73A 3JYAA 2UZBA 3GCQA 4FV8A 5CF4A 4BTKA 4I1ZA 3L9LA 4I24A 4TWOA 4WUNA 4QP2A 3IW5A 4R3PA 3R21A 3LE6A 4LOPA 2A19B 5AV0A 2QOBA 5IA0A 3W2SA 3BHVA 4J52A 4OLIA 5E9EA 2ITVA 4RT7A 3Q32A 3OY3A 1V1KA 3LW0A 2ZOQA 3UJGA 1AQ1A 5HBEA 2PVFA 1UU8A 2XVDA 2YDIA 3LFSA 4ASXA 3EQIA 4GYIA 2OFUA 4OBQA 5J7BA 1YWVA 2VX3A 4LGHA 4AZEA 3FXXA 4CQEA 3QQUA 2YJRA 3ZFYA 3TUDA 4CFMA 2BRBA 1FINA 1YXVA 2AC3A 2LGCA 3W8LA 1JKLA 2VAGA 3FC1X 2UV2A 2WMRA 4BKZA 5FTOA 1LR4A 2JEDA 2WIPA 2WTWA 3MVMA 3O51A 1OKWA 4CFFA 3UQCA 4N0SA 5DT4A 2EUFB 2P55A 3DCVA 4F9YA 3VUDA 3ZTXA 3D7ZA 4FSZA 1UWJA 4Y73A 3WI6A 2HENA 3CKWA 2R3MA 4RSSA 3TM0A 2Y9QA 5E4HA 5BNJA 3GC7A 3DK6A 4S2ZA 1IA9A 4FSTA 3PZEA 2A4LA 1PXPA 3V5LA 5EFQA 1MQBA 3HRCA 4QPMA 3F9NA 3QTRA 1PXLA 1XBCA 5KMJA 2YCQA 5A4EA 4TY1A 3BEGA 3C9WA 1GOLA 2RL5A 4QMSA 3LIJA 4A9TA 3ZRMA 1PYEA 4I41A 4QTCA 5CLPA 3R83A 5IPJA 4O0VA 3G90X 2J0IA 2YZAA 4FGBA 1WBSA 2BIYA 4H3QA 5AADA 4AX8A 4EL9A 4EC9A 5JGBA 2SRCA 5CNNA 4X2FA 3TIZA 4DITA 3OCGA 1JVPP 3CTQA 3CC6A 1LP4A 2X39A 2NPQA 3KK9A 3NR9A 4FKLA 3HZTA 3B8RA 5B7VA 3OWKA 4C4EA 1MRUA 3HA6A 3FBVA 4L43A 4YHJA 2IJMA 4CV9A 5HBJA 3Q4UA 1WCCA 2VTNA 3VN9A 3ZO2A 2XM8A 5I9WA 3VJOA 3NCZA 3FZ1A 3A60A 3S1HA 2BKKA 4OT5A 2ZB1A 3E88A 2W1FA 3KF7A 4FL1A 3V51A 3F2RA 5ANDA 4EOMA 3V8SA 4AGUA 5HO8A 3UIXA 3QFVA 3BV3A 3KCKA 4Q9ZA 3CBLA 5CVHA 2C5VA 2WPAA 4ZAUA 1CKPA 3ZUTA 4BZDA 1SVGA 4YURA 4UZHA 3LMGA 2WTVA 3KULA 3U87A 5LXMA 4AAAA 2PSQA 3G15A 4ZS0A 1P2AA 3O7LD 3R1SA 4ITJA 4TNDA 4AACA 3HRBA 4M67A 4Y85A 3LFAA 3FY0A 5L6WL 3RP9A 2WKMA 1OPLA 3FHRA 3IDPA 3MFRA 3WF6A 2VWBA 4ACDA 4AU8A 3HMPA 3F61A 4MEDA 1OUKA 2OZAA 3FSFA 3I4BA 3VBYA 5EYMA 5GIOE 4R3RA 4YLKA 2GQGA 5CU3A 4ACHA 5D11A 3C4EA 4Y95A 4P4CA 4XBRA 4JAJA 1ZYSA 4YLJA 5ITAA 4ZTLA 1IA8A 4DEBA 5E8XA 4X2KA 3GNIB 4EOLA 4YP8A 2NRYA 3SD0A 2JDOA 2PK9A 3Q96A 2KULA 3QRTA 3UIMA 4AP7A 5JRQA 1DS5A 3EQFA 2C6OA 3M42A 1FGIA 2XKEA 2VWYA 2W4OA 5HG9A 4H1MA 5I9XA 3KC3A 3NIZA 4YZMA 2JKOA 2E9VA 2E9PA 5M4UA 2C6IA 3COKA 3FLZA 4PL5A 4IZAA 2Q0NA 1Q61A 1H28A 1YDSE 2C5NA 2GS6A 3Q3BA 4HGEA 4F7JA 4RIYA 1DAYA 2F2CB 2C6EA 3KRXA 3P23A 3OUKA 4FNXA 4O0YA 4CLJA 5HO6A 4AT5A 4D58A 5EKOA 2B55A 2XYNA 3F7WA 3FDNA 4NEUA 4KKGA 2GS7A 4PDPA 4F9BA 1YI3A 3LCTA 1H1QA 2ZAZA 1SVEA 5HNGA 4LOOA 4YPDA 1GY3A 4RJ6A 5EHLA 3U8WA 3OMVA 2CKOA 1M14A 1JNKA 5I0BA 3LM5A 2HY0A 5J1WA 4FKVA 4FKGA 4FKQA 5C1QB 3ENHA 4UY9A 2VGPA 1P14A 4IM0A 3PXKA 1F0QA 3GCPA 3KU2A 1Y57A 5IQAA 4CTBA 3G9NA 3TIYA 3DOGA 4OBPA 3RM7A 5LVOA 3AXWA 3QD2B 4G31A 4U79A 2J9MA 2PTKA 4QP6A 4RVMA 3NVMB 4FKUA 4F6WA 5TKDA 5J1VA 3BQCA 2AYPA 4KIOA 4L8MA 5CZHA 4YBJA 4U80A 4D9UA 3TV7A 3OWPA 2IZSA 4X2JA 2BPMA 3WIGA 4O82A 5L8KA 3BYUA 4FV1A 4CNHA 1TQMA 2OJGA 4X2GA 2RF9A 5HEZA 3QWJA 5HKMA 5AUUA 2AC5A 4GKHA 2W5HA 1KV2A 2OGVA 3ALOA 4AG8A 4LOQA 4EOPA 4NKAA 5M06A 2YM7A 3LXPA 5HGIA 3D15A 2C3LA 3G51A 3WF9A 2OO8X 3MY0A 5H8EA 1YXXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F88 A;  2GHL A;  1SMH A;  3F3W A;  2GMX A;  2OIQ A;  4R1V A;  5IH6 A;  5DYJ A;  3GU5 A;  3HEC A;  3QBN A;  4JQ8 A;  2P33 A;  1Q97 A;  5HVJ A;  2OXX A;  3QRI A;  4FT3 A;  5FQD C;  3H0Y A;  3DA6 A;  4MK0 A;  3UIU A;  3UP7 A;  3DBF A;  3UPX A;  3DU8 A;  4NL0 A;  3U4U A;  4AN2 A;  2UW5 A;  4RA5 A;  2GQS A;  5HIB A;  3ZS5 A;  3QX4 A;  3LQ3 A;  5HO7 A;  4U41 A;  1IR3 A;  2O65 A;  3LMI A;  1VEB A;  1KUT A;  2HZ4 A;  1A48 A;  4IWO A;  2JIV A;  2FSO X;  4XP0 A;  4JXF A;  4A9U A;  5IA1 A;  3L8S A;  2GDO A;  4KIK B;  3SAY A;  5D7V A;  4ZLZ A;  5LMB A;  4O86 A;  4CGA A;  2R2P A;  5A46 A;  2DS1 A;  2Z60 A;  4LMU A;  1SNX A;  4TWP A;  3W32 A;  4O83 A;  4YZN A;  3P7A A;  1W8C A;  4M84 A;  4PTG A;  4X3F B;  4BGH A;  4EUU A;  3HEG A;  4F0I A;  2PYW A;  5H3Q A;  3P7C A;  4HGL A;  4YPS A;  4L42 A;  4FVR A;  2YIW A;  4BI0 A;  3LPB A;  5BUE A;  5AX9 A;  5HBH A;  2VWU A;  3NLB A;  4UMT A;  4YNE A;  4BCM A;  4D5K A;  3C5U A;  4G17 A;  1Q3D A;  4GT5 A;  4C4I A;  1XH4 A;  3IDC A;  4S31 A;  3HDM A;  3MFS A;  1ATP E; 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