1WFCA

Structure of apo, unphosphorylated, p38 mitogen activated protein kinase p38 (p38 map kinase) the mammalian homologue of the yeast hog1 protein
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
347
structure length
340
Chain Sequence
RPTFYRQELTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of p38 mitogen-activated protein kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE P38
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 107
structure length 340
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 1996-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1wfcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1wfcA01
1NY3A 3GNIB 4FI1A 5B0XA 1TKIA 3KCFA 4NSTA 5HG8A 3I4BA 3L9MA 5CU6A 1XH4A 5JH6A 5LXMA 1JNKA 4G17A 5KMOA 2WTIA 5FG8A 5KKRB 5CSXA 2XK7A 2CPKE 4O1PA 1XJDA 4YR8A 4BKJA 3R04A 4TWPA 3PPZA 4QP6A 1T46A 3QTSA 3DLZA 5BVOA 5HVKA 4YSJA 3CJFA 5DE2A 3RVGA 4H1JA 4UMRA 2J4ZA 2E2BA 4ZK5A 2QU5A 5CXZA 3UYSA 2QR8A 3I0QA 3C0IA 4ID7A 4XEYA 3R7UA 3RBWA 3WIKA 2YJSA 2B53A 3QTUA 3HEGA 3ATTA 2ITUA 3UBDA 3Q5ZA 3TM0A 2ZMDA 3HECA 3RM7A 3K2LA 3E7VA 2UUEA 2C47A 2FVDA 2WMTA 5ANGA 4FEUA 4UWCA 3QD0A 5CI7A 4PL3A 5DH3A 3FMEA 4BR3A 4IWQA 3EN4A 3GQIA 4L3PA 4TNBA 3NW5A 2W05A 2C6DA 3O8TA 4EOJA 4CFMA 3ORIA 2UV2A 4GVAA 4EWQA 3THBA 4CSVA 4IB1A 2Y8OA 3KXGA 1H1RA 4R3RA 1UNLA 4U97A 1FMKA 3ZBFA 4GRBA 4YGAA 3C4WA 3MPAA 4QMMA 3TWJA 1BUHA 2ITWA 4UV0A 3ZUTA 4QMQA 4GSBA 3W2PA 3N4TA 2PZRA 4J95A 3FJQE 5EHOA 4L44A 4JX7A 2ZYBA 4RGJA 4YJOA 5FTOA 1H1WA 4OTDA 4DEDA 3MVMA 2VGPA 3QU0A 3ALOA 4W8EA 4Z55A 2IPXA 3DJ5A 2PU8A 4NTSA 4P2KA 3JUHA 2CCHA 2FO0A 2CNQA 2PTKA 2IW9A 1UKIA 3TXOA 5HEZA 3E8DA 2YM4A 2ONLC 2ZM3A 4FL1A 4JR7A 4OTPA 4XMOA 3C13A 4AG8A 4YTFA 3V5PA 4O7RA 3D15A 3A2CA 4YJPA 2G2FA 4EQUA 3BRBA 4PP9A 3HV5A 2BRHA 4HGLA 2XNEA 4RZVA 4WD5A 4EHEA 4RFZA 4C4HA 1OB3A 3HUCA 4QQ5A 4FEVA 2XUUA 4FVQA 2ITVA 4O1OA 4AFJA 1HOWA 3EQIA 4QTBA 4BCJA 2F9GA 4FNWA 2Y9QA 2H6DA 4JQ7A 5EYCA 1IRKA 2HXQA 2R3FA 3KRRA 4FTNA 3LXPA 5M06A 2QOLA 4MQ1A 4XOYA 4RJ6A 1BI7A 3UNJA 4GFOA 4RIYB 2VTAA 4WSQA 1Z9XA 3BHHA 4EOSA 2VO6A 4BCGA 1PYXA 4KABA 1F5QA 3M11A 5CSWA 1R1WA 4USFA 1Q4LA 3LCSA 5EI6A 2WTWA 4U44A 1WBPA 3ORXA 4CLIA 4EH3A 3PE2A 2XBJA 3IO7A 3DT1A 3OG7A 3KF7A 4ZSAA 4O7SA 2WELA 4QMUA 3C4XA 4XBUA 5FBNC 2UZTA 4IB3A 1ZAOA 3QCQA 3WIGA 4FV8A 1Q61A 4ZTHA 5HG9A 3UP2A 5A4CA 4MQ2A 2X8EA 5AP3A 4W4XA 5E91A 4AP7A 4AS0A 2XIXA 4D4SA 3QUEA 3MBLA 4JNWA 4S33A 4BICA 4XHKB 3SDJA 2PK9A 4NM7A 4OTHA 3KRXA 3I79A 4LRMA 4FV2A 4IADA 4EQMA 4G5PA 4B7TA 5H9BA 3D2IA 2Z8CA 3IDCA 4IWPA 4EHVA 5ETCA 5M4UA 1PXPA 1JAMA 3ACKA 3HGKA 3NDMA 3QQUA 2QODA 3DK3A 2EB3A 4FA2A 3OEFX 2JDRA 2IW6A 4I5CA 3CC6A 3HMMA 4QQCA 4LUEA 2IVTA 2YM5A 3MI9A 2Z7QA 4GFGA 5CVHA 2GDOA 2ZB0A 4AT4A 4CKRA 5KKRC 5JKGA 2OW3A 5EYMA 3FDNA 3ZFMA 2C68A 3CY2A 3E8CA 4ZSLA 4DGMA 3ZU7A 4QYFA 2ZJWA 5J95A 3KMMA 1H07A 5JEBA 4FE2A 3ZC6A 5TKDA 2VTNA 3F7WA 3UYTA 4TPTA 4B6LA 4C8BA 2XVDA 3ZLSA 4RX9A 4F1TA 3MTLA 3PJ8A 5AP2A 3SHEA 2PWLA 2R3QA 3MJ2A 3B8RA 3MN3A 4LL5A 4Q5HA 5E8XA 4EWHA 4ANMA 4HVDA 4PPAA 2C6IA 3G33A 4FIGA 4CFNA 3R63A 5LVMA 1NW1A 2WPAA 5T68A 3RPOA 3S3IA 4KIKB 4Z7GA 3CQWA 4IWDA 5AIKA 4AW0A 3UIUA 4XP3A 2EUFB 1XH7A 2UW3A 2F57A 3K3IA 1H00A 1F0QA 3EN9A 1U46A 5LVPA 4O6EA 1RDQE 2BFYA 3WYYA 2VN9A 3Q9WA 3ZDIA 4Q5EA 4L7FA 2P2IA 4W8DA 4C57A 1TVOA 2J90A 3R8VA 3OVVA 4ANBA 4FYNA 3ZFYA 4IX6A 3DBEA 4D0XA 4YJUA 2PZYA 4ZY4A 4M68A 4WRSA 2YN8A 3WZDA 3C5IA 4AACA 3NUXA 2DYLA 3NNWA 3Q3BA 4HW7A 4O0UA 2XJ2A 2QOFA 3FV8A 5EW9A 5GIOE 4PNIA 3IW5A 4BDHA 3P0MA 3D5UA 4UALA 2W5BA 4AZFA 4DGLC 3A8WA 3D5XA 2C6LA 2W4JA 4FG7A 3UDBA 3MIAA 4BGQA 4OT5A 4GUEA 3NAXA 2REIA 4D2TA 4QMNA 3ORKA 3ROCA 3V8TA 4YNOA 3DQXA 4ZXTA 5IA0A 3KXXA 4FTTA 2QC6A 2FYSA 3AG9A 5ITAA 2WB8A 2JFLA 3CPCA 3DZOA 4MNEA 4ZZNA 4ARKA 3NAYA 4BZOA 5EOLA 4BZDA 2ZB1A 3RKBA 2OU7A 2UW7A 3I7BA 3ZO4A 4JR3A 2VWVA 3GVUA 4BFMA 3BX5A 5CAVA 4GU9A 4XJ0A 5EYKA 1LEZA 4IWOA 3V5TA 5IZFA 4FODA 3HUBA 4WRGA 4MD9E 3QQLA 2W06A 3WF9A 2OXXA 3R73A 5EG3A 1PMNA 3Q6WA 4FIIA 3F2NA 2BIYA 3DAJA 3EQHA 4ZS0A 4EH2A 3QXOA 2J51A 3MPTA 3VJOA 1B6CB 1ZMVA 1YRPA 3DJ7A 5FDPA 3VIDA 3VS6A 1LEWA 4XCUA 4BYJA 3QKLA 4NH1A 4NUSA 3UC4A 1UWJA 2CLQA 3KRWA 4MKCA 4FL2A 3NUYA 1JKLA 3LFCA 3QZGA 4GT3A 4IBMA 4BWKA 4EK6A 3QYWA 3G5DA 3Q9YA 4A9SA 5JGDA 3CD3A 3FXWA 4GYIA 3DAEA 4BDDA 4U43A 4UMTA 4IJPA 4GEOA 5LCKA 2C4GA 2XNBA 3PJ1A 4WO5A 4YBKA 5IA3A 1XQZA 5L8LA 4KBAA 2BRBA 3EQGA 2PVHA 3JXWA 4RVKA 4HYHA 3PPJA 1YI3A 3L8XA 4AA0A 5M09A 3V04A 5HNIX 4JDHA 4PL5A 4W9WA 4IAIA 2BAKA 3C51A 4I94A 3AC5A 3NNXA 1UA2A 3M2WA 3ZDUA 3C7QA 1OIYA 2OF2A 3ITZA 4FIEA 5IQGA 3KVXA 3RJCA 4I0TA 3VVHA 5I3RA 4FG9A 3SXFA 3VWAA 4C2VA 4PDPA 4ZOGA 3TEIA 3VS5A 2WO6A 3VRYA 3U9CA 5I9VA 3LVPA 3LFNA 3ZM9A 4UZDA 4ZTNA 3A7JA 2PMLX 5FEQA 4DFLA 4KBKA 3A60A 5ACBC 2XIZA 5A4QA 3CPBA 4MXOA 2RFDA 2UW6A 2UZLA 3GT8A 3S95A 3ORMA 2UW5A 4LGHA 4PNKA 3ODZX 4MH7A 5KZIA 5IH6A 2R4BA 4QT1A 2ZM4A 3OT8A 3RK5A 2R2PA 3IW8A 4H3QA 4YTIA 3MB7A 3R9DA 4DF3A 3O7LD 4BDEA 5B2LA 4M69B 2NPQA 3VC4A 2Z60A 4I93A 4IB5A 5CT7A 1YXXA 4EH5A 5FWKK 2EVAA 4XLVA 1LP4A 3HA8A 4AZWA 5CNOA 2YCQA 2IVVA 1NVQA 3CJGA 4DFYA 4PPBA 4Z9LA 3LMGA 4OBQA 4MBLA 3OEZA 3FZSA 4CV8A 5HBJA 1PW2A 3Q4TA 1OL6A 3A62A 4R3CA 5F94A 4WG3A 4CCUA 4U6RA 4PF4A 2CKOA 4BI0A 5K9IA 2YM3A 2XK9A 3FI2A 3GENA 5BVEA 5TT7A 3ZRLA 4EOKA 5KCVA 2B0QA 2CN5A 4ZY6A 2I1MA 3C1XA 4FSRA 3RINA 3WARA 1ZLTA 4C4EA 3E5AA 4N6ZA 5HNGA 3DLSA 4HYIA 5LMKC 5CF4A 5C27A 3AT4A 4MXZA 2GCDA 2PMIA 3QQFA 4TWCA 1Q8UA 4DTBA 4OGRA 2JIVA 3TIZA 1UU7A 5D7AA 4N4SA 4F0GA 2OGVA 2WMQA 4AT5A 5L2WA 2PPQA 2R3MA 4C3FA 3CS9A 5GINE 4FTKA 4LRJA 3W8QA 2WEIA 2XNGA 3SA0A 2YDJA 3O17A 3TTJA 1YXVA 3VF8A 2VTJA 4QRCA 4KAOA 4DEEA 3CLYA 3PXYA 4AX8A 3W2CA 3D5VA 5C1QB 3OXIA 5LOHA 3LMIA 4M0ZA 4IAYA 1AGWA 5AUYA 4FOBA 1Q5KA 5JQ8A 2KULA 5K4JA 1Q8WA 2ZDTA 2X7GA 4RPVA 5DVRA 4DN5A 2HW6A 2XF0A 2R3GA 5EM7A 3CR0A 2OBJA 1WBWA 5KHXA 5ACKA 4I1ZA 4NIFB 3D2KA 1JOWB 4ZJIA 3AMYA 3R8ZA 4HZSA 3NWWA 3RCJA 4RJ7A 2QI8A 2O0UA 1PKGA 1ZOEA 1G3NA 3HP2A 4AN3A 5AUUA 3DBFA 4X2FA 2ZDUA 1OVEA 3KMUA 3ULZA 5FXSA 4AZTA 3KXNA 3O7LB 5DR9A 5HCYA 3U6IA 4YJNA 3IECA 3PY3A 4BIDA 3CGFA 5CT0A 4ZJJA 3LIJA 2YM8A 4CVAA 2HZIA 4FKVA 5DPVA 3QFVA 3ZOSA 4ITIA 3NGAA 4W4YA 3R28A 1XKKA 1YWRA 3AGMA 4G16A 4O0RA 3S00A 5M57A 4CV9A 3MW1A 1GZKA 3A7HA 2DWBA 2R3OA 1IG1A 4PUZA 2WMAA 3RAIA 4J8MA 2VAGA 4IAAA 4FIFA 5HHWA 4FR4A 1WAKA 3BU6A 5EI2A 3R9NA 2Y7JA 4WHZA 3W2RA 1GOLA 3TUDA 1SVGA 2OH4A 2ZV9A 4DEAA 4E4NA 5J1WA 5DYJA 4GK2A 3LJ1A 2Z2WA 1H26A 4U81A 4F0IA 5F9EA 3UNZA 5JQ5A 3IDPA 2CLXA 1O6KA 4KA3A 5FEDA 1YWNA 4F7LA 3PP0A 2Z02A 2R9SA 4JAJA 4EONA 3K5UA 3UODA 5IA1A 3OWJA 1M7QA 4XV2A 4C7TA 5HCZA 3E3PA 4TRLA 1OL2A 3N4VA 2XS0A 3WZJA 1OIQA 3WILA 5CTPA 2BRMA 4AW1A 3Q6UA 3L8SA 3QALE 2EXEA 4LYNA 5EKOA 2ITQA 2UZBA 4BCIA 2OJJA 3OWLA 2W9ZB 3RMFA 2ZM1A 3MYGA 4GCJA 4WBOA 4FV1A 4D5KA 3LFEA 2X0GA 3COKA 3NLBA 4FNYA 4XG3A 4NM0A 3QTZA 4RWJA 3ZZWA 1DS5A 4JDKA 3SKCA 4BDGA 4PP7A 4YC8A 2IW8A 5EM6A 1ZMUA 3BELA 4FKJA 4YJVA 4F9CA 4YO4A 5M4IA 5F95A 3LMHA 3FI8A 3WZEA 3NPCA 3Q4UA 4YO6A 5FLFA 3LCTA 5I5ZA 5HX8A 1K3AA 4XUFA 5HNBA 4EOLA 5M44A 4MXAA 2XP2A 4EBVA 3DXPA 1BL6A 1OBGA 2VO7A 3BHTA 1NVRA 3HMPA 5E8ZA 4ZTMA 1RJBA 3PYYA 3FLZA 1CKJA 2YCRA 4FOCA 2QD9A 2W5AA 3ALNA 5K3YA 5A14A 3BGQA 3RNYA 4BN1A 4USEA 1OITA 1S9IA 3UGCA 3P4KA 2C5VA 5BYLA 1PXMA 5JFXA 2J2IB 5FGKA 4CZYB 4L46A 3OCGA 3S4QA 4D4RA 4FSZA 4AZSA 4G34A 3ZXZA 3GC8A 3VBXA 1Q24A 2UZOA 3DGKA 3FC2A 4YTCA 3QRJA 4WNOA 5HTIA 2RFEA 1BX6A 4OTGA 3OF0A 4ASDA 3BWFA 3RK9A 2WGJA 4FEWA 2J9MA 2JKMA 4ACDA 4ALVA 4H36A 4E4LA 5L4QA 3HV7A 3TL8A 3ZXTA 4OTIA 2ZMCA 4D2RA 5D12A 4BTMA 1RW8A 1P4OA 2RFNA 2RG5A 4RLKA 4EBWA 4CG9A 2BVAA 2OFUA 4TTHB 5CZHA 1WBOA 2BDWA 1V0OA 2XIYA 4BDKA 3CQUA 3RGFA 4AF3A 4B8MA 2XKDA 3POOA 2PZ5A 3LOKA 2QOOA 2HZNA 4NL0A 4CQEA 5A4TA 4ACHA 3VJNA 3OY3A 4E8AA 3QYZA 2C6OA 5KMIA 1GZ8A 2P33A 4PMTA 5F4NA 1XBCA 4ZSJA 4F4PA 3GOPA 4D9UA 3UG1A 4NFNA 3POZA 1NT2A 4D58A 2ZVAA 2GHGA 3ZLYA 2HY0A 3MIYA 5ICPA 5IQCA 2ZOQA 1KE8A 1ZWSA 2PVYA 3O23A 2Z7SA 4L9IA 4LFIA 4PY1A 4ZSGA 4APPA 4F7SA 4ZJVA 4EHZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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