1STCE

Camp-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit in complex with staurosporine
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
336
structure length
334
Chain Sequence
VKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Staurosporine-induced conformational changes of cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit explain inhibitory potential.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE
molecule tags Complex (transferase/inhibitor)
source organism Bos taurus
total genus 95
structure length 334
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 1997-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1stcE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1stcE02
4XYFA 4CXAA 4A4OA 4AACA 4KBAA 3QTRA 4QPMA 4AZSA 5BMSA 4DH5A 1SVEA 2PMLX 2PZPA 3ZYAA 3CJGA 3ZTXA 4O0XA 2QKRA 4EYJA 5HO7A 2PVKA 3D0EA 4EOSA 4TRLA 4BTKA 4P4CA 2QLUA 2VTPA 4UZHA 5CT7A 2W5BA 3LFFA 3RINA 3BQRA 1JPAA 3KY2A 2XK9A 3R9NA 5C1QB 1YI3A 4G3GA 3F88A 3FLWA 4I5MA 4EL9A 1OBGA 4FTTA 2R3PA 3EKNA 3TL8A 1HCKA 5CT0A 3EFWA 3OOMA 5LXMA 2B7AA 2GMXA 2Z7SA 3FQEA 4H3QA 4XS2A 5KMOA 4YLLA 1JKLA 5LVOA 5LCKA 2B4SB 3W2QA 3MESA 4QMQA 2OXYA 4NW6A 5HIEA 2WQEA 4PMSA 1M2PA 2CKEA 4DAWA 3BX5A 5A4EA 4CZTA 1MRYA 4WNKA 5AUTA 3PXZA 5I9WA 2VTHA 1ZYLA 4NM3A 1EH4A 4MX9A 1BI8A 2QOCA 3KRWA 4RVTA 3O8PA 1S9IA 4GYGA 1BI7A 1JQHA 4O7TA 4ENYA 5CU3A 5L8LA 3ELJA 3O2MA 4O7WA 2WMBA 3FI4A 4ASZA 1ZY4A 4NUSA 3WOWA 1APME 1O6YA 2ZV2A 3OF0A 2JLDA 1XH6A 2J2IB 2UVYA 4XG9A 2C5YA 3SKCA 1H0VA 2BZKB 2WMRA 4FIIA 1OKYA 4ARKA 1H1SA 5D9HA 1I44A 4WA9A 3SRVA 2C68A 3UNJA 4EUUA 3MVLA 4TWNA 3RVGA 1YWRA 3OROA 4K8AA 2OKRA 3GC0A 3MI9A 4YZCA 3CSVA 4TTHB 5KMLA 1W84A 2GHLA 3DFCB 4UEUA 4YTHA 5K5XA 3BELA 4GCJA 4EHZA 3Q2JA 5AFVA 3JPVA 4ZY5A 1OZ1A 4ZLOA 3MH0A 1YKRA 5FRIA 3EYHA 2W1IA 5J95A 4NZWB 4ONAA 4O83A 3Q4CA 1ZY5A 1KOAA 1W83A 5LJJA 4QYEA 3ORLA 4XMOA 3V5LA 3RP9A 4RIWA 2F9GA 4GVJA 3R04A 4QMTA 5HE3A 3PVUA 5AV3A 3I4BA 3COKA 5LMKA 2ZMCA 4HGTA 1OIRA 3LLTA 4H3PA 3E3BX 4ZSEA 5HESA 3FBVA 4AT5A 3LCTA 2XF0A 5CAUA 2YA9A 4EOIA 3KU2A 5ETCA 5AAFA 2R64A 2VO3A 4O0TA 3LQ8A 3ACKA 3CR0A 3RNIA 3D7TA 3LJ2A 5D7VA 4FYNA 3DPKA 2QOHA 3O7LD 2CGVA 5HBJA 1U5RA 2YDIA 1BMKA 2DYLA 3MPMA 4RJ3A 4UV0A 5HD4A 2HK5A 3ENMA 4ANMA 3LHJA 4FKTA 5FLFA 2HZ0A 2W1GA 4I6FA 3QWKA 3TZ7A 4TXCA 4CTCA 4GG5A 1OMWA 4I93A 5KZIA 2BRHA 3NCGA 2WMAA 5BNJA 2PVFA 3Q6UA 4N70A 2X6EA 1OIUA 2EB3A 3E3PA 4I4EA 4ZSLA 4YJPA 3VRYA 4HYHA 2YM4A 4UMPA 4AT3A 2PZ5A 1KE8A 3PE1A 3QA8A 1KOBA 4QMLA 5HCXA 5J1WA 3ZDIA 4HVGA 1O9UA 2REIA 4G9RA 3BBWA 3VIDA 3BV3A 3I7CA 4FA2A 3OHTA 3VUGA 4BI1A 3SHEA 3W1FA 5LCJA 2NO3A 2WQNA 2RFNA 1PXIA 4II5A 2RIOA 4LQMA 4BCHA 4L7SA 4MD8E 4EWHA 1VEBA 4D5KA 4M97A 4NT4A 4MQ2A 5FP6A 2IVTA 3A8WA 4GFOA 5AADA 5IISA 2X9FA 2Z2WA 3TM0A 5IA2A 4TYEA 3ERKA 4RIYB 2B55A 3JR1A 3Q6WA 3CKXA 3P9JA 5I9YA 4NU1A 4K0YA 4WG4A 4C59A 3U51A 5M51A 3BPRA 4OLIA 4BHNA 3QL8A 3BEAA 3I0OA 1UNGA 5KKRB 3CCNA 1OITA 2C6IA 3F2AA 1ZOEA 5IQEA 4APPA 3PYYA 3TDWA 4FTNA 3DZQA 4FK3A 3FUPA 4U9AA 3LLAA 2XNMA 2CN8A 2QURA 3FHRA 1AQ1A 3HMMA 3BE9A 1WVWA 2XEZA 2V0DA 4YJQA 4BCKA 4JDIA 5M4FA 2OFVA 4E5AX 3C1XA 3V51A 3ZFMA 5FTQA 4FGBA 2R3NA 4EOKA 1SM2A 3E7OA 5H8BA 1YDSE 4NK9A 4PX6A 3R7IA 3ORNA 2OZAB 3V6RA 4DGGA 4MD7E 4AF3A 2HXQA 3PY0A 3ROCA 4FKUA 2OJJA 1Q62A 4O6LA 4Q9SA 4AZEA 4E1ZA 3QQLA 4GKHA 4BB4A 3RHXA 3GQIA 2VD5A 4C61A 4XG6A 1M2RA 2HY0A 2VRXA 4R5YA 5CVHA 4ZY6A 2GNHA 4I6HA 5CSXA 1URCA 3MVJA 5KNJA 2UZTA 2BFXA 1M2QA 2ITUA 2WMUA 4J8MA 3HKOA 3UZRA 5ETAA 4J71A 4PDPA 3QKLA 4DFUA 1ZMUA 3Q9WA 2NP8A 2Y4IC 5IA5A 2WNTA 3PPZA 1W0XC 4GK2A 4LMUA 1BUHA 4FTCA 4LRKA 4HPUE 4U0IA 4K2RA 1NVQA 2HW6A 5TOZA 4CV9A 5M08A 2Z7RA 1J7UA 5DRBA 3ZSGA 4LGDA 4TWOA 2XM8A 3FXZA 4F6WA 4O0SA 4FNXA 2X39A 5E8SA 4ZTNA 5AX9A 1Q97A 2UW7A 4L42A 3L8PA 3G33A 5FXQA 2BALA 3G51A 4PL4A 3CKWA 2W05A 3MWUA 5CEMA 1XR1A 1FINA 3A4PA 3UIXA 2FGIA 4CFUA 3TN8A 3O50A 1OL5A 3VBXA 4PPCA 3CD3A 4ZS0A 4JG7A 3DTWA 1SMHA 3WILA 3ZLSA 3NSZA 2XNBA 3U4UA 4TL0A 4TW9A 4G1WA 2VZ6A 4CGAA 3A2CA 5FEEA 4HGLA 1IAHA 4ZAUA 5DGZA 3SG8A 3FY2A 5JFVA 2YACA 2ZV7A 3ET7A 4JDHA 1R39A 3RAWA 3FPQA 2F57A 1Q3WA 3B8QA 2ZM3A 1V1KA 3FXXA 3CTHA 3UPXA 4RVLA 4HYIA 4ORKA 4S2ZA 3Q4TA 1GIHA 4EJ7A 4KSPA 4IAFA 2I0VA 2A19B 2J0KA 4KIKA 4E6DA 2R3IA 4O7ZA 1YHSA 4EJNA 1IG1A 1JKKA 2BIYA 3ENHA 5M56A 2QR7A 4H1MA 4DTBA 1QL6A 4AAAA 4FZAB 4D5HA 3OCTA 4IX6A 4FOBA 1BLXA 1UKHA 4O38A 4I20A 2GDOA 4EOLA 2IG7A 4AFEA 3ORMA 3EFJA 2CGWA 4GT3A 4IC7A 5DLSA 3FI3A 5EHLA 5IH5A 4LRJA 2KTYA 4GIIA 5AP3A 2HZNA 3W2OA 4XRJA 3HUCA 5C8KA 4KWPA 2W99B 3K5UA 3W8LA 3FMEA 4I6BA 2OW3A 4YPSA 1LP4A 2EUFB 5GHVA 1JVPP 4QYFA 4OUCA 3TUCA 1YOLA 4HCTA 4EC8A 3NUXA 3UMWA 2QO2A 2XBJA 3KXGA 2ZMDA 3N51A 1X8BA 4MTAA 4F6SA 1JSUA 3NNVA 4HVSA 3DNDA 4FV0A 5E8XA 4BIEA 5CI7A 3MJ1A 4C3PA 2F2CB 3VS0A 1B38A 3UMXA 3UOJA 4BWKA 4G3CA 3P1AA 4DBXA 1Y8GA 3N4TA 4NIFA 4KIQA 2UZVA 4WO5A 2ZAZA 4DEGA 3BLQA 4YHFA 5GJGA 2VX3A 3QYWA 5K4IA 3D5XA 2C5NA 4G3DA 4NW5A 3IK3A 3O23A 4XV2A 3QXOA 4GVAA 3VUHA 2QU6A 5BVFA 1WBVA 2VTJA 2X8EA 2LAVA 3VWAA 2XVDA 4RZWA 5EW3A 2WFYA 4MBJA 5AIRA 3FDNA 1K2PA 2BFYA 1E1XA 3C4WA 4U44A 4YZMA 5TR6A 3PSCA 5EM5A 4CQGA 4E4LA 3DAKA 3QC9A 4AN3A 3VF9A 5EYKA 1QMZA 4BYJA 3VBVA 3R01A 3E92A 3RWQA 3UIMA 4DN5A 3GCQA 1KUTA 4BDAA 3LOKA 4YURA 5KMNA 4RVKA 3FZRA 4C4JA 3ATTA 3HRBA 3LAUA 5I3RA 3F61A 4O0RA 3W16A 3KFAA 4YLKA 3TDVA 5CU6A 3QALE 3QUEA 1YWNA 4JBPA 4X2NA 3AC3A 4KKEA 5EKOA 3R30A 3SDJA 4IIRA 4APCA 3OTVA 1WFCA 5ANJA 2VNWA 2XJ0A 3CC6A 3HV3A 4YUQA 4BR3A 4USDA 4USFA 2X2MA 5H8EA 4OR5A 4FVPA 4RT7A 3CGFA 3KF4A 5HTIA 1Q8WA 3K3JA 2C5VA 3E63A 2ETRA 4WHZA 5CWZA 1W98A 1SVGA 2VO6A 5DVRA 4DE4A 1Y91A 4A7CA 3NRMA 3QTUA 4RWJA 4XNEA 4XJ0A 5A6OA 3R9HA 3MBLA 3HV5A 3PLAE 1PXOA 1M7QA 5BVOA 5IUGA 2B52A 5HG7A 4C7TA 3V5WA 3GU7A 4D58A 1Y8YA 4U81A 3QKMA 3NUAA 4L67A 2EB2A 2XJ2A 4QMZA 3HGKA 3BYUA 4YGAA 4ZTSA 3U6IA 3OWJA 3HX4A 4QMUA 3I5ZA 2Q83A 4MK0A 3SXSA 4Q9ZA 4RIXA 2PVLA 3G90X 3ZO2A 4QTCA 2LGCA 3UOKA 2E9UA 2CNUA 5IQIA 4EOQA 3FJQE 4E4MA 3R9RA 4NCTA 4O2ZA 3Q5ZA 4L8MA 4XRLA 3BYSA 3DLZA 1FGKA 3I5NA 5H8GA 3A7FA 5BVEA 3RK7A 4RLLA 2G2IA 4YJOA 4BGGA 4FK6A 4RFMA 4E8AA 2QQ7A 4OTDA 2VTLA 4JAIA 3UNZA 3EN4A 4QYYA 3UIUA 2CSNA 3GU8A 2RGPA 3DB6A 3V04A 2I40A 2I0YA 2Y4PA 4JNWA 1H1PA 2PZRA 4L3LA 1NVRA 3S2PA 3ZM4A 2XMYA 3NZ0A 2J5FA 2PY3A 2OG8A 2OJFE 4IANA 4Z16A 3C50A 4M0YA 4PP9A 2YN8A 5AM6A 3IPHA 3FE3A 3TZMA 1Q8YA 3UP2A 3ZBFA 3FEGA 2JFMA 5K0KA 5M55A 3DDQA 2EXCX 3O96A 5AR3A 5IU2A 4AN2A 5KHXA 4OAVB 1P4OA 3KB7A 4V05A 4OBOA 2ETKA 4IX5A 1H24A 1WZYA 3QKKA 3AT2A 3PPKA 4JX7A 4HCUA 3OMVA 1A9UA 4EK6A 2Z8CA 3H0ZA 4I0SA 4UYAA 2FVDA 4V01A 4DTAA 4CLIA 4L3PA 3PA4A 3E7VA 3ZC6A 3NLBA 4C8BA 3SQQA 4QP8A 4OTIA 3QLFA 4N6YA 4TN6A 2HXLA 4IWPA 3TV7A 4AW2A 5FUTA 5FM3A 4XCUA 3TKUA 4UX9A 4O7NA 4RC2A 3V5PA 2PVMA 5IEVA 2OSCA 3LFCA 4Q2AA 4ZTMA 2HZ4A 2XNGA 5IA1A 2DQ7X 3TI1A 1KV1A 2QO9A 4TYHB 4XX9A 4AA5A 4BDBA 4EZ7A 4FE2A 2R3KA 4U6RA 1K3AA 2OFUA 3ORXA 3MTFA 4L45A 4QQ5A 5IEYA 2GQRA 2P4IA 4JRVA 3ANQA 3F3UA 1XH7A 3LFQA 3BHYA 3C51A 3C4ZA 3UG1A 5FXRA 1OUYA 1R0EA 2DS1A 4C0TA 4CMTA 4HCVA 1UNHA 2BRMA 1CKJA 3QU0A 3UE4A 4EKKA 2X8IA 4Z55A 2ZM4A 2J50A 2FH9A 3OY1A 3S95A 4AQCA 4CCBA 1DAYA 4FTIA 3II5A 3CQEA 5FXSA 4EK8A 1Z57A 3TG1A 2YCQA 3KF7A 4FMQA 3PIYA 3PJ1A 4RX7A 2XS0A 5KHWA 1YHWA 3QBNA 4RA5A 4CG8A 1KV2A 4BDJA 4ALWA 1RW8A 5JZJA 3ULIA 5DT3A 4RWKA 4AE6A 2GS2A 2ITTA 3BEGA 1H1QA 3E5AA 3QA0A 1OKVA 2QO7A 3CLYA 2H34A 1XQZA 3HYHA 5HIDA 4QMYA 3ZBXA 4C4IA 2WGJA 4ZIMA 1R0PA 2RG5A 4NWMA 2C6DA 4U97A 3SW7A 4EH3A 4RSSA 2B9JA 2BZJA 5BMMA 2H9VA 5HG8A 4BWXA 3PVBA 5KMMA 3BHVA 1GIJA 2GNIA 4K9YA 4J1RA 3F2NA 3QQGA 3PG3A 3VUTA 3ZLYA 4DGLC 2ITQA 4FG8A 1CDKA 5A9UA 2UZUE 4WIHA 4FZDB 3ITZA 3Q9ZA 3W2PA 4IAYA 3OWKA 3ZO3A 5HGIA 2PK9A 4S31A 2CDZA 5HCYA 3VAPA 1JLUE 1PMNA 2OF2A 1U54B 1JAMA 4N57A 4X7QA 4CV8A 3G6HA 4C58A 1OPLA 4IFGA 1HOWA 4YO4A 3PZEA 2BKZA 4M0ZA 4FICA 3DQWA 4U41A 5DRDA 4A9UA 3VS1A 3QTZA 4HNIA 4DFNA 4FL1A 3VN9A 3FZSA 3OUNB 1H25A 1PY5A 4CRLA 3HAVA 3PJ3A 1JBPE 2WHBA 3HV7A 2BMCA 2IVVA 3TEIA 2X81A 2UVZA 3W2SA 4EOMA 5JT2A 4JDKA 3V8TA 3ZC5A 2OJ9A 3QD4A 3A7HA 3AGMA 3KVWA 4MF0A 3LJ1A 3CPCA 3NNUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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