1QPDA

Structural analysis of the lymphocyte-specific kinase lck in complex with non-selective and src family selective kinase inhibitors
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
271
structure length
270
Chain Sequence
KPWWEDAWEVPRETLKLVERLGAGQAGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDAETAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structural analysis of the lymphocyte-specific kinase Lck in complex with non-selective and Src family selective kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LCK KINASE
total genus 87
structure length 270
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1999-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1qpdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1qpdA01
5A54A 5JGBA 3W2CA 5AP2A 4AGWA 5F9EA 4PMMA 2FUMA 5FEDA 4GT5A 1U46A 4A07A 4WA9A 2QOBA 4FKTA 1R39A 4F63A 2PVHA 5EQEA 3SLSA 2YM4A 2EXCX 4EH2A 4G3EA 2UVXA 3VUHA 5IISA 5ACKA 3NVMB 5L2WA 1JVPP 2IJMA 3W2SA 4K6ZA 4OTPA 2BROA 3PXYA 4QTDA 1KUTA 4DFUA 3I60A 2WO6A 5FWKK 3ZLWA 4RBLA 5E92A 3MVLA 2XA4A 3AC1A 3VRZA 5E8VA 5KNJA 2YM8A 2RSVA 3D5VA 4M12A 5FBNC 5LVLA 3BLQA 4IWPA 2F2CB 3QYWA 4UWBA 5IH5A 4FBXA 5DPVA 4PTGA 2C3LA 2F9GA 3DXPA 4FG8A 3F2NA 3AC4A 4XHKB 5EW3A 4IB0A 3REPA 4FK6A 2VAGA 3QCSA 4LMUA 3AT4A 1H01A 2X1NA 4BBFA 4O0TA 4YC3A 5TE0A 4EH4A 2HW7A 3F3WA 3W16A 4BCHA 5HTIA 2GPHA 4L44A 4L00A 2BVAA 4YO6A 3EYGA 2VTSA 3NNUA 2XK4A 4IIRA 4O84A 4RVKA 3POOA 1UU8A 4K77A 2I40A 3F2AA 4YP8A 4L7SA 2UW3A 5HNIX 2WEIA 2FSMX 4YHFA 3FAAA 2PVLA 5FDXA 3WYYA 4K0YA 4IX4A 4FODA 4PX6A 1GIHA 1OIQA 5FEEA 4KUJA 2Q0BA 5KMMA 1OUKA 5AV2A 3E8CA 1V0PA 5E4HA 1WBVA 4I5MA 3LXPA 4QPMA 1PW2A 3RWPA 5K4JA 3SRVB 3HAVA 1ZWSA 2J0MB 3VF9A 4M0YA 4BDAA 3DKFA 3OT8A 5HE2A 4F6SA 5AAFA 2ETMA 3PWYA 2P0CA 3DA6A 4X2FA 3F2RA 5AR4A 5IH4A 4GKHA 3HLLA 3KEXA 5DIAA 3VNTA 3GCPA 2YLFA 1J1CA 5HLWA 2VN9A 3OTVA 5AMNA 1ZOGA 2F7XE 2Z60A 3BEAA 3FKOA 3QUEA 5TT7A 3UDBA 3VJNA 3VS3A 4QP1A 4ZTHA 3FMHA 2NRUA 4Y73A 4OBOA 3VS0A 2OW3A 2QO9A 4ACMA 5JFWA 3ZDIA 1T46A 2UW9A 3AD4A 3DS6A 3KXMA 4HCVA 4W8EA 4XRLA 4BDJA 3OG7A 5ANOA 3RPRA 4ACCA 2VWVA 1VJYA 4LI5A 1HCKA 3MJ1A 4FT9A 4DGMA 2QI8A 2VTRA 2CKQA 4FC0A 4ANOA 3HP2A 5AV4A 3QA8A 3AC2A 2V0DA 4EHZA 4JJRA 4HGSA 4XJ0A 5AR5A 3TNWA 4BZNA 2B9FA 4JBPA 2J0KA 4G3GA 1ZARA 3R9RA 4IHPA 4KABA 3A99A 4I6FA 1L3RE 5HESA 2UW7A 5AADA 4O0SA 1SNXA 2REIA 3LOKA 3MIAA 2V7OA 4IZYA 2G9XA 4JIKA 5HNBA 1PRYA 2E9PA 3QZIA 4FZAB 4L3PA 4D2PA 3MVHA 2OO8X 2WTDA 3R73A 4O0VA 5HHWA 1Z57A 5KBQA 4IAYA 2C6DA 1PXOA 3U6IA 2IWIA 4RJ4A 2C0OA 4O1OA 3G15A 2OF4A 4HZRA 2A19B 2LAVA 4OBQA 4I5PA 3BHTA 4TY1A 4E6DA 4E5AX 4YLJA 2HIWA 2R3KA 4NW6A 3A62A 5BVKA 4GCJA 4KKGA 3ANQA 4JOAA 3OY3A 1IAHA 5EG3A 5BVDA 5H8EA 5TKDA 2BILB 1LP4A 3PIYA 3BELA 1SMHA 1NA7A 2GNGA 3P7BA 4D4YA 3RAKA 3U6HA 3ENHA 2WFYA 3HKOA 3I7CA 3U54A 1M17A 4S2ZA 5HIDA 1PY5A 2RFDA 3DK6A 5GJGA 4IADA 3V5TA 3GOKA 4I21A 2WOTA 4E6CA 3PLAE 4C0TA 3PA5A 5JN2A 2IZSA 3ZTXA 1URWA 3VW6A 4CG8A 4BCPA 2W96B 2ERKA 3R00A 4I3ZA 5DVRA 4GMYA 5IKWA 2PUNA 3A7HA 3PFQA 4LM5A 4FEXA 4YJQA 3ALNA 4HNFA 2CN8A 4P2KA 3MFRA 1O6YA 4MXAA 3I5NA 5M53A 4CG9A 2O8YA 3VBYA 3PE2A 5LMAA 3NW7A 4D1ZA 1YW2A 3LM5A 4I20A 2XYUA 3D9VA 4ZSEA 1S9IA 3V5PA 3VS2A 4YSMA 2XK9A 3VF8A 5M4UA 3TWJA 3C4ZA 5CU6A 4EC8A 2IZRA 4FTOA 3UNKA 4CV9A 5LQFA 2PK9A 3AT2A 5A4QA 2WMSA 4FUYA 4NK9A 1STCE 4FTUA 5AAGA 3NLBA 5AP0A 1EH4A 2E2BA 1BL7A 2JDOA 2ZDUA 3Q3BA 3W2PA 4HJOA 4PRJA 5BMMA 1A48A 2X4ZA 5T6KA 4FMQA 4BCMA 5AA9A 5A3XA 4CGAA 3R1SA 2QURA 3PY1A 4BKZA 4G2FA 3NSZA 3I4BA 3MY0A 3ULIA 4CYJA 3EQBA 3TT0A 3NWWA 3O7LB 3VUGA 5HU9A 2WHBA 4GK2A 4F0IA 4FIJA 4MTAA 5CI7A 3SHEA 4NZWB 1KE6A 5DHJA 1OL6A 1QPCA 2R3QA 4EZ3A 3FXWA 4RVTA 3D5WA 2CNQA 3NNVA 2EU9A 4YZDA 3II5A 4FZDB 1TQMA 3Q96A 2IVUA 5IMEA 1SM2A 4KIKB 2E9OA 5CU2A 2BRBA 3OFMA 4TN6A 2ITVA 4H1JA 5JFSA 4BCKA 4RWIA 3GGFA 2B52A 4KIKA 2ZAZA 3DKOA 4RX8A 3W10A 3A60A 4QQ5A 3C4CA 3I7BA 3UG2A 2WTCA 5JMSA 4JS8A 2ITQA 4I0SA 5A9UA 4ID7A 2VZ6A 3SG9A 4XMOA 1T45A 4DEDA 3GP0A 4UMQA 4AOTA 4DTBA 3GXLA 1H1QA 4C36A 5L8JA 2CKEA 4TWNA 5HBJA 2BAQA 4BIEA 1OUYA 2J0JA 2ITNA 3BU5A 5HI2A 4FL3A 3V5QA 3UPZA 3T3UA 5C4KA 1SVGA 4F7SA 2XNOA 3Q53A 4QMPA 3Q9XA 4FKJA 4O22A 4GG5A 3WOWA 4ONAA 4BCIA 1PXKA 2FVDA 4TWOA 5M55A 2XRWA 3WIKA 4W8DA 2F49A 3BZ3A 4IDTA 2X4FA 4DFNA 1UKHA 3COHA 3QZHA 5DRBA 4ZJVA 5E8WA 5T3QA 3NEWA 3ORMA 3PXKA 4CXAA 3R1NA 4GS6A 5KX8A 1TKIA 4AGUA 3NAYA 3KN5A 1BUHA 3QFVA 4NIFA 4F1MA 3QQLA 2HWPA 4I5CA 3VUIA 4NFMA 3P4KA 4GW8A 3UYTA 2Z2WA 3Q4UA 3HA6A 5HEZA 5AUZA 3I1AA 4HYUA 4QQJA 4YURA 4ZS0A 5CEIA 5K0XA 4KIOA 5AP1A 3UO5A 4ZLZA 2XB7A 4EKKA 3QRJA 1IEPA 2I1MA 4YHJA 4DT8A 4X21A 4PNIA 4TRLA 4CFMA 4TPTA 3ZO4A 4BWKA 1ZYCA 3PPKA 2GQSA 3G0EA 4YLKA 2NRYA 4P5ZA 5IUGA 4NM3A 4EONA 4QMQA 4DT9A 2WU6A 2XM8A 4BCFA 4C58A 1WBTA 3O96A 4E5BA 4EYJA 3Q9ZA 4L01A 2BDWA 5HVYA 2JLDA 3L9PA 3LFQA 4N70A 4PMSA 3ZLSA 4O91A 4WG3A 3RZBA 5IA3A 4XRJA 3DOGA 4U97A 4ANMA 3BX5A 4EOJA 5M51A 5KZ0A 4FSTA 3DAJA 4X2KA 1BLXA 4RJ7A 3QL8A 2G2HA 2YM3A 5HCZA 4DA5A 1TQIA 1S9JA 5DE2A 3I6UA 3ZC5A 1OKZA 5FLFA 3AGLA 3PRFA 4IWOA 5CF4A 5M4CA 3CD8A 4CVAA 2ONLA 2YIXA 5HNGA 4TYIA 1Q8TA 4CT2A 3NUAA 1G8AA 3FZRA 3M42A 4U42A 4BTKA 4G5PA 5C27A 1KOBA 3NW5A 3P78A 3SDJA 2O0UA 1HOWA 3L1SA 4L46A 5F1ZA 4GU6A 3DB8A 4RJ6A 1OB3A 2JDSA 3RNIA 3HRFA 4U79A 2OF2A 4EOSA 4U45A 4BN1A 5DH3A 2B0QA 3UIUA 2CCHA 4NJDA 3Q9WA 4N6YA 3QF9A 3FZPA 1E1XA 3MPAA 4JBQA 5C26A 3WF9A 5I5ZA 4CCUA 3VUKA 3GC0A 4OUCA 4XV1A 2YLEA 3UE4A 5M57A 2HZ4A 3COKA 3HMNA 3NRMA 5EYMA 4BIBA 3EQGA 2UZBA 4JRNA 3U4WA 4P4CA 4AZSA 4D28A 5JSMA 4XNEA 3E5AA 2A4LA 1JBPE 4LYNA 5CVGA 3MA6A 4UXQA 4XG9A 5ETIA 5E1EA 5BYZA 4AACA 3PXFA 4L3JA 4CRSA 5EQYA 4DFBA 2R3RA 1Y8YA 1OL5A 4EK4A 1M52A 3MY5A 4BKJA 5KKRB 2XNPA 2CCIA 4H3QA 5KZIA 2CJMA 2QODA 3FWQA 4TNDA 2X9EA 3NUSA 2F7ZE 3A8XA 4DH3A 4DGOA 2QOIA 3QRUA 2XKDA 5DT4A 3O17A 2JKMA 3UYSA 1YWRA 4BGHA 5GJFA 5CTPA 4NU1A 4XG8A 1OVEA 5L2IA 4HVDA 4WBBB 4O6LA 1CSNA 1IRKA 3FKLA 4K33A 2XJ0A 2WMRA 2Z7SA 3EOCA 4Q5EA 5CQWA 4YTHA 4BWPA 4A7CA 3QQGA 3DKGA 3G9LX 3AOXA 3QC4A 5IH6A 3D7TB 5A4EA 4QP6A 4CMOA 3FMKA 3EN4A 2ZVAA 3E3PA 5IQEA 4DGNA 3TL8A 4D2SA 1URCA 3PG3A 1IA9A 4IM2A 3I6WA 5J7BA 4MBIA 4YJVA 3UBDA 4U7ZA 4CKJA 3BGPA 2RG5A 5D10A 4G3DA 4IACA 4J8NA 3V5WA 3CQUA 5CANA 2QOLA 5HO6A 1AGWA 3QCXA 4A06A 2JKQA 4YBJA 4E4LA 2O65A 1PF8A 1UNGA 2C5XA 5E90A 4F4PA 3P86A 2P3GX 3RWQA 3R21A 3R7IA 4AOJA 4C57A 3KK9A 1H07A 5EDRA 3PXRA 5CAPA 3CKWA 3OF0A 3KXNA 2J0LA 2O63A 1TQPA 1WCCA 4TNBA 4UWYA 2OICA 4P5QA 3FL5A 3VHKA 3DLSA 2OJJA 3BHVA 2B9IA 2VTNA 4FYOA 3W18A 3C0IA 3QD3A 4R7HA 2G2FA 4UEUA 1ATPE 3ZU7A 4IZ7A 1R3CA 4FSUA 4XX9A 4O7NA 2XIYA 2A0CX 4JX3A 4CLJA 4IZAA 4O0YA 5A4LA 2UW6A 4AA0A 1YKRA 2NPQA 3PPZA 1BL6A 4AWIA 2QOKA 4TL0A 3R2BA 4UMTA 1E1VA 2GFCA 2HY81 4A9UA 4CD0A 4CQGA 4MXXA 3BLRA 3QRKA 3ZH8A 1PKDA 3WZJA 4IW0A 3DFCB 4RT7A 3PYYA 3SOAA 4GG7A 4O7RA 3QWKA 1P14A 4BWXA 2VTJA 4AW5A 4E8AA 5JQ5A 5EYKA 5AX9A 4MBLA 3RPSA 3U51A 2VWUA 3FMMA 4DYMA 2PY3A 3I79A 3S95A 2WEVA 2QKRA 2WTJA 1QPJA 2Z7LA 3OXTA 4OLIA 2Z7RA 4MEDA 4KS7A 5BX0A 2YJSA 1CTPE 3QD0A 2ZDTA 3LMGA 4MD8E 4AE6A 4DEIA 4YZNA 2OFVA 5IUIA 5CZHA 2PE1A 3FMLA 4M67A 3RK5A 3IW6A 3NZ0A 4FVPA 4CFXA 4DCAA 2VGOA 4G34A 5L8LA 4E4MA 3IG7A 2WQOA 4XCUA 3HDMA 3DBEA 3WE4A 4AS0A 5C01A 3CXWA 3Q6UA 1YDSE 2X7GA 3DK3A 4AF3A 4D4VA 3CGOA 3NUPA 3QD2B 4M66A 3SXFA 5HBHA 2VWBA 5H2UA 4S33A 3MTFA 3KB7A 4AN9A 1J7IA 4EHEA 3Q52A 4LGGA 3TKIA 4A4OA 2C3JA 4FT0A 3ACJA 1Y6AA 3BHYA 4DH1A 3ULZA 4RFYA 4QP9A 4WNMA 5DLSA 2CMWA 3THBA 3TIYA 1PYXA 4DEAA 3BHUA 4C4JA 2E9UA 1Y91A 2R0UA 4FV7A 3VUMA 4I0RA 2QU6A 3RJCA 4BBEA 4I1ZA 4ALWA 4OTIA 2YM5A 3ZM9A 4AFJA 2R7BA 4L68A 1ZYJA 1PMNA 4MNEB 3QU0A 2QOFA 3N4TA 2GCDA 5HO7A 2JBPA 1AQ1A 2J5EA 4MNEA 4DFZE 3PY3A 1AD5A 4LOPA 3OUNB 3G9NA 3O8UA 2YCQA 1P4OA 4FV6A 4HPUE 4OTRA 2BKKA 3MVMA 3FE3A 3K3IA 5HCXA 4WHZA 5GJDA 2X39A 3Q60A 4CMUA 2ITZA 3E63A 4QMOA 3MESA 4YTCA 4ZLOA 1KE8A 2FO0A 5EOLA 1WVWA 1YXVA 2R7IA 3MB6A 4M0ZA 4X6QC 3R28A 2FH9A 1BX6A 2B54A 2C47A 4WNPA 3F88A 4GT3A 4PMTA 4QMLA 2R3IA 5DRDA 3TEIA 4Q2AA 3EB0A 3Q5ZA 4RJ3A 3V01A 3LFNA 4X2NA 5HO8A 4ZJIA 4E6AA 5EKNA 3DXQA 1OZ1A 4E6QA 3GUBA 3NUXA 4GK4A 5C4LA 3OCGA 3E93A 3RPVA 4C4HA 3AD6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2IN6 A;  2RFE A;  2ZJW A;  3H10 A;  4TT7 A;  2JD5 A;  5E9E A;  2PUP A;  2I0V A;  2R3N A;  1M7N A;  3MH1 A;  4RWJ A;  4MVF A;  3HL7 A;  4IZ5 A;  4JBV A;  3FHI A;  4BRX A;  2NNW B;  2OBJ A;  4XP2 A;  5EYD A;  3TNQ B;  3V6R A;  4JRV A;  4F7N A;  4FTL A;  4FKG A;  3DB6 A;  3KRJ A;  4IAZ A;  2XK8 A;  2YM7 A;  4W4V A;  1JKS A;  3WIG A;  5KML A;  2Q0N A;  1Q5K A;  5J8I A;  3W2O A;  5CEP A;  4F70 A;  3H0Z A;  3BGQ A;  4JAI A;  3RVG A;  4JDI A;  4YNO A;  3GC9 A;  2PVJ A;  4GFG A;  4JDH A;  5AP7 A;  5IA2 A;  2BRM A;  1FIN A;  3LJ1 A;  3VAP A;  4Z9L A;  3NMU F;  4NUS A;  3WF5 A;  2G2I A;  3OVV A;  4AZF A;  2RKU A;  1YI4 A;  4IE9 A;  1Q8Z A;  4WNK A;  4ZME A;  3UMX A;  1Y8G A;  2OK1 A;  3BE2 A;  1Y57 A;  4TYE A;  3TV6 A;  3PPJ A;  5JKG A;  3P7A A;  4PP9 A;  3ZZW A;  2ITW A;  3HEG A;  4GIH A;  4ZEG A;  2HZI A;  1XBA A;  4FKU A;  3NCZ A;  1QPD A;  3KRE A;  3MPT A;  4E4N A;  2ZM4 A;  2YAC A;  3OD6 X;  2JC6 A;  3PJ2 A;  4YBK A;  3F9N A;  4J95 A;  4GKI A;  3ZBX A;  2WAJ A;  5HE1 A;  5AFV A;  4U9A A;  4RLL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5A54 A;  5JGB A;  3W2C A;  5AP2 A;  4AGW A;  5F9E A;  4PMM A;  2FUM A;  5FED A;  4GT5 A;  1U46 A;  4A07 A;  4WA9 A;  2QOB A;  4FKT A;  1R39 A;  4F63 A;  2PVH A;  5EQE A;  3SLS A;  2YM4 A;  2EXC X;  4EH2 A;  4G3E A;  2UVX A;  3VUH A;  5IIS A;  5ACK A;  3NVM B;  5L2W A;  1JVP P;  2IJM A;  3W2S A;  4K6Z A;  4OTP A;  2BRO A;  3PXY A;  4QTD A;  1KUT A;  4DFU A;  3I60 A;  2WO6 A;  5FWK K;  3ZLW A;  4RBL A;  5E92 A;  3MVL A;  2XA4 A;  3AC1 A;  3VRZ A;  5E8V A;  5KNJ A;  2YM8 A;  2RSV A;  3D5V A;  4M12 A;  5FBN C;  5LVL A;  3BLQ A;  4IWP A;  2F2C B;  3QYW A;  4UWB A;  5IH5 A;  4FBX A;  5DPV A;  1TFF A;  4PTG A;  2C3L A;  2F9G A;  3DXP A;  4FG8 A;  3F2N A;  3AC4 A;  4XHK B;  5EW3 A;  4IB0 A;  3REP A;  4FK6 A;  2VAG A;  3QCS A;  4LMU A;  3AT4 A;  1H01 A;  2X1N A;  4BBF A;  4O0T A;  4YC3 A;  5TE0 A;  4EH4 A;  2HW7 A;  3F3W A;  3W16 A;  4BCH A;  5HTI A;  2GPH A;  4L44 A;  4L00 A;  2BVA A;  4YO6 A;  3EYG A;  2VTS A;  3NNU A;  2XK4 A;  4IIR A;  4O84 A;  4RVK A;  3POO A;  1UU8 A;  4K77 A;  2I40 A;  3F2A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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