1ZYSA

Co-crystal structure of checkpoint kinase chk1 with a pyrrolo-pyridine inhibitor
Total Genus 83

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
271
structure length
271
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRAVDCPENIKKEICINAMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTII1 (3-6)S2 (21-28)TI1 (5-8)S1 (9-18)TI2 (18-21)S3 (34-41)TIV1 (28-31)AH1 (47-61)TII'1 (76-79)TI4 (41-44)TVIII1 (43-46)S4 (70-76)TI5 (42-45)TI9 (149-152)AH2 (104-124)S5 (79-85)TI6 (64-67)TI7 (87-90)3H2 (133-135)S6 (90-91)TIV3 (128-131)3H1 (92-95)TI8 (139-142)AH4 (186-203)TII2 (97-100)3H4 (231-233)TIV2 (98-101)3H5 (264-266)S7 (126-127)S9 (144-146)S10 (153-154)S12 (160-161)TIV4 (156-159)TVIII2 (181-184)3H3 (171-173)AH3 (176-180)TI12 (249-252)TIV5 (208-211)TI10 (212-215)AH5 (216-223)TI11 (225-228)TVIa1 (228-231)AH6 (236-246)AH7 (256-260)TIV6 (247-250)S8 (136-138)TI13 (250-253)Updating...
connected with : NaN
publication title Pyrrolo[2,3-b]pyridines Inhibit the Checkpoint Kinase Chk1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 271
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zysA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zysA01
4HGTA 4AXAA 2X9FA 4FEXA 2W1FA 3D9VA 3GCSA 1GIIA 3FSFA 4DH1A 3HEGA 4FICA 4M67A 4BB4A 3W55A 3PJ8A 3Q3BA 2ITVA 2Y6MA 2IPXA 3R71A 4QTAA 1O9UA 3O8PA 4EOIA 4OTPA 2YHVA 3LCDA 3HA6A 4IBMA 3TKUA 1MRVA 3HL7A 3ZC5A 5E8XA 3EYHA 2GHLA 2PZ5A 4RLLA 4QPAA 4OTIA 4BWKA 1PXLA 4FIHA 5FTOA 4I5MA 5K5NA 3HMNA 3DS6A 5AR2A 1OL7A 1XBBA 3O8UA 5BVKA 2LAVA 5HBJA 4IZ5A 3RWPA 3HZTA 4FUYA 2B53A 4EHZA 5L2SA 4K18A 1FVTA 3THBA 2C6TA 4WO5A 1YXUA 3ELJA 1YOMA 3V5TA 3W8QA 1OL1A 5AP2A 2BZKB 2RSVA 4TYHA 4QYFA 3KXXA 4K6ZA 4W4VA 4PTGA 1KV1A 1U54B 5AIRA 2ITYA 4FIFA 5LOHA 5HTBA 4L45A 2Z7RA 3ZC6A 3TIZA 3O7LB 5ICPA 3BI6A 3E8NA 3QQHA 3BHYA 3EQRA 4NM5A 4RPVA 3ERKA 5E8UA 1FVRA 5EQPA 3KRLA 2QR8A 2C6IA 4O7VA 3DKOA 5HX6A 3OOMA 2B9JA 4H1MA 5FDXA 5CAQA 5IEXA 2I0HA 4O86A 4JJRA 4KSQA 4PP9A 5CF8A 4DFBA 2IG7A 2R64A 3EQBA 4B6LA 4D1XA 2VZ6A 1PHKA 4C38A 3NLBA 4JVGA 3RZFA 4CFWA 4G1WA 4RIXB 3F3TA 2E9OA 4J1RA 3E5AA 3F66A 3HV5A 3O71A 4MX9A 1UU3A 4PDSA 4XUFA 3DQXA 4O1OA 4FTTA 3FMHA 4XRLA 3TXOA 5LQFA 1OB3A 3UVPA 4AOJA 3VS0A 2R3OA 2C6DA 3TM0A 4O0TA 4DH8A 2C3IB 4UZHA 2O63A 5AM7A 2JIVA 4FYNA 4BTFA 2XNEA 5JEBA 4NYEA 3OFMA 3FQHA 5LVPA 2BKKA 3IDPA 4RA5A 1DAYA 3AC1A 4D1ZA 2VX1A 2W5HA 4Q5EA 2XKCA 4FTQA 5TE0A 2Q83A 3VS7A 3DBEA 1CKJA 1QCFA 4FL1A 4C3PA 4DEHA 1G3NA 5F9EA 2UZDA 4PPCA 1YOLA 2QONA 3LFDA 4X3JA 1TQPA 3F5XA 3KY2A 1MUOA 2XM8A 3O96A 1NVRA 4FTIA 4GS6A 3BU5A 1U59A 4ANBA 1ATPE 4UYAA 3IGOA 1WBWA 3GQIA 4QP4A 5TT7A 5BX0A 5CXHA 1YXSA 4EOMA 2UZVA 5AP1A 4LMUA 3AMAA 3FZPA 5AUUA 3R28A 3QTQA 2WGJA 2Y4IC 4FTUA 2C68A 3OW3A 3U9CA 3TZ9A 4Z55A 4GIHA 4BDIA 5IEYA 4EH4A 3HECA 1PMVA 2QC6A 3IGGA 4ASDA 4EHEA 3GNIB 5BVDA 1ERKA 4AGCA 2VTNA 4ANLA 4GSBA 4JBVA 1G5SA 2EB2A 1IAHA 4P90A 5ETFA 4ZTQA 2P4IA 4WIHA 2E9UA 4CEGA 2UZOA 1PYXA 1YHSA 4D0XA 3CQEA 2RFEA 3PYYA 4DGOA 5EQEA 3SGCA 4C4FA 3PP1A 4A9UA 5EM5A 3TUCA 3GT8A 4TN6A 3UOJA 2VO7A 3ZSGA 5EOBA 5FDPA 3RAWA 4AOTA 3UYSA 5AP3A 3VS3A 3DAKA 4TL0A 3A4PA 3W2QA 2QNJA 3I5NA 2VGOA 2WMRA 1M17A 1ZRZA 3IW7A 3G6GA 5FEQA 3FHIA 3COIA 2HZIA 1CM8A 1ZMWA 3CKXA 5DG5A 4HVSA 5KHWA 4ACDA 3QRKA 4BCPA 2VTJA 5KMKA 4F08A 3I79A 4L00A 4CFFA 1F3MC 3A7GA 3HV3A 3CP9A 5EM6A 3KQ7A 5EYCA 3NZ0A 4AG8A 5A3XA 3NCZA 4JQEA 3FLNC 4C61A 4PMPA 5A6OA 3UG1A 3UMXA 3KREA 3QTIA 2QVSE 1H08A 4EWHA 3WYXA 4RC3A 3PVUA 4I5HA 3V8TA 3RJCA 3P79A 1B6CB 4PV0A 3TZ7A 3ZDIA 2DS1A 3OZ6A 1CKPA 1YXXA 4FTRA 2HOGA 3VUMA 2EB3A 2ZMCA 3CR0A 4MXZA 3GGFA 3R1QA 3R7GA 2UZNA 4ZAUA 2W9ZB 4TWPA 1VYWA 3EQDA 4QPSA 2HY81 5FGKA 4D9UA 3ACKA 2W1ZA 3O17A 4HGLA 3FZRA 1BLXA 1FVVA 2XM9A 2XRWA 5E7RA 3NUPA 3TZMA 2H8HA 4ZSEA 4BCQA 3E63A 4IAIA 4YPDA 5HVKA 1OBGA 4K1BA 2QG5A 3R7EA 4P2KA 3DNEA 5CS6A 4ZZMA 3UNJA 4WNMA 2XEYA 2QOOA 4B0GA 4PL4A 4ONAA 3VUIA 4F09A 1V1KA 2PWLA 4FNXA 3SXFA 3NSZA 4IWPA 4YHJA 1XH8A 4LRMA 5JGAA 3FXWA 4Y73A 3OUKA 3KN5A 2YCSA 3KRXA 4NEUA 4BGGA 2P55A 5A9UA 3BHHA 5AAGA 3OD6X 3UOHA 4I41A 1RW8A 2JD5A 3MW1A 5EHOA 3MIYA 2X2MA 5IUIA 4YR8A 2WMVA 3P7AA 1YVJA 4DA5A 4L3JA 4F65A 2VWWA 4QMPA 1H28A 5F95A 3ALNA 4GK3A 4RBLA 4W4WA 5H3QA 4QMLA 3F82A 4YTIA 5CF4A 1J7LA 3BQCA 4H58A 1ZY5A 4TRLA 3PA3A 5HG5A 1Z9XA 2PUPA 3N4TA 1R0PA 3AD4A 4CLIA 2C3LA 3SQQA 1M7NA 4NU1A 3VNTA 2B9FA 5DGZA 4QMUA 3PA5A 3GU7A 4F0FA 3DKFA 2J7TA 1L8TA 2CSNA 3OCBA 4GV1A 4MTAA 1OUKA 4C02A 4CNHA 4D4YA 5JMSA 3NNUA 3G90X 5EH0A 5T6KA 2XK7A 3LKMA 2XNPA 3QQJA 4TKSA 4J98A 3OXTA 3U54A 2PVJA 3DTWA 5DNRA 5CT0A 5JN2A 4NJ3A 4G3GA 2Q0NA 2OZAA 2ITUA 4YLLA 3WZEA 1GOLA 4FIJA 4AA0A 3F2AA 4OBOA 4W8DA 4DHFA 3MA6A 3DKGA 2IN6A 4EC9A 5J9YA 3PPKA 4B99A 4EOQA 4O6LA 2JDSA 2CPKE 3UGCA 4IEBA 3QBNA 3UNKA 4YURA 1RQQA 1Q5KA 4C3FA 2V7OA 1GJOA 3D7TA 5I9WA 2JLDA 3OCTA 2YAAA 2VD5A 3SLSA 2PHKA 2WTWA 1UNGA 4TWOA 4LUEA 5D9HA 1JKKA 4EI4A 5L6PA 2ACXA 3F2NA 4FT7A 3UO5A 2Q0BA 5LXMA 2F7XE 2C1AA 2O3PA 1H4LA 1UWHA 5CSWA 2CCIA 2WNTA 4K2RA 2PPQA 4DBXA 4F6UA 3QA8A 4YZDA 4GYGA 4WG5A 1M2PA 2YLEA 4DAWA 5LVNA 3H0ZA 5IISA 1IR3A 2IZUA 5IDNA 2XYNA 1PMNA 3FWQA 1Y8GA 2XK3A 3CJGA 3ORXA 3PY3A 3QTXA 4I93A 5EDPA 3VS1A 3I4BA 4YTCA 3VBTA 4ERKA 3KXZA 4MBLA 4ACGA 3BE2A 4RWIA 2XNBA 5KCVA 3KXMA 4NL0A 5E90A 4ZY4A 3IK3A 5K4JA 2CKQA 2EU9A 4AN9A 2ZVAA 3VUDA 1FQ1B 4NTTA 4RX9A 4RRVA 4G3CA 3KKVA 3DXPA 4XLVA 4IWOA 4YPSA 3LCKA 4FKTA 2PVHA 4GG5A 2V7AA 3D2KA 4JXFA 4RQKA 3AGMA 3DFAA 4NJDA 3ZUTA 2X8IA 4FEWA 3NS9A 3UG2A 4BDKA 2WQEA 5CF5A 4P4CA 4QP8A 4CMTA 3U6JA 4U0IA 2RGPA 4MH7A 5CSHA 4EH2A 5CU3A 2FSOX 3GU8A 3I60A 2YM8A 5DR2A 4IX6A 4BCMA 5J95A 4UWBA 3ZCLA 3NIEA 3SG9A 3UQFA 1ZLTA 1U46A 3EQCA 3KXNA 3VRYA 2VX0A 1UU8A 2BCJA 4NT4A 4QD6A 1JAMA 1YWRA 2GTNA 4YO6A 4YJPA 4JBPA 4FT5A 5HG8A 3QX2A 3WZJA 5CEKA 4WHZA 3BIZA 4ITJA 3P7BA 4ZY5A 2YCRA 1M52A 4F7JA 4YO4A 3F3UA 4EH7A 4YLKA 4BBMA 1YXTA 2PZRA 5BUJA 1BI7A 2ZB0A 5AIKA 3U9NA 2V0DA 3T9IA 2YDJA 2XK4A 5D7VA 2VWZA 3TTJA 4D4SA 4EH3A 4LFIA 5AA9A 2WOTA 3PDTA 4KABA 1ND4A 1B39A 1GIHA 4K77A 3HAMA 3RPRA 4BZOA 2QKWB 3FC1X 1WZYA 3O7LD 1XH9A 4ZS0A 4B9DA 3EQPA 3QF9A 4OT6A 5CNOA 3UE4A 3KN6A 1YRPA 4RMZA 3QZIA 1JBPE 3A8XA 3FLQA 2NNWB 4GW8A 2CGWA 3I0OA 4LI5A 4F9WA 3FI2A 2IZRA 2OLCA 2R3KA 3VS6A 4D58A 3A4OX 4LYNA 3DAJA 2YCFA 2ZB1A 4EQCA 4ZOGA 2X39A 5C01A 3V04A 1M2QA 1Q3DA 4HVDA 1KE7A 4L3LA 4LOPA 4WUNA 1UNLA 4RJ5A 3C7QA 1YWNA 1QPCA 4GFOA 3C50A 3WF8A 5L3AA 1PXMA 3I81A 3OY3A 3FY2A 3CJFA 2BMCA 3AC5A 4FNYA 5AR5A 2VV9A 2VWYA 4YJTA 4GK4A 2UW0A 3VRZA 4JDIA 2UZWE 1DM2A 3ZRKA 3S0OA 1O6LA 5CVFA 4QMXA 3SX9A 5AUTA 4X3FA 4O0WA 4PL5A 2YA9A 2JKOA 4FC0A 4RWKA 3EN9A 4IVAA 3ZRLA 4IAZA 4MBJA 4CXAA 3KXHA 3HDMA 4V04A 4YC8A 1ZMVA 4PPAA 3NUSA 4IDTA 1CDKA 4MXOA 5E8ZA 4QTEA 1YHVA 2R7BA 3DK7A 3TN8A 3RNIA 1H1QA 4IQ6A 3DGKA 3MPMA 3SC1A 3MGYA 4MF0A 2VWUA 4ACHA 4HVHA 3NVKI 2WEIA 2XJ0A 5GZAA 3EFKA 1Q3WA 3LAUA 2WTIA 5CAUA 4IZ7A 4PL3A 1U5QA 2FSMX 4CFVA 3EIDA 3VUKA 4JG8A 2VTSA 4WRSA 3ZONA 3P86A 5GINE 2J2IB 4ZK5A 3COMA 4QT1A 3TV4A 4X6RA 4D1SA 1OIQA 4BTKA 2G9XA 4QP6A 2J51A 2WZJA 5AP0A 4YC3A 4O0YA 3UQCA 1OL2A 1K9AA 4R1YA 4C59A 1T45A 4F7LA 2V62A 2ETRA 3CTHA 3PZHA 3TJDA 1U4DA 5HICA 5E8SA 4EBVA 2XBJA 3OOGA 3D14A 3SG8A 4FR4A 4BI2A 5TOZA 4BI1A 5GIPE 4ZMEA 4DCEA 4BYJA 2PVNA 2UW4A 4N57A 4IH8A 2WIPA 4BCGA 4RLKA 2J9MA 2OIBA 4U80A 2Y8OA 4QMMA 4ID7A 3VBXA 1OPKA 3DJ5A 4L44A 4O82A 2RIOA 5AX3A 1VEBA 2YITA 3CQWA 1SMHA 5DOSA 3BEAA 3ODZX 4UALA 3CBLA 2VO0A 4BWXA 5HLPA 4S2ZA 3RPSA 4XG4A 3CY2A 5AAEA 2J5EA 2WTCA 4HVGA 5FEEA 2BR1A 3VQHA 4F9YA 3SW7A 2J4ZA 3D5UA 1OUYA 1WBOA 3DLZA 3W10A 2XIYA 5JQ8A 4Q2AA 4CFXA 5L2TA 4I6QA 3ZLWA 3KB7A 3KGAA 1U5RA 2OH0E 2EWAA 2B4SB 2H6DA 3JY9A 4FV7A 3PXKA 4RFZA 4DG2E 3HAVA 3A7HA 2HIWA 3BELA 4M0YA 2XKDA 4FTOA 4NZWB 4RIYA 1T46A 5HHWA 2BDWA 2XCKA 5KMNA 3FC2A 4ITHA 3MYGA 3BPRA 1Q62A 5AAFA 2ZDUA 1NY3A 3R21A 4YLJA 1LEWA 4R1VA 4YGAA 2YM6A 4ZTRA 4NM3A 4UZDA 1KWPA 2BZIB 4F70A 4EKLA 4BCFA 4DITA 3PY1A 4RJ4A 2B9IA 3FBVA 3ZDUA 3TDVA 2GS7A 3PPZA 4X3FC 4FGRA 3QCXA 4I21A 3BWJA 3R00A 4TTHB 1JSVA 1OIUA 4R7IA 1S9IA 2VX3A 2QD9A 3KF4A 4FF8A 4MK0A 4X2FA 3GC8A 4AW0A 4JI9A 5L8KA 3R8MA 3MFSA 4GT3A 4G3DA 2W4JA 3TZ8A 3U87A 5C8NA 4XBRA 2OJIA 1JKSA 4USEA 4AT4A 4GFGA 3V5QA 2CNUA 5B2KA 3Q96A 4D4RA 2OWBA 3BQRA 4OTRA 4D4VA 4G16A 3ZLSA 4C4IA 3EN5A 4F6WA 4XG2A 4FTKA 2XNOA 3EQFA 5C8MA 4XEYA 4FG8A 4UB7A 2QOQA 4USDA 5CVGA 2QODA 2VN9A 1ZXEA 4AZEA 3RNYA 1MQ4A 2C5OA 2UUEA 4BTMA 4QMYA 4AN3A 4BDDA 5EW3A 5IA0A 2BRMA 4H3BA 2OJ9A 4O0SA 2J5FA 5ANGA 4YTHA 3IPHA 2R0IA 4UXQA 3PRIA 3LXPA 4PY1A 3P1AA 5FG8A 3SV0A 4QRCA 4E8AA 2VTAA 2GDOA 3E7OA 2BHHA 3EH9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1Q8Z A;  4I5P A;  2GNL A;  2XYU A;  4ZTS A;  3ZLX A;  1MRY A;  2CJM A;  2UVZ A;  4FNW A;  4BBF A;  4N4S A;  5AUX A;  3ZO3 A;  4C62 A;  4X7Q A;  4WNP A;  5DT3 A;  2XNN A;  2PVR A;  3ROY A;  3MBL A;  4BIC A;  4RX5 A;  3FHR A;  4TWN A;  4ZSA A;  2IWI A;  3DY7 A;  3HKO A;  3MES A;  3IEC A;  4DFL A;  4O38 A;  2H96 A;  2KUL A;  3Q4Z A;  4XRJ A;  4MNE B;  3QRJ A;  3FE3 A;  2YWP A;  3QTZ A;  5I0B A;  4DF3 A;  3HP5 A;  3L9M A;  3FYK X;  3EN6 A;  3KVX A;  2PY3 A;  3R1S A;  4YZ9 A;  5EYM A;  5DI1 A;  5TKD A;  3JS2 A;  3TDW A;  1O6Y A;  4RG0 A;  3S1H A;  5K3Y A;  3KK8 A;  4PMT A;  5D12 A;  2XVD A;  4IAK A;  3UP2 A;  4ZY6 A;  5HBE A;  2PMI A;  3PXR A;  4O6E A;  4ZSG A;  5L2Q A;  4CG9 A;  5DR9 A;  5CF6 A;  3AC2 A;  3LOK A;  4Z3V A;  2W1E A;  4U9A A;  5KX8 A;  3KMM A;  1VR2 A;  4DH7 A;  4ZEG A;  2AC3 A;  2X4F A;  2OJJ A;  3NR9 A;  4DGN A;  5D7A A;  3CTJ A;  2ITW A;  4KB8 A;  4KIQ A;  5J87 A;  1OPJ A;  2FO0 A;  3GCQ A;  4G31 A;  2PML X;  4QYG A;  3W33 A;  3VBV A;  3C9W A;  5IU2 A;  5A4C A;  5IKW A;  2C3J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HGT A;  4AXA A;  2X9F A;  4FEX A;  2W1F A;  3D9V A;  3GCS A;  1GII A;  3FSF A;  4DH1 A;  3HEG A;  4FIC A;  4M67 A;  4BB4 A;  3W0N A;  3W55 A;  3PJ8 A;  3Q3B A;  2ITV A;  2Y6M A;  2IPX A;  3R71 A;  4QTA A;  1O9U A;  3O8P A;  4EOI A;  4OTP A;  2YHV A;  3LCD A;  3HA6 A;  4IBM A;  3TKU A;  1MRV A;  3HL7 A;  3ZC5 A;  5E8X A;  3EYH A;  2GHL A;  2PZ5 A;  4RLL A;  4QPA A;  4OTI A;  4BWK A;  1PXL A;  4FIH A;  5FTO A;  4I5M A;  5K5N A;  3HMN A;  3DS6 A;  5AR2 A;  1OL7 A;  1XBB A;  3O8U A;  5BVK A;  2LAV A;  5HBJ A;  3W0P A;  4IZ5 A;  3RWP A;  3HZT A;  4FUY A;  2B53 A;  4EHZ A;  5L2S A;  4K18 A;  1FVT A;  3THB A;  2C6T A;  4WO5 A;  1YXU A;  3ELJ A;  1YOM A;  3V5T A;  3W8Q A;  1OL1 A;  5AP2 A;  2BZK B;  2RSV A;  4TYH A;  4QYF A;  3KXX A;  4K6Z A;  4W4V A;  4PTG A;  1KV1 A;  1U54 B;  5AIR A;  2ITY A;  4FIF A;  5LOH A;  5HTB A;  4L45 A;  2Z7R A;  3ZC6 A;  3TIZ A;  3O7L B;  5ICP A;  4AXF A;  3BI6 A;  3E8N A;  3QQH A;  3BHY A;  3EQR A;  4NM5 A;  4RPV A;  3ERK A;  5E8U A;  1FVR A;  5EQP A;  3KRL A;  2QR8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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