1PYXA

Gsk-3 beta complexed with amp-pnp
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
352
structure length
343
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the GSK-3beta active site using selective and non-selective ATP-mimetic inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
total genus 99
structure length 343
sequence length 352
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1pyxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1pyxA01
3OW4A 2WTJA 3LCOA 3QA8A 4X3FC 4M7IA 5F95A 3ZHPC 1FMOE 1U54B 2CN8A 3PXYA 1UNLA 1Q41A 2J9MA 4G3FA 3FKNA 3H9RA 3RWQA 1G8SA 4DFLA 3I0OA 1XBCA 4LUDA 2HXLA 1R0PA 5J8IA 1OI9A 4ZTLA 2BILB 1LEZA 3KF7A 3TXOA 3UZRA 3C4FA 4IB3A 3A60A 4YTFA 2X81A 3POZA 4FSZA 4FKGA 3LM5A 1XWSA 2A19B 3FKLA 5HCYA 4AFEA 2FO0A 3MH3A 4EUUA 1A48A 2QOBA 2OIDA 4AG8A 2O0UA 2RFNA 4PDPA 3HEGA 2QOQA 3SXSA 3DS6A 5IMXA 1QMZA 5KBRA 3II5A 4R7IA 2X7OA 3VQUA 1ZARA 5KHXA 2OG8A 4RT7A 5AV1A 2WMQA 4NL0A 1OMWA 4IWDA 1NT2A 5ACBC 3KMMA 4EH7A 3RAWA 1MP8A 4L3LA 2R3QA 2YFXA 4XP3A 4J95A 2R0IA 4YJRA 1JPAA 4YJSA 2I0YA 3O51A 3UBDA 4FKRA 2OXDA 4KAOA 4E1ZA 5TKDA 2FYSA 1XR1A 5IUHA 4BL1A 3DLZA 5FBOA 2R5TA 4ASDA 3KCKA 3MFTA 2C47A 2C0TA 3QU0A 5EH0A 2FH9A 5AM6A 3UOHA 3WF5A 5LXMA 2UV2A 3F7WA 5CX9A 2Z7LA 4BDKA 2XEYA 3OC1A 5HNBA 5A46A 4G17A 5BNJA 5IEYA 4DTBA 3DTWA 4DG0E 2C6LA 4U5JA 5B2LA 4Z16A 5AUZA 2WMWA 2VGPA 3MVHA 4K18A 5C01A 3D7TA 4L01A 3OT8A 3HYHA 3H0YA 5LVMA 1WVXA 4B7TA 4FKWA 2BROA 4I6FA 4XMOA 3MY5A 3UNZA 1GZNA 1KV1A 1TKIA 3GB2A 3T3VA 3TKUA 5A3XA 4MBIA 3LAUA 3DZOA 2BDWA 4IX5A 3KA0A 4F64A 3WF9A 1WBWA 1L3RE 4IB1A 4Z7GA 3AGMA 5CAOA 2WFYA 3O8PA 2VGOA 4FTKA 1W82A 2VWXA 3E8EA 4V04A 5AP0A 4D5KA 2VAGA 2R3KA 2OK1A 4F9BA 3PLSA 3GGFA 3R7VA 4ANQA 3EFKA 3EKKA 4J8NA 1VEBA 2UW7A 4M13A 4CRLA 2GQRA 4GS6A 3BEAA 5KMJA 1KE7A 3N4TA 4GKIA 3MVJA 3KN6A 4BVUA 1E1XA 4DEBA 5C8NA 2UW3A 3FY2A 4AZEA 3W2SA 1DAYA 2GS7A 3OW3A 5CF8A 4IJ9A 3DAEA 3QKMA 3QCSA 4GFOA 5EW3A 2PVHA 5AUWA 3D7ZA 3R30A 3UYTA 3A99A 4JG7A 5BMSA 4O0UA 2QU5A 3MFSA 4ZTSA 5AR2A 3HP2A 3PXZA 4HNFA 3IW8A 1RW8A 5FXRA 2VWVA 4LI5A 1PW2A 3O50A 5ETFA 3LVPA 2J7TA 4NW5A 4O96A 1BYGA 4MXOA 3K5VA 4GJ2A 5BQ0A 3EQIA 1Q97A 3BYSA 5CNNA 2REIA 3F5GA 4YLKA 3UYSA 2PUPA 3EQRA 4YJTA 4A4XA 3EL7A 4AW2A 2FSTX 2ITVA 2W1ZA 2F4JA 4NT4A 4V05A 3QWJA 1OL5A 4O27B 1OKWA 4ITIA 4RFZA 4WRGA 1H1RA 2VWIA 3PIXA 4HGEA 5AP7A 4BCFA 3ZEWA 3F5XA 2PPQA 4O7TA 1F5QA 1WBPA 5DFPA 4B8LA 2VN9A 5DI1A 3NYNA 5KZ0A 4I1ZA 3LFSA 4CZTA 2G9XA 1GOLA 3EH9A 3GU4A 4OTIA 5IF1A 2OIBA 4GT4A 4U44A 2OJGA 3RPRA 1B38A 4PMTA 5M07A 1Q99A 1M14A 4YP8A 2C6TA 3O17A 3W2CA 4AZTA 4N6ZA 2VO7A 1OVEA 3HRCA 2OZAB 4II5A 4MKCA 4A4OA 2JITA 5EM7A 4BBFA 3TIZA 3HMNA 3I7CA 4M84A 3S00A 2VU3A 3EQCA 4FSNA 4OGRA 4CV8A 3NUSA 4C34A 2C6IA 3ID6C 1STCE 2R2PA 3DNEA 3DXNA 1ZYDA 4M69A 3VHKA 2Y6MA 2BKZA 4OTPA 3A61A 4FIHA 4XUFA 4U97A 3VBXA 2EB2A 3D15A 1YDTE 2YJRA 3RPVA 4FKLA 3CTQA 3RAIA 4ZLYA 3SG9A 4I41A 5H2UA 3MV5A 4WSQA 2YIXA 4A9YA 2CGUA 4E4XA 3QUDA 1IAHA 2VWYA 3RZBA 5J5TA 1YI6A 3IS5A 4DA5A 2IZUA 4TWPA 2G2IA 4GUEA 5ANIA 4F9AA 3U54A 1WBSA 4QQ5A 3F66A 4FKSA 2I6LA 3Q2JA 2QCSA 4BZOA 2C3LA 1R0EA 3O71A 2ZDUA 1H28A 1H07A 4W8DA 3EN4A 2Z7SA 3EQHA 4MXAA 4NKSA 2WB8A 4NU1A 2HZNA 4X3FA 4GH2A 4FT7A 4IZYA 3AC4A 4Q2AA 5FP6A 5CSWA 3VC4A 4EK4A 4UMPA 3DFCB 3ENHA 3ZFYA 5I9UA 4TWOA 3WE8A 4UY9A 2WEVA 4HGLA 4TT7A 5AV0A 3E63A 2QO9A 3N4UA 4EQCA 3VUDA 3OWLA 4ZSJA 4RJ8A 2RL5A 3C4EA 5BX0A 4AOJA 3OEFX 4EJNA 5AV3A 1Q8UA 1Q3WA 3EB0A 5CEQA 5JGDA 4EH8A 4CG8A 1RQQA 2R3OA 1ZRZA 5H9BA 1P14A 2UVYA 4NWMA 1UV5A 5HTIA 3ORXA 1YVJA 4K33A 4XH6A 5LQFA 1W83A 2R3LA 5EHYA 3CKWA 4EOOA 2R3RA 4AN3A 4RMZA 2E2BA 1SVEA 2RF9A 2B7AA 3OD6X 5TOZA 5A54A 1KOAA 2W5BA 2R3NA 4U81A 1P4FA 2PE2A 3PJ2A 2CCHA 4H1JA 1T45A 4KRCA 5CU3A 4FV2A 3QF9A 5J5SA 3Q04A 4U6RA 3KVXA 3R2YA 4R1VA 5CSVA 3U9NA 4BN1A 3RAHA 3C13A 3D5UA 2PE0A 4RWLA 3R7EA 5ANJA 4AA4A 2XKFA 4DFBA 1LUFA 4FUXA 3PUPA 4GIHA 3FDNA 4M12A 2OJIA 5EFQA 3F2AA 4FEUA 2QOFA 4O7WA 5GJDA 4FKJA 4I93A 1JKTA 4KWPA 4TWNA 3QRUA 5CVFA 1R39A 2QI8A 2P55A 3JXWA 3PLAE 1ZYCA 2C5VA 2RG6A 3HX4A 4MQ2A 3Q4UA 4C0TA 3E5AA 3FMKA 4BWKA 4F7NA 4ONAA 4HYUA 5L2IA 5D9HA 5CVHA 4RSSA 2XNMA 4YJNA 5AX3A 4DEIA 3R7YA 2BRGA 4DT9A 3ORZA 3MFUA 3G9NA 5CQUA 3NS9A 2JGZA 4S30A 2JC6A 5EI6A 4C3RA 1IRKA 1H01A 4IXPA 3IG7A 1MQ4A 5AIKA 3ELJA 4UXLA 5DGZA 4ZY6A 1OZ1A 2JDTA 3IQ7A 4TYHB 4RRVA 4XP2A 2QOKA 3DJ5A 2AC3A 3QTUA 4QYHA 3F82A 4FK6A 2YM7A 4E26A 4EH6A 4I6HA 4E73A 2G01A 4WIHA 3BCEA 1NXKA 4QMNA 2UZDA 4QMQA 4JG6A 1KSWA 1PXKA 2PMIA 2OF2A 3BRBA 3CBLA 3EYGA 5E8WA 2XIRA 5ETIA 4M69B 4AW1A 3DAKA 4DFYA 2WU6A 3QZGA 3PRFA 4K0YA 4DYMA 4HZSA 1KE9A 3QHWA 3G6GA 2WMRA 3E64A 5IUGA 4IAZA 3T8OA 4EH3A 4YPSA 4YNEA 1XQZA 3VBQA 3G6HA 4TYEA 2VTLA 3QZHA 2EXCX 4FL3A 4IZAA 3UPXA 2J90A 3FZ1A 1WCCA 5JFVA 3UIUA 5TR6A 2DYLA 3HUCA 3PXRA 1DI8A 5C8MA 5F1ZA 4AT3A 4JXFA 3KQ7A 1KUTA 4BCIA 3EJ1A 5F4NA 1WFCA 3DKCA 5DG5A 2E9PA 3ORPA 5I9YA 5IH6A 5G6VA 4ZTQA 2Y7JA 4FT5A 4YURA 3LCKA 4PL5A 2W1DA 5E91A 2IVUA 4L9IA 4ZTRA 3PWDA 5JFSA 5GIPE 5ITAA 4EQMA 2B1PA 3BBTB 1XJDA 1URWA 3GU7A 2QD9A 4I5MA 1LEWA 1VJYA 4MNEA 4UB7A 4YR8A 4MXCA 4NIFB 3FQHA 2YABA 4GW8A 5FP5A 2BHEA 3RVGA 3UJGA 5C1QB 2IW8A 3R73A 4HCUA 2YA9A 3ZZWA 4BGHA 2XKDA 4RFYA 5HEZA 3WYYA 2YAAA 4YBKA 3R1QA 5DIAA 5IZFA 2CGXA 2PY3A 4GSBA 4JDKA 4XG2A 3DB6A 1PMEA 5E8VA 1F0QA 5IQGA 3OXZA 4XG7A 3SD0A 3HMOA 4FSRA 5IQEA 3MY1A 4G5JA 3IW7A 5GHVA 2BAQA 4U8ZA 2F7XE 2SRCA 4U79A 3QD4A 2C1BA 3U4UA 4AOIA 4I21A 2WQOA 2GCDA 3MBLA 4IWOA 4X6QC 4HJOA 2H96A 1JWHA 3PP1A 4OLIA 1UVRA 4FIEA 4YO4A 4GK4A 2OI4X 2JIIA 5D41A 4I24A 4IAKA 4AA0A 5CF4A 3LXKA 2PMNX 3FUPA 4YJVA 1UNGA 4HYHA 2FSOX 2YN8A 3QTXA 3L8VA 3ORLA 1DS5A 2X9FA 4CLIA 2VTTA 2Q0BA 5EKNA 3KK9A 1PHKA 4EOQA 4EK6A 3CGOA 4C3FA 2O2UA 4GMYA 1V1KA 2GNLA 3IOKA 2W0JA 5I3OA 1SVGA 5AX9A 5IH5A 4YJQA 4LYNA 4QYGA 3R63A 4QP4A 3VRYA 2JBOA 5K9IA 1HOWA 3QD2B 2O64A 3KN5A 1BL7A 4PTEA 2AYPA 4UBAA 2CGVA 4USEA 3COMA 5AIRA 3C0IA 3Q5IA 4QPAA 3VUIA 5EM8A 4G3CA 3DK6A 3RTPA 1YOLA 4RC3A 2XBAA 3KRJA 4O84A 1WBNA 4QMZA 5BYYA 3GFWA 3R6XA 4IBMA 1FQ1B 4FZ6A 3VBWA 4NSTA 2C6EA 4I6BA 1SVHA 5IQAA 4FKUA 4G2FA 3F9NA 1J1BA 1YHSA 2XNPA 3LJ1A 3T9IA 3W55A 4AZVA 2F9GA 4HYIA 3NW7A 4RC4A 1G5SA 1KOBA 4CSVA 5M4CA 1UWJA 1M17A 4W4YA 3ZU7A 4F6SA 5KNJA 5JSMA 2CKOA 3P86A 3QRJA 4G5PA 2J0JA 5E8SA 4F7SA 3DOGA 3COKA 3OROA 4GU6A 1REJA 1WMKA 3G90X 3NNVA 2HK5A 4FT9A 2E9OA 4UALA 5B0XA 4PTCA 5C27A 2PE1A 2YDKA 4LRMA 5JZNA 4ZJVA 4E4MA 5IA0A 2X2MA 3TZ9A 2ETMA 4AAAA 4AGCA 2IZTA 4Z3VA 1PMUA 4IM2A 5HE0A 3BI6A 1ZOGA 3QKKA 3RK5A 2YWPA 3Q9YA 4XG3A 3CJFA 3BYMA 3HA8A 5CU2A 4IM0A 4RJ6A 5LVOA 4N6YA 3LXPA 3NW6A 4TYGA 3ZSGA 4BCKA 2ZM3A 3BBWA 4GG5A 4NCTC 3G0EA 5M44A 3F61A 3FBVA 4AS0A 1X8BA 3AGLA 3HV4A 5HZNA 2OF4A 3KRWA 4O0YA 5GNKA 4YC8A 2JFMA 4O0VA 3DXPA 1WAKA 3ENMA 1LP4A 2VUWA 1XBAA 4UWYA 4O7VA 4IZ7A 4KIPA 5E1EA 4QMSA 1ZMVA 3IDPA 4BIBA 4GYIA 3R2BA 2Z60A 2IW9A 5C4KA 3QTRA 3ZYAA 2J51A 3QAME 3R22A 2E9NA 4BDHA 3BYVA 5AUTA 4I4EA 3BWFA 1NW1A 3QA0A 1MRVA 4O1OA 2Y9QA 3I6WA 3ZC5A 4C62A 4Y72A 3R9HA 2IO6A 1AD5A 5GINE 3PJ8A 1JSVA 5E92A 4LGGA 3QC4A 2G2HA 4HYSA 5L8LA 5HBHA 3C0HA 3EMGA 4Y46A 4NUSA 2XNOA 3GVUA 3E93A 2JKMA 4QTEA 3V8TA 2YCRA 4RX8A 3SOCA 3PYYA 3UC3A 4QP3A 4BHZA 4DFXE 3DA6A 4KSQA 4LUEA 4CTCA 4W4XA 3PIZA 5CY3A 3FI3A 1OKYA 4NM7A 3WZJA 3OOGA 3D0EA 3VULA 3UIBA 1E9HA 1PY5A 4QTBA 2XMYA 3NLBA 4EOLA 4FZDB 5IISA 4UMQA 4CRSA 5FBNC 3WIGA 3S95A 3FXWA 3P0MA 4D9TA 3W2OA 1U54A 5AP6A 4DLIA 1J1CA 2DUVA 2X4ZA 5BPYA 5GZ9A 3QFVA 4GKHA 1FMKA 3L8XA 2BCJA 3FMHA 3N51A 3PJ3A 3R9RA 3RPYA 3F3UA 2IVTA 2WTCA 3DQWA 3DT1A 4AN9A 5DOSA 5EI8A 4BY9E 3AT2A 4OTHA 3TKIA 5FM3A 1CTPE 4BCNA 3EQFA 5L3AA 4F99A 5CSPA 4ANOA 2QR8A 4XP0A 3SXFA 4EHGA 1FBNA 2PWLA 1OUYA 2WQMA 3L8PA 2ITYA 4QMXA 5E4HA 2UZEA 4TZRA 4ZZMA 4DE4A 1Q61A 3BQRA 3PA4A 4LOQA 5D10A 4DGMA 3OZ6A 3B8QA 3CTJA 5B2KA 5IDPA 3ORTA 1J3HA 3RK9A 4HPTE 3CPCA 3R9NA 2QOOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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