1BI7A

Mechanism of g1 cyclin dependent kinase inhibition from the structure of the cdk6-p16ink4a tumor suppressor complex
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
292
structure length
269
Chain Sequence
DQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for inhibition of the cyclin-dependent kinase Cdk6 by the tumour suppressor p16INK4a.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 6
molecule tags Complex (kinase/anti-oncogene)
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 269
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 1998-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1bi7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1bi7A01
2W1HA 3MFSA 4J8MA 4JG8A 3ZOSA 1OIYA 1Q8ZA 3WZKA 5ACKA 5FM2A 2ETMA 4LGHA 1GZKA 3H10A 1A06A 4GU9A 4D4YA 4LV8A 3BV2A 1Q3DA 2BAQA 4LMNA 5HCZA 4BCOA 4BZDA 3R28A 4RPVA 3ZBXA 4QP2A 4RX5A 4ANLA 3GU8A 5AR7A 5JFWA 4OTIA 3AQVA 4IWQA 4UMQA 2J51A 3ROCA 3F2RA 4FT3A 2KTYA 1JKLA 5HIDA 5AUXA 3TJDA 2E9NA 4LGGA 2FSOX 3AMBA 3IECA 3ROYA 1JOWB 3MA3A 4RRVA 4G6OA 4YJVA 5AV1A 5HVKA 5HG5A 5F20A 2Y4IC 4JG7A 4L3PA 4Z9LA 1DS5A 4H3QA 3T8OA 5IA4A 3BKBA 3EWHA 1H8FA 3DT1A 3KC3A 3LKMA 1XJDA 3E63A 4M0ZA 3A60A 4U81A 3OY1A 4RIOA 4TYEA 2BIYA 2CKQA 5CEIA 3VUMA 4FSTA 1Y57A 4D9UA 3V5TA 4DTBA 3I5ZA 2WD1A 3ZMMA 4Z7GA 1J1CA 4FSYA 5LMBA 3W55A 3DZQA 4WNMA 5CX9A 2UUEA 4G5JA 4Q5EA 1WCCA 2XKCA 5J9YA 3TJCA 3RPSA 2H6DA 2O2UA 2P33A 3LM5A 4S31A 2PULA 4I3ZA 2XCKA 4JNWA 4DAWA 3KA0A 4PNIA 4FV6A 4NM0A 5EM5A 3UDBA 1WBNA 4AFJA 4P5ZA 5CF5A 1J91A 4E93A 3NAYA 3B8RA 2JBOA 3ATSA 3VBQA 5AWMA 4Y95A 2WMVA 1GY3A 4BKJA 5AUZA 4ENYA 1J3HA 3O23A 3OP5A 3OOGA 3F66A 2IN6A 3TI1A 3GU6A 2C6TA 2WKMA 1EH4A 5EHYA 4X2GA 5IQFA 4MF1A 4ZTQA 3AGLA 3E88A 4CT2A 2YEXA 4WSYA 1GIHA 3F9NA 3EQRA 4A9UA 3KF7A 5ETCA 3OOMA 3HV5A 4YJTA 5DIAA 5CVHA 4IX4A 3ZM4A 1J7LA 5GJDA 4BTMA 2V7OA 4L01A 2PUUA 1Q5KA 4BGHA 2NRYA 2JDVA 3EQCA 2QNJA 2OU7A 2X39A 3NIZA 4CMTA 1ZYSA 2GNIA 4NFNA 3G0FA 2OZAA 1KOAA 2Z8CA 3I4BA 4AUAA 5M4IA 4X21A 1UU3A 3VUDA 1Q4LA 3W2SA 4FR4A 5LJJA 4O38A 4PNKA 5C1QB 5DR6A 4FOCA 2XP2A 4S34A 4XRJA 4JBQA 4ACDA 4O0WA 1PXIA 4EL9A 1I44A 3LMGA 2RFEA 4IQ6A 2G2FA 4JAIA 4DH8A 2X2LA 5AP5A 2BROA 3ZONA 3MTFA 3QQFA 4R8QA 4TKSA 4CYIA 5J1WA 4BCGA 4TYIA 3DU8A 1U54B 3PWDA 4HGLA 3W2RA 2VO7A 2I1MA 4WRSA 2B55A 4BHNA 4XRLA 5CNOA 5IQBA 3RWQA 3AOXA 4WG4A 2UW3A 4YZDA 4DT9A 4D2TA 1QPEA 4PDYA 5KUPA 2FSTX 3GU5A 2VU3A 4YJUA 2VTSA 3JVSA 4H3PA 1OL2A 5B7VA 1G5SA 3MDYA 2V5QA 2W5AA 3FDNA 2UVZA 3AT4A 1K2PA 1JVPP 2P4IA 3Q53A 5C4LA 1YXVA 4RVKA 4A9RA 1VYWA 4BIDA 5IA1A 3DBDA 4NKAA 1GZOA 4ZTNA 3HAMA 3VO3A 2OFVA 4JJRA 4ACGA 2C5YA 3NIEA 1CKPA 3L1SA 2C0IA 3KRJA 3W2QA 3QYZA 1RJBA 5IQCA 4L7FA 3EFWA 4S33A 1NA7A 4AGUA 4UY9A 3LCTA 5CANA 3H9RA 3UNZA 4D2SA 2XF0A 4HVDA 3EKKA 3GFEA 1FGKA 4FKGA 3QGWA 3UQCA 3H30A 4FV1A 2P0CA 3RI1A 5M09A 3I5NA 4AXAA 4OBOA 2RFNA 2QU6A 4QOXA 2XRWA 3R8UA 3RZBA 2C6DA 5ITAA 1U5QA 2CDZA 3PA4A 4CZYB 3GBZA 4L3LA 4Y83A 5L8LA 3D2IA 4GT3A 4Y73A 5LWNA 3PSBA 2WQNA 1AQ1A 4EQMA 3DNEA 4BDHA 4AZEA 5LVLA 5IDPA 3LHJA 2YM7A 2PUIA 3I7BA 4EHVA 2PHKA 2VO3A 1WBTA 4KWPA 4TRLA 1MRUA 4BCIA 2OH4A 4DFUA 4TZRA 4PDOA 3LVPA 3JS2A 4EHGA 3PLAE 2QVSE 2XIZA 3FLQA 4O7TA 3TKIA 3O0GA 5FTQA 3DS6A 4L45A 2XNEA 4EZ7A 3TV7A 3PVWA 4F6WA 3MVJA 2V22A 4FTAA 4OT6A 2YACA 2Q0BA 5M44A 2XVDA 4O27B 4F9BA 2Y0AA 4QTEA 2X81A 4EC9A 4D28A 3V04A 5C9CA 5M55A 4UV0A 4LGDA 3LZBA 5E4HA 4BDAA 4FSRA 1PKDA 2YIQA 2J9MA 4NYEA 4RIWB 3U6IA 1G3NA 1IRKA 2HY81 3HRFA 1J7IA 3AGMA 3QHWA 1UA2A 1K3AA 1ZOHA 3V8WA 3DK7A 4L00A 4W4WA 2XNNA 3BU5A 4IZYA 1YDSE 4IADA 3R9OA 3G2FA 3ULIA 2V0DA 4AA5A 3KMWA 3R8MA 4IAYA 4PY1A 4JL9A 3RAIA 3FSFA 4DITA 3ELJA 2GHGA 3KRRA 2NO3A 3FMEA 1GIJA 5E90A 5CAOA 4KABA 3GGFA 3FMKA 1XO2B 2E9PA 4DH1A 2CLQA 2BFYA 2AC5A 4YZ9A 3DBQA 3EMGA 4G6NA 1O6YA 4KIKB 3P23A 4RJ4A 4RIXA 2VWUA 3ACKA 2VNWA 3W2OA 2VAGA 2RIOA 3ENHA 4X6RA 3VS5A 4QTAA 3LQ3A 2XYNA 2ZDUA 4FT0A 3ZHPC 2QLQA 4EH5A 3VWAA 3KN5A 1XKKA 5D7AA 1PMUA 3UYSA 2WELA 1LP4A 2W1EA 1SVHA 2JDOA 2W1DA 5L3AA 4FZ7A 4XG4A 4FKLA 3N4UA 4U40A 2EXCX 4MD7E 2HWOA 3IW7A 3RNYA 3DKCA 2VTMA 3QZIA 4K0YA 3VS4A 5B2LA 1XBCA 4XBRA 3UOLA 4AOJA 4RJ8A 1U46A 2WTWA 2XIRA 3CIKA 5AJQA 1YI6A 1T45A 1URWA 4KBCA 3QQLA 4EOIA 3DJ6A 4AW5A 4IFCA 3GVUA 4HNFA 4JDKA 5KNJA 1CMKE 4TYGA 3QRTA 2BCJA 4FL1A 4I5HA 3PJ2A 1OVEA 4I6FA 4TL0A 2Y8OA 1VYZA 2XK8A 3PLSA 3QRUA 4L67A 3Q6WA 3OWJA 4E1ZA 2WMTA 3PA5A 4R5SA 4FOBA 4G17A 3UPZA 3WE4A 4AW2A 5IA2A 4O0RA 5JN2A 4I6BA 4H3BA 4V01A 3ZRKA 4IVAA 4C2WA 2F7ZE 4BWXA 4QP3A 3ZBFA 2OXXA 1PHKA 3O8UA 3Q52A 2J6MA 4XLVA 4MXCA 4EK5A 3TZ8A 4RQKA 4ERKA 3GOPA 5CEQA 4AZTA 4UX9A 3WZUA 1OUYA 2B0QA 1XHAA 2ITUA 3FYJX 3UG2A 3MVMA 3MIYA 5IQIA 3DB6A 5D11A 1XH9A 5AR8A 4IACA 4EKLA 3ZYAA 3BYVA 3UIBA 3QZGA 2RF9A 2YDJA 3ID6C 3VW8A 4LRMA 2AUHA 2GNJA 1KWPA 4YTCA 3KB7A 5HLWA 4M84A 3CLYA 3WF7A 2LGCA 3IPHA 5EG3A 3KXGA 3MJ2A 5DYJA 4GKHA 5KMLA 3KRLA 5KHWA 4DLJA 5BNJA 3E92A 5IH4A 3FC2A 3PWYA 2C6KA 4WUNA 2BAJA 3PA3A 1UNHA 3UBDA 2DWBA 2YN8A 1WBWA 2J7TA 4YJQA 3WOWA 1PXKA 3DAKA 3DBCA 3P4KA 2SRCA 3MY1A 4W9XA 3V6SA 4NL0A 4WBOA 4ZTHA 4EWHA 1F0QA 5JSMA 3HV6A 4M67A 3UMXA 5BMSA 4FKIA 5GNKA 4QMOA 4BWKA 2R9SA 2IO6A 2J2IB 4K77A 5FQDC 5L4QA 2GQSA 2J4ZA 3ORKA 3ET7A 4AN3A 3DKFA 3R2BA 4C3FA 4BI2A 2W1GA 2XKEA 3KK9A 3CBLA 4YR8A 1UV5A 4PWNA 4FV5A 5EKOA 1YQJA 2W0JA 4EJNA 5CYIA 4C4GA 1PYEA 3PVBA 5LMKA 3SW4A 4IB1A 3JXWA 3AT2A 2VTQA 3R2YA 5ANIA 3QRJA 3D15A 4YNEA 4DINA 3NUSA 3VJNA 4AT3A 5I9UA 1H1SA 2NNWB 4ANSA 2CSNA 2F7XE 3U55A 3I1AA 3RALA 3DKOA 3NX8A 3FL5A 3GU7A 2JC6A 4L52A 5ANEA 4D0XA 4F63A 3OY3A 4FT9A 5K4JA 3L9PA 2HZIA 2VN9A 4IX5A 4OW8A 5AUYA 4H05A 4HGTA 3NMUF 5CU4A 3FHRA 4JX3A 4AT5A 3NAXA 2CGUA 3R1QA 2QOCA 4GMYA 3PPKA 4IFGA 2XK6A 3PE2A 3OXZA 1TQMA 2QOHA 2RFDA 4IM2A 4U45A 3R8PA 2XIYA 1ZYCA 2XA4A 3S4QA 4C37A 4EONA 1GAGA 1R1WA 3VBVA 5A4LA 4HJOA 2C69A 3EKNA 3I81A 5HHWA 3EQGA 3VRYA 3GC0A 3RK5A 3VQHA 5L6PA 1OB3A 5AV4A 3TEIA 4CYJA 4GK4A 2XKFA 3BU6A 4C61A 1VZOA 1Y6AA 4LRJA 3H9OA 3VAPA 3ATTA 2GDOA 4UXQA 4AP7A 5HU9A 2OZAB 1VEBA 4LL5A 3RBWA 3P86A 5KMJA 3Q4CA 3P78A 4X3FB 3MI9A 3RK9A 1YOJA 1FMOE 5KCVA 2X4ZA 5EI2A 4D0WA 3U6HA 1Y6BA 2G01A 4HYHA 2YLFA 3EN9A 2GHMA 2X0GA 3FYKX 3OT3A 3FXZA 4CFWA 4OUCA 3W1FA 4QMSA 4AZFA 5HICA 2BVAA 3UNJA 2ZOQA 4P7EA 4ALWA 1P2AA 2XNPA 3VS6A 4F65A 4MBJA 2W9FB 2QONA 3F2AA 4CCBA 4Z55A 5IA5A 4RFMA 3BHVA 3FMMA 3OF0A 3RHKA 3ALNA 2R3QA 3G0EA 3QQJA 4FTLA 2W96B 5DRDA 3PP0A 4APCA 4DGOA 5BUEA 4AW0A 3HX4A 3O7LD 3HUBA 5C8MA 1PJKA 2YERA 1XH4A 4U41A 3Q9YA 2FVDA 2CKOA 4CVAA 5JH6A 2WTCA 5AADA 5E8VA 5J95A 5J9LA 3IW6A 4L43A 4O91A 5HCXA 2I40A 5A4CA 3G51A 2P55A 4CKJA 3CD3A 2OJGA 1QPJA 2P2HA 2WB8A 2OZOA 3KVWA 4KS8A 1Y8YA 3DAJA 3II5A 3W2PA 4QT1A 5CU0A 1OM1A 2AYPA 2Z7LA 4RVLA 1M2PA 2PUNA 4D5HA 3G15A 4FKSA 5TE0A 2WFYA 3R9RA 3PZEA 3ZO2A 1A48A 3O17A 5KMNA 4XMOA 3C9WA 2O5KA 2R3JA 2HCKA 3NW7A 1SYKA 4RX9A 3BQRA 3C0IA 1IASA 4LOQA 2B4SB 3I0QA 4P2KA 4DGGA 2OLCA 5T68A 3VUHA 3M1SA 4PRJA 5CSXA 3DJ7A 4O7LA 4P4CA 2W06A 4YZBA 3MFRA 4ZS4A 3C1XA 4QYYA 1YHWA 3A8XA 3WI6A 5DT0A 3L9LA 2CGWA 3C4CA 3TM0A 2OJIA 5JGAA 4BIEA 4N0SA 1U54A 4E3CA 1ZXEA 5JKGA 4GW8A 5IUGA 5HLNA 2O8YA 1H0VA 3VUIA 4K8AA 2X8DA 2ZB1A 5F4NA 3JY0A 4E6DA 4E6QA 5A14A 5I9ZA 2UW6A 3R8ZA 5IDNA 1YDTE 1Q8YA 4FVRA 5EQPA 3OS3A 2R4BA 4FA2A 1BI8A 1APME 3QCSA 4U6RA 3UG1A 5EQEA 5KKRB 3LFNA 3W10A 1X8BA 4IEBA 3GEQA 5H8GA 4D9TA 3D9VA 5L6WL 4BZOA 3FEGA 3EB0A 5AR3A 3F6XA 3QFVA 4N6YA 1MQBA 3HDMA 5LVNA 4E4NA 5I9WA 3E8CA 4DGLC 3FLZA 3ZC5A 4RX8A 4W8DA 3R73A 4KIQA 5TOZA 2R3RA 3UO6A 4BRXA 5A4TA 4ORKA 3P9JA 3WF6A 2YITA 4J96A 5LOHA 3TNHA 3OCTA 4YHJA 5DOSA 3U87A 2PVNA 4E6AA 4NUSA 4PDPA 3KXHA 2ITTA 4G2FA 3BHUA 4IB0A 3VBYA 5BQ0A 3SQQA 3SKCA 2W05A 3OW3A 4GK2A 4RJ7A 3U9NA 3UYTA 3WF8A 4LI5A 2BAKA 2VO6A 3N9XA 3PY0A 2ETKA 3UJGA 1W7HA 3K3IA 4W4XA 4LMUA 4QQ5A 2XRUA 5AV3A 4EZ3A 3G33A 3KMMA 2FA2A 2UW4A 4NU1A 2CNVA 3BX5A 4M0YA 1UNLA 3S2PA 2ESMA 4WKQA 2WEVA 4ITJA 4ZZMA 3ORPA 4BDJA 2QHMA 5AP7A 2IG7A 4FKRA 2HYYA 2ZM3A 5CSHA 2X9FA 3BGZA 5IU2A 2PPQA 3BYOA 3Q4TA 2R0UA 2UV2A 4YJPA 5L2IA 4RJ5A 3Q9ZA 4TNBA 3FPQA 3TV4A 2JKQA 5DR9A 5C01A 3MB6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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