1WBSA

Identification of novel p38 alpha map kinase inhibitors using fragment-based lead generation.
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
351
structure length
351
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of Novel P38Alpha Map Kinase Inhibitors Using Fragment-Based Lead Generation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 108
structure length 351
sequence length 351
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2004-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1wbsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1wbsA01
4CFMA 2Z02A 5AAGA 4I0RA 3W2PA 4C36A 1JAMA 2O5KA 4BR3A 5EYDA 4W9XA 4B8LA 5L2SA 5FM2A 1FVVA 3K2LA 4S33A 3RZBA 4GFGA 4D5KA 3QA0A 4QMOA 2XS0A 3ZRMA 5EQEA 5FTGA 3BHHA 3EQHA 2YCSA 4JBQA 4EH8A 1JVPP 4JDHA 1E1XA 3G9NA 1XH9A 4DEBA 5CVFA 5FP5A 2A4LA 3AC5A 2VO3A 1GIHA 1U5RA 3DQWA 3DOGA 5DIAA 4D2TA 3MH3A 3QUPA 4PP9A 4U7ZA 4WA9A 5I9WA 1Y8YA 3C4FA 4AW5A 3QRTA 3EQIA 4HVSA 3WF5A 3FWQA 4FF8A 4I5MA 3CXWA 3P79A 4YZNA 3W10A 2FSTX 4IC8A 3FC2A 5DFPA 2R9SA 5EM6A 3O8PA 4QO9A 1YRPA 4AAAA 4KB8A 4KSPA 1UV5A 3MPAA 2ITNA 2XA4A 3BHUA 3L8XA 3TN8A 3IW4A 4CLIA 4ZSGA 5J5TA 2XCHA 2C6OA 2PVNA 4F64A 5AP3A 5IA4A 4MNFA 4OTRA 4DN5A 4DF3A 3F3WA 3WIGA 2R0IA 3ZFYA 2WTIA 2C3KA 4EBWA 4MK0A 3ORKA 5M4CA 1ZYLA 3GQLA 4C33A 4FZAB 3PIYA 3TEIA 4I0SA 5JFSA 3DAEA 1R0EA 2P4IA 3LFBA 4AWIA 3N51A 4CCBA 4DFLA 2ITQA 2P55A 1Q41A 2P2IA 1H1RA 3EL8A 5CTPA 3TTJA 5GIOE 5HEZA 4JT3A 3JY0A 5CYIA 3ZM9A 2R3LA 1YOJA 5CF8A 2VTPA 4FSTA 3DGKA 4ZLOA 4GV1A 1WBSA 3FMKA 3FQSA 5IUIA 4XLVA 3U4UA 4ZTLA 3OWJA 3I1AA 4XG3A 5IUHA 4TYEA 5CX9A 3FQHA 4R78A 4EZ3A 1GZNA 5AP4A 2HXLA 4RBLA 4HCTA 1JSTA 5HESA 4EQUA 2XF0A 4ZY5A 4EUUA 4RWKA 5AX9A 4FKTA 3T3VA 2B54A 5ANJA 4OTFA 2O8YA 3RPYA 1W82A 4F63A 2W5HA 2WAJA 5A14A 3RCJA 1H01A 3VBQA 5IQIA 4EK8A 3BX5A 3PJ2A 4U45A 2ITVA 4W9WA 1OGUA 5HVKA 4Q9SA 5IQHA 3C4ZA 4FE2A 4FZ7A 4RFMA 1IRKA 3EFWA 3ZS5A 3TNPC 4AT5A 5LCJA 2XRWA 3SOAA 4J98A 2ONLA 3Q9XA 3WOWA 1CDKA 3I79A 2Y4PA 3EOCA 2BVAA 5DBXA 3HKOA 2XNBA 3V8SA 4JG8A 1YWVA 5DEYA 2YM5A 2UW9A 5K0KA 3DFAA 3HUBA 3N4VA 4R6VA 5EK7A 3UG2A 3SOCA 5M56A 3FZPA 5DNRA 4S34A 4BI0A 4IZ5A 4ITJA 3F2RA 5H9BA 3A4OX 2W7XA 4O38A 3VS1A 2FB8A 3KMWA 3WZDA 3BU6A 4X21A 4G6LA 2WTKC 3DDQA 2R4BA 4RG0A 2EU9A 2CDZA 3C50A 4GT3A 4RLKA 4G16A 3ULZA 3LOKA 1J7UA 2YN8A 3OP5A 4IX3A 2H34A 4AGUA 5JH6A 2PVMA 3CBLA 1U4DA 1DS5A 2WMSA 2IJMA 2XEZA 4U3ZA 4D2PA 3FDNA 4MYGA 4HGEA 1BI8A 3QTUA 2JAMA 5DLSA 4EONA 3JUHA 4QMYA 5LOHA 3VQHA 4YJNA 4CMUA 3BV3A 3S95A 5FG8A 4USEA 5JGBA 2NNWB 3HRFA 3MIYA 4H39A 2YHVA 3M42A 4OBOA 4FTAA 3ITZA 4HCUA 4UALA 2PMOX 4DLIA 3CKWA 3LMGA 5L2WA 2IN6A 3F5UA 4LM5A 5EM7A 2BILB 3GC7A 2JDTA 5ANKA 5TR6A 3RALA 4CVAA 5KMJA 3F5PA 3DNEA 3GXLA 3PRFA 4O0SA 3R9OA 1OL6A 4AA0A 2I40A 4F7JA 4K77A 2XIKA 5H3QA 4YO4A 4D9TA 4JR7A 4TWNA 2PK9A 3DK6A 4FNXA 4RT7A 5DWRA 2EXMA 5D7VA 3ZSHA 2WTKB 4BCGA 2R3IA 2CJMA 3F88A 4FKUA 3HECA 3W55A 4BI2A 1OPKA 4ERKA 2VGPA 5AR7A 4OAUC 2YACA 4ITIA 4M13A 3QKKA 4YHTA 3ORZA 3P7AA 1JSVA 5AUYA 3VBTA 2Z8CA 3H9RA 3G15A 4GRBA 2WU7A 4R3PA 3HMNA 4ORKA 3TACA 3GU4A 2P33A 5F9EA 3G90X 4LV5A 4A4XA 4IAAA 5KE0A 4ALUA 3ZBXA 3W33A 4CT1A 2F2CB 4EWQA 4YSMA 1HCKA 3TNIA 3FI3A 5CZHA 4CFVA 4MBIA 4KAOA 2WMRA 1Q24A 4F99A 1JKTA 2GSFA 2YLEA 3D4QA 1V0PA 3ALOA 5D1JA 2WQNA 4FKSA 5CF6A 3QZFA 4I1ZA 4NT4A 2HK5A 4GL9A 5KHXA 4RLLA 1ZOHA 2EWAA 3F5XA 3HA8A 3KXNA 4PUZA 3OFMA 3LAUA 4ZK5A 2WPAA 3VUTA 4CFNA 1IA9A 2W5BA 4BZOA 2C68A 3ACKA 5CALA 3N9XA 4PQNA 3A62A 3LZBA 4R3RA 4AW2A 4BWKA 4MX9A 2OI4X 2QVSE 5L8JA 3KF4A 3GU8A 4IQ6A 4LFIA 4NWMA 2X8IA 1Y6BA 3TUDA 3LLAA 1OUKA 2XEYA 3KKVA 5HG9A 3AQVA 5J87A 4OR5A 3DK7A 3FQEA 2BTSA 3FMDA 3R8MA 1W84A 3EB0A 3D5XA 4FSQA 3VRZA 3ZFMA 4AT3A 2GNHA 3O50A 4Z16A 3NMUF 1XWSA 4PX6A 1U46A 4HW7A 3QQUA 4I23A 2X6DA 4OAVB 4RRVA 4O0WA 3DAKA 4P5QA 4C8BA 3RPOA 1E9HA 2W1FA 4FKRA 4FX3A 4F1OA 5HVYA 2GTNA 2R2PA 2PSQA 3LIJA 1BX6A 4O0XA 3H30A 1A9UA 3KXZA 3MV5A 4RIYA 2I6LA 1JQHA 5GJDA 1URWA 5FRIA 5CEKA 1IASA 4RWLA 4ZTRA 2ITZA 3GU6A 3QUEA 5BVOA 1R0PA 4BDFA 5GHVA 4BIBA 4E93A 1YDSE 4CKRA 4JQ8A 1YVJA 2WHBA 3KGAA 3L9NA 3I5NA 2HELA 3CY3A 5DGZA 3V3VA 2PE2A 3PJ1A 4FVPA 2B9IA 4U79A 3TJCA 4O27B 4DH1A 4UXQA 4C2VA 3D5WA 2C3IB 4A9RA 3A7HA 1VEBA 5KHWA 1WBOA 4ACMA 2GFCA 5GNKA 2UW4A 1ND4A 3LFSA 5D9HA 3QWJA 3NW6A 5CNNA 5K5XA 3P9JA 1OMWA 3PPJA 4G1WA 5TO8A 2VX0A 3ZLXA 5DA3A 4GYGA 4F9CA 2WMQA 4WD5A 3W2QA 3LW0A 5M53A 4IW0A 3WF7A 5HE2A 5HHWA 4RZVA 2C0IA 4QMNA 3KC3A 2QG7A 4MNEB 1GIIA 5AV2A 2BMCA 4FICA 4JDIA 3SQQA 3WI6A 3SD0A 3F6XA 4TYJA 2DS1A 4USFA 5EH0A 4O7VA 3LXLA 5DYJA 3OW3A 5FEDA 4YTIA 4A9SA 4G31A 5BVWA 1DM2A 1DAWA 3MYGA 2QOKA 1KOBA 3PVGA 4BIDA 1GAGA 1PXIA 2OJIA 1PYEA 4QP4A 3FMJA 3QTWA 4L7SA 3TZ8A 2YM7A 2C0TA 3ORIA 3VUGA 3FKLA 2BKZA 4MTAA 2BRBA 3E8CA 1ZWSA 1E1VA 2BFYA 2F7EE 2QOFA 3NYXA 4O91A 4ALVA 4TY1A 4FEUA 1P4OA 4OTHA 4XP3A 4JIKA 1OB3A 3W16A 3O2MA 3Q2JA 1WMKA 5HZNA 5KZIA 4FSRA 5HBJA 3VULA 4E20A 2PYWA 2WKMA 4I21A 5JQ5A 2YIRA 4R5YA 5FEEA 2OLCA 4BDIA 4GK4A 2PVYA 4FOBA 1PMUA 4JVGA 3ZZWA 1ZOEA 3I6UA 4IIRA 1FPUA 2UZDA 4QP2A 3SXRA 4CKIA 5HTBA 5IU2A 3QHWA 4FGBA 3LXPA 5I4NA 2WTWA 1BI7A 3TKHA 3HZTA 3H9FA 4IE9A 4OGRA 4EH2A 2J2IB 4JAJA 3BQRA 4B6LA 2ETKA 3LCKA 4GYIA 4M8TA 4DE4A 2WQMA 5HTIA 5K3YA 2IW6A 4KBCA 4PRJA 3OUNB 4LGHA 3E8NA 2C1BA 2PZRA 4AA5A 4QYGA 2VWVA 3OCTA 4E73A 5BVKA 3UIXA 4ASXA 2X9FA 3DDPA 3DBEA 1HCLA 4XOZA 2HOGA 5AP1A 5AUTA 2ZAZA 3DCVA 1H1WA 2VX3A 2BR1A 3BGPA 3PXFA 4AACA 4F6WA 4BDEA 2JKMA 2OH0E 4L67A 4YTFA 4Y8DA 2YIYA 3ZRLA 5EI8A 3ET7A 4I22A 4DLJA 3MVLA 3VS6A 5JMSA 2YAKA 2XJ0A 5LXMA 1RE8A 2B0QA 4RIXA 3UQFA 4MEDA 3UZRA 2JFLA 4ZMEA 1WBNA 1DI9A 5ACBC 3KB7A 4EI4A 3CD8A 5IQCA 4JX7A 4AZVA 2VTTA 3D2IA 3EN7A 1XH6A 2ZB0A 1GNGA 2NRYA 4IBMA 4K9YA 3I7BA 3VC4A 5KMNA 3MPMA 4WNMA 5HOAA 3RNYA 3PVBA 1LEWA 3UE4A 3ZMMA 4JR3A 3LHJA 4TKSA 2GQRA 3OMVA 3OT8A 3DTCA 4FVRA 4X3JA 3D5VA 5JZNA 4A4OA 4DCEA 2GPHA 4FI1A 4QMXA 3FBVA 2CKQA 4MQ2A 4PNIA 4XCUA 2WMWA 2WTJA 3PG3A 3HV5A 4H3BA 3TM0A 4FOCA 3NYOA 4X6QC 4CGAA 5CVHA 3CGOA 4XP0A 3E8EA 3NNUA 4EHGA 1TVOA 2YLFA 4PMPA 5BNJA 5CAVA 4G34A 3BKBA 2ZV9A 2C6DA 4ZXTA 2IW8A 3E64A 4EKLA 5M55A 4IJPA 2Q0NA 4UYNA 3O17A 4FV6A 2C6EA 3DB6A 4Q9ZA 3DQXA 4F0IA 4BYJA 5IMXA 2OIQA 3ORTA 3UOJA 3AXWA 4DG2E 2DYLA 4BDAA 4O21A 2Q83A 2R5TA 3BV2A 3PFQA 4DINA 4OT6A 1UKIA 3LCOA 4YLLA 4FEQA 5D11A 4RWIA 1Y8GA 4MKCA 2F9GA 3MA6A 3P86A 4FUYA 3FUPA 4ALWA 4F1TA 3CCNA 2EVAA 3AGMA 4I6QA 3S4QA 2FVDA 3SXSA 3DY7A 2ZMDA 2VUWA 3PZHA 4IXPA 3AC8A 1KV1A 1OPLA 2PZIA 2XRUA 2OO8X 3PY0A 4FTIA 4GMYA 1FGKA 2RF9A 4GS6A 3HMMA 4M84A 4O2PA 5HBEA 3D2KA 4PDOA 4RJ5A 4IVCA 2VNYA 5HCYA 1OIYA 4ZSJA 3VUIA 4O1OA 3WF8A 4DT8A 1H0WA 4MF1A 2IPXA 3T9TA 2OWBA 4EH7A 2VTLA 4BDJA 2QI8A 3L9PA 5IZFA 5KMLA 4O7WA 3UYSA 4QPAA 3QQKA 2ZV7A 5IQDA 4YZBA 5E8VA 2E9PA 3UOLA 4L46A 2CGVA 2RKUA 5HIBA 2LGCA 2UZOA 4BTMA 5HCXA 3V8TA 2OJFE 3ZHPC 3RK5A 3OROA 3ZLYA 2BROA 3VHKA 3UNJA 4BDDA 1VYZA 5AV0A 3OTUA 4F09A 2W1IA 4M12A 4QD6A 4R8QA 3FZTA 2QURA 4GU9A 1Q8ZA 1UU7A 4GKHA 2QKWB 5CQWA 4ZLZA 2ITUA 4N4SA 2W06A 3VHEA 3LFEA 2SRCA 3TT0A 4MBLA 4PV0A 1SM2A 3T3UA 5LVNA 5GINE 5IEXA 5K5NA 3UZTA 5JFXA 4M14A 1UNHA 5HG8A 2RG5A 3A8WA 3UGCA 4AGCA 5JQ8A 1Q62A 4WOVA 4EWHA 3ZSIA 1QPJA 1H00A 2X6EA 5HO8A 4AQCA 3B8RA 1OBDA 3V04A 3DJ7A 5I9ZA 3PIXA 1SVEA 2BHHA 3ZO2A 5CEMA 1A06A 4GEOA 4M3QA 4ZEGA 3W18A 3AC2A 5HNIX 4F6SA 4YTHA 1YXUA 3R9NA 4NW5A 2ZDUA 3Q4CA 5DR9A 3SLSA 4EOPA 3Q2MA 3S3IA 3V5QA 4G17A 4EUTA 3FI4A 2BTRA 5IA3A 1CKJA 2J0KA 4O6LA 2XK9A 5DT3A 2CPKE 3LM5A 4IFGA 4NJDA 4DGLC 5I9YA 4IC7A 4NTSA 4XG6A 4F6UA 2XK8A 1WBWA 2YZLA 1OIQA 3Q5ZA 3Q5IA 3A7JA 1YHWA 4RZWA 4CD0A 3R1YA 3QTZA 5CY3A 5E91A 3BGZA 3TIYA 4K6ZA 3O0GA 3EQDA 3IQ7A 3FC1X 1H08A 2VD5A 2WMUA 2UZBA 2YZAA 1A48A 2W4JA 4FEXA 4FZFB 3DPKA 4C38A 2R3HA 2QCSA 3GU5A 4TN6A 3DXNA 2EXEA 5FXSA 3NNVA 5AP2A 4P7EA 3GT8A 3KVWA 1YOLA 1XQZA 1H28A 3EN5A 3QF9A 2BIYA 4ANBA 3U6HA 4DCAA 1PKGA 4XBRA 4UZHA 3RM7A 3M2WA 5C4LA 4LYNA 1ATPE 5JFVA 3LFDA 3UODA 2JDSA 3GOPA 3JR1A 5CEQA 4WT6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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