1FVTA

The structure of cyclin-dependent kinase 2 (cdk2) in complex with an oxindole inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
298
structure length
282
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prevention of chemotherapy-induced alopecia in rats by CDK inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase, cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 282
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2000-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1fvtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1fvtA01
2C6TA 4N6YA 3CXWA 3KRJA 3DJ7A 4NWMA 3V6RA 4GYGA 1AD5A 2WTJA 4L67A 4IQ6A 1G8SA 4OTPA 2R3RA 2W1EA 4WIHA 4R7HA 1QMZA 3ZBXA 2UZLA 3UYSA 3ELJA 3H30A 4QP2A 2WTCA 3QQLA 3QALE 3UIXA 2ZVAA 1XJDA 3UJGA 5KMOA 1NT2A 3BYMA 2QOIA 2W5AA 4GS6A 1DAYA 2VWUA 4IAZA 5C4LA 4R1VA 2YM5A 3QA8A 3FXZA 3WILA 1ERKA 5EYMA 4C3PA 4YHJA 2VWWA 4BWPA 5E8UA 3S0OA 3LXKA 4BCFA 1JPAA 4X6QC 3PJ1A 4QMLA 3DKGA 3FMNA 4KNBA 4WG5A 1YVJA 1KE5A 5E1EA 2J0MB 4TW9A 3UG1A 5CYIA 4F09A 3DLSA 5KKRC 5C4KA 4R78A 2B9IA 4I5PA 4UYAA 2CJMA 2WMQA 4GG7A 4XOZA 5AR2A 2Q0NA 2GNHA 5CS6A 4HZRA 1UNGA 4BYJA 4C4HA 3CQUA 4I92A 2R3IA 3AD6A 4AAAA 3WOWA 2QI8A 2EXEA 4TYEA 1H08A 5I9UA 3HMIA 4ENXA 3UE4A 1R0PA 2ACXA 3CTJA 1H07A 4OTQA 3NWWA 4C2WA 2JLDA 5AR8A 4EZ5A 3FZTA 2PUPA 4RX7A 3PY0A 4JG6A 2ZDUA 4AN9A 2QO2A 3GBZA 3DCVA 3LFCA 2W5HA 4DLJA 4HCVA 4ERWA 3FI4A 3HDNA 4EOOA 1U46A 3F61A 3PXKA 2PZYA 3THBA 4R7IA 4EHEA 3KMUA 1BL7A 3BGZA 4IDTA 4K77A 5L3AA 4J1RA 3F3ZA 1RW8A 3LMHA 1NW1A 4EQMA 3DOGA 4O0RA 3NYXA 3RINA 3VUDA 1YHWA 1XH5A 2FYSA 3KA0A 3ZFMA 2OH0E 3PSDA 4J71A 5FLFA 4QMSA 3WI6A 3VBQA 4J52A 5CEOA 2QHNA 4PL3A 2UZDA 1ATPE 3UGCA 3KULB 1GZ8A 3D14A 4WD5A 4CTBA 2CCIA 5GINE 3CR0A 2W99B 1W82A 3I79A 3IPHA 3OCSA 4MF0A 3ZO2A 4WA9A 2C68A 3JR1A 1NVQA 3FC1X 2B4SB 1DM2A 4L00A 4I94A 3FMHA 3SV0A 5EM5A 3VUHA 3LQ8A 4BI0A 3LFAA 4GRBA 3O8PA 4O0YA 5T68A 2CKPA 1R3CA 3HV3A 4QPSA 4RC4A 1SVGA 4QMZA 4ZTHA 3V51A 1ZMUA 3NNUA 2YCFA 1ZOGA 1Z5MA 4JDJA 3FLSA 2EB3A 2PVFA 2Z7RA 4F1OA 2E9OA 2JD5A 3CLYA 4I4EA 5CU6A 4HVSA 1AGWA 3D0EA 3QC9A 1Q61A 3UDBA 3P79A 2YHVA 1PXJA 3Q4ZA 2YLEA 3OD6X 4YO6A 4R5SA 2XM8A 4LUDA 4MD9E 2G15A 4C7TA 1UWJA 2BZHB 4EQUA 4TXCA 2JGZA 3W8LA 1MQ4A 4FKVA 1XH9A 5AA8A 5FUTA 5FWKK 2FUMA 3RM7A 1PKGA 2HK5A 3MYGA 3OT3A 3E88A 3EQHA 5H8GA 3FI3A 4OBQA 3S4QA 4FKIA 3TZ7A 4IWDA 4ZIMA 3HP5A 1B6CB 3VF8A 4YJPA 2GSFA 3F3VA 4PP9A 2VO7A 2ZAZA 3PPZA 4ID7A 3OP5A 1FBNA 3NYNA 5I9YA 2J0LA 5M07A 1SNXA 4K18A 3ZM4A 3UZPA 4UY9A 4IVCA 2VX3A 4L3PA 3Q9WA 3P1AA 3TNHA 5HTIA 4PDYA 3KXHA 3LHJA 3RNYA 2OG8A 3ACKA 1YQJA 1U5RA 3EZRA 2P55A 4FZ6A 4F9WA 3REPA 3FE3A 5HE1A 3QLGA 2BR1A 4EOIA 5J7HA 2QODA 2ETKA 4C2VA 3ZDIA 3IW4A 2VNWA 2JIIA 4FKQA 4U42A 4U79A 4YPDA 2X6DA 4RLLA 1MRVA 2C6OA 3F3UA 5IDNA 4FBXA 2YIXA 5AEPA 4I5HA 4Y95A 4WO5A 4O7ZA 3JY9A 3NDMA 3M42A 1OM1A 2BROA 3ZZWA 4KKEA 4DH7A 2WQNA 4EOQA 3MH1A 2YERA 3QCSA 4FL1A 3ORKA 2CGWA 3PWDA 5IPJA 3R83A 2G2FA 5E92A 5A46A 3MBLA 4FEXA 2VTLA 3M1SA 3DNDA 4M15A 3QZGA 1ZY5A 3K5VA 3UIMA 5J79A 2C6MA 5IQIA 4ITJA 4Q9SA 3F69A 3NEWA 5L2IA 3LQ3A 3MA6A 4AQCA 4KB8A 4Z55A 2OK1A 1PW2A 5AV4A 1K2PA 4HYUA 2HOGA 1GIJA 5AP0A 3OWKA 4FTNA 3TDVA 3L8VA 5CVGA 3RWPA 4FEVA 5IMEA 2VTHA 4I4FA 5DVRA 3UOKA 3MVMA 1Q8YA 3FYKX 2W4JA 4N57A 1XWSA 3NS9A 1TKIA 2V62A 2OH4A 3QF9A 2VU3A 4IWOA 3A7IA 3PXRA 3B8RA 1MQBA 4F0GA 3L9LA 4FIIA 4F08A 4C8BA 4I0RA 3RPVA 1GY3A 2R64A 4F64A 3ALOA 3JY0A 1U4DA 3ZLYA 3U9NA 3SX9A 5JFSA 4O96A 3AC1A 4RLKA 5E91A 2OZAA 3FKOA 4MHAA 4C37A 5GZ9A 1Y8GA 1AQ1A 5FM3A 3U6JA 2Y4IB 5HESA 3HV7A 3IOPA 4DFZE 1REJA 5AP2A 5I3RA 4G5PA 4YSMA 5D41A 1XQZA 4YJOA 2QLQA 4UMTA 5CQUA 3QCXA 2WGJA 1KE6A 4EORA 2C5YA 2WMWA 2IPXA 3OUNB 4F0FA 4X2NA 3QKKA 3DK3A 3AGMA 1B38A 3B2TA 4QP1A 2XJ0A 3EL8A 5EM6A 4E6DA 5LMKC 3FHIA 4MBIA 3KF4A 4UB7A 5ANEA 4EJ7A 5LJJA 2ITOA 2C3KA 4G3FA 4FSUA 4RFYA 2QD9A 3EKNA 5AIKA 4CXAA 4CNHA 4RJ5A 4YJRA 5IQDA 3HAVA 1JWHA 2GCDA 3IW8A 4G17A 4CLJA 4ANOA 4IB0A 3ZSGA 4BBEA 4XEYA 1OKYA 4YUQA 5K3YA 4XG3A 4HCTA 4LGGA 5DEWA 4JAJA 3TZ9A 3EIDA 4GT4A 5DR6A 5L6OA 4FTOA 4ZEGA 4PL5A 4BICA 3FMEA 2BILB 4DINA 2J0JA 3R2BA 3V5JA 2AYPA 2BFXA 1W7HA 3IDBA 4E26A 4ZY6A 4IC7A 1X8BA 3A7JA 4GKIA 3BYOA 4O0TA 5LVLA 3GT8A 4NFMA 3NUYA 1U59A 3QFVA 4J99A 4JOAA 2Z7LA 4NH1A 2WPAA 5CEMA 2BMCA 1XH6A 4XH6A 4ANLA 3TNQB 2PHKA 3CQWA 3Q5ZA 3WE4A 5AAGA 4GSBA 4EH5A 3ID6C 3MJ1A 4XV1A 2XK4A 4A4XA 4H39A 1Y91A 3V5TA 4MBLA 1H25A 4F6SA 3RCDA 2P0CA 2W7XA 4ANBA 4GVJA 2OGVA 4O83A 2PMOX 1OBGA 4AU8A 5AFVA 4P5ZA 4YNEA 3KREA 3R1SA 5HNIX 3DZQA 4JS8A 4BIDA 4EYMA 4ZLZA 4TWPA 2CGXA 3Q5IA 4V04A 4FKRA 3P7AA 4USEA 4RT7A 3KXGA 4D4RA 3TJDA 4EKKA 5FBOA 5KMKA 4NJDA 2VO3A 5EQPA 3S00A 4D2VA 1PRYA 4HPUE 4CCBA 2WNTA 4OAVB 3D7TB 3P23A 3H9OA 5KZIA 4EOJA 1YWNA 4FV6A 2WTIA 2YJRA 4FL2A 4IZYA 3TJCA 3ZU7A 5A54A 3F6XA 4AZWA 5I9XA 1ZLTA 3MIAA 5GIOE 3ZRKA 5K0KA 1YW2A 1W0XC 4AGWA 4EK6A 5CF8A 4XP0A 3GCPA 3F66A 3QX2A 2VD5A 3I81A 4FG8A 4O21A 1PMVA 5B0XA 4D4SA 2XS0A 2GFCA 2VTJA 3DLZA 1JKTA 2OFUA 5HIEA 2ZJWA 5AUXA 4FV7A 4AW1A 2ZV2A 4L42A 5K0XA 2XKDA 2QLUA 2B52A 5ANGA 2WMSA 1IG1A 2DS1A 4RVMA 3QQKA 2NP8A 4O7NA 2XK8A 3KMMA 1JKKA 3FLYA 2PK9A 3CD3A 2PVLA 3F5GA 3R28A 4DEBA 4PPBA 5J1VA 4E73A 4FV0A 1REKA 3E8CA 1JSVA 2JC6A 4BGHA 3TV7A 4EEVA 4TNBA 3SVVA 1JSUA 3AC5A 3LFDA 2UW9A 5ETCA 1O6YA 3U87A 3FZOA 3U55A 3HUCA 3POOA 2WQMA 2W1GA 2F2UA 2WB8A 1M7NA 2ITXA 4QP4A 3TZMA 4DGOA 4F7LA 4YTFA 2O63A 4W4XA 5IA0A 1TVOA 1JKSA 2QO7A 4D1SA 4QTDA 3VS5A 4OTDA 4UYNA 3UPXA 4GT3A 5EYKA 3ZBFA 5J9LA 4NKSA 2QOHA 4C38A 3R9RA 3S1HA 3I0OA 2FH9A 3FKNA 3NNWA 4BKZA 1MP8A 5E90A 3C4EA 4C0TA 1J7UA 3RJCA 3PLSA 5FBNC 5GZAA 4RJ4A 4W4YA 5EKNA 4I5CA 5CF4A 4E20A 3K54A 4I6BA 5LVMA 1GZNA 5BVNA 4PQNA 4QMPA 4FZ7A 2PE2A 4IBMA 3ZUUA 4X21A 4Q9ZA 2PWLA 4ITIA 1ZOEA 2GNFA 4BI1A 4FSQA 2BRNA 3CBLA 3LFNA 3NAYA 5IQFA 2C30A 3LFBA 3RK5A 3L8XA 1Y6BA 4BKYA 4A4LA 4UWBA 4FV2A 2C6DA 3UNZA 4HCUA 4DEEA 3EQCA 4MH7A 3SAYA 4DYMA 4PPCA 5L4QA 4DLIA 2BIYA 5JFXA 4BZNA 3UO5A 3M11A 4ZTNA 1OMWA 2FSLX 3BGPA 4RWIA 5CEQA 4CQEA 4A9YA 2XNMA 4DG2E 3FZSA 3BWFA 4ACGA 2SRCA 1PJKA 3TEIA 3TXOA 5CI7A 4G9RA 2UW3A 3TDWA 2X7FA 3OXIA 4FV8A 4PMTA 5DBXA 5BMMA 3Q60A 3E8EA 3R7GA 4X2FA 5FGKA 4JG7A 5DPVA 3LM0A 5LARA 1ZZLA 2YACA 3PPKA 4FKTA 4YLKA 3VS2A 3OOMA 4UWCA 4BWKA 5A4LA 1KUTA 4QYYA 2FSMX 4K8AA 1V1KA 1FQ1B 4L43A 3VQUA 2QURA 3GVUA 4AA0A 2UW5A 4E4NA 5F94A 3CCNA 2Z8CA 4FVPA 2W1FA 1TQMA 3P5KA 3VJOA 5C8MA 1Y57A 4MXOA 5EM7A 5EYCA 4ZK5A 3R8VA 5E8VA 3NIZA 5FP6A 3OC1A 3WF7A 4ZTQA 5LWMA 3UP7A 1CM8A 2WMRA 4DGNA 2QCSA 3A4OX 4ORKA 2WMBA 4TL0A 3L9PA 4AOTA 2BZIB 3E8DA 3EB0A 4J8NA 3QTRA 2RFNA 4B8MA 4LV5A 5JH6A 4E4MA 5IQBA 4K9YA 4QYFA 1YXUA 4D58A 5E8YA 5E8SA 5AJQA 1WMKA 4R3PA 3M2WA 5CT0A 5JSMA 4RG0A 5DYJA 2E9NA 3LJ1A 3MA3A 3MY0A 2XEZA 5JRQA 2OSCA 3BEGA 4CKJA 3FYJX 3SQQA 5KMIA 3PP0A 2QONA 1M2RA 4IX5A 5EYDA 4G1WA 4FX3A 2WFYA 2JKKA 4IM3A 2P33A 2YM7A 3ZXZA 3HMPA 4AGUA 2XK3A 3QKLA 4UALA 4PP7A 5IISA 4L53A 2O3PA 4AUAA 2IVTA 4IE9A 3MH2A 1PXKA 1ZYJA 5AUVA 2CGUA 3G0FA 4CFVA 4CYIA 4QP8A 2Z7QA 2OJFE 4LFIA 5AR4A 1PMNA 3CKWA 4AT5A 3VVHA 4IX6A 4PL4A 2YIQA 2YISA 2GNJA 3UMWA 1KV1A 4GEOA 3R1YA 1ZRZA 4QMVA 5A3XA 3L8SA 4EH8A 5L8LA 2WEIA 4OLIA 1PXOA 2QR8A 4BCQA 5LVNA 2XF0A 3FLZA 3DB8A 4AFJA 4YR8A 1LP4A 3V5QA 2UW6A 4O0UA 3H0YA 4ZSLA 4BC6A 3Q4TA 4JVGA 4O0SA 4WKQA 4E7WA 3UZRA 3W55A 2HZIA 4Y5HA 1IA8A 2XIKA 3CTQA 3TTIA 3QRKA 3PXYA 5KBRA 3R6XA 4KRDA 4PF4A 5ITAA 4JAIA 2HW6A 2B55A 3HECA 3W2CA 4Y8DA 3JYAA 2OF4A 4F9CA 2GS7A 4XBUA 3R8UA 2X39A 4NT4A 3FBVA 5LOHA 2X6EA 2J0IA 2RIOA 4QP6A 2GNIA 3GCUA 5DA3A 5KMLA 3H4JA 4B7TA 4EL9A 5J9ZA 2I40A 1XO2B 2IZRA 5IA3A 2XBAA 3KB7A 1CTPE 1RDQE 3FXXA 4JXFA 4JLCA 2HZ0A 5CXZA 1WBNA 3GUBA 3SKCA 1WZYA 4TYIA 3ZSIA 4YMJA 2XEYA 3QL8A 3VHKA 5IEYA 2QOOA 2XP2A 3CQEA 3VC4A 2YA9A 3AC4A 4PX6A 2BRMA 3B8QA 3ITZA 5H8BA 4G3CA 5LMAA 5CEIA 4IB3A 2KULA 3AT2A 4LGDA 2WXVA 1YI4A 3C4CA 2R2PA 2BTRA 3PJ3A 4QTCA 1PXLA 4O0VA 4ZS0A 3QCYA 4G31A 4N4SA 2HXQA 4OT5A 3ZOSA 2QO9A 3VUGA 4BB4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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