1ZYDA

Crystal structure of eif2alpha protein kinase gcn2: wild-type complexed with atp.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
302
structure length
270
Chain Sequence
SLRYASDFEEIAVLGQGAFGQVVKARNALDSRYYAIKKIRHTEEKLSTILSEVMLLASLNHQYVVRYYAAWLERRNFVKKKSTLFIQMEYCENRTLYDLIHSENLNQQRDEYWRLFRQILEALSYIHSQGIIHRDLKPMNIFIDESRNVKIGDFGLAKIGTAMYVATEVLDGTGHYNEKIDMYSLGIIFFEMIYPFSTGMERVNILKKLRSVSIEFPPDFDDNKMKVEKKIIRLLIDHDPNKRPGARTLLNSGWLPVKHQDEVIKEALKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Basis for Autoinhibition and Mutational Activation of Eukaryotic Initiation Factor 2{alpha} Protein Kinase GCN2
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase GCN2
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 75
structure length 270
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zydA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zydA01
3SV0A 4XS2A 4UZDA 4D55A 4AUAA 4FZDB 3KRRA 4C3FA 4I24A 2VTAA 5M55A 1RE8A 4CZYB 3W8QA 3PJ8A 4BI0A 5E1SA 4AA0A 2YDJA 4E5AX 4EH9A 4XV1A 5M4UA 2VU3A 3BHYA 5CAOA 4C4FA 2XNOA 5EW3A 1U5RA 3QTRA 3LCDA 3G2FA 3EZVA 4AS0A 2ITQA 1LUFA 3LZBA 3LJ0A 4UMQA 5ITAA 1JSVA 4M66A 4ZS4A 4NW6A 3NVKI 1DAWA 4UYNA 3HMOA 3V6RA 5IMXA 1OMWA 3GU4A 4V0GA 2VWYA 4KB8A 4YHFA 3UO4A 4LUEA 4PTGA 2PMIA 2YM5A 4IC7A 1Q99A 4AW0A 2BMCA 3KXGA 3AMYA 3DKFA 4QMPA 3HV6A 2WEIA 5DG5A 2YZAA 4TYIA 3WYXA 5CANA 2JIVA 2VX3A 5ANOA 3LCTA 1RJBA 4EZ5A 3TV6A 3GGFA 2WIHA 3O71A 3FXWA 3QCQA 4YBKA 3RPSA 5JGDA 4BR3A 4XV9A 3EKNA 4X6RA 4O7WA 4ZSEA 2G9XA 4GKHA 4A9RA 2YIRA 1Q8TA 1GIIA 4P5QA 4TYGA 5HE0A 2I6LA 2ZM1A 4ZLYA 4FNYA 4YJOA 2GS6A 3RAKA 5GZAA 4D0XA 3DLZA 4DCEA 2CKQA 3QTZA 1ZYLA 4YPSA 2WMTA 4C59A 5AAEA 1U5QA 3SG9A 3EJ1A 2PMLX 4CYJA 1U4DA 5H8GA 4BIEA 4O7NA 2IVTA 5E4HA 3JPVA 3V3VA 3ZH8A 4JQ7A 2V62A 3NVMB 3C4EA 3VS3A 5JT2A 5BMSA 4YJTA 3T8OA 3P7BA 2ITZA 3QC9A 4GJ2A 4KINA 4L43A 3QWJA 3ZFMA 1XWSA 3FMHA 3R83A 4KUJA 3FMMA 4APCA 4ANLA 2IW9A 4P4CA 4PL4A 3CKWA 4MQ2A 5DMZA 3WILA 1ZY5A 4EKKA 4IB0A 4QMQA 2QLUA 4DAWA 4EZ7A 4RC4A 4G5JA 4H36A 4RIYA 5HLNA 3F3UA 4F9BA 2QOLA 1REKA 3R8UA 2WTVA 3FMNA 3I1AA 3RM7A 4CLIA 4PP7A 4QMNA 2JDVA 3LHJA 2BCJA 4A4XA 3SGCA 2UZVA 5GJFA 3TZ7A 5LVMA 2OIDA 1LEWA 3P78A 4DFYA 4NIFA 3D4QA 1K2PA 2ZYBA 4RGJA 4FYOA 2YLFA 2ITXA 3GCQA 2VTQA 5E8YA 4AT3A 2P3GX 4U81A 1XJDA 3MV5A 1Q4LA 3VS6A 3DXNA 2VTTA 2C6OA 1JQHA 2YABA 4NM3A 4NTTA 3WZEA 4EC8A 4PTEA 5J7BA 5BVOA 3HGKA 2HAKA 1IAHA 3VBWA 4LFIA 1F0QA 2WPAA 3V8TA 5KMJA 4WSYA 2ZMCA 2W9ZB 3A61A 1PMEA 4D2WA 4O0XA 3TNIA 2BAQA 1CSNA 3DNDA 2B9FA 3TTJA 1KV2A 1URWA 2HZ0A 2ITPA 2O8YA 3H0YA 3IONA 2XP2A 3FI3A 4I41A 1E1VA 1IASA 4IB3A 2XNMA 2QOFA 4J96A 4RZWA 5E8WA 2O0UA 2JIIA 2ETKA 2UZLA 3G6HA 4K33A 3DAKA 4BB4A 1S9IA 1ZMVA 3D5XA 4GK2A 3UG2A 5DBXA 3Q4TA 3O17A 4FZ6A 3PVWA 3A2CA 4FKUA 2UZUE 1UU8A 5CSPA 3S00A 1NVSA 2WMRA 3MY1A 4RT7A 4E20A 4HW7A 3FKNA 5KCVA 3NYXA 4IVAA 3E5AA 1R0EA 3PP1A 4RJ8A 2ERZE 5E8UA 5HE1A 2LAVA 4DF3A 2H8HA 2EXCX 3OUNB 2C3KA 2VTMA 4KRCA 2XIXA 5CEKA 2OW3A 5KMOA 3EQHA 4L9IA 3U55A 4RVTA 4QMYA 4I94A 5A14A 4KIKB 4TY1A 2J0LA 3VQUA 3FZTA 4ZZNA 5K3YA 1UNHA 1Y8YA 4NM5A 2GQRA 3FLWA 3OBGA 4E5BA 3GU7A 5CNNA 4YURA 4YJRA 4U6RA 1XH9A 4ZEGA 3F2RA 3BGZA 2R3QA 3GQLA 4BGGA 2PVLA 3PFQA 1E1XA 5I5ZA 2YCQA 4O0YA 1KUTA 3SRVB 5AV0A 3B2TA 1Q61A 3MY5A 4ERKA 1Q97A 3JS2A 2YACA 3IKAA 3F82A 2GS7A 3ITZA 4JJRA 1ZYJA 4AW2A 5FP5A 5AM6A 3FHIA 3K3IA 2F7EE 4AAAA 4HGEA 4EZ3A 1IRKA 5EYKA 1JVPP 4NKSA 5CSWA 2ZV8A 1FVVA 2WMAA 5M4FA 4DTBA 4FSTA 2YAKA 1F3MC 3OXTA 5E8TA 1H4LA 1RQQA 3ZSHA 3Q60A 3V5JA 2J6MA 5B2KA 4GVJA 5TOZA 4E3CA 1W82A 1YOLA 5JRSA 4D2TA 4RX7A 1NXKA 1PXLA 4IM2A 4U5JA 4XOZA 4AGCA 3DDPA 2XKCA 5CF8A 3TUCA 3MFUA 3RALA 4J95A 4EOOA 2P4IA 3U4WA 3E64A 3WOWA 2CNQA 4FKLA 2W4KA 3ZUUA 5IDPA 3OG7A 2HZNA 2XVDA 1MQBA 2YDKA 4IX4A 4ZIMA 1WBWA 2J5EA 2YM7A 1K3AA 4XYFA 4O1OA 4YZCA 3PUPA 5B2LA 3I81A 3HRBA 3MDYA 2ITWA 3QTQA 3KMUA 1YHWA 3W2QA 3VUIA 2XRWA 5EDRA 3V8WA 2BAKA 2HY81 2W1IA 2BFXA 3PY1A 3C4WA 2JAMA 3B2WA 1JAMA 4M97A 4U7ZA 2X8IA 3KRXA 3RP9A 2CGVA 3ZU7A 5EKNA 4D5KA 3HNGA 5E8XA 3REPA 2KTYA 2Z2WA 5AR2A 3N9XA 4L01A 3C4CA 1PMVA 4BCOA 1OPKA 3LFBA 4ACGA 4D4SA 1U54A 3TCPA 3G0EA 3P79A 2YM8A 4GU9A 4BCGA 3PG1A 3DFCB 4TKSA 3AGMA 4R7IA 3RVGA 4BICA 5A46A 2WTCA 4ZP5A 1YXTA 2CCIA 2UW0A 5H9BA 5IH4A 4X2NA 1QPEA 3DS6A 3NAYA 4DITA 4O7YA 4NJDA 3R7IA 3DZQA 4ANQA 3PZEA 4I5MA 3OCTA 2PVFA 3HAMA 4QQJA 3UP7A 3QKMA 4FKIA 4G3FA 4GVAA 1KE7A 2C68A 3KEXA 5A4TA 4FSZA 5AADA 4TN6A 2WELA 5HORA 3DQWA 1WBOA 3AC2A 3UTOA 1UVRA 3KULA 3QQUA 4WG3A 5T6KA 4BDBA 4F7SA 2GQGA 4EJ7A 4Z55A 5AR7A 3EKKA 4W4XA 3VF9A 3HUCA 5B0XA 4MF0A 1EH4A 4KSPA 3JYAA 4ZY5A 4ITIA 2I1MA 4K11A 3FV8A 3SOAA 4AZWA 2W06A 5HBJA 4J53A 3UIXA 4R7HA 4BL1A 4FT0A 4ACMA 4F6SA 2X81A 4LUDA 1V1KA 1YXVA 5J9YA 5E92A 3CQEA 4MD7E 3SDJA 4YUQA 1Z5MA 3MTFA 4XUFA 1H0WA 3F3VA 3PIXA 2B9IA 4EWHA 4N0SA 5H8BA 1ZYSA 3OCBA 3OD6X 3MB7A 2J50A 3U54A 3VC4A 5IF1A 2I40A 3ZHPC 3BYMA 3GCPA 2C0OA 4C4HA 3UOHA 4FG9A 4HZSA 4I4EA 1PXKA 4BRXA 2BRMA 3QLFA 2QQ7A 3VBQA 3COKA 3CD3A 2ITOA 3EFLA 5CS6A 4C3PA 1WFCA 3BRBA 4RVLA 3OZ6A 2QG5A 3PWYA 4L44A 2QKRA 4JVGA 5CSHA 4S30A 5AP4A 3UC4A 4F99A 4DH8A 1OIQA 1V0PA 1YRPA 4DEHA 1P2AA 4FNZA 5BX0A 3D83A 3O8PA 3NS9A 4GIHA 4KNBA 3NLBA 4RC2A 4Z3VA 2R9SA 3KU2A 4FTLA 1QPCA 4JBPA 2B7AA 3K5UA 2C0TA 2GU8A 3DGKA 1WBPA 3W2CA 4M12A 5FEQA 3W18A 4TRLA 5KMMA 1VEBA 4FKOA 3IK3A 3QA8A 4O84A 4BTMA 4K6ZA 3VUTA 3MFRA 4LGGA 1PXMA 2JKKA 3POOA 3EQPA 3NUAA 3H0ZA 4JBVA 4IVBA 4RG0A 4P5ZA 5ACKA 4ZAUA 3BWFA 3LLAA 3HRCA 2ZVAA 1PMUA 4S32A 4G2FA 5CX9A 4U40A 2CKPA 3SOCA 5J9ZA 1ZMWA 4PTCA 3LPBA 5K4JA 3PA5A 1KOBA 2PZPA 4Y85A 4N6ZA 4AT5A 4EORA 1Q8UA 4FKVA 4FKSA 2VTLA 3CBLA 4FEQA 4P7EA 3ZM4A 3UQCA 3PSBA 5AIKA 1GZOA 1K9AA 4FT3A 2C5YA 3I6WA 3DBDA 3Q2MA 4QTBA 4TNBA 4GT4A 3HUBA 5E8SA 3ZCLA 1KE8A 3LFAA 3E8DA 3U8WA 4E4MA 5F20A 2OJGA 2UW9A 5EI2A 4MBIA 3IW6A 4GIIA 2HIWA 3G90X 2Z7QA 2Y4PA 4I93A 4A07A 3C4XA 2QONA 5L2WA 5EQEA 2SRCA 2OICA 4MVFA 1H1QA 1JKKA 1OKZA 4ZTLA 5BVFA 2YIWA 5L3AA 1R78A 2WMSA 2XIYA 3BYOA 5AR5A 3DKOA 3R73A 3QD4A 1MRVA 1H1WA 4RX9A 3UNKA 2JDRA 2V7OA 3R63A 5HG7A 3P86A 4F9YA 1HCLA 4LRKA 2F7XE 5HG5A 2F7ZE 1BI7A 3MBLA 2PVNA 2RG6A 3R9NA 3OOGA 3FL5A 3OFMA 4NZWB 4BIBA 4D1ZA 2BZIB 5BMMA 5GNKA 2X9FA 4D58A 3DJ5A 4G3EA 3LFEA 5BUEA 2PVHA 4XX9A 3F6XA 1JSTA 4L42A 5ETAA 5L6WL 4FIFA 2WQNA 3F5UA 4EL9A 4HPUE 3CQUA 5DIAA 5L8JA 1JKSA 4M84A 3FMKA 1M7QA 2XK9A 4FK6A 3DY7A 4BZDA 4EH2A 5J1WA 4QYGA 4S31A 2QO7A 2P2IA 1OIUA 3QBNA 4OTFA 4BFMA 2PHKA 3ENMA 4AOJA 4NM0A 2WKMA 4BC6A 4QNAA 2XKFA 3G9NA 4AE9A 2CCHA 2KULA 1H01A 2WOUA 3C4ZA 3EN7A 2VTHA 3RPRA 3VUDA 2Y6OA 3OXIA 1JWHA 5HTCA 5KBRA 3QTIA 4YZNA 3B8QA 3KFAA 2P0CA 2UW7A 2PE1A 2B54A 2JFLA 3MH2A 2OZAB 3QC4A 2UW3A 3Q4ZA 5AFVA 4A9SA 2HOGA 2VWUA 1CKIA 3WF6A 4ASEA 5G1XA 5CENA 5C8NA 5IEXA 3AMAA 2PWLA 4FIJA 2HYYA 2OK1A 3K5VA 1GIJA 4MBLA 4MNEB 5AMNA 1A06A 4DEDA 4O22A 3F7ZA 3OF0A 2UUEA 3FYKX 4TWPA 4YLKA 5M4IA 2WQBA 1GJOA 4FV8A 1BI8A 1SM2A 2Z7LA 4TWCA 5AP0A 3R22A 4IBMA 3EQIA 3O7LD 1W98A 3I5ZA 4RIXB 1DM2A 4GT5A 4F1OA 4FV4A 2RGPA 3GXLA 1O9UA 4Z9LA 2R7BA 3CTJA 5ETIA 3E93A 3FSFA 4ZLOA 3BE9A 3CP9A 5LMBA 4HJOA 3BGQA 4RWJA 3PRFA 4NFMA 2PPQA 3ATSA 1CMKE 3FC1X 1RW8A 5DR9A 2ITYA 1SNUA 3QRIA 2GMXA 4ZY4A 3MYGA 3IDCA 1O6KA 5A4EA 3GU6A 4C38A 3QUPA 5C03A 5EG3A 4H1JA 3VBXA 2AYPA 2YITA 4QMOA 3C51A 4O91A 4BKZA 3R7YA 2QO2A 4ACCA 1WVYA 4ZMEA 2BKZA 2PL0A 2WTJA 4RFMA 4L45A 1W84A 1YDSE 3BYSA 5EH0A 4QPAA 3IECA 1QL6A 4P2KA 1PXPA 3PXQA 4AZEA 3QQFA 2WMBA 2VWXA 4OTQA 2EUFB 5ANEA 4C2WA 4HYIA 4HVSA 4FL3A 1GZNA 2C3JA 4J8MA 3ZO2A 3D9VA 4C36A 3GP0A 4GYIA 4FTIA 3ALNA 4NT4A 3NW7A 2J4ZA 4F09A 4WA9A 2BVAA 3FSKA 2UVZA 2J2IB 5AV2A 4F70A 5IU2A 3IDBA 1I09A 3E8EA 2V55A 4BDHA 3SVVA 1ZYCA 1BKXA 1KE5A 2NRUA 1BMKA 4QYEA 5JQ8A 1G8AA 5AX3A 2DQ7X 5KE0A 3U6IA 3E7OA 4QYHA 4JG7A 4U8ZA 4YJPA 3KXZA 2WTIA 2RIOA 1GIHA 4XG7A 4AZTA 3ZUTA 4GCJA 5IA2A 5DT0A 4CCUA 4IEBA 4N70A 4O0TA 3GENA 4DEGA 5JFWA 2J7TA 3GOPA 4L52A 3BV2A 4OTGA 4LL0A 2H9VA 2BHHA 2FYSA 2RKUA 4BCPA 3OEFX 5H3QA 2VAGA 4K9YA 5HHWA 3ZC6A 4CLJA 1UV5A 2R3FA 2Y4IB 2AC3A 3PYYA 2DUVA 3UC3A 5J5SA 4U79A 1MRYA 3PRIA 2OF4A 2FH9A 3OT8A 4IB1A 4IWDA 4RLKA 2YWVA 4QTCA 4FV9A 2JIUA 3FI4A 3QYZA 4NJ3A 2XNBA 3H3CA 4CMUA 2W5BA 3M2WA 4IE9A 4RC3A 5FQDC 5FD2A 3ZFXA 3MS9A 1H1SA 4UMRA 4Y83A 5AR4A 5KKRB 1T45A 2XJ1A 4G6OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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