1R1WA

Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-met
Total Genus 92

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
311
structure length
287
Chain Sequence
TVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-Met and its complex with the microbial alkaloid K-252a
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR
total genus 92
structure length 287
sequence length 311
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2003-09-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1r1wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1r1wA01
4FR4A 3C4WA 3TM0A 4LG4A 4U0IA 3VS3A 2C0TA 3B2WA 1R78A 3HRFA 2X2KA 3Q4TA 5AUTA 4AZFA 4D9TA 4NIFB 3SRVA 4BDGA 2OWBA 4O82A 3VS5A 4GVJA 4LL0A 3DAJA 4KKGA 2PU8A 3R63A 4CCUA 1FVRA 1PMVA 3PY1A 4B4LA 4AT5A 4LFIA 3ORNA 4M0YA 5HNIX 5HX8A 3Q04A 4RLKA 4HNFA 1AD5A 3FI4A 4BDCA 1IA9A 4AA0A 5KMOA 2X6EA 1OZ1A 3LM0A 4IMYA 4O91A 5AR3A 4AUAA 4F7NA 4TT7A 3ZRKA 1NT2A 4XG7A 2I0EA 3HVCA 2EWAA 3NW6A 3UYSA 4AN2A 3UNJA 2JKQA 2W99B 4GRBA 3ZBFA 3LFNA 3QBNA 1R0EA 4KS8A 4E6DA 5ITAA 5DPVA 4C4JA 1WAKA 3GCPA 4D2TA 3ACKA 4EI4A 2J0IA 3QC4A 2JKKA 4JQ8A 4D1XA 4U41A 2J0LA 2WMSA 3AC3A 5CAQA 5BMSA 3FY0A 1JPAA 1W82A 3MTFA 4PWNA 3R30A 1MUOA 4OUCA 2HELA 4I5HA 3V3VA 3ZRLA 4EQUA 4F4PA 3B8RA 3I0OA 2WTKB 1EH4A 5A4EA 3ZC5A 5BQ0A 3O96A 4FKRA 4GFOA 3U6HA 2WMUA 4IB0A 1H00A 4XYFA 5L6WL 2F7ZE 4ZY5A 3N4UA 4GIIA 2QHNA 4LGHA 3CD8A 1JVPP 2C5YA 5K0XA 3W10A 4G9RA 2Y6OA 4JBPA 4XG8A 4RA4A 1CM8A 2B4SB 1PJKA 3QTSA 4YJTA 1FMOE 2JIIA 2C30A 3F61A 3OTUA 3LLAA 2PL0A 3ET7A 3R73A 1F5QA 3DGKA 5DWRA 1QL6A 3QQFA 3E3PA 5J9ZA 4EK5A 2B9JA 2RL5A 4L44A 4USEA 3OXIA 1DAYA 1F0QA 4L45A 5DE2A 1U5QA 3VULA 3FLZA 4FSNA 3R7UA 2ZMCA 1A9UA 3ZFYA 4YZMA 5HNBA 3RK9A 4LOQA 1IG1A 5BMMA 2E9NA 5K4JA 3EHAA 4DG2E 2PWLA 4O0YA 4FKUA 3GC8A 1U46A 1FQ1B 3EFWA 3FI2A 3LMGA 3ZEPA 2BZJA 3A60A 4EEVA 2VZ6A 3VC4A 2IVVA 4FKPA 2OIQA 3PIZA 2X4FA 2ZV7A 3WF5A 2OZOA 4PUZA 2VTTA 4YTHA 3GI3A 3QD4A 3OW3A 3OWPA 4RX7A 3QCXA 4XP3A 3SG8A 1JKSA 2BHEA 3OW4A 2OJFE 4FZDB 3ZBXA 3EN5A 4O1OA 4E93A 4RJ5A 2DS1A 3UYTA 4AN9A 5IUHA 3D9VA 4IWPA 2P0CA 4K77A 5EFQA 2IG7A 3A7JA 4MHAA 2W5AA 2WD1A 2WGJA 2XKFA 2XK3A 3VN9A 5EKOA 3BQRA 4O27B 5F1ZA 3BYUA 3W55A 4F64A 2W7XA 2UW4A 4G3FA 4BI0A 4CV9A 1LP4A 2JIUA 4AW1A 3QC9A 3F6XA 2UZUE 4O0VA 5CXZA 3EQGA 1P4FA 3RWPA 4FSZA 3DAEA 1XKKA 3SXFA 1IR3A 1Q8ZA 3I6UA 5C4LA 3PJ2A 1BI7A 2QURA 2R3NA 3ALOA 5JEBA 2UW8A 3VBTA 3POOA 2PULA 3ATTA 2E9PA 3H30A 3PUPA 3HA8A 4AA4A 3PDTA 3DAKA 3ZC6A 3GFEA 1OB3A 3PWYA 3EIDA 3M11A 2QOIA 4FE2A 3KULB 1W0XC 4O0WA 3NS9A 1H4LA 3LM5A 4WSYA 2QR8A 3UC3A 4GMYA 4IXPA 5L6PA 3UC4A 2Z7LA 3TNIA 5EDPA 3OVVA 3R7EA 4YO4A 2YIYA 3LIJA 4O21A 2C4GA 1XBAA 3ANQA 2HCKA 3CCNA 5IA1A 5JRQA 2XNBA 3PXFA 3RMFA 2F4JA 1VYWA 4IZ7A 2A19B 3DBFA 3KFAA 4R1YA 5ANGA 4C57A 4C34A 1G8AA 4U3YA 4RIWB 4LUEA 5E7RA 4QYEA 2BALA 2YERA 4XRJA 5FQDC 4ARKA 1OL1A 3R2YA 3PPJA 2PVJA 2XVDA 2CPKE 5HVYA 1IAHA 5GZ9A 3DXPA 4V0GB 2QD9A 2WTKC 3HKOA 4E5BA 2PUPA 4AFEA 4H36A 3D7TB 5IQHA 4S31A 4BWPA 4B7TA 3JPVA 5CASA 1PYXA 3RPSA 3RPYA 4BL1A 3CGOA 4FKIA 4F1MA 1GIIA 2VX3A 3HDMA 4MQ2A 3F5XA 1GZOA 1CKIA 2ETKA 4XLVA 1JKTA 2Y9QA 4JVGA 4MD9E 2XJ1A 4IACA 2YM7A 3K54A 3N4TA 4AGCA 4AAAA 2WMXA 2XK6A 3C0GA 5ANOA 3DZOA 4XV1A 5AP1A 3MY5A 5KCVA 5IA3A 3AOXA 4XV9A 3UPXA 4YZ9A 2JBPA 3GU5A 3Q96A 3FUPA 1AQ1A 5CVHA 2AYPA 4ZZOA 5CANA 2A1AB 2H9VA 3UG2A 4FL1A 4USDA 4IM2A 3DKGA 3OY1A 4MWHA 2XNEA 3R2BA 1ZYSA 4QTCA 5HQ0A 3N51A 4ANLA 1U59A 1JQHA 4FKOA 5EI8A 3FLWA 2B53A 1CSNA 1T45A 4K1BA 5LMAA 4IDVA 4BC6A 5HVKA 2O65A 1H1QA 3BHHA 4RZVA 5C26A 1KOAA 2OLCA 1W83A 3DV3A 2ZDUA 1UV5A 4FZ7A 3ZMMA 3MIYA 3NGAA 3NAXA 2CNUA 5EM7A 4I21A 5JZJA 5M4UA 4MVFA 4R3RA 4L3JA 4IFGA 3EMGA 4QMSA 1J1CA 4XP2A 4MK0A 5KZ0A 2C3JA 3F7ZA 4ZK5A 3OD6X 4NT4A 4O7NA 3A7FA 3HL7A 4B8LA 3QFVA 4E73A 3KRLA 4G1WA 3ZDIA 3NVMB 5IQIA 2UVZA 4P90A 2FSOX 3QWKA 1O9UA 5AADA 2V55A 4FI1A 4PDOA 4U44A 4I22A 3UIXA 2WFYA 3MPTA 3ORIA 4PY1A 3E7OA 4D1SA 3MESA 1ZAOA 1OBGA 3V51A 3QQLA 2QO9A 5E92A 3QD2B 4R7HA 4DFZE 3ZCLA 2FVDA 3FKOA 2SRCA 3B8QA 4NEUA 1XH4A 4BCNA 2UW5A 2YHVA 2HWPA 2NRYA 1BI8A 4ITHA 3F3UA 5IEVA 4FKSA 4EZ7A 4L53A 2QODA 3H3CA 4TYHA 5DOSA 4FTTA 4QP4A 3T9IA 1YDSE 3ZHPC 4OTPA 3SW7A 5H3QA 5FUTA 2ZM1A 3QZHA 4UZDA 4ENYA 3RNYA 1PXLA 3QX2A 2X9EA 4QO9A 4XV3A 5AP0A 5JFWA 3C5UA 2P2HA 4ZS0A 3QZIA 2QO7A 4XBUA 1BYGA 2XH5A 2BRBA 3DOGA 3SQQA 4C3RA 4U7ZA 3QUEA 1QPDA 3UP2A 4II5A 2QCSA 2VV9A 2VWWA 3CQEA 4HGEA 3W2CA 5AEPA 4B9DA 3V01A 4G5PA 4F9WA 3IDCA 1FGIA 1SZMA 5L8JA 5JGDA 1F3MC 2EVAA 4X2FA 3MVJA 5IUGA 3GCUA 3DU8A 4O96A 5CTPA 4DEAA 4BDJA 4XS2A 4BFMA 3FE3A 2RFDA 2HZ0A 3L8PA 4FTQA 5KBQA 4QYYA 2B55A 5GZAA 2XJ2A 3TIYA 3DDPA 5KX8A 2I7QA 2P2IA 5GHVA 4G6OA 2BZHB 4DCEA 3GB2A 2HY0A 5ETCA 3DNDA 3EN4A 3QZFA 3PA5A 4DFYA 2GQSA 3ORXA 4YC8A 4IVCA 3FXZA 4F0GA 2OGVA 2WTCA 4AGWA 3U87A 2IZRA 1KE8A 4FG8A 1W84A 2BRNA 3II5A 4RBLA 5I9XA 4J53A 4AT3A 4O7LA 2ETMA 4PMSA 3BGPA 5CZHA 1PXPA 4V05A 2YM8A 1XBBA 2ZVAA 2O2UA 4EBWA 5KKRB 4BGHA 2WO6A 1VZOA 2CN8A 3NUSA 4ALVA 3COMA 2JC6A 3QLGA 4TN6A 4W8DA 5B0XA 2PUIA 2F7EE 5IA2A 5EW3A 4KABA 4E5AX 5A3XA 2PVNA 3BI6A 5AP4A 2BDWA 5KMMA 2ESMA 3HEGA 2QG7A 3NCGA 5AUWA 1G3NA 4DAWA 2VNWA 3VS6A 3FV8A 4LGDA 4OGRA 5AX9A 1PXNA 3FHIA 4UYAA 3MWUA 4UWCA 4FNZA 5HIEA 4RVKA 1MRVA 4PDPA 3LJ2A 3PSBA 3FEGA 2BROA 4E6CA 5D1JA 2CGXA 2PZRA 3F69A 4ACHA 3C13A 1XWSA 2LAVA 4QP9A 4YZDA 1M2QA 3MFTA 3DY7A 3GOPA 2HXQA 4IWQA 1Q3WA 2PZ5A 3OP5A 3IGGA 4J98A 5DLSA 4JDJA 4EZ5A 1NXKA 3SA0A 5J95A 4L9IA 4I5MA 3KQ7A 5DRDA 5E8ZA 1E1VA 2AC5A 3NNXA 2C5XA 4QOXA 4ZSLA 1W8CA 2R3KA 3NUNA 2J5FA 4NM3A 1V0BA 4DGOA 4UWBA 4ZTQA 4RFYA 3JVSA 2ZDTA 3PE1A 3DT1A 3W32A 4YPSA 5EHOA 2UZEA 4FTRA 3H9RA 5L4QA 4XNEA 3LOKA 2ZV2A 3QQUA 3C4EA 5AP5A 5HEZA 4RX9A 4YSJA 3UPZA 4R3PA 5GJDA 4KKEA 1OL7A 4RIYA 4WBBB 2W1FA 2IN6A 4K6ZA 4YBJA 4ZTMA 4YNEA 4D4RA 4FV7A 3G6GA 4FT0A 4JL9A 5G6VA 4CMUA 1Y6BA 4ZXTA 1PHKA 4EOLA 1A06A 5DT3A 1YWNA 3BZ3A 3OEZA 4GUBA 4J8MA 2C3LA 4EK4A 4EJNA 1PRYA 3UIMA 1B39A 5AUVA 3GT8A 3BELA 3IW5A 4EONA 3V5LA 3RVGA 1Y91A 5E8VA 4XLIA 1Q62A 2PZYA 1BL6A 4PTGA 2YAKA 4DE4A 3FPQA 2WMRA 4DA5A 1ZXEA 2C3KA 3VUGA 4HYUA 2HXLA 1TQMA 5A6OA 4MX9A 2YISA 4EHZA 1XH9A 2XKCA 2GHLA 4L43A 5M56A 3S00A 2Y6MA 3O2MA 2QU6A 3EJ1A 4FBXA 4FVPA 4LV5A 4FYNA 2PMIA 3KK9A 2I1MA 4YHJA 5M08A 2YCFA 3ETAA 2FA2A 2R3QA 4U43A 3WZUA 3Q4UA 5L8LA 2OH0E 4O0TA 4DEIA 3FC1X 5FG8A 3QF9A 3QYZA 4UMQA 1B6CB 3EOCA 4AACA 4M12A 4OTIA 4L46A 1WFCA 1Z57A 2R3GA 2XNPA 5EHLA 5J79A 4JG7A 5G1XA 3KRJA 1JKKA 4IIRA 4TWOA 3E62A 4NSTA 1HCLA 4CKIA 4WG4A 4RZWA 4EOOA 1M7QA 2WTDA 4NU1A 1Q5KA 4X2KA 5HESA 4KBKA 1FPUA 3ZXZA 5AP6A 1UU8A 3PXQA 4DH7A 4J1RA 3HP5A 1QPCA 2XEYA 2VWZA 3GQIA 2W06A 4RWKA 4FEWA 4JRVA 5BVOA 5KKRC 2CLQA 2QG5A 3VVHA 3FMJA 1J1BA 1VJYA 2JDRA 1WCCA 3QRIA 3SX9A 3BU6A 1YXSA 4BCFA 2WTVA 2X81A 3ULIA 4ACCA 5CEKA 4WKQA 4YJUA 2VNYA 3HYHA 3EQRA 4X0MA 3NCZA 5EK7A 4ORKA 1SMHA 3TV7A 4IX5A 1M52A 4C4FA 5JGAA 5ANDA 3DQWA 3COHA 3O17A 4E4LA 2R3JA 3CEKA 3FYJX 3IO7A 4J52A 4ZMFA 4A06A 3MY0A 4FIJA 3UVRA 4E8AA 2ERKA 1XBCA 3D2KA 3O71A 3ZLSA 4BBMA 4BTJA 4C62A 2BFXA 1ZYCA 3B2TA 3NX8A 3L8XA 4D4SA 3R1YA 5AIRA 4QP8A 5FXSA 2OH4A 4U45A 5DFPA 3MBLA 4NKAA 4R6VA 4AOTA 1DM2A 2UV2A 2GHGA 3FHRA 3MPAA 4FODA 3S2PA 4MNEA 2I0YA 4FOCA 3R22A 2A0CX 3ZRMA 4C61A 3UTOA 4AX8A 4E20A 2BVAA 5CNOA 3I60A 5BYZA 3NVKI 2JDVA 5EM5A 5AA9A 3QU0A 4O1PA 2R4BA 3EQDA 3K3IA 5FRIA 3Q9YA 4QTDA 4JBVA 3QWJA 4F7JA 4GK4A 4EH8A 2CKEA 3HECA 4XV2A 4FTNA 3GU4A 4O84A 3NUXA 4BY9E 3K5VA 4UWYA 4QP2A 3ANRA 3KXHA 3DK7A 2F2UA 3ORKA 3SG9A 5FEDA 4E4MA 5DG5A 3G90X 3IW7A 1ZYDA 5JQ5A 2YCQA 4YJPA 5JN2A 4EZ3A 3SV0A 3Q60A 2ZMDA 2ETRA 4M69B 3WARA 3WYYA 4GYIA 4B99A 3FLQA 4L00A 2PHKA 4NCTC 5DHJA 3TACA 4BCIA 5D9HA 3CR0A 4Y46A 1KE9A 5AV3A 3FMLA 3LXPA 3EYGA 5HIBA 1H07A 4EUTA 5M4CA 5CI6A 4HCUA 2R3FA 2GNLA 5DVRA 3LJ1A 5EQYA 2VX1A 4ZTRA 5A4CA 4KD1A 3CTJA 4FKJA 4YZNA 3EFKA 4FV2A 3KXMA 4X3JA 1GIJA 4R3CA 2QC6A 4G6LA 3R7VA 2XK9A 3M42A 3CXWA 4FZFB 3UVQA 2PVYA 4D4VA 4YUQA 5HO7A 3G2FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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