1YOJA

Crystal structure of src kinase domain
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
273
structure length
233
Chain Sequence
EIPRESLRLEVKLGQGEVWMGTWNGTTRVAIKTLMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMSAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVAPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of active SRC kinase domain complexes
pubmed doi rcsb
molecule keywords proto-oncogene tyrosine-protein kinase SRC
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 233
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yojA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yojA01
5JZNA 4F0GA 4O7ZA 1YKRA 1KOBA 4OAUC 3BX5A 3Q04A 4UWCA 4AT3A 3LM5A 3RCJA 3H0ZA 2W7XA 4M84A 4APPA 4RQKA 1Q8ZA 5CALA 1UKHA 3VS2A 4EWQA 1A48A 3L9PA 2ZB0A 4MK0A 3HV5A 2PZ5A 3SW4A 4BGQA 1BUHA 2XBJA 2P55A 3VS0A 5IISA 4EQUA 5IA0A 3DAEA 5L4QA 4FG9A 1Y6AA 2W1GA 4AT5A 4YUQA 3A4PA 2C3IB 4HYIA 4MH7A 2C6MA 3UVPA 3O51A 3S1HA 1LEZA 3R7IA 1UVRA 2GS6A 1WCCA 4FSUA 3VUHA 2OICA 2YM4A 2JDOA 2J0MB 2XA4A 3KEXA 3KY2A 4RIWB 3POOA 1Y91A 2B9IA 3HRBA 3EKKA 1OIYA 5HD7A 4O7SA 4E4MA 1EH4A 3FE3A 3MSSA 2CNUA 2EVAA 4A9YA 5DR9A 2YCSA 1OPJA 2UW9A 4X2FA 5BVWA 2BR1A 3ETAA 4GL9A 2WU7A 4XG8A 4D4YA 3EMGA 1QPJA 4IZYA 5KMOA 2VTMA 4AFEA 5FLFA 3FAAA 2QOKA 4NFMA 4C4GA 3FZRA 3RPOA 3C0HA 3ZONA 5HU3A 4ZSLA 1PMVA 3UBDA 1MRVA 4N0SA 5A6NA 4J53A 1YQJA 2R7IA 2ONLA 1ZZLA 1O6KA 2OXXA 2X2MA 3DB8A 1XBCA 3LPBA 2CPKE 2VNYA 5EM7A 4DFNA 3AT3A 3D5WA 3MI9A 2VWWA 4UMTA 4OTHA 4EHEA 5KCVA 3LE6A 2PUPA 5I0BA 3QUEA 4KKEA 1BKXA 2XK9A 3ALNA 4XV2A 3FI3A 4L7FA 2IVTA 5AM6A 2XYNA 3DFAA 3EYHA 3ZHPC 4F1MA 5FQDC 3CJGA 3RM6A 5HHWA 1H07A 4UWYA 2J9MA 3S95A 4UBAA 3D7TA 5A9UA 4RZWA 4N57A 4PMSA 4F08A 3GC7A 2PHKA 3NZ0A 3OCTA 3CD8A 4YLLA 3BYUA 3IPHA 2P4IA 3W2SA 4CGAA 3BRBA 4P5ZA 4JDHA 4EL9A 3MVHA 5DRDA 5A4LA 4H3QA 4IQ6A 2FSOX 2XNNA 3G33A 5BMMA 5IH4A 2OF2A 3LCSA 2UZVA 4S30A 2PL0A 3KVXA 3VW8A 4RG0A 3FYKX 5FDPA 3TG1A 4XG9A 4JR3A 3NYOA 3BGZA 3D5VA 3G6GA 3M42A 2QHNA 3Q4ZA 2VGPA 2C6OA 3QD2B 4TWPA 5IA5A 2R3GA 3UE4A 4G3CA 2QR7A 3Q6UA 3AT4A 1JQHA 3QHRA 2XJ0A 3W2RA 4J95A 4O0VA 4XYFA 4ITIA 1ZMUA 4MCVA 4WA9A 4EH4A 4RIYA 3COMA 1ZMWA 5D7VA 2HK5A 4FV3A 3ZYAA 4C59A 5IPJA 4UZHA 2Y4IC 4ANSA 3DKCA 3OXZA 3RM7A 3FC1X 3S0OA 5AMNA 3O8UA 3BWFA 4EHZA 5M07A 3QD4A 4O0RA 1RE8A 2QONA 2W4JA 4HW7A 5T68A 3KQ7A 1NW1A 5CU4A 3AQVA 5K0XA 2OJFE 2ITNA 4ZS0A 3OT3A 3FL4A 4KUJA 3T8OA 2FSLX 4O2PA 4UMPA 1WBTA 4QTCA 3RZBA 1FINA 5LOHA 3ATSA 3FEGA 4BR3A 2UUEA 5KNJA 2VTNA 3TJCA 1DS5A 4AAAA 5HBJA 4BN1A 4A4LA 2GQRA 4YSJA 2CGVA 3AD4A 3EFJA 4FT0A 3OG7A 3V5TA 5J1WA 3NUXA 1O9UA 5K0KA 2JLDA 4C3FA 4E5BA 2PE2A 3M2WA 1J7LA 3G90X 4C36A 4IX3A 5HIDA 3VQUA 3E92A 1ZY5A 2XIZA 4DGGA 1FGKA 3A8WA 4CT2A 2QODA 1O6YA 4LFIA 2I1MA 3DOGA 3QC4A 3D15A 3SRVB 4EH5A 2IZSA 1UU3A 2EXCX 4FEVA 2XBAA 4KKHA 4Z7HA 1CSNA 1H1SA 5CEQA 5CAQA 1M52A 2IZUA 4I41A 2GNGA 3FXWA 1XH7A 3EN4A 5BX0A 4RIOA 2UVXA 2WOUA 3MA6A 3SOAA 2O8YA 3ZO2A 4NK9A 2IN6A 3QBNA 2XK8A 4YC8A 4YZCA 4G17A 2BUJA 2QHMA 3IW6A 4NKAA 2PPQA 1UA2A 1HOWA 4GK2A 4J8NA 4RWLA 4FSTA 3LZBA 3D94A 5EG3A 1H01A 3WZEA 1XBAA 3H9FA 2P33A 4IHPA 4CG9A 4HZRA 4I6FA 4TKSA 3OTUA 3GP0A 5HIEA 5CF5A 5FM3A 3C4XA 1GIHA 1G5SA 3AT2A 1XBBA 2P2HA 2V7OA 4BIDA 3JVRA 3PA4A 2WQBA 3W2QA 5C8KA 3DLSA 4WG5A 3V5PA 5LXMA 4M7IA 4PL3A 1MP8A 2REIA 3Q60A 1OL6A 3PXQA 2GHGA 1X8BA 3IW4A 3ORPA 2W06A 4CYJA 3ZOSA 3GT8A 4EH6A 1SYKA 3TTIA 4BDDA 4EORA 4O91A 1S9JA 1Q3WA 2WO6A 3VUMA 5DFPA 4K33A 5FEQA 3D14A 3NUSA 4R6VA 4UEUA 3E64A 4D1SA 5LMBA 3ZO3A 1GNGA 2FB8A 4XBRA 1R1WA 2QOFA 2JKMA 4UB7A 2EU9A 3B2WA 2EB2A 3G9LX 3BZ3A 4EH2A 4FSYA 2PSQA 3R22A 3UYSA 2XK4A 4MXOA 5EYMA 4U44A 3F7ZA 3W55A 4YP8A 5I9WA 1J91A 3A7JA 4BKJA 5ANGA 3FI2A 2BVAA 2VO0A 2WQEA 3PE2A 4FTUA 3DPKA 2YABA 2FSMX 1RQQA 1BMKA 4MNEB 4OTPA 4UYAA 3R0TA 3NUPA 2PVLA 3R8PA 3QTQA 5CSWA 4IVBA 3QXOA 1OGUA 3Q4UA 3QQJA 4FZFB 3F5XA 2ITTA 2OU7A 4JDJA 4B7TA 2BAKA 2JD5A 2OXYA 4NWMA 5HVKA 2ETMA 1OVEA 4Z16A 1M2QA 4Y85A 4CFFA 3S00A 4DEGA 3DNDA 4NM7A 4EC8A 4FTIA 3DKGA 3FPQA 4IB5A 5E8YA 4QMOA 3CQUA 1STCE 4ERKA 4I0RA 2IW8A 4AOIA 1YI4A 4BRXA 5H2UA 5IQDA 2A0CX 3EWHA 3F5GA 3MJ2A 3DB6A 3E88A 4BDCA 1JSTA 1RJBA 4J7BA 4L67A 2XZSA 3NLBA 2HXLA 4P4CA 4O1OA 4U6RA 3DU8A 3ZUVA 3PE1A 1JOWB 2UZEA 4HPUE 5CF6A 2P3GX 1XO2B 3HUCA 5T3QA 4CVAA 3K3JA 2R0IA 1OECA 2V0DA 1WVWA 3GB2A 2XCKA 4MD9E 4MQ2A 3WIKA 3E62A 2F4JA 2OXDA 3CKWA 5AUZA 4MX9A 1IASA 4IWDA 3TIYA 5CEPA 4G2FA 5DA3A 3QCQA 4YHJA 3H30A 3IW5A 3PXYA 3FUPA 2ZV9A 3PJ2A 5LMAA 4D1ZA 4FKOA 1UKIA 3SC1A 3PIZA 3Q4CA 4DGOA 4H05A 3II5A 3C51A 3AC8A 3IGOA 2QC6A 3JS2A 3CE3A 4UN0C 2O64A 3FPMA 2HW6A 2VTHA 2WMQA 3C4FA 1H25A 4U41A 3P7AA 3COHA 4FVQA 3MWUA 4OBQA 4CRLA 3TN8A 4GV1A 5FTOA 3R9NA 3VS5A 5JRQA 3ROYA 2F7XE 3DS6A 3OXIA 5HG5A 1LP4A 4CRSA 4DFUA 4FNZA 1GZOA 4USDA 5AV2A 2DYLA 3PXZA 4XP3A 5IUGA 4FKTA 5M4IA 2XM8A 5C27A 2I0EA 5CF8A 4JR7A 3NR9A 3PXRA 4F9BA 4DA5A 4CZTA 2VTTA 3JPVA 4CNHA 1XQZA 4WRGA 3OC1A 4FTLA 4O7VA 4C4JA 3HVCA 4A7CA 1JSVA 3F3ZA 2NRUA 4XG7A 5I9ZA 4IM0A 2FGIA 4UXLA 4XLIA 3DLZA 3U9CA 4ZXTA 5ICPA 4IBMA 3BGQA 4KA3A 5DT0A 4HGEA 2PVYA 2V22A 4GT5A 1SVGA 5EYKA 3UJGA 1NVSA 4DGMA 5BVFA 4Q2AA 1YXXA 4IFCA 5LCJA 3MN3A 3W2PA 4ZMFA 4LV5A 1P4OA 5JSMA 5F94A 5AFVA 3MTFA 4PTGA 5K5XA 5I9XA 5IH6A 4I5HA 4PRJA 4L3JA 4R7HA 3HMPA 4Y46A 3LXLA 1Q8UA 3PUPA 3Q52A 4I22A 5AUTA 5B2LA 3KRJA 3A7IA 3LHJA 3NWWA 3DKFA 5KMNA 4HNIA 5ANJA 3ZTXA 4QMTA 4J98A 3TZMA 2WTWA 3V6RA 4GKIA 3SQQA 4R5YA 2I0HA 4YJSA 4IMYA 4YC6A 1OL5A 1ZYDA 5DGZA 1QPDA 2DUVA 5AP0A 1SVHA 3VQHA 3BIZA 3GC9A 4ALVA 2B4SB 3HV3A 4FT7A 3OWKA 4CFUA 2Z7LA 2ZV7A 4E4NA 4XX9A 4ENXA 4F0IA 4NCTC 4FL3A 3MV5A 3R9DA 4H3PA 4Y8DA 3ANRA 2YIRA 3NX8A 4ANLA 4BFMA 1YOMA 3QGYA 2RFNA 4OAVB 4QP8A 1PXIA 3LJ1A 3SDJA 2OWBA 3VBXA 3LFCA 5EM5A 2WQNA 3ZDUA 5IA2A 2GSFA 3AGLA 5HESA 4YHTA 2OI4X 2OGVA 3MIYA 4FIJA 1W84A 4FTJA 3VBQA 2QKWB 4I20A 5KZIA 5AP7A 5CF4A 4F9YA 4RX8A 4Q5EA 3E8EA 1OKZA 2Z7QA 4XLVA 3QLGA 3SXFA 4F64A 4NM3A 2WOTA 2JIIA 4GEOA 4Y5HA 4GUBA 3RNYA 4D4VA 3TKIA 1PHKA 5CVHA 3MDYA 2AC3A 4KBAA 3V5WA 3FLNC 1HCLA 3F2NA 2BRGA 4S31A 3HX4A 2DQ7X 3A99A 1Z57A 4XG4A 3P7CA 1VJYA 4QP9A 5AUXA 4BTFA 3QF9A 1KE7A 4NSTA 4AZWA 2GNHA 4W9WA 1TQIA 3IDBA 3R28A 5E7RA 4MXXA 4XBUA 4EOQA 2UZLA 5FM2A 1OBDA 4R77A 2VO7A 1B38A 2JBPA 5HIBA 4TYEA 2VTAA 4QTAA 5AX9A 3N4VA 5CANA 2B0QA 4CFNA 1FVTA 4NT4A 4F7JA 4FKPA 5IKWA 3RK9A 3W2CA 4C3PA 4QMXA 3IW7A 4AUAA 4JXFA 3KRRA 4IEBA 3UIMA 5CEMA 2WGJA 2QOQA 1L3RE 2PUIA 3U55A 1YHWA 3NGAA 4O83A 3EZRA 2XNBA 4LV8A 2A27A 2YZLA 2QU6A 2RG5A 4YLJA 2WQMA 4L52A 2YLEA 3A7HA 4JJRA 5IZFA 3RAKA 4EOKA 3R02A 2HCKA 4IXPA 3G9NA 3W18A 1UV5A 4BCKA 3QTUA 3TCPA 3WIGA 5HCYA 1V0BA 4DTBA 2WAJA 2XF0A 3QZIA 4FTTA 4JQEA 3NCGA 4O22A 5DNRA 1SMHA 4BWPA 4YTCA 4FT5A 1JNKA 3MFTA 2JKOA 4FZAB 4E6CA 4CCUA 1BI7A 2ZM3A 4IIRA 4OT5A 3FMNA 5DEWA 5ETIA 4NYEA 4ITJA 4RBLA 2R3IA 4BC6A 2OSCA 2BRBA 2RG6A 4C4HA 3L8VA 4DEDA 5EKNA 5J9LA 3LQ3A 3LIJA 5EM6A 2WMSA 3FXXA 3MFSA 3PSBA 1UWHA 3C50A 1M2RA 2VTLA 3BHUA 1NVQA 2P2IA 3KRXA 3ORIA 4ZLZA 5J79A 3OW4A 1Q62A 2BHHA 5AP1A 5LWMA 3OCSA 4FTAA 1HCKA 1PXPA 3EHAA 3P23A 3NYVA 4FSMA 2IG7A 5JRSA 5M56A 4M14A 4FV4A 4QMPA 4QP7A 4ANNA 4R78A 3SXSA 1U5QA 4FUYA 3OROA 2BHEA 4YU2A 4OTIA 3WARA 2IZRA 2QD9A 5HBEA 5CXZA 2NNWB 1XH6A 4PPCA 4Y95A 3E8DA 2PVRA 2YFXA 4BY9E 5M44A 3PIYA 2CJMA 4P7EA 2W5HA 3JR1A 2G15A 4FNXA 5H3QA 4ALWA 3VS7A 2KULA 3GU4A 3DXPA 4OTFA 5FUTA 2UZDA 3OEFX 3V8SA 2XJ1A 4BWKA 2JAVA 1IAHA 3RI1A 5GINE 5HLNA 2BZHB 4DFBA 5HTIA 4FEWA 5GIPE 1MRUA 1JVPP 1Q3DA 1YOJA 4KWPA 5CX9A 5I5ZA 3BPRA 1GIJA 5KMIA 4U40A 3TZ7A 3ZEWA 3FLQA 1DAWA 4RWIA 1H8FA 4G3GA 2WTCA 5AR2A 4FR4A 4F63A 4QMUA 5AV4A 4EJNA 3D5UA 2PUNA 4N4SA 4PX6A 4GVJA 5HNBA 3QXPA 4ZTHA 2ETRA 2G1TA 4JL9A 5L6WL 4O1PA 3LLTA 5L2QA 5BVOA 2W1EA 3ATTA 4TNDA 4FBXA 3W32A 4BTKA 2ZYBA 5CQUA 4EHGA 2CHLA 4FEXA 1FOTA 3H10A 2YN8A 4JDKA 4D4SA 4IAZA 1WBOA 4YNEA 4BDBA 4YZMA 4ANBA 4BDGA 2ZDUA 4C34A 4R3RA 3G0FA 1WVYA 2C0TA 3BYOA 2QOLA 1U46A 3BI6A 3R8LA 2IVVA 4AZEA 3HP5A 4MD8E 4NW5A 3JUHA 4M97A 5FXRA 4BCPA 4E3CA 2VRXA 4IJPA 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