1ZOGA

Crystal structure of protein kinase ck2 in complex with tbb-derivatives
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inspecting the structure-activity relationship of protein kinase CK2 inhibitors derived from tetrabromo-benzimidazole.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN KINASE CK2, alpha SUBUNIT
molecule tags Transferase
source organism Zea mays
total genus 107
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zogA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zogA02
2XUUA 1Z9XA 1TQPA 4N6YA 2FA2A 4TYEA 3NVKI 3RPVA 4ANSA 3N51A 2IVTA 3P9JA 4HVHA 3HRCA 5K9IA 4KUJA 3LAUA 3MJ1A 5EM8A 3DKCA 2X7GA 3MVMA 4C59A 4ZIMA 2FSLX 2C0OA 4IWDA 4U3YA 2EXMA 4I92A 1PYEA 5FP6A 3MVLA 3QXPA 4AOTA 5E8XA 4YTFA 4YURA 1LEZA 3GEQA 4BIEA 4C02A 3A99A 4BCGA 3R8MA 2VGOA 5FDXA 3PFQA 4X0MA 3WOWA 5I9WA 5CQUA 1QPJA 3MY5A 2R3QA 4XV2A 4JIAA 1JWHA 1ZZ2A 3DV3A 3F3WA 2QCSA 3H9OA 2C30A 3KVXA 3LIJA 3WZKA 2WMRA 2EU9A 4UN0C 3L9LA 3PJ3A 3IS5A 4ACCA 4XG3A 5H8EA 3ZRKA 4PL3A 3UO5A 1DI8A 1WBWA 4LV8A 4FI1A 2P2HA 4UEUA 5JSMA 1YDTE 3PIZA 3QRIA 5M4UA 4ERWA 5FM3A 4NCTA 1U5QA 4FSZA 4UYAA 4W9XA 1SYKA 4FL3A 1KSWA 4R78A 4FV6A 3ORKA 1NA7A 4IJPA 4MBLA 2OK1A 4FEQA 4LOPA 4WG3A 4R1YA 5ICPA 5HX6A 5AR8A 5HBJA 5BYLA 1J1BA 3UE4A 2OWBA 3E93A 2C1AA 3Q5ZA 1DM2A 3UO4A 4ANBA 3G51A 3R04A 4EOJA 4YP8A 2BRGA 1UU8A 3QGWA 3AGMA 3R1NA 5AV4A 4O27B 4QYFA 3P7BA 3BYOA 1AD5A 4A9TA 3QX2A 4E73A 1UU7A 5K4IA 2YCSA 3IONA 4CYIA 1R1WA 4MXZA 2WMAA 3VAPA 4K6ZA 4EOIA 3VBTA 2QOQA 4U80A 2UZNA 4PP7A 4FEWA 1Y6BA 4PNKA 3FZRA 4RJ4A 3UOLA 2DWBA 3B8RA 2HENA 3ELJA 2HZNA 4FOCA 2W1ZA 2ZV8A 5HD4A 3EQFA 2VNYA 3M1SA 1XBCA 4O7NA 2B7AA 2QLQA 5CNOA 4ZLZA 3UO6A 3S0OA 3EIDA 2C6IA 5AMNA 4FEVA 4DEGA 3MWUA 4O7RA 4D4SA 2X4FA 5CEMA 2JDVA 2XK7A 3KXNA 3VBVA 4EH2A 4YGAA 5DLSA 4EWHA 1S9IA 4LMUA 3MN3A 3KFAA 3NNXA 4X3FC 3ZZEA 2WO6A 3FQHA 2OF2A 3FY0A 3NW5A 1ZZLA 3C5IA 3DJ6A 1R3CA 4RC3A 3KXZA 5AIKA 1PRYA 4TYJA 5C01A 2ACXA 3UP7A 2FVDA 3C51A 2XIKA 3HUCA 3JYAA 3OFMA 4FKOA 4YLLA 3EZVA 2X7OA 3R83A 4GV1A 1OL2A 3RBWA 3DDQA 3FLZA 4CT1A 4YO4A 1UWHA 4IB5A 4QP4A 3CGFA 3ZU7A 3BLHA 3KGAA 4FKWA 3DAKA 3TUDA 4M97A 1FMKA 2FUMA 2PUPA 4FTQA 3GQIA 4KABA 2OIBA 4YC6A 5IQFA 5CF6A 4KWPA 4L68A 3GC8A 3Q5IA 4BGHA 3O8TA 4I24A 5C4KA 1Q61A 3WYXA 4C57A 4IVDA 1JOWB 1J7IA 4JG8A 3EWHA 4AGDA 3QTXA 4UMQA 4F1MA 3RI1A 1B6CB 4NIFA 2BKKA 4P90A 4H3BA 2W0JA 4C36A 2UZLA 2YCRA 4IVCA 3V5QA 4CVAA 1W98A 4TWOA 4BDGA 5FP5A 4UX9A 5DIAA 2PL0A 2FYSA 3WF6A 3W18A 4L52A 1NVSA 4IAZA 2EXEA 3E62A 1VJYA 3TDWA 4ZLOA 1OI9A 1Z57A 4FKUA 2UW6A 3HMPA 4LYNA 4C2WA 4WIHA 2H9VA 3N4UA 2YDKA 1OB3A 2XIZA 1QL6A 2V55A 4NJDA 3W1FA 4YLKA 1XH4A 3UDBA 4NW5A 4D1XA 5EQPA 5K0XA 5EHOA 1OIQA 3QL8A 4J97A 2C3IB 4RIXA 4Y95A 3UVPA 2VWYA 4FZAB 4BICA 3TNIA 2GU8A 2R7BA 2JD5A 3Q2MA 4IX6A 3NW7A 4DG3E 2XEZA 4E6AA 5GIPE 1RW8A 1RJBA 2R0UA 2GNLA 3DXNA 3C4ZA 2XNEA 4K0YA 3ANRA 2ZDUA 5EYDA 4EL9A 4Z7GA 3FQSA 3P7CA 3TNHA 3VBQA 4KAOA 2OU7A 3LFEA 4QYYA 4Y5QA 3CPCA 4A9RA 1MUOA 1L8TA 3H0ZA 2R3MA 1XJDA 3LJ2A 4D55A 3GFWA 4JQEA 2WXVA 3MFTA 2XKDA 4KBKA 5E8VA 4BTKA 4BGQA 3QHRA 4D5KA 5LOHA 5E8SA 4BI1A 3HX4A 2JAVA 3O96A 3SC1A 5BMSA 4CG9A 4AA5A 2G2FA 1YXSA 2VZ6A 3AT2A 2RSVA 1EH4A 3MH0A 2PWLA 1GIJA 3UNZA 4FTNA 3IW5A 4LQMA 3RZFA 3RNIA 4Z16A 4EOOA 1Y57A 5B2KA 5HTIA 2ITXA 2UZTA 4BCQA 5HE1A 2OIDA 2AC5A 4C35A 4CFMA 5I9ZA 3KMWA 3C4FA 4Q5EA 4FV0A 4TTHB 5BPYA 4XEYA 2ZJWA 5DN3A 3PA5A 3R7OA 4EOKA 1WVXA 4HNIA 4A4XA 4FSUA 2IW8A 3UNJA 4L42A 1Q8WA 2XK6A 3GCVA 3HRBA 2AUHA 2BIYA 2RFDA 2GS2A 2CCHA 3G6HA 3OROA 5IH5A 2QOOA 3PRIA 4M7IA 5J87A 1SM2A 4CMUA 2OH4A 2OGVA 2ZB0A 3GCQA 4KRDA 3NR9A 4J8MA 4JAIA 4R3RA 5AWMA 3QWJA 4O83A 2BILB 3BIZA 3NUYA 4DGLC 4PMPA 4CV9A 3E92A 5KZIA 3OT3A 4H3PA 2NRUA 3HRFA 2XKCA 3I6WA 2F57A 2ETRA 4HCVA 1Y8YA 3UIUA 5I3RA 3QZIA 4G6LA 2VTPA 2HWOA 3PP0A 4RQKA 4WA9A 2R3OA 4XBRA 2A4LA 5EOBA 4H39A 4I5HA 4JBPA 4CZUA 1CKPA 2OJFE 2VWUA 4J52A 4OR5A 3PXKA 5EI2A 3ZC5A 4ANQA 4AZWA 2XIRA 5FM2A 4G5JA 4DTKA 4E8AA 3OWLA 4UZHA 2DQ7X 3MA6A 4Y83A 2HCKA 3FKNA 5DT3A 3FMDA 4ZTHA 4CFUA 1U46A 4BHZA 2E9VA 4XG7A 3IO7A 3D14A 3PXYA 2R3FA 3T9IA 2FSMX 5HNIX 3DDPA 4FKSA 4YUQA 3W16A 5L3AA 3OXZA 5CT7A 2WKMA 2UW0A 5IPJA 4FG7A 4FUYA 1J7LA 4L6QA 2CHLA 5BUEA 4IEBA 3O2MA 4F7JA 4GK4A 3FUPA 5IA0A 4AT3A 4XRLA 5EYMA 1TQIA 1Y91A 1PMUA 2B4SB 4QD6A 5ACKA 4KIPA 3ZLWA 4V01A 3Q6UA 1H01A 2YJSA 3LJ1A 3TXOA 5BVNA 5KBRA 3FI3A 4AN2A 2WTJA 3COMA 4KBCA 5L2WA 5BVEA 3NS9A 4U3ZA 4QP6A 3BWFA 3QA0A 2B9HA 5JN2A 4UZDA 2JKOA 1LEWA 4NM0A 3U6IA 4DTBA 4O38A 3OD6X 3U8WA 3A4PA 1ZY5A 1XR1A 5A4EA 2PMOX 2PZPA 4X6RA 4BKJA 3FV8A 4CV8A 2WZJA 2W1DA 3VC4A 4IAIA 2BROA 3G9LX 3HMMA 3OEFX 2HAKA 4O6EA 2HXQA 3FMEA 3SRVA 1ZYJA 3CCNA 4X3FB 2YA9A 4HZSA 4ZK5A 3RM7A 4AZTA 2VTAA 3ORIA 5EYCA 5L8JA 3DQXA 3ZO4A 3U9CA 5AUVA 4F7LA 2PHKA 5HNBA 3R6XA 4MD7E 4F9AA 3I0QA 2J6MA 4KIKB 2OZOA 2C47A 2R3KA 2SRCA 3OBGA 4L44A 4EORA 4QOXA 2QOHA 3R8VA 3RAKA 4AWIA 4Y85A 4FF8A 1DAYA 2VX0A 3JPVA 4I93A 4JIKA 4RSSA 4W8DA 3WF8A 1REJA 4YSMA 3LMGA 5HNGA 1YDRE 3PXRA 4G17A 4OTPA 1URCA 3ENHA 4R6VA 2YHVA 3OC1A 3KKVA 3EKNA 1XKKA 4TNBA 4BDIA 2VO6A 4FSNA 4IX4A 4QMXA 3PP1A 3F2RA 4C4FA 3TACA 1H0VA 3TZ8A 3ANQA 1FMOE 2G9XA 4C4IA 4YO6A 2BRBA 5L6OA 1KE7A 4X2JA 3AT3A 5CAPA 2R4BA 5AV2A 5T6KA 5IISA 4BCOA 3MH2A 3CY3A 4O6LA 4F65A 5AP2A 1FINA 1OM1A 2GS7A 1Q99A 4HYHA 4KRCA 2G15A 2XNBA 2I40A 1OPLA 4NTSA 3TKHA 3VW6A 4EOQA 5K5NA 4NL0A 4AACA 2R64A 4RIWB 4IZAA 3CP9A 4OTRA 3ATTA 4H1JA 4ASDA 2XMYA 5JK3A 3TDVA 1ZRZA 4M66A 2PVYA 5DRBA 3ZLXA 3Q4TA 3MV5A 2BDFA 2B1PA 4MD9E 3DK7A 5TT7A 1LUFA 4CKRA 2WU7A 3QD4A 4QPAA 4KKGA 4C38A 4A9UA 2BPMA 5GZAA 2J51A 3Q6WA 2BTRA 5AR2A 2B52A 5HVKA 4MX9A 1QCFA 2WQBA 5DVRA 1GZOA 3BQRA 4QPSA 2V5QA 2G01A 2Y6MA 3O71A 4TYHA 2YM6A 4YZCA 3GCPA 4MXYA 1KOBA 3LFNA 3PG1A 4XG9A 2EXCX 1H0WA 4Z9LA 3QCYA 4GVJA 2CLXA 5EK7A 3OCBA 2XM8A 2JC6A 4FV4A 3ZXTA 4IW0A 2UW3A 5J7BA 2B0QA 2R3LA 4CKIA 4XCUA 3D0EA 5DYJA 3MBLA 4YJPA 5LMKA 1VEBA 2WU6A 5DOSA 2XK8A 4L3LA 5DEWA 4QP2A 1P14A 4E4XA 2BDWA 3H0YA 5HG5A 2X9FA 3DY7A 4YJQA 4D5HA 3KMUA 4LL5A 1JQHA 3R73A 3R9OA 2YJRA 3FC1X 4DEBA 3T3UA 1YOJA 3ZDIA 4HGTA 2QOLA 1ZOEA 1Q8TA 4RMZA 4APPA 2C6MA 4ALWA 2CJMA 3QZFA 3R7UA 2YWPA 4B99A 2CLQA 2ETKA 3NUPA 3QALE 4QNYA 4UALA 3ULIA 1BYGA 5AR3A 4TYGA 5FDPA 1OZ1A 4LFIA 4XG4A 2QOBA 1IRKA 4RFZA 3NNWA 3F2NA 4AW5A 5AJQA 3ORNA 4U42A 1GJOA 3VUGA 4RWKA 4H05A 2YM3A 2J5EA 3FKOA 2C3JA 4AW2A 1X8BA 4N70A 3MB6A 5CI6A 4PDOA 4IDTA 2IZUA 4V0GA 1FVVA 3AQVA 4I94A 2PMIA 2XA4A 3F5UA 3MIAA 4OTGA 3I60A 3SX9A 3V6RA 3O7LB 2C6OA 5ETFA 4ZTSA 2A2AA 3JS2A 2W5AA 3SXFA 1I44A 2XCHA 4TPTA 4XRJA 4IAAA 3E8CA 1JKLA 4CYJA 4JDIA 5IQAA 4JQ7A 3DXPA 3PLAE 4G3DA 3VQHA 4KSQA 4QMWA 3PXZA 3QC9A 3GB2A 2W7XA 4YTIA 3QTQA 2HW7A 2PZRA 3WARA 4PTCA 3PZEA 3FL4A 3TI1A 4WT6A 3F88A 2GQRA 4NYEA 2PVHA 3OOGA 4USDA 2CGXA 3GFEA 3R01A 4GK2A 3DTCA 4L7SA 5LCKA 4E93A 4Z7HA 5HVJA 5DNRA 4QMUA 2BAKA 2O2UA 4H1MA 5CSVA 3ZO2A 4O82A 5DR6A 4IHPA 4AT4A 5HIBA 5EW8A 4BBMA 5I5ZA 1U59A 5HHWA 3VS0A 2WFYA 3CBLA 3KRWA 5CF8A 3S2PA 2ITOA 4JAJA 5BVOA 4O7VA 1PKDA 2G1TA 4I5PA 1BL6A 1PHKA 3VJOA 4C37A 3FE3A 4E5WA 3PVBA 4C3FA 2YIYA 2CSNA 2VU3A 3WZUA 4DH7A 4DYMA 3UYTA 4EYJA 1UA2A 4NZWB 5EKOA 1PXKA 1O6YA 3EN6A 5C9CA 4A9SA 4B4LA 2A1AB 4UWCA 5AADA 2BCJA 2ZV7A 4C3PA 5CEQA 3ZZWA 1M7NA 2OO8X 3QGYA 4FNWA 3KEXA 4FV5A 2WMXA 3QWKA 4QMMA 4D58A 2J0LA 2BALA 3U6HA 4L3PA 4BN1A 5AA8A 1OECA 3C4EA 2IPXA 1GZ8A 4PDYA 2WB8A 2H8HA 2OJGA 2ZB1A 1CSNA 5IA1A 3O51A 3KRLA 4LGGA 4RVMA 2ZVAA 3ACJA 4TWCA 2QLUA 2C69A 2Z02A 4BFMA 5EH0A 3DTWA 2XJ2A 4BCFA 3BHYA 3OTVA 1DS5A 3F5PA 4FSQA 5DWRA 2JKKA 2I1MA 4BDEA 4FBXA 4FIGA 2X1NA 3PPZA 3PYYA 3PVUA 2J0MB 2GQGA 4RWLA 2R3IA 1SNUA 2HYYA 2H34A 3W2SA 5E1SA 5CXZA 5BVDA 4BDHA 2UW9A 5C8KA 5KMKA 3JXWA 3R8LA 1GIIA 1NW1A 2ITYA 3A7GA 3MY1A 4XOZA 4A4LA 3HGKA 3VHEA 4QQTA 3OCSA 1A48A 1ZY4A 3DPKA 5AP1A 3P23A 5EFQA 4BYJA 1H08A 3QX4A 4DN5A 3CXWA 5KX8A 4M69B 2GHGA 3F69A 2BFYA 5IMEA 1URWA 5JRQA 3CE3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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