1BYGA

Kinase domain of human c-terminal src kinase (csk) in complex with inhibitor staurosporine
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
262
structure length
246
Chain Sequence
GWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLLPVKWTAPEALREKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVVPRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the protein tyrosine kinase domain of C-terminal Src kinase (CSK) in complex with staurosporine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PROTEIN (C-TERMINAL SRC KINASE)
total genus 76
structure length 246
sequence length 262
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1998-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1bygA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1bygA01
3V3VA 2H96A 1KOAA 4QT1A 2A19B 3RWPA 1ZOEA 4JDIA 3ZMMA 3SX9A 3ERKA 2UVYA 4B9DA 5JT2A 5GJGA 3OS3A 3EIDA 3W2SA 3L8XA 2WPAA 4J95A 1UA2A 5IUGA 4LGDA 3VUDA 5TO8A 4A9YA 4H58A 3TKUA 3LXLA 4FMQA 3S3IA 3TUCA 5DFPA 3BHTA 1WBTA 4DFYA 4H3QA 2B7AA 4FSYA 3NW5A 3MTLA 5HVYA 5JFXA 4L3PA 5M4UA 3C1XA 4QP7A 4E5WA 4NU1A 4V05A 5DBXA 1ZOHA 2J0LA 4YGAA 4MEDA 4X3FB 5FRIA 4FOCA 2FO0A 3R1SA 4V01A 4D4SA 2BAQA 2OJFE 2ZB1A 3TJDA 3DFCB 4F9CA 4J97A 4XBRA 4XG3A 5AP1A 4AN9A 5KKRB 4GS6A 3DDQA 1ZARA 4BWKA 1G8SA 2GPHA 3FMLA 4AT3A 1U4DA 4RX5A 3FQEA 3EQFA 3VJNA 4MWHA 2VTHA 3LMHA 3TIYA 4U6RA 4DFBA 3R63A 1BL7A 4CFNA 2XYUA 1NA7A 2RG6A 3UOJA 2JDVA 1O6LA 4MD7E 1VYWA 2YM5A 5EOLA 5E8UA 4HOKA 2Z2WA 4I4EA 4B99A 4U40A 5CQWA 3VAPA 3QTZA 4CMTA 3DDPA 3TACA 5DWRA 5JGBA 3OD6X 4NW6A 2XNNA 4FKSA 4EHZA 3FXXA 3PUPA 1FMKA 4HYUA 3VJOA 3ZZEA 5KBQA 2YIRA 4BRXA 2ITUA 4U79A 4EYMA 4FSQA 3QCSA 4AGUA 4CRSA 3A8XA 2X4ZA 5JFWA 5IZFA 4TTHB 4LV8A 4JG6A 3TZ7A 2BRGA 5TKDA 3GI3A 1M7QA 4E6AA 4USEA 5I4NA 2C0OA 3LMGA 3BE2A 4KINA 4X2JA 5E1SA 3L8PA 4GFMA 2G2IA 3DKCA 4BDBA 5HE0A 3RWQA 3SDJA 2ACXA 3EQIA 4UX9A 5BVFA 3E88A 3I5NA 3KF7A 2B54A 3RZBA 1K3AA 3IDPA 3TV7A 4ALWA 4EEVA 2I6LA 2X7FA 4FT0A 4ANMA 3UQFA 3NVKI 2WTJA 4K33A 4F9WA 3GOPA 2W96B 3HV5A 3GVUA 4CD0A 1BI8A 2XK6A 4XH6A 4GT4A 5FGKA 4DH8A 3ZU7A 4FZFB 3VWAA 2EXEA 2O64A 4UXQA 3UG2A 5L6OA 2PUNA 2IVTA 1E1XA 2EXMA 2X6EA 1KSWA 4RJ7A 5E8TA 3DB6A 2RGPA 3W1FA 4PP7A 3PSBA 3O23A 5AAGA 2JD5A 2UVZA 5DEYA 3R1QA 3RI1A 2WAJA 2FSMX 2X2KA 5BVWA 5EH0A 2WEIA 4YLKA 3C9WA 4O22A 4WG5A 4OLIA 3HEGA 3SHEA 2OI4X 3EQCA 4LL5A 5BMMA 3VN9A 1QPCA 3CTJA 1OL1A 3VRYA 5G6VA 4DBNA 4XG8A 2Y4IC 1RW8A 2PMNX 3FY0A 3QCXA 4XG6A 4XX9A 4AN2A 5HD7A 4O7NA 3BE9A 4U81A 2YZAA 3G9NA 4DH7A 2YDIA 3UZTA 3TEIA 3B8RA 5ITAA 2Z8CA 5AUXA 1SNXA 3I7CA 4RLKA 2OZAA 4G3EA 3VUGA 4CVAA 2GQGA 5KMMA 2WMWA 3KY2A 3GOKA 3GEQA 4IEBA 4BBMA 3HECA 2G2FA 3MFUA 2HXQA 2ITXA 4FZAB 2W17A 3FQSA 4MXAA 2C1AA 3TNIA 4ANNA 4M15A 5AA9A 2OIDA 4PPBA 2X8EA 4M0YA 3ZO1A 2GNLA 2IO6A 4IANA 3LFBA 4KIOA 4NIFB 4PWNA 4M69B 1MP8A 4EK5A 4GU9A 3OXZA 4F1MA 4YJOA 1IA9A 4RWIA 4RIYA 3UIMA 3FSFA 2A0CX 1U54A 3VUIA 4HGSA 5KMLA 5DG5A 3LCSA 5CSXA 3SG9A 4ACHA 4JDKA 3EOCA 1YI6A 3PA5A 4UEUA 2QNJA 3BHUA 4YJPA 3OFMA 4RIXB 5KUPA 5JQ8A 4JBVA 3QZHA 4CTCA 4CZTA 5HX8A 2JIUA 4F7JA 1DAYA 3NW6A 4GFGA 3JVSA 4GK3A 1Y57A 4DYMA 3CTHA 5CF8A 5H2UA 4KUJA 2GHLA 3ZRLA 1R0PA 4G3FA 1H00A 3RAKA 2PVLA 4IWOA 1XHAA 3AC3A 3DTWA 4WKQA 3VBYA 1H26A 2IN6A 4C35A 3H0ZA 3CKXA 1TQMA 1LPUA 1WBSA 4IWPA 4K8AA 5HE1A 4AN3A 3LCDA 5A4LA 3HMIA 3PXZA 4DEHA 3RPRA 3ZC5A 4YNOA 4EYJA 3SXRA 2W1FA 3HUBA 3NS9A 3TNQB 4DTBA 3F61A 2OIBA 2CGWA 2YCRA 4FG7A 4P5ZA 3R8MA 5ANKA 3TV6A 3V01A 1P4OA 3WZKA 2RSVA 3D5WA 3R9OA 1P14A 4RJ5A 4KS7A 3F2NA 4LI5A 4M13A 4Y46A 1YRPA 3QZGA 1A48A 4RIOA 4Y72A 3DAKA 2ITZA 4UMTA 5E9EA 2C0IA 4NTTA 2BMCA 5F95A 4ACGA 3D14A 1I09A 4LOOA 2ITTA 3GUBA 3LQ8A 1ZMVA 4N57A 2C3JA 2Q0NA 3D5XA 4A9TA 3PXQA 4JAIA 4QMLA 2UZVA 3UE4A 2XYNA 3K5VA 4GKIA 1ND4A 2QU6A 1ZZLA 5DA3A 3L9NA 4H1MA 2FH9A 1YQJA 3W55A 4EONA 2F7XE 3E3PA 5LWMA 4WG4A 5L6WL 1ZYCA 4BI1A 3E93A 4AA4A 4WO5A 1URCA 4UB7A 4YTHA 2DS1A 1OMWA 3N4TA 1LEWA 2J7TA 4JDHA 3T3VA 4MHAA 4GU6A 3UGCA 3G33A 4PY1A 3QQUA 3Q2JA 5D11A 3MW1A 5JSMA 2BAKA 5JGDA 3F5XA 2UW8A 5HESA 1RQQA 3F5GA 4QMUA 4IADA 5J1WA 4FF8A 2ZJWA 2ZV7A 1AQ1A 3NDMA 4LMNA 4UYAA 4B4LA 4A4LA 2OU7A 4I5HA 3ZUTA 4JRNA 4CT1A 4NT4A 4ERKA 5K5XA 1KOBA 2E9VA 4KIKA 4Y83A 3QTUA 3EN9A 2CGVA 1G5SA 3P4KA 4FTCA 4XV3A 4AW0A 3VS7A 3RBWA 4BFMA 4J1RA 4ALUA 1YI4A 2PVFA 3Q5ZA 3SV0A 4AOJA 5EKNA 4EQUA 4BTKA 3NLBA 5M57A 3VS4A 1GZ8A 1H25A 2WTKC 4M84A 2UZWE 4GH2A 4AX8A 3QQJA 3ZH8A 3Q9YA 3KGAA 1H1PA 4BCGA 2J5EA 4FYNA 3SVVA 4WD5A 2F49A 4RX9A 4C58A 3POOA 1L8TA 4OBPA 3W2OA 2BALA 1JPAA 5DE2A 4ASXA 4YZMA 3RALA 3FI3A 5ICPA 4WA9A 3MPTA 3Q9ZA 4M68A 3ZZWA 5CENA 3QGWA 3CXWA 1ZMUA 4EK3A 4FV8A 3ZLWA 3PJ8A 3TI1A 2XJ2A 3ORIA 2VWVA 3V5JA 5I9WA 3NGAA 1M7NA 4UXLA 4MAOA 3RAHA 2OZAB 5IQEA 2J0IA 5IA4A 4FKUA 4TYHA 2A1AB 3IW7A 3FHIA 3RMFA 3ZFMA 3JPVA 1ZWSA 2R3LA 1BKXA 3RM7A 4FNWA 1KE8A 1P5EA 4O7WA 2O5KA 1H28A 2GNIA 1VZOA 3R01A 4FSMA 4GUBA 4Q5HA 4BGGA 2I7QA 2RG5A 2IW6A 3BLQA 4PDPA 2BRBA 1ZRZA 4QYFA 3VC4A 3NYVA 5ANGA 5CF6A 1JVPP 1NXKA 2V62A 2V7OA 3MFTA 2UW4A 1T45A 3V5PA 4I41A 4RIYB 4BDAA 4F64A 2UW7A 4Z55A 5CZIA 5M08A 5CASA 5E8YA 1SYKA 4QYYA 3OCGA 4FTQA 3FKNA 3F2RA 1PMVA 5EYMA 4DT8A 2R3MA 1B39A 3T8OA 2FYSA 3DXPA 2R3HA 2Y6MA 5CNNA 3V6SA 2P2HA 3OWKA 5AP7A 3BHHA 4NKAA 4EUTA 2IZRA 3OY1A 4DEBA 4GL9A 3UYSA 3R21A 5HCXA 4F65A 1OL7A 5C4KA 4GCJA 4PL3A 3UO5A 5HO8A 4F9YA 3A8WA 2Z02A 3WZEA 5I9YA 4FYOA 2E9PA 4FT7A 3C5UA 4UY9A 2YDJA 3C50A 4FNXA 3ZUVA 4WUAA 5IA1A 4X6RA 1PXJA 5IUIA 3R9HA 4Z3VA 3CQEA 4QMNA 4TNBA 4O0WA 3G6HA 4X2NA 3PRFA 2Y7JA 3HYHA 4JDJA 3LFNA 4C3RA 4AT4A 5AUYA 4GEOA 1R1WA 3CD3A 5AV1A 4QTCA 5J8IA 2VO7A 5CAUA 3QWKA 3QALE 4E5AX 3HMNA 1H1SA 2XVDA 3A7FA 3BYVA 3KRXA 3LFSA 3PG1A 3R28A 1YWRA 3IW4A 2VUWA 3BYMA 4QPAA 4LUEA 2WGJA 4QNAA 4FSRA 4CFWA 5HO7A 2B4SB 3MGYA 2HY0A 3UOKA 4EWHA 4FGRA 3BWJA 3HMOA 1PXIA 4C3FA 5AM6A 3U8WA 3GC0A 2BZJA 3KXGA 2LAVA 4PUZA 4EOJA 4R1YA 1H1WA 2HAKA 4DG0E 3BYOA 2CKEA 1ZYSA 3MI9A 4FTOA 4YU2A 2OW3A 3O8TA 3WOWA 1YXVA 3UVPA 2QOKA 4ID7A 3V6RA 3VUKA 2YIWA 3FE3A 3EKNA 4Z16A 5CF5A 5J7BA 4O6EA 2W4OA 5FUTA 3EYHA 3K3IA 5BPYA 3W2CA 3C0GA 1E1VA 1XH4A 3MVHA 3EJ1A 4E6CA 1GAGA 1ERKA 1U5QA 2PUUA 3FYKX 2IVSA 3LFDA 3NUUA 2YZLA 2JBPA 2OH4A 3QUDA 1R3CA 3HP2A 4NM7A 4G3CA 2V5QA 5HICA 3QRKA 3ZO2A 4HYHA 2RF9A 5HI2A 4FSNA 5IEVA 2YCSA 3D0EA 3PA4A 4M67A 3WIKA 3TZMA 4HCTA 5I3RA 3S4QA 3WYXA 4NSTA 4KD1A 2VO6A 3Q4UA 3AGLA 3G15A 4FIJA 4F7NA 2CHLA 2YM3A 2Y4IB 4O83A 2OK1A 3TIZA 4M12A 5EI2A 4AACA 4E3CA 4GG7A 4LFIA 4D28A 4JNWA 3P1AA 4NH1A 4AWIA 1LEZA 3ULIA 1UNLA 3KEXA 4FTAA 3WZDA 5KCVA 3QTXA 4IAIA 4APPA 2R3NA 3N4VA 2BPMA 2IPXA 3OTUA 4KIQA 4FKQA 2R3QA 4R5SA 5EYDA 2YWVA 3PYYA 2BZKB 3SLSA 4YC6A 1IRKA 5KMKA 4O7SA 2QODA 2WO6A 2VN9A 3OTVA 3CQUA 3FL5A 3HV7A 3LVPA 5IQFA 4EK4A 4XJ0A 5C01A 1M52A 3VHEA 3V5TA 5JQ5A 4DE4A 3EFWA 5IQIA 2PPQA 3PWYA 3HAVA 5D7AA 4EOSA 4FT5A 1RDQE 4CYIA 1OPKA 1IAJA 3RCJA 3NWWA 2UZUE 3LXPA 3ODZX 4RFYA 3R30A 5E1EA 3TL8A 2BIKB 5CZHA 2WQMA 4GG5A 5C8KA 4GVJA 3RPOA 3ZLSA 3O8PA 3HDNA 3VF8A 3G51A 2YISA 5HBHA 3EYGA 3MBLA 3R04A 3A61A 4HGLA 3DA6A 4NFNA 4RJ4A 5IPJA 2PVYA 3E7OA 5LMBA 4WRGA 2PE2A 2V7AA 3BWFA 3QXOA 5DLSA 4APCA 1OKZA 5FBNC 3E5AA 4TYHB 5GJFA 4P2KA 2XP2A 2W06A 4FV5A 2WHBA 4KABA 3AC2A 5FG8A 4KIPA 3RVGA 4QP6A 3RPSA 2UZBA 3OBJA 3NNVA 3QRTA 4HCVA 4OAVB 3Q9XA 4M66A 5AV4A 4IC7A 5ANDA 1WZYA 4E4NA 5AR5A 3UTOA 4HZRA 1FMOE 3N9XA 3VUHA 4JI9A 3H3CA 4K11A 3LCTA 4IMYA 3SXSA 4YTFA 5C8MA 5BUEA 2W1ZA 5K0KA 2RKUA 3KK8A 4QYGA 2CNQA 3HV3A 3H9FA 3A99A 3D9VA 3QTWA 4XUFA 3R7UA 4RX7A 3MTFA 4ZK5A 4Y73A 5K0XA 5HEZA 3QD3A 2W5HA 4UZDA 4XLVA 3IK3A 4B8MA 4RVLA 5BX0A 3D7TB 3DB8A 5ANOA 4LV5A 1GY3A 2VX3A 3PPKA 3HA6A 4NWMA 5AA8A 2OZOA 3DAJA 3D4QA 4L7FA 3FMEA 4BI0A 1QCFA 3MH1A 5K9IA 3DXNA 2G1TA 2HW6A 2FSLX 2B53A 5CSHA 4I5MA 4CG8A 3KL8A 4D4YA 4U3ZA 3K5UA 4D2RA 1OM1A 2JDSA 2JLDA 3ENHA 2WMAA 1Q8UA 3EZRA 4BC6A 4F7LA 4CLJA 4IZ5A 3EMGA 1YXUA 4OT5A 2PVKA 2OWBA 4O2ZA 2XJ0A 4TWCA 3UOLA 5L3AA 2WKMA 4O84A 3KMUA 3BEGA 4QOXA 4ZEGA 4PTGA 5EDRA 4JBOA 3PA3A 5AUVA 1HCKA 4MD9E 3RK5A 1M17A 3ORPA 4FTNA 3A7JA 5CT7A 4QMSA 3MDYA 3DZOA 3D7ZA 4EH3A 4QTDA 3KRRA 5HIBA 1XH9A 3LCOA 3ZBXA 3KXXA 2FA2A 4WBOA 3KA0A 4RIWA 3FMDA 4CNHA 1OIUA 1KE5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FIE A;  2XMY A;  5ETI A;  1R78 A;  3UMX A;  5HNI X;  2ZDU A;  4J8N A;  4F6U A;  3A7I A;  3QX4 A;  4P7E A;  4I20 A;  2GS2 A;  1U59 A;  2XS0 A;  3WF9 A;  3WF5 A;  4FZ6 A;  3GC9 A;  3BKB A;  4QMM A;  4O6L A;  3R8V A;  2XA4 A;  5JMS A;  2UZD A;  4R8Q A;  3Q4C A;  4DA5 A;  2VGO A;  4EZ5 A;  2V0D A;  3FLW A;  3IOK A;  3PIY A;  2B9F A;  4GT3 A;  3LM0 A;  3ZXT A;  5D41 A;  3RIN A;  4MH7 A;  4BCJ A;  4ACM A;  1BMK A;  4XS2 A;  2BCJ A;  2C3L A;  4FBX A;  2ITQ A;  4L6Q A;  5LAR A;  3UMW A;  5JH6 A;  4GJ3 A;  2BFY A;  2QCS A;  3F69 A;  4E8A A;  1OBD A;  4DBX A;  4PMP A;  1R0E A;  3FMK A;  3QYW A;  1FPU A;  4WNO A;  2JDT A;  3DLZ A;  4I21 A;  4QD6 A;  4O7V A;  1SVH A;  3FC2 A;  4EL9 A;  5JKG A;  3ZDU A;  1JNK A;  2RL5 A;  3GCU A;  3CY2 A;  2QON A;  3FLZ A;  1XJD A;  5B0X A;  2C6T A;  2R64 A;  4RQK A;  5M55 A;  2X8D A;  4NIF A;  4QQ5 A;  4ZTQ A;  4M69 A;  3BU5 A;  2XK9 A;  2HIW A;  4B8L A;  1SNU A;  5CU0 A;  4XG2 A;  4Z7G A;  4U80 A;  1JSV A;  2PWL A;  4OBQ A;  4IX3 A;  5AAF A;  3Q96 A;  4C37 A;  3RM6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V3V A;  2H96 A;  1XMM A;  1KOA A;  4QT1 A;  2A19 B;  3RWP A;  1ZOE A;  4JDI A;  3ZMM A;  3SX9 A;  3ERK A;  2UVY A;  4B9D A;  5JT2 A;  5GJG A;  3OS3 A;  3EID A;  3W2S A;  3L8X A;  2WPA A;  4J95 A;  1UA2 A;  5IUG A;  4LGD A;  3VUD A;  5TO8 A;  4A9Y A;  4H58 A;  3TKU A;  3LXL A;  4FMQ A;  3S3I A;  3TUC A;  5DFP A;  3BHT A;  1WBT A;  4DFY A;  4H3Q A;  2B7A A;  4FSY A;  3NW5 A;  3MTL A;  5HVY A;  5JFX A;  4L3P A;  5M4U A;  3C1X A;  4QP7 A;  4E5W A;  4NU1 A;  4V05 A;  5DBX A;  1ZOH A;  2J0L A;  4YGA A;  4MED A;  4X3F B;  5FRI A;  4FOC A;  2FO0 A;  3R1S A;  4V01 A;  4D4S A;  2BAQ A;  2OJF E;  2ZB1 A;  3TJD A;  3DFC B;  4F9C A;  4J97 A;  4XBR A;  4XG3 A;  5AP1 A;  4AN9 A;  5KKR B;  4GS6 A;  3DDQ A;  1ZAR A;  4BWK A;  1G8S A;  2GPH A;  3FML A;  4AT3 A;  1U4D A;  4RX5 A;  3FQE A;  3EQF A;  3VJN A;  4MWH A;  2VTH A;  3LMH A;  3TIY A;  4U6R A;  4DFB A;  3R63 A;  1BL7 A;  4CFN A;  2XYU A;  1NA7 A;  2RG6 A;  3UOJ A;  2JDV A;  1O6L A;  4MD7 E;  1VYW A;  2YM5 A;  5EOL A;  5E8U A;  4HOK A;  2Z2W A;  4I4E A; 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