1YOLA

Crystal structure of src kinase domain in complex with cgp77675
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
256
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMSAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of active SRC kinase domain complexes
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 256
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yolA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yolA01
2OIDA 2UZDA 4XV1A 4IC8A 5DA3A 3ROCA 4WNPA 5DIAA 3SW4A 3QA8A 3DAEA 3C0HA 3VUKA 5JFSA 5EW3A 4MXZA 1M52A 5IUHA 5HCYA 2XB7A 2CGWA 4XNEA 2QKRA 4E6QA 5BVWA 3FPQA 2RKUA 3KCKA 4BCQA 1G8AA 4C4EA 4NL0A 5DRBA 2IZRA 3GEQA 5AR4A 1DI8A 2YCQA 2YJRA 4U44A 3MBLA 3DBQA 4I5MA 3I5ZA 1U46A 2C6MA 2CKEA 3C13A 5CU4A 3LM5A 4CYJA 4DN5A 5KMJA 3M2WA 4K1BA 4P90A 4FV4A 2CDZA 4AZWA 4CEGA 1YOLA 4FKOA 3OMVA 5ANOA 4FV3A 2OJIA 1PW2A 2YWPA 4JVGA 4M3QA 3R8LA 4CV9A 5A4CA 5CEOA 4FEUA 4LOQA 2IVTA 2R3FA 4EOSA 3SVVA 2WEVA 3QCQA 4J53A 1K2PA 3UP2A 3LLAA 4BFMA 2WMSA 4EOOA 3LJ0A 4DGGA 1RQQA 4IAZA 2W96B 2WQNA 3JYAA 3HA6A 3R7YA 4DLIA 4IFCA 1VYZA 3AGLA 4LQMA 4K11A 4FKQA 4F1MA 4IB0A 3WZKA 5M07A 4XV3A 5FEEA 1M17A 4FEQA 2YIXA 3LCSA 4QD6A 4DGLC 3VS0A 4FC0A 5G1XA 1OMWA 4JX7A 3I5NA 4YC6A 2BIYA 4O27B 1MP8A 3VBXA 3UOLA 5FGKA 3D0EA 2R3MA 4XG2A 2J5FA 4E6AA 2UZNA 2XK6A 4NKAA 1FOTA 4PPCA 1KUTA 5KO1A 5CAOA 3ORZA 4DFXE 3V8SA 4NW5A 3TCPA 2YLFA 3DV3A 1H08A 2FO0A 3FLYA 4Q5HA 5CSHA 4O96A 3HMPA 4XG7A 3DJ5A 3ROYA 4LRMA 4S30A 5HIEA 1YXXA 2OICA 3D4QA 4MAOA 4X2GA 3LMHA 4EBWA 3EQPA 5GJGA 4CD0A 4L44A 3HVCA 3MGYA 3AGMA 3DCVA 4ENYA 5I9XA 3PZEA 4I5PA 3A2CA 5IQAA 3S2PA 3A8WA 4GVJA 2P2IA 4D2SA 4BDCA 4PMPA 3R04A 4FOCA 4Y73A 3U6HA 4QP1A 3POOA 3LQ3A 4DG0E 3LPBA 3MFRA 3OF0A 2RFNA 2QOHA 5F94A 3FXWA 1I44A 3C1XA 3DKOA 5ANJA 3UOKA 2RG6A 3AC4A 4O21A 2C6DA 4KAOA 2PUNA 3B8RA 3ZO4A 4ZIMA 4D1XA 5IEVA 3KCFA 1OITA 3PY1A 4Z55A 4PTEA 5C4KA 1VJYA 3D2IA 2RIOA 3ZS5A 2DWBA 4IZYA 1XO2B 3QTIA 2W1IA 2R3NA 3G90X 4YJTA 3CPBA 1LEZA 5HE0A 3BQRA 4L3LA 3PRFA 2VGOA 1E1XA 2VX3A 2BHHA 4FYOA 4GCJA 5EYKA 4BTFA 5E4HA 4DT9A 5AX9A 2O63A 2BAQA 1YW2A 3SXRA 3ZBFA 4GFGA 3WYYA 4F09A 4USFA 1R1WA 2JC6A 3MY0A 4RC2A 3COHA 5B2LA 1H24A 4FKJA 4O0XA 1G8SA 4FG7A 2R3PA 5DOSA 1ZY5A 3MESA 1PJKA 5LMAA 3P79A 4QNAA 3JS2A 5EM6A 4J98A 3F7ZA 3KULB 2CNVA 4WD5A 2WNTA 2J7TA 1GNGA 1XBBA 3G33A 4FKTA 3V8TA 3WIGA 1YWVA 1PXIA 4ZJVA 3QKKA 5FXRA 4BIEA 4RRVA 4PDSA 1WBTA 3BLQA 4J7BA 3MB6A 5HTBA 4FSUA 3AG9A 5I9UA 5EOLA 4N6YA 4CG8A 4EI4A 4UV0A 1UWJA 4W4YA 3RNYA 3A7HA 1H0WA 2QOQA 2SRCA 3GUBA 4FT0A 4DYMA 2QONA 3NW7A 5CS6A 1K3AA 4BWKA 4CSVA 5JH6A 4TYHB 3A7JA 3QCYA 1Q3WA 4YJOA 4FTLA 5A6OA 4C4JA 3UGCA 4O81A 3QTQA 4H1MA 2ZM1A 2XIYA 1WFCA 4JG8A 5L2IA 4P5ZA 3DPKA 4YLLA 3U87A 5M4IA 1BYGA 4PDPA 5EHOA 4EEVA 3M1SA 3FC2A 3O0GA 2BKZA 1A48A 4PNKA 4HGTA 4DINA 2E9VA 2F57A 3MJ2A 2W5AA 2X1NA 4X0MA 5ETCA 3V6SA 4I1ZA 4BI2A 5J8IA 3TZ9A 4AOTA 3ZRMA 4F9CA 5C8MA 4UX9A 1KOAA 3R1YA 4FTNA 3HAVA 4FVRA 3U4WA 1MRVA 4TWOA 2XF0A 4YZMA 3FI8A 3TZMA 2E9UA 4FKSA 3QZHA 2XK3A 3P5KA 3NR9A 3ANRA 3ZC5A 5I3OA 1XH6A 3AQVA 4TPTA 1PKDA 4IZ7A 1Q8YA 1AQ1A 1HCLA 2YIRA 3NIZA 5FRIA 5DPVA 2VWBA 3QAME 4GVAA 4MBJA 3BGPA 3BU6A 3BX5A 3OY3A 4IDVA 3HMOA 2X2LA 4MF1A 2HXLA 2BRNA 3W10A 5CVHA 5AP3A 3H0YA 3NAYA 1ZRZA 4FT9A 3RKBA 4C4GA 4C34A 4RIYA 2F2CB 3BIZA 3FLZA 4IAYA 3HL7A 5FDPA 4O0YA 1F5QA 5FEQA 2Z02A 4QYEA 4KABA 4AXAA 5JQ8A 5J95A 5AR7A 4FTMA 3QCXA 5L2QA 3UQFA 2YLEA 1U54B 2UUEA 3Q3BA 5HI2A 4QMPA 1OBGA 1STCE 2BKKA 4ITIA 2WMAA 2WIHA 4U7ZA 5HVYA 2XCKA 5E8YA 2B52A 2B4SB 4YSJA 3ZDIA 3TDWA 3FMEA 4I93A 5DT0A 3NCZA 3A99A 2XYUA 2HZNA 3G51A 4RLLA 1YVJA 3FJQE 4M67A 2QOKA 4R7IA 3U6IA 5FLFA 5EOBA 3LXPA 4GT3A 3RAIA 1YXUA 4I92A 4DFUA 3AMAA 5BVKA 2ACXA 3QCSA 1OL6A 3PE1A 4JG6A 1YQJA 2FYSA 4BZDA 1WCCA 4G6NA 4I3ZA 4UZHA 3U6JA 3UQCA 4FV8A 3ZH8A 5J79A 5JQ5A 3AD5A 3WF6A 4AT5A 3HV3A 1TQIA 4IAIA 3QFVA 2GDOA 3R8UA 3CKXA 4FODA 2RFEA 3QTSA 5IEXA 5E90A 3SOAA 3KQ7A 3N51A 1BL6A 1AD5A 1BUHA 1UNGA 2BALA 3OBJA 4MD7E 4PTGA 5CLPA 2QO2A 3MDYA 4BWXA 3TI1A 4YTFA 4DITA 4XG3A 4ZSGA 3ID6C 5DR9A 4D0XA 3RVGA 2XKCA 3FI3A 3FHIA 4K77A 4BBEA 4YHTA 4W9WA 2PZRA 4O22A 3VBWA 4AACA 3JVSA 3ZZEA 3MB7A 2H96A 1IAJA 3LE6A 2Y7JA 4ASEA 5C01A 4ZMFA 3RJCA 4AQCA 5K0KA 3DKCA 3PUPA 1H07A 3G9NA 1OPLA 4RG0A 2B9FA 2X7OA 3EFWA 1WBVA 3VUGA 3R7VA 3VJOA 4FV9A 1APME 5A4EA 3GNIB 4QP3A 4IBMA 3TDVA 3GC9A 2C6KA 5LJJA 2G9XA 3UPXA 4WA9A 4UB7A 1WBWA 4XRLA 3IW7A 5IA4A 4LUDA 1QCFA 3E92A 4EQMA 2WTIA 5DEWA 4I21A 5JZJA 1OUYA 4QQJA 4RVKA 4EK3A 5I9YA 2EXCX 4C3FA 4CZTA 4UN0C 1OPKA 2OZAB 3BU5A 4O82A 3OWLA 4ZLZA 4IEBA 2YZAA 3QF9A 3IKAA 2BRGA 4C4HA 3RI1A 3V3VA 5J7HA 2YIYA 5HLWA 4A4LA 2XNMA 3MS9A 1PXPA 5DE2A 4AAAA 4BHNA 3PE2A 4O86A 4U0IA 4IX6A 2GHMA 4PP7A 3O17A 4O6EA 4NIFB 5DFPA 2P4IA 2R4BA 4YP8A 5AM7A 4EL9A 3UNKA 5A6NA 3MFTA 3PPKA 3BEAA 4AG8A 3QBNA 4RIXA 1S9JA 5BVFA 4RVTA 3P86A 2I0VA 1UU3A 4MK0A 3ETAA 1RW8A 4ACHA 3Q6UA 3WZEA 4MTAA 4D4RA 3O51A 1OL5A 3BLHA 3IPHA 5ANDA 4RIWA 4QYYA 4E20A 1WZYA 2HAKA 4NCTC 5CSXA 3QX2A 2WMQA 3WZUA 5M57A 3PVGA 4EH6A 2HIWA 4TY1A 1U5RA 2CN8A 2GNHA 4WUAA 2E9OA 2JFLA 4TYIA 4E4NA 1WVYA 4WG4A 3KKVA 4HVDA 3D5VA 1KWPA 4XOYA 1JSUA 3II5A 3RM6A 5HNGA 3OROA 5BUIA 3NNVA 3JXWA 4FNWA 2UZUE 3MPTA 5K5XA 2OJ9A 5EHLA 3UNZA 4EZ3A 4BGQA 3RPYA 5KCVA 3L9PA 4AN9A 2XK7A 2O64A 3GOPA 4GH2A 4C2VA 2YDKA 4RWIA 4II5A 5EQEA 3FEGA 3VBQA 1KE9A 2FH9A 1Y91A 2BTRA 3LZBA 4GEOA 4BDEA 4D4YA 1YOJA 1W98A 2B1PA 2XA4A 4GK2A 3S1HA 3SGCA 3AMYA 3FC1X 4EHVA 3LKMA 4BDIA 3PJ3A 3EHAA 4U9AA 3NYNA 2OFUA 3I7BA 1M7QA 2X6EA 2YIWA 2OGVA 4XYFA 3UVPA 2YDIA 2XJ1A 4F70A 2XKEA 1GAGA 2HZ4A 4FSNA 2RFSA 3DXNA 3IQ7A 3PRIA 2QQ7A 3HUCA 4ANSA 4EH4A 3HMMA 1U5QA 3LCDA 4TWCA 2X9EA 4IMYA 3F3WA 3R01A 2IWIA 4OUCA 4NT4A 4F7SA 3W2CA 5EK7A 2W1EA 4ITHA 1OECA 4X2JA 3GCQA 5KKRB 4KA3A 4X3FC 4Y8DA 3ORKA 5C4LA 3QQJA 5CVFA 4RX8A 5E8TA 1VZOA 3BWFA 5JT2A 4AZEA 4A07A 1GZNA 3ZDUA 3AC8A 3GGFA 3CY2A 3HRBA 3OUKA 2B0QA 5CF6A 3CD8A 4EKKA 2YITA 2Y6MA 4O91A 5HG8A 4G3DA 2XRUA 4AGCA 2XK4A 3I7CA 2GNGA 5FP6A 4ANQA 3HV6A 4MX9A 1Y8YA 5KMLA 3NNXA 2Q83A 2GPHA 3C4EA 2QOCA 4JRNA 3GT8A 3R00A 3HMIA 5FXSA 2A19B 3U9NA 5IUGA 3ZO2A 4AN2A 4Y5HA 4BKZA 4H05A 3MWUA 3CLYA 4CQGA 3THBA 5AR5A 4EQUA 4YSMA 3Q53A 5B0XA 5K0XA 3DKGA 4RWLA 4AUAA 4BDJA 3ZLYA 3FY2A 4RA5A 5JK3A 2JAMA 1JKLA 2CKPA 2XH5A 1YHWA 2XK8A 5LMBA 2JKMA 3QZFA 1L8TA 1A06A 3UDBA 3NPCA 2G1TA 5E1SA 4D4SA 4LUEA 4XG9A 2ZV8A 4RT7A 2VWXA 5JGAA 3RWQA 4JJRA 3TACA 2QNJA 2QC6A 3OCSA 4YTHA 2WMBA 2E9NA 5M55A 3ZUVA 3FQEA 4BCGA 3BV2A 1F0QA 1KSWA 4OW8A 5CY3A 5E8WA 4AWIA 2X8DA 4FTJA 3EQBA 3A8XA 4CVAA 2C6LA 4OTIA 4DGOA 3VS1A 2WTKB 2PWLA 1QPEA 3MTFA 3PJCA 4I4FA 5FBOA 5HORA 4FTIA 5AR3A 2ONLC 3OOMA 3KN6A 4D1SA 5T68A 3WZJA 3A4PA 4MF0A 2GS6A 2XIXA 4AE9A 3IW8A 2O3PA 4FL1A 5CXZA 4LRKA 2PPQA 2YA9A 1S9IA 3EQRA 3W2RA 3EQDA 3OY1A 4O7TA 4BCFA 2P3GX 1FQ1B 4G3EA 4A9SA 4UMRA 4M66A 3CP9A 1JKSA 3PG3A 4O38A 4QP7A 3Q9WA 3R1NA 4FZAB 2I7QA 5BYLA 5GIOE 4QQTA 3QRUA 3ZLXA 4PTCA 4PPBA 3TWJA 2PMLX 3NUXA 3QHRA 3W55A 4AT3A 4FKRA 3LFEA 4RFZA 4YHFA 4ZSEA 5GJFA 2C5XA 3S95A 4DTAA 3EQFA 2WTDA 4EOIA 2Y4IB 4QT1A 1X8BA 4FV1A 4CV8A 1FPUA 5KBQA 4AX8A 3HA8A 3PPZA 5CZHA 3O8PA 1B6CB 1PMUA 2OU7A 4NEUA 5D9HA 4DHFA 4LL0A 3MI9A 4FV0A 4WO5A 4JNWA 2R3JA 4XG4A 4FIGA 5DI1A 2WQEA 5D7AA 2UVYA 4PDYA 2QKWB 2QCSA 3FZOA 5FDXA 4BDAA 4JG7A 4QPSA 3OP5A 4BN1A 5L6WL 4I0TA 5AUWA 3REPA 3LFSA 4PL5A 1SVGA 5IG1A 3VUDA 2NP8A 3Q96A 4IM2A 2PVMA 3VO3A 1SNUA 4HGSA 3Q2JA 3KRXA 2YISA 2YCSA 3AD6A 3FL4A 1I09A 4FKLA 4AGUA 4L45A 2W06A 3PP1A 1E1VA 3KA0A 5HVJA 1B38A 1SM2A 1ZARA 4L3JA 2GFSA 3KXNA 5IF1A 3QHWA 4HNFA 2XCHA 3HRFA 3DQWA 5AV0A 3W8LA 4D2TA 2AC5A 2AC3A 3ZTXA 5IKWA 4OAUC 3R30A 4BHZA 4DH1A 4D5HA 3VJNA 3LFDA 3E88A 2W7XA 3CE3A 5TE0A 5TF9A 5AIRA 4FOBA 1ZMUA 2W99B 3DLSA 5AA9A 4HGLA 4EOKA 1PXOA 3PSBA 1BL7A 2WEIA 4IVAA 5AV4A 4G9RA 4IX3A 5FM2A 4ZTHA 5EDQA 2JFMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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