1REKA

Crystal structure of camp-dependent protein kinase complexed with balanol analog 8
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
338
structure length
336
Chain Sequence
ESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Balanol analogues probe specificity determinants and the conformational malleability of the cyclic 3',5'-adenosine monophosphate-dependent protein kinase catalytic subunit
pubmed rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit
total genus 97
structure length 336
sequence length 338
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2003-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1rekA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1rekA02
4LOOA 4QYEA 2ESMA 3EMGA 1KWPA 4JG6A 3TL8A 3P4KA 5HO6A 4PP7A 4JL9A 2XIYA 5B2KA 3RPRA 1PJKA 1ZMVA 4IVAA 3UJGA 3FSFA 3PIXA 2QC6A 2W9ZB 2OF4A 3U6HA 3D5UA 4IC8A 3KREA 1W0XC 5IZFA 3QALE 3GNIB 2XK6A 3SVVA 1MRUA 1B38A 5KX8A 3UBDA 3IO7A 5I9VA 4BY9E 2XA4A 4I93A 3MVMA 4O1OA 4X6QC 3PG3A 3FZPA 4AFEA 2Q83A 2XB7A 4OTDA 5DLSA 5IQCA 3OCTA 4X7QA 4F1TA 2QOIA 4FSRA 3HNGA 4AGUA 4DH3A 4NL0A 2OZOA 2UW6A 2JEDA 2QQ7A 3DGKA 4I5PA 3OHTA 4JRNA 3CR0A 4DH8A 3W2SA 5CAOA 4RG0A 2UW5A 1YDSE 4XMOA 4EH2A 3MFUA 3SG8A 4TXCA 2W0JA 4AOIA 3NSZA 4KSPA 2VN9A 4EOMA 1H24A 2UVZA 4C35A 2R7IA 5M06A 4KWPA 2BIKB 4HVHA 5KMMA 2XNMA 2R3QA 5F4NA 1A48A 2OFVA 3C5IA 4FZ7A 2DYLA 4G9CA 5AR7A 4I4EA 2PK9A 5JQ8A 4Y8DA 3JXWA 1M7NA 5L2QA 3WZDA 4OBOA 5IA3A 3FPQA 3NUUA 5E8YA 2OGVA 3DFAA 5LVLA 3QQLA 3ZRKA 1BL6A 5LCJA 3ZC6A 4FICA 5FTQA 2FA2A 2ITNA 2QOHA 3R8PA 1U54A 2ZB0A 4DAWA 4MBIA 4YURA 5M4FA 2KTYA 5I9ZA 3OWLA 2HW6A 3W10A 1O6LA 3DB6A 2BIYA 2VAGA 4DTAA 3KXXA 4FV5A 5HLWA 5IUIA 1ZAOA 1M52A 2WMTA 3PZEA 4NSTA 3CTQA 1R1WA 5LOHA 1XO2B 3Q52A 3GC7A 3E8CA 3UOHA 3QZGA 3PA3A 4Y83A 3VBXA 1H08A 2Y8OA 4YPSA 5B2LA 3R30A 4MBJA 3VBYA 4BDDA 4L68A 5CSPA 5AADA 5KZ0A 2GHLA 3QZHA 5KBRA 4FSNA 1BL7A 3UVRA 2Y6OA 4XV3A 5DA3A 5AP0A 2BRMA 1GZOA 1TQPA 3E64A 4JJRA 4XLVA 3QYZA 3QKMA 3BEGA 3PIYA 5IQDA 2VTQA 4N4SA 3ERKA 2A1AB 3QHRA 3DJ6A 1YVJA 3TEIA 4B7TA 3UO5A 3BV3A 3FKLA 2HYYA 4NKSA 2OXXA 5EDRA 4MBLA 3Q9YA 3CPBA 4JX3A 4MD8E 3PXKA 2XKEA 4F99A 3DXPA 3IKAA 3RPYA 2W1DA 5E9EA 4AW0A 5K4JA 2YIXA 3FZOA 2A2AA 3LFNA 1SVGA 4BDEA 4NZWB 1YHWA 2VWIA 3QCQA 2ZM3A 4UXQA 2YCFA 4OTHA 2UW8A 5TO8A 5KMJA 1OGUA 4UYNA 4F0IA 3SXSA 2UZBA 5EKOA 1O9UA 2B7AA 3Q9WA 4O21A 2HY0A 3EIDA 3M2WA 3AC8A 2ERZE 4EYMA 5C8NA 2HZ4A 3TKHA 3HZTA 4RJ5A 2UZWE 5C01A 1WBOA 4FT3A 5DE2A 4YMJA 2FVDA 3LMHA 3AGMA 3FUPA 4DEEA 3R02A 3QL8A 4OR5A 5JH6A 4ANSA 4V0GB 3E5AA 3GU4A 4IAFA 4MQ2A 3JY0A 2XMYA 2QCSA 4B9DA 3FDNA 4YPDA 4M66A 4MD9E 4MH7A 5CAQA 4DFNA 3GC8A 4BCNA 5ITAA 3ZONA 1Z5MA 5A9UA 1WZYA 2PE0A 4YZCA 4D5HA 4OBQA 4CQGA 3TUCA 3ZFYA 3O8PA 3V5TA 4AF3A 4UMRA 4QP2A 2JC6A 4D0WA 2BRGA 2DUVA 2GNHA 2CLXA 3C0IA 4ALWA 2JAMA 4C4HA 5LVMA 3QRUA 4GK3A 2RFNA 4ASDA 4QQTA 1OIYA 3AD6A 3RM7A 2C0TA 1GOLA 2JLDA 2OXDA 4E20A 4KIQA 3FMHA 4ITIA 4WRGA 4K33A 4A9UA 3UG1A 1SVHA 4FG9A 5HHWA 4QYFA 2BDFA 3ETAA 1UVRA 1E1XA 2XNNA 4D0XA 3GT8A 5L3AA 3AQVA 2BMCA 3SXRA 3VS1A 2BAKA 1J1CA 1HCKA 2QO2A 3C9WA 3OCGA 1XWSA 4F64A 4JDJA 4PNIA 4BGQA 5EOBA 3QX4A 5HLPA 5HVJA 3P08A 3PG1A 4FIGA 5CF8A 4C34A 2QURA 2ZYBA 4IX5A 2IZTA 5AV0A 4QYHA 4ZOGA 3FWQA 3D9VA 4FG7A 3GOKA 5ACBC 5CXZA 2BRBA 2CNUA 2DWBA 2F2UA 2WMSA 3QD2B 3OF0A 5A6NA 4RVKA 3V5WA 4O7YA 3PXZA 3CS9A 4A9RA 4ENXA 4R8QA 3GU8A 1PMVA 4TWOA 2RFSA 3NGAA 4PTEA 1WVWA 4Y73A 3ZMMA 1Q8TA 3PPZA 2VWWA 4JQ8A 4QMYA 3RNYA 1PXIA 4FIJA 5EQEA 4HJOA 5JGDA 4KBAA 3QCSA 4KRCA 2YFXA 2QKWB 4E5AX 2X8EA 3VBQA 1Y8GA 3DTWA 3HAMA 3OXZA 2WTIA 4RX7A 4HGTA 3QLFA 3VW8A 4BZOA 1ERKA 4FKIA 2OFUA 2EXEA 3EYHA 3Q4UA 3ZXTA 4O1PA 2YDIA 3F66A 3CXWA 3ZSGA 2VX1A 1EH4A 3A4OX 1Q8UA 3CE3A 4KKGA 4WG5A 2CKPA 3F5UA 1YI3A 4OTGA 2VTIA 5HBEA 3VUGA 3LVPA 3P5KA 3PXQA 4Q5HA 1J7UA 2C6TA 1GY3A 2G01A 4UMUA 4Y46A 4E3CA 4UY9A 3D4QA 2VTAA 4LRJA 3WE4A 3QAME 4FEVA 3P0MA 4F9CA 1MQ4A 4O7SA 4IIRA 1RW8A 4M13A 5JSMA 3HKOA 4DEAA 5J9LA 5D12A 2PVHA 3CD3A 5FLFA 2OWBA 3Q60A 3KN6A 1WFCA 2XM8A 3MVHA 4JG7A 1WBVA 2WZJA 3K3IA 3G9LX 1URCA 2ZV7A 3H0YA 4CMUA 4I6FA 2WMWA 3FPMA 4FZ6A 4NFMA 5BYZA 3HEGA 3VUIA 4W8EA 2B9IA 3A4PA 4IB3A 3WBLA 4YZNA 2QI8A 4O6LA 3NNXA 5A4TA 4APCA 3WF7A 2CNVA 3HYHA 3K3JA 2XNEA 3TNWA 1OL6A 2WMUA 3KU2A 3IDCA 1NA7A 3UP7A 4ANOA 2UZDA 3ORXA 3I6UA 4J1RA 3BEAA 3VS3A 3ZO4A 5CSWA 4CFXA 1YXUA 1XH8A 4FSYA 3WYXA 3MI9A 3V3VA 2YEXA 3ZEWA 3QU0A 2X2KA 3ANRA 4GUBA 4M69B 4WNPA 5IA1A 4MX9A 3TTJA 3CSVA 3HLLA 2UZLA 3DDQA 4DTBA 1H1RA 1PYEA 4GIIA 1M17A 4GV1A 5FWKK 1W82A 4G3GA 3N4TA 4NT4A 4GFOA 1BX6A 3D5VA 1YOLA 3E8EA 4DH1A 2G2IA 2VWVA 4PF4A 3SGCA 3DS6A 5DN3A 4J95A 3SXFA 3S2PA 4ZMEA 3BIZA 3DJ7A 4M67A 2PVNA 1SNXA 3BGQA 2ZOQA 3M11A 3W2CA 2X2MA 5DMZA 3CBLA 4BKJA 3QTZA 5M51A 2QHMA 5LJJA 2PHKA 4N6YA 4PP9A 2IG7A 5EM6A 5BVKA 4XP2A 5HBHA 5ANIA 2XCKA 4RLLA 5CEQA 2RSVA 3O8UA 3KQ7A 5GJFA 4FIFA 3U4WA 4CXAA 3FL5A 4AW5A 3V6SA 4E4XA 4X2JA 4ENYA 4AT5A 3JS2A 2FH9A 1G5SA 3AGLA 2XKDA 4APPA 5M4CA 4BKYA 3D94A 5AV1A 4JIKA 4AS0A 5CU4A 4CD0A 2C3JA 3I60A 4GVAA 3L9MA 4XJ0A 2IZSA 5HCZA 5IEYA 4R78A 4FSZA 5DRDA 5K9IA 1UWJA 4O83A 3LCKA 3OZ6A 3QUEA 3C0GA 4FSQA 1Q24A 2QNJA 1MRYA 4NUSA 3ZC5A 5M07A 4BKZA 4GS6A 4JG8A 3FZRA 4QP4A 3FSKA 3IW7A 4LV5A 4WT6A 4ACDA 4ANLA 2GS6A 3UQCA 2RG5A 5CI6A 4AN9A 4DHFA 3B8QA 4UYAA 4GT4A 4CZTA 4O84A 3RK5A 3SQQA 3D7TB 5BVEA 2LAVA 4AG8A 2ITWA 3R2BA 2PMNX 5EI2A 4BHNA 4FSUA 3FLQA 5CU2A 4L3JA 2OICA 2XK9A 4DFUA 3LCOA 4YLJA 2PUNA 4CYIA 4IX6A 2X4ZA 3DNEA 4GK2A 3SW7A 3ALNA 3R21A 2AC3A 4JDKA 4M68A 2C6DA 4RA4A 2J0IA 3SDJA 4AUAA 4AZVA 5IUHA 3MA3A 4GKIA 5C4KA 1NVRA 5GIPE 4IH8A 5KZIA 3UVPA 4QMSA 4XP0A 4KKHA 1T45A 3F61A 3IONA 3IW6A 3MY1A 5EM7A 5IQBA 5IA4A 4I5CA 4GYGA 2BROA 4G3FA 2WOTA 3MIYA 4RT7A 4E8AA 3VQHA 5I4NA 1OZ1A 1J7LA 4EHEA 2RFDA 4I21A 4K11A 4BCMA 4UN0C 4BWXA 1YXVA 2VTJA 3C0HA 2WFYA 3ENMA 4FGBA 3GI3A 1IEPA 2UV2A 4ZSLA 2X39A 4NIFB 4XYFA 4I5HA 5J7HA 3VC4A 3R0TA 2XZSA 5DH3A 3IGGA 2OW3A 2WTJA 1CKIA 2QODA 3CPCA 4XG9A 4ZEGA 1VEBA 2OU7A 4ANQA 3I0OA 4S31A 2C69A 5ANOA 1J91A 1Q61A 4J7BA 3OW3A 3DK3A 3H9OA 4IJPA 5DR6A 4NJDA 2YZAA 1ZZ2A 2Z60A 2E9UA 4IZYA 3HDMA 4YUQA 2EUFB 4LGHA 4DCAA 1W8CA 3MVLA 5CQUA 2BZHB 4EOQA 3BWJA 3UO6A 4MHAA 2AC5A 4XBUA 1KE9A 5EK7A 4CVAA 1SMHA 3QKKA 2P2HA 4YC6A 3EOCA 3TUBA 5ANDA 4RMZA 3BU3A 3IK3A 5GJGA 2VTPA 5CZHA 1OKZA 4V01A 3DBDA 5DT4A 4EEVA 2HXQA 4G2FA 3R7OA 1FBNA 2A4LA 3A7FA 4FNZA 1WAKA 2I1MA 4PTCA 3FE3A 4M84A 4WUNA 4YJSA 2F9GA 1UKHA 5F1ZA 2Y4IC 4YC8A 5CTPA 2OH4A 3WYYA 3DOGA 4P5ZA 3FQSA 4ASEA 3UIMA 2PVJA 3W16A 2OLCA 4J97A 4YZDA 4CFWA 3LW0A 2XK7A 2FSLX 4ZSAA 4OTWA 4O0RA 2J5FA 3GCQA 3H10A 4FOCA 3VUHA 1VR2A 4U5JA 2YLFA 3ATSA 4QTBA 2PWLA 5HBJA 3ODYX 2PUIA 2FYSA 3CY2A 5BVOA 3MJ2A 3DK7A 3IG7A 3IW5A 1P4FA 4ITHA 4BL1A 3ZUVA 2JFMA 4U80A 4DH7A 2FB8A 2WQNA 5CI7A 4KS7A 1ZRZA 4ZZOA 3UVQA 3HGKA 2PUPA 5IMEA 2QLUA 2BILB 4CEGA 3K5UA 4DBXA 4HYIA 2X6EA 2J7TA 2YIRA 3ZUUA 5C8KA 2YZLA 2J90A 3KEXA 4M8TA 3NVMB 3KVXA 3R7VA 4ZAUA 3IW4A 2VTSA 1FINA 3Q4TA 3E3BX 4FBXA 2W1ZA 5B2MA 2HWPA 4OT6A 5ANJA 4JR3A 3TJDA 1DI9A 3U55A 2XEZA 3C4CA 2XYNA 4BDKA 3E92A 1GIHA 3OBGA 4FSTA 4O7RA 4LM5A 5GZ9A 4CFFA 2C1BA 3Q3BA 3DK6A 2VTHA 3I0QA 4JNWA 4O0YA 2G9XA 5CEOA 3ET7A 5I0BA 3LE6A 4OTRA 3KF4A 3PPJA 3A7HA 2HIWA 4MQ1A 4ZTSA 4P4CA 3POOA 3UODA 1U59A 3DKCA 5HIBA 3MV5A 4IAIA 4XX9A 3OEZA 4EHGA 3QTWA 2R3FA 2ETMA 2WMVA 2ZJWA 2ZV8A 3CGFA 4MXYA 1S9IA 4H05A 1H01A 5DYJA 3I81A 4HCTA 1H0WA 5BUIA 4RZVA 3POZA 4AP7A 4TKSA 4YP8A 3PP1A 2JDSA 5HIEA 4G34A 2Q0BA 4FTRA 3TV6A 3FMDA 5BQ0A 4P5QA 3NUSA 2O8YA 3NPCA 1WCCA 4AA4A 3RCDA 4BFMA 4H58A 3BGZA 2W4KA 3W32A 3UQFA 2X81A 2X9EA 3NUAA 1XBCA 2OSCA 5ETCA 4IAZA 2FUMA 4IJ9A 5HKMA 4HCVA 3UO4A 3KMUA 3TZ9A 4R77A 4DFZE 2BFYA 3OXTA 2Y9QA 4FV2A 4PL3A 2QOBA 4LGGA 2ZB1A 4FZAB 2PUUA 5C4LA 4GRBA 3GCUA 3V8SA 5E92A 4ZTNA 2YM7A 1ZZLA 3AXWA 2BZJA 3DAEA 2XK3A 3FAAA 3HVCA 3ZFXA 3NIEA 5AP5A 4J71A 4LGDA 5FP5A 4AZSA 4MNEB 4UBAA 4EWHA 2W96B 3GXLA 4H3BA 4IHPA 3TZ7A 4YO6A 3S1HA 3QZIA 2HOGA 3NW6A 4HYSA 4BRXA 5BYYA 4S2ZA 2V5QA 1FGIA 3PXRA 4PMMA 5M09A 5FP6A 3D2KA 3QGYA 4ORKA 3KMMA 4IVCA 5HG5A 4EK5A 3FKNA 5KKRB 1TQIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3QQF A;  3EWH A;  3COK A;  2Z7L A;  3B2W A;  4GJ3 A;  3SAY A;  4FEX A;  2WU6 A;  4NJ3 A;  4FKL A;  4YR8 A;  3HV7 A;  4ALV A;  2J4Z A;  3QHW A;  4D1X A;  4CZY B;  1OPL A;  4W8D A;  4YSJ A;  4GKH A;  2QG7 A;  2VTR A;  2V7O A;  3LQ3 A;  1F5Q A;  2BHE A;  5IMX A;  2PVK A;  3R8M A;  3PVW A;  2JKO A;  4LOQ A;  4CFM A;  4MTA A;  1IRK A;  4JRV A;  4BDH A;  3PLA E;  3HA6 A;  5KKR C;  4BI0 A;  5A46 A;  2RG6 A;  3RCJ A;  4A4L A;  4C3F A;  2GTN A;  3BYU A;  3FEG A;  3GVU A;  1XH5 A;  2I0Y A;  2JKM A;  1XH7 A;  4IAY A;  3DJ5 A;  4OTF A;  4RIW B;  3WIL A;  5M4I A;  4ZSG A;  4TYJ A;  2E9N A;  3UP2 A;  4JQE A;  2AYP A;  2NO3 A;  2VTT A;  1OMW A;  1FVR A;  5EYK A;  3VW6 A;  4F6S A;  3FLN C;  3V8T A;  4BF2 A;  4BCP A;  3ANQ A;  4HCU A;  4AW2 A;  3JUH A;  5GZ8 A;  4PPB A;  3MB6 A;  4C33 A;  3P7C A;  4FUX A;  3PWY A;  3OT8 A;  4FKG A;  4JX7 A;  3PTG A;  4NW6 A;  4ASX A;  4EOK A;  2WPA A;  3LJ1 A;  2BZK B;  4HNI A;  4QTD A;  3F5G A;  5ETF A;  4FV1 A;  2BAJ A;  3ZU7 A;  2PZR A;  2JII A;  4PPA A;  2OIB A;  3QTS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LOO A;  4QYE A;  2ESM A;  3EMG A;  1KWP A;  4JG6 A;  3TL8 A;  3P4K A;  5HO6 A;  4PP7 A;  4JL9 A;  2XIY A;  5B2K A;  3RPR A;  1PJK A;  1ZMV A;  4IVA A;  3UJG A;  3FSF A;  1G8J A;  3PIX A;  2QC6 A;  2W9Z B;  2OF4 A;  3U6H A;  3D5U A;  4IC8 A;  3KRE A;  1W0X C;  5IZF A;  3QAL E;  3GNI B;  2XK6 A;  3SVV A;  1MRU A;  1B38 A;  5KX8 A;  3UBD A;  3IO7 A;  5I9V A;  4BY9 E;  2XA4 A;  4I93 A;  3MVM A;  4O1O A;  4X6Q C;  3PG3 A;  3FZP A;  4AFE A;  2Q83 A;  2XB7 A;  4OTD A;  5DLS A;  5IQC A;  3OCT A;  4X7Q A;  4F1T A;  2QOI A;  4FSR A;  3HNG A;  4AGU A;  4DH3 A;  4NL0 A;  2OZO A;  2XAM A;  2UW6 A;  2JED A;  2QQ7 A;  3DGK A;  4I5P A;  3OHT A;  4JRN A;  3CR0 A;  4DH8 A;  3W2S A;  5CAO A;  4RG0 A;  2UW5 A;  1YDS E;  4XMO A;  4EH2 A;  3MFU A;  3SG8 A;  4TXC A;  2W0J A;  4AOI A;  3NSZ A;  4KSP A;  2VN9 A;  4EOM A;  1H24 A;  2UVZ A;  4C35 A;  2R7I A;  5M06 A;  4KWP A;  2BIK B;  4HVH A;  5KMM A;  2XNM A;  2R3Q A;  5F4N A;  1A48 A;  2OFV A;  3C5I A;  4FZ7 A;  2DYL A;  4G9C A;  5AR7 A;  4I4E A;  4F78 A;  2PK9 A; 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