1ZY5A

Crystal structure of eif2alpha protein kinase gcn2: r794g hyperactivating mutant complexed with amppnp.
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
302
structure length
271
Chain Sequence
SLRYASDFEEIAVLGQGAFGQVVKARNALDSRYYAIKKIRHTEEKLSTILSEVMLLASLNHQYVVRYYAAWLERRNFVKKKSTLFIQMEYCENGTLYDLIHSENLNQQRDEYWRLFRQILEALSYIHSQGIIHRDLKPMNIFIDESRNVKIGDFGLAKNVHRAMYVATEVLDGTGHYNEKIDMYSLGIIFFEMIYPFSTGMERVNILKKLRSVSIEFPPDFDDNKMKVEKKIIRLLIDHDPNKRPGARTLLNSGWLPVKHQDEVIKEALKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Basis for Autoinhibition and Mutational Activation of Eukaryotic Initiation Factor 2{alpha} Protein Kinase GCN2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase GCN2
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 81
structure length 271
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zy5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zy5A01
1WBWA 1JVPP 2XKEA 1UVRA 2JIIA 2XK8A 1BL7A 3LMHA 4XV9A 3GC0A 3DLSA 4XNEA 3TKHA 1WBTA 4UN0C 1X8BA 2RG6A 3NUNA 4JOAA 5DT3A 3KRLA 1GAGA 3UOHA 1H27A 2X8DA 3B8RA 5AR8A 4KABA 2E9NA 3OEZA 4IC8A 4JQ8A 4DGLC 3UODA 5IQDA 3OXZA 5M4FA 4BVUA 1QPCA 3VQHA 4ASXA 4RGJA 3ATTA 4O96A 4NJDA 4RA5A 2R7IA 4IWDA 5KMNA 5IA1A 5HVYA 4JX3A 5IKWA 5HIBA 2O65A 4IE9A 4R1YA 1PXKA 3ANRA 2OXDA 4EUTA 4ZTQA 3BU5A 4IM2A 3VS3A 2H9VA 4QNYA 2KTYA 3HRBA 4IEBA 4X3FB 3A2CA 4CMUA 3OZ6A 4D28A 4Z3VA 2YABA 3G9NA 3QQHA 4YHJA 5GZ8A 5M53A 1H4LA 3OBGA 3UC4A 3PFQA 4AWIA 4KSQA 2CDZA 5L2WA 4II5A 5D7AA 5CEPA 4K8AA 2XRWA 1IRKA 3FMEA 4RJ4A 3MGYA 4LGDA 2AC3A 3EOCA 4L01A 4CZTA 1P4FA 2OIQA 1H07A 5AUZA 1JBPE 2PVJA 2WTJA 4KBKA 4EH8A 3VHKA 4YSJA 3SA0A 2E9VA 3WF5A 4D0XA 5A3XA 1W8CA 3GU7A 3F61A 3FLWA 1URCA 4MXXA 3FI3A 3IDBA 4DFZE 4YLKA 4NTSA 3QHWA 4WRGA 4WG3A 2YM8A 5HG8A 4G3CA 4O0UA 4E8AA 2A19B 2GNHA 3AC2A 1PXLA 1KWPA 5GZ9A 4I6QA 3DZOA 3R9DA 3WYXA 3ZO1A 3RWQA 3KRXA 4EC8A 5HLNA 4F08A 4XG8A 4ZK5A 2C0IA 1H25A 1E9HA 4IANA 3RAHA 2JFMA 3CIKA 3ZU7A 4FTRA 5L4QA 3ZM9A 3CQWA 4CT2A 3VJOA 4FIGA 4E6AA 1PXOA 2XKCA 3BEGA 3HV6A 4G3EA 4UEUA 2JDVA 1H28A 5TF9A 5AUUA 1H26A 4FSYA 2P2IA 4U45A 4EH3A 4OTFA 3MDYA 4G2FA 2OLCA 3IGGA 2VWWA 1FMKA 1R1WA 1OIQA 3PDTA 4J8NA 1UKHA 3KXGA 3PVWA 1HOWA 5F20A 2ZV7A 4H1MA 3ZZEA 4IMYA 4CKRA 4EUUA 3VBXA 4AQCA 4YPDA 4YNEA 5IZFA 3ZUVA 2ESMA 3FZ1A 3DT1A 4MWIA 5FEDA 5M51A 2WMBA 2W99B 3QD2B 5TE0A 3TNWA 4GIHA 3OWLA 4FKQA 3TM0A 5HG7A 2YIXA 1J91A 2ETMA 4FI1A 3KK8A 1H1RA 1ZMWA 2QO7A 2HCKA 4MF1A 4F65A 5TO8A 2PZRA 4YZCA 4DE4A 4OTDA 1M2QA 3HNGA 2XZSA 2YACA 3ZDIA 2C6EA 4BIEA 4BCIA 1IEPA 1NY3A 3C4ZA 5EYMA 3JR1A 4PMTA 4A4LA 3DCVA 3TZMA 4DLIA 1ZYCA 2R2PA 1R0EA 3SC1A 3R71A 4G1WA 5CNOA 2JITA 3HLLA 4WNOA 4W9XA 4QTAA 4GG5A 1JLUE 3VBVA 2QU5A 2PE0A 4WUAA 5JSMA 4O38A 3ANQA 3POZA 5CZHA 5HCYA 5JFXA 3DBCA 1PYXA 2YN8A 4DEHA 1O6KA 1GZOA 4Z16A 1U5QA 2B52A 2FO0A 3G5DA 2QD9A 3BZ3A 3NNWA 3I4BA 4PNIA 4TYHA 2YEXA 3PJ1A 3FYJX 3UQCA 4FYOA 4WRSA 1XBCA 5G6VA 2VO7A 4F0GA 3TL8A 4G9CA 2BZIB 5D11A 4EJ7A 5AAEA 3R30A 4C61A 3GI3A 3TN8A 4RJ7A 5TKDA 5IH6A 2JBOA 2ZV2A 3ODZX 5FM2A 3PXFA 3FBVA 4QMNA 2OF4A 4O27B 4I23A 4YO4A 2UZUE 4EKKA 4F99A 1YHVA 4JVGA 4YJVA 4E93A 5K4JA 4FTKA 2R3FA 2XIYA 4LMUA 3UPZA 3RWPA 2QONA 1OPKA 4BC6A 2QCSA 2XNEA 4QMOA 5JFWA 2PE1A 2W9FB 3BYVA 1FMOE 2QOFA 4ZP5A 2WTCA 2XK9A 5IQIA 5M07A 4QO9A 3GOPA 3KQ7A 4XG6A 3ATSA 2VTAA 1Q61A 3DV3A 2P2HA 5F4NA 1JWHA 3RINA 3CTHA 3V3VA 4HNFA 2JDTA 4EZ5A 1RJBA 2VGPA 3EN7A 3ACJA 3DFCB 4S32A 3Q52A 3F7WA 3FPQA 2VNWA 3BEAA 3Q2MA 5BYZA 4QP6A 3SXSA 1IAJA 2IG7A 1ZYDA 3PIXA 3RPSA 4O91A 1Y6AA 4L7FA 4EI4A 5HORA 5A14A 3QTQA 1Q8WA 5FBNC 2J5FA 2OXXA 3DB8A 4WA9A 5IISA 3QA8A 3D7ZA 1GY3A 4QQJA 2QNJA 1ZYJA 1SVEA 3BHHA 3LXKA 3N9XA 4KA3A 4QP9A 2JLDA 5AX3A 4KS8A 3DOGA 3Q4ZA 3GGFA 4ZLOA 1H1PA 4G16A 4XOZA 5AUVA 1Q8UA 2FSLX 4QMWA 1IR3A 3RHXA 4ANNA 3P86A 2WQOA 5G1XA 5HIDA 5JQ8A 5D12A 4X6QC 3W2CA 3EL8A 5IG1A 2DUVA 2X81A 4Y5HA 4RWIA 4BI1A 3R9HA 3REPA 4YR8A 1REKA 4U41A 3ZS5A 2BAJA 1OGUA 5ACBC 3WF6A 2VO3A 5CEOA 3DJ5A 3KF7A 4IVAA 3NRMA 4TT7A 1F3MC 5T3QA 3U9NA 3ZM4A 3EHAA 3TUCA 5JH6A 3BLQA 4ANBA 4C4HA 4MBJA 4MNEB 3QFVA 3ORNA 2J0IA 3NIZA 4IWQA 4IIRA 5FM3A 2PZYA 2J50A 4O0RA 1DI8A 2PZPA 3P23A 3PUPA 4V0GA 3WIKA 1W7HA 4CKIA 4DN5A 1U4DA 2X9FA 3OC1A 3VS0A 1T46A 4JBQA 4BB4A 3QCYA 4FGRA 4J71A 3BGPA 4R5YA 4AA0A 1SMHA 4E4MA 4O6EA 4FSNA 3PG1A 2I1MA 2BFXA 2WU7A 3KC3A 3F3VA 4NCTA 2UZBA 2WB8A 3Q9ZA 4D2SA 4EOLA 2B9FA 4DEEA 5KMOA 3I7BA 3D2KA 3E8DA 2VUWA 3F3UA 3LCTA 4FKVA 1KE6A 1YXTA 4FSMA 4WT6A 5E1EA 5EK7A 3HV3A 4DG3E 5HLPA 4L45A 5AP5A 1PHKA 3C5IA 1G3NA 2ONLA 3SW4A 5KMIA 3HUCA 2R3QA 3PE2A 4PMSA 3HDMA 4E4XA 4PP7A 1M2RA 4UMRA 3DK6A 4C4JA 5DOSA 3FE3A 3NS9A 3ENHA 3U54A 1JSUA 2QR7A 4YU2A 3R9NA 5EW8A 4IAZA 4KS7A 3UP7A 4FT0A 4NK9A 3ULZA 1XQZA 1W84A 2WXVA 4M0ZA 3MA3A 3WF8A 3DDPA 4GFOA 4EHGA 2CSNA 3HMMA 1WBVA 2Y6MA 4E7WA 4ANSA 4TYEA 4KD1A 3RK5A 5CSWA 3E88A 2YIWA 3MV5A 3PG3A 4FV9A 4RG0A 2BRHA 3O96A 5KX8A 1B39A 4YJRA 3UZRA 5AR3A 4BCQA 4PL4A 1KOAA 4O22A 4MD7E 5M4CA 3MWUA 2R9SA 4BF2A 4NW5A 2C6IA 3F69A 1CMKE 3F6XA 4D4VA 5ANIA 2BMCA 4BL1A 1K2PA 5E8UA 1IA8A 1PXIA 3A61A 4YC3A 5AIKA 1J7UA 4FV6A 3GNIB 2G2FA 5HTIA 2GNGA 1XJDA 3TNPC 3FI2A 3V51A 3EQRA 2CGUA 5I4NA 1PMNA 4D58A 2BRNA 3DNEA 3NNUA 4J8MA 5HKMA 5FXRA 2J0JA 3PE1A 3TZ9A 2ZDTA 2PVFA 5T68A 1UU7A 1L3RE 5K5XA 3UZTA 5I3RA 3BV3A 5TOZA 4M0YA 2R3OA 2W1GA 2BRMA 4K6ZA 3DDQA 4E4LA 5J9YA 1OECA 1TQMA 4QD6A 4XMOA 3CJGA 4NL0A 4ZZOA 3WOWA 4FEUA 3ZC5A 4FTLA 3SOCA 5HE3A 4CFUA 3S0OA 1GNGA 3CCNA 3FXWA 4JAIA 4IZ7A 1CSNA 1H00A 2YM7A 3R1QA 4X3FC 4JXFA 3PRIA 4P7EA 4UX9A 1SVGA 2V7AA 3EL7A 4ERKA 5IPJA 3GC7A 3RZFA 4IJPA 4N6YA 5J95A 3V5QA 5A4TA 2XP2A 4D2WA 4YTCA 3SRVA 2GNIA 2PVRA 4OW8A 4YNOA 4U9AA 2FSOX 4O83A 3LIJA 4FNYA 2QQ7A 1NVSA 2NO3A 4RFYA 3KN6A 3ORKA 3VF8A 4ITIA 5J8IA 3V01A 4O21A 3V6RA 3OFMA 4HCUA 5KMKA 3MH2A 3MH1A 3Q4CA 2EWAA 2ITYA 4E3CA 2HENA 4HCVA 4EOKA 3FMMA 4Q9ZA 4EH9A 3FQEA 5E92A 3GT8A 4OBOA 4OT5A 5CT0A 4WSYA 1YRPA 4RVLA 3IDPA 3MW1A 3HL7A 4AFJA 1OVEA 4KWPA 5CQWA 4FTMA 4PTCA 4R77A 2XK7A 3PZEA 2UW8A 2QOIA 5AAFA 4HYUA 5HI2A 4MBLA 3HZTA 4I3ZA 4ITJA 3SDJA 2RFDA 2UVYA 2KULA 4J99A 4L3PA 4TWOA 3QTSA 5CQUA 2F4JA 4KIKB 5CENA 4FV8A 1IG1A 4AGCA 4TYHB 3EH9A 1UU9A 4JRNA 1JKKA 2YM5A 4GT3A 5ETAA 3VN9A 2XYUA 5HNGA 5HG5A 2G2HA 4BDBA 1BMKA 4NKAA 3D0EA 3G2FA 2W1CA 2CGWA 5DH3A 4KUJA 4R78A 4CZUA 5CY3A 3CR0A 2V5QA 2Y7JA 1U5RA 4IFGA 3HP5A 5D41A 2BUJA 3NMUF 5GIOE 2W17A 3ZLXA 4U79A 3VAPA 4C4FA 1J1CA 2FVDA 3QRKA 2QLQA 3VWAA 5GINE 3V8WA 2RL5A 4KIQA 3AQVA 4NZWB 4BFMA 4B99A 4O7RA 4EBVA 4DAWA 1A06A 1WVXA 2F7XE 5DR6A 2Z8CA 3R7VA 4BI2A 4ERWA 2YAKA 2YZAA 3VBYA 5JRSA 2B0QA 3ORPA 2WPAA 2IVSA 3QLGA 2JAMA 1I44A 4CD0A 3EN6A 3IPHA 2OH4A 1VYWA 4XJ0A 3NZ0A 3VBWA 4DFUA 1OIRA 3MY5A 5AADA 2ITOA 1U54A 2QU6A 3GU8A 5AWMA 4GT5A 3NDMA 2BKZA 2XCKA 4XG9A 4YHTA 3BYSA 3UO4A 4W4YA 5AA8A 3LJ0A 1ZMUA 5EHLA 4AP7A 2CLXA 3EQGA 3KN5A 3E8NA 2G15A 4BZDA 1W82A 1XKKA 5HD7A 5GZAA 3G9LX 3NCZA 5H3QA 3IQ7A 3FMKA 2XBJA 3M2WA 3ODYX 4Z7HA 2HW6A 2PMOX 2R3MA 3W1FA 3S4QA 4Q2AA 3QBNA 1CM8A 3AMBA 3QC4A 3OTVA 3UMWA 3CKWA 4K9YA 5HEZA 3V5LA 1YXSA 2XIRA 2C68A 4FIEA 4GK2A 4GUEA 2VWBA 5H9BA 3TTJA 3HV7A 4Z7GA 5E8SA 3E93A 2R3LA 2V22A 2WELA 4M3QA 4F64A 5DT4A 4DG2E 2XNBA 4BRXA 2CNVA 3NVKI 3PJ2A 2Y6OA 4RIXA 2XK3A 4DH3A 3VS5A 3OCGA 2GTNA 3PYYA 4MWHA 2Z7SA 4DGNA 5LWNA 3Q96A 2VTRA 3HEGA 3I1AA 2YCSA 4QYHA 3L9LA 5KO1A 5HTCA 1Q97A 4GRBA 5BMSA 4FKPA 3T3UA 3LXPA 2WNTA 1WBPA 3TTIA 3MVLA 2JD5A 2WTWA 3QTIA 4WG5A 4X2FA 1XHAA 4XS2A 3H4JA 3DXNA 4U42A 4WD5A 3LFQA 4M97A 4DTAA 3EMGA 3TCPA 3L8VA 3FJQE 2GS6A 3ETAA 3R1YA 4F9CA 5KCVA 4QYGA 3COMA 4MKCA 4ITHA 4Q5EA 4R3CA 4S30A 5BVWA 1XH5A 4JAJA 3E5AA 2ITZA 4JDHA 4NYEA 4WKQA 2E9PA 5IA0A 3ZMMA 1GIIA 4APPA 4MQ2A 5DRDA 2ITUA 5ANGA 3U6JA 1Y57A 3KU2A 3QRUA 2V55A 3OP5A 2X39A 4LL5A 4FKRA 4DFYA 3NW6A 2CCIA 4EOJA 5IA5A 3WZDA 4NIFB 2HZIA 2NRUA 5HE2A 3PXKA 5HCZA 1WBNA 3COHA 4QMLA 3PTGA 2I0HA 4CZYB 5DN3A 2CGVA 3F3TA 5LCKA 1YI4A 2C69A 2J90A 4ZSLA 1TKIA 3NWWA 4GL9A 3FEGA 2C6OA 5AV3A 4O7ZA 2VX0A 4X2NA 2BTSA 3QX4A 4U6RA 4Y72A 5C27A 3AMAA 2VGOA 4I92A 4M14A 5CSHA 4ACMA 3VQUA 4LOQA 2PK9A 5DEYA 5EH0A 3BE9A 3EKNA 4F9YA 4FVQA 2IZUA 1UV5A 2E2BA 4TW9A 4R7IA 4QMSA 4BCKA 4G17A 2YDIA 4QQTA 3GCVA 3NUXA 2OFVA 4CFWA 2OG8A 2ZMCA 4EHZA 3HA8A 3FPMA 4GU9A 3A7FA 4FSQA 3MJ1A 3Q60A 3G6GA 5HO6A 4CV8A 1OIYA 3ORTA 4OTGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WBW A;  1JVP P;  2XKE A;  1UVR A;  2JII A;  2XK8 A;  1BL7 A;  3LMH A;  4XV9 A;  4MUQ A;  3GC0 A;  3DLS A;  4XNE A;  3TKH A;  1WBT A;  4UN0 C;  1X8B A;  2RG6 A;  3NUN A;  4JOA A;  5DT3 A;  3KRL A;  1GAG A;  3UOH A;  1H27 A;  2X8D A;  3B8R A;  5AR8 A;  4KAB A;  2E9N A;  3OEZ A;  4IC8 A;  4JQ8 A;  4DGL C;  3UOD A;  5IQD A;  3OXZ A;  5M4F A;  4BVU A;  1QPC A;  3VQH A;  4ASX A;  4RGJ A;  3ATT A;  4O96 A;  4NJD A;  4RA5 A;  2R7I A;  4IWD A;  5KMN A;  5IA1 A;  5HVY A;  4JX3 A;  5IKW A;  5HIB A;  2O65 A;  4IE9 A;  4R1Y A;  1PXK A;  3ANR A;  2OXD A;  4EUT A;  5BV3 A;  4ZTQ A;  3BU5 A;  4IM2 A;  3VS3 A;  2H9V A;  4QNY A;  2KTY A;  3HRB A;  4IEB A;  4X3F B;  3A2C A;  4CMU A;  3OZ6 A;  4D28 A;  4Z3V A;  2YAB A;  3G9N A;  3QQH A;  4YHJ A;  5GZ8 A;  5M53 A;  1H4L A;  3OBG A;  3UC4 A;  3PFQ A;  4AWI A;  4KSQ A;  2CDZ A;  5L2W A;  4II5 A;  5D7A A;  5CEP A;  4K8A A;  2XRW A;  1IRK A;  3FME A;  4RJ4 A;  3MGY A;  4LGD A;  2AC3 A;  3EOC A;  4L01 A;  4CZT A;  1P4F A;  2OIQ A;  1H07 A;  5AUZ A;  1JBP E;  2PVJ A; 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