1UNLA

Structural mechanism for the inhibition of cd5-p25 from the roscovitine, aloisine and indirubin.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLANFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanism of Cdk5/P25 Binding by Cdk Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 5
molecule tags Cyclin dependent kinase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 292
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1unlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1unlA01
2AUHA 1H0VA 3RVGA 5JQ8A 5CVGA 3QUDA 1H1PA 4LFIA 4RIWA 4W4VA 1JLUE 2BAQA 3NAXA 2GFSA 3ZBFA 5C4KA 1ZYJA 2V0DA 4PV0A 5HE3A 3WYYA 4B4LA 2VWWA 1YWVA 4RX5A 3QRIA 4CGAA 2I0YA 4TYHA 4ANSA 2C6LA 3BBWA 4CFVA 4NKAA 4O2PA 5DT0A 2ETMA 2XKCA 2XRUA 3ROCA 4ID7A 1NVSA 2VUWA 3MPTA 3ZUTA 3R1NA 4D5HA 3WARA 5CQWA 1PXNA 2E2BA 3UMWA 3OCGA 5K5NA 5B0XA 3JR1A 3JXWA 1SVGA 4EEVA 5IEXA 3K5UA 4E5BA 5M51A 3A7FA 5CEQA 4FEWA 5E92A 1HOWA 2UW7A 3PA5A 4N6YA 3AC2A 4G6OA 5AUZA 1OPLA 4PTEA 3F5PA 4PL4A 3P0MA 4GJ3A 5HIBA 2R5TA 4LUEA 1SZMA 1LPUA 3CCNA 3CQEA 4IDVA 4Z9LA 4DC2A 4FTJA 3KULB 3ZC6A 4ZZNA 5JFVA 3D7TB 1IEPA 1H24A 5FTQA 1PF8A 4HZSA 3RHXA 5E8WA 3KVWA 3BIZA 4FGBA 4F9WA 4AWIA 3HEGA 4GJ2A 3VWAA 2WMRA 3GUBA 5CVHA 5JFWA 4MF1A 4FSQA 3DFAA 1WZYA 3QQFA 3DKFA 3L9LA 4L45A 4XLVA 4XX9A 3DBQA 5BMSA 3CPCA 3CC6A 3QWKA 2DWBA 2GDOA 4K9YA 2EXCX 4QO9A 3LFSA 3RGFA 1JVPP 4M3QA 4EOJA 4TWCA 1XQZA 2VWXA 3AC1A 1QPDA 3D9VA 3JYAA 2UW0A 4EUUA 4AXAA 5GIPE 5HE0A 3MW1A 5ITAA 4K2RA 3R30A 4DGOA 1JOWB 5CQUA 4BKZA 2WTKC 2CKEA 4AGWA 3PZHA 4EOMA 3I7BA 3RP9A 1UA2A 3DB8A 4FZFB 5D41A 2GNIA 1ZOGA 3QU0A 1CKJA 4PP7A 2J2IB 3B8QA 1ND4A 3EN7A 2ZB1A 4FKLA 3VBYA 4G6LA 1OKWA 3R7EA 2X2MA 4ZSJA 4DBNA 2R9SA 3AXWA 4JDHA 3N51A 3QALE 1UU7A 3UVPA 1L3RE 4ZEGA 5HU9A 4MYGA 2ZM4A 2HY0A 4L3LA 1JAMA 3EL8A 4JX7A 4MCVA 3FY2A 4WT6A 2W05A 4CRSA 4XHKB 3ATSA 2OF2A 4EK5A 2XH5A 4O27B 4QP3A 3GCSA 3K54A 4QMXA 2PVJA 3Q2MA 5JGAA 2XNOA 1UWHA 5I9UA 3P7AA 2PMIA 5DEWA 4QD6A 4KABA 3FZOA 5CSWA 4FEQA 3LLAA 5ANOA 3RK9A 1U54B 2GQGA 2JDTA 1CDKA 5HCXA 4FZ7A 4RJ5A 3QQUA 2C5NA 3VW8A 3F3WA 4GMYA 4F7SA 2X4ZA 4MTAA 2OZOA 4YBKA 5A4CA 3D7ZA 5LARA 3UC4A 4EZ5A 2PULA 4JRNA 4NIFA 5CANA 4L7FA 3Q52A 3AT4A 5AUYA 5EQEA 2Y7JA 5TO8A 3DBEA 3BHHA 2CLQA 5AP4A 4PNKA 5L8KA 3GI3A 3VIDA 4CFFA 4DAWA 5DRDA 3OVVA 1KSWA 3D5WA 3CBLA 4GVAA 4DEDA 1Y91A 3LMHA 1FMKA 1Y8YA 4NFNA 1UU9A 3ZDUA 3ZUVA 1I09A 4OT6A 2BDWA 3QD3A 3II5A 5D7VA 2YCRA 3H10A 1WAKA 2VNYA 1OL5A 5AV3A 4DYMA 3C1XA 3FLZA 4FT5A 3MIAA 4PPAA 3W33A 3ZC5A 2P55A 5AR8A 4O7WA 5FM3A 3DB6A 2VWVA 3TNIA 1KOBA 4YJNA 4WHZA 2F57A 1H01A 3QRJA 3E93A 3R8PA 4CZTA 1OUYA 2IZRA 2YA9A 2PZPA 4ONAA 4S31A 4F7LA 4FEXA 2Y6OA 3BV2A 3H9FA 4USEA 1OPKA 2ETKA 3P86A 4PRJA 1H28A 4CMTA 3C0IA 4XLIA 5CNNA 4FIFA 2CPKE 4B0GA 5J95A 2X7FA 1NT2A 4Z7GA 2QOBA 2AYPA 1CMKE 3MS9A 4ZS0A 2WTDA 5KHXA 3NAYA 4NCTA 2B55A 4IZAA 3FV8A 4BYJA 4KIKB 5AP5A 4ASZA 3E63A 4U97A 1MQBA 3NUXA 2OIQA 2C68A 4MF0A 4WNMA 2XA4A 4XP2A 2F9GA 5M44A 3CSVA 2WQOA 5L4QA 1E9HA 4QPMA 3RHKA 4MQ2A 3KF7A 3F82A 4EH6A 2QLUA 4G9RA 4ZLYA 4DFUA 3U51A 1V0OA 3LCOA 3VS6A 4BHNA 3AD5A 3NPCA 4UWYA 2Z02A 2RKUA 3EFWA 3OFMA 3G0EA 4QQCA 5DLSA 3V8TA 3TTJA 3SG8A 2PK9A 2ERKA 4XV2A 2YLEA 3PG3A 4E3CA 3CJGA 4RC4A 4E6DA 5DMZA 3S95A 4AZSA 2C4GA 5KX8A 4TYGA 4JRVA 4RIXB 1SM2A 3MB7A 5HU3A 5IA2A 1FVTA 2J0LA 4JQEA 3QKMA 2V7OA 4M84A 2QOCA 4EH8A 4YBJA 2VX3A 3BYUA 3KRRA 5CU6A 4A4LA 5I4NA 2IVSA 1VEBA 1Y8GA 3GT8A 4O0YA 3IPHA 5IZFA 1J7IA 2HW6A 1XH7A 3RAIA 3Q9XA 1PMNA 3VW6A 3ALOA 3EH9A 3UPXA 1YRPA 3RCDA 2QQ7A 4QQTA 3FWQA 4ZSGA 3KXXA 3A62A 3G33A 2J5FA 2LAVA 4RLLA 5GJFA 3RJCA 3LIJA 4LGDA 4RQKA 3UVQA 3RWQA 5CF5A 4W9XA 4EJ7A 2XIZA 2WELA 3RPOA 2PYWA 3SG9A 3HDMA 5BQ0A 3PY3A 4C35A 3E87A 4ERKA 4FTTA 3R7YA 5LCKA 4P90A 1WVXA 2ITZA 3L9PA 2R3GA 4E5WA 4R7BA 3S00A 3DOGA 1YI3A 2O8YA 3RNIA 3ZO2A 2FGIA 3E8DA 1T46A 4ZP5A 1NY3A 5AP6A 2CGXA 4NJDA 2X6DA 5DPVA 4CRLA 4XOYA 2JAVA 2XNNA 4E8AA 3HAMA 4BI1A 4ZOGA 4EHEA 3OW3A 2UZWE 1PYEA 1Q8WA 4EOLA 1Q8TA 4NCTC 4X0MA 2XK7A 3V51A 2CN5A 5AUVA 3I5ZA 5AP1A 3R7VA 3HMNA 3T8OA 1XBAA 1BUHA 1TKIA 2OZAA 2YIYA 3IQ7A 3RAKA 2O63A 1RJBA 1REKA 4I0SA 2R3JA 4UB7A 3DU8A 4U81A 2W06A 5DOSA 5ETFA 2CKQA 3GC8A 4CXAA 4F4PA 2YDIA 3NMUF 2C3IB 4KIOA 3QTQA 2OBJA 2EXEA 1Q8UA 4AA4A 4IFCA 5C26A 4IQ6A 4O91A 2JAMA 2I7QA 2V62A 2HAKA 4D0WA 4FTNA 5HZNA 3FKOA 4O2ZA 1APME 2QO2A 5TOZA 2VO0A 1W82A 4NJ3A 4OGRA 4D9TA 4EOKA 4BTFA 3P08A 5JK3A 5AUTA 4YZ9A 4QP6A 3MIYA 1QPEA 4DFXE 5DR2A 2WFYA 3ODYX 2G2FA 4MBJA 3L8SA 4KRCA 2YJSA 3V01A 3TUCA 4KUJA 3TDVA 4NW6A 5BVWA 1KV2A 3UDBA 3OT8A 4DGLC 4AFEA 2X39A 3TKHA 5HG8A 4HVHA 5EDRA 2X7OA 2R4BA 5CEKA 3OP5A 1Q62A 2PZ5A 2YM8A 3C5UA 4KIPA 3EN4A 5D12A 1P2AA 1BLXA 4KS8A 4BTMA 4DGGA 4OBOA 2CNQA 2ZMDA 2UZTA 2EWAA 1UNLA 1FGIA 1ZY4A 2IW6A 4QYFA 2XNPA 4UZDA 2C0TA 4X7QA 5H3QA 4C7TA 3A7JA 3H9OA 2BALA 4LRJA 3DAJA 4FSWA 3UVRA 3A8WA 5A6NA 4GVJA 1YOMA 2ITVA 5CZHA 4BDJA 2G2IA 5CSVA 4O96A 3UNKA 5F9EA 3SAYA 3QA0A 1H1QA 3MVHA 4U43A 1KWPA 3OCBA 1F3MC 4CTCA 4D1SA 3EFJA 2GS6A 4QNAA 4WNPA 5DR9A 4AW1A 2R3RA 4CCBA 5AV2A 2H6DA 2VTJA 3BELA 1BMKA 4EOPA 1JKTA 2YCQA 4L68A 2RF9A 4FL3A 3W2SA 4E7WA 4UXLA 4YUQA 2HZNA 3G9NA 4IWDA 4EKLA 3TDWA 2OIBA 5LWMA 3EQDA 3PVUA 2X8IA 4MHAA 3U6IA 4ITHA 1E1XA 4FC0A 4XYFA 4BCIA 2BFYA 2OXYA 3BI6A 2HCKA 4BCGA 4JLCA 3OROA 1FPUA 4YLLA 3VF8A 3UZTA 4FNZA 4QTAA 2R0UA 3AMAA 5F95A 5HBHA 1O6LA 3ORLA 4YTIA 2RIOA 3E64A 5FXSA 3DDPA 3G2FA 2J6MA 3EZVA 3HV7A 4HGEA 3NNWA 3SD0A 1FQ1B 4YSJA 2WZJA 1Q99A 4BDEA 4O83A 5KE0A 3L8PA 3HA8A 4CYJA 2HZ0A 2W7XA 5GINE 1PXMA 3WI6A 1Q24A 3G6GA 4X3JA 1Z57A 1Q3DA 1ZYCA 2P2IA 5TT7A 3TCPA 2ITTA 5FM2A 1Q61A 4FK6A 2X8EA 4BF2A 5KMLA 3BLQA 3IW5A 2BRMA 4M68A 4TTHB 4LRMA 5AWMA 4M12A 4TNBA 4UMQA 4ZZOA 5M4FA 5HTIA 2R3HA 1U4DA 2JEDA 3NYNA 4U8ZA 4IDTA 3SHEA 2WAJA 4IBMA 3WE4A 2YACA 1M7QA 3DA6A 4MD9E 3HX4A 2HIWA 3GCUA 5HESA 3E7OA 3V5WA 4IX4A 4YHJA 2RFNA 1Z5MA 3BE2A 4JT3A 2X9EA 4MVFA 2W1HA 3KXMA 3KN5A 4LMNA 3PVGA 1W0XC 3ZTXA 3W2RA 3U9NA 2WMWA 4DEEA 4D2SA 2VTSA 2YIRA 3G15A 5A9UA 3L8XA 2R7BA 4MKCA 4MXAA 3LFBA 4HPUE 1OL1A 2OSCA 4I5CA 4DINA 1AQ1A 2B4SB 4IEBA 4FV5A 3FBVA 1TQPA 2BFXA 1JPAA 4DH3A 3W16A 4C61A 5C27A 5L3AA 3C0HA 4QP4A 3IW6A 4IHPA 4PPBA 1ZY5A 1KE5A 5HQ0A 1YOJA 3A8XA 2EB3A 4JAJA 4WD5A 3IOPA 2XJ2A 4D55A 4XP0A 4YJPA 5EHLA 5AAEA 1PJKA 4RRVA 1SNXA 1XH5A 3U55A 4BCHA 3NW7A 2FVDA 3MH0A 5EM8A 1XBCA 2G15A 4A4OA 1XKKA 4HVIA 3OWKA 3FXWA 4UZHA 4ZMEA 1V1KA 4K1BA 3RAHA 2PMOX 1OUKA 2REIA 5EDPA 4O0TA 3UO6A 4APPA 4E4LA 5AR2A 2VO7A 1OGUA 1W84A 3IW8A 4AZTA 1SMHA 3FMJA 4ZTSA 5LVNA 4O7TA 4RFZA 5TR6A 3PY1A 1XWSA 4DEHA 1J1BA 3WIKA 2BPMA 3Q4TA 4O7SA 3E3PA 1L8TA 3Q53A 2P3GX 3FLNC 3PLSA 5CEIA 3UGCA 4FNYA 4CKRA 5FWKK 4IVDA 3TT0A 4ANLA 3LQ8A 3NUNA 5HEZA 5F4NA 3I60A 1ZMWA 5CS6A 4EK3A 4I5HA 2C0OA 4KBCA 4I6HA 3PJ8A 5BVKA 3Q4ZA 4TWOA 4AT5A 1H00A 2P4IA 3MFUA 3QYWA 4MK0A 4F64A 2ZVAA 3F2NA 1NA7A 2CN8A 3OXTA 3PPJA 3NCZA 4FTCA 3O51A 5EYCA 4E1ZA 3KMMA 3FLQA 1FMOE 3R7GA 2AC3A 2GNFA 3MA3A 3VS2A 1OL7A 3UP2A 4C8BA 3LW0A 3R28A 5JZJA 5CTPA 4R6VA 4BL1A 3V6RA 1YI6A 3FQSA 5L8JA 5M06A 3F3ZA 3NUUA 2Y4PA 5CWZA 3R7IA 3VRZA 4D2PA 3C9WA 4AUAA 5DNRA 4IWQA 1PXJA 4FKRA 3GC7A 3BHTA 3BYMA 5AX9A 3BLHA 3Q5IA 4I0RA 4JBOA 2QG7A 2H9VA 3QD0A 3GU8A 3R83A 4A7CA 5CAQA 2XVDA 2XNMA 3FL5A 5IH6A 3GVUA 2VTIA 3QTZA 4NFMA 4OTRA 1BX6A 4K8AA 2RFEA 2WTJA 2QC6A 1AGWA 2QOLA 3HUCA 4O82A 4BDDA 4FUXA 1YWRA 3VUMA 5GZAA 2IVTA 5M57A 2BZKB 2WD1A 4UEUA 3W10A 2YERA 3AQVA 4FTUA 4F0IA 4HNIA 4OTPA 3TNQB 3CTQA 3HP5A 5KMMA 5BYYA 3IGOA 4O7RA 4G3DA 3FAAA 2J9MA 3HMOA 4JBQA 2W0JA 4CZYB 4IX6A 4O22A 4DEAA 2IZUA 3QX2A 3COIA 4L8MA 2W9FB 3L9NA 4FSYA 2V7AA 4NM3A 4QMYA 4BIBA 3EMGA 2W5BA 3TXOA 5DE2A 3SLSA 4NEUA 4RZVA 2YZAA 3BEAA 1IRKA 1PXLA 3AMYA 2A2AA 2OJGA 3BQCA 5CT0A 3ZO4A 4J8NA 3UYSA 4Y5QA 2W96B 5J1VA 3QXOA 3LJ2A 2IG7A 5IH4A 3R1QA 4ANNA 4GKIA 5TKDA 4WBOA 4RVLA 3VBQA 2PVFA 4FNXA 3G9LX 3MWUA 3KXHA 4CFMA 3D5VA 3HRFA 5IU2A 5KMOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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