1XBCA

Crystal structure of the syk tyrosine kinase domain with staurosporin
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
274
structure length
268
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A novel mode of Gleevec binding is revealed by the structure of spleen tyrosine kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 268
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2004-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1xbcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1xbcA01
2X2LA 3KXNA 3LFAA 3NX8A 1JKKA 2GDOA 1XH6A 3FXZA 4HVDA 4O7SA 3RI1A 2G01A 5HE3A 4DFLA 3WILA 1NW1A 5L2SA 1PXPA 2CMWA 2ITYA 2W1HA 3KF4A 4XH6A 3E3PA 3ZDIA 2OJ9A 1Q5KA 4QTBA 3P5KA 2CSNA 4JG8A 4U97A 3COIA 3MBLA 4JDKA 4RIXA 4EQCA 3SLSA 5J1WA 4ZXTA 4CG8A 3JPVA 3OOGA 4UZHA 4QMOA 3EFKA 4FT5A 3B2WA 2ZV7A 4G6NA 4IXPA 4IAKA 1BMKA 2BUJA 3MIAA 5AP7A 2YIQA 2J50A 3R1QA 3RNYA 4GU9A 4AGWA 2CCIA 5A14A 5E9EA 4O7YA 1H27A 4KBAA 2QOBA 3VF8A 4BBEA 3LHJA 3ZSGA 2C0TA 4C33A 3QL8A 3V51A 5HVJA 1FQ1B 4RZWA 2R3OA 5KBRA 4H3BA 2UW4A 2R3KA 3HRBA 3OWJA 2EVAA 1OIRA 2OBJA 3W2PA 3OT8A 3QBNA 5AP6A 3K2LA 3F3VA 1URWA 3BWFA 4DFYA 4B9DA 4EOPA 4YPDA 5DHJA 5C8KA 2O8YA 4M13A 5JZJA 3FZTA 3LFQA 2GFCA 4NUSA 4GL9A 5AR4A 5L2WA 4RFZA 3QQHA 3LCDA 3FUPA 3VBWA 4N6ZA 4D0WA 4V04A 1Q8ZA 4ITJA 3GNIB 5DIAA 3G33A 2I7QA 1ZOEA 1P14A 4WO5A 3SHEA 4E1ZA 3ODYX 3PP1A 3RPSA 3LFCA 4W4WA 3W2CA 3Q9XA 1BYGA 1XHAA 4BCJA 4AN3A 3GEQA 4Y8DA 4ZSGA 1BL7A 3CGFA 4S32A 4R7BA 4RLLA 3E63A 4FIJA 2REIA 3PVGA 3VRZA 3NRMA 3HP2A 5AV0A 4FTCA 4D55A 3LMHA 3DBDA 4AZWA 5KMLA 4M97A 2HZIA 3IGOA 4GT5A 4G3CA 4ZSLA 3UIXA 3EN7A 3EKKA 2ZM3A 4JL9A 2QOCA 3DK3A 4KUJA 3SOCA 3H0ZA 3BHHA 3W32A 4EHZA 3TZ7A 3UQFA 5IZFA 1YDTE 4BDJA 4OAVB 3TTJA 4BHNA 4F0FA 2BR1A 1Q24A 3TDWA 2P0CA 4KBCA 2VO3A 4XBRA 1ND4A 4FTMA 3CGOA 4LQMA 4O38A 3TUDA 2O65A 1OUYA 3NDMA 3QWKA 4XX9A 3F3ZA 3HAMA 4O91A 5C4LA 4LRKA 3ZYAA 4UX9A 1IAJA 2Z7QA 5EW8A 3OY1A 5JN2A 5IKWA 3L8SA 3V5PA 4NJDA 2XH5A 4BDCA 4QYFA 4EONA 3PUPA 4MBIA 4LM5A 2PVFA 4FV8A 3ZM4A 2VAGA 4D9TA 1M2RA 3C4FA 3TTIA 2G1TA 4EBVA 2BRBA 5CT7A 3D15A 4DC2A 1BI7A 4DCAA 2CCHA 5FXQA 3CKWA 3MWUA 4E73A 4D4RA 1Q99A 3ZZEA 3TV7A 1GZKA 5HIDA 5LVMA 4JIKA 3ET7A 3A7FA 3LFSA 2XYUA 4K2RA 2UZWE 2IZTA 2CGUA 1YRPA 4GW8A 4Z3VA 2XCHA 1CTPE 3F2RA 1T46A 2XB7A 5AM6A 4GUBA 4LUEA 2VWYA 4D1ZA 1U54B 2OF2A 3A4PA 4GFOA 2YABA 2O64A 4GYIA 4MAOA 2YM3A 4X2GA 2UZTA 2XNMA 4EOLA 3DKOA 4FVQA 4RA4A 2ITQA 5BVEA 3ZO2A 3S95A 2DYLA 2IG7A 4PP7A 1MUOA 2X6EA 3PSCA 5AMNA 2RL5A 3BBWA 3P9JA 4AXAA 3OCSA 3R8VA 3AG9A 4HVGA 3R63A 3I60A 4TYGA 4IZ5A 4V0GB 2PVNA 3CP9A 3NWWA 4O0VA 3WZKA 4WNPA 2CNUA 3GCVA 5B2MA 5L2QA 4J52A 2YIRA 5B0XA 3TWJA 4X6QC 2WMSA 3TL8A 3EQFA 4YJTA 5AP1A 4N57A 2WIHA 3K3IA 2J0JA 4XCUA 4EOSA 1UNLA 2W1GA 4FTKA 4RJ8A 1L3RE 1ZMWA 2PZRA 3NGAA 4FSUA 1TQIA 2ITWA 3FKOA 3COHA 2E9VA 2GNJA 4FEQA 2W1EA 4FK6A 5HCZA 2WMXA 3HDMA 4G9RA 5HOAA 4GJ3A 5EYDA 3ZONA 4EI4A 4CKIA 3EL7A 3PTGA 4XV1A 2JBPA 2GQRA 4O21A 4M69A 5M4FA 5FTGA 4WNKA 3GU6A 3QZGA 4FTUA 4EHVA 4FZ7A 3HUCA 3OD6X 2JDOA 2YM4A 4XG6A 4BYJA 2WAJA 2FB8A 3EN6A 4EUTA 4UMRA 3QKMA 5LARA 2WTCA 4C34A 4I4FA 3DXNA 1W83A 3LJ0A 2V22A 3PA3A 4G6LA 3NR9A 3F82A 4RIXB 1P4FA 4HZRA 3ZUVA 4C4GA 5CI7A 2R0UA 3A7GA 5BYYA 3U54A 4DITA 3G9NA 1Z5MA 3H30A 3SXFA 4FKVA 4AGCA 4IBMA 5EM7A 1OECA 1FGKA 3OCTA 2QG5A 4RJ7A 3W8LA 4TWCA 3O0GA 4PNKA 3TKUA 4I0SA 3QHRA 4EHEA 4EZ3A 3CY2A 2F7EE 4FTQA 2WOTA 4RWLA 1DAYA 4C61A 4IAIA 4X2FA 1P2AA 1FVRA 2PWLA 5IA5A 3TCPA 5ANOA 1I09A 5T68A 5HD4A 5DYJA 1ERKA 1H26A 4QP3A 2VWWA 1H0VA 4QNAA 4U79A 5FP5A 2C1BA 3THBA 1UU8A 3R01A 5CNNA 5DMZA 2XKFA 4NTSA 5HGIA 5EI8A 5A46A 2YAKA 4BB4A 4DT9A 4FOCA 4UWYA 1MQBA 2IW6A 2Y4IB 3GU5A 4XP2A 1U4DA 3L8PA 3E92A 2HENA 4RRVA 5GNKA 4KRDA 5A3XA 2YZAA 4HYIA 2YCFA 2FVDA 4IACA 3R00A 3VS1A 2CKPA 4FV5A 3FZOA 5HO8A 3OZ6A 4HVIA 3LLTA 1TKIA 2R3PA 3PLSA 3OXTA 4RJ6A 4WA9A 1H1SA 2XIZA 3ANRA 3BHYA 3CD8A 3EN4A 1QMZA 1UU9A 4U42A 4W8EA 4YJRA 3VW8A 4ACGA 5IG1A 3N9XA 3RK5A 5CU3A 5FM3A 1DM2A 2OJJA 3G9LX 4MK0A 3UC3A 4XOYA 5AP0A 1FGIA 3QWJA 4I6HA 3V5WA 5AJQA 4DH5A 4MNEA 2P2IA 3PE2A 3HV5A 1E9HA 4YBKA 2WZJA 4IC7A 4HVHA 1JSTA 3RAHA 3H0YA 5CSHA 4S31A 2JFLA 4A4XA 1IG1A 3QD3A 4TN6A 3ORIA 3PJ8A 4CT2A 3TNIA 4IAYA 3BHUA 3BKBA 5E8YA 1R1WA 1OIYA 4EL9A 2G2FA 2NPQA 2YM7A 4EOOA 4FKSA 4C4JA 2UW3A 1OUKA 5DRBA 4CD0A 5BUIA 4IB5A 4L45A 4EOIA 3MVMA 1KV2A 2YZLA 3OXIA 4B6LA 5HBEA 2JKQA 2Z60A 3H10A 3BWJA 5FP6A 5BVDA 3RM6A 1G5SA 5KMOA 4G17A 4E4LA 3DFCB 2BTRA 3MPTA 3FMNA 4FKJA 3QD2B 2XRUA 3F9NA 3A7JA 3ZLWA 1JPAA 3FL5A 2SRCA 3ENMA 3LQ8A 2ZV2A 2I6LA 5JQ5A 3PFQA 4PX6A 4CTCA 2GFSA 3LE6A 2JAMA 3FLWA 4ERWA 4EWHA 4Z7GA 5AUTA 3KXGA 3NIZA 1OGUA 2X4ZA 3CXWA 3GT8A 4FV4A 3GC0A 4U81A 3FSKA 2O5KA 4ANLA 2E9PA 4I5PA 1F5QA 3PIYA 5IMXA 4R5YA 4MX9A 4YP8A 4R77A 2BHEA 1ZMUA 4EYJA 4R1YA 3BU6A 3SGCA 4PTCA 2H6DA 2UVZA 3NUAA 3WF5A 4D9UA 3CPBA 2IPXA 4BHZA 3GFWA 4F08A 5AUZA 2J51A 4CVAA 3Q2JA 3DLZA 3VBXA 2UW9A 3IKAA 3VUHA 3PXZA 3ZEWA 2JD5A 4NKAA 5JH6A 1ZXEA 3DCVA 3EFJA 3R7GA 4GFMA 3TV4A 3PXFA 4M8TA 2EWAA 2CKEA 3FMLA 3UO4A 3SG9A 4BDGA 2X2KA 3DT1A 4ANOA 2YAAA 2XKCA 3IQ7A 3BGPA 5AR5A 1O6KA 3ZFXA 4DFUA 2VUWA 3MYGA 4RC3A 2RFSA 4PMSA 4LUDA 4TXCA 3OTVA 3CR0A 3RP9A 4NL0A 4FMQA 2NRYA 3GU8A 4Y5HA 2ONLA 4OT6A 4Q2AA 5J7HA 5ANEA 3VVHA 5KUPA 3UOJA 3V3VA 4ZTRA 4YSMA 5L6OA 4Q9SA 1OVEA 4MH7A 4O0RA 4LOOA 3S1HA 1NVRA 2C6DA 4I20A 3FQEA 4EC8A 4IAZA 3ORKA 1Y8YA 4DYMA 1U59A 4G5PA 2BIKB 1SYKA 4O83A 4L42A 2C6EA 3R7VA 5DN3A 4NK9A 3DDPA 2IN6A 4CRSA 4X3JA 4TWOA 3K5VA 4UV0A 5A4CA 5HU3A 4YJSA 3IW6A 3BYUA 3R1YA 4YZDA 2YJRA 4CFWA 2XKEA 4V01A 3TKHA 2ESMA 1GJOA 1H1QA 4C7TA 4K0YA 1V0PA 3MFUA 3RVGA 4QD6A 4RVKA 3FC2A 3TACA 3OROA 1VEBA 4IZAA 5LCKA 4TRLA 5A4TA 3MY5A 4TYIA 2OH4A 3FZPA 3VJNA 4BF2A 3EFWA 4MCVA 3EB0A 1CKJA 3GGFA 3FWQA 4UZDA 3FI3A 1W82A 3F61A 3KB7A 4FIIA 4EOKA 4L68A 5HCYA 5M57A 3O8PA 1GIJA 3S3IA 3QD0A 3VF9A 5IEYA 5F94A 3F3UA 2C5NA 4BDBA 1JWHA 5JRSA 1ZYDA 2UVYA 2Z02A 4L53A 4QP2A 3UODA 2R64A 2FH9A 3CCNA 3U55A 4AWIA 4WNMA 4W8DA 4WNOA 3U6IA 1AD5A 2W1IA 3E8NA 1W0XC 3AC2A 2E2BA 2VN9A 3E62A 4WSQA 4NH1A 4DG2E 5JK3A 5E8WA 2J2IB 2WKMA 5IQIA 3DV3A 4D28A 3BBTB 2HXLA 5CTPA 2WTJA 2XNPA 1OKYA 3BCEA 2GPHA 1I44A 3DQXA 2UZDA 4FA2A 4QTDA 1FVVA 2B4SB 2XRWA 4QTCA 5EI2A 5FRIA 4UMPA 4K11A 4R3PA 4FTTA 4BDHA 1BLXA 5AUUA 5IUIA 5JT2A 4JBQA 1ZYCA 2XK6A 3EJ1A 2WOUA 3OWLA 3MY0A 4AE6A 2YLFA 5C8MA 2OWBA 5DWRA 4X2JA 3TUBA 5E8UA 3KULA 3QXPA 3REPA 2OK1A 4LMUA 5DA3A 3NYNA 5HD7A 5J87A 4U0IA 2QD9A 4LV8A 3OT3A 2W9FB 3F5XA 5KMIA 3P7AA 4D1SA 1PYXA 3E3BX 3G0FA 4G3DA 2YWPA 3FBVA 5D11A 3DTCA 2PMNX 2WMUA 3C7QA 2C3KA 2HWOA 4FICA 2QKRA 4JI9A 3OF0A 5E90A 5E8TA 5FXRA 4O7NA 5FGKA 4XV9A 3R7YA 4FEWA 4E4NA 3QQUA 4I5MA 2YM8A 4JAIA 4YLKA 4WIHA 1FPUA 2XF0A 4AX8A 3FHIA 2C68A 3FXWA 4QQTA 4FEXA 3OEFX 1UWHA 5D12A 1H28A 3D7TB 5HIBA 4DEDA 2RF9A 2OFUA 1WCCA 5LMAA 3MA3A 3Q3BA 5EYCA 3OHTA 3TJDA 3VS0A 3JR1A 4U9AA 3CQEA 3KEXA 5LCJA 2QO9A 2R3LA 3ZEPA 4EWQA 1PRYA 4CLJA 4G3FA 2ONLC 4CYJA 2YJSA 2W06A 3Q4CA 2PU8A 2Y6OA 1Q41A 4YO4A 3IW4A 1BI8A 5I3OA 5I9VA 3BZ3A 3SKCA 4QOXA 4YTCA 2Y9QA 3RAWA 4A4OA 1PXLA 4U43A 3WBLA 3S2PA 3WF6A 5KMJA 4F1OA 5DGZA 1H1WA 4NIFA 3ZLXA 4AZEA 3EQGA 5B2KA 3TG1A 3DXPA 3HECA 3ZRMA 5AA8A 3Q6WA 1P5EA 4P5ZA 2XIXA 3WZJA 4RVLA 3VW6A 2XK9A 5DR6A 5HE1A 4EQUA 3UO6A 3LJ1A 3VS2A 2WHBA 3D94A 2GU8A 4DTBA 3CPCA 3RM7A 4F7SA 4YC8A 2YCRA 4TYJA 3QRJA 3MFRA 4A07A 5E91A 1UNGA 1WFCA 1PXIA 1XBAA 4MQ2A 3TZ8A 4ZY5A 1OKVA 4W4XA 4EH6A 3Q9YA 4MXAA 3HEGA 4YJUA 3DJ6A 4NTTA 3Q5IA 4MD7E 4DA5A 4TWPA 4ZK5A 4C62A 4HJOA 3KVXA 3MB7A 3DJ7A 2WD1A 2X8EA 1ZYLA 4FIEA 5DEYA 4GG7A 4E5WA 2R7IA 5CAQA 3MTLA 5AR3A 3UQCA 3R7UA 4QMUA 5FTOA 4BR3A 3GOPA 1J7IA 3HRCA 2C4GA 2ETKA 4PQNA 3V5LA 2PZYA 3T3VA 5HVYA 1O6LA 4KKGA 1LP4A 2YM6A 4C58A 5LXMA 3FYJX 3EQRA 3VBTA 2IZSA 3HP5A 3QALE 3AT3A 4DEBA 5IEXA 5K9IA 4FF8A 4O0XA 4O7WA 5AV3A 3ODZX 3P23A 2GTMA 3JY0A 3UIBA 4C37A 2BILB 2G2HA 4UN0C 5HLNA 2OW3A 4PPCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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