1QPEA

Structural analysis of the lymphocyte-specific kinase lck in complex with non-selective and src family selective kinase inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
271
structure length
270
Chain Sequence
KPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNETAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the lymphocyte-specific kinase Lck in complex with non-selective and Src family selective kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords LCK KINASE
total genus 88
structure length 270
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1999-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1qpeA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1qpeA01
5LVOA 1TVOA 3VIDA 2JIIA 4LL5A 4DBNA 1F3MC 3I4BA 4F63A 4N57A 1NXKA 3FI3A 4ZTSA 4FL1A 2OK1A 3SC1A 3D0EA 2ZV2A 4BCKA 3NPCA 3AC3A 4FSNA 3LFSA 3N4TA 3UVQA 3TDWA 5LWMA 4HNFA 2WGJA 4K33A 3TNHA 4QMQA 5J5SA 2X2LA 1SVHA 4AT3A 4X2NA 4M67A 5FM2A 4F7JA 5J1VA 4HCTA 4YJOA 4E4MA 3W33A 5HGIA 4E7WA 1JKLA 5JGDA 4BYIA 4MQ1A 4PP7A 4UZDA 1Q41A 2XK4A 4K0YA 3NUYA 4BCMA 4GFGA 5BMSA 3C7QA 4A9SA 4XG8A 5AP0A 3ORZA 4GS6A 4C4GA 4DE4A 3BI6A 4JIAA 2VZ6A 2E9UA 2GHLA 4LOQA 4M0ZA 4M66A 4FKLA 4EBWA 4O81A 4KKGA 4EOJA 3H0YA 3BIZA 1JNKA 3MPTA 3A7HA 4ANSA 4AXAA 4G6NA 4FICA 3EHAA 2V55A 1W7HA 4J7BA 3MGYA 4AW2A 1T45A 1FVVA 3OVVA 4LI5A 3MBLA 2XMYA 4XV2A 1P4FA 2VN9A 1OPLA 5M06A 4L42A 2XIYA 2GQGA 1W84A 3PJ8A 4ITIA 3UIBA 1H4LA 4EOLA 4CFNA 5EW3A 1H1SA 4OTIA 2J51A 1PMUA 3QKKA 4U9AA 4C7TA 3PXYA 3WZKA 4D2SA 4U44A 4TWNA 4LRKA 2EUFB 5BVDA 3B2TA 4AW1A 3FMDA 5ACKA 1WZYA 5CT7A 2X7GA 4BWPA 2XNNA 5FM3A 4MD9E 3MA6A 4IADA 4MXXA 2F57A 1XH9A 4AW0A 4BDJA 2UZTA 2QR8A 4QTCA 3FKLA 4F1OA 3ZLWA 2V7OA 2OLCA 3IDBA 3Q32A 3QZHA 2NRUA 4RJ4A 2QKWB 5LCKA 4FV1A 4QYGA 4ANLA 4CKJA 4R8QA 3FMJA 4GUBA 3I0QA 3VJOA 1K3AA 2G2HA 3ODYX 4HJOA 1KE5A 3O8UA 2OGVA 4MNEA 4P2KA 2CGXA 4AZTA 5CNNA 4TY1A 4JI9A 4FTKA 3U51A 2OFVA 1Q8WA 2ETMA 4YLJA 4RBLA 3DLSA 5TT7A 4F08A 3AD6A 3GOPA 2WTDA 3FHIA 4UEUA 1Z5MA 4O0YA 5EHLA 5BVNA 1SM2A 3E8CA 4BICA 4IQ6A 4FV8A 4Y5HA 4D9UA 2PULA 2RIOA 1V0BA 3ERKA 1FBNA 3MVMA 3OWJA 3HP2A 4L00A 4D1XA 5AUZA 4UALA 3UC4A 4DEHA 2PHKA 4ZTQA 3VUIA 4J53A 2JKOA 3MFUA 5EYMA 3O96A 4CFVA 5GINE 1M7NA 3QC4A 5D11A 1OL1A 2B9HA 1JWHA 3KXZA 3PRFA 3UZPA 4C58A 2OIQA 3DXNA 2UZEA 3HA8A 3EFLA 5HU3A 5B7VA 3TKHA 3R8LA 5KMOA 3MFSA 3C5IA 3FC2A 4PMMA 5HLPA 1M2RA 3EQBA 2PE0A 3R73A 3R1SA 5IA2A 2YITA 2FSMX 4RWKA 4FVQA 1OIQA 2XCHA 3C9WA 4QMTA 4JT3A 5L3AA 2CHLA 3H9FA 3KRWA 2RFEA 3SVVA 2UW4A 2Y0AA 4IH8A 5IQAA 3QZGA 4FF8A 2IVVA 3MH0A 3DQWA 3G0EA 4O1OA 1U54B 3JY9A 3GI3A 4IM3A 4CZUA 3CPCA 2WQEA 3UDBA 5GJDA 4X21A 3OBGA 4NSTA 1JQHA 4QMLA 5DT0A 5HTBA 2X8EA 4LMUA 4ORKA 3O8PA 1ZAOA 2A27A 2OWBA 5AP7A 5LMAA 3C4XA 4I4EA 3QCQA 3NIEA 3CTJA 4FODA 5HG7A 5JFSA 2GS6A 4IACA 4NIFA 5CU3A 4CLIA 4EOMA 4NYEA 1IASA 1RQQA 4YURA 4P4CA 4BDIA 4N6YA 1CM8A 3PPKA 5CSVA 3GBZA 3P4KA 2XK8A 3SG8A 5IU2A 4FKTA 5JGAA 4BGQA 4C3RA 4EJNA 3FLSA 2R0IA 1ZLTA 2OG8A 2XM9A 2J6MA 3IDCA 4GUEA 2ZB0A 3UZRA 3FI4A 3PXRA 5AUYA 4JIKA 4BTJA 2IZSA 4XP2A 2HWPA 4NM3A 2OXYA 5FD2A 3KXHA 2VAGA 5T68A 4ALVA 4C35A 5HE1A 3T9TA 2I0VA 4QMUA 3UOKA 5AUTA 3ORTA 2VWBA 2BFXA 1MRYA 5DHJA 5HCYA 5L8JA 5F9EA 5FEEA 3FZTA 4L52A 2X2MA 3FZSA 5KX8A 2VTIA 3RMFA 4KINA 3ORPA 4AZVA 1ZMVA 3BWFA 4EOKA 4RIWB 1B39A 5E8XA 5LOHA 1HCKA 4DG0E 4RQKA 1SYKA 1UV5A 3WILA 3M2WA 4I23A 3VNTA 4D4YA 2X8IA 3KREA 2CGVA 3UOLA 1UA2A 4NL0A 2E9VA 1QL6A 4ID7A 5AA9A 5DA3A 1PHKA 5C26A 4DA5A 3AMBA 3TL8A 2XH5A 4IDTA 4BCJA 5JRQA 4BCFA 2W1CA 2W5BA 5ETFA 2UW5A 5JN2A 3GNIB 4FL2A 3OTVA 2GNLA 5DEWA 2Z7LA 4F6SA 3I60A 2C6DA 4DH7A 3TJDA 4O7YA 2OXXA 5BVEA 3RNYA 4OLIA 3UMXA 1FGIA 4PRJA 4UB7A 5I9UA 3G9NA 3G2FA 3CJGA 4DEEA 3CJFA 4UMTA 5LMKA 2WHBA 5L2SA 2F7ZE 2OW3A 3UQCA 4ZS4A 5LQFA 3W18A 4QMSA 3P78A 1FVTA 5BX0A 4G3EA 4P90A 4E6DA 3F7ZA 3PZEA 3QTWA 2VGOA 3R1QA 3KU2A 1JKKA 2ETRA 2UUEA 1JLUE 4PV0A 5IDPA 4C59A 4DFBA 3QHRA 4E26A 3ET7A 3JYAA 3FPMA 2CDZA 3UQGA 2QG7A 2XBJA 3EQHA 4MNFA 4XRLA 3W8QA 4O91A 2BRMA 4EK4A 4UN0C 3A7FA 2ONLC 2H34A 3FBVA 2XA4A 3NGAA 4JDKA 4O7RA 2CPKE 2VV9A 3HGKA 4K77A 5FBNC 5DVRA 2HK5A 4C33A 2GNFA 4H1MA 5AP4A 5FWKK 4EHGA 5LJJA 3EL8A 5K9IA 1AQ1A 4O0UA 3A7GA 3CLYA 3LOKA 5CLPA 3R21A 2W9ZB 4L01A 3TNPC 3KXGA 4FV7A 3TDVA 1WBSA 1H1WA 2QURA 2ITWA 3B2WA 3QTSA 4ZOGA 4CV8A 4WG4A 3GU7A 3QYWA 5AP1A 5HOAA 2W1EA 4CYIA 4YJQA 4O7SA 2O64A 1Q97A 2A0CX 4YZ9A 4XBRA 4EOSA 5FP6A 5I9ZA 3GFEA 2W05A 5IQCA 2JDRA 1XH5A 3Q5ZA 1OM1A 2E9NA 4LGGA 5DYJA 4W4WA 1GIIA 1KE6A 3U54A 4NT4A 3R9DA 4E4XA 3OEZA 3OWKA 3QCSA 5EDQA 3UMWA 4LOPA 3C1XA 3PRIA 4R7BA 3B8RA 1Y6AA 4C37A 3TUCA 4RZWA 3OXZA 5M4IA 5E4HA 3UYSA 1W82A 2YIRA 4NKSA 5CEIA 2XUUA 4M97A 2CGWA 2GSFA 5AAGA 2CN5A 3FJQE 3OXTA 5HCXA 4ZXTA 2W06A 3ORKA 2DYLA 2YA9A 2C3LA 3F5XA 3NSZA 4GV1A 4IAFA 3U6IA 4MKCA 4S33A 1A06A 4JR3A 3AGMA 4ZZMA 2PMNX 4PDYA 3BX5A 3I0OA 3VVHA 3LMIA 4BZDA 1H26A 4G9CA 1YI3A 4NM5A 4V05A 5E8UA 3R8PA 1XBAA 3K5UA 3OCBA 1FINA 3CIKA 3PVUA 5C01A 3RK5A 2GDOA 3IW7A 3NNXA 4NW5A 3ZEPA 3CD8A 3ANRA 4FV0A 3ZM4A 4GIHA 5CSWA 3IGOA 2XKDA 4IB3A 2BDFA 2RG6A 3F5UA 2WIHA 5EDRA 3W2CA 2W4JA 3NNVA 3RVGA 3NVKI 2PVYA 5A4TA 3GCPA 4IVBA 1KE7A 2HCKA 3REPA 4E6QA 4IM2A 1Q62A 4ZTRA 3BYSA 3QAME 4MCVA 5IMEA 3MIYA 2OBJA 2C5NA 2PE2A 3Q9XA 4GSBA 1XJDA 3H0ZA 5AP2A 2Z2WA 3G0FA 4EK8A 1ZYJA 3PY0A 4OBOA 4A7CA 4QP8A 4FTLA 1QPDA 4WSQA 3O0GA 3WZEA 3MVHA 4O0XA 4BCOA 2JAMA 3P86A 3EYGA 2OIDA 3QQJA 3QX4A 1LUFA 2JKKA 3ZC5A 2UZLA 1ZWSA 3G15A 5AR4A 2XJ2A 3QTUA 1U5QA 3D9VA 4Y95A 4FKVA 5DGZA 4GFOA 1G5SA 3JY0A 4IC8A 3QD0A 1Q61A 3QUPA 4OBPA 4XRJA 5KNJA 4M14A 5GZ9A 4AE9A 2SRCA 3A2CA 3TKUA 3RAKA 2JFLA 2QCSA 4ACDA 2R3IA 2J5EA 2W7XA 4K18A 1OL2A 4LUEA 4UV0A 5H8GA 3SW7A 3GUBA 2PK9A 3FXZA 4TYGA 3ZM9A 3VF8A 4CCUA 3FXWA 3EN6A 3BLRA 3QXOA 1OMWA 1QPEA 3CQEA 4KIKB 4WT6A 4YJUA 4AACA 2YAAA 5DFPA 5HNGA 3HMOA 3R8UA 2GS2A 4QRCA 5I0BA 3GC7A 3SOCA 5CY3A 3KN6A 3UO4A 4UMRA 3TZ9A 2WQOA 3ZEWA 4O86A 3FI2A 4QP6A 2VUWA 1U54A 5ANOA 5AM6A 2PZYA 2VTSA 4E3CA 2JFMA 4FL3A 4YTIA 1UWJA 3ZFYA 3VC4A 5AR2A 4CNHA 4I5CA 3ZRKA 5K4IA 1Q8UA 3P7CA 2C0TA 4G3FA 3EJ1A 4G3GA 4G6LA 4RWJA 3UP2A 3K2LA 4EHVA 3U6HA 4DTKA 1GIJA 1NA7A 2ITQA 3F3VA 1H00A 2WMAA 3MY1A 1OBGA 4CFUA 3WBLA 3E64A 4QMOA 4FZDB 3QCXA 1BYGA 5JGBA 3R83A 1UU9A 3C4ZA 3F9NA 4ERKA 4MQ2A 2C6LA 5CI7A 3VBQA 2HELA 4EYMA 1OIYA 2ZDUA 2YCFA 3HV4A 3MY0A 2OH0E 5KHXA 4O82A 5LARA 3R04A 4D4SA 4Q9SA 3ITZA 3BGZA 2JLDA 3N51A 5AP3A 4EYJA 5M4CA 3I6UA 3VBTA 4RFMA 3NAYA 2V22A 5DWRA 1ZXEA 5E8TA 3R02A 5CF4A 3RAHA 5CZHA 4FI1A 3SD0A 4IVDA 1IG1A 3BZ3A 3EZVA 2J90A 3LFCA 4D1ZA 3IONA 2QLUA 2XJ1A 4R6VA 2G9XA 4S34A 3PSDA 1LPUA 5EK7A 4GCJA 3OXIA 4S2ZA 3NUXA 4L46A 4ZK5A 4C0TA 4ASXA 4RIWA 3OWPA 3N9XA 3R28A 1I09A 5C4KA 3FZRA 3P7BA 3TXOA 4KIPA 1QMZA 3NUAA 1PRYA 3IO7A 2CSNA 3LFAA 4TPTA 4DLJA 3IW5A 4QMWA 4S32A 4H3BA 5HLNA 4PL5A 5IH6A 4DEBA 2QOOA 5IQGA 5E1EA 4J97A 3T9IA 3CEKA 3G33A 3KK9A 4LYNA 4X2GA 4FT7A 4HGLA 3FSFA 5HD7A 4XG3A 2BZHB 4QTAA 3LCKA 3KMMA 4Y85A 5TR6A 5CQUA 2R3KA 3MW1A 4FKRA 1YQJA 3FMNA 3DBFA 2C6TA 5ANEA 2O65A 1WVXA 5HORA 5CEMA 2ZMCA 4P7EA 4PWNA 5CXHA 3COMA 4CLJA 1P5EA 1YVJA 3POZA 3BGQA 4JAIA 5EW9A 1FPUA 4EH8A 5C8KA 2RFDA 2OI4X 4RC2A 1H25A 2RF9A 1YOMA 3BYOA 4FG7A 3GCUA 4A9RA 3JVSA 1XBBA 2C6KA 4I0SA 4WRGA 3OC1A 5HO6A 4AA0A 2YZLA 3R8VA 4KRDA 4RJ6A 4OTDA 4F1MA 1XH6A 3OD6X 4GIIA 2FVDA 4ARKA 2VWWA 3PLSA 2YHVA 4LOOA 1GAGA 3BHUA 4ALUA 3QBNA 5J7HA 2JGZA 3V3VA 2PMLX 3LM0A 5AJQA 4BGHA 5LVLA 3Q60A 3ZH8A 4FV2A 2VWZA 4AN9A 5HVKA 4L7SA 2OJJA 3ACKA 5FTGA 2RSVA 2VTMA 4HYHA 2GQSA 4J99A 4HVGA 1FOTA 4ITJA 3VUTA 4W4VA 4O6EA 3VO3A 4D2TA 4DYMA 2PPQA 1ZYLA 4DF3A 3NVMB 5GIPE 5J7BA 4I24A 4IB1A 2UZUE 2BZIB 4OTQA 4F99A 1VYZA 2VD5A 3WE8A 4PTGA 3HRFA 2A4LA 3QRTA 5BUEA 3SRVB 3QLFA 2X9EA 4O2ZA 2QLQA 3D15A 2Q0BA 4XNEA 4OTHA 3ZDIA 2ITVA 3KXXA 2IJMA 3R00A 2EVAA 3OTUA 3PA3A 4YHTA 3VHEA 4FC0A 3TTJA 2XK7A 4AOIA 4U3ZA 4N6ZA 3ATSA 1K9AA 2AC5A 1LP4A 4HZRA 4TWOA 4BI1A 5FXRA 3DV3A 3ENHA 4NFNA 5IG1A 3ROYA 4IWDA 1YXTA 4FX3A 2R0UA 2ITOA 4FVRA 1PMVA 4V0GB 3ULZA 5IQHA 4TYJA 3QD2B 4YTCA 3GOKA 1BUHA 4DLIA 3VHKA 3D5XA 2C1AA 5HI2A 5J5TA 3W10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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