1WFCA

Structure of apo, unphosphorylated, p38 mitogen activated protein kinase p38 (p38 map kinase) the mammalian homologue of the yeast hog1 protein
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
347
structure length
340
Chain Sequence
RPTFYRQELTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of p38 mitogen-activated protein kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE P38
total genus 107
structure length 340
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 1996-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1wfcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1wfcA01
5E8ZA 3O71A 4YZNA 3OUNB 4WD5A 5KKRB 4LRJA 4BTKA 4Z16A 1W98A 3W16A 2XYNA 3QA0A 2GCDA 5E1EA 2BCJA 3E63A 2OZAB 4Y72A 3NRMA 5C9CA 3NYXA 3GCQA 3LVPA 4PV0A 2V7OA 4DEBA 3A60A 3R21A 3TNIA 4AZFA 4YBJA 2XUUA 3R30A 4TW9A 3A2CA 3JPVA 1KV2A 4UEUA 3IW6A 3R7EA 4O6EA 3B2WA 4DT9A 3DJ5A 4DH8A 3FAAA 3Q60A 3Q52A 2O63A 4XP0A 4U7ZA 4UX9A 2FO0A 3NUPA 3PFQA 5CSXA 4I6HA 4TY1A 2FB8A 2RFEA 3UVPA 3V6RA 2OU7A 3VUMA 4F65A 4FSMA 2XK6A 2OJ9A 1ZYDA 4ZJVA 3MJ1A 4YUQA 4AU8A 4B99A 4ZLOA 4YZBA 2BIYA 2GNGA 5CI6A 2VO7A 2OF4A 3IDBA 2AYPA 1XH5A 3QTXA 3CC6A 4E3CA 2PZ5A 4L44A 3ZHPC 2YZAA 4RC2A 4QTDA 4V01A 4ZXTA 3FY2A 4D2TA 3MPAA 3PWYA 3VUTA 2XKCA 4R8QA 5ANKA 3TKHA 3T3UA 4FSQA 4ZY4A 3NAYA 4S32A 2XK7A 5EM5A 3PP0A 2P2IA 5DHJA 4BHNA 2UZNA 5AR2A 4CZTA 3I6UA 4FV7A 3VJOA 4BZDA 4L7FA 5HU3A 5CY3A 3TZMA 4BRXA 1QL6A 3VUHA 4CRLA 3DBQA 4CV8A 5LMAA 4YZCA 4EEVA 5L8LA 3UQFA 3PVUA 3GUBA 3LJ2A 2XIYA 4PMSA 3QTIA 2IW8A 1TVOA 3O23A 4GV1A 4QP2A 5IUGA 4I6FA 4A4XA 4B7TA 3G15A 4R77A 3IOKA 1OKYA 3QUPA 3A7IA 4QYHA 2O65A 3BEGA 2C5XA 4FG9A 4J1RA 3FDNA 3KRLA 2JDSA 3OCSA 5FXRA 4NFMA 1H1QA 4GVAA 4EOJA 5KMKA 5IQFA 2R0IA 4FTTA 5T3QA 5L6WL 3EWHA 3G6GA 2GNLA 4CG8A 3ULZA 2VV9A 4RBLA 3L9LA 4CCUA 5BMSA 4HYUA 3UO6A 2I1MA 4FA2A 4KUJA 4GG7A 1APME 4PDOA 4AT3A 4XJ0A 2VTAA 4ENYA 3R9OA 2PVRA 4CFMA 2ITWA 3DB6A 4EH9A 3ELJA 4MXYA 2QI8A 4TYIA 5C27A 3R02A 3A7HA 1LEWA 3F9NA 4YPDA 3MBLA 3MTLA 4C34A 1PXJA 1Y6BA 2HZ0A 4JBPA 3UOLA 2F49A 5BVOA 3E8DA 3ZUTA 3FKLA 1QPJA 4O7VA 2EUFB 3GCUA 4BZNA 2XNMA 4ZJJA 2WKMA 4EZ3A 4HCVA 4IADA 4G3GA 3SXSA 2WHBA 3Q96A 2VTJA 1PXIA 4H1MA 3T3VA 3UIBA 2YAKA 4F63A 3GU5A 3PVGA 4M84A 3CD8A 4O84A 5C8MA 3TV4A 4K9YA 4GW8A 4Z9LA 4AZEA 4BGHA 3VBVA 3K3JA 2V55A 4LQMA 3R22A 5AUWA 3R7IA 5FQDC 2BALA 5CI7A 5EW8A 3S4QA 3TM0A 5DVRA 4WNOA 4RIWA 2OZOA 3PWDA 4FZAB 2C6KA 3C4XA 4A4OA 1WVWA 4PMTA 5FWKK 5JFVA 2OJIA 4C37A 4K18A 1FVRA 4DF3A 3ANQA 3POZA 5CEPA 1VR2A 1GIIA 5HZNA 4GK4A 2QR8A 3O7LD 3QKLA 4IX6A 1Y91A 1H1RA 5DGZA 4EOSA 1P4FA 4FEVA 3UNZA 3TV6A 5CVHA 1FVTA 2YIQA 1Q61A 4LRMA 4BBFA 5I5ZA 5GIPE 1ZOEA 2JDVA 2WQNA 3EOCA 3F82A 5CAVA 5E8YA 3ALNA 5L6PA 4HGEA 4TN6A 4W8DA 2B9JA 3WZJA 4JG8A 4MHAA 2W5BA 5F95A 3ZFMA 1P5EA 3KXMA 3QTRA 3MVMA 3MY5A 5GJGA 4RQVA 4D2SA 4PWNA 4WT6A 4CNHA 5JSMA 4AA5A 4F1TA 5HICA 4WG4A 4EOQA 2BRHA 3F69A 3GP0A 3SVVA 3ZSIA 3SG8A 1NW1A 5IH6A 3QRJA 4NZWB 1OMWA 5ETFA 5L6OA 2E9UA 2VX0A 3DY7A 3LM0A 3DT1A 4R3PA 1UWJA 3S95A 4O0TA 3HA8A 2BHEA 3EFLA 1PXLA 3JS2A 4NFNA 1XBCA 2NRUA 3GFEA 2X2KA 1J1BA 4DGOA 2W1FA 2QLQA 1H0WA 5FDXA 4L53A 5EHYA 2VO6A 5HGIA 3WBLA 3KGAA 3BPRA 4JIKA 3CGFA 3FMEA 4KIQA 4ENXA 3LPBA 2XRWA 3LIJA 4AGCA 2IW9A 3UQCA 4IB1A 1PHKA 3VQHA 3GVUA 3NVMB 2BVAA 4WG5A 3K5UA 5DFPA 2ITUA 3NZ0A 2BIKB 2IZRA 4D1ZA 2WTJA 4PDPA 4LL5A 3OD6X 4E6AA 4USEA 3VS7A 3UZRA 2VTRA 3BGQA 1P14A 3ULIA 1GIJA 4YTCA 2F7XE 3CQUA 3D7ZA 2WU6A 3NUYA 1UV5A 2UZLA 4W4WA 4FX3A 3ZRMA 3S0OA 3PY3A 2C4GA 2P0CA 2UV2A 4FKPA 2LAVA 4AZVA 5GINE 3E8NA 4XNEA 3IO7A 5DR6A 4D2VA 4J96A 2B55A 3EB0A 2ITQA 4FV1A 2QKWB 4NTSA 2X39A 4FV2A 4RJ4A 3OF0A 3FQSA 3GQIA 1H08A 4LYNA 3QAME 3HECA 1T46A 5FEEA 4ZSAA 3DFCB 2W05A 3TZ8A 3RPYA 3R01A 2GS7A 2RFSA 4IH8A 2FA2A 3MYGA 5KMIA 4UY9A 3UP7A 5EOLA 4LV8A 1U54A 5DT4A 4RX9A 3ZLXA 3H0YA 2XJ0A 5JFWA 5AAGA 1IR3A 5LWNA 3OEZA 1RDQE 1WZYA 3MB7A 1BUHA 4JBQA 5D41A 2JFMA 5HCZA 3A4OX 1ZMVA 4X2NA 5CEQA 2J51A 1Z5MA 2YDJA 4YZMA 5DRBA 4AW2A 4WG3A 2XBJA 4C4IA 4AWIA 1BX6A 1PXMA 4GK2A 4YSJA 3FC1X 4RX8A 3NYVA 5FM2A 1Q62A 5ETCA 2IZSA 3ZSHA 3FL4A 4D0WA 3IPHA 3DZOA 2X6EA 3HLLA 3JVRA 4IWDA 4JDIA 4L00A 5CU6A 3EHAA 3GOKA 3G6HA 1JSVA 3ACKA 5A46A 3LCTA 4LG4A 3U51A 4TL0A 3AMAA 2VO3A 3FXZA 2XMYA 4YURA 5K5NA 3RZFA 4OBPA 2BKKA 1FINA 1A06A 5A6OA 3QC9A 3G2FA 2X0GA 4I41A 3NCGA 4IB0A 4O7NA 4GMYA 3AD4A 3WZEA 2JDTA 4GT3A 4E93A 3ZCLA 2KTYA 2W5AA 2BMCA 1SVHA 3FXXA 4FIEA 2B4SB 2PVHA 2WPAA 4B4LA 4JQ7A 2XZSA 3F61A 4TWNA 3GU4A 4FIGA 3W8LA 4WSYA 3A7FA 2E9VA 4BDCA 2J0KA 5F4NA 4D28A 4Q5HA 3GCVA 3OWLA 4AW0A 3GU8A 5GJFA 3HMIA 5M08A 1KSWA 1UVRA 1W0XC 4M0ZA 4YR8A 5KNJA 4ZSLA 5LWMA 4X6RA 4FEWA 4N70A 4O1OA 3ZYAA 2BDFA 2F7ZE 3CEKA 3DKFA 2B52A 4BCQA 5JFXA 5C1QB 4FR4A 1UNLA 3QZHA 4QTCA 3ALOA 3OC1A 2BRGA 2B9HA 4RVLA 1UKIA 4FKGA 2H8HA 1BL7A 3FXWA 4FSZA 3QUDA 3AC4A 3DKGA 4QMZA 3ZU7A 4DYMA 3BIZA 3MB6A 3DBDA 3HMOA 3KXZA 1OUYA 4E8AA 4ACMA 3EN5A 4PRJA 2IJMA 3MH0A 3DBEA 3ERKA 4AP7A 2VGPA 4O27B 4ZIMA 5C01A 4ASDA 3PA5A 2YIYA 5BX0A 4K2RA 3MFTA 3W2SA 3VS4A 5EDQA 4RVMA 3ZO2A 4A9RA 4PP9A 1L8TA 5JRSA 4I4FA 1ZZ2A 4U42A 2X9EA 2ONLA 4ZJIA 3G5DA 2JLDA 2BAJA 2JDRA 3KXGA 4LL0A 4GS6A 4O83A 4MXOA 3K2LA 4YO6A 3ORTA 5CAUA 4BIEA 5JGBA 5L2IA 2C30A 3M42A 4PTCA 3DA6A 1URWA 3D4QA 3MH2A 4WNKA 3ZRKA 3OBGA 4S30A 3HRCA 4F9CA 3ATTA 3N4TA 3U6JA 4ALUA 4BDJA 3L9PA 4S34A 1VZOA 2Z7SA 1PKGA 3AT4A 3HVCA 4FT7A 4HOKA 3MY0A 1CKPA 2VTNA 4EUUA 1RW8A 3S3IA 5CS6A 2CGWA 2GNIA 3LE6A 5J87A 1Z9XA 3F5PA 1V1KA 4FTQA 5BVDA 4N6YA 4U41A 4HW7A 4XV3A 3F5XA 3Q5ZA 3P5KA 3NW6A 4IAAA 3DZQA 4BDFA 3GC0A 5DNRA 2ZM3A 4EBWA 1JBPE 4GIHA 2W1CA 2HW6A 4O21A 3EZRA 3FMNA 3AMYA 5IG1A 4QYFA 5LMBA 2W99B 2YITA 2WMWA 3F7WA 4MVFA 3CBLA 5EOBA 5ETIA 4JVGA 4MD7E 4EH6A 5KMNA 2W1IA 5CSVA 3EKNA 3CTJA 4P2KA 4DN5A 5DH3A 5EW9A 5J1WA 3QQKA 1JSTA 2VWIA 5BVNA 1K2PA 3RPRA 2R3OA 5H9BA 5M44A 5FTGA 5DMZA 1H24A 4CGAA 4X7QA 4EWHA 4OTRA 3KRRA 3RZBA 3UMWA 3C0GA 3F7ZA 3QFVA 4F9WA 4FIHA 5B7VA 3DV3A 4H36A 2VWWA 1GAGA 3QXOA 2UW4A 5H8GA 4JBVA 1S9IA 5BNJA 3ZLYA 4IVBA 2R2PA 5FXSA 1MQBA 2Y7JA 2C68A 4FKJA 4CFXA 3RAKA 3ROYA 5JGAA 3DFAA 3EN4A 5M56A 2J6MA 2C6MA 5AAEA 4QOXA 4I6QA 3IS5A 4IC7A 3VRYA 3RINA 5AP3A 4C35A 3QCQA 4YTHA 5EI8A 2VTSA 3R1SA 3DDPA 1I09A 4FGRA 4IWOA 2X2MA 3VS3A 4DH3A 4FTNA 2X4FA 4OT6A 3EL7A 5CNNA 2XJ1A 5GJDA 3H3CA 4D4RA 4F6SA 4NM0A 2JIIA 3EL8A 4BI1A 2HENA 4HZSA 3QTWA 1T45A 4B0GA 4BCPA 5JEBA 4RWIA 5G1XA 2YCRA 5IQGA 3H9FA 3W32A 3BQRA 2YABA 3KCKA 5CAQA 5FG8A 3RMFA 5CU0A 5D10A 2NNWB 2EXCX 2ZAZA 2YDIA 4GCJA 3CQEA 2C5OA 3A4PA 4FT0A 4EOLA 4RC3A 4IACA 4Y5QA 3UC4A 4HVGA 3PXYA 3F3UA 4K6ZA 3C4CA 3TZ7A 5IDNA 3PPZA 5AIKA 3QALE 1REKA 1U54B 3RP9A 5ICPA 4O0RA 2Z02A 4FSUA 3QCYA 3FLWA 3EFKA 1QPDA 2BZIB 2F9GA 3MN3A 4L68A 1R0PA 5M4CA 3C1XA 3OY3A 3E92A 3NX8A 3QWJA 2WMVA 2HW7A 4MBJA 3QTSA 3E8CA 3NGAA 1IAJA 4GSBA 3SRVB 2FUMA 4MF0A 5K9IA 1YHWA 5FP6A 3VWAA 1K9AA 1YQJA 3MFUA 4TYEA 2XYUA 5B2MA 5E8SA 5AEPA 2R9SA 5IZFA 2FSLX 5J8IA 4QMQA 4MEDA 4BC6A 3P1AA 3MWUA 3D5VA 1TKIA 3L8VA 2OJFE 1IEPA 4BR3A 2W4JA 1UNHA 2C6OA 4BBMA 2J7TA 3GEQA 5FM3A 5C8NA 1PXNA 4RJ3A 4DFLA 3G9NA 4G6OA 5H8BA 3GFWA 3BCEA 4H58A 5IH4A 1L3RE 3L8SA 3VBQA 4UV0A 3HKOA 2O5KA 2UW7A 3I60A 4RG0A 4S2ZA 5BVEA 3TNQB 4ASXA 2PUIA 2X7OA 2IPXA 5E92A 2QQ7A 1JLUE 1OGUA 4G31A 4CXAA 4D1SA 5T68A 3BYVA 1OPJA 4M97A 4QPSA 4DTKA 4UXQA 4GJ3A 4UYAA 4FV6A 3FZTA 2UW0A 3NW7A 4BDIA 2Y6OA 3KMMA 4R5YA 1KE8A 2WQEA 5CZHA 1Q97A 4AFJA 2IZUA 4YHFA 4QMOA 5JFSA 1DI8A 5IA4A 3LCDA 5LVNA 4MXAA 4GFGA 3SAYA 2OJJA 2JBOA 4G3EA 4ZLZA 3SW7A 4XG9A 2E9NA 2ITVA 2PVKA 3KC3A 3PLSA 4O1PA 5CF5A 4GH2A 4L67A 4G3DA 4PQNA 2PVJA 3E62A 4BCIA 1NVSA 1KWPA 4RT7A 5CTPA 3UVQA 3TT0A 5BMMA 2VTOA 3I4BA 3V8SA 5BVFA 4C61A 4E4NA 4OTQA 2RG6A 1PKDA 2OLCA 1J3HA 3GC8A 2BPMA 3HEGA 3QTQA 5AR5A 5HO8A 1XBBA 2VAGA 2UW6A 3I0OA 4XEYA 5EFQA 1U5RA 4HYSA 4O7RA 5JRQA 4QYGA 3ETAA 2ITXA 4GU9A 2YA9A 5FBOA 1B38A 3CE3A 3PJCA 4M7IA 5H3QA 4EH8A 2PY3A 3ACJA 4EZ5A 2XK8A 3FPMA 1M2QA 4JXFA 3LFQA 5IQEA 2Z2WA 2UZVA 4OTDA 2QOOA 4D5HA 5DYJA 3W2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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